FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7332, 1032 aa 1>>>pF1KB7332 1032 - 1032 aa - 1032 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6897+/-0.00117; mu= 19.2322+/- 0.070 mean_var=67.4256+/-13.016, 0's: 0 Z-trim(101.7): 35 B-trim: 0 in 0/49 Lambda= 0.156193 statistics sampled from 6583 (6613) to 6583 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.553), E-opt: 0.2 (0.203), width: 16 Scan time: 3.540 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS42788.1 ITGA4 gene_id:3676|Hs108|chr2 (1032) 6891 1562.7 0 CCDS2669.1 ITGA9 gene_id:3680|Hs108|chr3 (1035) 2758 631.4 2.9e-180 CCDS82540.1 ITGA4 gene_id:3676|Hs108|chr2 ( 195) 1330 309.4 4.9e-84 CCDS11558.1 ITGA3 gene_id:3675|Hs108|chr17 (1051) 962 226.7 2e-58 CCDS2292.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1048) 949 223.8 1.5e-57 CCDS46471.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1002) 861 203.9 1.4e-51 CCDS8880.1 ITGA5 gene_id:3678|Hs108|chr12 (1049) 837 198.5 6.1e-50 CCDS46470.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1012) 817 194.0 1.3e-48 CCDS45461.1 ITGAL gene_id:3683|Hs108|chr16 (1086) 803 190.9 1.3e-47 CCDS31155.1 ITGA8 gene_id:8516|Hs108|chr10 (1063) 798 189.7 2.7e-47 CCDS10711.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16 (1163) 796 189.3 4e-47 CCDS67014.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16 (1169) 796 189.3 4e-47 CCDS32433.1 ITGAL gene_id:3683|Hs108|chr16 (1170) 794 188.9 5.5e-47 CCDS45291.1 ITGA11 gene_id:22801|Hs108|chr15 (1188) 760 181.2 1.1e-44 CCDS54004.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16 (1153) 686 164.5 1.2e-39 CCDS45470.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16 (1152) 684 164.1 1.6e-39 CCDS32438.1 ITGAD gene_id:3681|Hs108|chr16 (1161) 658 158.2 9.2e-38 CCDS32665.1 ITGA2B gene_id:3674|Hs108|chr17 (1039) 655 157.5 1.3e-37 CCDS76204.1 ITGA10 gene_id:8515|Hs108|chr1 (1024) 643 154.8 8.6e-37 CCDS72869.1 ITGA10 gene_id:8515|Hs108|chr1 (1167) 643 154.8 9.6e-37 CCDS8888.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12 (1137) 634 152.8 3.8e-36 CCDS44914.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12 (1044) 629 151.7 7.8e-36 CCDS55832.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12 (1141) 629 151.7 8.4e-36 CCDS3957.1 ITGA2 gene_id:3673|Hs108|chr5 (1181) 569 138.2 1e-31 CCDS32531.1 ITGAE gene_id:3682|Hs108|chr17 (1179) 518 126.7 2.9e-28 CCDS3955.1 ITGA1 gene_id:3672|Hs108|chr5 (1179) 418 104.1 1.8e-21 >>CCDS42788.1 ITGA4 gene_id:3676|Hs108|chr2 (1032 aa) initn: 6891 init1: 6891 opt: 6891 Z-score: 8383.0 bits: 1562.7 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6891; 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CCDS26 CREDRDDEWMGVSLARQPKADGRVLACAHRWKNIYY-EADHILPHGFCYIIPSNLQAK-G 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 KRIAPCYQDYVKKFGENFASCQAGISSFYTKDLIVMGAPGSSYWTGSLFVYNITTNKYKA . . :::..: ::.::. .::::::..:.:..:.::::::: ::.:.. : :.: : : CCDS26 RTLIPCYEEYKKKYGEEHGSCQAGIAGFFTEELVVMGAPGSFYWAGTIKVLNLTDNTYLK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 FLDKQNQVKFGSYLGYSVGAGHFRSQHTTEVVGGAPQHEQIGKAYIFSIDEKELNILH-- . :. . . .::::.: :::: : .::::::: . :::.::: :.. .... CCDS26 LNDEVIMNRRYTYLGYAVTAGHFSHPSTIDVVGGAPQDKGIGKVYIFRADRRSGTLIKIF 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 EMKGKKLGSYFGASVCAVDLNADGFSDLLVGAPMQSTIREEGRVFVYINSGSGAVMNAME . .:::.:::::.:.::::::.::.::::::::: : ::.::.: :::: :.::. . . CCDS26 QASGKKMGSYFGSSLCAVDLNGDGLSDLLVGAPMFSEIRDEGQVTVYINRGNGALEEQL- 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 TNLVGSDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQEDDLQGAIYIYNGRADGISSTFS :.:. : :.:::::..: :.::::: :::::::.:::. ::.:::.: : :: .: CCDS26 -ALTGDGAYNAHFGESIASLDDLDNDGFPDVAIGAPKEDDFAGAVYIYHGDAGGIVPQYS 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 QRIEGLQISKSLSMFGQSISGQIDADNNGYVDVAVGAFRSDSAVLLRTRPVVIVDASLSH ... : .:. : :::::::: :: :.::: ::.:::: :::.::::.:::. ::.:. CCDS26 MKLSGQKINPVLRMFGQSISGGIDMDGNGYPDVTVGAFMSDSVVLLRARPVITVDVSIFL 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB7 PESVNRTKFDCVENGWPSVCIDLTLCFSYKGKEVPGYIVLFYNMSLDVNRKAESP-PRFY : :.: : .: .. : :...: :::..::.::: : : : . :: .: .. :: : CCDS26 PGSINITAPQCHDGQQPVNCLNVTTCFSFHGKHVPGEIGLNYVLMADVAKKEKGQMPRVY 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KB7 FSSNG-TSDVITGSIQVSSREANCRTHQAFMRKDVRDILTPIQIEAAYHLGPHVISKRST : : : .: ..:.. : .:: . : ... :.:...:: .:::: :. :: ... CCDS26 FVLLGETMGQVTEKLQLTYMEETCRHYVAHVKRRVQDVISPIVFEAAYSLSEHVTGEEE- 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KB7 EEFPPLQPILQQKKEKDIMKKTIN-FARFCAHENCSADLQVSAKIGFLKPHENKTYLAVG .:.::: :.:. :: . : .:. . : : : :.:.::::...:. . . :. :::.: CCDS26 RELPPLTPVLRWKKGQKIAQKNQTVFERNCRSEDCAADLQLQGKLLLSSMDEKTLYLALG 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KB7 SMKTLMLNVSLFNAGDDAYETTLHVKLPVGLYFIKILELEEKQINCEVTDNSGVVQLDCS ..:.. ::.:. : :::::.... .. :.::.. . :: :.::. ... : :: CCDS26 AVKNISLNISISNLGDDAYDANVSFNVSRELFFINMWQKEEMGISCELLESD---FLKCS 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 pF1KB7 IGYIYVDHLSRIDISFLLDVSSLSRAEEDLSITVHATCENEEEMDNLKHSRVTVAIPLKY .:. .. :. ..: ..:.: :: :: ::. : : : :. ..:. . ... .:: . CCDS26 VGFPFMRSKSKYEFSVIFDTSHLSGEEEVLSFIVTAQSGNTERSESLHDNTLVLMVPLMH 710 720 730 740 750 760 780 790 800 810 820 pF1KB7 EVKLTVHGFVNPTSFVYG-SNDEN-----EPETCMVEKMNLTFHVINTGNSMAPNVSVEI :: .. :...::::::: : : . : . .:.:..: ::: : :. :: : CCDS26 EVDTSITGIMSPTSFVYGESVDAANFIQLDDLECHFQPINITLQVYNTGPSTLPGSSVSI 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 pF1KB7 MVPNSFSPQTDKLFNILD--VQTTTGECHFENYQRVCALEQQKSAMQTLKGIVRFLSKTD :: .: ..:.. . : :.: :.. : . :.. . .. : :..:. CCDS26 SFPNRLSSGGAEMFHVQEMVVGQEKGNCSFQKNPTPCIIPQEQENI--FHTIFAFFTKSG 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 pF1KB7 KRLLYCIKADPHCLNFLCNFGKMESGKEASVHIQLEGRPSILEMDETSALKFEIRATGFP ...: : : ::. :::. . . . .. : . ::. : .:...: :: CCDS26 RKVLDCEKPGISCLTAHCNFSALAKEESRTIDIYMLLNTEILKKDSSSVIQFMSRAKVKV 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 pF1KB7 EPNPRVIEL--NKDENVAHVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLIVLLLISYVMWKA .: ::.:. .. :.:. :..:.::. .:. : . ::. :::.:....::.. ..:: CCDS26 DPALRVVEIAHGNPEEVT-VVFEALHNLEPRGYVVGWIIAISLLVGILIFLLLAVLLWKM 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KB7 GFFKRQYKSILQ-EENRR---DSWSYINSKSNDD :::.:.:: :.. :.::. :::... CCDS26 GFFRRRYKEIIEAEKNRKENEDSWDWVQKNQ 1010 1020 1030 >>CCDS82540.1 ITGA4 gene_id:3676|Hs108|chr2 (195 aa) initn: 1360 init1: 1330 opt: 1330 Z-score: 1622.2 bits: 309.4 E(32554): 4.9e-84 Smith-Waterman score: 1330; 97.4% identity (99.0% similar) in 191 aa overlap (1-191:1-191) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MAWEARREPGPRRAAVRETVMLLLCLGVPTGRPYNVDTESALLYQGPHNTLFGYSVVLHS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS82 MAWEARREPGPRRAAVRETVMLLLCLGVPTGRPYNVDTESALLYQGPHNTLFGYSVVLHS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 HGANRWLLVGAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQTCEQLQLGSPNGEPCGKTCLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS82 HGANRWLLVGAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQTCEQLQLGSPNGEPCGKTCLE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 ERDNQWLGVTLSRQPGENGSIVTCGHRWKNIFYIKNENKLPTGGCYGVPPDLRTELSKRI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS82 ERDNQWLGVTLSRQPGENGSIVTCGHRWKNIFYIKNENKLPTGGCYGVPPDLRTELSKRI 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 APCYQDYVKKFGENFASCQAGISSFYTKDLIVMGAPGSSYWTGSLFVYNITTNKYKAFLD ::::: ..:. CCDS82 APCYQGSISKYRART 190 >>CCDS11558.1 ITGA3 gene_id:3675|Hs108|chr17 (1051 aa) initn: 483 init1: 243 opt: 962 Z-score: 1162.4 bits: 226.7 E(32554): 2e-58 Smith-Waterman score: 1047; 27.5% identity (56.2% similar) in 1076 aa overlap (9-1019:3-1033) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MAWEARREPGPRRAAVRETVMLL-LCLGVPTG----RPYNVDTESALLYQ-GPHNTLFGY ::: :: .:: : : : .: .:.::. .. . : ..:::: CCDS11 MGPGPSRAPRAPRLMLCALALMVAAGGCVVSAFNLDTRFLVVKEAGNPGSLFGY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 SVVLH--SHGANRWLLV-GAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQTCEQLQLGSPNG ::.:: .. .:.::. ::: . .. . ::.: : . . . ::.... : CCDS11 SVALHRQTERQQRYLLLAGAPRELAVPDGYTNRTGAVYLCPLTAHK-DDCERMNITVKN- 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 EPCGKTCLEERDNQWLGVTLSRQPGENGSIVTCGHRWKNIFYIKNEN-KLPTGGCYGVPP .: :. .:. .:::::.. : : : ...:.::. .... .:. . .: :: CCDS11 DP-GHHIIED---MWLGVTVASQ-GPAGRVLVCAHRYTQVLWSGSEDQRRMVGKCYVRGN 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 pF1KB7 DLRTELSKRIAPCYQDYVKKFGENFAS--CQAGISSFYTKDLIVMGAPGSSYWTGSLFV- ::. . : .... .. . . . :: : :. .:.. . .::::. : :. .. CCDS11 DLELDSSDDWQTYHNEMCNSNTDYLETGMCQLGTSGGFTQNTVYFGAPGAYNWKGNSYMI 