FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7339, 833 aa 1>>>pF1KB7339 833 - 833 aa - 833 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.0332+/-0.00049; mu= -24.5867+/- 0.031 mean_var=721.4594+/-151.036, 0's: 0 Z-trim(123.0): 1381 B-trim: 0 in 0/62 Lambda= 0.047749 statistics sampled from 40084 (41945) to 40084 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.777), E-opt: 0.2 (0.492), width: 16 Scan time: 14.300 The best scores are: opt bits E(85289) NP_009112 (OMIM: 601983) mitogen-activated protein ( 833) 5690 408.0 9.2e-113 NP_001036065 (OMIM: 601983) mitogen-activated prot ( 821) 5465 392.5 4.2e-108 XP_016881720 (OMIM: 601983) PREDICTED: mitogen-act ( 860) 3096 229.3 5.8e-59 XP_011524705 (OMIM: 601983) PREDICTED: mitogen-act ( 873) 3096 229.3 5.9e-59 XP_011524706 (OMIM: 601983) PREDICTED: mitogen-act ( 861) 2871 213.8 2.7e-54 NP_004570 (OMIM: 603166) mitogen-activated protein ( 820) 1765 137.6 2.3e-31 XP_011534679 (OMIM: 604923) PREDICTED: mitogen-act ( 845) 1689 132.3 8.7e-30 XP_006720076 (OMIM: 604923) PREDICTED: mitogen-act ( 846) 1689 132.3 8.7e-30 NP_006566 (OMIM: 604923) mitogen-activated protein ( 846) 1689 132.3 8.7e-30 NP_942089 (OMIM: 604923) mitogen-activated protein ( 846) 1689 132.3 8.7e-30 XP_011543505 (OMIM: 603166) PREDICTED: mitogen-act ( 797) 1595 125.8 7.4e-28 XP_011534680 (OMIM: 604923) PREDICTED: mitogen-act ( 779) 1464 116.8 3.8e-25 NP_003609 (OMIM: 604921) mitogen-activated protein ( 894) 1427 114.3 2.4e-24 NP_001257354 (OMIM: 604921) mitogen-activated prot ( 873) 1423 114.0 2.9e-24 XP_016873585 (OMIM: 603166) PREDICTED: mitogen-act ( 584) 1350 108.8 7.1e-23 NP_001294919 (OMIM: 603166) mitogen-activated prot ( 812) 1333 107.8 2e-22 XP_011534681 (OMIM: 604923) PREDICTED: mitogen-act ( 710) 1101 91.8 1.2e-17 XP_016873583 (OMIM: 603166) PREDICTED: mitogen-act ( 643) 975 83.1 4.6e-15 XP_011534682 (OMIM: 604923) PREDICTED: mitogen-act ( 557) 962 82.1 7.7e-15 XP_016883522 (OMIM: 604965,614868) PREDICTED: seri ( 388) 861 75.0 7.3e-13 XP_011527322 (OMIM: 604965,614868) PREDICTED: seri ( 404) 861 75.0 7.6e-13 XP_005260590 (OMIM: 604965,614868) PREDICTED: seri ( 462) 861 75.1 8.3e-13 XP_005260588 (OMIM: 604965,614868) PREDICTED: seri ( 478) 861 75.1 8.5e-13 NP_006273 (OMIM: 604965,614868) serine/threonine-p ( 487) 861 75.1 8.6e-13 XP_005260587 (OMIM: 604965,614868) PREDICTED: seri ( 503) 861 75.1 8.8e-13 XP_011508795 (OMIM: 602255) PREDICTED: serine/thre ( 376) 836 