FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7331, 994 aa
1>>>pF1KB7331 994 - 994 aa - 994 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3487+/-0.00112; mu= -1.0563+/- 0.067
mean_var=321.4786+/-65.446, 0's: 0 Z-trim(112.8): 80 B-trim: 6 in 1/51
Lambda= 0.071532
statistics sampled from 13406 (13475) to 13406 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.74), E-opt: 0.2 (0.414), width: 16
Scan time: 5.280
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45639.1 SEZ6 gene_id:124925|Hs108|chr17 ( 994) 6902 727.0 4.5e-209
CCDS45638.1 SEZ6 gene_id:124925|Hs108|chr17 ( 993) 6840 720.6 3.8e-207
CCDS13833.1 SEZ6L gene_id:23544|Hs108|chr22 (1024) 2893 313.3 1.6e-84
CCDS54508.1 SEZ6L gene_id:23544|Hs108|chr22 (1023) 2876 311.6 5.4e-84
CCDS58447.1 SEZ6L2 gene_id:26470|Hs108|chr16 ( 879) 2734 296.9 1.2e-79
CCDS73865.1 SEZ6L2 gene_id:26470|Hs108|chr16 ( 923) 2733 296.8 1.4e-79
CCDS10658.1 SEZ6L2 gene_id:26470|Hs108|chr16 ( 853) 2696 292.9 1.8e-78
CCDS74837.1 SEZ6L gene_id:23544|Hs108|chr22 (1011) 2677 291.0 8.1e-78
CCDS54509.1 SEZ6L gene_id:23544|Hs108|chr22 (1013) 2676 290.9 8.7e-78
CCDS10659.1 SEZ6L2 gene_id:26470|Hs108|chr16 ( 910) 2553 278.2 5.3e-74
CCDS54510.1 SEZ6L gene_id:23544|Hs108|chr22 ( 948) 2488 271.5 5.7e-72
CCDS45458.1 SEZ6L2 gene_id:26470|Hs108|chr16 ( 809) 2335 255.6 2.9e-67
CCDS54511.1 SEZ6L gene_id:23544|Hs108|chr22 ( 949) 2298 251.9 4.6e-66
CCDS380.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1 (3487) 876 105.6 1.8e-21
CCDS60082.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1 (3631) 876 105.6 1.9e-21
CCDS55189.1 CSMD1 gene_id:64478|Hs108|chr8 (3564) 852 103.2 1e-20
CCDS6316.2 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3538) 800 97.8 4.2e-19
CCDS6317.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3667) 800 97.8 4.3e-19
CCDS6315.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3707) 800 97.8 4.3e-19
>>CCDS45639.1 SEZ6 gene_id:124925|Hs108|chr17 (994 aa)
initn: 6902 init1: 6902 opt: 6902 Z-score: 3867.1 bits: 727.0 E(32554): 4.5e-209
Smith-Waterman score: 6902; 99.7% identity (99.8% similar) in 994 aa overlap (1-994:1-994)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MRPVALLLLPSLLALLAHGLSLEAPTVGKGQAPGIEETDGELTAAPTPEQPERGVHFVTT
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 APTLKLLNHHPLLEEFLQEGLEKGDEELRPALPFQPDPPAPFTPSPLPRLANQDSRPVFT
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SPTPAMAAVPTQPQSKEGPWSPESESPMLRITAPLPPGPSMAVPTLGPGEIASTTPPSRA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 WTPTQEGPGDMGRPWVAEVVSQGAGIGIQGTITSSTASGDDEETTTTTTIITTTITTVQT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PGPCSWNFSGPEGSLDSPTDLSSPTDVGLDCFFYISVYPGYGVEIKVQNISLREGETVTV
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310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EGLGGPDPLPLANQSFLLRGQVIRSPTHQAALRFQSLPPPAGPGTFHFHYQAYLLSCHFP
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370 380 390 400 410 420
pF1KB7 RRPAYGDVTVTSLHPGGSARFHCATGYQLKGARHLTCLNATQPFWDSKEPVCIGECPGVI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. : :::
CCDS45 RRPAYGDVTVTSLHPGGSARFHCATGYQLKGARHLTCLNATQPFWDSKEPVCIAACGGVI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RNATTGRIVSPGFPGNYSNNLTCHWLLEAPEGQRLHLHFEKVSLAEDDDRLIIRNGDNVE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 APPVYDSYEVEYLPIEGLLSSGKHFFVELSTDSSGAAAGMALRYEAFQQGHCYEPFVKYG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NFSSSTPTYPVGTTVEFSCDPGYTLEQGSIIIECVDPHDPQWNETEPACRAVCSGEITDS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AGVVLSPNWPEPYGRGQDCIWGVHVEEDKRIMLDIRVLRIGPGDVLTFYDGDDLTARVLG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QYSGPRSHFKLFTSMADVTIQFQSDPGTSVLGYQQGFVIHFFEVPRNDTCPELPEIPNGW
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730 740 750 760 770 780
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KSPSQPELVHGTVVTYQCYPGYQVVGSSVLMCQWDLTWSEDLPSCQRVTSCHDPGDVEHS
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790 800 810 820 830 840