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 ----YNITTNKYKAFLDKQNQVKFGSYLGYSVGAGHF-RSQHTTEVVGGAPQHEQIGKAY .... .:: : ..: .. :.::.. .: : .. .: :::.:...: .. CCDS11 QRKEWDLSEYSYK---DPEDQGNL--YIGYTMQVGSFILHPKNITIVTGAPRHRHMGAVF 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 IFSIDEK-ELNILHEMKGKKLGSYFGASVCAVDLNADGFSDLLVGAPMQSTIREE--GRV ..: . .: . ..:...:.:::... .::: ::..:::::::. .:: : . CCDS11 LLSQEAGGDLRRRQVLEGSQVGAYFGSAIALADLNNDGWQDLLVGAPYYFERKEEVGGAI 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KB7 FVYINSGSGAVMNAMETNLVGSDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQEDDLQGA .:..:. .:. . : . :. . . .: :: :....:::..:::.:.:.::: : : CCDS11 YVFMNQ-AGTSFPAHPSLLLHGPSGSA-FGLSVASIGDINQDGFQDIAVGAPFEG--LGK 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KB7 IYIYNGRADGISSTFSQRIEGLQIS-KSLSMFGQSISGQIDADNNGYVDVAVGAFRSDSA .:::.. . :. .: :.: ... .:. :: :.:::.:.:.: : :. ::.. :: CCDS11 VYIYHSSSKGLLRQPQQVIHGEKLGLPGLATFGYSLSGQMDVDENFYPDLLVGSL-SDHI 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KB7 VLLRTRPVV-IVDASLSHPESVNRTKFDCVENGWPSVCIDLTLCFSY-KGKEVPGY---I ::::.:::. :: .: :. . :. .. :... :::.: .. :.: : CCDS11 VLLRARPVINIVHKTLV-PRPAVLDPALCTATS----CVQVELCFAYNQSAGNPNYRRNI 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KB7 VLFYNMSLDVNRKAESPPRFYFSSNGTSDVITGSIQVSSREANCRTHQAFMRKDVRDILT .: :.. : .:. :::. :... : :. : . : : :. . .. ..:: : CCDS11 TLAYTLEADRDRR---PPRLRFAGS-ESAVFHGFF--SMPEMRCQKLELLLMDNLRDKLR 520 530 540 550 560 580 590 600 610 620 630 pF1KB7 PIQIEAAYHLGPHVISKRSTEEFPPLQ--PILQQKKEKDIMKKTINFARFCAHEN-CSAD :: : : : : . : . :. :::.: . . . ..: . :. .: : .. CCDS11 PIIISMNYSL-PLRMPDRPRLGLRSLDAYPILNQAQALE-NHTEVQFQKECGPDNKCESN 570 580 590 600 610 620 640 650 660 670 680 pF1KB7 LQVSAKIGFLKPHENK-TYLAVG-SMKTLMLNVSLFN------AGDDAYETTLHVKLPVG ::. : .:.. ...: . : . ... :.:.... : .:.::.:. : . .: . CCDS11 LQMRA--AFVSEQQQKLSRLQYSRDVRKLLLSINVTNTRTSERSGEDAHEALLTLVVPPA 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 pF1KB7 LYFIKILELEEKQIN----CEVTD---NSGVVQLDCSIGYIYVDHLSRIDISFLLDVSSL : . .. : : ::. . . ..: .. : : .: :.. :..:. CCDS11 LLLSSVRPPGACQANETIFCELGNPFKRNQRMELLIAFEVIGVTLHTR-DLQVQLQLSTS 690 700 710 720 730 740 740 750 760 770 780 790 pF1KB7 SRAEED----LSITVHATCENEEEMDNLKHSRVTVAIPLKYEVKLTVHGFVNPTSFVYGS :. .. :.. : : .. : : . . . . ::. .: .. . CCDS11 SHQDNLWPMILTLLVDYTLQTSLSMVNHRLQSFFGGTVMGESGMKTVEDVGSPLKYEFQV 750 760 770 780 790 800 800 810 820 830 840 pF1KB7 NDENEPET---CMVEKMNLTFHVINTGNSMAPNVSVEIMVPNSFS----PQTDKLFNILD . .: . .: .. ..: : . :. :: : .. : : : :.: :. CCDS11 GPMGEGLVGLGTLVLGLEWPYEVSNGKWLLYPT---EITVHGNGSWPCRPPGD-LINPLN 810 820 830 840 850 850 860 870 880 890 900 pF1KB7 VQTTT-GECHFENYQRVCALEQ---QKSAMQTLKGIVRFLSKTDKRLLYCIKADPHCLNF . . :. .: :. : :: . . :.: .: : . ::. . CCDS11 LTLSDPGDRPSSPQRRRRQLDPGGGQGPPPVTLAAAKKAKSET---VLTCATGRAHCVWL 860 870 880 890 900 910 910 920 930 940 950 pF1KB7 LCNFGKMESGKEASVHIQLEGRPSILEMDETSALKFEIRATGFPEPN-PRVIELNKDE-- : . ...:. .. . : .. . . .. . :: : . . : . :: CCDS11 ECPIPDAPVVTNVTVKARVWNSTFIEDYRDFDRVRVNGWATLFLRTSIPTINMENKTTWF 920 930 940 950 960 970 960 970 980 990 1000 1010 pF1KB7 --NVAHVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLIVLLLISYVMWKAGFFKRQYKSILQE .. :.: : . ... .. ::::::.::: :: ::::: : : CCDS11 SVDIDSELVEELPAEIELWLVLVAVGAGLLLLGLIILLL-----WKCGFFKRARTRALYE 980 990 1000 1010 1020 1020 1030 pF1KB7 ENRRDSWSYINSKSNDD .:. CCDS11 AKRQKAEMKSQPSETERLTDDY 1030 1040 1050 >>CCDS2292.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1048 aa) initn: 581 init1: 161 opt: 949 Z-score: 1146.5 bits: 223.8 E(32554): 1.5e-57 Smith-Waterman score: 1163; 27.2% identity (58.5% similar) in 1099 aa overlap (1-1032:1-1047) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MAWEARREPGPRRAAVRETVMLLLCLGVPTGRPYNVDTESALLYQGPHNTLFGYSV--VL ::. ::. : . : .:: : .: : .:.:..: :.::... ::..: . CCDS22 MAFPPRRR---LRLGPRGLPLLLSGLLLPLCRAFNLDVDSPAEYSGPEGSYFGFAVDFFV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 HSHGANRWLLVGAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQTCEQLQLGSPNGEPCGKTC : .. .:::::: :: .. .... : . .: ... . :. ... . ... .: CCDS22 PSASSRMFLLVGAPKAN-TTQPGIVEGGQVLKCDWSST--RRCQPIEFDATGNRDYAKDD 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 -LEERDNQWLGVTL-SRQPGENGSIVTCG--HRWKNIFYIKNENKLPTGGCYGVPPDLRT :: ...::.:... :.: .:..:. ..:.. .:.: . :.: :. . .: CCDS22 