Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7326
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7326, 1215 aa
1>>>pF1KB7326 1215 - 1215 aa - 1215 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.4371+/-0.00138; mu= -13.9530+/- 0.081
mean_var=336.8749+/-76.291, 0's: 0 Z-trim(107.4): 448 B-trim: 254 in 1/52
Lambda= 0.069878
statistics sampled from 9024 (9544) to 9024 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.638), E-opt: 0.2 (0.293), width: 16
Scan time: 4.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7884.1 HIPK3 gene_id:10114|Hs108|chr11 (1215) 8177 839.9 0
CCDS41634.1 HIPK3 gene_id:10114|Hs108|chr11 (1194) 5187 538.5 3.7e-152
CCDS75666.1 HIPK2 gene_id:28996|Hs108|chr7 (1171) 3002 318.2 7.4e-86
CCDS867.1 HIPK1 gene_id:204851|Hs108|chr1 (1210) 2944 312.4 4.4e-84
CCDS868.1 HIPK1 gene_id:204851|Hs108|chr1 (1075) 2580 275.7 4.4e-73
CCDS75667.1 HIPK2 gene_id:28996|Hs108|chr7 (1198) 2570 274.7 9.7e-73
CCDS41370.1 HIPK1 gene_id:204851|Hs108|chr1 ( 836) 1404 157.1 1.7e-37
CCDS869.1 HIPK1 gene_id:204851|Hs108|chr1 ( 816) 1224 138.9 4.9e-32
CCDS12555.1 HIPK4 gene_id:147746|Hs108|chr19 ( 616) 1095 125.9 3.2e-28
CCDS13654.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21 ( 529) 746 90.6 1.1e-17
CCDS42926.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21 ( 584) 746 90.7 1.2e-17
CCDS13653.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21 ( 754) 746 90.7 1.5e-17
CCDS42925.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21 ( 763) 746 90.7 1.5e-17
CCDS12543.1 DYRK1B gene_id:9149|Hs108|chr19 ( 629) 713 87.4 1.3e-16
CCDS46075.1 DYRK1B gene_id:9149|Hs108|chr19 ( 589) 700 86.0 2.9e-16
CCDS12544.1 DYRK1B gene_id:9149|Hs108|chr19 ( 601) 700 86.0 3e-16
CCDS8530.1 DYRK4 gene_id:8798|Hs108|chr12 ( 520) 681 84.1 1e-15
CCDS8979.1 DYRK2 gene_id:8445|Hs108|chr12 ( 528) 661 82.1 4.1e-15
CCDS8978.1 DYRK2 gene_id:8445|Hs108|chr12 ( 601) 661 82.1 4.6e-15
CCDS31000.1 DYRK3 gene_id:8444|Hs108|chr1 ( 568) 615 77.5 1.1e-13
CCDS30999.1 DYRK3 gene_id:8444|Hs108|chr1 ( 588) 615 77.5 1.1e-13
CCDS4488.1 PRPF4B gene_id:8899|Hs108|chr6 (1007) 548 70.8 1.9e-11
>>CCDS7884.1 HIPK3 gene_id:10114|Hs108|chr11 (1215 aa)
initn: 8177 init1: 8177 opt: 8177 Z-score: 4474.2 bits: 839.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8177; 100.0% identity (100.0% similar) in 1215 aa overlap (1-1215:1-1215)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MASQVLVYPPYVYQTQSSAFCSVKKLKVEPSSCVFQERNYPRTYVNGRNFGNSHPPTKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MASQVLVYPPYVYQTQSSAFCSVKKLKVEPSSCVFQERNYPRTYVNGRNFGNSHPPTKGS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 AFQTKIPFNRPRGHNFSLQTSAVVLKNTAGATKVIAAQAQQAHVQAPQIGAWRNRLHFLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AFQTKIPFNRPRGHNFSLQTSAVVLKNTAGATKVIAAQAQQAHVQAPQIGAWRNRLHFLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GPQRCGLKRKSEELDNHSSAMQIVDELSILPAMLQTNMGNPVTVVTATTGSKQNCTTGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GPQRCGLKRKSEELDNHSSAMQIVDELSILPAMLQTNMGNPVTVVTATTGSKQNCTTGEG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 