FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7330, 872 aa
1>>>pF1KB7330 872 - 872 aa - 872 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6446+/-0.000824; mu= 12.1378+/- 0.050
mean_var=169.2326+/-33.185, 0's: 0 Z-trim(113.6): 63 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.098590
statistics sampled from 14197 (14259) to 14197 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.75), E-opt: 0.2 (0.438), width: 16
Scan time: 5.030
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13520.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 872) 5958 859.9 0
CCDS13519.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 854) 3015 441.3 3.5e-123
CCDS13518.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 844) 3013 441.0 4.2e-123
CCDS46629.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 841) 2814 412.7 1.4e-114
CCDS13521.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 393) 2506 368.6 1.2e-101
CCDS456.1 KCNQ4 gene_id:9132|Hs108|chr1 ( 695) 1762 263.0 1.3e-69
CCDS55037.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 923) 1602 240.4 1.2e-62
CCDS4976.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 932) 1594 239.2 2.6e-62
CCDS55035.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 822) 1580 237.2 9.3e-62
CCDS55034.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 951) 1573 236.2 2.1e-61
CCDS7736.1 KCNQ1 gene_id:3784|Hs108|chr11 ( 676) 1171 178.9 2.6e-44
CCDS56554.1 KCNQ3 gene_id:3786|Hs108|chr8 ( 752) 654 105.4 3.9e-22
CCDS34943.1 KCNQ3 gene_id:3786|Hs108|chr8 ( 872) 654 105.5 4.3e-22
>>CCDS13520.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 (872 aa)
initn: 5958 init1: 5958 opt: 5958 Z-score: 4587.2 bits: 859.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5958; 100.0% identity (100.0% similar) in 872 aa overlap (1-872:1-872)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MVQKSRNGGVYPGPSGEKKLKVGFVGLDPGAPDSTRDGALLIAGSEAPKRGSILSKPRAG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GAGAGKPPKRNAFYRKLQNFLYNVLERPRGWAFIYHAYVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYEK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SSEGALYILEIVTIVVFGVEYFVRIWAAGCCCRYRGWRGRLKFARKPFCVIDIMVLIASI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AVLAAGSQGNVFATSALRSLRFLQILRMIRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LCLILASFLVYLAEKGENDHFDTYADALWWGLITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GVSFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QYYERTVTVPMYSSQTQTYGASRLIPPLNQLELLRNLKSKSGLAFRKDPPPEPSPSKGSP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 CRGPLCGCCPGRSSQKVSLKDRVFSSPRGVAAKGKGSPQAQTVRRSPSADQSLEDSPSKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CRGPLCGCCPGRSSQKVSLKDRVFSSPRGVAAKGKGSPQAQTVRRSPSADQSLEDSPSKV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 PKSWSFGDRSRARQAFRIKGAASRQNSEEASLPGEDIVDDKSCPCEFVTEDLTPGLKVSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PKSWSFGDRSRARQAFRIKGAASRQNSEEASLPGEDIVDDKSCPCEFVTEDLTPGLKVSI
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pF1KB7 RAVCVMRFLVSKRKFKESLRPYDVMDVIEQYSAGHLDMLSRIKSLQSRVDQIVGRGPAIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RAVCVMRFLVSKRKFKESLRPYDVMDVIEQYSAGHLDMLSRIKSLQSRVDQIVGRGPAIT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 DKDRTKGPAEAELPEDPSMMGRLGKVEKQVLSMEKKLDFLVNIYMQRMGIPPTETEAYFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DKDRTKGPAEAELPEDPSMMGRLGKVEKQVLSMEKKLDFLVNIYMQRMGIPPTETEAYFG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 AKEPEPAPPYHSPEDSREHVDRHGCIVKIVRSSSSTGQKNFSAPPAAPPVQCPPSTSWQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AKEPEPAPPYHSPEDSREHVDRHGCIVKIVRSSSSTGQKNFSAPPAAPPVQCPPSTSWQP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 QSHPRQGHGTSPVGDHGSLVRIPPPPAHERSLSAYGGGNRASMEFLRQEDTPGCRPPEGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QSHPRQGHGTSPVGDHGSLVRIPPPPAHERSLSAYGGGNRASMEFLRQEDTPGCRPPEGN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 LRDSDTSISIPSVDHEELERSFSGFSISQSKENLDALNSCYAAVAPCAKVRPYIAEGESD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LRDSDTSISIPSVDHEELERSFSGFSISQSKENLDALNSCYAAVAPCAKVRPYIAEGESD
