Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7320
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7320, 1288 aa
1>>>pF1KB7320 1288 - 1288 aa - 1288 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7272+/-0.0013; mu= 0.6793+/- 0.079
mean_var=382.7773+/-78.108, 0's: 0 Z-trim(111.1): 104 B-trim: 2 in 1/53
Lambda= 0.065554
statistics sampled from 12061 (12142) to 12061 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.373), width: 16
Scan time: 5.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3189.1 SMC4 gene_id:10051|Hs108|chr3 (1288) 8209 792.0 0
CCDS75046.1 SMC4 gene_id:10051|Hs108|chr3 (1263) 7723 746.0 1.4e-214
CCDS75985.1 SMC1A gene_id:8243|Hs108|chrX (1211) 603 72.6 7.1e-12
CCDS14352.1 SMC1A gene_id:8243|Hs108|chrX (1233) 603 72.6 7.2e-12
CCDS31285.1 SMC3 gene_id:9126|Hs108|chr10 (1217) 578 70.2 3.7e-11
>>CCDS3189.1 SMC4 gene_id:10051|Hs108|chr3 (1288 aa)
initn: 8209 init1: 8209 opt: 8209 Z-score: 4213.9 bits: 792.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8209; 100.0% identity (100.0% similar) in 1288 aa overlap (1-1288:1-1288)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRKGTQPSTARRREEGPPPPSPDGASSDAEPEPPSGRTESPATAAETASEELDNRSLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MPRKGTQPSTARRREEGPPPPSPDGASSDAEPEPPSGRTESPATAAETASEELDNRSLEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 ILNSIPPPPPPAMTNEAGAPRLMITHIVNQNFKSYAGEKILGPFHKRFSCIIGPNGSGKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ILNSIPPPPPPAMTNEAGAPRLMITHIVNQNFKSYAGEKILGPFHKRFSCIIGPNGSGKS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 NVIDSMLFVFGYRAQKIRSKKLSVLIHNSDEHKDIQSCTVEVHFQKIIDKEGDDYEVIPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NVIDSMLFVFGYRAQKIRSKKLSVLIHNSDEHKDIQSCTVEVHFQKIIDKEGDDYEVIPN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SNFYVSRTACRDNTSVYHISGKKKTFKDVGNLLRSHGIDLDHNRFLILQGEVEQIAMMKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SNFYVSRTACRDNTSVYHISGKKKTFKDVGNLLRSHGIDLDHNRFLILQGEVEQIAMMKP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 KGQTEHDEGMLEYLEDIIGCGRLNEPIKVLCRRVEILNEHRGEKLNRVKMVEKEKDALEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KGQTEHDEGMLEYLEDIIGCGRLNEPIKVLCRRVEILNEHRGEKLNRVKMVEKEKDALEG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 EKNIAIEFLTLENEIFRKKNHVCQYYIYELQKRIAEMETQKEKIHEDTKEINEKSNILSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EKNIAIEFLTLENEIFRKKNHVCQYYIYELQKRIAEMETQKEKIHEDTKEINEKSNILSN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 EMKAKNKDVKDTEKKLNKITKFIEENKEKFTQLDLEDVQVREKLKHATSKAKKLEKQLQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EMKAKNKDVKDTEKKLNKITKFIEENKEKFTQLDLEDVQVREKLKHATSKAKKLEKQLQK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 DKEKVEEFKSIPAKSNNIINETTTRNNALEKEKEKEEKKLKEVMDSLKQETQGLQKEKES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DKEKVEEFKSIPAKSNNIINETTTRNNALEKEKEKEEKKLKEVMDSLKQETQGLQKEKES
