Result of FASTA (omim) for
pF1KB7319
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7319, 839 aa
1>>>pF1KB7319 839 - 839 aa - 839 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8745+/-0.000453; mu= 23.7189+/- 0.028
mean_var=77.2629+/-15.950, 0's: 0 Z-trim(110.5): 138 B-trim: 625 in 1/52
Lambda= 0.145911
statistics sampled from 18675 (18838) to 18675 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.566), E-opt: 0.2 (0.221), width: 16
Scan time: 10.740
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_689418 (OMIM: 606226) taste receptor type 1 mem ( 839) 5677 1205.6 0
NP_619642 (OMIM: 606225) taste receptor type 1 mem ( 841) 1841 398.1 8.8e-110
XP_016857891 (OMIM: 606225) PREDICTED: taste recep ( 843) 1749 378.7 6e-104
XP_011540505 (OMIM: 606225) PREDICTED: taste recep ( 763) 1715 371.5 8e-102
NP_689414 (OMIM: 605865) taste receptor type 1 mem ( 852) 1402 305.7 5.9e-82
XP_011540508 (OMIM: 606225) PREDICTED: taste recep ( 580) 1122 246.6 2.5e-64
XP_016857924 (OMIM: 605865) PREDICTED: taste recep ( 894) 986 218.1 1.4e-55
XP_016857925 (OMIM: 605865) PREDICTED: taste recep ( 893) 977 216.2 5.2e-55
NP_803884 (OMIM: 606225) taste receptor type 1 mem ( 587) 937 207.6 1.3e-52
XP_016857892 (OMIM: 606225) PREDICTED: taste recep ( 589) 937 207.6 1.3e-52
XP_016861760 (OMIM: 604099) PREDICTED: metabotropi ( 872) 814 181.9 1.1e-44
NP_000830 (OMIM: 604099) metabotropic glutamate re ( 872) 814 181.9 1.1e-44
NP_000831 (OMIM: 601115) metabotropic glutamate re ( 879) 801 179.2 7.3e-44
XP_005247894 (OMIM: 145980,239200,601198,601199,61 ( 917) 772 173.1 5.2e-42
NP_000379 (OMIM: 145980,239200,601198,601199,61289 (1078) 772 173.2 5.8e-42
XP_006713852 (OMIM: 145980,239200,601198,601199,61 (1078) 772 173.2 5.8e-42
XP_016862813 (OMIM: 145980,239200,601198,601199,61 (1078) 772 173.2 5.8e-42
XP_016862814 (OMIM: 145980,239200,601198,601199,61 (1078) 772 173.2 5.8e-42
NP_001171536 (OMIM: 145980,239200,601198,601199,61 (1088) 667 151.1 2.6e-35
NP_000833 (OMIM: 604102) metabotropic glutamate re (1180) 666 150.9 3.2e-35
XP_016873116 (OMIM: 604102) PREDICTED: metabotropi (1180) 666 150.9 3.2e-35
XP_006718891 (OMIM: 604102) PREDICTED: metabotropi (1212) 666 150.9 3.3e-35
XP_011541094 (OMIM: 604102) PREDICTED: metabotropi (1212) 666 150.9 3.3e-35
NP_001137303 (OMIM: 604102) metabotropic glutamate (1212) 666 150.9 3.3e-35
NP_001243741 (OMIM: 604100) metabotropic glutamate ( 743) 658 149.0 7.5e-35
XP_016866282 (OMIM: 604100) PREDICTED: metabotropi ( 779) 658 149.0 7.7e-35
NP_001243742 (OMIM: 604100) metabotropic glutamate ( 779) 658 149.0 7.7e-35
XP_016866281 (OMIM: 604100) PREDICTED: metabotropi ( 832) 658 149.0 8.1e-35
NP_001264995 (OMIM: 604473,614831) metabotropic gl ( 906) 654 148.2 1.5e-34
XP_016866275 (OMIM: 604473,614831) PREDICTED: meta ( 906) 654 148.2 1.5e-34
NP_001264994 (OMIM: 604473,614831) metabotropic gl ( 906) 654 148.2 1.5e-34
XP_016866276 (OMIM: 604473,614831) PREDICTED: meta ( 906) 654 148.2 1.5e-34
XP_016866274 (OMIM: 604473,614831) PREDICTED: meta ( 906) 654 148.2 1.5e-34
XP_011514393 (OMIM: 601116) PREDICTED: metabotropi ( 908) 654 148.2 1.5e-34
NP_001120795 (OMIM: 601116) metabotropic glutamate ( 908) 654 148.2 1.5e-34
XP_011514394 (OMIM: 601116) PREDICTED: metabotropi ( 908) 654 148.2 1.5e-34
XP_006716001 (OMIM: 601116) PREDICTED: metabotropi ( 908) 654 148.2 1.5e-34