790 800 810 820 830 840
850 860 870
pF1KB7 TDSDLCTPCGPPPRSATGEGPFGDVGWAGPRK
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TDSDLCTPCGPPPRSATGEGPFGDVGWAGPRK
850 860 870
>>CCDS13519.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 (854 aa)
initn: 3013 init1: 3013 opt: 3015 Z-score: 2325.1 bits: 441.3 E(32554): 3.5e-123
Smith-Waterman score: 5758; 97.9% identity (97.9% similar) in 872 aa overlap (1-872:1-854)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVQKSRNGGVYPGPSGEKKLKVGFVGLDPGAPDSTRDGALLIAGSEAPKRGSILSKPRAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MVQKSRNGGVYPGPSGEKKLKVGFVGLDPGAPDSTRDGALLIAGSEAPKRGSILSKPRAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 GAGAGKPPKRNAFYRKLQNFLYNVLERPRGWAFIYHAYVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GAGAGKPPKRNAFYRKLQNFLYNVLERPRGWAFIYHAYVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYEK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 SSEGALYILEIVTIVVFGVEYFVRIWAAGCCCRYRGWRGRLKFARKPFCVIDIMVLIASI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SSEGALYILEIVTIVVFGVEYFVRIWAAGCCCRYRGWRGRLKFARKPFCVIDIMVLIASI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 AVLAAGSQGNVFATSALRSLRFLQILRMIRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AVLAAGSQGNVFATSALRSLRFLQILRMIRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LCLILASFLVYLAEKGENDHFDTYADALWWGLITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LCLILASFLVYLAEKGENDHFDTYADALWWGLITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 GVSFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GVSFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 QYYERTVTVPMYSSQTQTYGASRLIPPLNQLELLRNLKSKSGLAFRKDPPPEPSPSKGSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QYYERTVTVPMYSSQTQTYGASRLIPPLNQLELLRNLKSKSGLAFRKDPPPEPSPS----
370 380 390 400 410
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pF1KB7 CRGPLCGCCPGRSSQKVSLKDRVFSSPRGVAAKGKGSPQAQTVRRSPSADQSLEDSPSKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB7 PKSWSFGDRSRARQAFRIKGAASRQNSEEASLPGEDIVDDKSCPCEFVTEDLTPGLKVSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB7 RAVCVMRFLVSKRKFKESLRPYDVMDVIEQYSAGHLDMLSRIKSLQSRVDQIVGRGPAIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RAVCVMRFLVSKRKFKESLRPYDVMDVIEQYSAGHLDMLSRIKSLQSRVDQIVGRGPAIT
530 540 550 560 570 580
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pF1KB7 DKDRTKGPAEAELPEDPSMMGRLGKVEKQVLSMEKKLDFLVNIYMQRMGIPPTETEAYFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DKDRTKGPAEAELPEDPSMMGRLGKVEKQVLSMEKKLDFLVNIYMQRMGIPPTETEAYFG
590 600 610 620 630 640
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pF1KB7 AKEPEPAPPYHSPEDSREHVDRHGCIVKIVRSSSSTGQKNFSAPPAAPPVQCPPSTSWQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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730 740 750 760 770 780
pF1KB7 QSHPRQGHGTSPVGDHGSLVRIPPPPAHERSLSAYGGGNRASMEFLRQEDTPGCRPPEGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QSHPRQGHGTSPVGDHGSLVRIPPPPAHERSLSAYGGGNRASMEFLRQEDTPGCRPPEGN
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790 800 810 820 830 840
