Result of FASTA (ccds) for pF1KB7323
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7323, 1954 aa
  1>>>pF1KB7323 1954 - 1954 aa - 1954 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3731+/-0.00101; mu= 13.2533+/- 0.062
 mean_var=224.6221+/-44.717, 0's: 0 Z-trim(112.4): 138  B-trim: 2 in 1/51
 Lambda= 0.085575
 statistics sampled from 13016 (13156) to 13016 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.404), width:  16
 Scan time:  5.800

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS57.1 CHD5 gene_id:26038|Hs108|chr1             (1954) 13323 1659.4       0
CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12           (1912) 5597 705.5  5e-202
CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12          (1905) 5586 704.2 1.3e-201
CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17          (1966) 5266 664.7  1e-189
CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17          (2000) 5266 664.7  1e-189
CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17          (2059) 5266 664.7 1.1e-189
CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8          (2997) 1582 210.0 1.1e-52
CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16         (2881) 1576 209.3 1.9e-52
CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16         (2897) 1576 209.3 1.9e-52
CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20         (2715) 1564 207.8   5e-52
CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14         (2302) 1532 203.7 6.8e-51
CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14         (2581) 1532 203.8 7.4e-51
CCDS34204.1 CHD1 gene_id:1105|Hs108|chr5           (1710) 1312 176.5 8.3e-43
CCDS10374.2 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15          (1828) 1311 176.4 9.4e-43
CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX        (1058) 1183 160.3 3.6e-38
CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4         (1052) 1160 157.5 2.6e-37
CCDS12253.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1647) 1045 143.5 6.7e-33
CCDS34978.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        (1572) 1040 142.8   1e-32
CCDS34977.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        (1590) 1040 142.8   1e-32
CCDS54218.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1613) 1028 141.4 2.8e-32
CCDS54217.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1614) 1028 141.4 2.8e-32
CCDS45973.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1616) 1010 139.2 1.3e-31
CCDS45972.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19       (1617) 1010 139.2 1.3e-31
CCDS72882.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1          ( 797)  959 132.6 6.3e-30
CCDS927.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1            ( 897)  959 132.6 6.8e-30
CCDS83338.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9        (1514)  803 113.6 6.3e-24
CCDS7229.1 ERCC6 gene_id:2074|Hs108|chr10          (1493)  766 109.0 1.5e-22
CCDS14612.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX        (1054)  690 99.5 7.6e-20
CCDS76019.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX        (1070)  690 99.5 7.7e-20
CCDS58022.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1          ( 616)  684 98.5 8.7e-20
CCDS58021.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1          ( 693)  684 98.6 9.5e-20
CCDS73164.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10         ( 700)  630 91.9 9.7e-18
CCDS73165.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10         ( 714)  630 91.9 9.8e-18
CCDS73163.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10         ( 740)  630 91.9   1e-17
CCDS7434.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10          ( 838)  630 92.0 1.1e-17
CCDS73162.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10         ( 884)  630 92.0 1.1e-17
CCDS10689.2 SRCAP gene_id:10847|Hs108|chr16        (3230)  562 84.1 9.7e-15
CCDS10071.1 INO80 gene_id:54617|Hs108|chr15        (1556)  545 81.7 2.5e-14


>>CCDS57.1 CHD5 gene_id:26038|Hs108|chr1                  (1954 aa)
 initn: 13323 init1: 13323 opt: 13323  Z-score: 8895.4  bits: 1659.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 13323; 100.0% identity (100.0% similar) in 1954 aa overlap (1-1954:1-1954)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MRGPVGTEEELPRLFAEEMENEDEMSEEEDGGLEAFDDFFPVEPVSLPKKKKPKKLKENK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MRGPVGTEEELPRLFAEEMENEDEMSEEEDGGLEAFDDFFPVEPVSLPKKKKPKKLKENK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 CKGKRKKKEGSNDELSENEEDLEEKSESEGSDYSPNKKKKKKLKDKKEKKAKRKKKDEDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 CKGKRKKKEGSNDELSENEEDLEEKSESEGSDYSPNKKKKKKLKDKKEKKAKRKKKDEDE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 DDNDDGCLKEPKSSGQLMAEWGLDDVDYLFSEEDYHTLTNYKAFSQFLRPLIAKKNPKIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 DDNDDGCLKEPKSSGQLMAEWGLDDVDYLFSEEDYHTLTNYKAFSQFLRPLIAKKNPKIP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 MSKMMTVLGAKWREFSANNPFKGSSAAAAAAAVAAAVETVTISPPLAVSPPQVPQPVPIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MSKMMTVLGAKWREFSANNPFKGSSAAAAAAAVAAAVETVTISPPLAVSPPQVPQPVPIR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 KAKTKEGKGPGVRKKIKGSKDGKKKGKGKKTAGLKFRFGGISNKRKKGSSSEEDEREESD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 KAKTKEGKGPGVRKKIKGSKDGKKKGKGKKTAGLKFRFGGISNKRKKGSSSEEDEREESD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 FDSASIHSASVRSECSAALGKKSKRRRKKKRIDDGDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 FDSASIHSASVRSECSAALGKKSKRRRKKKRIDDGDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 CPRAYHLVCLDPELEKAPEGKWSCPHCEKEGIQWEPKDDDDEEEEGGCEEEEDDHMEFCR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 CPRAYHLVCLDPELEKAPEGKWSCPHCEKEGIQWEPKDDDDEEEEGGCEEEEDDHMEFCR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 VCKDGGELLCCDACPSSYHLHCLNPPLPEIPNGEWLCPRCTCPPLKGKVQRILHWRWTEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 VCKDGGELLCCDACPSSYHLHCLNPPLPEIPNGEWLCPRCTCPPLKGKVQRILHWRWTEP
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 PAPFMVGLPGPDVEPSLPPPKPLEGIPEREFFVKWAGLSYWHCSWVKELQLELYHTVMYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 PAPFMVGLPGPDVEPSLPPPKPLEGIPEREFFVKWAGLSYWHCSWVKELQLELYHTVMYR
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 NYQRKNDMDEPPPFDYGSGDEDGKSEKRKNKDPLYAKMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 NYQRKNDMDEPPPFDYGSGDEDGKSEKRKNKDPLYAKMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNH
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB7 SFDKKGDVHYLIKWKDLPYDQCTWEIDDIDIPYYDNLKQAYWGHRELMLGEDTRLPKRLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 SFDKKGDVHYLIKWKDLPYDQCTWEIDDIDIPYYDNLKQAYWGHRELMLGEDTRLPKRLL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB7 KKGKKLRDDKQEKPPDTPIVDPTVKFDKQPWYIDSTGGTLHPYQLEGLNWLRFSWAQGTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 KKGKKLRDDKQEKPPDTPIVDPTVKFDKQPWYIDSTGGTLHPYQLEGLNWLRFSWAQGTD
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB7 TILADEMGLGKTVQTIVFLYSLYKEGHSKGPYLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDFYVVTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 TILADEMGLGKTVQTIVFLYSLYKEGHSKGPYLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDFYVVTY
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB7 TGDKESRSVIRENEFSFEDNAIRSGKKVFRMKKEVQIKFHVLLTSYELITIDQAILGSIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 TGDKESRSVIRENEFSFEDNAIRSGKKVFRMKKEVQIKFHVLLTSYELITIDQAILGSIE
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB7 WACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNSYKIDYKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 WACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNSYKIDYKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNN
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB7 LEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSQMQKKYY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSQMQKKYY
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB7 KFILTRNFEALNSKGGGNQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAVEAPVLPNGSYDGSSLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 KFILTRNFEALNSKGGGNQVSLLNIMMDLKKCCNHPYLFPVAAVEAPVLPNGSYDGSSLV
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB7 KSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLEYEGYKYERIDGGITGGLRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 KSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQMTKMLDLLEDFLEYEGYKYERIDGGITGGLRQ
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB7 EAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 EAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQN
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB7 KKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVRPGLGSKSGSMTKQELDDILKFGTEEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 KKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHLVVRPGLGSKSGSMTKQELDDILKFGTEEL
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB7 FKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGGNLAASAKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 FKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGGNLAASAKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDA
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KB7 AISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSFKVAQYVVREEDGVEEVEREIIKQEENVDPDYW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 AISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSFKVAQYVVREEDGVEEVEREIIKQEENVDPDYW
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KB7 EKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNYNDASQEDQEWQDELSDNQSEYSIGSEDED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 EKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNYNDASQEDQEWQDELSDNQSEYSIGSEDED
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CCDS85 VVESMVTATEVAPPPPPVEVPIRKAKTKEGKGPNARRKPKGSPRVPDAKKPKPKKVAPLK
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CCDS85 E-KSRKRKNKDPKFAEMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSVDKKGHVHYLIKWRDLPYDQ
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CCDS85 DMLGPHMLRRLKADVFKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNARGGGNQVS
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CCDS85 AGGLGINLATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQV
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CCDS85 --ATDGG---------------GDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQDETEDTELQGM
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CCDS85 NEYLSSFKVAQYVVREEEMGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNL
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CCDS85 GKGKRIRKQVNYNDGSQEDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAP--RRPSRKG
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pF1KB7 LKSDRDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRWGMPPQDAFNSHWLVRDLRGK
       :..:.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::...:::::::::
CCDS85 LRNDKDKPLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGK
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pF1KB7 SEKEFRAYVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLVRKKVQEFEH
       :::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS85 SEKEFKAYVSLFMRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLIRKKVQEFEH
            1460      1470      1480      1490      1500      1510 