PLEFKSHQWFGASVRSKQD----KILACAPLYHWRT--EMKQERE-PVGTCF-LQDGTKT 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 pF1KB7 ELSKRIAPCYQDYVKKFGENFASCQAGISSFYTK-DLIVMGAPGSSYWTGSL-------- . ::: .. . :..: ::.:.: .:: : ...:.::: :: :.: CCDS22 ---VEYAPCRSQDIDADGQGF--CQGGFSIDFTKADRVLLGGPGSFYWQGQLISDQVAEI 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KB7 ---FVYNITTNKYKAFL-DKQNQVKFG-SYLGYSVGAGHFRSQHTTEVVGGAPQHEQ-IG . :. . ::. : . :. : :::::::..: : .. . :.:.:. . .: CCDS22 VSKYDPNVYSIKYNNQLATRTAQAIFDDSYLGYSVAVGDFNGDGIDDFVSGVPRAARTLG 230 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 KAYIFSIDEKELNILHEMKGKKLGSYFGASVCAVDLNADGFSDLLVGAPM------QSTI .::. : :... :... :.....::: :: :.:.:.: ..:...:::. .. . CCDS22 MVYIY--DGKNMSSLYNFTGEQMAAYFGFSVAATDINGDDYADVFIGAPLFMDRGSDGKL 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KB7 REEGRVFVYINSGSGAVMNAMETNLVGSDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQE .: :.: : .. .:: . . :.: : . .: ::: .:. :::.:.:::.:.::.:: CCDS22 QEVGQVSVSLQRASG---DFQTTKLNGFEVFA-RFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAAPYG 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KB7 -DDLQGAIYIYNGRADGISSTFSQRIEGLQISKSLS-MFGQSISGQIDADNNGYVDVAVG .: .: .::.:::. :.... :: .:: ..:. :: :..: : :.::: :. :: CCDS22 GEDKKGIVYIFNGRSTGLNAVPSQILEGQWAARSMPPSFGYSMKGATDIDKNGYPDLIVG 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 pF1KB7 AFRSDSAVLLRTRPVVIVDASLS-HPESVNRTKFDCVENG--WPSVCIDLTLCFSYKGKE :: : :.: :.:::. :.:.: .: .:. . : : :... .:.. :: CCDS22 AFGVDRAILYRARPVITVNAGLEVYPSILNQDNKTCSLPGTALKVSCFNVRFCLKADGKG 460 470 480 490 500 510 510 520 530 540 550 560 pF1KB7 V-PGYIVLFYNMSLDVNRKAESPPR-FYFSSNGTSDVITGSIQVSSREANCRTHQAFMR- : : . . .. :: .. . : ... : . : . .:. .. .:. :..: CCDS22 VLPRKLNFQVELLLDKLKQKGAIRRALFLYSRSPSHSKNMTISRGGL-MQCEELIAYLRD 520 530 540 550 560 570 570 580 590 600 610 620 pF1KB7 -KDVRDILTPIQIEAAYHLGPHVISKRSTEEFPPLQPILQQKKEKDIMKKTINFARFCAH .. :: :::: : :.: . :.. . :::::.: .: ... .. :.. CCDS22 ESEFRDKLTPITIFMEYRL-----DYRTAADTTGLQPILNQFTPANISRQA-HILLDCGE 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 pF1KB7 EN-CSADLQVSAKIGFLKPHENKTYLAVGSMKTLMLNVSLFNAGDDAYETTLHVKLPVGL .: :. :.:: . ..: : .:. . : : :. : :. :::. : :..:. CCDS22 DNVCKPKLEVS-----VDSDQKKIY--IGDDNPLTLIVKAQNQGEGAYEAELIVSIPLQA 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 pF1KB7 YFIKILELEEK--QINCEVTDNSGVVQLDCSIGYIYVDHLSRIDISFL--LDVSSLSRAE :: ... .: ...: .. . :. :..: . . ..: : : ...: CCDS22 DFIGVVRNNEALARLSCAFKTENQTRQVVCDLGNPM-----KAGTQLLAGLRFSVHQQSE 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 pF1KB7 EDLSITVHATCENEEEMDNLK---HSRVTVAIPLKYEVKLTV---HGFVNPTSFVYGSND : :. .. . .:... .: .:. :.. . : :. .. . : CCDS22 MDTSVKFDLQIQSSNLFDKVSPVVSHKVDLAVLAAVEIRGVSSPDHVFLPIPNWEHKENP 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 pF1KB7 ENEPETCMVEKMNLTFHVINTGNSMAPNVSVEIMVPNSFSPQTDKLFNILDVQTTTGECH :.: .. : .. ... :.: : .. .... : ... .: :. :: . : . CCDS22 ETEEDVGPV--VQHIYELRNNGPSSFSKAMLHLQWPYKYNNNT--LLYILHYDID-GPMN 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 pF1KB7 FENYQRVCALEQQKSAMQTLK--GIVRFLSKTD----KRLLYCIKADPH--------CLN . ... :. . :..:: . : .. : :: : ..: : ::. CCDS22 CTSDMEINPLRIKISSLQTTEKNDTVAGQGERDHLITKRDLALSEGDIHTLGCGVAQCLK 860 870 880 890 900 910 900 910 920 930 940 950 pF1KB7 FLCNFGKMESGKEASVHIQLEGRPSILEMDETSALKFEIRATG------FPEPNPRVIEL ..:. :... :: : .... . :.. .. ..... :: : . .. CCDS22 IVCQVGRLDRGKSAILYVKSLLWTETFMNKENQNHSYSLKSSASFNVIEFPYKNLPIEDI 920 930 940 950 960 970 960 970 980 990 1000 1010 pF1KB7 NKDENVAHVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLIVLLLISYVMWKAGFFKRQYKSIL ... :. . :. : . .: ..: ::..: .. .::.. ::::: . CCDS22 TNSTLVTTNVTWGI--QPAPMPVPVWVIILAVLAGLLLLAVLVFVMYRMGFFKR-VRPPQ 980 990 1000 1010 1020 1020 1030 pF1KB7 QEENRRDSWSYINSKSNDD .:..:.. . :...:.. CCDS22 EEQEREQLQPHENGEGNSET 1030 1040 >>CCDS46471.