pF1KB7 LRDSDTSISIPSVDHEELERSFSGFSISQSKENLDALNSCYAAVAPCAKVRPYIAEGESD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LRDSDTSISIPSVDHEELERSFSGFSISQSKENLDALNSCYAAVAPCAKVRPYIAEGESD
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850 860 870
pF1KB7 TDSDLCTPCGPPPRSATGEGPFGDVGWAGPRK
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TDSDLCTPCGPPPRSATGEGPFGDVGWAGPRK
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>>CCDS13518.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 (844 aa)
initn: 5504 init1: 3013 opt: 3013 Z-score: 2323.6 bits: 441.0 E(32554): 4.2e-123
Smith-Waterman score: 5668; 96.8% identity (96.8% similar) in 872 aa overlap (1-872:1-844)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVQKSRNGGVYPGPSGEKKLKVGFVGLDPGAPDSTRDGALLIAGSEAPKRGSILSKPRAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MVQKSRNGGVYPGPSGEKKLKVGFVGLDPGAPDSTRDGALLIAGSEAPKRGSILSKPRAG
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70 80 90 100 110 120
pF1KB7 GAGAGKPPKRNAFYRKLQNFLYNVLERPRGWAFIYHAYVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GAGAGKPPKRNAFYRKLQNFLYNVLERPRGWAFIYHAYVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYEK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 SSEGALYILEIVTIVVFGVEYFVRIWAAGCCCRYRGWRGRLKFARKPFCVIDIMVLIASI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SSEGALYILEIVTIVVFGVEYFVRIWAAGCCCRYRGWRGRLKFARKPFCVIDIMVLIASI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 AVLAAGSQGNVFATSALRSLRFLQILRMIRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AVLAAGSQGNVFATSALRSLRFLQILRMIRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LCLILASFLVYLAEKGENDHFDTYADALWWGLITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LCLILASFLVYLAEKGENDHFDTYADALWWGLITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 GVSFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GVSFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 QYYERTVTVPMYSSQTQTYGASRLIPPLNQLELLRNLKSKSGLAFRKDPPPEPSPSKGSP
:::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QYYERTVTVPMY----------RLIPPLNQLELLRNLKSKSGLAFRKDPPPEPSPS----
370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 CRGPLCGCCPGRSSQKVSLKDRVFSSPRGVAAKGKGSPQAQTVRRSPSADQSLEDSPSKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 --------------QKVSLKDRVFSSPRGVAAKGKGSPQAQTVRRSPSADQSLEDSPSKV
410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 PKSWSFGDRSRARQAFRIKGAASRQNSEEASLPGEDIVDDKSCPCEFVTEDLTPGLKVSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PKSWSFGDRSRARQAFRIKGAASRQNSEEASLPGEDIVDDKSCPCEFVTEDLTPGLKVSI
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 RAVCVMRFLVSKRKFKESLRPYDVMDVIEQYSAGHLDMLSRIKSLQSRVDQIVGRGPAIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RAVCVMRFLVSKRKFKESLRPYDVMDVIEQYSAGHLDMLSRIKSLQSRVDQIVGRGPAIT
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 DKDRTKGPAEAELPEDPSMMGRLGKVEKQVLSMEKKLDFLVNIYMQRMGIPPTETEAYFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DKDRTKGPAEAELPEDPSMMGRLGKVEKQVLSMEKKLDFLVNIYMQRMGIPPTETEAYFG
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 AKEPEPAPPYHSPEDSREHVDRHGCIVKIVRSSSSTGQKNFSAPPAAPPVQCPPSTSWQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AKEPEPAPPYHSPEDSREHVDRHGCIVKIVRSSSSTGQKNFSAPPAAPPVQCPPSTSWQP
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 QSHPRQGHGTSPVGDHGSLVRIPPPPAHERSLSAYGGGNRASMEFLRQEDTPGCRPPEGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QSHPRQGHGTSPVGDHGSLVRIPPPPAHERSLSAYGGGNRASMEFLRQEDTPGCRPPEGN
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 LRDSDTSISIPSVDHEELERSFSGFSISQSKENLDALNSCYAAVAPCAKVRPYIAEGESD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LRDSDTSISIPSVDHEELERSFSGFSISQSKENLDALNSCYAAVAPCAKVRPYIAEGESD
