Result of FASTA (omim) for
pF1KB7318
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7318, 1181 aa
1>>>pF1KB7318 1181 - 1181 aa - 1181 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2807+/-0.000463; mu= 17.2859+/- 0.029
mean_var=94.5392+/-19.522, 0's: 0 Z-trim(111.2): 221 B-trim: 196 in 1/53
Lambda= 0.131907
statistics sampled from 19478 (19730) to 19478 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.581), E-opt: 0.2 (0.231), width: 16
Scan time: 11.200
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_703148 (OMIM: 609658) NACHT, LRR and PYD domain (1200) 6856 1316.3 0
NP_789792 (OMIM: 609665) NACHT, LRR and PYD domain (1093) 2357 460.1 3.4e-128
XP_011518346 (OMIM: 609665) PREDICTED: NACHT, LRR (1052) 1925 377.9 1.8e-103
NP_789781 (OMIM: 609659) NACHT, LRR and PYD domain (1048) 1495 296.1 7.8e-79
NP_001303929 (OMIM: 609659) NACHT, LRR and PYD dom (1029) 1087 218.4 1.8e-55
XP_006723138 (OMIM: 231090,609661) PREDICTED: NACH (1037) 1085 218.1 2.4e-55
XP_011524901 (OMIM: 231090,609661) PREDICTED: NACH (1037) 1085 218.1 2.4e-55
XP_006723139 (OMIM: 231090,609661) PREDICTED: NACH (1037) 1085 218.1 2.4e-55
NP_001120727 (OMIM: 231090,609661) NACHT, LRR and (1037) 1085 218.1 2.4e-55
XP_011524898 (OMIM: 231090,609661) PREDICTED: NACH (1065) 1085 218.1 2.4e-55
NP_001167554 (OMIM: 609364) NACHT, LRR and PYD dom (1039) 1062 213.7 5e-54
NP_001167553 (OMIM: 609364) NACHT, LRR and PYD dom (1040) 1062 213.7 5e-54
NP_060322 (OMIM: 609364) NACHT, LRR and PYD domain (1062) 1062 213.7 5.1e-54
NP_001167552 (OMIM: 609364) NACHT, LRR and PYD dom (1062) 1062 213.7 5.1e-54
NP_996611 (OMIM: 231090,609661) NACHT, LRR and PYD ( 980) 996 201.1 2.9e-50
XP_011524903 (OMIM: 231090,609661) PREDICTED: NACH (1008) 996 201.1 2.9e-50
XP_011518565 (OMIM: 173320) PREDICTED: ribonucleas ( 461) 804 164.4 1.5e-39
NP_976318 (OMIM: 173320) ribonuclease inhibitor [H ( 461) 804 164.4 1.5e-39
NP_976317 (OMIM: 173320) ribonuclease inhibitor [H ( 461) 804 164.4 1.5e-39
NP_976320 (OMIM: 173320) ribonuclease inhibitor [H ( 461) 804 164.4 1.5e-39
NP_976323 (OMIM: 173320) ribonuclease inhibitor [H ( 461) 804 164.4 1.5e-39
XP_011518560 (OMIM: 173320) PREDICTED: ribonucleas ( 461) 804 164.4 1.5e-39
XP_011518557 (OMIM: 173320) PREDICTED: ribonucleas ( 461) 804 164.4 1.5e-39
XP_011518559 (OMIM: 173320) PREDICTED: ribonucleas ( 461) 804 164.4 1.5e-39
NP_002930 (OMIM: 173320) ribonuclease inhibitor [H ( 461) 804 164.4 1.5e-39
NP_976322 (OMIM: 173320) ribonuclease inhibitor [H ( 461) 804 164.4 1.5e-39
XP_011518562 (OMIM: 173320) PREDICTED: ribonucleas ( 461) 804 164.4 1.5e-39
XP_011518563 (OMIM: 173320) PREDICTED: ribonucleas ( 461) 804 164.4 1.5e-39
XP_011518564 (OMIM: 173320) PREDICTED: ribonucleas ( 461) 804 164.4 1.5e-39
XP_011518561 (OMIM: 173320) PREDICTED: ribonucleas ( 461) 804 164.4 1.5e-39
NP_976319 (OMIM: 173320) ribonuclease inhibitor [H ( 461) 804 164.4 1.5e-39
XP_016873595 (OMIM: 173320) PREDICTED: ribonucleas ( 461) 804 164.4 1.5e-39
NP_976321 (OMIM: 173320) ribonuclease inhibitor [H ( 461) 804 164.4 1.5e-39
XP_016872742 (OMIM: 609650) PREDICTED: NACHT, LRR ( 730) 801 163.9 3.3e-39
NP_612202 (OMIM: 609650) NACHT, LRR and PYD domain ( 892) 801 164.0 3.9e-39
NP_001263629 (OMIM: 609650) NACHT, LRR and PYD dom ( 891) 795 162.8 8.6e-39
XP_016882953 (OMIM: 609648,611762) PREDICTED: NACH ( 923) 777 159.4 9.5e-38
XP_016882954 (OMIM: 609648,611762) PREDICTED: NACH ( 923) 777 159.4 9.5e-38
