Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7312
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7312, 1059 aa
1>>>pF1KB7312 1059 - 1059 aa - 1059 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3295+/-0.00105; mu= 13.4359+/- 0.063
mean_var=150.8527+/-29.760, 0's: 0 Z-trim(109.9): 182 B-trim: 10 in 1/50
Lambda= 0.104423
statistics sampled from 11040 (11233) to 11040 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.345), width: 16
Scan time: 5.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12088.1 TMPRSS9 gene_id:360200|Hs108|chr19 (1059) 7308 1113.7 0
CCDS74856.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 ( 802) 843 139.7 2.5e-32
CCDS13941.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 ( 811) 843 139.7 2.5e-32
CCDS43129.2 TMPRSS7 gene_id:344805|Hs108|chr3 ( 717) 832 138.0 7.3e-32
CCDS8487.1 ST14 gene_id:6768|Hs108|chr11 ( 855) 810 134.7 8.3e-31
CCDS73391.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 413) 766 127.8 4.7e-29
CCDS73392.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 448) 766 127.9 5e-29
CCDS44735.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 457) 766 127.9 5.1e-29
CCDS55788.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 532) 687 116.0 2.2e-25
CCDS41721.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 567) 687 116.0 2.3e-25
CCDS58185.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 563) 685 115.7 2.8e-25
CCDS33564.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs108|chr21 ( 492) 677 114.5 5.9e-25
CCDS13571.1 TMPRSS15 gene_id:5651|Hs108|chr21 (1019) 682 115.5 6.1e-25
CCDS54486.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs108|chr21 ( 529) 677 114.5 6.2e-25
CCDS10481.1 PRSS22 gene_id:64063|Hs108|chr16 ( 317) 670 113.3 8.7e-25
CCDS34120.1 KLKB1 gene_id:3818|Hs108|chr4 ( 638) 671 113.7 1.3e-24
CCDS75122.1 CORIN gene_id:10699|Hs108|chr4 ( 938) 671 113.8 1.8e-24
CCDS58790.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs108|chr21 ( 453) 665 112.6 1.9e-24
CCDS3477.1 CORIN gene_id:10699|Hs108|chr4 (1042) 671 113.8 1.9e-24
CCDS3518.1 TMPRSS11D gene_id:9407|Hs108|chr4 ( 418) 660 111.9 3e-24
CCDS13686.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs108|chr21 ( 454) 653 110.8 6.7e-24
CCDS33993.1 TMPRSS11E gene_id:28983|Hs108|chr4 ( 423) 648 110.1 1.1e-23
CCDS3521.1 TMPRSS11B gene_id:132724|Hs108|chr4 ( 416) 636 108.2 3.7e-23
CCDS10430.1 TPSG1 gene_id:25823|Hs108|chr16 ( 321) 633 107.7 4.2e-23
CCDS74669.1 PRSS56 gene_id:646960|Hs108|chr2 ( 603) 630 107.5 9.3e-23
CCDS76482.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 290) 619 105.6 1.7e-22
CCDS3520.1 TMPRSS11F gene_id:389208|Hs108|chr4 ( 438) 622 106.2 1.7e-22
CCDS53717.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 397) 619 105.7 2.1e-22
CCDS44743.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 432) 619 105.7 2.3e-22
CCDS53716.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 435) 619 105.7 2.3e-22
CCDS31684.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 437) 619 105.7 2.3e-22
CCDS5976.1 PRSS55 gene_id:203074|Hs108|chr8 ( 352) 611 104.4 4.5e-22
CCDS5872.1 PRSS1 gene_id:5644|Hs108|chr7 ( 247) 607 103.7 5.2e-22
CCDS44881.1 TMPRSS12 gene_id:283471|Hs108|chr12 ( 348) 609 104.1 5.4e-22
CCDS14101.1 ACR gene_id:49|Hs108|chr22 ( 421) 608 104.0 7e-22
