FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7344, 1049 aa 1>>>pF1KB7344 1049 - 1049 aa - 1049 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5653+/-0.00122; mu= 11.9088+/- 0.074 mean_var=153.6318+/-32.183, 0's: 0 Z-trim(106.6): 191 B-trim: 75 in 1/50 Lambda= 0.103475 statistics sampled from 8888 (9085) to 8888 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.616), E-opt: 0.2 (0.279), width: 16 Scan time: 4.130 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11896.1 DSG1 gene_id:1828|Hs108|chr18 (1049) 6963 1052.6 0 CCDS11897.1 DSG4 gene_id:147409|Hs108|chr18 (1040) 2018 314.4 8.3e-85 CCDS45845.1 DSG4 gene_id:147409|Hs108|chr18 (1059) 2018 314.4 8.4e-85 CCDS11898.1 DSG3 gene_id:1830|Hs108|chr18 ( 999) 1807 282.8 2.4e-75 CCDS42423.1 DSG2 gene_id:1829|Hs108|chr18 (1118) 1302 207.5 1.3e-52 CCDS32810.1 DSC3 gene_id:1825|Hs108|chr18 ( 896) 852 140.2 1.8e-32 CCDS77172.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18 ( 875) 848 139.6 2.7e-32 CCDS11891.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18 ( 906) 848 139.7 2.8e-32 CCDS11893.1 DSC2 gene_id:1824|Hs108|chr18 ( 847) 839 138.3 6.8e-32 CCDS11892.1 DSC2 gene_id:1824|Hs108|chr18 ( 901) 839 138.3 7.1e-32 CCDS10869.1 CDH1 gene_id:999|Hs108|chr16 ( 882) 824 136.1 3.3e-31 CCDS10868.1 CDH3 gene_id:1001|Hs108|chr16 ( 829) 814 134.6 8.9e-31 CCDS58784.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20 ( 842) 811 134.1 1.2e-30 CCDS13488.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20 ( 916) 811 134.1 1.3e-30 CCDS11895.1 DSC1 gene_id:1823|Hs108|chr18 ( 840) 752 125.3 5.5e-28 CCDS11894.1 DSC1 gene_id:1823|Hs108|chr18 ( 894) 752 125.3 5.7e-28 CCDS10976.1 CDH15 gene_id:1013|Hs108|chr16 ( 814) 746 124.4 9.9e-28 CCDS82004.1 CDH3 gene_id:1001|Hs108|chr16 ( 784) 741 123.6 1.6e-27 CCDS13485.1 CDH26 gene_id:60437|Hs108|chr20 ( 832) 704 118.1 7.8e-26 CCDS58486.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 ( 713) 690 116.0 2.9e-25 CCDS58485.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 ( 760) 690 116.0 3.1e-25 CCDS58487.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 ( 674) 681 114.6 7.1e-25 CCDS3890.1 CDH12 gene_id:1010|Hs108|chr5 ( 794) 593 101.5 7.3e-21 CCDS54835.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5 ( 574) 568 97.7 7.5e-20 CCDS75229.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5 ( 575) 568 97.7 7.6e-20 CCDS3889.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5 ( 790) 568 97.8 9.7e-20 CCDS11977.1 CDH20 gene_id:28316|Hs108|chr18 ( 801) 562 96.9 1.8e-19 CCDS3894.1 CDH6 gene_id:1004|Hs108|chr5 ( 790) 550 95.1 6.2e-19 CCDS81993.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16 ( 693) 543 94.0 1.2e-18 CCDS10803.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16 ( 796) 543 94.1 1.3e-18 CCDS9586.1 CDH24 gene_id:64403|Hs108|chr14 ( 781) 532 92.4 4e-18 CCDS9585.1 CDH24 gene_id:64403|Hs108|chr14 ( 819) 532 92.5 4.1e-18 CCDS3892.1 CDH10 gene_id:1008|Hs108|chr5 ( 788) 531 92.3 4.4e-18 CCDS82005.1 CDH1 gene_id:999|Hs108|chr16 ( 821) 530 92.2 5.1e-18 CCDS82259.1 CDH7 gene_id:1005|Hs108|chr18 ( 630) 527 91.6 5.6e-18 CCDS11993.1 CDH7 gene_id:1005|Hs108|chr18 ( 785) 527 91.7 6.7e-18 CCDS10804.1 CDH5 gene_id:1003|Hs108|chr16 ( 784) 495 86.9 1.8e-16 CCDS10802.1 CDH8 gene_id:1006|Hs108|chr16 ( 799) 492 86.5 2.5e-16 CCDS6260.1 CDH17 gene_id:1015|Hs108|chr8 ( 832) 488 85.9 4e-16 CCDS13395.1 CDH22 gene_id:64405|Hs108|chr20 ( 828) 486 85.6 4.9e-16 CCDS3893.1 CDH9 gene_id:1007|Hs108|chr5 ( 789) 480 84.7 8.7e-16 CCDS59325.1 CDH19 gene_id:28513|Hs108|chr18 ( 490) 449 79.9 1.5e-14 CCDS11994.1 CDH19 gene_id:28513|Hs108|chr18 ( 772) 449 80.0 2.1e-14 CCDS81992.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16 ( 670) 441 78.8 4.3e-14 CCDS56002.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16 ( 807) 370 68.3 7.8e-11 >>CCDS11896.1 DSG1 gene_id:1828|Hs108|chr18 (1049 aa) initn: 6963 init1: 6963 opt: 6963 Z-score: 5625.6 bits: 1052.6 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6963; 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CCDS11 DRDGAADGLSSECDCRIKVLDVNDNFPTLEKTSYSASIEENCLSSELIRLQAIDLDEEGT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 ANWMAVIFFISGNEGNWFEIEMNERTNVGILKVVKPLDYEAMQSLQLSIGVRNKAEFHHS ::.: ...:::.::::.:. . .:: ::::::: :::: ..::::::.:.:.::.: CCDS11 DNWLAQYLILSGNDGNWFDIQTDPQTNEGILKVVKMLDYEQAPNIQLSIGVKNQADFHYS 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 IMSQYKLKASAISVTVLNVIEGPVFRPGSKTYVVT-GNMGS---NDKVGDFVATDLDTGR . ::.... . . . :..: :::.:.:.. .. : : :: : .: ..: ::::: CCDS11 VASQFQMHPTPVRIQVVDVREGPAFHPSTMAFSVREGIKGSSLLNYVLGTYTAIDLDTGN 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 