XP_016882956 (OMIM: 609648,611762) PREDICTED: NACH ( 923) 777 159.4 9.5e-38
XP_016882955 (OMIM: 609648,611762) PREDICTED: NACH ( 923) 777 159.4 9.5e-38
XP_016882952 (OMIM: 609648,611762) PREDICTED: NACH ( 923) 777 159.4 9.5e-38
NP_001264055 (OMIM: 609648,611762) NACHT, LRR and (1062) 777 159.4 1.1e-37
NP_653288 (OMIM: 609648,611762) NACHT, LRR and PYD (1061) 774 158.9 1.6e-37
NP_789790 (OMIM: 609663) NACHT, LRR and PYD domain ( 991) 759 156.0 1.1e-36
NP_604393 (OMIM: 609645) NACHT, LRR and PYD domain ( 994) 738 152.0 1.7e-35
XP_011525782 (OMIM: 609648,611762) PREDICTED: NACH (1005) 724 149.4 1.1e-34
NP_789780 (OMIM: 609660) NACHT, LRR and PYD domain (1043) 719 148.4 2.2e-34
XP_011525781 (OMIM: 609648,611762) PREDICTED: NACH (1005) 716 147.8 3.2e-34
NP_001264058 (OMIM: 609648,611762) NACHT, LRR and (1004) 706 145.9 1.2e-33
NP_001307986 (OMIM: 609660) NACHT, LRR and PYD dom (1036) 701 145.0 2.4e-33
>>NP_703148 (OMIM: 609658) NACHT, LRR and PYD domains-co (1200 aa)
initn: 6844 init1: 6844 opt: 6856 Z-score: 7049.1 bits: 1316.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7942; 98.4% identity (98.4% similar) in 1200 aa overlap (1-1181:1-1200)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKVAGGLELGAAALLSASPRALVTLSTGPTCSILPKNPLFPQNLSSQPCIKMEGDKSLTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_703 MKVAGGLELGAAALLSASPRALVTLSTGPTCSILPKNPLFPQNLSSQPCIKMEGDKSLTF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 SSYGLQWCLYELDKEEFQTFKELLKKKSSESTTCSIPQFEIENANVECLALLLHEYYGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_703 SSYGLQWCLYELDKEEFQTFKELLKKKSSESTTCSIPQFEIENANVECLALLLHEYYGAS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LAWATSISIFENMNLRTLSEKARDDMKRHSPEDPEATMTDQGPSKEKVPGISQAVQQDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_703 LAWATSISIFENMNLRTLSEKARDDMKRHSPEDPEATMTDQGPSKEKVPGISQAVQQDSA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220
pF1KB7 TAAETKEQEISQAMEQEGATAAETEEQ-------------------GHGGDTWDYKSHVM
::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
NP_703 TAAETKEQEISQAMEQEGATAAETEEQEISQAMEQEGATAAETEEQGHGGDTWDYKSHVM
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 TKFAEEEDVRRSFENTAADWPEMQTLAGAFDSDRWGFRPRTVVLHGKSGIGKSALARRIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_703 TKFAEEEDVRRSFENTAADWPEMQTLAGAFDSDRWGFRPRTVVLHGKSGIGKSALARRIV
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 LCWAQGGLYQGMFSYVFFLPVREMQRKKESSVTEFISREWPDSQAPVTEIMSRPERLLFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_703 LCWAQGGLYQGMFSYVFFLPVREMQRKKESSVTEFISREWPDSQAPVTEIMSRPERLLFI
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 IDGFDDLGSVLNNDTKLCKDWAEKQPPFTLIRSLLRKVLLPESFLIVTVRDVGTEKLKSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_703 IDGFDDLGSVLNNDTKLCKDWAEKQPPFTLIRSLLRKVLLPESFLIVTVRDVGTEKLKSE
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 VVSPRYLLVRGISGEQRIHLLLERGIGEHQKTQGLRAIMNNRELLDQCQVPAVGSLICVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_703 VVSPRYLLVRGISGEQRIHLLLERGIGEHQKTQGLRAIMNNRELLDQCQVPAVGSLICVA
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 LQLQDVVGESVAPFNQTLTGLHAAFVFHQLTPRGVVRRCLNLEERVVLKRFCRMAVEGVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_703 LQLQDVVGESVAPFNQTLTGLHAAFVFHQLTPRGVVRRCLNLEERVVLKRFCRMAVEGVW
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 NRKSVFDGDDLMVQGLGESELRALFHMNILLPDSHCEEYYTFFHLSLQDFCAALYYVLEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_703 NRKSVFDGDDLMVQGLGESELRALFHMNILLPDSHCEEYYTFFHLSLQDFCAALYYVLEG