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1002 aa) initn: 615 init1: 161 opt: 861 Z-score: 1039.7 bits: 203.9 E(32554): 1.4e-51 Smith-Waterman score: 1075; 26.9% identity (58.4% similar) in 1032 aa overlap (66-1032:19-1001) 40 50 60 70 80 90 pF1KB7 VDTESALLYQGPHNTLFGYSVVLHSHGANRWLLVGAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGK .:::::: :: .. .... : . .: .. CCDS46 MLLGTLLLILYILMLCRMFLLVGAPKAN-TTQPGIVEGGQVLKCDWSS 10 20 30 40 100 110 120 130 140 150 pF1KB7 NPGQTCEQLQLGSPNGEPCGKTC-LEERDNQWLGVTL-SRQPGENGSIVTCG--HRWKNI . . :. ... . ... .: :: ...::.:... :.: .:..:. ..:.. CCDS46 T--RRCQPIEFDATGNRDYAKDDPLEFKSHQWFGASVRSKQD----KILACAPLYHWRT- 50 60 70 80 90 100 160 170 180 190 200 210 pF1KB7 FYIKNENKLPTGGCYGVPPDLRTELSKRIAPCYQDYVKKFGENFASCQAGISSFYTK-DL .:.: . :.: :. . .: . ::: .. . :..: ::.:.: .:: : CCDS46 -EMKQE-REPVGTCF-LQDGTKT---VEYAPCRSQDIDADGQGF--CQGGFSIDFTKADR 110 120 130 140 150 220 230 240 250 pF1KB7 IVMGAPGSSYWTGSL-----------FVYNITTNKYKAFL-DKQNQVKFG-SYLGYSVGA ...:.::: :: :.: . :. . ::. : . :. : :::::::.. CCDS46 VLLGGPGSFYWQGQLISDQVAEIVSKYDPNVYSIKYNNQLATRTAQAIFDDSYLGYSVAV 160 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 310 pF1KB7 GHFRSQHTTEVVGGAPQHEQ-IGKAYIFSIDEKELNILHEMKGKKLGSYFGASVCAVDLN : : .. . :.:.:. . .: .::. : :... :... :.....::: :: :.:.: CCDS46 GDFNGDGIDDFVSGVPRAARTLGMVYIY--DGKNMSSLYNFTGEQMAAYFGFSVAATDIN 220 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 pF1KB7 ADGFSDLLVGAPM------QSTIREEGRVFVYINSGSGAVMNAMETNLVGSDKYAARFGE .: ..:...:::. .. ..: :.: : .. .:: . . :.: : . .: ::: CCDS46 GDDYADVFIGAPLFMDRGSDGKLQEVGQVSVSLQRASG---DFQTTKLNGFEVFA-RFGS 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 pF1KB7 SIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQE-DDLQGAIYIYNGRADGISSTFSQRIEGLQISKSLS- .:. :::.:.:::.:.::.:: .: .: .::.:::. :.... :: .:: ..:. CCDS46 AIAPLGDLDQDGFNDIAIAAPYGGEDKKGIVYIFNGRSTGLNAVPSQILEGQWAARSMPP 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 pF1KB7 MFGQSISGQIDADNNGYVDVAVGAFRSDSAVLLRTRPVVIVDASLS-HPESVNRTKFDCV :: :..: : :.::: :. :::: : :.: :.:::. :.:.: .: .:. . : CCDS46 SFGYSMKGATDIDKNGYPDLIVGAFGVDRAILYRARPVITVNAGLEVYPSILNQDNKTCS 390 400 410 420 430 440 490 500 510 520 530 540 pF1KB7 ENG--WPSVCIDLTLCFSYKGKEV-PGYIVLFYNMSLDVNRKAESPPR-FYFSSNGTSDV : :... .:.. :: : : . . .. :: .. . : ... : . : CCDS46 LPGTALKVSCFNVRFCLKADGKGVLPRKLNFQVELLLDKLKQKGAIRRALFLYSRSPSHS 450 460 470 480 490 500 550 560 570 580 590 600 pF1KB7 ITGSIQVSSREANCRTHQAFMR--KDVRDILTPIQIEAAYHLGPHVISKRSTEEFPPLQP . .:. .. .:. :..: .. :: :::: : :.: . :.. . ::: CCDS46 KNMTISRGGL-MQCEELIAYLRDESEFRDKLTPITIFMEYRL-----DYRTAADTTGLQP 510 520 530 540 550 560 610 620 630 640 650 660 pF1KB7 ILQQKKEKDIMKKTINFARFCAHEN-CSADLQVSAKIGFLKPHENKTYLAVGSMKTLMLN ::.: .: ... .. :...: :. :.:: . ..: : .:. . : : CCDS46 ILNQFTPANISRQA-HILLDCGEDNVCKPKLEVS-----VDSDQKKIY--IGDDNPLTLI 570 580 590 600 610 670 680 690 700 710 pF1KB7 VSLFNAGDDAYETTLHVKLPVGLYFIKILELEEK--QINCEVTDNSGVVQLDCSIGYIYV :. : :. :::. : :..:. :: ... .: ...: .. . :. :..: CCDS46 VKAQNQGEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEALARLSCAFKTENQTRQVVCDLG---- 620 630 640 650 660 720 730 740 750 760 770 pF1KB7 DHLSRIDISFL--LDVSSLSRAEEDLSITVHATCENEEEMDNLK---HSRVTVAIPLKYE . . ..: : : ...: : :. .. . .:... .: .:. : CCDS46 -NPMKAGTQLLAGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQSSNLFDKVSPVVSHKVDLAVLAAVE 670 680 690 700 710 720 780 790 800 810 820 830 pF1KB7 VKLTV---HGFVNPTSFVYGSNDENEPETCMVEKMNLTFHVINTGNSMAPNVSVEIMVPN .. . : :. .. . : :.: .. : . ... :.: : .. .... : CCDS46 IRGVSSPDHVFLPIPNWEHKENPETEEDVGPVVQH--IYELRNNGPSSFSKAMLHLQWPY 730 740 750 760 770 780 840 850 860 870 880 pF1KB7 SFSPQTDKLFNILDVQTTTGECHFENYQRVCALEQQKSAMQTLK--GIVRFLSKTD---- ... .: :. :: . : . . ... :. . :..:: . : .. : CCDS46 KYNNNT--LLYILHYDID-GPMNCTSDMEINPLRIKISSLQTTEKNDTVAGQGERDHLIT 790 800 810 820 830 840 890 900 910 920 930 pF1KB7 KRLLYCIKADPH--------CLNFLCNFGKMESGKEASVHIQLEGRPSILEMDETSALKF :: : ..: : ::...:. :... :: : .... . :.. .. CCDS46 KRDLALSEGDIHTLGCGVAQCLKIVCQVGRLDRGKSAILYVKSLLWTETFMNKENQNHSY 850 860 870 880 890 900 940 950 960 970 980 990 pF1KB7 EIRATG------FPEPNPRVIELNKDENVAHVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLI ..... :: : . ..... :. . :. : . .: ..: ::. CCDS46 SLKSSASFNVIEFPYKNLPIEDITNSTLVTTNVTWGI--QPAPMPVPVWVIILAVLAGLL 910 920 930 940 950 960 1000 1010 1020 1030 pF1KB7 VLLLISYVMWKAGFFKRQYKSILQEENRRDSWSYINSKSNDD .: .. .::.. ::::: . .:..:.. . :...:.. CCDS46 LLAVLVFVMYRMGFFKR-VRPPQEEQEREQLQPHENGEGNSET 970 980 990 1000 >>CCDS8880.1 ITGA5 gene_id:3678|Hs108|chr12 (1049 aa) initn: 663 init1: 147 opt: 837 Z-score: 1010.1 bits: 198.5 E(32554): 6.1e-50 Smith-Waterman score: 1174; 27.4% identity (59.7% similar) in 1054 aa overlap (10-1007:18-1028) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MAWEARREPGPRRAAVRETVMLLLCLGVPTGRPYNVDTESALLYQGPHNTLF :::: ..::: : .:.:.:. . .:: ...: CCDS88 MGSRTPESPLHAVQLRWGPRRRPPLLPLLLLLLPPPPRVGGFNLDAEAPAVLSGPPGSFF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 GYSVVLHSHGANRW-LLVGAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQTCEQLQLGSPNG :.:: .. :.. .::::: :: .. .:.. ::.: : : .: : : ... : .. CCDS88 GFSVEFYRPGTDGVSVLVGAPKAN-TSQPGVLQGGAVYLCPWGASPTQ-CTPIEFDSKGS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KB7 E--------PCGKTCLEERDNQWLGVTLSRQPGENGSIVTCG--HRWKNIFYIKNENKLP . :. .: .. ::.:.:. : : .::..:. . :.. :. . : CCDS88 RLLESSLSSSEGEEPVEYKSLQWFGATV-RAHG--SSILACAPLYSWRTE---KEPLSDP 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB7 TGGCYGVPPDLRTELSKRIAPCYQDYVKKFGENFASCQAGISSFYTKD-LIVMGAPGSSY .: :: . : :.. . ::: .:. :... ::.:.:. .:: .:.:.::: . CCDS88 VGTCY-LSTDNFTRILEY-APCRSDFSWAAGQGY--CQGGFSAEFTKTGRVVLGGPGSYF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 pF1KB7 WTGSLFVYN---ITTNKYKAFLDK--QNQVKF--------GSYLGYSVGAGHFRSQHTTE : :... . :. . : .: . :.:.. :::::::..:.: .. : . CCDS88 WQGQILSATQEQIAESYYPEYLINLVQGQLQTRQASSIYDDSYLGYSVAVGEFSGDDTED 230 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 320 pF1KB7 VVGGAPQHEQIGKAYIFSIDEKELNILHEMKGKKLGSYFGASVCAVDLNADGFSDLLVGA :.:.:. . . .:. .. ... :....:....:::: .: :.:.:.::..:::::: CCDS88 FVAGVPKGN-LTYGYVTILNGSDIRSLYNFSGEQMASYFGYAVAATDVNGDGLDDLLVGA 290 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 pF1KB7 PM------QSTIREEGRVFVYINSGSGAVMNAMETNLVGSDKYAARFGESIVNLGDIDND :. .. .: :::.::.. .: . . .:.: :... ::: :.. :::.:.: CCDS88 PLLMDRTPDGRPQEVGRVYVYLQHPAG-IEPTPTLTLTGHDEFG-RFGSSLTPLGDLDQD 350 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 pF1KB7 GFEDVAIGAP-QEDDLQGAIYIYNGRADGISSTFSQRIEGLQI-SKSLSMFGQSISGQID :..::::::: . ::..... : :..: :: .. : :.. ..::... : : CCDS88 GYNDVAIGAPFGGETQQGVVFVFPGGPGGLGSKPSQVLQPLWAASHTPDFFGSALRGGRD 410 420 430 440 450 460 440 450 460 470 480 490 pF1KB7 ADNNGYVDVAVGAFRSDSAVLLRTRPVVIVDASLS-HPESVNRTKFDCVENGWPSVCIDL :.::: :. ::.: :.::. : ::.: ..:::. : : . .: .: : .::.: CCDS88 LDGNGYPDLIVGSFGVDKAVVYRGRPIVSASASLTIFPAMFNPEERSCSLEGNPVACINL 470 480 490 500 510 520 500 510 520 530 540 550 pF1KB7 TLCFSYKGKEVPGYIVLFYNMSLDVNRKAESPPR-FYFSSNGTSDVITGSIQVSSREANC ..:.. .::.: : . ...:: ... . : ....: .. . : :: ..:: .: CCDS88 SFCLNASGKHVADSIGFTVELQLDWQKQKGGVRRALFLASRQATLTQTLLIQNGARE-DC 530 540 550 560 570 580 560 570 580 590 600 610 pF1KB7 RTHQAFMRKD--VRDILTPIQIEAAYHLGPHVISKRSTEEFPPLQPILQQKKEKDIMKKT : . ..:.. :: :.::.: . : :. . . :.: :. .... : :. CCDS88 REMKIYLRNESEFRDKLSPIHIALNFSLDPQ-----APVDSHGLRPALHYQSKSRIEDKA 590 600 610 620 630 620 630 640 650 660 670 pF1KB7 INFARFCAHEN-CSADLQVSAKIGFLKPHENKTYLAVGSMKTLMLNVSLFNAGDD-AYET . :...: : :::. . .: ..:..:: :. ..: :. :.:. :::. CCDS88 QILLD-CGEDNICVPDLQLEV-FG----EQNHVYL--GDKNALNLTFHAQNVGEGGAYEA 640 650 660 670 680 690 680 690 700 710 720 730 pF1KB7 TLHVKLPVGLYFIKILEL--EEKQINCEVTDNSGVVQLDCSIGYIYVDHLSRIDISFLLD :.: : . ... . ....:. . : :..: . : .. . CCDS88 ELRVTAPPEAEYSGLVRHPGNFSSLSCDYFAVNQSRLLVCDLGNPMKAGASLWG-GLRFT 700 710 720 730 740 750 740 750 760 770 780 790 pF1KB7 VSSLSRAEEDLSITVHATCENEEEMDNLKHSRVTVAIPLKYEVKLTVHGFVNPTSFVYGS : : ... ... . .: ..: . . :. . .. ....:..: .: . .. CCDS88 VPHLRDTKKTIQFDFQILSKN---LNNSQSDVVSFRLSVEAQAQVTLNGVSKPEAVLFPV 760 770 780 790 800 800 810 820 830 840 pF1KB7 ND---ENEP--ETCMVEKMNLTFHVINTGNSMAPNVSVEIMVPNSFSPQTDKLFNILDVQ .: ...: : . .. ....:: : : . .:. :... : ..: : CCDS88 SDWHPRDQPQKEEDLGPAVHHVYELINQGPSSISQGVLELSCPQALEGQ-----QLLYVT 810 820 830 840 850 860 850 860 870 880 890 900 pF1KB7 TTTG-ECHFENYQRVCALEQQKSA----MQTLKGIVRFLSKTDKRLLYCIKADPHCLNFL .:: .: .. .:: . . .: .. : ... ..: : .:. :. . CCDS88 RVTGLNCTTNHPINPKGLELDPEGSLHHQQKREAPSRSSASSGPQILKCPEAE--CFRLR 870 880 890 900 910 920 910 920 930 940 950 pF1KB7 CNFGKMESGKEASV--HIQLEGRPSILEMDETSALKFEIRATGFPEPN---PRVIELNKD :..: ... . :. :... .. . . . .:. : .. : :: . .:. CCDS88 CELGPLHQQESQSLQLHFRVWAKTFLQREHQPFSLQCEAVYKALKMPYRILPRQLP-QKE 930 940 950 960 970 960 970 980 990 1000 1010 pF1KB7 ENVAHVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLIVLLLISYVMWKAGFFKRQYKSILQEE ..:: .. . . . . :: ..:.::..: :. :...: ::::: CCDS88 RQVATAV--QWTKAEGSYGVPLWIIILAILFGLLLLGLLIYILYKLGFFKRSLPYGTAME 980 990 1000 1010 1020 1030 1020 1030 pF1KB7 NRRDSWSYINSKSNDD CCDS88 KAQLKPPATSDA 1040 >>CCDS46470.