DYQLVQHEVLCSMKNTYEVLDFLGRGTFGQVVKCWKRGTNEIVAIKILKNHPSYARQGQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DYQLVQHEVLCSMKNTYEVLDFLGRGTFGQVVKCWKRGTNEIVAIKILKNHPSYARQGQI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 EVSILARLSTENADEYNFVRAYECFQHRNHTCLVFEMLEQNLYDFLKQNKFSPLPLKVIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 EVSILARLSTENADEYNFVRAYECFQHRNHTCLVFEMLEQNLYDFLKQNKFSPLPLKVIR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 PILQQVATALKKLKSLGLIHADLKPENIMLVDPVRQPYRVKVIDFGSASHVSKTVCSTYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PILQQVATALKKLKSLGLIHADLKPENIMLVDPVRQPYRVKVIDFGSASHVSKTVCSTYL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 QSRYYRAPEIILGLPFCEAIDMWSLGCVIAELFLGWPLYPGALEYDQIRYISQTQGLPGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 QSRYYRAPEIILGLPFCEAIDMWSLGCVIAELFLGWPLYPGALEYDQIRYISQTQGLPGE
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430 440 450 460 470 480
pF1KB7 QLLNVGTKSTRFFCKETDMSHSGWRLKTLEEHEAETGMKSKEARKYIFNSLDDVAHVNTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 QLLNVGTKSTRFFCKETDMSHSGWRLKTLEEHEAETGMKSKEARKYIFNSLDDVAHVNTV
430 440 450 460 470 480
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pF1KB7 MDLEGSDLLAEKADRREFVSLLKKMLLIDADLRITPAETLNHPFVNMKHLLDFPHSNHVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MDLEGSDLLAEKADRREFVSLLKKMLLIDADLRITPAETLNHPFVNMKHLLDFPHSNHVK
490 500 510 520 530 540
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pF1KB7 SCFHIMDICKSHLNSCDTNNHNKTSLLRPVASSSTATLTANFTKIGTLRSQALTTSAHSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 SCFHIMDICKSHLNSCDTNNHNKTSLLRPVASSSTATLTANFTKIGTLRSQALTTSAHSV
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pF1KB7 VHHGIPLQAGTAQFGCGDAFQQTLIICPPAIQGIPATHGKPTSYSIRVDNTVPLVTQAPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VHHGIPLQAGTAQFGCGDAFQQTLIICPPAIQGIPATHGKPTSYSIRVDNTVPLVTQAPA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 VQPLQIRPGVLSQTWSGRTQQMLVPAWQQVTPLAPATTTLTSESVAGSHRLGDWGKMISC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VQPLQIRPGVLSQTWSGRTQQMLVPAWQQVTPLAPATTTLTSESVAGSHRLGDWGKMISC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 SNHYNSVMPQPLLTNQITLSAPQPVSVGIAHVVWPQPATTKKNKQCQNRGILVKLMEWEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 SNHYNSVMPQPLLTNQITLSAPQPVSVGIAHVVWPQPATTKKNKQCQNRGILVKLMEWEP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 GREEINAFSWSNSLQNTNIPHSAFISPKIINGKDVEEVSCIETQDNQNSEGEARNCCETS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GREEINAFSWSNSLQNTNIPHSAFISPKIINGKDVEEVSCIETQDNQNSEGEARNCCETS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 IRQDSDSSVSDKQRQTIIIADSPSPAVSVITISSDTDEEETSQRHSLRECKGSLDCEACQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 IRQDSDSSVSDKQRQTIIIADSPSPAVSVITISSDTDEEETSQRHSLRECKGSLDCEACQ
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910 920 930 940 950 960
pF1KB7 STLNIDRMCSLSSPDSTLSTSSSGQSSPSPCKRPNSMSDEEQESSCDTVDGSPTSDSSGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 STLNIDRMCSLSSPDSTLSTSSSGQSSPSPCKRPNSMSDEEQESSCDTVDGSPTSDSSGH
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pF1KB7 DSPFAESTFVEDTHENTELVSSADTETKPAVCSVVVPPVELENGLNADEHMANTDSICQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DSPFAESTFVEDTHENTELVSSADTETKPAVCSVVVPPVELENGLNADEHMANTDSICQP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB7 LIKGRSAPGRLNQPSAVGTRQQKLTSAFQQQHLNFSQVQHFGSGHQEWNGNFGHRRQQAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 LIKGRSAPGRLNQPSAVGTRQQKLTSAFQQQHLNFSQVQHFGSGHQEWNGNFGHRRQQAY