pF1KB7 RRLISSPKFPVGATVQYICDQGFVLMGSSILTCHDRQAGSPKWSDRAPKCLLEQLKPCHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RRLISSPKFPVGATVQYICDQGFVLMGSSILTCHDRQAGSPKWSDRAPKCLLEQLKPCHG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 LSAPENGARSPEKQLHPAGATIHFSCAPGYVLKGQASIKCVPGHPSHWSDPPPICRAASL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LSAPENGARSPEKQLHPAGATIHFSCAPGYVLKGQASIKCVPGHPSHWSDPPPICRAASL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DGFYNSRSLDVAKAPAASSTLDAAHIAAAIFLPLVAMVLLVGGVYFYFSRLQGKSSLQLP
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970 980 990
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::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RPRPRPYNRITIESAFDNPTYETGSLSFAGDERI
970 980 990
>>CCDS45638.1 SEZ6 gene_id:124925|Hs108|chr17 (993 aa)
initn: 6840 init1: 6840 opt: 6840 Z-score: 3832.5 bits: 720.6 E(32554): 3.8e-207
Smith-Waterman score: 6840; 99.7% identity (99.8% similar) in 984 aa overlap (1-984:1-984)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MRPVALLLLPSLLALLAHGLSLEAPTVGKGQAPGIEETDGELTAAPTPEQPERGVHFVTT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 APTLKLLNHHPLLEEFLQEGLEKGDEELRPALPFQPDPPAPFTPSPLPRLANQDSRPVFT
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SPTPAMAAVPTQPQSKEGPWSPESESPMLRITAPLPPGPSMAVPTLGPGEIASTTPPSRA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 WTPTQEGPGDMGRPWVAEVVSQGAGIGIQGTITSSTASGDDEETTTTTTIITTTITTVQT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PGPCSWNFSGPEGSLDSPTDLSSPTDVGLDCFFYISVYPGYGVEIKVQNISLREGETVTV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EGLGGPDPLPLANQSFLLRGQVIRSPTHQAALRFQSLPPPAGPGTFHFHYQAYLLSCHFP
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. : :::
CCDS45 RRPAYGDVTVTSLHPGGSARFHCATGYQLKGARHLTCLNATQPFWDSKEPVCIAACGGVI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RNATTGRIVSPGFPGNYSNNLTCHWLLEAPEGQRLHLHFEKVSLAEDDDRLIIRNGDNVE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 APPVYDSYEVEYLPIEGLLSSGKHFFVELSTDSSGAAAGMALRYEAFQQGHCYEPFVKYG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NFSSSTPTYPVGTTVEFSCDPGYTLEQGSIIIECVDPHDPQWNETEPACRAVCSGEITDS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB7 QYSGPRSHFKLFTSMADVTIQFQSDPGTSVLGYQQGFVIHFFEVPRNDTCPELPEIPNGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB7 KSPSQPELVHGTVVTYQCYPGYQVVGSSVLMCQWDLTWSEDLPSCQRVTSCHDPGDVEHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KSPSQPELVHGTVVTYQCYPGYQVVGSSVLMCQWDLTWSEDLPSCQRVTSCHDPGDVEHS
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pF1KB7 RRLISSPKFPVGATVQYICDQGFVLMGSSILTCHDRQAGSPKWSDRAPKCLLEQLKPCHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RRLISSPKFPVGATVQYICDQGFVLMGSSILTCHDRQAGSPKWSDRAPKCLLEQLKPCHG
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pF1KB7 LSAPENGARSPEKQLHPAGATIHFSCAPGYVLKGQASIKCVPGHPSHWSDPPPICRAASL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LSAPENGARSPEKQLHPAGATIHFSCAPGYVLKGQASIKCVPGHPSHWSDPPPICRAASL
850 860 870 880 890 900
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pF1KB7 DGFYNSRSLDVAKAPAASSTLDAAHIAAAIFLPLVAMVLLVGGVYFYFSRLQGKSSLQLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DGFYNSRSLDVAKAPAASSTLDAAHIAAAIFLPLVAMVLLVGGVYFYFSRLQGKSSLQLP
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pF1KB7 RPRPRPYNRITIESAFDNPTYETGSLSFAGDERI
::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RPRPRPYNRITIESAFDNPTYETGETREYEVSI
970 980 990
>>CCDS13833.1 SEZ6L gene_id:23544|Hs108|chr22 (1024 aa)
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Smith-Waterman score: 2941; 43.4% identity (70.8% similar) in 1021 aa overlap (1-984:11-1015)
10 20 30 40
pF1KB7 MRPVALLLLPSLLALLAHGLSLEAPTVGKGQA----PGIEETDGELTAAP
.: ..:.: : : . . .:: .. .:.: : . . . ..:
CCDS13 MPAARPPAAGLRGISLFL---ALLLGSPAAALERDALPEGDASPLGPYLLPSGAPERGSP
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 TPEQPERGVHFVTTAPTLKLLNHHPLLEEFLQEGLEKGDEELRPAL-PFQPDPPAPFTPS
:.::. : ::. :. . . .: :.. .: . .. ::: :. :. :
CCDS13 GKEHPEERV--VTAPPSSS--QSAEVLGELVLDGTAPSAHHDIPALSPLLPEEARPKHAL
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140
pF1KB7 P----LPRLANQDS-----RPVFTSPT--------PAMAAVPTQPQSKEGPWSPESESPM
: :: : . .: :: :: . :: .. .: : : : . .:.