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1012 aa) initn: 581 init1: 161 opt: 817 Z-score: 986.0 bits: 194.0 E(32554): 1.3e-48 Smith-Waterman score: 1040; 26.3% identity (57.3% similar) in 1087 aa overlap (1-1032:1-1011) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MAWEARREPGPRRAAVRETVMLLLCLGVPTGRPYNVDTESALLYQGPHNTLFGYSV--VL ::. ::. : . : .:: : .: : .:.:..: :.::... ::..: . CCDS46 MAFPPRRR---LRLGPRGLPLLLSGLLLPLCRAFNLDVDSPAEYSGPEGSYFGFAVDFFV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 HSHGANRWLLVGAPTANWLANASVINPGAIYRCRIGKNPGQTCEQLQLGSPNGEPCGKTC : .. .:::::: :: .. .... : . .: ... . :. ... . ... .: CCDS46 PSASSRMFLLVGAPKAN-TTQPGIVEGGQVLKCDWSST--RRCQPIEFDATGNRDYAKDD 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 -LEERDNQWLGVTL-SRQPGENGSIVTCG--HRWKNIFYIKNENKLPTGGCYGVPPDLRT :: ...::.:... :.: .:..:. ..:.. .:.: . :.: :. CCDS46 PLEFKSHQWFGASVRSKQD----KILACAPLYHWRT--EMKQERE-PVGTCF-------- 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 ELSKRIAPCYQDYVKKFGENFASCQA-GISSFYTKDLIVMGAPGSSYWTGSLFVYNITTN :: .: ..: :.. . : . ... :. ::.: : CCDS46 ---------LQDGTKTV--EYAPCRSRQLISDQVAEIVSKYDPN---------VYSIKYN 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 KYKAFLDKQNQVKFG-SYLGYSVGAGHFRSQHTTEVVGGAPQHEQ-IGKAYIFSIDEKEL . : . :. : :::::::..: : .. . :.:.:. . .: .::. : :.. CCDS46 NQLA--TRTAQAIFDDSYLGYSVAVGDFNGDGIDDFVSGVPRAARTLGMVYIY--DGKNM 200 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 pF1KB7 NILHEMKGKKLGSYFGASVCAVDLNADGFSDLLVGAPM------QSTIREEGRVFVYINS . :... :.....::: :: :.:.:.: ..:...:::. .. ..: :.: : .. CCDS46 SSLYNFTGEQMAAYFGFSVAATDINGDDYADVFIGAPLFMDRGSDGKLQEVGQVSVSLQR 260 270 280 290 300 310 350 360 370 380 390 400 pF1KB7 GSGAVMNAMETNLVGSDKYAARFGESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQE-DDLQGAIYIYN .:: . . :.: : . .: ::: .:. :::.:.:::.:.::.:: .: .: .::.: CCDS46 ASG---DFQTTKLNGFEVFA-RFGSAIAPLGDLDQDGFNDIAIAAPYGGEDKKGIVYIFN 320 330 340 350 360 370 410 420 430 440 450 460 pF1KB7 GRADGISSTFSQRIEGLQISKSLS-MFGQSISGQIDADNNGYVDVAVGAFRSDSAVLLRT ::. :.... :: .:: ..:. :: :..: : :.::: :. :::: : :.: :. CCDS46 GRSTGLNAVPSQILEGQWAARSMPPSFGYSMKGATDIDKNGYPDLIVGAFGVDRAILYRA 380 390 400 410 420 430 470 480 490 500 510 pF1KB7 RPVVIVDASLS-HPESVNRTKFDCVENG--WPSVCIDLTLCFSYKGKEV-PGYIVLFYNM :::. :.:.: .: .:. . : : :... .:.. :: : : . . .. CCDS46 RPVITVNAGLEVYPSILNQDNKTCSLPGTALKVSCFNVRFCLKADGKGVLPRKLNFQVEL 440 450 460 470 480 490 520 530 540 550 560 570 pF1KB7 SLDVNRKAESPPR-FYFSSNGTSDVITGSIQVSSREANCRTHQAFMR--KDVRDILTPIQ :: .. . : ... : . : . .:. .. .:. :..: .. :: :::: CCDS46 LLDKLKQKGAIRRALFLYSRSPSHSKNMTISRGGL-MQCEELIAYLRDESEFRDKLTPIT 500 510 520 530 540 550 580 590 600 610 620 630 pF1KB7 IEAAYHLGPHVISKRSTEEFPPLQPILQQKKEKDIMKKTINFARFCAHEN-CSADLQVSA : :.: . :.. . :::::.: .: ... .. :...: :. :.:: CCDS46 IFMEYRL-----DYRTAADTTGLQPILNQFTPANISRQA-HILLDCGEDNVCKPKLEVS- 560 570 580 590 600 640 650 660 670 680 690 pF1KB7 KIGFLKPHENKTYLAVGSMKTLMLNVSLFNAGDDAYETTLHVKLPVGLYFIKILELEEK- . ..: : .:. . : : :. : :. :::. : :..:. :: ... .: CCDS46 ----VDSDQKKIY--IGDDNPLTLIVKAQNQGEGAYEAELIVSIPLQADFIGVVRNNEAL 610 620 630 640 650 700 710 720 730 740 750 pF1KB7 -QINCEVTDNSGVVQLDCSIGYIYVDHLSRIDISFL--LDVSSLSRAEEDLSITVHATCE ...: .. . :. :..: . . ..: : : ...: : :. . CCDS46 ARLSCAFKTENQTRQVVCDLGNPM-----KAGTQLLAGLRFSVHQQSEMDTSVKFDLQIQ 660 670 680 690 700 710 760 770 780 790 800 pF1KB7 NEEEMDNLK---HSRVTVAIPLKYEVKLTV---HGFVNPTSFVYGSNDENEPETCMVEKM . . .:... .: .:. :.. . : :. .. . : :.: .. : . CCDS46 SSNLFDKVSPVVSHKVDLAVLAAVEIRGVSSPDHVFLPIPNWEHKENPETEEDVGPV--V 720 730 740 750 760 770 810 820 830 840 850 860 pF1KB7 NLTFHVINTGNSMAPNVSVEIMVPNSFSPQTDKLFNILDVQTTTGECHFENYQRVCALEQ . ... :.: : .. .... : ... .: :. :: . : . . ... :. CCDS46 QHIYELRNNGPSSFSKAMLHLQWPYKYNNNT--LLYILHYDID-GPMNCTSDMEINPLRI 780 790 800 810 820 870 880 890 900 910 pF1KB7 QKSAMQTLK--GIVRFLSKTD----KRLLYCIKADPH--------CLNFLCNFGKMESGK . :..:: . : .. : :: : ..: : ::...:. :... :: CCDS46 KISSLQTTEKNDTVAGQGERDHLITKRDLALSEGDIHTLGCGVAQCLKIVCQVGRLDRGK 830 840 850 860 870 880 920 930 940 950 960 pF1KB7 EASVHIQLEGRPSILEMDETSALKFEIRATG------FPEPNPRVIELNKDENVAHVLLE : .... . :.. .. ..... :: : . ..... :. . CCDS46 SAILYVKSLLWTETFMNKENQNHSYSLKSSASFNVIEFPYKNLPIEDITNSTLVTTNVTW 890 900 910 920 930 940 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KB7 GLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLIVLLLISYVMWKAGFFKRQYKSILQEENRRDSWSYI :. : . .: ..: ::..: .. .::.. ::::: . .:..:.. . CCDS46 