Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7319
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7319, 839 aa
1>>>pF1KB7319 839 - 839 aa - 839 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3698+/-0.00105; mu= 20.9084+/- 0.063
mean_var=74.1290+/-15.297, 0's: 0 Z-trim(104.2): 60 B-trim: 0 in 0/47
Lambda= 0.148964
statistics sampled from 7704 (7758) to 7704 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.588), E-opt: 0.2 (0.238), width: 16
Scan time: 3.130
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS187.1 TAS1R2 gene_id:80834|Hs108|chr1 ( 839) 5677 1230.1 0
CCDS81.1 TAS1R1 gene_id:80835|Hs108|chr1 ( 841) 1841 405.7 1.7e-112
CCDS30556.1 TAS1R3 gene_id:83756|Hs108|chr1 ( 852) 1401 311.2 5e-84
CCDS82.1 TAS1R1 gene_id:80835|Hs108|chr1 ( 587) 937 211.3 3.9e-54
CCDS2834.1 GRM2 gene_id:2912|Hs108|chr3 ( 872) 814 185.0 4.8e-46
CCDS5600.1 GRM3 gene_id:2913|Hs108|chr7 ( 879) 801 182.2 3.4e-45
CCDS3010.1 CASR gene_id:846|Hs108|chr3 (1078) 772 176.0 3e-43
CCDS54632.1 CASR gene_id:846|Hs108|chr3 (1088) 667 153.5 1.9e-36
CCDS8283.1 GRM5 gene_id:2915|Hs108|chr11 (1180) 666 153.3 2.3e-36
CCDS44694.1 GRM5 gene_id:2915|Hs108|chr11 (1212) 666 153.3 2.4e-36
CCDS59011.1 GRM4 gene_id:2914|Hs108|chr6 ( 743) 658 151.4 5.2e-36
CCDS59010.1 GRM4 gene_id:2914|Hs108|chr6 ( 779) 658 151.5 5.4e-36
CCDS47497.1 GRM1 gene_id:2911|Hs108|chr6 ( 906) 654 150.6 1.1e-35
CCDS47696.1 GRM8 gene_id:2918|Hs108|chr7 ( 908) 654 150.6 1.1e-35
CCDS5794.1 GRM8 gene_id:2918|Hs108|chr7 ( 908) 654 150.6 1.1e-35
CCDS64548.1 GRM1 gene_id:2911|Hs108|chr6 ( 908) 654 150.6 1.1e-35
CCDS5209.1 GRM1 gene_id:2911|Hs108|chr6 (1194) 654 150.7 1.4e-35
CCDS4787.1 GRM4 gene_id:2914|Hs108|chr6 ( 912) 618 142.9 2.4e-33
CCDS69184.1 GPRC6A gene_id:222545|Hs108|chr6 ( 855) 605 140.1 1.6e-32
CCDS5112.1 GPRC6A gene_id:222545|Hs108|chr6 ( 926) 605 140.1 1.7e-32
CCDS43042.1 GRM7 gene_id:2917|Hs108|chr3 ( 915) 580 134.7 6.9e-31
CCDS59012.1 GRM4 gene_id:2914|Hs108|chr6 ( 796) 565 131.5 5.8e-30
CCDS4442.1 GRM6 gene_id:2916|Hs108|chr5 ( 877) 546 127.4 1.1e-28
CCDS69185.1 GPRC6A gene_id:222545|Hs108|chr6 ( 751) 534 124.8 5.6e-28
CCDS75432.1 GRM4 gene_id:2914|Hs108|chr6 ( 865) 424 101.2 8.1e-21
>>CCDS187.1 TAS1R2 gene_id:80834|Hs108|chr1 (839 aa)
initn: 5677 init1: 5677 opt: 5677 Z-score: 6588.5 bits: 1230.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5677; 100.0% identity (100.0% similar) in 839 aa overlap (1-839:1-839)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGPRAKTISSLFFLLWVLAEPAENSDFYLPGDYLLGGLFSLHANMKGIVHLNFLQVPMCK
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CCDS18 MGPRAKTISSLFFLLWVLAEPAENSDFYLPGDYLLGGLFSLHANMKGIVHLNFLQVPMCK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EYEVKVIGYNLMQAMRFAVEEINNDSSLLPGVLLGYEIVDVCYISNNVQPVLYFLAHEDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 EYEVKVIGYNLMQAMRFAVEEINNDSSLLPGVLLGYEIVDVCYISNNVQPVLYFLAHEDN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LLPIQEDYSNYISRVVAVIGPDNSESVMTVANFLSLFLLPQITYSAISDELRDKVRFPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 LLPIQEDYSNYISRVVAVIGPDNSESVMTVANFLSLFLLPQITYSAISDELRDKVRFPAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LRTTPSADHHIEAMVQLMLHFRWNWIIVLVSSDTYGRDNGQLLGERVARRDICIAFQETL