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB7 IPTSVTSNPFTLSHGSPNHTAVHAHLAGNTHLGGQPTLLPYPSSATLSSAAPVAHLLASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 IPTSVTSNPFTLSHGSPNHTAVHAHLAGNTHLGGQPTLLPYPSSATLSSAAPVAHLLASP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB7 CTSRPMLQHPTYNISHPSGIVHQVPVGLNPRLLPSPTIHQTQYKPIFPPHSYIAASPAYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 CTSRPMLQHPTYNISHPSGIVHQVPVGLNPRLLPSPTIHQTQYKPIFPPHSYIAASPAYT
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210
pF1KB7 GFPLSPTKLSQYPYM
:::::::::::::::
CCDS78 GFPLSPTKLSQYPYM
1210
>>CCDS41634.1 HIPK3 gene_id:10114|Hs108|chr11 (1194 aa)
initn: 8013 init1: 5158 opt: 5187 Z-score: 2845.2 bits: 538.5 E(32554): 3.7e-152
Smith-Waterman score: 7975; 98.3% identity (98.3% similar) in 1215 aa overlap (1-1215:1-1194)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MASQVLVYPPYVYQTQSSAFCSVKKLKVEPSSCVFQERNYPRTYVNGRNFGNSHPPTKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MASQVLVYPPYVYQTQSSAFCSVKKLKVEPSSCVFQERNYPRTYVNGRNFGNSHPPTKGS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 AFQTKIPFNRPRGHNFSLQTSAVVLKNTAGATKVIAAQAQQAHVQAPQIGAWRNRLHFLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AFQTKIPFNRPRGHNFSLQTSAVVLKNTAGATKVIAAQAQQAHVQAPQIGAWRNRLHFLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GPQRCGLKRKSEELDNHSSAMQIVDELSILPAMLQTNMGNPVTVVTATTGSKQNCTTGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GPQRCGLKRKSEELDNHSSAMQIVDELSILPAMLQTNMGNPVTVVTATTGSKQNCTTGEG
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190 200 210 220 230 240
pF1KB7 DYQLVQHEVLCSMKNTYEVLDFLGRGTFGQVVKCWKRGTNEIVAIKILKNHPSYARQGQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DYQLVQHEVLCSMKNTYEVLDFLGRGTFGQVVKCWKRGTNEIVAIKILKNHPSYARQGQI
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250 260 270 280 290 300
pF1KB7 EVSILARLSTENADEYNFVRAYECFQHRNHTCLVFEMLEQNLYDFLKQNKFSPLPLKVIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EVSILARLSTENADEYNFVRAYECFQHRNHTCLVFEMLEQNLYDFLKQNKFSPLPLKVIR
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310 320 330 340 350 360
pF1KB7 PILQQVATALKKLKSLGLIHADLKPENIMLVDPVRQPYRVKVIDFGSASHVSKTVCSTYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PILQQVATALKKLKSLGLIHADLKPENIMLVDPVRQPYRVKVIDFGSASHVSKTVCSTYL
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pF1KB7 QSRYYRAPEIILGLPFCEAIDMWSLGCVIAELFLGWPLYPGALEYDQIRYISQTQGLPGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QSRYYRAPEIILGLPFCEAIDMWSLGCVIAELFLGWPLYPGALEYDQIRYISQTQGLPGE
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430 440 450 460 470 480
pF1KB7 QLLNVGTKSTRFFCKETDMSHSGWRLKTLEEHEAETGMKSKEARKYIFNSLDDVAHVNTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QLLNVGTKSTRFFCKETDMSHSGWRLKTLEEHEAETGMKSKEARKYIFNSLDDVAHVNTV
430 440 450 460 470 480
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pF1KB7 MDLEGSDLLAEKADRREFVSLLKKMLLIDADLRITPAETLNHPFVNMKHLLDFPHSNHVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MDLEGSDLLAEKADRREFVSLLKKMLLIDADLRITPAETLNHPFVNMKHLLDFPHSNHVK