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       :::..: :.:  :  :.:: ..  : .:.::.:..:.   : .:  .:          ..
CCDS85 VNGRWSMPELA-EVEENKKMSQPGSPSPKTPTPSTPGDTQPNTPAPVPPAEDGIKIEENS
            1520       1530      1540      1550      1560      1570

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       .. . .   ::.  .  :.  .:    ::      :::..   : : ..:..  :. :  
CCDS85 LKEEESIEGEKEVKSTAPETAIECTQAPAP----ASEDEKVVVEPPEGEEKV--EKAEVK
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pF1KB7 EKAPPSPEQLPREEVLPEKEKILDKLELSLIHSRGDSSELRPDDTKAEEKEPIETQQNGD
       :..    :  :.  .  . ::. .:  ..:     ...: . ..   :::. .  : ::.
CCDS85 ERTEEPMETEPKGAA--DVEKVEEKSAIDLTPIVVEDKEEKKEE---EEKKEVMLQ-NGE
         1630        1640      1650      1660         1670         

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pF1KB7 KEEDDEGKKEDKKGKFKFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAVSSGKIYDIWHRRHDYWLL
         .: . .:. :. : .::::::::::::::.:::::::::. . : :.:::::::::::
CCDS85 TPKDLNDEKQKKNIKQRFMFNIADGGFTELHSLWQNEERAATVTKKTYEIWHRRHDYWLL
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pF1KB7 AGIVTHGYARWQDIQNDPRYMILNEPFKSEVHKGNYLEMKNKFLARRFKLLEQALVIEEQ
       :::..::::::::::::::: :::::::.:...::.::.:::::::::::::::::::::
CCDS85 AGIINHGYARWQDIQNDPRYAILNEPFKGEMNRGNFLEIKNKFLARRFKLLEQALVIEEQ
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pF1KB7 LRRAAYLNMTQDPNHPAMALNARLAEVECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVLHKVLNQLE
       :::::::::..::.::.::::.:.:::::::::::::::::.::::::::::::::.:::
CCDS85 LRRAAYLNMSEDPSHPSMALNTRFAEVECLAESHQHLSKESMAGNKPANAVLHKVLKQLE
     1800      1810      1820      1830      1840      1850        