CCDS56570.1 PRSS3 gene_id:5646|Hs108|chr9 ( 240) 602 102.9 8.5e-22
CCDS3847.1 F11 gene_id:2160|Hs108|chr4 ( 625) 609 104.3 8.5e-22
CCDS6545.1 PRSS3 gene_id:5646|Hs108|chr9 ( 247) 602 102.9 8.7e-22
CCDS56571.1 PRSS3 gene_id:5646|Hs108|chr9 ( 261) 602 103.0 9.1e-22
CCDS47958.1 PRSS3 gene_id:5646|Hs108|chr9 ( 304) 603 103.2 9.2e-22
CCDS47065.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs108|chr4 ( 418) 602 103.1 1.3e-21
CCDS3519.1 TMPRSS11A gene_id:339967|Hs108|chr4 ( 421) 602 103.1 1.3e-21
CCDS83236.1 PRSS2 gene_id:5645|Hs108|chr7 ( 247) 598 102.3 1.3e-21
CCDS5279.1 PLG gene_id:5340|Hs108|chr6 ( 810) 603 103.5 1.9e-21
CCDS45388.1 PRSS21 gene_id:10942|Hs108|chr16 ( 300) 587 100.8 4.8e-21
CCDS3369.1 HGFAC gene_id:3083|Hs108|chr4 ( 655) 591 101.6 5.8e-21
CCDS75098.1 HGFAC gene_id:3083|Hs108|chr4 ( 662) 591 101.6 5.8e-21
CCDS83235.1 PRSS2 gene_id:5645|Hs108|chr7 ( 261) 584 100.3 5.9e-21
CCDS10852.1 CTRL gene_id:1506|Hs108|chr16 ( 264) 577 99.2 1.2e-20
CCDS32490.1 CTRB1 gene_id:1504|Hs108|chr16 ( 263) 569 98.0 2.9e-20
>>CCDS12088.1 TMPRSS9 gene_id:360200|Hs108|chr19 (1059 aa)
initn: 7308 init1: 7308 opt: 7308 Z-score: 5955.9 bits: 1113.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7308; 100.0% identity (100.0% similar) in 1059 aa overlap (1-1059:1-1059)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MEPTVADVHLVPRTTKEVPALDAACCRAASIGVVATSLVVLTLGVLLAFLSTQGFHVDHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MEPTVADVHLVPRTTKEVPALDAACCRAASIGVVATSLVVLTLGVLLAFLSTQGFHVDHT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 AELRGIRWTSSLRRETSDYHRTLTPTLEALLHFLLRPLQTLSLGLEEELLQRGIRARLRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AELRGIRWTSSLRRETSDYHRTLTPTLEALLHFLLRPLQTLSLGLEEELLQRGIRARLRE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 HGISLAAYGTIVSAELTGRHKGPLAERDFKSGRCPGNSFSCGNSQCVTKVNPECDDQEDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HGISLAAYGTIVSAELTGRHKGPLAERDFKSGRCPGNSFSCGNSQCVTKVNPECDDQEDC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SDGSDEAHCECGLQPAWRMAGRIVGGMEASPGEFPWQASLRENKEHFCGAAIINARWLVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SDGSDEAHCECGLQPAWRMAGRIVGGMEASPGEFPWQASLRENKEHFCGAAIINARWLVS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 AAHCFNEFQDPTKWVAYVGATYLSGSEASTVRAQVVQIVKHPLYNADTADFDVAVLELTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AAHCFNEFQDPTKWVAYVGATYLSGSEASTVRAQVVQIVKHPLYNADTADFDVAVLELTS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 PLPFGRHIQPVCLPAATHIFPPSKKCLISGWGYLKEDFLVKPEVLQKATVELLDQALCAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PLPFGRHIQPVCLPAATHIFPPSKKCLISGWGYLKEDFLVKPEVLQKATVELLDQALCAS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 LYGHSLTDRMVCAGYLDGKVDSCQGDSGGPLVCEEPSGRFFLAGIVSWGIGCAEARRPGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LYGHSLTDRMVCAGYLDGKVDSCQGDSGGPLVCEEPSGRFFLAGIVSWGIGCAEARRPGV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 YARVTRLRDWILEATTKASMPLAPTMAPAPAAPSTAWPTSPESPVVSTPTKSMQALSTVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YARVTRLRDWILEATTKASMPLAPTMAPAPAAPSTAWPTSPESPVVSTPTKSMQALSTVP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 LDWVTVPKLQECGARPAMEKPTRVVGGFGAASGEVPWQVSLKEGSRHFCGATVVGDRWLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LDWVTVPKLQECGARPAMEKPTRVVGGFGAASGEVPWQVSLKEGSRHFCGATVVGDRWLL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 