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 REKELMGFSKSVNEARSKMDVAQSELDIYLSRHNTAVSQLTKAKEALIAASETLKERKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 REKELMGFSKSVNEARSKMDVAQSELDIYLSRHNTAVSQLTKAKEALIAASETLKERKAA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 IRDIEGKLPQTEQELKEKEKELQKLTQEETNFKSLVHDLFQKVEEAKSSLAMNRSRGKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IRDIEGKLPQTEQELKEKEKELQKLTQEETNFKSLVHDLFQKVEEAKSSLAMNRSRGKVL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 DAIIQEKKSGRIPGIYGRLGDLGAIDEKYDVAISSCCHALDYIVVDSIDIAQECVNFLKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DAIIQEKKSGRIPGIYGRLGDLGAIDEKYDVAISSCCHALDYIVVDSIDIAQECVNFLKR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 QNIGVATFIGLDKMAVWAKKMTEIQTPENTPRLFDLVKVKDEKIRQAFYFALRDTLVADN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QNIGVATFIGLDKMAVWAKKMTEIQTPENTPRLFDLVKVKDEKIRQAFYFALRDTLVADN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 LDQATRVAYQKDRRWRVVTLQGQIIEQSGTMTGGGSKVMKGRMGSSLVIEISEEEVNKME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LDQATRVAYQKDRRWRVVTLQGQIIEQSGTMTGGGSKVMKGRMGSSLVIEISEEEVNKME
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 SQLQNDSKKAMQIQEQKVQLEERVVKLRHSEREMRNTLEKFTASIQRLIEQEEYLNVQVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SQLQNDSKKAMQIQEQKVQLEERVVKLRHSEREMRNTLEKFTASIQRLIEQEEYLNVQVK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 ELEANVLATAPDKKKQKLLEENVSAFKTEYDAVAEKAGKVEAEVKRLHNTIVEINNHKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ELEANVLATAPDKKKQKLLEENVSAFKTEYDAVAEKAGKVEAEVKRLHNTIVEINNHKLK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 AQQDKLDKINKQLDECASAITKAQVAIKTADRNLQKAQDSVLRTEKEIKDTEKEVDDLTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AQQDKLDKINKQLDECASAITKAQVAIKTADRNLQKAQDSVLRTEKEIKDTEKEVDDLTA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB7 ELKSLEDKAAEVVKNTNAAEESLPEIQKEHRNLLQELKVIQENEHALQKDALSIKLKLEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ELKSLEDKAAEVVKNTNAAEESLPEIQKEHRNLLQELKVIQENEHALQKDALSIKLKLEQ
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB7 IDGHIAEHNSKIKYWHKEISKISLHPIEDNPIEEISVLSPEDLEAIKNPDSITNQIALLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IDGHIAEHNSKIKYWHKEISKISLHPIEDNPIEEISVLSPEDLEAIKNPDSITNQIALLE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB7 ARCHEMKPNLGAIAEYKKKEELYLQRVAELDKITYERDSFRQAYEDLRKQRLNEFMAGFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ARCHEMKPNLGAIAEYKKKEELYLQRVAELDKITYERDSFRQAYEDLRKQRLNEFMAGFY
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB7 IITNKLKENYQMLTLGGDAELELVDSLDPFSEGIMFSVRPPKKSWKKIFNLSGGEKTLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IITNKLKENYQMLTLGGDAELELVDSLDPFSEGIMFSVRPPKKSWKKIFNLSGGEKTLSS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB7 LALVFALHHYKPTPLYFMDEIDAALDFKNVSIVAFYIYEQTKNAQFIIISLRNNMFEISD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LALVFALHHYKPTPLYFMDEIDAALDFKNVSIVAFYIYEQTKNAQFIIISLRNNMFEISD
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280
pF1KB7 RLIGIYKTYNITKSVAVNPKEIASKGLC
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RLIGIYKTYNITKSVAVNPKEIASKGLC
1270 1280
>>CCDS75046.1 SMC4 gene_id:10051|Hs108|chr3 (1263 aa)
initn: 7723 init1: 7723 opt: 7723 Z-score: 3965.6 bits: 746.0 E(32554): 1.4e-214
Smith-Waterman score: 7980; 98.1% identity (98.1% similar) in 1288 aa overlap (1-1288:1-1263)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRKGTQPSTARRREEGPPPPSPDGASSDAEPEPPSGRTESPATAAETASEELDNRSLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MPRKGTQPSTARRREEGPPPPSPDGASSDAEPEPPSGRTESPATAA--------------