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pF1KB7 ELLSDMKADVTRLPSMLSRIPPVAARLQMSERSILSRLTNRAGDPTIQQGAFGSSQMYSN
       ::::::::::::::. ..::::::.:::::::.:::::.::: .:: :: :         
CCDS85 ELLSDMKADVTRLPATIARIPPVAVRLQMSERNILSRLANRAPEPTPQQVAQQQ      
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        1930      1940      1950    
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CCDS76 MASGLGSPSPCSAGSEEEDMDALLNNSLPPPHPENEED-----PEEDLSETETPKLKKKK
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CCDS76 KKEKKSKSKRKEEEEEEDDDDDSKEPKSSAQLLEDWGMEDIDHVFSEEDYRTLTNYKAFS
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       ::.::::: ::::: .:::: ::::::::::.::::::::.:..:::.:::: .: ..  
CCDS76 QFVRPLIAAKNPKIAVSKMMMVLGAKWREFSTNNPFKGSSGASVAAAAAAAVAVVESMVT
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pF1KB7 PLAVSPPQVPQPVPIRKAKTKEGKGPGVRKKIKGSK--DGKKKGKGKKTAGLKFRFGGIS
          :.::  :  ::::::::::::::..:.: :::      :: : ::.: ::...::..
CCDS76 ATEVAPPPPPVEVPIRKAKTKEGKGPNARRKPKGSPRVPDAKKPKPKKVAPLKIKLGGFG
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       .:::..:: ..:   :::::.:::.: :: :. :.. ...:...    .:::. ..    
CCDS76 SKRKRSSSEDDDLDVESDFDDASINSYSV-SDGSTSRSSRSRKKLRTTKKKKKGEEEVTA
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pF1KB7 -DGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHLVCLDPELEKAPEGKWSCPHCEKEGIQW
        :::::::::::::::::::::::::::::::.:::::..::::::::::::::::::::
CCDS76 VDGYETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHMVCLDPDMEKAPEGKWSCPHCEKEGIQW
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CCDS76 EAKEDNSEGEEILEEVGGDLEEEDDHHMEFCRVCKDGGELLCCDTCPSSYHIHCLNPPLP
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       ::::::::::::::: ::::::.:: :.: .::.:  :  : ::..:. : :::::: ::
CCDS76 EIPNGEWLCPRCTCPALKGKVQKILIWKWGQPPSPTPVPRP-PDADPNTPSPKPLEGRPE
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pF1KB7 REFFVKWAGLSYWHCSWVKELQLELYHTVMYRNYQRKNDMDEPPPFDYGSGDEDGKSEKR
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CCDS76 RQFFVKWQGMSYWHCSWVSELQLELHCQVMFRNYQRKNDMDEPPSGDFG-GDEE-KSRKR
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pF1KB7 KNKDPLYAKMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSFDKKGDVHYLIKWKDLPYDQCTWEIDD
       ::::: .:.:::::::::::::::::::::::: :::: :::::::.:::::: .:: .:
CCDS76 KNKDPKFAEMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSVDKKGHVHYLIKWRDLPYDQASWESED
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pF1KB7 IDIPYYDNLKQAYWGHRELMLGEDTRLPKRLLKKGKKLRDDKQEKPPDTPIVDPTVKFDK
       ..:  :: .::.::.::::: ::. : : . :::  :::  : :.::.:: ::::::...
CCDS76 VEIQDYDLFKQSYWNHRELMRGEEGR-PGKKLKK-VKLR--KLERPPETPTVDPTVKYER
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pF1KB7 QPWYIDSTGGTLHPYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTIVFLYSLYKEGHS
       :: :.:.:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS76 QPEYLDATGGTLHPYQMEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTAVFLYSLYKEGHS
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pF1KB7 KGPYLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDFYVVTYTGDKESRSVIRENEFSFEDNAIRSGKKV
       :::.::::::::::::::::::::::.:::::.:::.::..::::::::::::::.:::.
CCDS76 KGPFLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDMYVVTYVGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIRGGKKA
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pF1KB7 FRMKKEVQIKFHVLLTSYELITIDQAILGSIEWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNSYKI
        :::::...:::::::::::::::.::::::.::::.:::::::::::::::::::.:..
CCDS76 SRMKKEASVKFHVLLTSYELITIDMAILGSIDWACLIVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYSL
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      870       880       890       900       910       920        
pF1KB7 DYKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHM
       ..::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::.::::::::::.:::::
CCDS76 QHKLLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFHNLEGFLEEFADIAKEDQIKKLHDMLGPHM
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pF1KB7 LRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSQMQKKYYKFILTRNFEALNSKGGGNQVSLLNIMMD
       :::::::::::::.::::::::::: :::::::.::::::::::..::::::::::..::
CCDS76 LRRLKADVFKNMPSKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNARGGGNQVSLLNVVMD
       950       960       970       980       990      1000       

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pF1KB7 LKKCCNHPYLFPVAAVEAPVLPNGSYDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQ
       :::::::::::::::.::: .::: ::::.:...::::.:::::::.:.. :::::::::
CCDS76 LKKCCNHPYLFPVAAMEAPKMPNGMYDGSALIRASGKLLLLQKMLKNLKEGGHRVLIFSQ
      1010      1020      1030      1040      1050      1060       

     1050      1060      1070      1080      1090      1100        
pF1KB7 MTKMLDLLEDFLEYEGYKYERIDGGITGGLRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGIN
       :::::::::::::.::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MTKMLDLLEDFLEHEGYKYERIDGGITGNMRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGIN
      1070      1080      1090      1100      1110      1120       

     1110      1120      1130      1140      1150      1160        
pF1KB7 LATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMML
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS76 LATADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKKKMML
      1130      1140      1150      1160      1170      1180       

     1170      1180      1190      1200      1210      1220        
pF1KB7 THLVVRPGLGSKSGSMTKQELDDILKFGTEELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGG
       ::::::::::::.:::.::::::::::::::::::.                   .. ::
CCDS76 THLVVRPGLGSKTGSMSKQELDDILKFGTEELFKDE-------------------ATDGG
      1190      1200      1210      1220                           

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pF1KB7 NLAASAKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDAAISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSF
                      ::::. :::::::::: :: .::::::: :.:::::.::::::::
CCDS76 ---------------GDNKEGEDSSVIHYDDKAIERLLDRNQDETEDTELQGMNEYLSSF
                    1230      1240      1250      1260      1270   