NP_000836 (OMIM: 601116) metabotropic glutamate re ( 908) 654 148.2 1.5e-34
NP_001264996 (OMIM: 604473,614831) metabotropic gl ( 908) 654 148.2 1.5e-34
XP_016867563 (OMIM: 601116) PREDICTED: metabotropi ( 908) 654 148.2 1.5e-34
XP_016866273 (OMIM: 604473,614831) PREDICTED: meta (1194) 654 148.4 1.9e-34
XP_016866272 (OMIM: 604473,614831) PREDICTED: meta (1194) 654 148.4 1.9e-34
XP_011534084 (OMIM: 604473,614831) PREDICTED: meta (1194) 654 148.4 1.9e-34
NP_001264993 (OMIM: 604473,614831) metabotropic gl (1194) 654 148.4 1.9e-34
XP_016866279 (OMIM: 604100) PREDICTED: metabotropi ( 912) 618 140.7 3e-32
XP_016866280 (OMIM: 604100) PREDICTED: metabotropi ( 912) 618 140.7 3e-32
NP_000832 (OMIM: 604100) metabotropic glutamate re ( 912) 618 140.7 3e-32
XP_016865965 (OMIM: 613572) PREDICTED: G-protein c ( 558) 605 137.7 1.4e-31
NP_001273284 (OMIM: 613572) G-protein coupled rece ( 855) 605 137.9 1.9e-31
NP_683766 (OMIM: 613572) G-protein coupled recepto ( 926) 605 137.9 2e-31
>>NP_689418 (OMIM: 606226) taste receptor type 1 member (839 aa)
initn: 5677 init1: 5677 opt: 5677 Z-score: 6456.0 bits: 1205.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5677; 100.0% identity (100.0% similar) in 839 aa overlap (1-839:1-839)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGPRAKTISSLFFLLWVLAEPAENSDFYLPGDYLLGGLFSLHANMKGIVHLNFLQVPMCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 MGPRAKTISSLFFLLWVLAEPAENSDFYLPGDYLLGGLFSLHANMKGIVHLNFLQVPMCK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EYEVKVIGYNLMQAMRFAVEEINNDSSLLPGVLLGYEIVDVCYISNNVQPVLYFLAHEDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 EYEVKVIGYNLMQAMRFAVEEINNDSSLLPGVLLGYEIVDVCYISNNVQPVLYFLAHEDN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LLPIQEDYSNYISRVVAVIGPDNSESVMTVANFLSLFLLPQITYSAISDELRDKVRFPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 LLPIQEDYSNYISRVVAVIGPDNSESVMTVANFLSLFLLPQITYSAISDELRDKVRFPAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LRTTPSADHHIEAMVQLMLHFRWNWIIVLVSSDTYGRDNGQLLGERVARRDICIAFQETL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 LRTTPSADHHIEAMVQLMLHFRWNWIIVLVSSDTYGRDNGQLLGERVARRDICIAFQETL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 PTLQPNQNMTSEERQRLVTIVDKLQQSTARVVVVFSPDLTLYHFFNEVLRQNFTGAVWIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 PTLQPNQNMTSEERQRLVTIVDKLQQSTARVVVVFSPDLTLYHFFNEVLRQNFTGAVWIA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SESWAIDPVLHNLTELRHLGTFLGITIQSVPIPGFSEFREWGPQAGPPPLSRTSQSYTCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 SESWAIDPVLHNLTELRHLGTFLGITIQSVPIPGFSEFREWGPQAGPPPLSRTSQSYTCN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 QECDNCLNATLSFNTILRLSGERVVYSVYSAVYAVAHALHSLLGCDKSTCTKRVVYPWQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 QECDNCLNATLSFNTILRLSGERVVYSVYSAVYAVAHALHSLLGCDKSTCTKRVVYPWQL
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430 440 450 460 470 480
pF1KB7 LEEIWKVNFTLLDHQIFFDPQGDVALHLEIVQWQWDRSQNPFQSVASYYPLQRQLKNIQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 LEEIWKVNFTLLDHQIFFDPQGDVALHLEIVQWQWDRSQNPFQSVASYYPLQRQLKNIQD
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pF1KB7 ISWHTINNTIPMSMCSKRCQSGQKKKPVGIHVCCFECIDCLPGTFLNHTEDEYECQACPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 ISWHTINNTIPMSMCSKRCQSGQKKKPVGIHVCCFECIDCLPGTFLNHTEDEYECQACPN
490 500 510 520 530 540