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KB7 LEIEPALCPLYVEKTKRSMELKQAGFHIHSLWMKRFLFGLVSEDVRRPLEVLLGCPVPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_703 LEIEPALCPLYVEKTKRSMELKQAGFHIHSLWMKRFLFGLVSEDVRRPLEVLLGCPVPLG
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KB7 VKQKLLHWVSLLGQQPNATTPGDTLDAFHCLFETQDKEFVRLALNSFQEVWLPINQNLDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_703 VKQKLLHWVSLLGQQPNATTPGDTLDAFHCLFETQDKEFVRLALNSFQEVWLPINQNLDL
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KB7 IASSFCLQHCPYLRKIRVDVKGIFPRDESAEACPVVPLWMRDKTLIEEQWEDFCSMLGTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_703 IASSFCLQHCPYLRKIRVDVKGIFPRDESAEACPVVPLWMRDKTLIEEQWEDFCSMLGTH
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810 820
pF1KB7 PHLRQLDLGSSILTERAMKTLCAKLRHPTCKIQTLMFRNAQITPGVQHLWRIVMANRNLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_703 PHLRQLDLGSSILTERAMKTLCAKLRHPTCKIQTLMFRNAQITPGVQHLWRIVMANRNLR
790 800 810 820 830 840
830 840 850 860 870 880
pF1KB7 SLNLGGTHLKEEDVRMACEALKHPKCLLESLRLDCCGLTHACYLKISQILTTSPSLKSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_703 SLNLGGTHLKEEDVRMACEALKHPKCLLESLRLDCCGLTHACYLKISQILTTSPSLKSLS
850 860 870 880 890 900
890 900 910 920 930 940
pF1KB7 LAGNKVTDQGVMPLSDALRVSQCALQKLILEDCGITATGCQSLASALVSNRSLTHLCLSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_703 LAGNKVTDQGVMPLSDALRVSQCALQKLILEDCGITATGCQSLASALVSNRSLTHLCLSN
910 920 930 940 950 960
950 960 970 980 990 1000
pF1KB7 NSLGNEGVNLLCRSMRLPHCSLQRLMLNQCHLDTAGCGFLALALMGNSWLTHLSLSMNPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_703 NSLGNEGVNLLCRSMRLPHCSLQRLMLNQCHLDTAGCGFLALALMGNSWLTHLSLSMNPV
970 980 990 1000 1010 1020
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB7 EDNGVKLLCEVMREPSCHLQDLELVKCHLTAACCESLSCVISRSRHLKSLDLTDNALGDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_703 EDNGVKLLCEVMREPSCHLQDLELVKCHLTAACCESLSCVISRSRHLKSLDLTDNALGDG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KB7 GVAALCEGLKQKNSVLARLGLKACGLTSDCCEALSLALSCNRHLTSLNLVQNNFSPKGMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_703 GVAALCEGLKQKNSVLARLGLKACGLTSDCCEALSLALSCNRHLTSLNLVQNNFSPKGMM
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KB7 KLCSAFACPTSNLQIIGLWKWQYPVQIRKLLEEVQLLKPRVVIDGSWHSFDEDDRYWWKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_703 KLCSAFACPTSNLQIIGLWKWQYPVQIRKLLEEVQLLKPRVVIDGSWHSFDEDDRYWWKN
1150 1160 1170 1180 1190 1200
>>NP_789792 (OMIM: 609665) NACHT, LRR and PYD domains-co (1093 aa)
initn: 2108 init1: 1282 opt: 2357 Z-score: 2422.6 bits: 460.1 E(85289): 3.4e-128
Smith-Waterman score: 2475; 38.2% identity (67.2% similar) in 1133 aa overlap (53-1179:3-1091)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 VTLSTGPTCSILPKNPLFPQNLSSQPCIKMEGDKSLTFSSYGLQWCLYELDKEEFQTFKE
....: : ..:: : ::.:::..:::
NP_789 MADSSSSSFFPDFGLLLYLEELNKEELNTFK-
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 LLKKKSSESTTCSIPQFEIENANVECLALLLHEYYGASLAWATSISIFENMNLRTLSEKA
:. :.. : : :...: : :: :...:: . ::..:..:: .:::. : :.:
NP_789 LFLKETMEPEHGLTPWNEVKKARREDLANLMKKYYPGEKAWSVSLKIFGKMNLKDLCERA
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 RDDMKRHSPEDPEATMTDQGPSKEKVPGISQAVQQDSATAAETKEQEISQAMEQEGATAA
::.. .:.. :.: :.::.:.. .:. .: :
NP_789 ----------------------KEEINWSAQTIGPDDAKAGETQEDQ--EAVLGDG-TEY
100 110 120
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 ETEEQGHGGDTWDYKSHVMTKFAEEEDVRRSFENTAADWPEMQTLAGAFDSD-RWGFRPR
... . . ::: :: . .. :: :.. :. . . : :: : . : .:.