     1290       1300       1310      1320      1330      1340      
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CCDS76 KVAQYVVREEEMGEEEEVEREIIKQEESVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIR
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CCDS76 KQVNYNDGSQEDRDWQDDQSDNQSDYSVASEEGDEDFDERSEAP--RRPSRKGLRNDKDK
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CCDS76 PLPPLLARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRYGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKSEKEFKA
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::..: 
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       :.:  :  :.:: ..  : .:.::.:..:.   : .:  .:          .... . . 
CCDS76 PELA-EVEENKKMSQPGSPSPKTPTPSTPGDTQPNTPAPVPPAEDGIKIEENSLKEEESI
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         ::.  .  :.  .:    ::      :::..   : : ..:..  :. :  :..    
CCDS76 EGEKEVKSTAPETAIECTQAPAP----ASEDEKVVVEPPEGEEKV--EKAEVKERTEEPM
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       :  :.  .  . ::. .:  ..:     ...: . ..   :::. .  : ::.  .: . 
CCDS76 ETEPKGAA--DVEKVEEKSAIDLTPIVVEDKEEKKEE---EEKKEVMLQ-NGETPKDLND
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       .:. :. : .::::::::::::::.:::::::::. . : :.::::::::::::::..::
CCDS76 EKQKKNIKQRFMFNIADGGFTELHSLWQNEERAATVTKKTYEIWHRRHDYWLLAGIINHG
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       ::::::::::::: :::::::.:...::.::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 YARWQDIQNDPRYAILNEPFKGEMNRGNFLEIKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLRRAAYL
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       ::..::.::.::::.:.:::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::::
CCDS76 NMSEDPSHPSMALNTRFAEVECLAESHQHLSKESMAGNKPANAVLHKVLKQLEELLSDMK
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       :::::::. ..::::::.:::::::.:::::.::: .:: :: :                
CCDS76 ADVTRLPATIARIPPVAVRLQMSERNILSRLANRAPEPTPQQVAQQQ             
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CCDS32 ISFPPGLCWGDRMPDKDDIRLLPSALGVKKRKRGPKKQKENKPGKPRKRKKRDSEEEFGS
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       .... .::::: ::.:.  :..:...: ..:::::.::.:: :      ::  :  : ::
CCDS32 ERDEYREKSESGGSEYGTGPGRKRRRKHREKKEKKTKRRKKGEG-----DGGQKQVEQKS
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       :. :.  :::.::...::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::
CCDS32 SATLLLTWGLEDVEHVFSEEDYHTLTNYKAFSQFMRPLIAKKNPKIPMSKMMTILGAKWR
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CCDS32 EFSANNPFKGSAAAVAAAAAAAAAAVAEQVSAAVSSATPIAPSGPPALPPPPAADIQPPP
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pF1KB7 IRKAKTKEGKGPGVRKKIKGSK--DGKKKGKGKKTAGLKFRFGGISNKRKKGSS------
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CCDS32 IRRAKTKEGKGPGHKRRSKSPRVPDGRKKLRGKKMAPLKIKLGLLGGKRKKGGSYVFQSD
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pF1KB7 -SEEDEREESDFDSASIHSASVRSECSAALGKKSKRR--RKKKRI---------DDGDGY
        . : : ::::.::.:.:::: : .  .   : .. :  ::::..         .. :::
CCDS32 EGPEPEAEESDLDSGSVHSASGRPDGPVRTKKLKRGRPGRKKKKVLGCPAVAGEEEVDGY
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::.::: :.
CCDS32 ETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHLVCLDPELDRAPEGKWSCPHCEKEGVQWEAKE
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CCDS32 EEEEYEEEGEEEGEKEEEDDHMEYCRVCKDGGELLCCDACISSYHIHCLNPPLPDIPNGE
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CCDS32 WLCPRCTCPVLKGRVQKILHWRWGEPP----VAVPAPQQADGNPDVPPPRPLQGRSEREF
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pF1KB7 FVKWAGLSYWHCSWVKELQLELYHTVMYRNYQRKNDMDEPPPFDYGSGDEDGKSEKRKNK
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CCDS32 FVKWVGLSYWHCSWAKELQLEIFHLVMYRNYQRKNDMDEPPPLDYGSGEDDGKSDKRKVK
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pF1KB7 DPLYAKMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSFDKKGDVHYLIKWKDLPYDQCTWEIDDIDI
       :: ::.:::..::.::::::: .:::.::: ::::. :::.::.:::::: ::: :...:
CCDS32 DPHYAEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRIINHSVDKKGNYHYLVKWRDLPYDQSTWEEDEMNI
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pF1KB7 PYYDNLKQAYWGHRELMLGEDTRLPKRLLKKGKKLRDDKQEKPPDTPIVDPTVKFDKQPW
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CCDS32 PEYEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKYKKKKKELQGD---GPPSSPTNDPTVKYETQPR
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pF1KB7 YIDSTGGTLHPYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTIVFLYSLYKEGHSKGP
       .: .:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.:::
CCDS32 FITATGGTLHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTIQTIVFLYSLYKEGHTKGP
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pF1KB7 YLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDFYVVTYTGDKESRSVIRENEFSFEDNAIRSGKKVFRM
       .::::::::::::::::.:::: ::::::::::.::..:::::::::::::..:::.:.:
CCDS32 FLVSAPLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIKGGKKAFKM
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pF1KB7 KKEVQIKFHVLLTSYELITIDQAILGSIEWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNSYKIDYK
       :.:.:.::::::::::::::::: ::::.::::::::::::::::::::::::.::::.:
CCDS32 KREAQVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYKIDHK
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pF1KB7 LLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRR
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CCDS32 LKADVFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNSRGGGNQVSLLNIMMDLKK
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CCDS32 CCNHPYLFPVAAMESPKLPSGAYEGGALIKSSGKLMLLQKMLRKLKEQGHRVLIFSQMTK
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pF1KB7 MLDLLEDFLEYEGYKYERIDGGITGGLRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLAT
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CCDS32 MLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLAT
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pF1KB7 ADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHL
       ::::::.::::::::::::::::::::: .::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHL
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pF1KB7 VVRPGLGSKSGSMTKQELDDILKFGTEELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGGNLA
       :::::::::.:::.::::::::::::::::::. ::                        
CCDS32 VVRPGLGSKAGSMSKQELDDILKFGTEELFKDENEG------------------------
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pF1KB7 ASAKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDAAISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSFKVA
                    .::. :::::::::. ::..:::::::::.::..:::::::::::::
CCDS32 -------------ENKE-EDSSVIHYDNEAIARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVA
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pF1KB7 QYVVREEDGVEEVEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNY
       :::::::: .::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS32 QYVVREEDKIEEIEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNY
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pF1KB7 NDASQEDQEWQDELSDNQSEYSIGSEDEDEDFEERPEGQSGRRQSRRQLKSDRDKPLPPL
       :::.::::       :::::::.:::.:::::.:::::   ::::.:::....:::::::
CCDS32 NDAAQEDQ-------DNQSEYSVGSEEEDEDFDERPEG---RRQSKRQLRNEKDKPLPPL
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pF1KB7 LARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRWGMPPQDAFNSHWLVRDLRGKSEKEFRAYVSLF
       ::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::...:::::::::.::::.::::::
CCDS32 LARVGGNIEVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKTEKEFKAYVSLF
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pF1KB7 MRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLVRKKVQEFEHVNGKYSTPDLIP
       :::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::::.::::::::.::..: :.:.:
CCDS32 MRHLCEPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKKKVQEFEHINGRWSMPELMP
    1460      1470      1480      1490      1500      1510         