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CCDS18 LRTTPSADHHIEAMVQLMLHFRWNWIIVLVSSDTYGRDNGQLLGERVARRDICIAFQETL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 PTLQPNQNMTSEERQRLVTIVDKLQQSTARVVVVFSPDLTLYHFFNEVLRQNFTGAVWIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 PTLQPNQNMTSEERQRLVTIVDKLQQSTARVVVVFSPDLTLYHFFNEVLRQNFTGAVWIA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SESWAIDPVLHNLTELRHLGTFLGITIQSVPIPGFSEFREWGPQAGPPPLSRTSQSYTCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 SESWAIDPVLHNLTELRHLGTFLGITIQSVPIPGFSEFREWGPQAGPPPLSRTSQSYTCN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 QECDNCLNATLSFNTILRLSGERVVYSVYSAVYAVAHALHSLLGCDKSTCTKRVVYPWQL
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CCDS18 QECDNCLNATLSFNTILRLSGERVVYSVYSAVYAVAHALHSLLGCDKSTCTKRVVYPWQL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 LEEIWKVNFTLLDHQIFFDPQGDVALHLEIVQWQWDRSQNPFQSVASYYPLQRQLKNIQD
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CCDS18 LEEIWKVNFTLLDHQIFFDPQGDVALHLEIVQWQWDRSQNPFQSVASYYPLQRQLKNIQD
430 440 450 460 470 480
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pF1KB7 ISWHTINNTIPMSMCSKRCQSGQKKKPVGIHVCCFECIDCLPGTFLNHTEDEYECQACPN
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CCDS18 ISWHTINNTIPMSMCSKRCQSGQKKKPVGIHVCCFECIDCLPGTFLNHTEDEYECQACPN
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pF1KB7 NEWSYQSETSCFKRQLVFLEWHEAPTIAVALLAALGFLSTLAILVIFWRHFQTPIVRSAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 NEWSYQSETSCFKRQLVFLEWHEAPTIAVALLAALGFLSTLAILVIFWRHFQTPIVRSAG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 GPMCFLMLTLLLVAYMVVPVYVGPPKVSTCLCRQALFPLCFTICISCIAVRSFQIVCAFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 GPMCFLMLTLLLVAYMVVPVYVGPPKVSTCLCRQALFPLCFTICISCIAVRSFQIVCAFK
610 620 630 640 650 660
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pF1KB7 MASRFPRAYSYWVRYQGPYVSMAFITVLKMVIVVIGMLATGLSPTTRTDPDDPKITIVSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 MASRFPRAYSYWVRYQGPYVSMAFITVLKMVIVVIGMLATGLSPTTRTDPDDPKITIVSC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 NPNYRNSLLFNTSLDLLLSVVGFSFAYMGKELPTNYNEAKFITLSMTFYFTSSVSLCTFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 NPNYRNSLLFNTSLDLLLSVVGFSFAYMGKELPTNYNEAKFITLSMTFYFTSSVSLCTFM
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KB7 SAYSGVLVTIVDLLVTVLNLLAISLGYFGPKCYMILFYPERNTPAYFNSMIQGYTMRRD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 SAYSGVLVTIVDLLVTVLNLLAISLGYFGPKCYMILFYPERNTPAYFNSMIQGYTMRRD
790 800 810 820 830
>>CCDS81.1 TAS1R1 gene_id:80835|Hs108|chr1 (841 aa)
initn: 1349 init1: 583 opt: 1841 Z-score: 2133.2 bits: 405.7 E(32554): 1.7e-112
Smith-Waterman score: 1841; 37.5% identity (65.5% similar) in 833 aa overlap (16-837:19-837)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGPRAKTISSLFFLLWVLA-EPAENS-DFYLPGDYLLGGLFSLHANMKGIVHLNFLQ
:..: . .:.: :: :::::::.::: ::.. . : .