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 ILNSIPPPPPPAMTNEAGAPRLMITHIVNQNFKSYAGEKILGPFHKRFSCIIGPNGSGKS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 -----------AMTNEAGAPRLMITHIVNQNFKSYAGEKILGPFHKRFSCIIGPNGSGKS
50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 NVIDSMLFVFGYRAQKIRSKKLSVLIHNSDEHKDIQSCTVEVHFQKIIDKEGDDYEVIPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NVIDSMLFVFGYRAQKIRSKKLSVLIHNSDEHKDIQSCTVEVHFQKIIDKEGDDYEVIPN
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SNFYVSRTACRDNTSVYHISGKKKTFKDVGNLLRSHGIDLDHNRFLILQGEVEQIAMMKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SNFYVSRTACRDNTSVYHISGKKKTFKDVGNLLRSHGIDLDHNRFLILQGEVEQIAMMKP
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 KGQTEHDEGMLEYLEDIIGCGRLNEPIKVLCRRVEILNEHRGEKLNRVKMVEKEKDALEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KGQTEHDEGMLEYLEDIIGCGRLNEPIKVLCRRVEILNEHRGEKLNRVKMVEKEKDALEG
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 EKNIAIEFLTLENEIFRKKNHVCQYYIYELQKRIAEMETQKEKIHEDTKEINEKSNILSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EKNIAIEFLTLENEIFRKKNHVCQYYIYELQKRIAEMETQKEKIHEDTKEINEKSNILSN
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 EMKAKNKDVKDTEKKLNKITKFIEENKEKFTQLDLEDVQVREKLKHATSKAKKLEKQLQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EMKAKNKDVKDTEKKLNKITKFIEENKEKFTQLDLEDVQVREKLKHATSKAKKLEKQLQK
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 DKEKVEEFKSIPAKSNNIINETTTRNNALEKEKEKEEKKLKEVMDSLKQETQGLQKEKES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DKEKVEEFKSIPAKSNNIINETTTRNNALEKEKEKEEKKLKEVMDSLKQETQGLQKEKES
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 REKELMGFSKSVNEARSKMDVAQSELDIYLSRHNTAVSQLTKAKEALIAASETLKERKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 REKELMGFSKSVNEARSKMDVAQSELDIYLSRHNTAVSQLTKAKEALIAASETLKERKAA
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 IRDIEGKLPQTEQELKEKEKELQKLTQEETNFKSLVHDLFQKVEEAKSSLAMNRSRGKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IRDIEGKLPQTEQELKEKEKELQKLTQEETNFKSLVHDLFQKVEEAKSSLAMNRSRGKVL
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 DAIIQEKKSGRIPGIYGRLGDLGAIDEKYDVAISSCCHALDYIVVDSIDIAQECVNFLKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DAIIQEKKSGRIPGIYGRLGDLGAIDEKYDVAISSCCHALDYIVVDSIDIAQECVNFLKR
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 QNIGVATFIGLDKMAVWAKKMTEIQTPENTPRLFDLVKVKDEKIRQAFYFALRDTLVADN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QNIGVATFIGLDKMAVWAKKMTEIQTPENTPRLFDLVKVKDEKIRQAFYFALRDTLVADN
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 LDQATRVAYQKDRRWRVVTLQGQIIEQSGTMTGGGSKVMKGRMGSSLVIEISEEEVNKME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LDQATRVAYQKDRRWRVVTLQGQIIEQSGTMTGGGSKVMKGRMGSSLVIEISEEEVNKME
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 SQLQNDSKKAMQIQEQKVQLEERVVKLRHSEREMRNTLEKFTASIQRLIEQEEYLNVQVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SQLQNDSKKAMQIQEQKVQLEERVVKLRHSEREMRNTLEKFTASIQRLIEQEEYLNVQVK
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 ELEANVLATAPDKKKQKLLEENVSAFKTEYDAVAEKAGKVEAEVKRLHNTIVEINNHKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ELEANVLATAPDKKKQKLLEENVSAFKTEYDAVAEKAGKVEAEVKRLHNTIVEINNHKLK
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 AQQDKLDKINKQLDECASAITKAQVAIKTADRNLQKAQDSVLRTEKEIKDTEKEVDDLTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AQQDKLDKINKQLDECASAITKAQVAIKTADRNLQKAQDSVLRTEKEIKDTEKEVDDLTA