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pF1KB7 EGPEGKKSGEVISSDPNTPVPASPAHLLPAPLGLPDKMEAQLGYMDEKDPGAQKPRQPLE
       .    .:     ::  ..:. .::.    .  . :   .      .::  :    : :::
CCDS32 DPSADSKR----SSRASSPTKTSPTTPEASATNSPCTSKPATPAPSEKGEGI---RTPLE
    1520          1530      1540      1550      1560         1570  

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pF1KB7 VQALPAALDRVESEDKHESPASKERAREERPEETEKAPPSPEQLPREEVLPEKEKILDKL
                . :.:...:.: .. :  :.   :::   :::     :.. :.:  . :  
CCDS32 ---------KEEAENQEEKPEKNSRIGEKM--ETEADAPSPAPSLGERLEPRKIPLED--
                    1580      1590        1600      1610           

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pF1KB7 ELSLIHSRGDSSE-LRPDDTKAEEKEPIETQQNGDKEED-DEGKKEDKKGKFKFMFNIAD
       :.  . .. .     : :  :.:. .  .  . : ..:  ..:..:.:  : .:::::::
CCDS32 EVPGVPGEMEPEPGYRGDREKSEDVKGDRELRPGPRDEPRSNGRREEKTEKPRFMFNIAD
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pF1KB7 GGFTELHTLWQNEERAAVSSGKIYDIWHRRHDYWLLAGIVTHGYARWQDIQNDPRYMILN
       :::::::::::::::::.::::. .::::::::::::::: :::::::::::: .. :.:
CCDS32 GGFTELHTLWQNEERAAISSGKLNEIWHRRHDYWLLAGIVLHGYARWQDIQNDAQFAIIN
    1680      1690      1700      1710      1720      1730         

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pF1KB7 EPFKSEVHKGNYLEMKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLRRAAYLNMTQDPNHPAMALNARL
       ::::.:..:::.::::::::::::::::::::::::::::::::..:.: ::::::.::.
CCDS32 EPFKTEANKGNFLEMKNKFLARRFKLLEQALVIEEQLRRAAYLNLSQEPAHPAMALHARF
    1740      1750      1760      1770      1780      1790         

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pF1KB7 AEVECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVLHKVLNQLEELLSDMKADVTRLPSMLSRIPPVA
       ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. ::::::.:
CCDS32 AEAECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVLHKVLNQLEELLSDMKADVTRLPATLSRIPPIA
    1800      1810      1820      1830      1840      1850         

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pF1KB7 ARLQMSERSILSRLTNRAGDP----TIQQGAFGSSQMYSNNFGPNFRGPGPGGIVNYNQM
       ::::::::::::::.... .:    .   : ...   :.  :.    :   .. .::.::
CCDS32 ARLQMSERSILSRLASKGTEPHPTPAYPPGPYATPPGYGAAFSAAPVGALAAAGANYSQM
    1860      1870      1880      1890      1900      1910         

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pF1KB7 PLGPYVTDI                                      
       : : ..:                                        
CCDS32 PAGSFITAATNGPPVLVKKEKEMVGALVSDGLDRKEPRAGEVICIDD
    1920      1930      1940      1950      1960      

>>CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17               (2000 aa)
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pF1KB7 MENEDEMSEEEDGGLEAFDDFFPVEPVSLPKKKKPKKLKENK-CKGKRKKKEGSNDELSE
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CCDS32 ISFPPGLCWGDRMPDKDDIRLLPSALGVKKRKRGPKKQKENKPGKPRKRKKRDSEEEFGS
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pF1KB7 NEEDLEEKSESEGSDYS--PNKKKKKKLKDKKEKKAKRKKKDEDEDDNDDGCLK--EPKS
       .... .::::: ::.:.  :..:...: ..:::::.::.:: :      ::  :  : ::
CCDS32 ERDEYREKSESGGSEYGTGPGRKRRRKHREKKEKKTKRRKKGEG-----DGGQKQVEQKS
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pF1KB7 SGQLMAEWGLDDVDYLFSEEDYHTLTNYKAFSQFLRPLIAKKNPKIPMSKMMTVLGAKWR
       :. :.  :::.::...::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::
CCDS32 SATLLLTWGLEDVEHVFSEEDYHTLTNYKAFSQFMRPLIAKKNPKIPMSKMMTILGAKWR
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pF1KB7 EFSANNPFKGSSAAAAAAAVAAAVET-------VTISPPLAVS-PPQVP-------QPVP
       :::::::::::.::.::::.:::. .       :. . :.: : :: .:       :: :
CCDS32 EFSANNPFKGSAAAVAAAAAAAAAAVAEQVSAAVSSATPIAPSGPPALPPPPAADIQPPP
          200       210       220       230       240       250    