CCDS81 MLLCTARLVGLQLLISCCWAFACHSTESSPDFTLPGDYLLAGLFPLHSGCLQVRHRP--E
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 VPMC-KEYEVKVIGYNLMQAMRFAVEEINNDSSLLPGVLLGYEIVDVCYISNNVQPVLYF
: .: . . ::.:.::::..::::::...:::.. :::.. ::: : :: .:
CCDS81 VTLCDRSCSFNEHGYHLFQAMRLGVEEINNSTALLPNITLGYQLYDVCSDSANVYATLRV
60 70 80 90 100 110
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pF1KB7 LAHE-DNLLPIQEDYSNYISRVVAVIGPDNSESVMTVANFLSLFLLPQITYSAISDELRD
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CCDS81 LSLPGQHHIELQGDLLHYSPTVLAVIGPDSTNRAATTAALLSPFLVPMISYAASSETLSV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 KVRFPALLRTTPSADHHIEAMVQLMLHFRWNWIIVLVSSDTYGRDNGQLLGERVARRDIC
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CCDS81 KRQYPSFLRTIPNDKYQVETMVLLLQKFGWTWISLVGSSDDYGQLGVQALENQATGQGIC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 IAFQETLPTLQPNQNMTSEERQRLVTIVDKLQQSTARVVVVFSPDLTLYHFFNEVLRQNF
:::.. .: . ....::.. .. .: :. : :::::: ::. :. :.
CCDS81 IAFKDIMPF----SAQVGDERMQ--CLMRHLAQAGATVVVVFSSRQLARVFFESVVLTNL
240 250 260 270 280 290
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pF1KB7 TGAVWIASESWAIDPVLHNLTELRHLGTFLGITIQSVPIPGFSEFREWGPQA---GPPPL
:: ::.:::.::.. . .. ....: ::..::. .::.. :.: .: .: :
CCDS81 TGKVWVASEAWALSRHITGVPGIQRIGMVLGVAIQKRAVPGLKAFEEAYARADKKAPRPC
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 SRTSQSYTCNQECDNCLNATLSFNTILRLSGERVVYSVYSAVYAVAHALHSLLGCDKSTC
. : . :: : .: :. . .:..: :::::::.::.:::: ...:
CCDS81 HKGSWC-SSNQLCRECQAFMAHTMPKLKAFSMSSAYNAYRAVYAVAHGLHQLLGCASGAC
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KB7 TKRVVYPWQLLEEIWKVNFTLLDHQIFFDPQGDVALHLEIVQWQWDRSQNPFQSVAS--Y
.. ::::::::.: ::.: : . :. . : .:. :.:. . : ..: .
CCDS81 SRGRVYPWQLLEQIHKVHFLLHKDTVAFNDNRDPLSSYNIIAWDWNGPKWTFTVLGSSTW
420 430 440 450 460 470
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pF1KB7 YPLQRQLKNIQDISWHTINNTIPMSMCSKRCQSGQKKKPVGIHVCCFECIDCLPGTFLNH
:.: .. : :.:: .: .: :.::. : :... .:.: :::::. : :::::.