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550 560 570 580 590 600
pF1KB7 SCFHIMDICKSHLNSCDTNNHNKTSLLRPVASSSTATLTANFTKIGTLRSQALTTSAHSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SCFHIMDICKSHLNSCDTNNHNKTSLLRPVASSSTATLTANFTKIGTLRSQALTTSAHSV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 VHHGIPLQAGTAQFGCGDAFQQTLIICPPAIQGIPATHGKPTSYSIRVDNTVPLVTQAPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VHHGIPLQAGTAQFGCGDAFQQTLIICPPAIQGIPATHGKPTSYSIRVDNTVPLVTQAPA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 VQPLQIRPGVLSQTWSGRTQQMLVPAWQQVTPLAPATTTLTSESVAGSHRLGDWGKMISC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VQPLQIRPGVLSQTWSGRTQQMLVPAWQQVTPLAPATTTLTSESVAGSHRLGDWGKMISC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 SNHYNSVMPQPLLTNQITLSAPQPVSVGIAHVVWPQPATTKKNKQCQNRGILVKLMEWEP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SNHYNSVMPQPLLTNQITLSAPQPVSVGIAHVVWPQPATTKKNKQCQNR-----------
730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 GREEINAFSWSNSLQNTNIPHSAFISPKIINGKDVEEVSCIETQDNQNSEGEARNCCETS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ----------SNSLQNTNIPHSAFISPKIINGKDVEEVSCIETQDNQNSEGEARNCCETS
770 780 790 800 810
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pF1KB7 IRQDSDSSVSDKQRQTIIIADSPSPAVSVITISSDTDEEETSQRHSLRECKGSLDCEACQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IRQDSDSSVSDKQRQTIIIADSPSPAVSVITISSDTDEEETSQRHSLRECKGSLDCEACQ
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 STLNIDRMCSLSSPDSTLSTSSSGQSSPSPCKRPNSMSDEEQESSCDTVDGSPTSDSSGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 STLNIDRMCSLSSPDSTLSTSSSGQSSPSPCKRPNSMSDEEQESSCDTVDGSPTSDSSGH
880 890 900 910 920 930
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB7 DSPFAESTFVEDTHENTELVSSADTETKPAVCSVVVPPVELENGLNADEHMANTDSICQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DSPFAESTFVEDTHENTELVSSADTETKPAVCSVVVPPVELENGLNADEHMANTDSICQP
940 950 960 970 980 990
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB7 LIKGRSAPGRLNQPSAVGTRQQKLTSAFQQQHLNFSQVQHFGSGHQEWNGNFGHRRQQAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LIKGRSAPGRLNQPSAVGTRQQKLTSAFQQQHLNFSQVQHFGSGHQEWNGNFGHRRQQAY
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB7 IPTSVTSNPFTLSHGSPNHTAVHAHLAGNTHLGGQPTLLPYPSSATLSSAAPVAHLLASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IPTSVTSNPFTLSHGSPNHTAVHAHLAGNTHLGGQPTLLPYPSSATLSSAAPVAHLLASP
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB7 CTSRPMLQHPTYNISHPSGIVHQVPVGLNPRLLPSPTIHQTQYKPIFPPHSYIAASPAYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CTSRPMLQHPTYNISHPSGIVHQVPVGLNPRLLPSPTIHQTQYKPIFPPHSYIAASPAYT
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1210
pF1KB7 GFPLSPTKLSQYPYM
:::::::::::::::
CCDS41 GFPLSPTKLSQYPYM
1180 1190
>>CCDS75666.1 HIPK2 gene_id:28996|Hs108|chr7 (1171 aa)
initn: 3442 init1: 2298 opt: 3002 Z-score: 1654.9 bits: 318.2 E(32554): 7.4e-86
Smith-Waterman score: 3754; 51.5% identity (73.8% similar) in 1256 aa overlap (1-1215:8-1171)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MASQVLVYPPYVYQTQSSAFCSVKKLKVEPSSC--VFQERNYPRTYVNGRNFG
:::.: :. :.. ::::::::::::.:::: . .. ..: ...:.