SAAHCFNHTKVEQVRAHLGTASLLGLGGSPVKIGLRRVVLHPLYNPGILDFDLAVLELAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SAAHCFNHTKVEQVRAHLGTASLLGLGGSPVKIGLRRVVLHPLYNPGILDFDLAVLELAS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 PLAFNKYIQPVCLPLAIQKFPVGRKCMISGWGNTQEGNATKPELLQKASVGIIDQKTCSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PLAFNKYIQPVCLPLAIQKFPVGRKCMISGWGNTQEGNATKPELLQKASVGIIDQKTCSV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 LYNFSLTDRMICAGFLEGKVDSCQGDSGGPLACEEAPGVFYLAGIVSWGIGCAQVKKPGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LYNFSLTDRMICAGFLEGKVDSCQGDSGGPLACEEAPGVFYLAGIVSWGIGCAQVKKPGV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 YTRITRLKGWILEIMSSQPLPMSPPSTTRMLATTSPRTTAGLTVPGATPSRPTPGAASRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YTRITRLKGWILEIMSSQPLPMSPPSTTRMLATTSPRTTAGLTVPGATPSRPTPGAASRV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 TGQPANSTLSAVSTTARGQTPFPDAPEATTHTQLPDCGLAPAALTRIVGGSAAGRGEWPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TGQPANSTLSAVSTTARGQTPFPDAPEATTHTQLPDCGLAPAALTRIVGGSAAGRGEWPW
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 QVSLWLRRREHRCGAVLVAERWLLSAAHCFDVYGDPKQWAAFLGTPFLSGAEGQLERVAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QVSLWLRRREHRCGAVLVAERWLLSAAHCFDVYGDPKQWAAFLGTPFLSGAEGQLERVAR
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910 920 930 940 950 960
pF1KB7 IYKHPFYNLYTLDYDVALLELAGPVRRSRLVRPICLPEPAPRPPDGTRCVITGWGSVREG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IYKHPFYNLYTLDYDVALLELAGPVRRSRLVRPICLPEPAPRPPDGTRCVITGWGSVREG
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pF1KB7 GSMARQLQKAAVRLLSEQTCRRFYPVQISSRMLCAGFPQGGVDSCSGDAGGPLACREPSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GSMARQLQKAAVRLLSEQTCRRFYPVQISSRMLCAGFPQGGVDSCSGDAGGPLACREPSG
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050
pF1KB7 RWVLTGVTSWGYGCGRPHFPGVYTRVAAVRGWIGQHIQE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RWVLTGVTSWGYGCGRPHFPGVYTRVAAVRGWIGQHIQE
1030 1040 1050
>>CCDS74856.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 (802 aa)
initn: 1275 init1: 588 opt: 843 Z-score: 693.8 bits: 139.7 E(32554): 2.5e-32
Smith-Waterman score: 958; 46.0% identity (73.7% similar) in 285 aa overlap (154-436:522-802)
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 SLAAYGTIVSAELTGRHKGPLAERDFKSGRCPGNSFSCGNSQCVTKVNPECDDQEDCSDG
: .:.: . .:: : ::.:: . :: ::
CCDS74 STCISLPKVCDGQPDCLNGSDEEQCQEGVPCGTFTFQCEDRSCVKKPNPQCDGRPDCRDG
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190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SDEAHCECGLQPAWRMAGRIVGGMEASPGEFPWQASLRENKEHFCGAAIINARWLVSAAH
::: ::.:::: ..::::: .: ::.::::::. .:.::.:.: ::...:::
CCDS74 SDEEHCDCGLQGP---SSRIVGGAVSSEGEWPWQASLQVRGRHICGGALIADRWVITAAH
560 570 580 590 600
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CFNE--FQDPTKWVAYVGATYLSGSEASTVRAQVVQIVKHPLYNADTADFDVAVLELTSP
::.: . . . :....: .. .. . : .: ... :: .. :. :.:::.:.: :
CCDS74 CFQEDSMASTVLWTVFLGKVWQNSRWPGEVSFKVSRLLLHPYHEEDSHDYDVALLQLDHP
610 620 630 640 650 660
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LPFGRHIQPVCLPAATHIFPPSKKCLISGWGYLKEDFLVKPEVLQKATVELLDQALCASL
. . ..:::::: .:.: :. .: :.::: :.: .. ..:::. :.:. : ::. .
