FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7330, 872 aa 1>>>pF1KB7330 872 - 872 aa - 872 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6446+/-0.000824; mu= 12.1378+/- 0.050 mean_var=169.2326+/-33.185, 0's: 0 Z-trim(113.6): 63 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.098590 statistics sampled from 14197 (14259) to 14197 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.75), E-opt: 0.2 (0.438), width: 16 Scan time: 5.030 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS13520.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 872) 5958 859.9 0 CCDS13519.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 854) 3015 441.3 3.5e-123 CCDS13518.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 844) 3013 441.0 4.2e-123 CCDS46629.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 841) 2814 412.7 1.4e-114 CCDS13521.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 393) 2506 368.6 1.2e-101 CCDS456.1 KCNQ4 gene_id:9132|Hs108|chr1 ( 695) 1762 263.0 1.3e-69 CCDS55037.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 923) 1602 240.4 1.2e-62 CCDS4976.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 932) 1594 239.2 2.6e-62 CCDS55035.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 822) 1580 237.2 9.3e-62 CCDS55034.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 951) 1573 236.2 2.1e-61 CCDS7736.1 KCNQ1 gene_id:3784|Hs108|chr11 ( 676) 1171 178.9 2.6e-44 CCDS56554.1 KCNQ3 gene_id:3786|Hs108|chr8 ( 752) 654 105.4 3.9e-22 CCDS34943.1 KCNQ3 gene_id:3786|Hs108|chr8 ( 872) 654 105.5 4.3e-22 >>CCDS13520.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 (872 aa) initn: 5958 init1: 5958 opt: 5958 Z-score: 4587.2 bits: 859.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5958; 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96.4% identity (96.4% similar) in 872 aa overlap (1-872:1-841) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MVQKSRNGGVYPGPSGEKKLKVGFVGLDPGAPDSTRDGALLIAGSEAPKRGSILSKPRAG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 MVQKSRNGGVYPGPSGEKKLKVGFVGLDPGAPDSTRDGALLIAGSEAPKRGSILSKPRAG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 GAGAGKPPKRNAFYRKLQNFLYNVLERPRGWAFIYHAYVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYEK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 GAGAGKPPKRNAFYRKLQNFLYNVLERPRGWAFIYHAYVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYEK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 SSEGALYILEIVTIVVFGVEYFVRIWAAGCCCRYRGWRGRLKFARKPFCVIDIMVLIASI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 SSEGALYILEIVTIVVFGVEYFVRIWAAGCCCRYRGWRGRLKFARKPFCVIDIMVLIASI 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 AVLAAGSQGNVFATSALRSLRFLQILRMIRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 AVLAAGSQGNVFATSALRSLRFLQILRMIRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGF 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 LCLILASFLVYLAEKGENDHFDTYADALWWGLITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 