760 770 780 790 800 810
850 860 870
pF1KB7 TDSDLCTPCGPPPRSATGEGPFGDVGWAGPRK
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TDSDLCTPCGPPPRSATGEGPFGDVGWAGPRK
820 830 840
>>CCDS46629.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 (841 aa)
initn: 5314 init1: 2796 opt: 2814 Z-score: 2170.7 bits: 412.7 E(32554): 1.4e-114
Smith-Waterman score: 5644; 96.4% identity (96.4% similar) in 872 aa overlap (1-872:1-841)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVQKSRNGGVYPGPSGEKKLKVGFVGLDPGAPDSTRDGALLIAGSEAPKRGSILSKPRAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MVQKSRNGGVYPGPSGEKKLKVGFVGLDPGAPDSTRDGALLIAGSEAPKRGSILSKPRAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 GAGAGKPPKRNAFYRKLQNFLYNVLERPRGWAFIYHAYVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GAGAGKPPKRNAFYRKLQNFLYNVLERPRGWAFIYHAYVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYEK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 SSEGALYILEIVTIVVFGVEYFVRIWAAGCCCRYRGWRGRLKFARKPFCVIDIMVLIASI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SSEGALYILEIVTIVVFGVEYFVRIWAAGCCCRYRGWRGRLKFARKPFCVIDIMVLIASI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 AVLAAGSQGNVFATSALRSLRFLQILRMIRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AVLAAGSQGNVFATSALRSLRFLQILRMIRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LCLILASFLVYLAEKGENDHFDTYADALWWGLITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LCLILASFLVYLAEKGENDHFDTYADALWWGLITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 GVSFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GVSFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 QYYERTVTVPMYSSQTQTYGASRLIPPLNQLELLRNLKSKSGLAFRKDPPPEPSPSKGSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QYYERTVTVPMYSSQTQTYGASRLIPPLNQLELLRNLKSKSGLAFRKDPPPEPSPS----
370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 CRGPLCGCCPGRSSQKVSLKDRVFSSPRGVAAKGKGSPQAQTVRRSPSADQSLEDSPSKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 --------------------------PRGVAAKGKGSPQAQTVRRSPSADQSLEDSPSKV
420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 PKSWSFGDRSRARQAFRIKGAASRQNSEEASLPGEDIVDDKSCPCEFVTEDLTPGLKVSI
:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PKSWSFGDRSRARQAFRIKGAASRQNSE-ASLPGEDIVDDKSCPCEFVTEDLTPGLKVSI
460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 RAVCVMRFLVSKRKFKESLRPYDVMDVIEQYSAGHLDMLSRIKSLQSRVDQIVGRGPAIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RAVCVMRFLVSKRKFKESLRPYDVMDVIEQYSAGHLDMLSRIKSLQSRVDQIVGRGPAIT
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 DKDRTKGPAEAELPEDPSMMGRLGKVEKQVLSMEKKLDFLVNIYMQRMGIPPTETEAYFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DKDRTKGPAEAELPEDPSMMGRLGKVEKQVLSMEKKLDFLVNIYMQRMGIPPTETEAYFG
570 580 590 600 610 620
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 AKEPEPAPPYHSPEDSREHVDRHGCIVKIVRSSSSTGQKNFSAPPAAPPVQCPPSTSWQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AKEPEPAPPYHSPEDSREHVDRHGCIVKIVRSSSSTGQKNFSAPPAAPPVQCPPSTSWQP
630 640 650 660 670 680
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 QSHPRQGHGTSPVGDHGSLVRIPPPPAHERSLSAYGGGNRASMEFLRQEDTPGCRPPEGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QSHPRQGHGTSPVGDHGSLVRIPPPPAHERSLSAYGGGNRASMEFLRQEDTPGCRPPEGN
690 700 710 720 730 740
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 LRDSDTSISIPSVDHEELERSFSGFSISQSKENLDALNSCYAAVAPCAKVRPYIAEGESD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LRDSDTSISIPSVDHEELERSFSGFSISQSKENLDALNSCYAAVAPCAKVRPYIAEGESD
750 760 770 780 790 800
850 860 870