NP_789 RNRIKEKFCITWDKKSLA----GKPED----FHHGIAE-KDRKLLEHLFDVDVKTGAQPQ
130 140 150 160 170
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 TVVLHGKSGIGKSALARRIVLCWAQGGLYQGMFSYVFFLPVREMQRKKESSVTEFISREW
:::.: .:.::..:.:. .: ::.:.::: :.:::.: ::... :: : ...::..:
NP_789 IVVLQGAAGVGKTTLVRKAMLDWAEGSLYQQRFKYVFYLNGREINQLKERSFAQLISKDW
180 190 200 210 220 230
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 PDSQAPVTEIMSRPERLLFIIDGFDDLGSVLNN-DTKLCKDWAEKQPPFTLIRSLLRKVL
:....:. ::: .: ::::::.::.:. .... . ::.::....: :. ::::::.
NP_789 PSTEGPIEEIMYQPSSLLFIIDSFDELNFAFEEPEFALCEDWTQEHPVSFLMSSLLRKVM
240 250 260 270 280 290
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 LPESFLIVTVRDVGTEKLKSEVVSPRYLLVRGISGEQRIHLLLERGIGEHQKTQGLRAIM
:::. :.::.: . ...::. . . .:. . :.: . : . . . .. . . ..
NP_789 LPEASLLVTTRLTTSKRLKQLLKNHHYVELLGMSEDAREEYIYQFFEDKRWAMKVFSSLK
300 310 320 330 340 350
450 460 470 480 490 500
pF1KB7 NNRELLDQCQVPAVGSLICVALQLQDVVGESVAPFNQTLTGLHAAFVFHQLTPRGVVRRC
.:. :...:::: : :. :. : : .:. :: :.: . .. .:: :
NP_789 SNEMLFSMCQVPLVCWAACTCLKQQMEKGGDVTLTCQTTTALFTCYISSLFTP--VDGGS
360 370 380 390 400 410
510 520 530 540 550 560
pF1KB7 LNLEERVVLKRFCRMAVEGVWNRKSVFDGDDLMVQGLGESELRALFHMNILLPDSHCEEY
.: ... :.:.:..:..:.:. :: ..: :: .:.. ... ::. :.. :.
NP_789 PSLPNQAQLRRLCQVAAKGIWTMTYVFYRENLRRLGLTQSDVSSFMDSNIIQKDAEYENC
420 430 440 450 460 470
570 580 590 600 610
pF1KB7 YTFFHLSLQDFCAALYYVLEG-LEIEPALCPLYVEKTKRSMELKQAGFH-IHSLWMKRFL
:.: :: .:.: ::..:.:.: : : . : : :. :...... : :: ::
NP_789 YVFTHLHVQEFFAAMFYMLKGSWEAGNPSCQPF-EDLK-SL-LQSTSYKDPHLTQMKCFL
480 490 500 510 520 530
620 630 640 650 660 670
pF1KB7 FGLVSEDVRRPLEVLLGCPVPLGVKQKLLHWVSLLGQQPNATTPGDTLDAFHCLFETQDK
:::..:: . :: ..: . : .:.:::. . .::.. . . :. ::::.:::::
NP_789 FGLLNEDRVKQLERTFNCKMSLKIKSKLLQCMEVLGNSDYSPSQLGFLELFHCLYETQDK
540 550 560 570 580 590
680 690 700 710 720 730
pF1KB7 EFVRLALNSFQEVWLPINQNLDLIASSFCLQHCPYLRKIRVDVKGIFPRDESAEACPVVP
:. :. : .: . : ... :..:::::.:: :: ::..: .: . . :.
NP_789 AFISQAMRCFPKVAINICEKIHLLVSSFCLKHCRCLRTIRLSVTVVFEKKILKTSLPT-N
600 610 620 630 640 650
740 750 760 770 780 790
pF1KB7 LWMRDKTLIEEQWEDFCSMLGTHPHLRQLDLGSSILTERAMKTLCAKLRHPTCKIQTLMF
: :. : . :.:.::.: :. :::.::: : : . ::. : .::::.::.: :..
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