CCDS75 MAPVYEGMASHVQVFSPHTL--QSSAFCSVKKLKIEPSSNWDMTGYGSHSKVYSQSKNIP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KB7 NSHPPTKGSAFQTKIPFNRPRGHNFSLQ-TSAVVLKNTAGATKVIAAQAQQAHVQA---P
:.: : .. .:..: : :: ...:. ...: : .:.. .. :. :
CCDS75 LSQPAT--TTVSTSLPVPNP-----SLPYEQTIVFPGSTGHIVVTSASSTSVTGQVLGGP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 QIGAWRNRLHFLEGPQRCGLKRKSEELDNHSSAMQIVDELSILPAMLQTNMGNPVTVVTA
. :. . .:. :.:::::::::..: .:..::..: : :.:.: .. .::.::
CCDS75 HNLMRRSTVSLLDTYQKCGLKRKSEEIEN-TSSVQIIEEH---PPMIQNNASG-ATVATA
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 TTG---SKQNCTTGEGDYQLVQHEVLCSMKNTYEVLDFLGRGTFGQVVKCWKRGTNEIVA
::. ::.. ...::::::::::::::: ::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS75 TTSTATSKNSGSNSEGDYQLVQHEVLCSMTNTYEVLEFLGRGTFGQVVKCWKRGTNEIVA
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 IKILKNHPSYARQGQIEVSILARLSTENADEYNFVRAYECFQHRNHTCLVFEMLEQNLYD
:::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS75 IKILKNHPSYARQGQIEVSILARLSTESADDYNFVRAYECFQHKNHTCLVFEMLEQNLYD
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CCDS75 FGSASHVSKAVCSTYLQSRYYRAPEIILGLPFCEAIDMWSLGCVIAELFLGWPLYPGASE
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::::: :::.:.:: . ::::::.:.::::::::..:::::: :::: :::: :::::::
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:.: ::::::::.::::::. :.::: ..: :: :..:: .. :: :....:: .:.
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.. :...: ..: .:.....:::.::::. :. : :::.::.:::..::. :. .:
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..::.:..:.::.:::::..:::::.::.:.: .: . :::.:.: ::::.: .: :.
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:. :..::...:.:: . . ..::: .: :: :::...:: : ::..::.:::.
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::..: .:.:: :. :. : . . :.. . :. ..... :. :.. .
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. .: .: . :.. ..:.. ..:::::.: :.:::.:::::
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...:::.. . . .:...: .. : . . . :. . .. .:.
CCDS75 PRTIIVPPLKTQASEVLVECDSLVPVNTSHHSSSYKSKSSSNVTSTSGHSSGSSSGAITY
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CCDS75 HGTVHPHLAAAAAAAHLPTQPHLYTYTAPAALGSTGTVAHLVASQGSARHTVQHTAY---
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CCDS75 PYI
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CCDS86 HGSPLHSTGHPHLAPAPAHLPSQAHLYTYAAPTSAAALGSTSSIAHLFSPQGSSR----H
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CCDS86 TKISQYSYL
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CCDS86 SLLEPYQKCGLKRKSEEVDSNGS-VQIIEEHP--PLMLQNRTVVGAAATTTTVTT--KSS
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CCDS86 ARQGQIEVSILSRLSSENADEYNFVRSYECFQHKNHTCLVFEMLEQNLYDFLKQNKFSPL
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pF1KB7 PLKVIRPILQQVATALKKLKSLGLIHADLKPENIMLVDPVRQPYRVKVIDFGSASHVSKT
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pF1KB7 HSNHVKSCFHIMDICKSHLNSCDTNNHNKTSLLRPVASSSTATLTANFT-KIGTLRSQA-
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CCDS86 HSNHVKSCFQNMEICKRRVHMYDTVSQIKSPFTTHVAPNTSTNLTMSFSNQLNTVHNQAS
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CCDS86 VLASSSTAAAATLSLANSDVSLLNYQSALYPSSAAPVPGVAQQGVSLQPGTTQI-CTQTD
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CCDS86 NVGVAHVVRQQQSSSLPSKKNKQ------------------------------------S
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CCDS86 APVSSK----------SSLDVLPSQVYSLVGSSPLRTTSSYNSLVPVQD-QHQPIIIPDT
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CCDS86 PSPPVSVITIRSDTDEEEDNKY------KPSSSGLKPRSNV-ISYVTVNDSPDSDSSLSS
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... : :: : : . ..::. :
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990 1000 1010 1020 1030 1040
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CCDS86 TKPVASVSGQSSGCCITPTGYRAQRGGTSAAQPLNLSQVSAMGYCLLFGPCTVVTFWRTL
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:::.: :. :.. ::::::::::::.:::: . .. ..: ...:.