73.3 2.4e-12 XP_011508798 (OMIM: 602255) PREDICTED: serine/thre ( 334) 833 73.0 2.5e-12 NP_057626 (OMIM: 300547) serine/threonine-protein ( 416) 836 73.3 2.5e-12 NP_001258907 (OMIM: 602255) serine/threonine-prote ( 426) 836 73.3 2.6e-12 NP_006365 (OMIM: 602255) serine/threonine-protein ( 426) 836 73.3 2.6e-12 NP_001258906 (OMIM: 602255) serine/threonine-prote ( 426) 836 73.3 2.6e-12 XP_016858658 (OMIM: 602255) PREDICTED: serine/thre ( 365) 829 72.8 3.2e-12 XP_016858657 (OMIM: 602255) PREDICTED: serine/thre ( 365) 829 72.8 3.2e-12 XP_016869247 (OMIM: 605030) PREDICTED: serine/thre ( 456) 828 72.8 4e-12 NP_006272 (OMIM: 605030) serine/threonine-protein ( 491) 828 72.8 4.2e-12 NP_001027467 (OMIM: 604984) serine/threonine-prote ( 431) 826 72.6 4.2e-12 NP_003567 (OMIM: 604984) serine/threonine-protein ( 443) 826 72.6 4.3e-12 NP_001243241 (OMIM: 605030) serine/threonine-prote ( 519) 828 72.8 4.4e-12 XP_011515553 (OMIM: 605030) PREDICTED: serine/thre ( 522) 828 72.8 4.4e-12 XP_016869246 (OMIM: 605030) PREDICTED: serine/thre ( 524) 828 72.8 4.4e-12 XP_016876284 (OMIM: 604984) PREDICTED: serine/thre ( 474) 826 72.7 4.5e-12 XP_011515550 (OMIM: 605030) PREDICTED: serine/thre ( 576) 828 72.9 4.7e-12 XP_016869245 (OMIM: 605030) PREDICTED: serine/thre ( 580) 828 72.9 4.7e-12 XP_016876283 (OMIM: 604984) PREDICTED: serine/thre ( 517) 826 72.7 4.8e-12 NP_001155038 (OMIM: 610005,617028) TRAF2 and NCK-i (1268) 838 73.9 5.1e-12 NP_001155037 (OMIM: 610005,617028) TRAF2 and NCK-i (1276) 838 73.9 5.2e-12 NP_001155036 (OMIM: 610005,617028) TRAF2 and NCK-i (1297) 838 73.9 5.2e-12 NP_001155035 (OMIM: 610005,617028) TRAF2 and NCK-i (1305) 838 73.9 5.3e-12 NP_001155034 (OMIM: 610005,617028) TRAF2 and NCK-i (1323) 838 73.9 5.3e-12 NP_001155033 (OMIM: 610005,617028) TRAF2 and NCK-i (1331) 838 73.9 5.3e-12 >>NP_009112 (OMIM: 601983) mitogen-activated protein kin (833 aa) initn: 5690 init1: 5690 opt: 5690 Z-score: 2145.4 bits: 408.0 E(85289): 9.2e-113 Smith-Waterman score: 5690; 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XP_011 PRDLRSSSPRKQLSESSDDDYDDVDMLNLGTWKSPKDQILSPRSRPNSQPRPPYSPAHRP 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 440 pF1KB7 ------PTPAEDTPPPLPPKPKFRSPSDEGPGSMGDDGQLSPGVLVRCASGPPPNSPRPG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 SQAPSSPTPAEDTPPPLPPKPKFRSPSDEGPGSMGDDGQLSPGVLVRCASGPPPNSPRPG 430 440 450 460 470 480 450 460 470 480 490 500 pF1KB7 