CCDS81 SPVQLNI-NETKIQWHGKDNQVPKSVCSSDCLEGHQRVVTGFHHCCFECVPCGAGTFLNK
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 TEDEYECQACPNNEWSYQSETSCFKRQLVFLEWHEAPTIAVALLAALGFLSTLAILVIFW
. : :.:: : ..::. .. .:: : .::: .: . .. .: .: :. .:
CCDS81 S-DLYRCQPCGKEEWAPEGSQTCFPRTVVFLALREHTSWVLLAANTLLLLLLLGTAGLFA
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pF1KB7 RHFQTPIVRSAGGPMCFLMLTLLLVAYMVVPVYVGPPKVSTCLCRQALFPLCFTICISCI
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CCDS81 WHLDTPVVRSAGGRLCFLMLGSLAAGSGSLYGFFGEPTRPACLLRQALFALGFTIFLSCL
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pF1KB7 AVRSFQIVCAFKMASRFPRAYSYWVRYQGPYVSMAFITVLKMVIVVIGMLATGLSPTTRT
.:::::.. ::.... : : ::. .: . . . .. ...: . ... :. :
CCDS81 TVRSFQLIIIFKFSTKVPTFYHAWVQNHGAGLFVMISSAAQLLICLTWLVVWTPLPA-RE
650 660 670 680 690 700
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pF1KB7 DPDDPKITIVSCNPNYRNSLLFNTSL--DLLLSVVGFSFAYMGKELPTNYNEAKFITLSM
:..... :. . ::: : .. . :::. .:. .:.::.:: :::::: .:.:.
CCDS81 YQRFPHLVMLECTET--NSLGFILAFLYNGLLSISAFACSYLGKDLPENYNEAKCVTFSL
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pF1KB7 TFYFTSSVSLCTFMSAYSGVLVTIVDLLVTVLNLLAISLGYFGPKCYMILFYPERNTPAY
: :.: ... : :.:.: . ..... . .: . ::: ::::.:: :. :. .
CCDS81 LFNFVSWIAFFTTASVYDGKYLPAANMMAGLSSLSSGFGGYFLPKCYVILCRPDLNSTEH
770 780 790 800 810 820
830
pF1KB7 FNSMIQGYTMRRD
:.. :: :: :
CCDS81 FQASIQDYTRRCGST
830 840
>>CCDS30556.1 TAS1R3 gene_id:83756|Hs108|chr1 (852 aa)
initn: 1078 init1: 314 opt: 1401 Z-score: 1622.0 bits: 311.2 E(32554): 5e-84
Smith-Waterman score: 1401; 30.0% identity (61.5% similar) in 847 aa overlap (1-827:2-829)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGPRAKTISSLFFLLWVLAEPAENS------DFYLPGDYLLGGLFSL-HANMKGIVHLN
.:: . .: ::.: .:. .. .. . :::.::::: : .:. :. .
CCDS30 MLGPAVLGLS-----LWALLHPGTGAPLCLSQQLRMKGDYVLGGLFPLGEAEEAGLRSRT
10 20 30 40 50
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pF1KB7 FLQVPMCKEYEVKVIGYNLMQAMRFAVEEINNDSSLLPGVLLGYEIVDVCYISN-NVQPV
. :.: .. . . . : ::..::::::: :.::::. :::.. :.: ..:
CCDS30 RPSSPVCTRFSSNGLLWAL--AMKMAVEEINNKSDLLPGLRLGYDLFDTCSEPVVAMKPS
60 70 80 90 100 110
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pF1KB7 LYFLAHEDNL-LPIQEDYSNYISRVVAVIGPDNSESVMTVANFLSLFLLPQITYSAISDE
:.:::. . . .:..: ::.::::: .:: .:....:.:.::.::..:.: .