LCLILASFLVYLAEKGENDHFDTYADALWWGLITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 GVSFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 GVSFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTW 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB7 QYYERTVTVPMYSSQTQTYGASRLIPPLNQLELLRNLKSKSGLAFRKDPPPEPSPSKGSP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 QYYERTVTVPMYSSQTQTYGASRLIPPLNQLELLRNLKSKSGLAFRKDPPPEPSPS---- 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 pF1KB7 CRGPLCGCCPGRSSQKVSLKDRVFSSPRGVAAKGKGSPQAQTVRRSPSADQSLEDSPSKV :::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 --------------------------PRGVAAKGKGSPQAQTVRRSPSADQSLEDSPSKV 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 pF1KB7 PKSWSFGDRSRARQAFRIKGAASRQNSEEASLPGEDIVDDKSCPCEFVTEDLTPGLKVSI :::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 PKSWSFGDRSRARQAFRIKGAASRQNSE-ASLPGEDIVDDKSCPCEFVTEDLTPGLKVSI 460 470 480 490 500 550 560 570 580 590 600 pF1KB7 RAVCVMRFLVSKRKFKESLRPYDVMDVIEQYSAGHLDMLSRIKSLQSRVDQIVGRGPAIT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 RAVCVMRFLVSKRKFKESLRPYDVMDVIEQYSAGHLDMLSRIKSLQSRVDQIVGRGPAIT 510 520 530 540 550 560 610 620 630 640 650 660 pF1KB7 DKDRTKGPAEAELPEDPSMMGRLGKVEKQVLSMEKKLDFLVNIYMQRMGIPPTETEAYFG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 DKDRTKGPAEAELPEDPSMMGRLGKVEKQVLSMEKKLDFLVNIYMQRMGIPPTETEAYFG 570 580 590 600 610 620 670 680 690 700 710 720 pF1KB7 AKEPEPAPPYHSPEDSREHVDRHGCIVKIVRSSSSTGQKNFSAPPAAPPVQCPPSTSWQP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 AKEPEPAPPYHSPEDSREHVDRHGCIVKIVRSSSSTGQKNFSAPPAAPPVQCPPSTSWQP 630 640 650 660 670 680 730 740 750 760 770 780 pF1KB7 QSHPRQGHGTSPVGDHGSLVRIPPPPAHERSLSAYGGGNRASMEFLRQEDTPGCRPPEGN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 QSHPRQGHGTSPVGDHGSLVRIPPPPAHERSLSAYGGGNRASMEFLRQEDTPGCRPPEGN 690 700 710 720 730 740 790 800 810 820 830 840 pF1KB7 LRDSDTSISIPSVDHEELERSFSGFSISQSKENLDALNSCYAAVAPCAKVRPYIAEGESD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 LRDSDTSISIPSVDHEELERSFSGFSISQSKENLDALNSCYAAVAPCAKVRPYIAEGESD 750 760 770 780 790 800 850 860 870 pF1KB7 TDSDLCTPCGPPPRSATGEGPFGDVGWAGPRK :::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 TDSDLCTPCGPPPRSATGEGPFGDVGWAGPRK 810 820 830 840 >>CCDS13521.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 (393 aa) initn: 2505 init1: 2505 opt: 2506 Z-score: 1938.4 bits: 368.6 E(32554): 1.2e-101 Smith-Waterman score: 2506; 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55.0% identity (76.7% similar) in 687 aa overlap (28-695:35-692) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MVQKSRNGGVYPGPSGEKKLKVGFVGLDPGAPDSTRDGALLIAGSEAPKRGSILSKP . :. : : .:: :: : :. : : CCDS45 PPRRLGLGPPPGDAPRAELVALTAVQSEQGEAGGGGSPRRLGLL--GSPLPP-GAPLPGP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 RAG-GAGAG-KPPKRNAFYRKLQNFLYNVLERPRGWAFIYHAYVFLLVFSCLVLSVFSTI .: :.. : . . ::.:::..::::::::::::.::...::::::::::::.::: CCDS45 GSGSGSACGQRSSAAHKRYRRLQNWVYNVLERPRGWAFVYHVFIFLLVFSCLVLSVLSTI 