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10 20 30 40 50
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:.: : .. .:..: : :: ...:. ...: : .:.. .. :. :
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. :. . .:. :.:::::::::..: .:..::..: : :.:.: .. .::.::
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CCDS75 IKILKNHPSYARQGQIEVSILARLSTESADDYNFVRAYECFQHKNHTCLVFEMLEQNLYD
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::::::::::::: :::.:::::::: :::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS75 FLKQNKFSPLPLKYIRPVLQQVATALMKLKSLGLIHADLKPENIMLVDPSRQPYRVKVID
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:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
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::::::::::::::.: ::..:::.:::: ..:: . ::::: ..::::::.::::::
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::::: :::.:.:: . ::::::.:.::::::::..:::::: :::: :::: :::::::
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:.: ::::::::.::::::. :.::: ..: :: :..:: .. :: :....:: .:.
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pF1KB7 KIGTLRSQALTTSAHS---------------------------VVHHGIPLQAGTAQFGC
.. :...:: .... . :.....:::.::::. :
CCDS75 QLTTVHNQAPSSTSATISLANPEVSILNYPSTLYQPSAASMAAVAQRSMPLQTGTAQI-C
590 600 610 620 630 640
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pF1KB7 G--DAFQQTLIICPPAIQGIPATHGKPTSYSIRVDNTVPLVTQAPAVQPLQIRPGVLSQ-
. : :::.::.:::..::. :. .: ..::.:..:.::.:::::..:::::.::.:.:
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pF1KB7 TWSGRTQQMLVP-AWQQVTPLAPATT----TLTSESVAGSHRLGDWGKMISCSNHYNSVM
.: . :::.:.: ::::.: .: :. :. :..::...:.:: . . ..::: .:
CCDS75 AWPSGTQQILLPPAWQQLTGVATHTSVQHATVIPETMAGTQQLADWRNTHAHGSHYNPIM
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pF1KB7 PQP-LLTNQITLSAPQPVSVGIAHVVWPQPATT---KKNKQCQNRGILVKLMEWEPGREE
:: :::...:: : ::..::.:::. ::..: .:.:: :. :. : . .
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pF1KB7 INAFSWSNSLQNTNIPHSAFISPKIINGKDVEEVSCIETQDNQNSEGEARNCCETSIRQD
:.. . :. ..... :. :.. . . .: .: . :..
CCDS75 ISSPQRSKRVKENTPPRCAMVHSSPACSTSV---TC--------GWGDV-----------
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..:.. ..:::::.: :.:::.:::::::::::::: :.:.
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. . . .. :. . .: ... ...:::.. . . .:...: .
CCDS75 SVQQRAGHNNANAFDTKGSLENHCTGNPRTIIVPPLKTQASEVLVECDSLVPVNTSHHSS
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. : . . . :. . .. .:. :::. ::::. ::.::.:. : . .
CCDS75 SYKSKSSSNVTSTSGHSSGSSSGAITYRQQRPGPHFQQQQPLNLSQAQQ----HITTDRT
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: ::::.:.::::.: :. :: : ... .:.::.::.: ::::.:::::. :::.:
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.: : :::.:.:. :
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::. .: :.. :.......:.:: . : .:.:...: :: ::::..::..