pF1KB7 TDSDLCTPCGPPPRSATGEGPFGDVGWAGPRK
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TDSDLCTPCGPPPRSATGEGPFGDVGWAGPRK
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10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVQKSRNGGVYPGPSGEKKLKVGFVGLDPGAPDSTRDGALLIAGSEAPKRGSILSKPRAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MVQKSRNGGVYPGPSGEKKLKVGFVGLDPGAPDSTRDGALLIAGSEAPKRGSILSKPRAG
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 GAGAGKPPKRNAFYRKLQNFLYNVLERPRGWAFIYHAYVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GAGAGKPPKRNAFYRKLQNFLYNVLERPRGWAFIYHAYVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYEK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 SSEGALYILEIVTIVVFGVEYFVRIWAAGCCCRYRGWRGRLKFARKPFCVIDIMVLIASI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SSEGALYILEIVTIVVFGVEYFVRIWAAGCCCRYRGWRGRLKFARKPFCVIDIMVLIASI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 AVLAAGSQGNVFATSALRSLRFLQILRMIRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AVLAAGSQGNVFATSALRSLRFLQILRMIRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LCLILASFLVYLAEKGENDHFDTYADALWWGLITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LCLILASFLVYLAEKGENDHFDTYADALWWGLITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 GVSFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GVSFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 QYYERTVTVPMYSSQTQTYGASRLIPPLNQLELLRNLKSKSGLAFRKDPPPEPSPSKGSP
:::::::::::: . .. ....:
CCDS13 QYYERTVTVPMYRYRRRAPATKQLFHFLFSICS
370 380 390
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Smith-Waterman score: 2346; 55.0% identity (76.7% similar) in 687 aa overlap (28-695:35-692)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MVQKSRNGGVYPGPSGEKKLKVGFVGLDPGAPDSTRDGALLIAGSEAPKRGSILSKP
. :. : : .:: :: : :. : :
CCDS45 PPRRLGLGPPPGDAPRAELVALTAVQSEQGEAGGGGSPRRLGLL--GSPLPP-GAPLPGP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 RAG-GAGAG-KPPKRNAFYRKLQNFLYNVLERPRGWAFIYHAYVFLLVFSCLVLSVFSTI
.: :.. : . . ::.:::..::::::::::::.::...::::::::::::.:::
CCDS45 GSGSGSACGQRSSAAHKRYRRLQNWVYNVLERPRGWAFVYHVFIFLLVFSCLVLSVLSTI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 KEYEKSSEGALYILEIVTIVVFGVEYFVRIWAAGCCCRYRGWRGRLKFARKPFCVIDIMV
.:... .. : :::.: :::::.::.::.:.::::::::::.::..::::::::::..:
CCDS45 QEHQELANECLLILEFVMIVVFGLEYIVRVWSAGCCCRYRGWQGRFRFARKPFCVIDFIV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LIASIAVLAAGSQGNVFATSALRSLRFLQILRMIRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELVTA
..::.::.:::.:::.::::::::.::::::::.:::::::::::::::::::::::.::
CCDS45 FVASVAVIAAGTQGNIFATSALRSMRFLQILRMVRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELITA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 WYIGFLCLILASFLVYLAEKGENDHFDTYADALWWGLITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAA
:::::: ::.:::::::::: :. :..:::.:::: ::::::::::: :.:: ::.:::
CCDS45 WYIGFLVLIFASFLVYLAEKDANSDFSSYADSLWWGTITLTTIGYGDKTPHTWLGRVLAA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 TFTLIGVSFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTD
:.:.:.::::::::::::::::::::::::::::::: :::.:::.:::.:.:..::.
CCDS45 GFALLGISFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRMPAANLIQAAWRLYSTDMSRAY
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400
pF1KB7 LHSTWQYYERTVTVPMYSSQTQTYGASRLIPPLNQLELLRN--LKSKSG----LAFRKDP
: .:: ::. ..: . .: :: . ....: : :. :
CCDS45 LTATWYYYDS------------------ILPSFRELALLFEHVQRARNGGLRPLEVRRAP
370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 PPEPSPSKGSP---CRGP-LCGCCPGRSSQKVSLKDRV-FSSPRGVAAKGKGSPQAQTVR
:. .::. : :. : . :::.:: ....:::. ..: . .. .: :.