880 890 900 910 920 930
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB7 ELKSLEDKAAEVVKNTNAAEESLPEIQKEHRNLLQELKVIQENEHALQKDALSIKLKLEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ELKSLEDKAAEVVKNTNAAEESLPEIQKEHRNLLQELKVIQENEHALQKDALSIKLKLEQ
940 950 960 970 980 990
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB7 IDGHIAEHNSKIKYWHKEISKISLHPIEDNPIEEISVLSPEDLEAIKNPDSITNQIALLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IDGHIAEHNSKIKYWHKEISKISLHPIEDNPIEEISVLSPEDLEAIKNPDSITNQIALLE
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB7 ARCHEMKPNLGAIAEYKKKEELYLQRVAELDKITYERDSFRQAYEDLRKQRLNEFMAGFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ARCHEMKPNLGAIAEYKKKEELYLQRVAELDKITYERDSFRQAYEDLRKQRLNEFMAGFY
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB7 IITNKLKENYQMLTLGGDAELELVDSLDPFSEGIMFSVRPPKKSWKKIFNLSGGEKTLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IITNKLKENYQMLTLGGDAELELVDSLDPFSEGIMFSVRPPKKSWKKIFNLSGGEKTLSS
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB7 LALVFALHHYKPTPLYFMDEIDAALDFKNVSIVAFYIYEQTKNAQFIIISLRNNMFEISD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LALVFALHHYKPTPLYFMDEIDAALDFKNVSIVAFYIYEQTKNAQFIIISLRNNMFEISD
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1270 1280
pF1KB7 RLIGIYKTYNITKSVAVNPKEIASKGLC
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RLIGIYKTYNITKSVAVNPKEIASKGLC
1240 1250 1260
>>CCDS75985.1 SMC1A gene_id:8243|Hs108|chrX (1211 aa)
initn: 469 init1: 243 opt: 603 Z-score: 326.6 bits: 72.6 E(32554): 7.1e-12
Smith-Waterman score: 1120; 25.5% identity (58.1% similar) in 1268 aa overlap (118-1279:15-1206)
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 VNQNFKSYAGEKILGPFHKRFSCIIGPNGSGKSNVIDSMLFVFGYRAQKIRSKKLSVLIH
::::..:.. ::.: .....: : : :::
CCDS75 MLEVSIPTPHRYVRGKSNLMDAISFVLGEKTSNLRVKTLRDLIH
10 20 30 40
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 NSDEHKDIQSCTVEVHFQKIIDKEGDDYEVIPNSNFYVSRTACRDNTSVYHISGKKKTFK
.. : . .. . . ..:: . . .: .:. ..: :.:..: ..
CCDS75 GAPVGKPAAN---RAFVSMVYSEEGAE-----DRTF--ARVIV-GGSSEYKINNKVVQLH
50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 DVGNLLRSHGIDLDHNRFLILQGEVEQIAMMKPKGQTEHDEGMLEYLEDIIGCGRLNEPI
. .. :.. :: . ::..:: ::.::: .:: .: .:.: :.: .
CCDS75 EYSEELEKLGILIKARNFLVFQGAVESIAMKNPKERTA-------LFEEISRSGELAQEY
100 110 120 130 140
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 KVLCRRVEILNEHRGEKLN--RVKMVEKEKDALEGEKNIAIEFLTLENEIFRKKNHVCQY
:. :... .. ..: : : . :. . ::. : .. :..:. : . .. .
CCDS75 DK--RKKEMVKAEEDTQFNYHRKKNIAAERKEAKQEKEEADRYQRLKDEVVRAQVQLQLF
150 160 170 180 190 200
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 YIY----ELQKRIAEMETQKEKIHEDTKEINEKSNILSNEMKAKNKDVKDTEKKLNKITK
.: :..: :. .....:..: :.... . .:.: :.:.. .. ..: :
CCDS75 KLYHNEVEIEKLNKELASKNKEIEKDKKRMDK----VEDELKEKKKELGKMMREQQQIEK
210 220 230 240 250 260
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 FIEENKEKFTQLDLEDVQVREKLKHATSKAKKLEKQLQKDKEKVEEFKSIPAKSNNIINE
:.:. ...: . ....:. .: .: . .:.::. ... .: : .. ..:
CCDS75 EIKEKDSELNQKRPQYIKAKENTSHKIKKLEAAKKSLQNAQKH---YK----KRKGDMDE
270 280 290 300 310
450 460 470 480 490 500
pF1KB7 TTTRNNALEKEKEKEEKKLKEVMDSLKQETQGLQKEKESREKELMGFSKSVNEARSKMDV
:::: . :: .: . ...:.:. .. .:... . . .:: .. .