PPPSTSSPHLTAHSEPSLWNPPSRELDKPPLLPPKKEKMKRKGCALLVKLFNGCPLRIHS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 PPPSTSSPHLTAHSEPSLWNPPSRELDKPPLLPPKKEKMKRKGCALLVKLFNGCPLRIHS 490 500 510 520 530 540 510 520 530 540 550 560 pF1KB7 TAAWTHPSTKDQHLLLGAEEGIFILNRNDQEATLEMLFPSRTTWVYSINNVLMSLSGKTP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 TAAWTHPSTKDQHLLLGAEEGIFILNRNDQEATLEMLFPSRTTWVYSINNVLMSLSGKTP 550 560 570 580 590 600 570 580 590 600 610 620 pF1KB7 HLYSHSILGLLERKETRAGNPIAHISPHRLLARKNMVSTKIQDTKGCRACCVAEGASSGG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 HLYSHSILGLLERKETRAGNPIAHISPHRLLARKNMVSTKIQDTKGCRACCVAEGASSGG 610 620 630 640 650 660 630 640 650 660 670 680 pF1KB7 PFLCGALETSVVLLQWYQPMNKFLLVRQVLFPLPTPLSVFALLTGPGSELPAVCIGVSPG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 PFLCGALETSVVLLQWYQPMNKFLLVRQVLFPLPTPLSVFALLTGPGSELPAVCIGVSPG 670 680 690 700 710 720 690 700 710 720 730 740 pF1KB7 RPGKSVLFHTVRFGALSCWLGEMSTEHRGPVQVTQVEEDMVMVLMDGSVKLVTPEGSPVR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 RPGKSVLFHTVRFGALSCWLGEMSTEHRGPVQVTQVEEDMVMVLMDGSVKLVTPEGSPVR 730 740 750 760 770 780 750 760 770 780 790 800 pF1KB7 GLRTPEIPMTEAVEAVAMVGGQLQAFWKHGVQVWALGSDQLLQELRDPTLTFRLLGSPRL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 GLRTPEIPMTEAVEAVAMVGGQLQAFWKHGVQVWALGSDQLLQELRDPTLTFRLLGSPRP 790 800 810 820 830 840 810 820 830 pF1KB7 ECSGTISPHCNLLLPGSSNSPASASRVAGITGL XP_011 VVVETRPVDDPTAPSNLYIQE 850 860 >>NP_004570 (OMIM: 603166) mitogen-activated protein kin (820 aa) initn: 2019 init1: 1270 opt: 1765 Z-score: 684.2 bits: 137.6 E(85289): 2.3e-31 Smith-Waterman score: 2172; 44.4% identity (68.9% similar) in 850 aa overlap (7-820:6-819) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MDVVDPDIFNRDPRDHYDLLQRLGGGTYGEVFKARDKVSGDLVALKMVKMEPDDDVSTLQ :. .::::...::::.:.::::.:.:::: :...:.:.:.::..: ::.:.:: NP_004 MALLRDVSLQDPRDRFELLQRVGAGTYGDVYKARDTVTSELAAVKIVKLDPGDDISSLQ 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 KEILILKTCRHANIVAYHGSYLWLQKLWICMEFCGAGSLQDIYQVTGSLSELQISYVCRE .:: ::. ::: :.::: :::: ..:::::::::.::::.::..:: : : ::.::::: NP_004 QEITILRECRHPNVVAYIGSYLRNDRLWICMEFCGGGSLQEIYHATGPLEERQIAYVCRE 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 VLQGLAYLHSQKKIHRDIKGANILINDAGEVRLADFGISAQIGATLARRLSFIGTPYWMA .:.:: .:::: ::::::::::.:.. :.:.:::::.:... :..:.: :::::::::: NP_004 ALKGLHHLHSQGKIHRDIKGANLLLTLQGDVKLADFGVSGELTASVAKRRSFIGTPYWMA 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 PEVAAVALKGGYNELCDIWSLGITAIELAELQPPLFDVHPLRVLFLMTKSGYQPPRLKEK :::::: :::::::::.:.::::::::.::::::: .::.:.:.::.::..:::.:..: NP_004 PEVAAVERKGGYNELCDVWALGITAIELGELQPPLFHLHPMRALMLMSKSSFQPPKLRDK 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 pF1KB7 GKWSAAFHNFIKVTLTKSPKKRPSATKMLSHQLVSQPGLNRGLILDLLDKLKNPGKG-PS .:. ::.:.:..:::.:::::.: :.:.: ...: : :.:. .:::: ..: : :: NP_004 TRWTQNFHHFLKLALTKNPKKRPTAEKLLQHPFTTQQ-LPRALLTQLLDKASDPHLGTPS 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 IGDIEDEEPELPPAIPRRIRSTHRSSSLGIPDADCCRRHMEFRKLRGMETRP---PANTA :: : : .: :.: . . .. ....: : :: : : . NP_004 P---EDCELETYDMFPDTIHSRGQHGPAERTPSEIQFHQVKFGAPRRKETDPLNEPWEEE 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KB7 -RLQPPRDLRSS---SPRKQLSESS-----DDDYDDVDIPTPAEDT---PPPLPPKPKFR : ..: .: : .. : : : ......: : . : : : : : NP_004 WTLLGKEELSGSLLQSVQEALEERSLTIRSASEFQELDSPDDTMGTIKRAPFLGPLP--T 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KB7 SPSDEGPGSMGDDGQLSPGVLVRCASGPPPNSPRPGPPPSTSSPHLTAHSEPSLWNPPSR .: : : : ::.: ::: : :: .::: : :. : .. NP_004 DPPAEEPLSS------PPGTL------PPPPS---GP---NSSPLL-----PTAWATMKQ 420 430 440 450 470 480 490 500 510 pF1KB7 ELDKPPL-----LPPKKEKMKRKGCALLVKLFNGCPLRIHSTAAWTHPSTKDQHLLLGAE . : : ::: :.. .: . :.:::::::::....: :: :.:: :..::: NP_004 RED-PERSSCHGLPPTP-KVHMGAC--FSKVFNGCPLRIHAAVTWIHPVTRDQFLVVGAE 460 470 480 490 500 520 530 540 550 560 570 pF1KB7 EGIFILNRND-QEATLEMLFPSRTTWVYSINNVLMSLSGKTPHLYSHSILGLLERKETRA :::. :: .. .: ::: :. : .:.: .::::.:::::. :...:.. ::.:... . NP_004 EGIYTLNLHELHEDTLEKLISHRCSWLYCVNNVLLSLSGKSTHIWAHDLPGLFEQRRLQQ 510 520 530 540 550 560 580 590 600 610 620 630 pF1KB7 GNPIAHIS---PHRLLARKNMVSTKIQDTKGCRACCVAEGASSGGPFLCGALETSVVLLQ :.. . .:.. :. .:::: ::::: : :... .:. :: .:: ::..::: NP_004 QVPLSIPTNRLTQRIIPRRFALSTKIPDTKGCLQCRVVRNPYTGATFLLAALPTSLLLLQ 570 580 590 600 610 620 640 650 660 670 680 690 pF1KB7 WYQPMNKFLLVRQVLFPLPTPLSVFALLTGPGSELPAVCIGV-SPGRPGKSVLFHTVRFG ::.:..::::... :::.: ... :. :.::: ::.:. .: :: ::::.. . NP_004 WYEPLQKFLLLKNFSSPLPSPAGMLEPLVLDGKELPQVCVGAEGPEGPGCRVLFHVLPLE 630 640 650 660 670 680 700 710 720 730 740 750 pF1KB7 ALSCWLGEMSTEHRG-P---VQVTQVEEDMVMVLMDGSVKLVTPEGSPVRGLRTPEIPMT : .. .: : :: ::..: ..: .. :..:. .: :. : .::. . NP_004 A--GLTPDILIPPEGIPGSAQQVIQVDRDTILVSFERCVRIVNMQGEPTATL-APELTFD 690 700 710 720 730 740 760 770 780 790 800 pF1KB7 EAVEAVAMVGGQLQAFWKHGVQVWALGSDQLLQELRDPTLTFRLLGSPR---LECSGTIS .:.:. . .. :::.::.: .: .... ::. : : ::.::. : :: : . 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