CCDS45 VPDGAPSRYPPVATCHRPGSTSFCPGESS-RMGIKDRIRMGSSQRRTGPSKQHLAPPTMP
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 RSPSADQSLE-DSPSKVPKSWSFGDRSRARQAFRIKGAASRQNSEEASLPGEDIVDDKSC
:::..: : ::.:: :::::.::.: : ..:.: : ..:.: :.:.....::
CCDS45 TSPSSEQVGEATSPTKVQKSWSFNDRTRFRASLRLK---PRTSAEDA--PSEEVAEEKSY
470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 PCEFVTEDLTPGLKVSIRAVCVMRFLVSKRKFKESLRPYDVMDVIEQYSAGHLDMLSRIK
::....:. :..:. ::.. ...:::.::::::.:::::: ::::::::::::::.:::
CCDS45 QCELTVDDIMPAVKTVIRSIRILKFLVAKRKFKETLRPYDVKDVIEQYSAGHLDMLGRIK
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KB7 SLQSRVDQIVGRGPAITDKDRTKG---PAEAELPEDPSMMGRLGKVEKQVLSMEKKLDFL
:::.::::::::::. : : :: :..::. .. :::::. :::::: :.:.:::.:
CCDS45 SLQTRVDQIVGRGPG-DRKAREKGDKGPSDAEVVDEISMMGRVVKVEKQVQSIEHKLDLL
580 590 600 610 620 630
650 660 670 680 690
pF1KB7 VNIYMQ--RMGIPPTETEAYFGAKEPEPAPPYHSPEDSREHVDRHGCIVKIVRSSSSTGQ
...: . : : . . .:. . :::: : .: .. . ..: :: :.
CCDS45 LGFYSRCLRSGTSASLGAVQVPLFDPDITSDYHSPVD-HEDISVSAQTLSISRSVSTNMD
640 650 660 670 680 690
700 710 720 730 740 750
pF1KB7 KNFSAPPAAPPVQCPPSTSWQPQSHPRQGHGTSPVGDHGSLVRIPPPPAHERSLSAYGGG
>>CCDS55037.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 (923 aa)
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10 20 30
pF1KB7 MVQKSRNGGVYPGPSGEKKLKVGF--VGLDPGAPDSTRDG
:: : :: : .. : : :. .: .:
CCDS55 MPRHHAGGEEGGAAGLWVKSGAAAAAAGGGRLG-SGMKDVESGRGRVLLNSAA---ARGD
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80
pF1KB7 ALLIAGSEAPKRGSI---LSKPRAGGAGA-----GKPP--------KRNAFYRKLQNFLY
.::. :..: :. : . : : :: ::: .::. ::..::.::
CCDS55 GLLLLGTRAATLGGGGGGLRESRRGKQGARMSLLGKPLSYTSSQSCRRNVKYRRVQNYLY
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 NVLERPRGWAFIYHAYVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYEKSSEGALYILEIVTIVVFGVEYF
:::::::::::::::.::::::.::.::::::: :. : . . : :::.: :::::.:..
CCDS55 NVLERPRGWAFIYHAFVFLLVFGCLILSVFSTIPEHTKLASSCLLILEFVMIVVFGLEFI
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 VRIWAAGCCCRYRGWRGRLKFARKPFCVIDIMVLIASIAVLAAGSQGNVFATSALRSLRF
.:::.::::::::::.:::.:::::::::: .::::::::..: .:::.:::::::::::
CCDS55 IRIWSAGCCCRYRGWQGRLRFARKPFCVIDTIVLIASIAVVSAKTQGNIFATSALRSLRF
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 LQILRMIRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGFLCLILASFLVYLAEKGENDHFD
::::::.:::::::::::::::::::::::.:::::::: ::..::::::.:: : .:.
CCDS55 LQILRMVRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELITAWYIGFLVLIFSSFLVYLVEKDANKEFS
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 TYADALWWGLITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLIGVSFFALPAGILGSGFALKVQE
::::::::: ::::::::::: : :: ::::.: :.:.:.::::::::::::::::::::
CCDS55 TYADALWWGTITLTTIGYGDKTPLTWLGRLLSAGFALLGISFFALPAGILGSGFALKVQE
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 QHRQKHFEKRRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTWQYYERTVTVPMYSSQTQTYGAS
:::::::::::::::.::: .:: ::.. :..:.. ..