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 KEYEKSSEGALYILEIVTIVVFGVEYFVRIWAAGCCCRYRGWRGRLKFARKPFCVIDIMV .:... .. : :::.: :::::.::.::.:.::::::::::.::..::::::::::..: CCDS45 QEHQELANECLLILEFVMIVVFGLEYIVRVWSAGCCCRYRGWQGRFRFARKPFCVIDFIV 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 LIASIAVLAAGSQGNVFATSALRSLRFLQILRMIRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELVTA ..::.::.:::.:::.::::::::.::::::::.:::::::::::::::::::::::.:: CCDS45 FVASVAVIAAGTQGNIFATSALRSMRFLQILRMVRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELITA 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 WYIGFLCLILASFLVYLAEKGENDHFDTYADALWWGLITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAA :::::: ::.:::::::::: :. :..:::.:::: ::::::::::: :.:: ::.::: CCDS45 WYIGFLVLIFASFLVYLAEKDANSDFSSYADSLWWGTITLTTIGYGDKTPHTWLGRVLAA 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 TFTLIGVSFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTD :.:.:.::::::::::::::::::::::::::::::: :::.:::.:::.:.:..::. CCDS45 GFALLGISFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKRRMPAANLIQAAWRLYSTDMSRAY 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 pF1KB7 LHSTWQYYERTVTVPMYSSQTQTYGASRLIPPLNQLELLRN--LKSKSG----LAFRKDP : .:: ::. ..: . .: :: . ....: : :. : CCDS45 LTATWYYYDS------------------ILPSFRELALLFEHVQRARNGGLRPLEVRRAP 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KB7 PPEPSPSKGSP---CRGP-LCGCCPGRSSQKVSLKDRV-FSSPRGVAAKGKGSPQAQTVR :. .::. : :. : . :::.:: ....:::. ..: . .. .: :. CCDS45 VPDGAPSRYPPVATCHRPGSTSFCPGESS-RMGIKDRIRMGSSQRRTGPSKQHLAPPTMP 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KB7 RSPSADQSLE-DSPSKVPKSWSFGDRSRARQAFRIKGAASRQNSEEASLPGEDIVDDKSC :::..: : ::.:: :::::.::.: : ..:.: : ..:.: :.:.....:: CCDS45 TSPSSEQVGEATSPTKVQKSWSFNDRTRFRASLRLK---PRTSAEDA--PSEEVAEEKSY 470 480 490 500 510 530 540 550 560 570 580 pF1KB7 PCEFVTEDLTPGLKVSIRAVCVMRFLVSKRKFKESLRPYDVMDVIEQYSAGHLDMLSRIK ::....:. :..:. ::.. ...:::.::::::.:::::: ::::::::::::::.::: CCDS45 QCELTVDDIMPAVKTVIRSIRILKFLVAKRKFKETLRPYDVKDVIEQYSAGHLDMLGRIK 520 530 540 550 560 570 590 600 610 620 630 640 pF1KB7 SLQSRVDQIVGRGPAITDKDRTKG---PAEAELPEDPSMMGRLGKVEKQVLSMEKKLDFL :::.::::::::::. : : :: :..::. .. :::::. :::::: :.:.:::.: CCDS45 SLQTRVDQIVGRGPG-DRKAREKGDKGPSDAEVVDEISMMGRVVKVEKQVQSIEHKLDLL 580 590 600 610 620 630 650 660 670 680 690 pF1KB7 VNIYMQ--RMGIPPTETEAYFGAKEPEPAPPYHSPEDSREHVDRHGCIVKIVRSSSSTGQ ...: . : : . . .:. . :::: : .: .. . ..: :: :. CCDS45 LGFYSRCLRSGTSASLGAVQVPLFDPDITSDYHSPVD-HEDISVSAQTLSISRSVSTNMD 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 pF1KB7 KNFSAPPAAPPVQCPPSTSWQPQSHPRQGHGTSPVGDHGSLVRIPPPPAHERSLSAYGGG >>CCDS55037.