CCDS74 VVRSAAVRPVCLPARSHFFEPGLHCWITGWGALREGGPIS-NALQKVDVQLIPQDLCSEV
670 680 690 700 710 720
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 YGHSLTDRMVCAGYLDGKVDSCQGDSGGPLVCEEPSGRFFLAGIVSWGIGCAEARRPGVY
: ...: ::.:::: :: :.:::::::::::. :::.::::.::::.::.. :::
CCDS74 YRYQVTPRMLCAGYRKGKKDACQGDSGGPLVCKALSGRWFLAGLVSWGLGCGRPNYFGVY
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430 440 450 460 470 480
pF1KB7 ARVTRLRDWILEATTKASMPLAPTMAPAPAAPSTAWPTSPESPVVSTPTKSMQALSTVPL
.:.: . .:: ...:
CCDS74 TRITGVISWIQQVVT
790 800
>>CCDS13941.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 (811 aa)
initn: 1275 init1: 588 opt: 843 Z-score: 693.7 bits: 139.7 E(32554): 2.5e-32
Smith-Waterman score: 958; 46.0% identity (73.7% similar) in 285 aa overlap (154-436:531-811)
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 SLAAYGTIVSAELTGRHKGPLAERDFKSGRCPGNSFSCGNSQCVTKVNPECDDQEDCSDG
: .:.: . .:: : ::.:: . :: ::
CCDS13 STCISLPKVCDGQPDCLNGSDEEQCQEGVPCGTFTFQCEDRSCVKKPNPQCDGRPDCRDG
510 520 530 540 550 560
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SDEAHCECGLQPAWRMAGRIVGGMEASPGEFPWQASLRENKEHFCGAAIINARWLVSAAH
::: ::.:::: ..::::: .: ::.::::::. .:.::.:.: ::...:::
CCDS13 SDEEHCDCGLQGP---SSRIVGGAVSSEGEWPWQASLQVRGRHICGGALIADRWVITAAH
570 580 590 600 610
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CFNE--FQDPTKWVAYVGATYLSGSEASTVRAQVVQIVKHPLYNADTADFDVAVLELTSP
::.: . . . :....: .. .. . : .: ... :: .. :. :.:::.:.: :
CCDS13 CFQEDSMASTVLWTVFLGKVWQNSRWPGEVSFKVSRLLLHPYHEEDSHDYDVALLQLDHP
620 630 640 650 660 670
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LPFGRHIQPVCLPAATHIFPPSKKCLISGWGYLKEDFLVKPEVLQKATVELLDQALCASL
. . ..:::::: .:.: :. .: :.::: :.: .. ..:::. :.:. : ::. .