PSTTVRYVMGNNPADLLAVDSRTGKLTLKNKVTKEQYNMLGGKYQGTILSIDDNLQRTCT :.: :::..:.. .. : .:::::.. .. . :.. ...: : . ::.:::. .: : CCDS11 PATDVRYIIGHDAGSWLKIDSRTGEIQFSREFDKKSKYIINGIYTAEILAIDDGSGKTAT 430 440 450 460 470 480 480 490 500 pF1KB7 GTININIQSFGNDDRTNTEPNTK----------ITTNTGRQES----------------- ::: :.. .. :: : :. . :..: : CCDS11 GTICIEVPDI-NDYCPNIFPERRTICIDSPSVLISVNEHSYGSPFTFCVVDEPPGIADMW 490 500 510 520 530 510 520 530 pF1KB7 -TSSTN----------------YDTSTTSTDSS----------QVY------------SS . ::: :. :: :.: :. CCDS11 DVRSTNATSAILTAKQVLSPGFYEIPILVKDSYNRACELAQMVQLYACDCDDNHMCLDSG 540 550 560 570 580 590 540 550 560 570 pF1KB7 EPGNGAKDLLSD-------------NVHFGPAGIGLLIMGFLVLGLVPFLMICCDCGGAP : ..:. .: :: .::::::....:.:.: :.:.:.. : : CCDS11 AAGIYTEDITGDTYGPVTEDQAGVSNVGLGPAGIGMMVLGILLLILAPLLLLLCCCKQRQ 600 610 620 630 640 650 580 590 600 610 620 630 pF1KB7 RSAAG--FEPVPECSDGAIHSWAVEGPQPEPRDITTVIPQIPPDNANIIECIDNSGVYTN . : : :::: ..:...:: .:: .:: ::.... : .: . .:.: .::: CCDS11 PEGLGTRFAPVPEGGEGVMQSWRIEGAHPEDRDVSNICA--PMTASNTQDRMDSSEIYTN 660 670 680 690 700 710 640 650 660 670 680 pF1KB7 EY--GGREMQDLGGGERMTGFELTEGVKTSGMPEICQEYSGTLRRNS-----MRECREGG : :: ..: : ::. . :. ..: ::. :. : .:. .. CCDS11 TYAAGGTVEGGVSGVELNTGMGTAVGLMAAGAAGA----SGAARKRSSTMGTLRDYADAD 720 730 740 750 760 770 690 700 710 720 730 740 pF1KB7 LNMNFMESYFCQKAYAYADEDEGRPSNDCLLIYDIEGVGSPAGSVGCCSFIGEDLDDSFL .:: :..::: .:::::::::::::.:::::::: ::::::.::.::::.: .:::.: . CCDS11 INMAFLDSYFSEKAYAYADEDEGRPANDCLLIYDHEGVGSPVGSIGCCSWIVDDLDESCM 780 790 800 810 820 830 750 760 770 780 790 800 pF1KB7 DTLGPKFKKLADISLGKESYPDLDPSWPPQSTEPVCLPQETEPVVSGHPPISPHFGTTTV .:: :::. ::.: :. : : .: .. .:.: :. : ..:.. CCDS11 ETLDPKFRTLAEICLNTEIEP-----FP---SHQACIPISTD-----LPLLGPNY----F 840 850 860 870 810 820 830 840 850 860 pF1KB7 ISEST--YPSGPGVLHPKPILDPLGYGNVTVTESYTTSDT-LKPSVHVHDNRPASNVVVT ..::. :: . .:. .:.. :::.: ..: ..:.. . : . : ::::: CCDS11 VNESSGLTPSEVEFQEEMAASEPVVHGDIIVTETYGNADPCVQPTTIIFDPQLAPNVVVT 880 890 900 910 920 930 870 880 890 900 910 920 pF1KB7 ERVVGPISGADLHGMLEMP-DLRDGSNVIVTERVIAPSSSLPTSLTIHHPRESSNVVVTE : :..:. :..: . .: .: : .::: .:::.: : ..: . :: .:: CCDS11 EAVMAPV--YDIQGNICVPAELADYNNVIYAERVLA-SPGVP---------DMSNSSTTE 940 950 960 970 980 930 940 950 960 970 980 pF1KB7 RVIQPTSGMIGSLSMHPELANAHNVIVTERVVSGAGVTGISGTTGISGGIGSSGLVGTSM . :. : :.. . ::. CCDS11 GCMGPV--MSGNILVGPEIQVMQMMSPDLPIGQTVGSTSPMTSRHRVTRYSNIHYTQQ 990 1000 1010 1020 1030 1040 >>CCDS45845.1 DSG4 gene_id:147409|Hs108|chr18 (1059 aa) initn: 2729 init1: 1799 opt: 2018 Z-score: 1635.9 bits: 314.4 E(32554): 8.4e-85 Smith-Waterman score: 2643; 43.8% identity (67.6% similar) in 1056 aa overlap (1-943:1-1020) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MDWSFFRVVAMLFIFLVVVEVNSEFRIQVRDYNTKNGTIKWHSIRRQKREWIKFAAACRE ::: ::: . .:.:..::.:::::: ..:.... .::: ::...:::::::::::::::: CCDS45 MDWLFFRNICLLIILMVVMEVNSEFIVEVKEFDIENGTTKWQTVRRQKREWIKFAAACRE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 GEDNSKRNPIAKIHSDCAANQQVTYRISGVGIDQPPYGIFVINQKTGEINITSIVDREVT :::::::::::::.::: .::..::::::::::.::::.:.:: .::::::::.::::.: CCDS45 GEDNSKRNPIAKIRSDCESNQKITYRISGVGIDRPPYGVFTINPRTGEINITSVVDREIT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 PFFIIYCRALNSMGQDLERPLELRVRVLDINDNPPVFSMATFAGQIEENSNANTLVMILN :.:.:::::::: :.::::::::::.:.::::: ::::.......:::::.:::::. : CCDS45 PLFLIYCRALNSRGEDLERPLELRVKVMDINDNAPVFSQSVYTASIEENSDANTLVVKLC 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 ATDADEPNNLNSKIAFKIIRQEPSDSPMFIINRNTGEIRTMNNFLDREQYGQYALAVRGS :::::: :.::::::.::. :::: .::::.:: :::. ::..::::::...: :.:::: CCDS45 ATDADEENHLNSKIAYKIVSQEPSGAPMFILNRYTGEVCTMSSFLDREQHSMYNLVVRGS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 DRDGGADGMSAECECNIKILDVNDNIPYMEQSSYTIEIQENTLNSNLLEIRVIDLDEEFS ::::.:::.:.::.: ::.::::::.: .:..::. :.:: :.:.:.....:::::: . CCDS45 DRDGAADGLSSECDCRIKVLDVNDNFPTLEKTSYSASIEENCLSSELIRLQAIDLDEEGT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 ANWMAVIFFISGNEGNWFEIEMNERTNVGILKVVKPLDYEAMQSLQLSIGVRNKAEFHHS ::.: ...:::.::::.:. . .:: ::::::: :::: ..::::::.:.:.::.: CCDS45 DNWLAQYLILSGNDGNWFDIQTDPQTNEGILKVVKMLDYEQAPNIQLSIGVKNQADFHYS 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 IMSQYKLKASAISVTVLNVIEGPVFRPGSKTYVVT-GNMGS---NDKVGDFVATDLDTGR . ::.... . . . :..: :::.:.:.. .. : : :: : .: ..: ::::: CCDS45 VASQFQMHPTPVRIQVVDVREGPAFHPSTMAFSVREGIKGSSLLNYVLGTYTAIDLDTGN 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 PSTTVRYVMGNNPADLLAVDSRTGKLTLKNKVTKEQYNMLGGKYQGTILSIDDNLQRTCT :.: :::..:.. .. : .:::::.. .. . :.. ...: : . ::.:::. .: : CCDS45 PATDVRYIIGHDAGSWLKIDSRTGEIQFSREFDKKSKYIINGIYTAEILAIDDGSGKTAT 430 440 450 460 470 480 480 490 500 pF1KB7 GTININIQSFGNDDRTNTEPNTK----------ITTNTGRQES----------------- ::: :.. .. :: : :. . :..: : CCDS45 GTICIEVPDI-NDYCPNIFPERRTICIDSPSVLISVNEHSYGSPFTFCVVDEPPGIADMW 490 500 510 520 530 510 520 530 pF1KB7 -TSSTN----------------YDTSTTSTDSS----------QVY------------SS . ::: :. :: :.: :. CCDS45 DVRSTNATSAILTAKQVLSPGFYEIPILVKDSYNRACELAQMVQLYACDCDDNHMCLDSG 540 550 560 570 580 590 540 550 560 570 pF1KB7 EPGNGAKDLLSD-------------NVHFGPAGIGLLIMGFLVLGLVPFLMICCDCGGAP : ..:. .: :: .::::::....:.:.: :.:.:.. : : CCDS45 AAGIYTEDITGDTYGPVTEDQAGVSNVGLGPAGIGMMVLGILLLILAPLLLLLCCCKQRQ 600 610 620 630 640 650 580 590 600 610 620 pF1KB7 RSAAG--FEPVPECSDGAIHSWAVEGPQPEPRDITT-VIPQI--PPDNANII--ECIDN- . : : :::: ..:...:: .:: .:: : ... ..: :... . .: . CCDS45 PEGLGTRFAPVPEGGEGVMQSWRIEGAHPEDRLFSAYALPGGGGTADGGGSVLGRCALQA 660 670 680 690 700 710 630 640 650 660 670 pF1KB7 -----------SGVYTNEY--GGREMQDLGGGERMTGFELTEGVKTSGMPEICQEYSGTL : .::: : :: ..: : ::. . :. ..: ::. CCDS45 TPALLNQHPPFSEIYTNTYAAGGTVEGGVSGVELNTGMGTAVGLMAAGAAGA----SGAA 720 730 740 750 760 770 680 690 700 710 720 730 pF1KB7 RRNS-----MRECREGGLNMNFMESYFCQKAYAYADEDEGRPSNDCLLIYDIEGVGSPAG :. : .:. .. .:: :..::: .:::::::::::::.:::::::: ::::::.: CCDS45 RKRSSTMGTLRDYADADINMAFLDSYFSEKAYAYADEDEGRPANDCLLIYDHEGVGSPVG 780 790 800 810 820 830 740 750 760 770 780 790 pF1KB7 SVGCCSFIGEDLDDSFLDTLGPKFKKLADISLGKESYPDLDPSWPPQSTEPVCLPQETEP :.::::.: .:::.: ..:: :::. ::.: :. : : .: .. .:.: :. CCDS45 SIGCCSWIVDDLDESCMETLDPKFRTLAEICLNTEIEP-----FP---SHQACIPISTD- 840 850 860 870 880 800 810 820 830 840 pF1KB7 VVSGHPPISPHFGTTTVISEST--YPSGPGVLHPKPILDPLGYGNVTVTESYTTSDT-LK : ..:.. ..::. :: . .:. .:.. :::.: ..: .. CCDS45 ----LPLLGPNY----FVNESSGLTPSEVEFQEEMAASEPVVHGDIIVTETYGNADPCVQ 890 900 910 920 930 850 860 870 880 890 900 pF1KB7 PSVHVHDNRPASNVVVTERVVGPISGADLHGMLEMP-DLRDGSNVIVTERVIAPSSSLPT :.. . : . : :::::: :..:. :..: . .: .: : .::: .:::.: : ..: CCDS45 PTTIIFDPQLAPNVVVTEAVMAPV--YDIQGNICVPAELADYNNVIYAERVLA-SPGVP- 940 950 960 970 980 990 910 920 930 940 950 960 pF1KB7 SLTIHHPRESSNVVVTERVIQPTSGMIGSLSMHPELANAHNVIVTERVVSGAGVTGISGT . :: .:: . :. : :.. . ::. CCDS45 --------DMSNSSTTEGCMGPV--MSGNILVGPEIQVMQMMSPDLPIGQTVGSTSPMTS 1000 1010 1020 1030 1040 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KB7 TGISGGIGSSGLVGTSMGAGSGALSGAGISGGGIGLSSLGGTASIGHMRSSSDHHFNQTI CCDS45 RHRVTRYSNIHYTQQ 1050 >>CCDS11898.1 DSG3 gene_id:1830|Hs108|chr18 (999 aa) initn: 1565 init1: 1066 opt: 1807 Z-score: 1466.1 bits: 282.8 E(32554): 2.4e-75 Smith-Waterman score: 2483; 44.0% identity (69.1% similar) in 1001 aa overlap (5-896:5-992) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MDWSFFRVVAMLFIFLVVVEVNSEFRIQVR-DYNTKNGTIKWHSIRRQKREWIKFAAACR : :... : ::.::. :..:.::... .:. .. :.. .. :::::::.::: :: CCDS11 MMGLFPRTTGALAIFVVVILVHGELRIETKGQYDEEEMTMQ-QAKRRQKREWVKFAKPCR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 EGEDNSKRNPIAKIHSDCAANQQVTYRISGVGIDQPPYGIFVINQKTGEINITSIVDREV :::::::::::::: :: :.:..:::::::::::::.::::....::.::::.::::: CCDS11 EGEDNSKRNPIAKITSDYQATQKITYRISGVGIDQPPFGIFVVDKNTGDINITAIVDREE 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 TPFFIIYCRALNSMGQDLERPLELRVRVLDINDNPPVFSMATFAGQIEENSNANTLVMIL :: :.: :::::..: :.:.:: : :..:::::::::::. : :.::::: .:.::::: CCDS11 TPSFLITCRALNAQGLDVEKPLILTVKILDINDNPPVFSQQIFMGEIEENSASNSLVMIL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 NATDADEPNNLNSKIAFKIIRQEPSDSPMFIINRNTGEIRTMNNFLDREQYGQYALAVRG :::::::::.:::::::::. :::. .:::...:::::.::..: ::::: ..: :.: : CCDS11 NATDADEPNHLNSKIAFKIVSQEPAGTPMFLLSRNTGEVRTLTNSLDREQASSYRLVVSG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 SDRDGGADGMSAECECNIKILDVNDNIPYMEQSSYTIEIQENTLNSNLLEIRVIDLDEEF .:.:: .:.:..::::::. :::::.:....:.:. .:.:: :.:.::...: :::::. CCDS11 ADKDG--EGLSTQCECNIKVKDVNDNFPMFRDSQYSARIEENILSSELLRFQVTDLDEEY 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 SANWMAVIFFISGNEGNWFEIEMNERTNVGILKVVKPLDYEAMQSLQLSIGVRNKAEFHH . ::.:: :: ::::::::::. . ::: ::::::: :::: .::..:::.:.::::::. CCDS11 TDNWLAVYFFTSGNEGNWFEIQTDPRTNEGILKVVKALDYEQLQSVKLSIAVKNKAEFHQ 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 SIMSQYKLKASAISVTVLNVIEGPVFRPGSKTYVVTGNMGSNDKV----GDFVATDLDTG :..:.:..... ... :.:: :: .:::.:::..: ...:. : : . : : ::. CCDS11 SVISRYRVQSTPVTIQVINVREGIAFRPASKTFTVQKGISSKKLVDYILGTYQAIDEDTN 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 RPSTTVRYVMGNNPADLLAVDSRTGKLTLKNKVTKEQYNMLGGKYQGTILSIDDNLQRTC . ...:.:::: : . : .::.:... . ....... ... . .:.::. .: CCDS11 KAASNVKYVMGRNDGGYLMIDSKTAEIKFVKNMNRDSTFIVNKTITAEVLAIDEYTGKTS 420 430 440 450 460 470 480 490 500 pF1KB7 TGTININIQSFGN---------DDRTNTEPNTKITTNT--GR------------------ :::. . . .:.. : .. :.. ... : .: CCDS11 TGTVYVRVPDFNDNCPTAVLEKDAVCSSSPSVVVSARTLNNRYTGPYTFALEDQPVKLPA 480 490 500 510 520 530 510 520 530 