CCDS55 QHRQKHFEKRRNPAANLIQCVWRSYAAD-------------EKSVSIATWK---------
360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 RLIPPLNQLELLRNLKSKSGLAFRKDPPPEPSPSKGSPCRGPLCGCCPGRSSQKVSLKDR
: :. :. : : ..::.:.:.:
CCDS55 ---PHLKALHT----------------------------------CSP--TNQKLSFKER
400 410
450 460 470 480 490 500
pF1KB7 V-FSSPRGVAAKGKGSPQAQTVRRSPSADQSLEDSPSKVPKSWSFGDRSRARQAFRIKGA
: ..:::: . :.. . .. :::::.: . : ::.:: :::::.::.: : ..:.:..
CCDS55 VRMASPRGQSIKSRQASVGD--RRSPSTDITAEGSPTKVQKSWSFNDRTRFRPSLRLKSS
420 430 440 450 460 470
510 520 530 540 550 560
pF1KB7 ASRQNSE-EASLPGEDIVDDKSCPCEFVTEDLTPGLKVSIRAVCVMRFLVSKRKFKESLR
. . ...: .:. :.:.: :. .::::: ::. :::. .:.: :.::::::.::
CCDS55 QPKPVIDADTALGTDDVYDEKGCQCDVSVEDLTPPLKTVIRAIRIMKFHVAKRKFKETLR
480 490 500 510 520 530
570 580 590 600 610
pF1KB7 PYDVMDVIEQYSAGHLDMLSRIKSLQSRVDQIVGRGPAITDK-DRTKGPAEAELPEDPSM
:::: :::::::::::::: ::::::.:::::.:.: .:: .: : :: : .: ::
CCDS55 PYDVKDVIEQYSAGHLDMLCRIKSLQTRVDQILGKGQITSDKKSREKITAEHETTDDLSM
540 550 560 570 580 590
620 630 640 650 660 670
pF1KB7 MGRLGKVEKQVLSMEKKLDFLVNIYMQ--RMGIPPTETEAYFGAK--EPEPAPPYHSPED
.::. :::::: :.:.::: :..::.: : : . . : : : : . :.:: :
CCDS55 LGRVVKVEKQVQSIESKLDCLLDIYQQVLRKGSASALALASFQIPPFECEQTSDYQSPVD
600 610 620 630 640 650
680 690 700 710 720
pF1KB7 SRE---HVDRHGCIVKIVRSSSSTGQKNFSAPPAAPPVQC-----PPSTSWQPQSHPRQG
:.. .. ::. . . .. : : . : : .: : : : :.
CCDS55 SKDLSGSAQNSGCLSRSTSANISRGLQ-FILTPNEFSAQTFYALSPTMHSQATQVPISQS
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 HGTSPVGDH--GSLVRIPPPPAHERSLSAYGGGNRASMEFLRQEDTPGCRPPEGNLRDSD
:.. .. . .. . : :: .:. ... : . .: .: ..:..:
CCDS55 DGSAVAATNTIANQINTAPKPAAPTTLQI--PPPLPAIKHLPRPET--LHPNPAGLQESI
720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 TSISIPSV-DHEELERSFSGFSISQS-KENLDALNSCYAAVAPCAKVRPYIAEGESDTDS
.... : ..:... . :... ..: ....: . .: :
CCDS55 SDVTTCLVASKENVQVAQSNLTKDRSMRKSFDMGGETLLSVCPMVPKDLGKSLSVQNLIR
770 780 790 800 810 820
850 860 870
pF1KB7 DLCTPCGPPPRSATGEGPFGDVGWAGPRK
CCDS55 STEELNIQLSGSESSGSRGSQDFYPKWRESKLFITDEEVGPEETETDTFDAAPQPAREAA
830 840 850 860 870 880
>>CCDS4976.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 (932 aa)
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10 20 30
pF1KB7 MVQKSRNGGVYPGPSGEKKLKVGF--VGLDPGAPDSTRDG
:: : :: : .. : : :. .: .:
CCDS49 MPRHHAGGEEGGAAGLWVKSGAAAAAAGGGRLG-SGMKDVESGRGRVLLNSAA---ARGD
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80
pF1KB7 ALLIAGSEAPKRGSI---LSKPRAGGAGA-----GKPP--------KRNAFYRKLQNFLY
.::. :..: :. : . : : :: ::: .::. ::..::.::
CCDS49 GLLLLGTRAATLGGGGGGLRESRRGKQGARMSLLGKPLSYTSSQSCRRNVKYRRVQNYLY
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 NVLERPRGWAFIYHAYVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYEKSSEGALYILEIVTIVVFGVEYF
:::::::::::::::.::::::.::.::::::: :. : . . : :::.: :::::.:..