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pF1KB7 NEWSYQSETSCFKRQLVFLEWHEAPTIAVALLAALGFLSTLAILVIFWRHFQTPIVRSAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 NEWSYQSETSCFKRQLVFLEWHEAPTIAVALLAALGFLSTLAILVIFWRHFQTPIVRSAG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 GPMCFLMLTLLLVAYMVVPVYVGPPKVSTCLCRQALFPLCFTICISCIAVRSFQIVCAFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 GPMCFLMLTLLLVAYMVVPVYVGPPKVSTCLCRQALFPLCFTICISCIAVRSFQIVCAFK
610 620 630 640 650 660
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pF1KB7 MASRFPRAYSYWVRYQGPYVSMAFITVLKMVIVVIGMLATGLSPTTRTDPDDPKITIVSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 MASRFPRAYSYWVRYQGPYVSMAFITVLKMVIVVIGMLATGLSPTTRTDPDDPKITIVSC
670 680 690 700 710 720
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pF1KB7 NPNYRNSLLFNTSLDLLLSVVGFSFAYMGKELPTNYNEAKFITLSMTFYFTSSVSLCTFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 NPNYRNSLLFNTSLDLLLSVVGFSFAYMGKELPTNYNEAKFITLSMTFYFTSSVSLCTFM
730 740 750 760 770 780
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pF1KB7 SAYSGVLVTIVDLLVTVLNLLAISLGYFGPKCYMILFYPERNTPAYFNSMIQGYTMRRD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 SAYSGVLVTIVDLLVTVLNLLAISLGYFGPKCYMILFYPERNTPAYFNSMIQGYTMRRD
790 800 810 820 830
>>NP_619642 (OMIM: 606225) taste receptor type 1 member (841 aa)
initn: 1349 init1: 583 opt: 1841 Z-score: 2091.9 bits: 398.1 E(85289): 8.8e-110
Smith-Waterman score: 1841; 37.5% identity (65.5% similar) in 833 aa overlap (16-837:19-837)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGPRAKTISSLFFLLWVLA-EPAENS-DFYLPGDYLLGGLFSLHANMKGIVHLNFLQ
:..: . .:.: :: :::::::.::: ::.. . : .
NP_619 MLLCTARLVGLQLLISCCWAFACHSTESSPDFTLPGDYLLAGLFPLHSGCLQVRHRP--E
10 20 30 40 50
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pF1KB7 VPMC-KEYEVKVIGYNLMQAMRFAVEEINNDSSLLPGVLLGYEIVDVCYISNNVQPVLYF
: .: . . ::.:.::::..::::::...:::.. :::.. ::: : :: .:
NP_619 VTLCDRSCSFNEHGYHLFQAMRLGVEEINNSTALLPNITLGYQLYDVCSDSANVYATLRV
60 70 80 90 100 110
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pF1KB7 LAHE-DNLLPIQEDYSNYISRVVAVIGPDNSESVMTVANFLSLFLLPQITYSAISDELRD
:. .. . .: : .: :.::::::... . :.: .:: ::.:.:.:.: :. :
NP_619 LSLPGQHHIELQGDLLHYSPTVLAVIGPDSTNRAATTAALLSPFLVPMISYAASSETLSV
120 130 140 150 160 170
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pF1KB7 KVRFPALLRTTPSADHHIEAMVQLMLHFRWNWIIVLVSSDTYGRDNGQLLGERVARRDIC
: ..:..::: :. ...:.:: :. .: :.:: .. ::: ::. . : : .... . ::
NP_619 KRQYPSFLRTIPNDKYQVETMVLLLQKFGWTWISLVGSSDDYGQLGVQALENQATGQGIC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 IAFQETLPTLQPNQNMTSEERQRLVTIVDKLQQSTARVVVVFSPDLTLYHFFNEVLRQNF
:::.. .: . ....::.. .. .: :. : :::::: ::. :. :.
NP_619 IAFKDIMPF----SAQVGDERMQ--CLMRHLAQAGATVVVVFSSRQLARVFFESVVLTNL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 TGAVWIASESWAIDPVLHNLTELRHLGTFLGITIQSVPIPGFSEFREWGPQA---GPPPL
:: ::.:::.::.. . .. ....: ::..::. .::.. :.: .: .: :
NP_619 TGKVWVASEAWALSRHITGVPGIQRIGMVLGVAIQKRAVPGLKAFEEAYARADKKAPRPC
300 310 320 330 340 350
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pF1KB7 SRTSQSYTCNQECDNCLNATLSFNTILRLSGERVVYSVYSAVYAVAHALHSLLGCDKSTC
. : . :: : .: :. . .:..: :::::::.::.:::: ...:
NP_619 HKGSWC-SSNQLCRECQAFMAHTMPKLKAFSMSSAYNAYRAVYAVAHGLHQLLGCASGAC
360 370 380 390 400 410
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pF1KB7 TKRVVYPWQLLEEIWKVNFTLLDHQIFFDPQGDVALHLEIVQWQWDRSQNPFQSVAS--Y
.. ::::::::.: ::.: : . :. . : .:. :.:. . : ..: .