CCDS30 LMFLAKAGSRDIAAYCNYTQYQPRVLAVIGPHSSELAMVTGKFFSFFLMPQVSYGASMEL
120 130 140 150 160 170
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pF1KB7 LRDKVRFPALLRTTPSADHHIEAMVQLMLHFRWNWIIVLVSSDTYGRDNGQLLGERVARR
: . ::...::.:: .. : ..:. .: :::. .: :.: :::.. .... .: :
CCDS30 LSARETFPSFFRTVPSDRVQLTAAAELLQEFGWNWVAALGSDDEYGRQGLSIFSALAAAR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 DICIAFQETLPTLQPNQNMTSEERQRLVTIVDKLQQSTARVVVVFSPDLTLYHFFNEVLR
:::: . .: . ... . .. .. ...::...::..:. . . .:: .
CCDS30 GICIAHEGLVPLPRADDSRLG----KVQDVLHQVNQSSVQVVLLFASVHAAHALFNYSIS
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KB7 QNFTGAVWIASESWAIDPVLHNLTELRHLGTFLGITIQSVPIPGFSEFREWGPQAGPPP-
. .. ::.:::.: . .. .: . ..:: ::. ... . : .. . . :
CCDS30 SRLSPKVWVASEAWLTSDLVMGLPGMAQMGTVLGFLQRGAQLHEFPQYVKTHLALATDPA
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 ----LSRTSQSY---TCNQECDNCLNATLSFNTILRLSGERVVYSVYSAVYAVAHALHSL
:.. :. . .:.: .: ::. :. :. ... .:::.:::.::.:::.
CCDS30 FCSALGEREQGLEEDVVGQRCPQCDCITLQ-NVSAGLNHHQT-FSVYAAVYSVAQALHNT
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 LGCDKSTC-TKRVVYPWQLLEEIWKVNFTLLDHQIFFDPQGDVALHLEIVQWQWDRSQNP
: :. : : .. : ::::::......: . . :: .:.: .. .. : :. :
CCDS30 LQCNASGCPAQDPVKPWQLLENMYNLTFHVGGLPLRFDSSGNVDMEYDLKLWVWQGSVPR
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 FQSVASYYPLQRQLKNIQDISWHTINNTIPMSMCSKRCQSGQKKKPVGIHVCCFECIDCL
...:. . : . : ::: .: :.: ::..:: :: .. :.: ::..:.::
CCDS30 LHDVGRFNGSLRTER--LKIRWHTSDNQKPVSRCSRQCQEGQVRRVKGFHSCCYDCVDCE
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 PGTFLNHTEDEYECQACPNNEWSYQSETSCFKRQLVFLEWHEAPTIAVALLAALGFLSTL
:.. .. :. : : ..::: . : ::.:. :: : : .. . :: .:.. .:
CCDS30 AGSY-RQNPDDIACTFCGQDEWSPERSTRCFRRRSRFLAWGEPAVLLLLLLLSLALGLVL
530 540 550 560 570 580
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pF1KB7 AILVIFWRHFQTPIVRSAGGPM-CFLMLTLLLVAYMVVPVYVGPPKVSTCLCRQALFPLC
: : .: .: ..:.:...:::. :: .. : :: :. .. : :. . :: .: : :
CCDS30 AALGLFVHHRDSPLVQASGGPLACFGLVCLGLVCLSVL-LFPGQPSPARCLAQQPLSHLP
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pF1KB7 FTICISCIAVRSFQIVCAFKMASRFPRAYSYWVRYQGPYVSMAFITVLKMVIVVIGMLAT
.: :.: . ... .: .. . : .: ::.. .. . .. . ... .
CCDS30 LTGCLSTLFLQAAEIFVESELPLSWADRLSGCLR--GPWAWLVVLLAMLVEVALCTWYLV
650 660 670 680 690 700
710 720 730 740 750
pF1KB7 GLSPTTRTDPDD-PKITIVSCNPNYRNSLLFNTSLDLLLSVVGFSFAYMGKELPTNYNEA
.. : . :: : ..: : :. . . . :. . : ... . : ::.:
CCDS30 AFPPEVVTDWHMLPTEALVHCRTRSWVSFGLAHATNATLAFLCFLGTFLVRSQPGCYNRA
710 720 730 740 750 760
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pF1KB7 KFITLSMTFYFTSSVSLCTFMSAYSGVLVTIVDLLVTVLNLLAISLGYFGPKCYMILFYP
. .:..: :: . ::. ... . :: :.. . .: .:.: .. :.::... :
CCDS30 RGLTFAMLAYFITWVSFVPLLANVQVVLRPAVQMGALLLCVLGILAAFHLPRCYLLMRQP
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. .: :: :.:: .: .: :: ::.:...: .:...: ... : .. .... :...