CCDS49 NVLERPRGWAFIYHAFVFLLVFGCLILSVFSTIPEHTKLASSCLLILEFVMIVVFGLEFI
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 VRIWAAGCCCRYRGWRGRLKFARKPFCVIDIMVLIASIAVLAAGSQGNVFATSALRSLRF
.:::.::::::::::.:::.:::::::::: .::::::::..: .:::.:::::::::::
CCDS49 IRIWSAGCCCRYRGWQGRLRFARKPFCVIDTIVLIASIAVVSAKTQGNIFATSALRSLRF
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 LQILRMIRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGFLCLILASFLVYLAEKGENDHFD
::::::.:::::::::::::::::::::::.:::::::: ::..::::::.:: : .:.
CCDS49 LQILRMVRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELITAWYIGFLVLIFSSFLVYLVEKDANKEFS
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 TYADALWWGLITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLIGVSFFALPAGILGSGFALKVQE
::::::::: ::::::::::: : :: ::::.: :.:.:.::::::::::::::::::::
CCDS49 TYADALWWGTITLTTIGYGDKTPLTWLGRLLSAGFALLGISFFALPAGILGSGFALKVQE
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 QHRQKHFEKRRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTWQYYERTVTVPMYSSQTQTYGAS
:::::::::::::::.::: .:: ::.. :..:.. ..
CCDS49 QHRQKHFEKRRNPAANLIQCVWRSYAAD-------------EKSVSIATWK---------
360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 RLIPPLNQLELLRNLKSKSGLAFRKDPPPEPSPSKGSPCRGPLCGCCPGRSSQKVSLKDR
: :. :. :...: : ::::.:.:.:
CCDS49 ---PHLKALHTCSPTKKEQGEA---------------------------SSSQKLSFKER
400 410 420
450 460 470 480 490 500
pF1KB7 V-FSSPRGVAAKGKGSPQAQTVRRSPSADQSLEDSPSKVPKSWSFGDRSRARQAFRIKGA
: ..:::: . :.. . .. :::::.: . : ::.:: :::::.::.: : ..:.:..
CCDS49 VRMASPRGQSIKSRQASVGD--RRSPSTDITAEGSPTKVQKSWSFNDRTRFRPSLRLKSS
430 440 450 460 470 480
510 520 530 540 550 560
pF1KB7 ASRQNSE-EASLPGEDIVDDKSCPCEFVTEDLTPGLKVSIRAVCVMRFLVSKRKFKESLR
. . ...: .:. :.:.: :. .::::: ::. :::. .:.: :.::::::.::
CCDS49 QPKPVIDADTALGTDDVYDEKGCQCDVSVEDLTPPLKTVIRAIRIMKFHVAKRKFKETLR
490 500 510 520 530 540
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pF1KB7 PYDVMDVIEQYSAGHLDMLSRIKSLQSRVDQIVGRGPAITDK-DRTKGPAEAELPEDPSM
:::: :::::::::::::: ::::::.:::::.:.: .:: .: : :: : .: ::
CCDS49 PYDVKDVIEQYSAGHLDMLCRIKSLQTRVDQILGKGQITSDKKSREKITAEHETTDDLSM
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CCDS55 MLGRVVKVEKQVQSIESKLDCLLDIYQQVLRKGSASALALASFQIPPFECEQTSDYQSPV
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CCDS55 DSKDLSGSAQNSGCLSRSTSANISRGLQ-FILTPNEFSAQTFYALSPTMHSQATQVPISQ
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