NP_619 SRGRVYPWQLLEQIHKVHFLLHKDTVAFNDNRDPLSSYNIIAWDWNGPKWTFTVLGSSTW
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 YPLQRQLKNIQDISWHTINNTIPMSMCSKRCQSGQKKKPVGIHVCCFECIDCLPGTFLNH
:.: .. : :.:: .: .: :.::. : :... .:.: :::::. : :::::.
NP_619 SPVQLNI-NETKIQWHGKDNQVPKSVCSSDCLEGHQRVVTGFHHCCFECVPCGAGTFLNK
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 TEDEYECQACPNNEWSYQSETSCFKRQLVFLEWHEAPTIAVALLAALGFLSTLAILVIFW
. : :.:: : ..::. .. .:: : .::: .: . .. .: .: :. .:
NP_619 S-DLYRCQPCGKEEWAPEGSQTCFPRTVVFLALREHTSWVLLAANTLLLLLLLGTAGLFA
540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KB7 RHFQTPIVRSAGGPMCFLMLTLLLVAYMVVPVYVGPPKVSTCLCRQALFPLCFTICISCI
:..::.:::::: .::::: : .. . . : : .:: ::::: : ::: .::.
NP_619 WHLDTPVVRSAGGRLCFLMLGSLAAGSGSLYGFFGEPTRPACLLRQALFALGFTIFLSCL
590 600 610 620 630 640
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pF1KB7 AVRSFQIVCAFKMASRFPRAYSYWVRYQGPYVSMAFITVLKMVIVVIGMLATGLSPTTRT
.:::::.. ::.... : : ::. .: . . . .. ...: . ... :. :
NP_619 TVRSFQLIIIFKFSTKVPTFYHAWVQNHGAGLFVMISSAAQLLICLTWLVVWTPLPA-RE
650 660 670 680 690 700
710 720 730 740 750 760
pF1KB7 DPDDPKITIVSCNPNYRNSLLFNTSL--DLLLSVVGFSFAYMGKELPTNYNEAKFITLSM
:..... :. . ::: : .. . :::. .:. .:.::.:: :::::: .:.:.
NP_619 YQRFPHLVMLECTET--NSLGFILAFLYNGLLSISAFACSYLGKDLPENYNEAKCVTFSL
710 720 730 740 750 760
770 780 790 800 810 820
pF1KB7 TFYFTSSVSLCTFMSAYSGVLVTIVDLLVTVLNLLAISLGYFGPKCYMILFYPERNTPAY
: :.: ... : :.:.: . ..... . .: . ::: ::::.:: :. :. .
NP_619 LFNFVSWIAFFTTASVYDGKYLPAANMMAGLSSLSSGFGGYFLPKCYVILCRPDLNSTEH
770 780 790 800 810 820
830
pF1KB7 FNSMIQGYTMRRD
:.. :: :: :
NP_619 FQASIQDYTRRCGST
830 840
>>XP_016857891 (OMIM: 606225) PREDICTED: taste receptor (843 aa)
initn: 1486 init1: 583 opt: 1749 Z-score: 1987.2 bits: 378.7 E(85289): 6e-104
Smith-Waterman score: 1755; 36.6% identity (64.9% similar) in 817 aa overlap (29-837:44-839)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGPRAKTISSLFFLLWVLAEPAENSDFYLPGDYLLGGLFSLHANMKGIVHLNFLQVPM
: :. . .:: . .. :..: .
XP_016 LLSLRALVEVVVWGTGPMTSKVPFAPKPQSLGGQRVSAGLCPSQLSLTGFLHRS------
20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 CKEYEVKVIGYNLMQAMRFAVEEINNDSSLLPGVLLGYEIVDVCYISNNVQPVLYFLAHE
:. : ::.:.::::..::::::...:::.. :::.. ::: : :: .: :.
XP_016 CSFNE---HGYHLFQAMRLGVEEINNSTALLPNITLGYQLYDVCSDSANVYATLRVLSLP
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 -DNLLPIQEDYSNYISRVVAVIGPDNSESVMTVANFLSLFLLPQITYSAISDELRDKVRF
.. . .: : .: :.::::::... . :.: .:: ::.:.:.:.: :. : : ..
XP_016 GQHHIELQGDLLHYSPTVLAVIGPDSTNRAATTAALLSPFLVPMISYAASSETLSVKRQY
130 140 150 160 170 180
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pF1KB7 PALLRTTPSADHHIEAMVQLMLHFRWNWIIVLVSSDTYGRDNGQLLGERVARRDICIAFQ
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