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 (923 aa) initn: 2108 init1: 1553 opt: 1602 Z-score: 1238.4 bits: 240.4 E(32554): 1.2e-62 Smith-Waterman score: 2252; 47.9% identity (67.5% similar) in 856 aa overlap (8-826:28-811) 10 20 30 pF1KB7 MVQKSRNGGVYPGPSGEKKLKVGF--VGLDPGAPDSTRDG :: : :: : .. : : :. .: .: CCDS55 MPRHHAGGEEGGAAGLWVKSGAAAAAAGGGRLG-SGMKDVESGRGRVLLNSAA---ARGD 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 pF1KB7 ALLIAGSEAPKRGSI---LSKPRAGGAGA-----GKPP--------KRNAFYRKLQNFLY .::. :..: :. : . : : :: ::: .::. ::..::.:: CCDS55 GLLLLGTRAATLGGGGGGLRESRRGKQGARMSLLGKPLSYTSSQSCRRNVKYRRVQNYLY 60 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 140 pF1KB7 NVLERPRGWAFIYHAYVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYEKSSEGALYILEIVTIVVFGVEYF :::::::::::::::.::::::.::.::::::: :. : . . : :::.: :::::.:.. 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CCDS55 QHRQKHFEKRRNPAANLIQCVWRSYAAD-------------EKSVSIATWK--------- 360 370 380 390 390 400 410 420 430 440 pF1KB7 RLIPPLNQLELLRNLKSKSGLAFRKDPPPEPSPSKGSPCRGPLCGCCPGRSSQKVSLKDR : :. :. : : ..::.:.:.: CCDS55 ---PHLKALHT----------------------------------CSP--TNQKLSFKER 400 410 450 460 470 480 490 500 pF1KB7 V-FSSPRGVAAKGKGSPQAQTVRRSPSADQSLEDSPSKVPKSWSFGDRSRARQAFRIKGA : ..:::: . :.. . .. :::::.: . : ::.:: :::::.::.: : ..:.:.. CCDS55 VRMASPRGQSIKSRQASVGD--RRSPSTDITAEGSPTKVQKSWSFNDRTRFRPSLRLKSS 420 430 440 450 460 470 510 520 530 540 550 560 pF1KB7 ASRQNSE-EASLPGEDIVDDKSCPCEFVTEDLTPGLKVSIRAVCVMRFLVSKRKFKESLR . . ...: .:. :.:.: :. .::::: ::. :::. .:.: :.::::::.:: CCDS55 QPKPVIDADTALGTDDVYDEKGCQCDVSVEDLTPPLKTVIRAIRIMKFHVAKRKFKETLR 480 490 500 510 520 530 570 580 590 600 610 pF1KB7 PYDVMDVIEQYSAGHLDMLSRIKSLQSRVDQIVGRGPAITDK-DRTKGPAEAELPEDPSM :::: :::::::::::::: ::::::.:::::.:.: .:: .: : :: : .: :: CCDS55 PYDVKDVIEQYSAGHLDMLCRIKSLQTRVDQILGKGQITSDKKSREKITAEHETTDDLSM 540 550 560 570 580 590 620 630 640 650 660 670 pF1KB7 MGRLGKVEKQVLSMEKKLDFLVNIYMQ--RMGIPPTETEAYFGAK--EPEPAPPYHSPED .::. :::::: :.:.::: :..::.: : : . . : : : : . :.:: : CCDS55 LGRVVKVEKQVQSIESKLDCLLDIYQQVLRKGSASALALASFQIPPFECEQTSDYQSPVD 600 610 620 630 640 650 680 690 700 710 720 pF1KB7 SRE---HVDRHGCIVKIVRSSSSTGQKNFSAPPAAPPVQC-----PPSTSWQPQSHPRQG :.. .. ::. . . .. : : . : : .: : : : :. CCDS55 SKDLSGSAQNSGCLSRSTSANISRGLQ-FILTPNEFSAQTFYALSPTMHSQATQVPISQS 660 670 680 690 700 710 730 740 750 760 770 780 pF1KB7 HGTSPVGDH--GSLVRIPPPPAHERSLSAYGGGNRASMEFLRQEDTPGCRPPEGNLRDSD :.. .. . .. . : :: .:. ... : . .: .: ..:..: CCDS55 DGSAVAATNTIANQINTAPKPAAPTTLQI--PPPLPAIKHLPRPET--LHPNPAGLQESI 720 730 740 750 760 790 800 810 820 830 840 pF1KB7 TSISIPSV-DHEELERSFSGFSISQS-KENLDALNSCYAAVAPCAKVRPYIAEGESDTDS .... : ..:... . :... ..: ....: . .: : CCDS55 SDVTTCLVASKENVQVAQSNLTKDRSMRKSFDMGGETLLSVCPMVPKDLGKSLSVQNLIR 770 780 790 800 810 820 850 860 870 pF1KB7 DLCTPCGPPPRSATGEGPFGDVGWAGPRK CCDS55 STEELNIQLSGSESSGSRGSQDFYPKWRESKLFITDEEVGPEETETDTFDAAPQPAREAA 830 840 850 860 870 880 >>CCDS4976.