CCDS13 PPKKKLPSLKQVNSARKQLRPKATSAATVQRAGSQPASQGLDLLSSSTEKPGPPGDPDPI
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190
pF1KB7 L---------------RITAPLPPGPSMAVPTLGPGEIASTTPPSRAWTPTQEGPGDMGR
. . ..: :.: . : . .: : : .: : . :: ::..
CCDS13 VASEEASEVPLWLDRKESAVPTTPAPLQISPFTSQPYVAHTLP-QRP-EPGEPGP-DMAQ
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 PWVAEVVSQGAGIGIQGTITSSTASGDDEETTTTTTIITTTITTVQTPGPCSWNFSGPEG
: .: : . . ...:: ...::::.: : ::.::: :.:. :: .::.:::
CCDS13 EAPQEDTSPMALMDKGENELTGSASEESQETTTSTIITTTVITTEQAPALCSVSFSNPEG
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 SLDSPTDLSSPTDVGLDCFFYISVYPGYGVEIKVQNISLREGETVTVEGLGGPDPLPLAN
.:: : . :.: . ..:: :::::..:....: .:: ....:. :: :::
CCDS13 YIDSSDYPLLPLNNFLECTYNVTVYTGYGVELQVKSVNLSDGELLSIRGVDGPTLTVLAN
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 QSFLLRGQVIRSPTHQAALRFQSLPPPAGPGTFHFHYQAYLLSCHFPRRPAYGDVTVTSL
:..:..::::::::. .. :... : :::..::::..:::.::::: ::::: .:
CCDS13 QTLLVEGQVIRSPTNTISVYFRTFQDD-GLGTFQLHYQAFMLSCNFPRRPDSGDVTVMDL
360 370 380 390 400
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 HPGGSARFHCATGYQLKGARHLTCLNATQPFWDSKEPVCIGECPGVIRNATTGRIVSPGF
: :: :.::: ::.:.::. :::.::..: :.:.::.: . : :...::: ::..::..
CCDS13 HSGGVAHFHCHLGYELQGAKMLTCINASKPHWSSQEPICSAPCGGAVHNATIGRVLSPSY
410 420 430 440 450 460
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 PGNYSNNLTCHWLLEAPEGQRLHLHFEKVSLAEDDDRLIIRNGDNVEAPPVYDSYEVEYL
: : ... : : .::::::.::::::.. : .: ::. ...:.. .. .::: ..: .
CCDS13 PENTNGSQFCIWTIEAPEGQKLHLHFERL-LLHDKDRMTVHSGQTNKSALLYDSLQTESV
470 480 490 500 510 520
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 PIEGLLSSGKHFFVELSTDSSGAAAGMALRYEAFQQGHCYEPFVKYGNFSSSTPTYPVGT
:.::::: :. . .:...:.. ::. . .:.:::..::::::... :::..: ::: .::
CCDS13 PFEGLLSEGNTIRIEFTSDQARAASTFNIRFEAFEKGHCYEPYIQNGNFTTSDPTYNIGT
530 540 550 560 570 580
560 570 580 590 600 610
pF1KB7 TVEFSCDPGYTLEQGSIIIECVDPHDPQWNETEPACRAVCSGEITDSAGVVLSPNWPEPY
:::.::::..:::: ::::.. .:: ::.::: :::.:.::.. :::::::::::::
CCDS13 IVEFTCDPGHSLEQGPAIIECINVRDPYWNDTEPLCRAMCGGELSAVAGVVLSPNWPEPY
590 600 610 620 630 640
620 630 640 650 660 670
pF1KB7 GRGQDCIWGVHVEEDKRIMLDIRVLRIGPGDVLTFYDGDDLTARVLGQYSGPRSHFKLFT
.:.:::: .:: :.:::.:::. : .. .:.::.::::.. ..:::: : . ::..