CCDS75 -------LEKEMLSVEKARQEFEERMEEESQSQGRDLTLEENQVKKYHRLKEEASKRAAT
320 330 340 350 360
510 520 530 540 550 560
pF1KB7 AQSELDIYLSRHNTAVSQLTKAKEALIAASETLKERKAAIRDIEGKLPQTEQELKEKEKE
.::. . .: . : .. : :.::: . . :.:. : .:..:..:.
CCDS75 LAQELEKF-NRDQKA------DQDRL-----DLEERKKV--ETEAKIKQKLREIEENQKR
370 380 390 400 410
570 580 590 600
pF1KB7 LQKLTQEETNFKS-------LVHDLFQKVEEAKSSL-AMNRSRGKVL----DAIIQEKKS
..:: . :. :. : .: ..:: :: . .:. ..:. :: :....:
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:: . . . : . . ...:. ..: :. : . :. . . .:.. ::
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. ..: ... :::.. .:. :::: : : . :.. . .:: .. .:
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CCDS75 NEQQSVLQRIAAPNMKAMEKLESVRDKFQETSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRF
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CCDS75 EEFYTKAESLIGVYPEQGDCVISKVLTFDLTKYPDANPNPNEQ
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CCDS14 YPDANPNPNEQ
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pF1KB7 GDDYEVIPNSNFYVSRT--ACRDNTSVYHISGKKKTFKDVGNLLRSHGIDLDHNRFLILQ
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CCDS31 SDNRLPIDKEEVSLRRVIGAKKDQ---YFLDKKMVTKNDVMNLLESAGFSRSNPYYIVKQ
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CCDS31 ETSGEKSRQLRDAQQDARDKMEDIERQVRELKTKISAMKEEKEQLSAERQEQIKQRTKLE
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CCDS31 LKAKDLQDELAGNSEQRKRLLKERQKLLEKIEEKQKELAETEPKFNSVKEKEERGIARLA
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. .:. : . .: :. ...: . ::: ......:. . .. . ...:. .
CCDS31 QATQERTDLYAKQGRGSQFTSKEERDKWIK-KELKSLDQAINDKKRQIAAIHKDLEDTEA
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CCDS31 NKEKNLEQYNKL-------DQDLNEVKARVEELDRKYYEVKNKKDELQSERNYLWREENA
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pF1KB7 FKSLVHDLFQKVEEAKSSLAMNRSRGKV--LDAIIQEKKSGRIPGIYGRL--GDLGAIDE
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CCDS31 EQQALAAKREDLEKKQQLLRAATGKAILNGIDSINKVLDHFRRKGINQHVQNGYHGIVMN
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pF1KB7 KYDV--AISSCCHA-----LDYIVVDSIDIAQECVNFLKRQNI-GVATFIGLDKMAVWAK
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CCDS31 NFECEPAFYTCVEVTAGNRLFYHIVDSDEVSTKILMEFNKMNLPGEVTFLPLNKLDV---
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CCDS31 --RDTAYPETNDAIPMISKLRYNPRFDKAFKHVFGKTLICRSMEVSTQLA--RAFTMDCI
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CCDS31 TLEGDQVSHRGALTGGYYDTRKSRLELQKDVRKAEEELGELEAKLNENLRR--NIERINN
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CCDS31 EIDQLMNQMQQIETQQR----KFKASRDSILSEMKMLKEKRQQSEKTFM---PKQRSLQS
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CCDS31 LEASLHAMESTRESLKAELGTDLLSQLSLEDQKRVDALNDEIRQLQQENRQLLNERI-KL
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pF1KB7 ASAITKAQVAIKTADRNLQKAQDSVLRTEKEIKDTEKEVDDLTAELKSLEDKAAEVVKNT
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CCDS31 EGIITRVETYL---NENLRKRLDQVEQELNELRETEGGTV-LTATTSELE-AINKRVKDT
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CCDS31 MARSEDLDNSIDKTEAGIKELQKSMERWKNMEKEHMDAINHDTKELEKMTNRQGMLLKKK
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CCDS31 EECMKKIRELGSLPQEAFEKYQTLSLKQL--FRKLEQCNTE---LKKYSHVNKKALDQFV
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