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 (932 aa) initn: 2104 init1: 1549 opt: 1594 Z-score: 1232.2 bits: 239.2 E(32554): 2.6e-62 Smith-Waterman score: 2275; 48.2% identity (68.0% similar) in 856 aa overlap (8-826:28-820) 10 20 30 pF1KB7 MVQKSRNGGVYPGPSGEKKLKVGF--VGLDPGAPDSTRDG :: : :: : .. : : :. .: .: CCDS49 MPRHHAGGEEGGAAGLWVKSGAAAAAAGGGRLG-SGMKDVESGRGRVLLNSAA---ARGD 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 pF1KB7 ALLIAGSEAPKRGSI---LSKPRAGGAGA-----GKPP--------KRNAFYRKLQNFLY .::. :..: :. : . : : :: ::: .::. ::..::.:: CCDS49 GLLLLGTRAATLGGGGGGLRESRRGKQGARMSLLGKPLSYTSSQSCRRNVKYRRVQNYLY 60 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 140 pF1KB7 NVLERPRGWAFIYHAYVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYEKSSEGALYILEIVTIVVFGVEYF :::::::::::::::.::::::.::.::::::: :. : . . : :::.: :::::.:.. CCDS49 NVLERPRGWAFIYHAFVFLLVFGCLILSVFSTIPEHTKLASSCLLILEFVMIVVFGLEFI 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 200 pF1KB7 VRIWAAGCCCRYRGWRGRLKFARKPFCVIDIMVLIASIAVLAAGSQGNVFATSALRSLRF .:::.::::::::::.:::.:::::::::: .::::::::..: .:::.::::::::::: CCDS49 IRIWSAGCCCRYRGWQGRLRFARKPFCVIDTIVLIASIAVVSAKTQGNIFATSALRSLRF 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KB7 LQILRMIRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGFLCLILASFLVYLAEKGENDHFD ::::::.:::::::::::::::::::::::.:::::::: ::..::::::.:: : .:. CCDS49 LQILRMVRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELITAWYIGFLVLIFSSFLVYLVEKDANKEFS 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KB7 TYADALWWGLITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLIGVSFFALPAGILGSGFALKVQE ::::::::: ::::::::::: : :: ::::.: :.:.:.:::::::::::::::::::: CCDS49 TYADALWWGTITLTTIGYGDKTPLTWLGRLLSAGFALLGISFFALPAGILGSGFALKVQE 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KB7 QHRQKHFEKRRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTWQYYERTVTVPMYSSQTQTYGAS :::::::::::::::.::: .:: ::.. :..:.. .. CCDS49 QHRQKHFEKRRNPAANLIQCVWRSYAAD-------------EKSVSIATWK--------- 360 370 380 390 390 400 410 420 430 440 pF1KB7 RLIPPLNQLELLRNLKSKSGLAFRKDPPPEPSPSKGSPCRGPLCGCCPGRSSQKVSLKDR : :. :. :...: : ::::.:.:.: CCDS49 ---PHLKALHTCSPTKKEQGEA---------------------------SSSQKLSFKER 400 410 420 450 460 470 480 490 500 pF1KB7 V-FSSPRGVAAKGKGSPQAQTVRRSPSADQSLEDSPSKVPKSWSFGDRSRARQAFRIKGA : ..:::: . :.. . .. :::::.: . : ::.:: :::::.::.: : ..:.:.. CCDS49 VRMASPRGQSIKSRQASVGD--RRSPSTDITAEGSPTKVQKSWSFNDRTRFRPSLRLKSS 430 440 450 460 470 480 510 520 530 540 550 560 pF1KB7 ASRQNSE-EASLPGEDIVDDKSCPCEFVTEDLTPGLKVSIRAVCVMRFLVSKRKFKESLR . . ...: .:. :.:.: :. .::::: ::. :::. .:.: :.::::::.:: CCDS49 QPKPVIDADTALGTDDVYDEKGCQCDVSVEDLTPPLKTVIRAIRIMKFHVAKRKFKETLR 490 500 510 520 530 540 570 580 590 600 610 pF1KB7 PYDVMDVIEQYSAGHLDMLSRIKSLQSRVDQIVGRGPAITDK-DRTKGPAEAELPEDPSM :::: :::::::::::::: ::::::.:::::.:.: .:: .: : :: : .: :: CCDS49 PYDVKDVIEQYSAGHLDMLCRIKSLQTRVDQILGKGQITSDKKSREKITAEHETTDDLSM 550 560 570 580 590 600 620 630 640 650 660 670 pF1KB7 MGRLGKVEKQVLSMEKKLDFLVNIYMQ--RMGIPPTETEAYFGAK--EPEPAPPYHSPED .::. :::::: :.:.::: :..::.: : : . . : : : : . :.:: : CCDS49 LGRVVKVEKQVQSIESKLDCLLDIYQQVLRKGSASALALASFQIPPFECEQTSDYQSPVD 610 620 630 640 650 660 680 690 700 710 720 pF1KB7 SRE---HVDRHGCIVKIVRSSSSTGQKNFSAPPAAPPVQC-----PPSTSWQPQSHPRQG :.. .. ::. . . .. : : . : : .: : : : :. CCDS49 