CCDS13 VVRSAAVRPVCLPARSHFFEPGLHCWITGWGALREGGPIS-NALQKVDVQLIPQDLCSEV
680 690 700 710 720 730
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 YGHSLTDRMVCAGYLDGKVDSCQGDSGGPLVCEEPSGRFFLAGIVSWGIGCAEARRPGVY
: ...: ::.:::: :: :.:::::::::::. :::.::::.::::.::.. :::
CCDS13 YRYQVTPRMLCAGYRKGKKDACQGDSGGPLVCKALSGRWFLAGLVSWGLGCGRPNYFGVY
740 750 760 770 780 790
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 ARVTRLRDWILEATTKASMPLAPTMAPAPAAPSTAWPTSPESPVVSTPTKSMQALSTVPL
.:.: . .:: ...:
CCDS13 TRITGVISWIQQVVT
800 810
>>CCDS43129.2 TMPRSS7 gene_id:344805|Hs108|chr3 (717 aa)
initn: 1020 init1: 258 opt: 832 Z-score: 685.5 bits: 138.0 E(32554): 7.3e-32
Smith-Waterman score: 842; 43.1% identity (67.8% similar) in 311 aa overlap (139-431:405-709)
110 120 130 140 150
pF1KB7 LLQRGIRARLREHGISLAAYGTIVSAELTGRHKGPL---AERDFKSGR----------CP
:..::: . :: ..:: :
CCDS43 QRCDGVNDCFDESDELFCVSPQPACNTSSFRQHGPLICDGFRDCENGRDEQNCTQSIPCN
380 390 400 410 420 430
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 GNSFSCGNSQCVTKVNPECDDQEDCSDGSDEAHCECGLQPAWRMAGRIVGGMEASPGEFP
. .:.:::. : : : .:: :: ::::: : :. . . ::.:: .. : .:
CCDS43 NRTFKCGNDICFRKQNAKCDGTVDCPDGSDEEGCTCSRSSS--ALHRIIGGTDTLEGGWP
440 450 460 470 480 490
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 WQASLRENKEHFCGAAIINARWLVSAAHCF--NEFQDPTKWVAYVGATYLSGSEASTVRA
::.::. .:::..:. .::.:::::: :...::: :.:..: :..:. :. : .
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pF1KB7 QVVQIVKHPLYNADTADFDVAVLELTSPLP--FGRHIQPVCLPAATHIFPPSKKCLISGW
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: .: :::.: :::.::.::.: :: .:.::.::: ..:: :.:.:::::::
CCDS43 GRRHEADNKGSLVLQQAEVELIDQTLCVSTYG-IITSRMLCAGIMSGKRDACKGDSGGPL
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:.. : :...:.:::::: : .. ::::.::. . ::
CCDS43 SCRRKSDGKWILTGIVSWGHGSGRPNFPGVYTRVSNFVPWIHKYVPSLL
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pF1KB7 SKKCLISGWGYLKEDFLVKPEVLQKATVELLDQALCAS--LYGHSLTDRMVCAGYLDGKV
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CCDS73 L
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pF1KB7 GGMEASPGEFPWQASLRENKEHFCGAAIINARWLVSAAHCFNEFQDP--TKWVAYVGATY
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CCDS73 GGQSVAPGRWPWQASVALGFRHTCGGSVLAPRWVVTAAHCMHSFRLARLSSWRVHAGLVS
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pF1KB7 LSGSEASTVRAQVVQIVKHPLYNADTADFDVAVLELTSPLPFGRHIQPVCLPAATHIFPP
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CCDS73 HSAVRPHQ-GALVERIIPHPLYSAQNHDYDVALLRLQTALNFSDTVGAVCLPAKEQHFPK
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pF1KB7 SKKCLISGWGYLKEDFLVKPEVLQKATVELLDQALCAS--LYGHSLTDRMVCAGYLDGKV
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CCDS73 GSRCWVSGWGHTHPSHTYSSDMLQDTVVPLFSTQLCNSSCVYSGALTPRMLCAGYLDGRA
330 340 350 360 370 380
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pF1KB7 DSCQGDSGGPLVCEEPSGRFF-LAGIVSWGIGCAEARRPGVYARVTRLRDWILEATTKAS
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CCDS73 DACQGDSGGPLVC--PDGDTWRLVGVVSWGRGCAEPNHPGVYAKVAEFLDWIHDTAQDSL