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pF1KB7 IRKAKTKEGKGPGVRKKIKGSK--DGKKKGKGKKTAGLKFRFGGISNKRKKGSS------
       ::.:::::::::: ... :. .  ::.:: .::: : ::...: ...:::::.:      
CCDS32 IRRAKTKEGKGPGHKRRSKSPRVPDGRKKLRGKKMAPLKIKLGLLGGKRKKGGSYVFQSD
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pF1KB7 -SEEDEREESDFDSASIHSASVRSECSAALGKKSKRR--RKKKRI---------DDGDGY
        . : : ::::.::.:.:::: : .  .   : .. :  ::::..         .. :::
CCDS32 EGPEPEAEESDLDSGSVHSASGRPDGPVRTKKLKRGRPGRKKKKVLGCPAVAGEEEVDGY
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pF1KB7 ETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHLVCLDPELEKAPEGKWSCPHCEKEGIQWEPKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::.::: :.
CCDS32 ETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHLVCLDPELDRAPEGKWSCPHCEKEGVQWEAKE
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pF1KB7 DDDE-EEEG---GCEEEEDDHMEFCRVCKDGGELLCCDACPSSYHLHCLNPPLPEIPNGE
       ...: ::::   : .::::::::.:::::::::::::::: ::::.::::::::.:::::
CCDS32 EEEEYEEEGEEEGEKEEEDDHMEYCRVCKDGGELLCCDACISSYHIHCLNPPLPDIPNGE
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       ::::::::: :::.::.:::::: :::    :..:.:   : .:..:::.::.:  ::::
CCDS32 WLCPRCTCPVLKGRVQKILHWRWGEPP----VAVPAPQQADGNPDVPPPRPLQGRSEREF
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pF1KB7 FVKWAGLSYWHCSWVKELQLELYHTVMYRNYQRKNDMDEPPPFDYGSGDEDGKSEKRKNK
       ::::.:::::::::.::::::..: :::::::::::::::::.:::::..::::.::: :
CCDS32 FVKWVGLSYWHCSWAKELQLEIFHLVMYRNYQRKNDMDEPPPLDYGSGEDDGKSDKRKVK
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pF1KB7 DPLYAKMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSFDKKGDVHYLIKWKDLPYDQCTWEIDDIDI
       :: ::.:::..::.::::::: .:::.::: ::::. :::.::.:::::: ::: :...:
CCDS32 DPHYAEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRIINHSVDKKGNYHYLVKWRDLPYDQSTWEEDEMNI
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pF1KB7 PYYDNLKQAYWGHRELMLGEDTRLPKRLLKKGKKLRDDKQEKPPDTPIVDPTVKFDKQPW
       : :.. ::.:: ::::..:::   :..  :: :.:. :    ::..:  :::::.. :: 
CCDS32 PEYEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKYKKKKKELQGD---GPPSSPTNDPTVKYETQPR
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pF1KB7 YIDSTGGTLHPYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTIVFLYSLYKEGHSKGP
       .: .:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.:::
CCDS32 FITATGGTLHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTIQTIVFLYSLYKEGHTKGP
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pF1KB7 YLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDFYVVTYTGDKESRSVIRENEFSFEDNAIRSGKKVFRM
       .::::::::::::::::.:::: ::::::::::.::..:::::::::::::..:::.:.:
CCDS32 FLVSAPLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIKGGKKAFKM
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pF1KB7 KKEVQIKFHVLLTSYELITIDQAILGSIEWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNSYKIDYK
       :.:.:.::::::::::::::::: ::::.::::::::::::::::::::::::.::::.:
CCDS32 KREAQVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYKIDHK
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pF1KB7 LLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRR
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pF1KB7 LKADVFKNMPAKTELIVRVELSQMQKKYYKFILTRNFEALNSKGGGNQVSLLNIMMDLKK
       :::::::::::::::::::::: :::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS32 LKADVFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNSRGGGNQVSLLNIMMDLKK
       970       980       990      1000      1010      1020       

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pF1KB7 CCNHPYLFPVAAVEAPVLPNGSYDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQMTK
       ::::::::::::.:.: ::.:.:.:..:.:::::::::::::.::...::::::::::::
CCDS32 CCNHPYLFPVAAMESPKLPSGAYEGGALIKSSGKLMLLQKMLRKLKEQGHRVLIFSQMTK
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pF1KB7 MLDLLEDFLEYEGYKYERIDGGITGGLRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLAT
       :::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MLDLLEDFLDYEGYKYERIDGGITGALRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLAT
      1090      1100      1110      1120      1130      1140       

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pF1KB7 ADTVIIYDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQNKKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHL
       ::::::.::::::::::::::::::::: .::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ADTVIIFDSDWNPHNDIQAFSRAHRIGQANKVMIYRFVTRASVEERITQVAKRKMMLTHL
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pF1KB7 VVRPGLGSKSGSMTKQELDDILKFGTEELFKDDVEGMMSQGQRPVTPIPDVQSSKGGNLA
       :::::::::.:::.::::::::::::::::::. ::                        
CCDS32 VVRPGLGSKAGSMSKQELDDILKFGTEELFKDENEG------------------------
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pF1KB7 ASAKKKHGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDAAISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSFKVA
                    .::. :::::::::. ::..:::::::::.::..:::::::::::::
CCDS32 -------------ENKE-EDSSVIHYDNEAIARLLDRNQDATEDTDVQNMNEYLSSFKVA
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pF1KB7 QYVVREEDGVEEVEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRIRKQVNY
       :::::::: .::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS32 QYVVREEDKIEEIEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARNLGKGKRVRKQVNY
    1290      1300      1310      1320      1330      1340         

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       :::.::::       :::::::.:::.:::::.:::::   ::::.:::....:::::::
CCDS32 NDAAQEDQ-------DNQSEYSVGSEEEDEDFDERPEG---RRQSKRQLRNEKDKPLPPL
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pF1KB7 LARVGGNIEVLGFNARQRKAFLNAIMRWGMPPQDAFNSHWLVRDLRGKSEKEFRAYVSLF
       ::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::...:::::::::.::::.::::::
CCDS32 LARVGGNIEVLGFNTRQRKAFLNAVMRWGMPPQDAFTTQWLVRDLRGKTEKEFKAYVSLF
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pF1KB7 MRHLCEPGADGAETFADGVPREGLSRQHVLTRIGVMSLVRKKVQEFEHVNGKYSTPDLIP
       :::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::::.::::::::.::..: :.:.:
CCDS32 MRHLCEPGADGSETFADGVPREGLSRQQVLTRIGVMSLVKKKVQEFEHINGRWSMPELMP
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pF1KB7 EGPEGKKSGEVISSDPNTPVPASPAHLLPAPLGLPDKMEAQLGYMDEKDPGAQKPRQPLE
       .    .:     ::  ..:. .::.    .  . :   .      .::  :    : :::
CCDS32 DPSADSKR----SSRASSPTKTSPTTPEASATNSPCTSKPATPAPSEKGEGI---RTPLE
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pF1KB7 VQALPAALDRVESEDKHESPASKERAREERPEETEKAPPSP---EQL-PRE---------
                . :.:...:.: .. :  :.   :..   :.:   :.: ::.         
CCDS32 ---------KEEAENQEEKPEKNSRIGEKMETEADAPSPAPSLGERLEPRKIPLEDEVPG
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pF1KB7 ---EVLPEKEKILDKLELSLIHSRGDSSELRPDDTKAEEKEPIETQQNGD--KEED----
          :. ::     :. . .   . :. .: .: : . ....:    ..::  :.::    
CCDS32 VPGEMEPEPGYRGDREKSATESTPGERGEEKPLDGQEHRERP--EGETGDLGKREDVKGD
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pF1KB7 --------DE----GKKEDKKGKFKFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAVSSGKIYDIWH
               ::    :..:.:  : .::::::::::::::::::::::::.::::. .:::
CCDS32 RELRPGPRDEPRSNGRREEKTEKPRFMFNIADGGFTELHTLWQNEERAAISSGKLNEIWH
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pF1KB7 RRHDYWLLAGIVTHGYARWQDIQNDPRYMILNEPFKSEVHKGNYLEMKNKFLARRFKLLE
       :::::::::::: :::::::::::: .. :.:::::.:..:::.::::::::::::::::
CCDS32 RRHDYWLLAGIVLHGYARWQDIQNDAQFAIINEPFKTEANKGNFLEMKNKFLARRFKLLE
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pF1KB7 QALVIEEQLRRAAYLNMTQDPNHPAMALNARLAEVECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVL
       ::::::::::::::::..:.: ::::::.::.::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QALVIEEQLRRAAYLNLSQEPAHPAMALHARFAEAECLAESHQHLSKESLAGNKPANAVL
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pF1KB7 HKVLNQLEELLSDMKADVTRLPSMLSRIPPVAARLQMSERSILSRLTNRAGDP----TIQ
       ::::::::::::::::::::::. ::::::.:::::::::::::::.... .:    .  
CCDS32 HKVLNQLEELLSDMKADVTRLPATLSRIPPIAARLQMSERSILSRLASKGTEPHPTPAYP
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pF1KB7 QGAFGSSQMYSNNFGPNFRGPGPGGIVNYNQMPLGPYVTDI                   
        : ...   :.  :.    :   .. .::.::: : ..:                     
CCDS32 PGPYATPPGYGAAFSAAPVGALAAAGANYSQMPAGSFITAATNGPPVLVKKEKEMVGALV
            1930      1940      1950      1960      1970      1980 