540 pF1KB7 ----------------QESTSSTNYDTSTTSTDSSQVYSSEPGNGAKDLLS-DNV----- ::. : : . :::.. : . . .. . :: CCDS11 VWSITTLNATSALLRAQEQIPPGVYHISLVLTDSQNNRCEMPRSLTLEVCQCDNRGICGT 540 550 560 570 580 590 550 560 570 580 pF1KB7 --------------H---FGPAGIGLLIMGFLVLGLVPFLMICCDCGGAPRSAA--GFEP : .:::.::::..:.:.: :.:.:.. ::::.. ... :: : CCDS11 SYPTTSPGTRYGRPHSGRLGPAAIGLLLLGLLLLLLAPLLLLTCDCGAGSTGGVTGGFIP 600 610 620 630 640 650 590 600 610 620 630 640 pF1KB7 VPECSDGAIHSWAVEGPQPEPRDITTVIPQIPPDNANIIECIDNSGVYTNEYG-GREMQD ::. :.:.::.:..:: .:: ..::.. .:: .:: . ...: : :: :. : .. CCDS11 VPDGSEGTIHQWGIEGAHPEDKEITNIC--VPPVTANGADFMESSEVCTNTYARGTAVEG 660 670 680 690 700 710 650 660 670 680 pF1KB7 LGGGERMT------------GFEL-TEGVKTSGMPE-----ICQE-YSGTLR-RNSM--- .: : : :: : . .::. ::. :::.: :.: CCDS11 TSGMEMTTKLGAATESGGAAGFATGTVSGAASGFGAATGVGICSSGQSGTMRTRHSTGGT 720 730 740 750 760 770 690 700 710 720 730 pF1KB7 -RECREGGLNMNFMESYFCQKAYAYADEDEGRPSNDCLLIYDIEGV---GSPAGSVGCCS .. .:...:::..::: :::.: :.::.:. .:::::::: ::. :::.::::::: CCDS11 NKDYADGAISMNFLDSYFSQKAFACAEEDDGQEANDCLLIYDNEGADATGSPVGSVGCCS 780 790 800 810 820 830 740 750 760 770 780 790 pF1KB7 FIGEDLDDSFLDTLGPKFKKLADISLGKESYPDLDPSWPPQSTEPVCLPQETEPVV---S ::..::::::::.:::::::::.:::: .. . ::.. . . .:. . CCDS11 FIADDLDDSFLDSLGPKFKKLAEISLGVDG--EGKEVQPPSKDSGYGIESCGHPIEVQQT 840 850 860 870 880 890 800 810 820 830 840 850 pF1KB7 GHPPISPHFGTTTVISESTYPS-GPGVLHPKPILDPLGYGNVTVTESYTTSDTL-KPSVH : . :. . . :: : :.: : ::: .:: :::.:..: .: .::. CCDS11 GFVKCQTLSGSQGASALSTSGSVQPAVSIP----DPLQHGNYLVTETYSASGSLVQPSTA 900 910 920 930 940 860 870 880 890 900 910 pF1KB7 VHDNRPASNVVVTERVVGPISGADLHGMLEMP-DLRDGSNVIVTERVIAPSSSLPTSLTI : ..::.:::::. ::: .. : : : .:: . ... :: CCDS11 GFDPLLTQNVIVTERVICPIS--SVPGNLAGPTQLRGSHTMLCTEDPCSRLI 950 960 970 980 990 920 930 940 950 960 970 pF1KB7 HHPRESSNVVVTERVIQPTSGMIGSLSMHPELANAHNVIVTERVVSGAGVTGISGTTGIS >>CCDS42423.1 DSG2 gene_id:1829|Hs108|chr18 (1118 aa) initn: 1665 init1: 625 opt: 1302 Z-score: 1057.9 bits: 207.5 E(32554): 1.3e-52 Smith-Waterman score: 1841; 35.2% identity (60.3% similar) in 1106 aa overlap (7-998:7-1083) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MDWSFFRVVAMLFIFLVVVEVNSEFRIQVRDYNTKNGTIKWHS-IRRQKREWIKFAAACR :. :.: ..:. .:.: ...:: . ..: . : . :::: :: .: : CCDS42 MARSPGRAYALL-LLLICFNVGSGLHLQVLSTRNENKLLPKHPHLVRQKRAWITAPVALR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 EGEDNSKRNPIAKIHSDCAANQ--QVTYRISGVGIDQPPYGIFVINQKTGEINITSIVDR :::: ::.::::::::: : .. ..::. .: :: .::.::::.:. :::.:.:::.:: CCDS42 EGEDLSKKNPIAKIHSDLAEERGLKITYKYTGKGITEPPFGIFVFNKDTGELNVTSILDR 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 EVTPFFIIYCRALNSMGQDLERPLELRVRVLDINDNPPVFSMATFAGQIEENSNANTLVM : ::::.. ::.. :...:.:::::..::::::: :::.. .:.:..:: : :.:::: CCDS42 EETPFFLLTGYALDARGNNVEKPLELRIKVLDINDNEPVFTQDVFVGSVEELSAAHTLVM 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 ILNATDADEPNNLNSKIAFKIIRQEPSDSPMFIINRNTGEIRTMNNFLDREQYGQYALAV .:::::::::.:::::...:. ::. :.: .:..:::: : . ::::....:.:.: CCDS42 KINATDADEPNTLNSKISYRIVSLEPAYPPVFYLNKDTGEIYTTSVTLDREEHSSYTLTV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 RGSDRDGGA-DGMSAECECNIKILDVNDNIPYMEQSSYTIEIQENTLNSNLLEIRVIDLD .. : .: . : . . .:.::::::::: .:.. ..:: .: .. .:.:.: : CCDS42 EARDGNGEVTDKPVKQAQVQIRILDVNDNIPVVENKVLEGMVEENQVNVEVTRIKVFDAD 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 EEFSANWMAVIFFISGNEGNWFEIEMNERTNVGILKVVKPLDYEAMQSLQLSIGVRNKAE : : ::.: . : :::::..:.:: . .:: ::. ..: .::: :..:..:. : ::: CCDS42 EIGSDNWLANFTFASGNEGGYFHIETDAQTNEGIVTLIKEVDYEEMKNLDFSVIVANKAA 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 FHHSIMSQYKLKASAISVTVLNVIEGPVFRPGSKTYVVTGNMGSNDK---VGDFVATDLD ::.:: :.:: :.: : :: :: :. . . :. .: ..: .:.: : : : CCDS42 FHKSIRSKYKPTPIPIKVKVKNVKEGIHFKSSVISIYVSESMDRSSKGQIIGNFQAFDED 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 TGRPSTTVRYVMGNNPADLLAVDSRTGKLTLKNKVTKEQYNMLGGKYQGTILSIDDNLQR :: :. . ::: .. . ..::: :... : . :. . .: : :..:... : CCDS42 TGLPAHA-RYVKLEDRDNWISVDSVTSEIKLAKLPDFESRYVQNGTYTVKIVAISEDYPR 420 430 440 450 460 470 480 490 500 pF1KB7 -TCTGTININIQSFGNDDRTNTEPNTKIT----------------TNTG----------- : :::. ::....... : :: : :.: CCDS42 KTITGTVLINVEDINDNCPTLIEPVQTICHDAEYVNVTAEDLDGHPNSGPFSFSVIDKPP 480 490 500 510 520 530 510 520 530 pF1KB7 ---------RQESTSSTNY----------------DTSTTSTDSSQVYSSE-----PGNG :::::: :.. : .:: . :.: CCDS42 GMAEKWKIARQESTSVLLQQSEKKLGRSEIQFLISDNQGFSCPEKQVLTLTVCECLHGSG 540 550 560 570 580 590 540 550 560 570 580 590 pF1KB7 AKDLLSDN-VHFGPAGIGLLIMGFLVLGLVPFLMICCDCGGAPRSAAGFEPVPECSDGAI .. :. : .:::.:.:.:..::.: :::.:.. : :: ..: :: :.: . . CCDS42 CREAQHDSYVGLGPAAIALMILAFLLLLLVPLLLLMCHCG---KGAKGFTPIPGTIE-ML 600 610 620 630 640 650 600 