SKDLSGSAQNSGCLSRSTSANISRGLQ-FILTPNEFSAQTFYALSPTMHSQATQVPISQS 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KB7 HGTSPVGDH--GSLVRIPPPPAHERSLSAYGGGNRASMEFLRQEDTPGCRPPEGNLRDSD :.. .. . .. . : :: .:. ... : . .: .: ..:..: CCDS49 DGSAVAATNTIANQINTAPKPAAPTTLQI--PPPLPAIKHLPRPET--LHPNPAGLQESI 730 740 750 760 770 790 800 810 820 830 840 pF1KB7 TSISIPSV-DHEELERSFSGFSISQS-KENLDALNSCYAAVAPCAKVRPYIAEGESDTDS .... : ..:... . :... ..: ....: . .: : CCDS49 SDVTTCLVASKENVQVAQSNLTKDRSMRKSFDMGGETLLSVCPMVPKDLGKSLSVQNLIR 780 790 800 810 820 830 850 860 870 pF1KB7 DLCTPCGPPPRSATGEGPFGDVGWAGPRK CCDS49 STEELNIQLSGSESSGSRGSQDFYPKWRESKLFITDEEVGPEETETDTFDAAPQPAREAA 840 850 860 870 880 890 >>CCDS55035.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 (822 aa) initn: 2020 init1: 1549 opt: 1580 Z-score: 1222.2 bits: 237.2 E(32554): 9.3e-62 Smith-Waterman score: 1762; 42.9% identity (58.8% similar) in 854 aa overlap (8-826:28-710) 10 20 30 pF1KB7 MVQKSRNGGVYPGPSGEKKLKVGF--VGLDPGAPDSTRDG :: : :: : .. : : :. .: .: CCDS55 MPRHHAGGEEGGAAGLWVKSGAAAAAAGGGRLG-SGMKDVESGRGRVLLNSAA---ARGD 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 pF1KB7 ALLIAGSEAPKRGSI---LSKPRAGGAGA-----GKPP--------KRNAFYRKLQNFLY .::. :..: :. : . : : :: ::: .::. ::..::.:: CCDS55 GLLLLGTRAATLGGGGGGLRESRRGKQGARMSLLGKPLSYTSSQSCRRNVKYRRVQNYLY 60 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 140 pF1KB7 NVLERPRGWAFIYHAYVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYEKSSEGALYILEIVTIVVFGVEYF :::::::::::::::.::::::.::.::::::: :. : . . : :::.: :::::.:.. CCDS55 NVLERPRGWAFIYHAFVFLLVFGCLILSVFSTIPEHTKLASSCLLILEFVMIVVFGLEFI 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 200 pF1KB7 VRIWAAGCCCRYRGWRGRLKFARKPFCVIDIMVLIASIAVLAAGSQGNVFATSALRSLRF .:::.::::::::::.:::.:::::::::: .::::::::..: .:::.::::::::::: CCDS55 IRIWSAGCCCRYRGWQGRLRFARKPFCVIDTIVLIASIAVVSAKTQGNIFATSALRSLRF 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KB7 LQILRMIRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGFLCLILASFLVYLAEKGENDHFD ::::::.:::::::::::::::::::::::.:::::::: ::..::::::.:: : .:. CCDS55 LQILRMVRMDRRGGTWKLLGSVVYAHSKELITAWYIGFLVLIFSSFLVYLVEKDANKEFS 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KB7 TYADALWWGLITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLIGVSFFALPAGILGSGFALKVQE ::::::::: ::::::::::: : :: ::::.: :.:.:.:::::::::::::::::::: CCDS55 TYADALWWGTITLTTIGYGDKTPLTWLGRLLSAGFALLGISFFALPAGILGSGFALKVQE 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KB7 QHRQKHFEKRRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTWQYYERTVTVPMYSSQTQTYGAS :::::::::::::::.::: .:: ::.. :..:.. .. CCDS55 QHRQKHFEKRRNPAANLIQCVWRSYAAD-------------EKSVSIATWK--------- 360 370 380 390 390 400 410 420 430 440 pF1KB7 RLIPPLNQLELLRNLKSKSGLAFRKDPPPEPSPSKGSPCRGPLCGCCPGRSSQKVSLKDR : :. :. : : .. : CCDS55 ---PHLKALHT----------------------------------CSPTKKEQ------- 400 410 450 460 470 480 490 500 pF1KB7 VFSSPRGVAAKGKGSPQAQTVRRSPSADQSLEDSPSKVPKSWSFGDRSRARQAFRIKGAA :. :. 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