CCDS32 SDGLDRKEPRAGEVICIDD
            1990      2000

>>CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17               (2059 aa)
 initn: 6766 init1: 3445 opt: 5266  Z-score: 3519.2  bits: 664.7 E(32554): 1.1e-189
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pF1KB7 MENEDEMSEEEDGGLEAFDDFFPVEPVSLPKKKKPKKLKENK-CKGKRKKKEGSNDELSE
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CCDS32 PPPPLPPPPPPPPPDKDDIRLLPSALGVKKRKRGPKKQKENKPGKPRKRKKRDSEEEFGS
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       .... .::::: ::.:.  :..:...: ..:::::.::.:: :      ::  :  : ::
CCDS32 ERDEYREKSESGGSEYGTGPGRKRRRKHREKKEKKTKRRKKGEG-----DGGQKQVEQKS
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       :. :.  :::.::...::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.::::::
CCDS32 SATLLLTWGLEDVEHVFSEEDYHTLTNYKAFSQFMRPLIAKKNPKIPMSKMMTILGAKWR
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       :::::::::::.::.::::.:::. .       :. . :.: : :: .:       :: :
CCDS32 EFSANNPFKGSAAAVAAAAAAAAAAVAEQVSAAVSSATPIAPSGPPALPPPPAADIQPPP
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       ::.:::::::::: ... :. .  ::.:: .::: : ::...: ...:::::.:      
CCDS32 IRRAKTKEGKGPGHKRRSKSPRVPDGRKKLRGKKMAPLKIKLGLLGGKRKKGGSYVFQSD
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pF1KB7 -SEEDEREESDFDSASIHSASVRSECSAALGKKSKRR--RKKKRI---------DDGDGY
        . : : ::::.::.:.:::: : .  .   : .. :  ::::..         .. :::
CCDS32 EGPEPEAEESDLDSGSVHSASGRPDGPVRTKKLKRGRPGRKKKKVLGCPAVAGEEEVDGY
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pF1KB7 ETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHLVCLDPELEKAPEGKWSCPHCEKEGIQWEPKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::.::: :.
CCDS32 ETDHQDYCEVCQQGGEIILCDTCPRAYHLVCLDPELDRAPEGKWSCPHCEKEGVQWEAKE
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pF1KB7 DDDE-EEEG---GCEEEEDDHMEFCRVCKDGGELLCCDACPSSYHLHCLNPPLPEIPNGE
       ...: ::::   : .::::::::.:::::::::::::::: ::::.::::::::.:::::
CCDS32 EEEEYEEEGEEEGEKEEEDDHMEYCRVCKDGGELLCCDACISSYHIHCLNPPLPDIPNGE
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pF1KB7 WLCPRCTCPPLKGKVQRILHWRWTEPPAPFMVGLPGP---DVEPSLPPPKPLEGIPEREF
       ::::::::: :::.::.:::::: :::    :..:.:   : .:..:::.::.:  ::::
CCDS32 WLCPRCTCPVLKGRVQKILHWRWGEPP----VAVPAPQQADGNPDVPPPRPLQGRSEREF
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pF1KB7 FVKWAGLSYWHCSWVKELQLELYHTVMYRNYQRKNDMDEPPPFDYGSGDEDGKSEKRKNK
       ::::.:::::::::.::::::..: :::::::::::::::::.:::::..::::.::: :
CCDS32 FVKWVGLSYWHCSWAKELQLEIFHLVMYRNYQRKNDMDEPPPLDYGSGEDDGKSDKRKVK
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pF1KB7 DPLYAKMEERFYRYGIKPEWMMIHRILNHSFDKKGDVHYLIKWKDLPYDQCTWEIDDIDI
       :: ::.:::..::.::::::: .:::.::: ::::. :::.::.:::::: ::: :...:
CCDS32 DPHYAEMEEKYYRFGIKPEWMTVHRIINHSVDKKGNYHYLVKWRDLPYDQSTWEEDEMNI
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pF1KB7 PYYDNLKQAYWGHRELMLGEDTRLPKRLLKKGKKLRDDKQEKPPDTPIVDPTVKFDKQPW
       : :.. ::.:: ::::..:::   :..  :: :.:. :    ::..:  :::::.. :: 
CCDS32 PEYEEHKQSYWRHRELIMGEDPAQPRKYKKKKKELQGD---GPPSSPTNDPTVKYETQPR
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pF1KB7 YIDSTGGTLHPYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTVQTIVFLYSLYKEGHSKGP
       .: .:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.:::
CCDS32 FITATGGTLHMYQLEGLNWLRFSWAQGTDTILADEMGLGKTIQTIVFLYSLYKEGHTKGP
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pF1KB7 YLVSAPLSTIINWEREFEMWAPDFYVVTYTGDKESRSVIRENEFSFEDNAIRSGKKVFRM
       .::::::::::::::::.:::: ::::::::::.::..:::::::::::::..:::.:.:
CCDS32 FLVSAPLSTIINWEREFQMWAPKFYVVTYTGDKDSRAIIRENEFSFEDNAIKGGKKAFKM
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pF1KB7 KKEVQIKFHVLLTSYELITIDQAILGSIEWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNSYKIDYK
       :.:.:.::::::::::::::::: ::::.::::::::::::::::::::::::.::::.:
CCDS32 KREAQVKFHVLLTSYELITIDQAALGSIRWACLVVDEAHRLKNNQSKFFRVLNGYKIDHK
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pF1KB7 LLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLLTGTPLQNNLEELFHLLNFLTPERFNNLEGFLEEFADISKEDQIKKLHDLLGPHMLRR
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pF1KB7 LKADVFKNMPAKTELIVRVELSQMQKKYYKFILTRNFEALNSKGGGNQVSLLNIMMDLKK
       :::::::::::::::::::::: :::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS32 LKADVFKNMPAKTELIVRVELSPMQKKYYKYILTRNFEALNSRGGGNQVSLLNIMMDLKK
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pF1KB7 CCNHPYLFPVAAVEAPVLPNGSYDGSSLVKSSGKLMLLQKMLKKLRDEGHRVLIFSQMTK
       ::::::::::::.:.: ::.:.:.:..:.:::::::::::::.::...::::::::::::
CCDS32 CCNHPYLFPVAAMESPKLPSGAYEGGALIKSSGKLMLLQKMLRKLKEQGHRVLIFSQMTK
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pF1KB7 MLDLLEDFLEYEGYKYERIDGGITGGLRQEAIDRFNAPGAQQFCFLLSTRAGGLGINLAT
       :::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS32 SDGLDRKEPRAGEVICIDD
             2050         