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CCDS56 DVILVILCTVYAFKTRKCPENFNEAKFIGFTM---YTTCIIWLAFLPIF---YVTSSDYR
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CCDS56 VQTTTMCISVSLSGFVVLGCLFAPKVHIILFQPQKNVVTHRLHLNRFSVSGTGTTYSQSS
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CCDS56 ASTYVPTVCNGREVLDSTTSSL
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CCDS30 ECIRYNFR--GFRWLQAMIFAIEEINSSPALLPNLTLGYRIFDTCNTVSKALEATLSFVA
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CCDS30 QNKIDSLNLDEFCNCSEHIPSTIAVVGATGSGVSTAVANLLGLFYIPQVSYASSSRLLSN
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CCDS30 KNQFKSFLRTIPNDEHQATAMADIIEYFRWNWVGTIAADDDYGRPGIEKFREEAEERDIC
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CCDS30 IDFSELI-----SQYSDEEEIQHVVEVI---QNSTAKVIVVFSSGPDLEPLIKEIVRRNI
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CCDS30 TGKIWLASEAWASSSLIAMPQYFHVVGGTIGFALKAGQIPGFREFLKKVHPRKSVHNGFA
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pF1KB7 -----------------GPPPLS-----------RTSQSYTCNQE-CDNCLNATLSFNTI
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CCDS30 KEFWEETFNCHLQEGAKGPLPVDTFLRGHEESGDRFSNSSTAFRPLCTGDENISSVETPY
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CCDS30 IDYTHLRISYNVYLAVYSIAHALQDIYTCLPGRGLFTNGSCADIKKVEAWQVLKHLRHLN
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CCDS30 FTNNMGEQVTFDECGDLVGNYSIINWHLSPEDGSIVFKEVG-YYNVYAKKGERLFINEEK
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pF1KB7 ISWHTINNTIPMSMCSKRCQSGQKKKPV-GIHVCCFECIDCLPGTFLNHTEDEYECQACP
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CCDS30 ILWSGFSREVPFSNCSRDCLAGTRKGIIEGEPTCCFECVECPDGEYSDET-DASACNKCP
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CCDS30 DDFWSNENHTSCIAKEIEFLSWTEPFGIALTLFAVLGIFLTAFVLGVFIKFRNTPIVKAT
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CCDS30 NRELSYLLLFSLLCCFSSSLFFIGEPQDWTCRLRQPAFGISFVLCISCILVKTNRVLLVF
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CCDS30 E--AKIPTSFHRKWWGLNLQFLLVFLCTFMQIVICVI-WLYTAPPSSYRNQELEDEIIFI
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CCDS44 KQIYCYLQRIGIGLSPAMSYSALVTKTNRIARILAGSKKKICTKKPRFMS-----ACAQL
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CCDS44 VIAFILICIQLGIIVALFIME-PPDIMHDYPSIREVYLICNTTNLGVVTPLGYNGLLILS
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CCDS44 CTF-YAFKTRNVPANFNEAKYIAFTM---YTTCIIWLAFVPIYFGSNYKIITMCFSVSLS
760 770 780 790 800
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pF1KB7 LAISLG-YFGPKCYMILFYPERNTPAYFNSMIQGYTMRRD
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CCDS44 ATVALGCMFVPKVYIILAKPERNVRSAFTTSTVVRMHVGDGKSSSAASRSSSLVNLWKRR
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839 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 08:37:44 2016 done: Sat Nov 5 08:37:45 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]