610 620 630 640 pF1KB7 HSWAVEGPQPEPRDITTVIPQ-IPPDNANIIECIDNSGVYTNEY------------GGRE : : :: :: . :.:. .: :... . .. : ...: : .: CCDS42 HPWNNEGAPPEDK----VVPSFLPVDQGGSLVGRNGVGGMAKEATMKGSSSASIVKGQHE 660 670 680 690 700 710 650 660 670 680 690 pF1KB7 MQDLGG---------GERMTGFELTEGVKTSGMPEICQEYSGTLRRNSMRECREGGLNMN :... : . : : : . :. . . .:. : . . .:: . CCDS42 MSEMDGRWEEHRSLLSGRATQFTGATGAIMTTETTKTARATGASRDMAGAQAAAVALNEE 720 730 740 750 760 770 700 710 720 730 740 750 pF1KB7 FMESYFCQKAYAYADEDEGRPSNDCLLIYDIEGVGSPAGSVGCCSFIGEDLDDSFLDTLG :...:: .:: .:..:::.. ..::::.:. : . : .:.:::::: .::: ::: :: CCDS42 FLRNYFTDKAASYTEEDENHTAKDCLLVYSQEETESLNASIGCCSFIEGELDDRFLDDLG 780 790 800 810 820 830 760 770 780 790 pF1KB7 PKFKKLADISLGK--ESYPDLDPSWPPQS-------TEPVC---LPQETEPVVSGHP-PI ::: ::.. ::. . ... : . .. .: . . . :: :. CCDS42 LKFKTLAEVCLGQKIDINKEIEQRQKPATETSMNTASHSLCEQTMVNSENTYSSGSSFPV 840 850 860 870 880 890 800 810 820 830 840 850 pF1KB7 SPHFG-------TTTVISESTYPSGPGVLHPKPILDPLGYGNVTVTE-SYTTSDTLKPSV . : ...: . : . :. ::.. :: .:: ::.:..:. :.. CCDS42 PKSLQEANAEKVTQEIVTERSVSSRQAQKVATPLPDPMASRNVIATETSYVTGSTMPPTT 900 910 920 930 940 950 860 870 880 890 900 910 pF1KB7 HVHDNRPASNVVVTERVVGPISGADLHGMLEMPDLRDGSNVIVTERVIAPSSSLPTSLT- . ....::::: .: : ....: .:. :.:::::: : .. . : CCDS42 VILGPSQPQSLIVTERVYAPAST-----LVDQPYANEGT-VVVTERVIQPHGGGSNPLEG 960 970 980 990 1000 920 930 940 950 960 pF1KB7 IHHPRESSNVVVTER--VIQPTSGMIGSLSMHPELANAHNVIVTERVVSGAGVTGISGTT .: .. :.: :: . :.::. .:.: :..: ..:: :::::.. :.. CCDS42 TQHLQDVPYVMVRERESFLAPSSGVQPTLAM-PNIAVGQNVTVTERVLAPAST------- 1010 1020 1030 1040 1050 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KB7 GISGGIGSSGLVGT--SMGAGSGALSGAGISGGGIGLSSLGGTASIGHMRSSSDHHFNQT . :: . : :: : . ..::::. : CCDS42 -----LQSSYQIPTENSMTARNTTVSGAGVPGPLPDFGLEESGHSNSTITTSSTRVTKHS 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1030 1040 pF1KB7 IGSASPSTARSRITKYSTVQYSK CCDS42 TVQHSYS >>CCDS32810.1 DSC3 gene_id:1825|Hs108|chr18 (896 aa) initn: 947 init1: 752 opt: 852 Z-score: 696.2 bits: 140.2 E(32554): 1.8e-32 Smith-Waterman score: 954; 28.5% identity (55.6% similar) in 775 aa overlap (44-760:130-891) 20 30 40 50 60 70 pF1KB7 IFLVVVEVNSEFRIQVRDYNTKNGTIKWHSIRRQKREWIKFAAACREGEDNSKRNPI--A .:: ::.: . : :.. :. CCDS32 DKRKQTQKEVTVLLEHQKKVSKTRHTRETVLRRAKRRWAPI--PCSMQENSLGPFPLFLQ 100 110 120 130 140 150 80 90 100 110 120 130 pF1KB7 KIHSDCAANQQVTYRISGVGIDQPPYGIFVINQKTGEINITSIVDREVTPFFIIYCRALN ...:: : : : : ::: :.:. : ..: :.. ::.. : :::: : . : . CCDS32 QVESDAAQNYTVFYSISGRGVDKEPLNLFYIERDTGNLFCTRPVDREEYDVFDLIAYAST 160 170 180 190 200 210 140 150 160 170 180 190 pF1KB7 SMGQDLERPLELRVRVLDINDNPPVFSMATFAGQIEENSNANTLVMILNATDADEPNNLN . : . . :: : .:: : ::: :::. : . .. :.: .: : .. ::: :::.... CCDS32 ADGYSADLPLPLPIRVEDENDNHPVFTEAIYNFEVLESSRPGTTVGVVCATDRDEPDTMH 220 230 240 250 260 270 200 210 220 230 240 250 pF1KB7 SKIAFKIIRQEPSDSPMFIINRNTGEIRTMNNFLDREQYGQYALAVRGSDRDGGADGMSA ... ..:..: : . .: .. .:: : :....:::: .:.: .. .: :: :. . CCDS32 TRLKYSILQQTPRSPGLFSVHPSTGVITTVSHYLDREVVDKYSLIMKVQDMDGQFFGLIG 280 290 300 310 320 330 260 270 280 290 300 310 pF1KB7 ECECNIKILDVNDNIPYMEQSSYTIEIQENTLNSNLLEIRVIDLDEEFSANWMAVIFFIS : : . : ::: : ..:..: ..::..: ..:.: . : : .::: . . ... CCDS32 TSTCIITVTDSNDNAPTFRQNAYEAFVEENAFNVEILRIPIEDKDLINTANWRVNFTILK 340 350 360 370 380 390 320 330 340 350 360 370 pF1KB7 GNEGNWFEIEMNERTNVGILKVVKPLDYEAMQSLQLSIGVRNKAEFHHSIMSQYKLKASA :::.. :.: ...:: :.:.:::::.:: ....: ::: :.: : ..: :. . CCDS32 GNENGHFKISTDKETNEGVLSVVKPLNYEENRQVNLEIGVNNEAPFARDIPRVTALNRAL 400 410 420 430 440 450 380 390 400 410 420 430 pF1KB7 ISVTVLNVIEGPVFRPGSKTYVVTGNMGSNDKVGDFVATDLDTGRPSTTVRYVMGNNPAD ..: : .. ::: :... . :.. ..:.. . : : .: .. .:: ..: CCDS32 VTVHVRDLDEGPECTPAAQYVRIKENLAVGSKINGYKAYD-PENRNGNGLRYKKLHDPKG 460 470 480 490 500 510 440 450 460 470 480 490 pF1KB7 LLAVDSRTGKLTLKNKVTKEQYNMLGGKYQGTILSIDDNLQRTCTGTININIQSFGNDDR ...: .:.. .. . .: . . :. :.:.:: . .:.::::. .::.. ::. CCDS32 WITIDEISGSIITSKILDREVETPKNELYNITVLAIDKD-DRSCTGTLAVNIEDV-NDNP 520 530 540 550 560 570 500 510 520 530 pF1KB7 TNT--------EPNTKIT----TNTGRQESTSSTNYDTSTTSTDSSQVYSSEPGNGAKDL . .:. : .. . . .. .:: . :...: : . CCDS32 PEILQEYVVICKPKMGYTDILAVDPDEPVHGAPFYFSLPNTSPEISRLWSLTKVNDTAAR 580 590 600 610 620 630 540 550 560 570 580 590 pF1KB7 LS--DNVHFGPAGIGLLIMGFLVLGLVPFLMIC-CDCGGAPRSAAGFEPVPECSDGAI-H :: :. : : . . . . .: . :.: . : . : :.: CCDS32 LSYQKNAGFQEYTIPITVKDRAGQAATKLLRVNLCECTHPTQCRATSR-----STGVILG 640 650 660 670 680 600 610 620 pF1KB7 SWAVE----GPQPEPRDITTVI---------PQIPPDNA--NII-----------ECIDN .::. : . :.. ..: : : :.: : : CCDS32 KWAILAILLGIALLFSVLLTLVCGVFGATKGKRFPEDLAQQNLIISNTEAPGDDRVCSAN 690 700 710 720 730 740 630 640 650 660 670 680 pF1KB7 SGVY--TNEYGGREMQDLGGGERMTGFELTEGVKTSGMP-EICQEYSGTLRRNSMRECRE . . ::. . .:.: . : : : .: ... : :. :. ..... :: CCDS32 GFMTQTTNNSSQGFCGTMGSGMKNGGQETIEMMKGGNQTLESCR---GAGHHHTLDSCRG 750 760 770 780 790 800 690 700 710 720 730 pF1KB7 GGLNMN-----------FMESYFCQKAYAYADEDEGRPSNDCLLIYDIEGVGSPAGSVGC : ... : . . .: . .... ::.: .: :. :: ::::::::: CCDS32 GHTEVDNCRYTYSEWHSFTQPRLGEKLHRCNQNEDRMPSQDYVLTYNYEGRGSPAGSVGC 810 820 830 840 850 860 740 750 760 770 780 790 pF1KB7 CSFIGEDLDDSFLDTLGPKFKKLADISLGKESYPDLDPSWPPQSTEPVCLPQETEPVVSG :: :. .::..: ::: ::. CCDS32 CSEKQEEDGLDFLNNLEPKFITLAEACTKR 870 880 890 >>CCDS77172.