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::..::.:::: : ... :::::
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pF1KB7 PHSAFISPKIINGKDVEEVSCIETQDNQNSEGEARNCCETSIRQDSDSSVSDKQRQTIII
:: .: : : ... .: . . .:. .: :.: :.: :::
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pF1KB7 ADSPSPAVSVITISSDTDEEETSQRHSLRECKGSLDCEACQSTLNIDRMCSLSSPDSTLS
:.::: :::::: ::::::: :. .
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:::: . : : : .: ::. :: :::: .::.. .:. .. .
CCDS41 PSSSGLK---P--RSNVISYV-------TVNDSPDSDSS-LSSPYSTDTLSALRGNSGSV
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pF1KB7 VSSADTETKPAVCS--VVVPPVELENG--LNADEHMANTDSICQPL--IKGRSAPGRLNQ
. . . .. . ..:::.. . : : . . .. .:. ..:.:. :
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pF1KB7 PSAVGTRQQKL-TSAFQQQHLNFSQVQHFGSG--HQEWNGNFGHRRQQAYIPTSVTSNPF
:. : : :. ::: : ::.:: :. ... :: ..: . :::::.. . ... :.
CCDS41 PT--GYRAQRGGTSA--AQPLNLSQNQQSSAAPTSQERSSNPAPRRQQAFV-APLSQAPY
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pF1KB7 TLSHGSPNHTAVHAHLA-GNTHLGGQPTLLPY--PSSAT-LSSAAPVAHLLASPCTSRPM
:..:::: :.. : ::: . .:: .: : : :.::. :.:.. .:::.. .::
CCDS41 TFQHGSPLHSTGHPHLAPAPAHLPSQAHLYTYAAPTSAAALGSTSSIAHLFSPQGSSR--
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: . .::: .::::::...: :: : .. .::. : .:::..: :::.:
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pF1KB7 LSPTKLSQYPYM
:::::.::: :.
CCDS41 LSPTKISQYSYL
830
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pF1KB7 CEAIDMWSLGCVIAELFLGWPLYPGALEYDQIRYISQTQGLPGEQLLNVGTKSTRFFCKE
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CCDS86 MVLMFQIRYISQTQGLPAEYLLSAGTKTTRFFNRD
10 20 30
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 TDMSHSGWRLKTLEEHEAETGMKSKEARKYIFNSLDDVAHVNTVMDLEGSDLLAEKADRR
.... ::::: :::: :::.::::::::::: :::.:.:: ::::.:.::::::::
CCDS86 PNLGYPLWRLKTPEEHELETGIKSKEARKYIFNCLDDMAQVNMSTDLEGTDMLAEKADRR
40 50 60 70 80 90
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pF1KB7 EFVSLLKKMLLIDADLRITPAETLNHPFVNMKHLLDFPHSNHVKSCFHIMDICKSHLNSC
:...:::::: :::: :::: .:::: ::.: :::::::::::::::. :.::: ...
CCDS86 EYIDLLKKMLTIDADKRITPLKTLNHQFVTMTHLLDFPHSNHVKSCFQNMEICKRRVHMY
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pF1KB7 DTNNHNKTSLLRPVASSSTATLTANFT-KIGTLRSQA--LTTS----------AHS----
:: .. :. . :: .....:: .:. ...:...:: :..: :.:
CCDS86 DTVSQIKSPFTTHVAPNTSTNLTMSFSNQLNTVHNQASVLASSSTAAAATLSLANSDVSL
160 170 180 190 200 210
600 610 620 630
pF1KB7 -----------------VVHHGIPLQAGTAQFGCG--DAFQQTLIICPPAIQ-GIPATHG
:...:. :: ::.:. : : ::::.:.::::.: :. ::
CCDS86 LNYQSALYPSSAAPVPGVAQQGVSLQPGTTQI-CTQTDPFQQTFIVCPPAFQTGLQATT-
220 230 240 250 260 270
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pF1KB7 KPTSYSIRVDNTVPLVTQAPAVQPLQIRPGVLSQ--------------------------
: ... .:.::.::.: ::::.:::::. :::.:
CCDS86 KHSGFPVRMDNAVPIVPQAPAAQPLQIQSGVLTQGSCTPLMVATLHPQVATITPQYAVPF
280 290 300 310 320 330
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pF1KB7 --------------------TWSGRTQQMLVPA-WQQVTPLA----PATTTLTSESVAGS
.: : :::.:.:. :::. .: :.. :.....