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pF1KB7 MPLAPTMAPAPAAPSTAWPTSPESPVVSTPTKSMQALSTVPLDWVTVPKLQECGARPAME
CCDS73 L
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pF1KB7 RDFKSGRCPGNSFSCGNSQCVTKVNPECDDQEDCSDGSDEA-HC-ECGLQPAWRMAGRIV
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CCDS44 NLTDIKLNSSQEFAQLSPRLGGFLEEAWQPRNNCTSGQVVSLRCSECGARP---LASRIV
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pF1KB7 GGMEASPGEFPWQASLRENKEHFCGAAIINARWLVSAAHCFNEFQDP--TKWVAYVGATY
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CCDS44 GGQSVAPGRWPWQASVALGFRHTCGGSVLAPRWVVTAAHCMHSFRLARLSSWRVHAGLVS
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270 280 290 300 310 320
pF1KB7 LSGSEASTVRAQVVQIVKHPLYNADTADFDVAVLELTSPLPFGRHIQPVCLPAATHIFPP
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CCDS44 HSAVRPHQ-GALVERIIPHPLYSAQNHDYDVALLRLQTALNFSDTVGAVCLPAKEQHFPK
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330 340 350 360 370 380
pF1KB7 SKKCLISGWGYLKEDFLVKPEVLQKATVELLDQALCAS--LYGHSLTDRMVCAGYLDGKV
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CCDS44 GSRCWVSGWGHTHPSHTYSSDMLQDTVVPLFSTQLCNSSCVYSGALTPRMLCAGYLDGRA
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pF1KB7 DSCQGDSGGPLVCEEPSGRFF-LAGIVSWGIGCAEARRPGVYARVTRLRDWILEATTKAS
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CCDS44 DACQGDSGGPLVC--PDGDTWRLVGVVSWGRGCAEPNHPGVYAKVAEFLDWIHDTAQDSL
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CCDS44 L
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: :.
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pF1KB7 KASMPLAPTMAPAPAAPSTAWPTSPESPVVSTPTKSMQALSTVPLDWVTVPKLQECGARP
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CCDS41 CQQLGFESAHRTTEVAHRDFANSFSILRYNSTIQESLHR-SECPSQRYISLQCSHCGLR-
270 280 290 300 310 320
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 AMEKPTRVVGGFGAASGEVPWQVSLKEGSRHFCGATVVGDRWLLSAAHCFNHTK---VEQ
:: :.::: :.... ::::::. :. :.::.:.. .:.:.::::: :. .:
CCDS41 AMTG--RIVGGALASDSKWPWQVSLHFGTTHICGGTLIDAQWVLTAAHCFFVTREKVLEG
330 340 350 360 370
560 570 580 590 600 610
pF1KB7 VRAHLGTASLLGLGGSPVKIGLRRVVLHPLYNPGILDFDLAVLELASPLAFNKYIQPVCL
... ::..: : : .. ..... :. :.:.:...:..::... .:.:.::
CCDS41 WKVYAGTSNLHQL---PEAASIAEIIINSNYTDEEDDYDIALMRLSKPLTLSAHIHPACL
380 390 400 410 420 430
620 630 640 650 660 670
pF1KB7 PLAIQKFPVGRKCMISGWGNTQEGNATKPELLQKASVGIIDQKTCS--VLYNFSLTDRMI
:. : : ... : :.:.:.:.: . .:....:..:: : :. ..:. :: ::.
CCDS41 PMHGQTFSLNETCWITGFGKTRETDDKTSPFLREVQVNLIDFKKCNDYLVYDSYLTPRMM
440 450 460 470 480 490
680 690 700 710 720 730
pF1KB7 CAGFLEGKVDSCQGDSGGPLACEEAPGVFYLAGIVSWGIGCAQVKKPGVYTRITRLKGWI
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CCDS41 CAGDLRGGRDSCQGDSGGPLVCEQN-NRWYLAGVTSWGTGCGQRNKPGVYTKVTEVLPWI
500 510 520 530 540 550
740 750 760 770 780 790
pF1KB7 LEIMSSQPLPMSPPSTTRMLATTSPRTTAGLTVPGATPSRPTPGAASRVTGQPANSTLSA
: :.
CCDS41 YSKMESEVRFRKS
560
1059 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 08:33:50 2016 done: Sat Nov 5 08:33:51 2016
Total Scan time: 5.430 Total Display time: 0.160
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]