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18 (875 aa) initn: 795 init1: 385 opt: 848 Z-score: 693.2 bits: 139.6 E(32554): 2.7e-32 Smith-Waterman score: 936; 28.2% identity (56.1% similar) in 765 aa overlap (42-764:119-872) 20 30 40 50 60 pF1KB7 LFIFLVVVEVNSEFRIQVRDYNTKNGTIKWHS--IRRQKREWIKFAAACREGEDNSKRNP :: ..::::.:. :. . . CCDS77 KLSLKPTLTEESVKESAEVEEIVFPRQFSKHSGHLQRQKRDWVIPPINLPENSRGPFPQE 90 100 110 120 130 140 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 IAKIHSDCAANQQVTYRISGVGIDQPPYGIFVINQKTGEINITSIVDREVTPFFIIYCRA ...:.:: : .. : ..: : :::: :::.:: .:....:. .::: : . .: CCDS77 LVRIRSDRDKNLSLRYSVTGPGADQPPTGIFIINPISGQLSVTKPLDREQIARFHLRAHA 150 160 170 180 190 200 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 LNSMGQDLERPLELRVRVLDINDNPPVFSMATFAGQIEENSNANTLVMILNATDADEPNN .. :...: :... . :.:.::: : : .. : . :.:. .: :: ..: :::.:: CCDS77 VDINGNQVENPIDIVINVIDMNDNRPEFLHQVWNGTVPEGSKPGTYVMTVTAIDADDPNA 210 220 230 240 250 260 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 LNSKIAFKIIRQEPSD-SP-MFIINRNTGEIRTMNNFLDREQYGQYALAVRGSDRDGGAD ::. . ..:. : :: :: :: :: .::.: :. ::::. ::.: ....: .:. CCDS77 LNGMLRYRIVSQAPSTPSPNMFTINNETGDIITVAAGLDREKVQQYTLIIQATDMEGNPT 270 280 290 300 310 320 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 -GMSAECECNIKILDVNDNIPYMEQSSYTIEIQENTLNSNLLEIRVIDLDEEFSANWMAV :.: : . ::::: : . .. :. :: .. . .. : : :. . : :: CCDS77 YGLSNTATAVITVTDVNDNPPEFTAMTFYGEVPENRVDIIVANLTVTDKDQPHTPAWNAV 330 340 350 360 370 380 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 IFFISGNEGNWFEIEMNERTNVGILKVVKPLDYEAMQSLQLSIGVRNKAEFHHSIMSQYK . .:. . : :. . .: :.. ::::.:.:. . . :.....:.. . ..: :. CCDS77 YRISGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFETNRMFVLTVAAENQVPLAKGI--QHP 390 400 410 420 430 440 370 380 390 400 410 420 pF1KB7 LKASA-ISVTVLNVIEGPVFRPGSKTYVVTGNMGSNDKVGDFVATDLDTGRPSTTVRYVM ...: .::::..: :.: : :. : .. .. . :.: : : . ..::. CCDS77 PQSTATVSVTVIDVNENPYFAPNPKIIRQEEGLHAGTMLTTFTAQDPDR-YMQQNIRYTK 450 460 470 480 490 500 430 440 450 460 470 480 pF1KB7 GNNPADLLAVDSRTGKLTLKNKVTKEQYNMLGGKYQGTILSIDDNLQ-RTCTGTININIQ ..::. : .: .:..: . .:. :. .. :..:.:. :... . :::..: . CCDS77 LSDPANWLKIDPVNGQITTIAVLDRESPNVKNNIYNATFLASDNGIPPMSGTGTLQIYLL 510 520 530 540 550 560 490 500 510 520 530 540 pF1KB7 SFGNDDRTNTEPNTKITTNTGRQESTSST--NYDTSTTSTDSSQVYSSEPGNGAKDLLSD .. ::. .. :. : .: .: . : .:: . .. . : . .. CCDS77 DI-NDNAPQVLPQEAETCETPDPNSINITALDYDIDPNAGPFAFDLPLSPVTIKRNWTIT 570 580 590 600 610 620 550 560 570 580 590 pF1KB7 NVHFGPAGIGLLIMGFLVLGLVPFLMICCDCGGAPRSAAGFEPVP--------ECSD--- .. : ..: : :: :. .: : :. :.: .. : .:.: CCDS77 RLNGDFAQLNLKIK-FLEAGIYEVPIIITDSGNPPKSNISILRVKVCQCDSNGDCTDVDR 630 640 650 660 670 680 600 610 620 630 pF1KB7 --GA-IHSWAVEGP----------------QPEPRDITTVIPQIPPDNANIIECIDNSGV :: . . :. . . :: :. : . .. :: CCDS77 IVGAGLGTGAIIAILLCIIILLILVLMFVVWMKRRDKERQAKQLLIDPEDDVR--DNILK 690 700 710 720 730 740 640 650 660 670 680 690 pF1KB7 YTNEYGGREMQDLGGGE-RMTGFELTEGVKTSGMPEICQEYSGTLRRNSMRECREGGLNM : .: ::.: :: .. .. ...: :. .. .. . . .: .. CCDS77 YDEEGGGEEDQDYDLSQLQQPDTVEPDAIKPVGIRRMDERPIHAEPQYPVRSAAPHPGDI 750 760 770 780 790 800 700 710 720 730 740 pF1KB7 NFMESYFCQKAYAYADEDEGRPSNDCLLIYDIEGVGSPAGSVGC--CSFIGEDLDDSFLD . : ... ::.: : : ::..: :: :: :::.. : : . : ..:. CCDS77 ----GDFINEGLKAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSLSSLNSSSSGGEQDYDYLN 810 820 830 840 850 750 760 770 780 790 800 pF1KB7 TLGPKFKKLADISLGKESYPDLDPSWPPQSTEPVCLPQETEPVVSGHPPISPHFGTTTVI ::.::::::. : CCDS77 DWGPRFKKLADMYGGGDD 860 870 >>CCDS11891.