CCDS86 TLSCAAGRPALVEQTAAVLQAWPGGTQQILLPSTWQQLPGVALHNSVQPTAMIPEAMGSG
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710 720 730 740 750 760
pF1KB7 HRLGDWGKMISCSNHYNSVMPQP-LLTNQITLSAPQPVSVGIAHVVWPQPATT---KKNK
..:.:: . : .:.:...: :: ::::..::.. ::..::.:::: : ... ::::
CCDS86 QQLADWRNAHSHGNQYSTIMQQPSLLTNHVTLATAQPLNVGVAHVVRQQQSSSLPSKKNK
400 410 420 430 440 450
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pF1KB7 QCQNRGILVKLMEWEPGREEINAFSWSNSLQNTNIPHSAFISPKIINGKDVEEVSCIETQ
: :: .: : : ...
CCDS86 Q------------------------------------SAPVSSK----------SSLDVL
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pF1KB7 DNQNSEGEARNCCETSIRQDSDSSVSDKQRQTIIIADSPSPAVSVITISSDTDEEETSQR
.: . . .:. .: :.: :.: ::: :.::: :::::: :::::::
CCDS86 PSQVYSLVGSSPLRTTSSYNSLVPVQD-QHQPIIIPDTPSPPVSVITIRSDTDEEE----
470 480 490 500 510 520
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pF1KB7 HSLRECKGSLDCEACQSTLNIDRMCSLSSPDSTLSTSSSGQSSPSPCKRPNSMSDEEQES
:. . :::: . : : : .:
CCDS86 ------------------------------DNKYKPSSSGLK-P----RSNVISYV----
530 540
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pF1KB7 SCDTVDGSPTSDSSGHDSPFAESTFVE------DTHENTELVSSADTETKPAVCSVVVPP
::. :: :::: .::.. .:. .. :. : . : :. ...:::
CCDS86 ---TVNDSPDSDSS-LSSPYSTDTLSALRGNSGSVLEGPGRVVADGTGTR----TIIVPP
550 560 570 580 590
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pF1KB7 VELENG--LNADEHMANTDSICQPL--IKGRSAPGRLNQPSAVGTRQQKL-TSAFQQQHL
.. . : : . . .. .:. ..:.:. : :. : : :. ::: : :
CCDS86 LKTQLGDCTVATQASGLLSNKTKPVASVSGQSS-GCCITPT--GYRAQRGGTSA--AQPL
600 610 620 630 640 650
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pF1KB7 NFSQVQHFGSG--HQEWNGNFGHRRQQAYIPTSVTSNPFTLSHGSPNHTAVHAHLA-GNT
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CCDS86 NLSQNQQSSAAPTSQERSSNPAPRRQQAFV-APLSQAPYTFQHGSPLHSTGHPHLAPAPA
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pF1KB7 HLGGQPTLLPY--PSSAT-LSSAAPVAHLLASPCTSRPMLQHPTYNISHPSGIVHQVPVG
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CCDS86 HLPSQAHLYTYAAPTSAAALGSTSSIAHLFSPQGSSR----HAAAYTTHPSTLVHQVPVS
710 720 730 740 750 760
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pF1KB7 LNPRLLPSPTIHQTQYKPIFPPHSYIAAS---PAYTGFPLSPTKLSQYPYM
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CCDS86 VGPSLLTSASVAPAQYQHQFATQSYIGSSRGSTIYTGYPLSPTKISQYSYL
770 780 790 800 810
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. ::: .. : :::...:::.. :: . . . . :::.:: . .: :.:.::
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.. ::.:. .: ::::.:..: . ...:
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]