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CCDS47 LLHFLEPSRFPSETTFMQEFGDLKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKEETII
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CCDS47 EVELTNIQKKYYRAILEKNFTFL-SKGGGQANVPNLLNTMMELRKCCNHPYL--INGAEE
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CCDS47 KILEEFKETHNAESPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLKAGGHRVLIFSQMVRCLDILE
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CCDS47 DYLIQRRYPYERIDGRVRGNLRQAAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCII
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CCDS47 FDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKSVKIYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAV----L
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CCDS47 QSMSGRENATN-------GVQQLSKKEIEDLLRKGAY-------------GALM------
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pF1KB7 HGSTPPGDNKDVEDSSVIHYDDAAISKLLDRNQDATDDTELQNMNEYLSSFKVAQYVVRE
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CCDS47 -------DEED-EGSKFCEEDIDQI--LLRRTHTITIESEGKG-----STFAKASFVA--
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pF1KB7 EDGVEEVEREIIKQEENVDPDYWEKLLRHHYEQQQEDLARN--LGKGKRIRKQVNYNDAS
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CCDS47 -SG----NRTDISLD---DPNFWQKWAKKAELDIDALNGRNNLVIDTPRVRKQTRLYSAV
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CCDS47 KEDELM--EFSDLES-----------DSEEKPCAKPRRPQDKSQGYA-RSECF-----RV
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CCDS47 EKNLLVYGWG-RWTDILSHGRYKRQLTEQDV---ETICRTILVYCLNHYKGDENIKSFIW
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CCDS13 EDLDFKVVDDDGETIAVLGAGRTSALSASTLAWQAEEPPEDDANIIEKILASKTVQEVHP
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       .  ::  ::      :.::. ..:: ::.:.   .::    .  .  . .:         
CCDS13 G-EPPFDLE-----LFYVKYRNFSYLHCKWATMEELEKDPRIAQKIKRFRN---------
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               :. . :.   .... .: ..    .:... . :::.  :. : . :.  .::
CCDS13 --------KQAQMKH---IFTEPDEDLF----NPDYVEVDRILEVAHTKDAETGEEVTHY
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       :.:: .:::.. :::.. :.:                         : .. :. ..:.  
CCDS13 LVKWCSLPYEESTWELEEDVD-------------------------PAKV-KEFESLQVL
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        . :  . :  :   :..:.  : .:.   :. :::::.::: :.: .  . ::::::::
CCDS13 PEIKHVERPASDSWQKLEKSREYKNSN--QLREYQLEGMNWLLFNWYNRKNCILADEMGL
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       :::.:.:.::  .. .:  .::.:. :::::: ::::::. :. .. ...: :.. ::..
CCDS13 GKTIQSITFLSEIFLRG-IHGPFLIIAPLSTITNWEREFRTWT-EMNAIVYHGSQISRQM
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CCDS13 IQQYEMVYRDAQGNPLSGVF--------KFHVVITTFEMILADCPELKKIHWSCVIIDEA
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CCDS13 HRLKNRNCKLLEGLKLMALEHKVLLTGTPLQNSVEELFSLLNFLEPSQFPSETAFLEEFG
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pF1KB7 DISKEDQIKKLHDLLGPHMLRRLKADVFKNMPAKTELIVRVELSQMQKKYYKFILTRNFE
       :.. :.:.:::...: : :::::: :: ::.  : : :..:::...:::::. :: .:: 
CCDS13 DLKTEEQVKKLQSILKPMMLRRLKDDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFS
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CCDS13 FL-TKGANQHNMPNLINTMMELRKCCNHPYL--INGAEEKILEDFRKTHSPDAPDFQLQA
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CCDS13 MIQAAGKLVLIDKLLPKLIAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYTYERIDGRVRGNL
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CCDS13 RQAAIDRFCKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIG
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CCDS13 QSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQD-INRKGGTN-----------GVQ
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CCDS13 QLSKMEVEDLLRKGAY-------------GALM-------------DEED-EGSKFCEED
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          :...:.:    :    .:. ..  :.:  :..:.   .:    .:  :. .   ::.
CCDS13 ---IDQILQRR---THTITIQSEGKG-STFAKASFVA---SG----NRTDISLD---DPN
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pF1KB7 YWEKLLR-HHYEQQQEDLARNLGKGK-RIRKQVNYNDASQEDQEWQDELSDNQSEYSIGS
       .:.:  .  . . . ..  ..:   . :.:::... .. .::     ::     :.:   
CCDS13 FWQKWAKIAELDTEAKNEKESLVIDRPRVRKQTKHYNSFEED-----ELM----EFS---
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CCDS13 -ELDSDSDERPT------RSRR-LNDKARRYLRAECFRVEKNLLIFGWG-RWKDILTHGR
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CCDS13 FKWHLNEKDM---EMICRALLVYCVKHYKGDEKIKSFIWELITPTKDGQAQTLQN---HS
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CCDS13 GLSAPVPRGRKGKKTKNQLLIPELKDADWLATCNPEVVLHDDGYKKHLKQHCNKVLLRVR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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