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18 (906 aa) initn: 795 init1: 385 opt: 848 Z-score: 692.9 bits: 139.7 E(32554): 2.8e-32 Smith-Waterman score: 936; 28.2% identity (56.1% similar) in 765 aa overlap (42-764:150-903) 20 30 40 50 60 pF1KB7 LFIFLVVVEVNSEFRIQVRDYNTKNGTIKWHS--IRRQKREWIKFAAACREGEDNSKRNP :: ..::::.:. :. . . CCDS11 KLSLKPTLTEESVKESAEVEEIVFPRQFSKHSGHLQRQKRDWVIPPINLPENSRGPFPQE 120 130 140 150 160 170 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 IAKIHSDCAANQQVTYRISGVGIDQPPYGIFVINQKTGEINITSIVDREVTPFFIIYCRA ...:.:: : .. : ..: : :::: :::.:: .:....:. .::: : . .: CCDS11 LVRIRSDRDKNLSLRYSVTGPGADQPPTGIFIINPISGQLSVTKPLDREQIARFHLRAHA 180 190 200 210 220 230 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 LNSMGQDLERPLELRVRVLDINDNPPVFSMATFAGQIEENSNANTLVMILNATDADEPNN .. :...: :... . :.:.::: : : .. : . :.:. .: :: ..: :::.:: CCDS11 VDINGNQVENPIDIVINVIDMNDNRPEFLHQVWNGTVPEGSKPGTYVMTVTAIDADDPNA 240 250 260 270 280 290 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 LNSKIAFKIIRQEPSD-SP-MFIINRNTGEIRTMNNFLDREQYGQYALAVRGSDRDGGAD ::. . ..:. : :: :: :: :: .::.: :. ::::. ::.: ....: .:. CCDS11 LNGMLRYRIVSQAPSTPSPNMFTINNETGDIITVAAGLDREKVQQYTLIIQATDMEGNPT 300 310 320 330 340 350 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 -GMSAECECNIKILDVNDNIPYMEQSSYTIEIQENTLNSNLLEIRVIDLDEEFSANWMAV :.: : . ::::: : . .. :. :: .. . .. : : :. . : :: CCDS11 YGLSNTATAVITVTDVNDNPPEFTAMTFYGEVPENRVDIIVANLTVTDKDQPHTPAWNAV 360 370 380 390 400 410 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 IFFISGNEGNWFEIEMNERTNVGILKVVKPLDYEAMQSLQLSIGVRNKAEFHHSIMSQYK . .:. . : :. . .: :.. ::::.:.:. . . :.....:.. . ..: :. CCDS11 YRISGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFETNRMFVLTVAAENQVPLAKGI--QHP 420 430 440 450 460 470 370 380 390 400 410 420 pF1KB7 LKASA-ISVTVLNVIEGPVFRPGSKTYVVTGNMGSNDKVGDFVATDLDTGRPSTTVRYVM ...: .::::..: :.: : :. : .. .. . :.: : : . ..::. CCDS11 PQSTATVSVTVIDVNENPYFAPNPKIIRQEEGLHAGTMLTTFTAQDPDR-YMQQNIRYTK 480 490 500 510 520 530 430 440 450 460 470 480 pF1KB7 GNNPADLLAVDSRTGKLTLKNKVTKEQYNMLGGKYQGTILSIDDNLQ-RTCTGTININIQ ..::. : .: .:..: . .:. :. .. :..:.:. :... . :::..: . CCDS11 LSDPANWLKIDPVNGQITTIAVLDRESPNVKNNIYNATFLASDNGIPPMSGTGTLQIYLL 540 550 560 570 580 590 490 500 510 520 530 540 pF1KB7 SFGNDDRTNTEPNTKITTNTGRQESTSST--NYDTSTTSTDSSQVYSSEPGNGAKDLLSD .. ::. .. :. : .: .: . : .:: . .. . : . .. CCDS11 DI-NDNAPQVLPQEAETCETPDPNSINITALDYDIDPNAGPFAFDLPLSPVTIKRNWTIT 600 610 620 630 640 650 550 560 570 580 590 pF1KB7 NVHFGPAGIGLLIMGFLVLGLVPFLMICCDCGGAPRSAAGFEPVP--------ECSD--- .. : ..: : :: :. .: : :. :.: .. : .:.: CCDS11 RLNGDFAQLNLKIK-FLEAGIYEVPIIITDSGNPPKSNISILRVKVCQCDSNGDCTDVDR 660 670 680 690 700 710 600 610 620 630 pF1KB7 --GA-IHSWAVEGP----------------QPEPRDITTVIPQIPPDNANIIECIDNSGV :: . . :. . . :: :. : . .. :: CCDS11 IVGAGLGTGAIIAILLCIIILLILVLMFVVWMKRRDKERQAKQLLIDPEDDVR--DNILK 720 730 740 750 760 770 640 650 660 670 680 690 pF1KB7 YTNEYGGREMQDLGGGE-RMTGFELTEGVKTSGMPEICQEYSGTLRRNSMRECREGGLNM : .: ::.: :: .. .. ...: :. .. .. . . .: .. CCDS11 YDEEGGGEEDQDYDLSQLQQPDTVEPDAIKPVGIRRMDERPIHAEPQYPVRSAAPHPGDI 780 790 800 810 820 830 700 710 720 730 740 pF1KB7 NFMESYFCQKAYAYADEDEGRPSNDCLLIYDIEGVGSPAGSVGC--CSFIGEDLDDSFLD . : ... ::.: : : ::..: :: :: :::.. : : . : ..:. CCDS11 ----GDFINEGLKAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSLSSLNSSSSGGEQDYDYLN 840 850 860 870 880 750 760 770 780 790 800 pF1KB7 TLGPKFKKLADISLGKESYPDLDPSWPPQSTEPVCLPQETEPVVSGHPPISPHFGTTTVI ::.::::::. : CCDS11 DWGPRFKKLADMYGGGDD 890 900 >>CCDS11893.1 DSC2 gene_id:1824|Hs108|chr18 (847 aa) initn: 749 init1: 704 opt: 839 Z-score: 686.1 bits: 138.3 E(32554): 6.8e-32 Smith-Waterman score: 850; 28.4% identity (55.9% similar) in 707 aa overlap (40-707:126-817) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 AMLFIFLVVVEVNSEFRIQVRDYNTKNGTIKWHSIRRQKREWIKFAAACREGEDNSKRNP : . .:: ::.: . : :.. : CCDS11 ILLSNTENQEKKKIFVFLEHQTKVLKKRHTKEKVLRRAKRRWAPI--PCSMLENSLGPFP 100 110 120 130 140 150 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 I--AKIHSDCAANQQVTYRISGVGIDQPPYGIFVINQKTGEINITSIVDREVTPFFIIYC . ...:: : : . : : : :.:: : ..: ... ::.. : :::: : : CCDS11 LFLQQVQSDTAQNYTIYYSIRGPGVDQEPRNLFYVERDTGNLYCTRPVDREQYESFEIIA 160 170 180 190 200 210 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 RALNSMGQDLERPLELRVRVLDINDNPPVFSMATFAGQIEENSNANTLVMILNATDADEP : . : : :: : ... : ::: :.:. :.. : :: ..: : . ::: ::: CCDS11 FATTPDGYTPELPLPLIIKIEDENDNYPIFTEETYTFTIFENCRVGTTVGQVCATDKDEP 220 230 240 250 260 270 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 NNLNSKIAFKIIRQEPSDSPMFIINRNTGEIRTMNNFLDREQYGQYALAVRGSDRDGGAD ....... ..:: : : . .: .. .:: : : .. :::: .: : .. .: :: CCDS11 DTMHTRLKYSIIGQVPPSPTLFSMHPTTGVITTTSSQLDRELIDKYQLKIKVQDMDGQYF 280 290 300 310 320 330 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 GMSAECECNIKILDVNDNIPYMEQSSYTIEIQENTLNSNLLEIRVIDLDEEFSANWMAVI :... : :.: ::::..: . ..::. ..:::.. ..:.. : : : .::: : CCDS11 GLQTTSTCIINIDDVNDHLPTFTRTSYVTSVEENTVDVEILRVTVEDKDLVNTANWRANY 340 350 360 370 380 390 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 FFISGNEGNWFEIEMNERTNVGILKVVKPLDYEAMQSLQLSIGVRNKAEFHHSIMSQYKL ...:::.. :.: . .:: :.: :::::.:: :.. :.::: :.: : . . . CCDS11 