CCDS13 VEGEDCIWKIHVGEEKRIFLDIQFLNLSNSDILTIYDGDEVMPHILGQYLGNSGPQKLYS
650 660 670 680 690 700
680 690 700 710 720 730
pF1KB7 SMADVTIQFQSDPGTSVLGYQQGFVIHFFEVPRNDTCPELPEIPNGWKSPSQPELVHGTV
: :.::::.:::. ..: :::.....:: :::.: .:::: ::::. :. :::.:.
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980 990
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CCDS54 TIQYTCNPGFVLEGSSLLTCYSRETGTPIWTSRLPHCVSEESLACDNPGLPENGYQILYK
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CCDS54 A-AAETSLEGGNMALAIFIPVLIISLLLGGAYIYITRCRYYSNLRLPLMYSHPYSQITVE
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pF1KB7 SAFDNPTYETGSLSFAGDERI
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CCDS54 TEFDNPIYETGETREYEVSI
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CCDS58 PLGLVIVLGSGVYIYYTKLQGKSLFGFSGSHS--YSPITVESDFSNPLYEAGDTREYEVS
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pF1KB7 RI
CCDS58 I
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pF1KB7 PTLKLLNHHPLLEEFLQEGLEKGDEELRPALPFQPDPPAPFTPSPLPRLANQDSRPVFTS
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CCDS73 MGTPRAQHPPPPQLLFLILLSCPWIQGLPLKEEEILPEPGSETPTVASE--------
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pF1KB7 PTPAMAAVPTQPQSKEGP---WSPESE-SPMLRITAPLPPGPSMAVPTLGPGEIASTTPP
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CCDS73 ---ALAELLHGALLRRGPEMGYLPGSDRDPTL---ATPPAGQTLAVPSLPRATEPGTGPL
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CCDS73 TTAVTPNGVRGAG----PTAPELLTPPPGTTAPPPPSPASPGPPLGPEGGEEETTTTIIT
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CCDS73 TTTVTTTVTSPVLCNNNISEGEGYVESP-DLGSPVSRTLGLLDCTYSIHVYPGYGIEIQV
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CCDS73 QTLNLSQEEELLVLAGGGSPGLAPRLLANSSMLGEGQVLRSPTNRLLLHFQSPRVPRGGG
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CCDS73 -FRIHYQAYLLSCGFPPRPAHGDVSVTDLHPGGTATFHCDSGYQLQGEETLICLNGTRPS
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pF1KB7 WDSKEPVCIGECPGVIRNATTGRIVSPGFPGNYSNNLTCHWLLEAPEGQRLHLHFEKVSL
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CCDS73 WNGETPSCMASCGGTIHNATLGRIVSPEPGGAVGPNLTCRWVIEAAEGRRLHLHFERVSL
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pF1KB7 AEDDDRLIIRNGDNVEAPPVYDSYEVEYLPIEGLLSSGKHFFVELSTDSSGAAAGMALRY
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CCDS73 DEDNDRLMVRSGGSPLSPVIYDS-DMDDVPERGLISDAQSLYVELLSETPANPLLLSLRF
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pF1KB7 EAFQQGHCYEPFVKYGNFSSSTPTYPVGTTVEFSCDPGYTLEQGSI--IIECVDPHDPQW
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CCDS73 EAFEEDRCFAPFLAHGNVTTTDPEYRPGALATFSCLPGYALEPPGPPNAIECVDPTEPHW
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pF1KB7 NETEPACRAVCSGEITDSAGVVLSPNWPEPYGRGQDCIWGVHVEEDKRIMLDIRVLRIGP
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CCDS73 NDTEPACKAMCGGELSEPAGVVLSPDWPQSYSPGQDCVWGVHVQEEKRILLQVEILNVRE
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CCDS73 GDMLTLFDGDGPSARVLAQLRGPQPRRRLLSSGPDLTLQFQAPPGPPNPGLGQGFVLHFK
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CCDS73 EVPRNDTCPELPPPEWGWRTASHGDLIRGTVLTYQCEPGYELLGSDILTCQWDLSWSAAP
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CCDS73 PACQKIMTCADPGEIANGHRTASDAGFPVGSHVQYRCLPGYSLEGAAMLTCYSRDTGTPK
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CCDS73 WSDRVPKCAL-KYEPCLNPGVPENGYQTLYKHHYQAGESLRFFCYEGFELIGEVTITCVP
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980 990
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CCDS54 TEFDNPIYETGETREYEVSI
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