GI--QPAPMPVPVWVIILAVLAGLLLLAVLVFVMYRMGFFKR-VRPPQEEQEREQLQPHE 950 960 970 980 990 1000 1030 pF1KB7 NSKSNDD :...:.. CCDS46 NGEGNSET 1010 >>CCDS45461.1 ITGAL gene_id:3683|Hs108|chr16 (1086 aa) initn: 572 init1: 196 opt: 803 Z-score: 968.5 bits: 190.9 E(32554): 1.3e-47 Smith-Waterman score: 826; 26.9% identity (58.0% similar) in 872 aa overlap (171-1014:239-1042) 150 160 170 180 190 pF1KB7 IVTCGHRWKNIFYIKNENKLPTGGCYGVPPDLRTELSKRI----APCYQDYVKKFGENFA :: :::.:.: . :: . .:. ... CCDS45 TKESQETLHKFASKPASEFVKILDTFEKLKDLFTELQKKIYVIEGTSKQD-LTSFNMELS 210 220 230 240 250 260 200 210 220 230 240 250 pF1KB7 SCQAGISSFYTKDLIVMGAPGSSYWTGSLFVYNITTNKYKAFLDKQN---QVKFGSYLGY : .:::. .. :.:: :.. :.:. :. . . .:. .. .:. : :::: CCDS45 S--SGISADLSRGHAVVGAVGAKDWAGG-FLDLKADLQDDTFIGNEPLTPEVRAG-YLGY 270 280 290 300 310 320 260 270 280 290 300 310 pF1KB7 SVGAGHFRSQHTTEVVGGAPQHEQIGKAYIFSIDEK--ELNILHEMKGKKLGSYFGASVC .: : :.:. ...:::.....:.. .:. . . . .. ..: ..:::::. .: CCDS45 TVTWLPSR-QKTSLLASGAPRYQHMGRVLLFQEPQGGGHWSQVQTIHGTQIGSYFGGELC 330 340 350 360 370 380 320 330 340 350 360 pF1KB7 AVDLNADGFSDLL-VGAPMQSTIREEGRVFVYINSGSGAVMNAMETNLVGSDKYA-ARFG .::.. :: ..:: .:::. .. ::::.: : ..: :. : .::: CCDS45 GVDVDQDGETELLLIGAPLFYGEQRGGRVFIYQRRQLGF---EEVSELQGDPGYPLGRFG 390 400 410 420 430 370 380 390 400 410 420 pF1KB7 ESIVNLGDIDNDGFEDVAIGAPQEDDLQGAIYIYNGRADGISSTFSQRIEGLQISKSLSM :.:. : ::..::. :::.::: :. :::.::.::: :.: :::::: :. .... CCDS45 EAITALTDINGDGLVDVAVGAPLEE--QGAVYIFNGRHGGLSPQPSQRIEGTQVLSGIQW 440 450 460 470 480 490 430 440 450 460 470 480 pF1KB7 FGQSISGQIDADNNGYVDVAVGAFRSDSAVLLRTRPVVIVDASLSH-PESVNRTKFDCVE ::.:: : : ...: .:::::: .. ..: .:::: . . .: : . . .: CCDS45 FGRSIHGVKDLEGDGLADVAVGA--ESQMIVLSSRPVVDMVTLMSFSPAEIPVHEVECSY 500 510 520 530 540 550 490 500 510 520 530 540 pF1KB7 NGWPSVC--IDLTLCFSYKG--KEVPGYIV--LFYNMSLDVNRKAESPPRFYFSSNGTSD . .. ...:.::. :. . : .: : :...:: .: . : : : CCDS45 STSNKMKEGVNITICFQIKSLIPQFQGRLVANLTYTLQLDGHRTRR---RGLFP--GGRH 560 570 580 590 600 610 550 560 570 580 590 600 pF1KB7 VITGSIQVSSREANCRTHQAFMRKDVRDILTPIQIEAAYHLGPHVISKRSTEEFPPLQPI . .: :.. .: . . :.:...::.. . : . . :. . . :: CCDS45 ELRRNIAVTTS-MSCTDFSFHFPVCVQDLISPINVSLNFSLWEEEGTPRDQRAGKDIPPI 620 630 640 650 660 610 620 630 640 650 660 pF1KB7 LQQKKEKDIMKKTINFARFCAHEN-CSADLQVSAKIGFLKPHENKTYLAVGSMKTLMLNV :. . ... . : : . :.... : :.:.:: ..: .... : . .. .: ... CCDS45 LRPSLHSETWE--IPFEKNCGEDKKCEANLRVS-----FSPARSRA-LRLTAFASLSVEL 670 680 690 700 710 720 670 680 690 700 710 pF1KB7 SLFNAGDDAYETTLHVKLPVGLYFIKILELEEKQ---INCE-VTDNSGVVQ--LDCSIGY :: : .::: . : ...: :: : :. :. .. ..:: . ..: ... :.:... CCDS45 SLSNLEEDAYWVQLDLHFPPGLSFRKVEMLKPHSQIPVSCEELPEESRLLSRALSCNVSS 730 740 750 760 770 780 720 730 740 750 760 770 pF1KB7 IYVDHLSRIDISFLLDVSSLSRAEEDLSITVHA--TCENEEEMDNLKHSRVTVAIPLKYE . ...... .: . :. .:: ::.::. : :. . .:. ::. : CCDS45 PIFKAGHSVALQMMFN--TLVNSSWGDSVELHANVTCNNEDS-DLLEDNSATTIIPILYP 790 800 810 820 830 780 790 800 810 820 830 pF1KB7 VKLTVHGFVNPTSFVYGSNDENEPETCMVEKMNLTFHVINTGNSMAPNVSVEIMVPNSFS ... .. . : .: : . :. .:..: . . . :.. . . ::. CCDS45 INILIQD--QEDSTLYVSFTPKGPKIHQVKHMYQVRIQPSIHDHNIPTLEAVVGVPQ--P 840 850 860 870 880 890 840 850 860 870 880 890 pF1KB7 PQTDKLFNILDVQTTTG-ECHFENYQRVCALEQQKSAMQTLKGIVRFLSKTDKRLLYCIK :. . . .:: ::.:. .:. .: : : . : . : .. CCDS45 PSEGPITHQWSVQMEPPVPCHYEDLERL-----PDAAEPCLPGAL-FRCPVVFRQEILVQ 900 910 920 930 940 900 910 920 930 940 950 pF1KB7 ADPHCLNFLCNFGKMESGKEASVHIQLEGRPSILEMDETSALKFEIRATGFPEPNPRVIE . .. : :..: :: ..: : : .. .:. .:.. .. CCDS45 V----IGTLELVGEIE----ASSMFSLC---SSLSISFNSSKHFHLYGS----------- 950 960 970 980 960 970 980 990 1000 1010 pF1KB7 LNKDENVAHVLLEGLHHQRPKRYFTIVIISSSLLLGLIVLLLISYVMWKAGFFKRQYKSI . ..:.:... . :... . ..:. . ::..:::: :..:.:::::. : CCDS45 ---NASLAQVVMK-VDVVYEKQMLYLYVLSG--IGGLLLLLLIFIVLYKVGFFKRNLKEK 990 1000 1010 1020 1030 1040 1020 1030 pF1KB7 LQEENRRDSWSYINSKSNDD .. CCDS45 MEAGRGVPNGIPAEDSEQLASGQEAGDPGCLKPLHEKDSESGGGKD 1050 1060 1070 1080 >>CCDS31155.1 ITGA8 gene_id:8516|Hs108|chr10 (1063 aa) initn: 662 init1: 136 opt: 798 Z-score: 962.5 bits: 189.7 E(32554): 2.7e-47 Smith-Waterman score: 1240; 27.0% identity (59.6% similar) in 1078 aa overlap (22-1029:27-1060) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MAWEARREPGPRRAAVRETVMLLLCLGVPTGRPYNVDTESALLYQGPHNTLFGYS : . : :. . .:.:.:. .:.::... :::. 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