TILKGNENGNFKIVTDAKTNEGVLCVVKPLNYEEKQQMILQIGVVNEAPFSREASPRSAM 400 410 420 430 440 450 370 380 390 400 410 420 pF1KB7 KASAISVTVLNVIEGPVFRPGSKTYVVTGNMGSNDKVGDFVATDLDTGRPSTTVRYVMGN ......:.: . ::: : .: . : . . . : : .: : :. .:: . CCDS11 STATVTVNVEDQDEGPECNPPIQTVRMKENAEVGTTSNGYKAYDPET-RSSSGIRYKKLT 460 470 480 490 500 510 430 440 450 460 470 480 pF1KB7 NPADLLAVDSRTGKLTLKNKVTKEQYNMLGGKYQGTILSIDDNLQRTCTGTININIQSFG .:. ...: ::.. . .. .: .. .: :. :.:. :.. ::::::..: .:. CCDS11 DPTGWVTIDENTGSIKVFRSLDREAETIKNGIYNITVLASDQG-GRTCTGTLGIILQDV- 520 530 540 550 560 570 490 500 510 520 530 pF1KB7 NDDRTNTEPNT----KITTNTGR------QESTSSTNYDTSTTSTDS--SQVYSSEPGNG ::. .: : : .... .: . .: : :. : .... . : CCDS11 NDNSPFIPKKTVIICKPTMSSAEIVAVDPDEPIHGPPFDFSLESSTSEVQRMWRLKAIND 580 590 600 610 620 630 540 550 560 570 580 590 pF1KB7 AKDLLS--DNVHFGPAGIGLLIMGFLVLGLVPFLMIC-CDCGGAPRSAAGFEPVPECSDG . :: .. :: . . . : .. : : . ::: .. . :. . : CCDS11 TAARLSYQNDPPFGSYVVPITVRDRLGMSSVTSLDVTLCDC--ITENDCTHRVDPRIGGG 640 650 660 670 680 600 610 620 630 pF1KB7 AIH--SWAVE----GPQPEPRDITTVI---------PQIPPDN---ANII----ECIDNS ... .::. : . :.. :.. ::. :.: : .. CCDS11 GVQLGKWAILAILLGIALLFCILFTLVCGASGTSKQPKVIPDDLAQQNLIVSNTEAPGDD 690 700 710 720 730 740 640 650 660 670 680 690 pF1KB7 GVYTNEYGGREMQDLGGGERMTGFELTEGVKTSGMPEICQEYSGTLRRNSMRECREGGLN ::. . : : .:.. . . . :.:..:. : . .: .: :: .: . CCDS11 KVYSAN--GFTTQTVGASAQGVCGTVGSGIKNGGQETIEMVKGGHQTSES---CRGAG-H 750 760 770 780 790 800 700 710 720 730 740 750 pF1KB7 MNFMESYFCQKAYAYADEDEGRPSNDCLLIYDIEGVGSPAGSVGCCSFIGEDLDDSFLDT . ..: :. ... .: CCDS11 HHTLDS--CRGGHTEVDNCRYTYSEWHSFTQPRLGEESIRGHTLIKN 810 820 830 840 >>CCDS11892.1 DSC2 gene_id:1824|Hs108|chr18 (901 aa) initn: 870 init1: 704 opt: 839 Z-score: 685.7 bits: 138.3 E(32554): 7.1e-32 Smith-Waterman score: 984; 29.2% identity (55.2% similar) in 785 aa overlap (40-765:126-901) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 AMLFIFLVVVEVNSEFRIQVRDYNTKNGTIKWHSIRRQKREWIKFAAACREGEDNSKRNP : . .:: ::.: . : :.. : CCDS11 ILLSNTENQEKKKIFVFLEHQTKVLKKRHTKEKVLRRAKRRWAPIP--CSMLENSLGPFP 100 110 120 130 140 150 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 I--AKIHSDCAANQQVTYRISGVGIDQPPYGIFVINQKTGEINITSIVDREVTPFFIIYC . ...:: : : . : : : :.:: : ..: ... ::.. : :::: : : CCDS11 LFLQQVQSDTAQNYTIYYSIRGPGVDQEPRNLFYVERDTGNLYCTRPVDREQYESFEIIA 160 170 180 190 200 210 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 RALNSMGQDLERPLELRVRVLDINDNPPVFSMATFAGQIEENSNANTLVMILNATDADEP : . : : :: : ... : ::: :.:. :.. : :: ..: : . ::: ::: CCDS11 FATTPDGYTPELPLPLIIKIEDENDNYPIFTEETYTFTIFENCRVGTTVGQVCATDKDEP 220 230 240 250 260 270 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 NNLNSKIAFKIIRQEPSDSPMFIINRNTGEIRTMNNFLDREQYGQYALAVRGSDRDGGAD ....... ..:: : : . .: .. .:: : : .. :::: .: : .. .: :: CCDS11 DTMHTRLKYSIIGQVPPSPTLFSMHPTTGVITTTSSQLDRELIDKYQLKIKVQDMDGQYF 280 290 300 310 320 330 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 GMSAECECNIKILDVNDNIPYMEQSSYTIEIQENTLNSNLLEIRVIDLDEEFSANWMAVI :... : :.: ::::..: . ..::. ..:::.. ..:.. : : : .::: : CCDS11 GLQTTSTCIINIDDVNDHLPTFTRTSYVTSVEENTVDVEILRVTVEDKDLVNTANWRANY 340 350 360 370 380 390 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 FFISGNEGNWFEIEMNERTNVGILKVVKPLDYEAMQSLQLSIGVRNKAEFHHSIMSQYKL ...:::.. :.: . .:: :.: :::::.:: :.. :.::: :.: : . . . CCDS11 TILKGNENGNFKIVTDAKTNEGVLCVVKPLNYEEKQQMILQIGVVNEAPFSREASPRSAM 400 410 420 430 440 450 370 380 390 400 410 420 pF1KB7 KASAISVTVLNVIEGPVFRPGSKTYVVTGNMGSNDKVGDFVATDLDTGRPSTTVRYVMGN ......:.: . ::: : .: . : . . . : : .: : :. .:: . CCDS11 STATVTVNVEDQDEGPECNPPIQTVRMKENAEVGTTSNGYKAYDPET-RSSSGIRYKKLT 460 470 480 490 500 510 430 440 450 460 470 480 pF1KB7 NPADLLAVDSRTGKLTLKNKVTKEQYNMLGGKYQGTILSIDDNLQRTCTGTININIQSFG .:. ...: ::.. . .. .: .. .: :. :.:. :.. ::::::..: .:. CCDS11 DPTGWVTIDENTGSIKVFRSLDREAETIKNGIYNITVLASDQG-GRTCTGTLGIILQDV- 520 530 540 550 560 570 490 500 510 520 530 pF1KB7 NDDRTNTEPNT----KITTNTGR------QESTSSTNYDTSTTSTDS--SQVYSSEPGNG ::. .: : : .... .: . .: : :. : .... . : CCDS11 NDNSPFIPKKTVIICKPTMSSAEIVAVDPDEPIHGPPFDFSLESSTSEVQRMWRLKAIND 580 590 600 610 620 630 540 550 560 570 580 590 pF1KB7 AKDLLS--DNVHFGPAGIGLLIMGFLVLGLVPFLMIC-CDCGGAPRSAAGFEPVPECSDG . :: .. :: . . . : .. : : . ::: .. . :. . : CCDS11 TAARLSYQNDPPFGSYVVPITVRDRLGMSSVTSLDVTLCDC--ITENDCTHRVDPRIGGG 640 650 660 670 680 600 610 620 630 pF1KB7 AIH--SWAVE----GPQPEPRDITTVI---------PQIPPDN---ANII----ECIDNS ... .::. : . :.. :.. ::. :.: : .. CCDS11 GVQLGKWAILAILLGIALLFCILFTLVCGASGTSKQPKVIPDDLAQQNLIVSNTEAPGDD 690 700 710 720 730 740 640 650 660 670 680 pF1KB7 GVY-----TNEYGGREMQDL----GGGERMTGFELTEGVKTSGMPEICQEYSGTLRRNSM :: :.. : : . :.: . : : : :: : . . :. ..... CCDS11 KVYSANGFTTQTVGASAQGVCGTVGSGIKNGGQETIEMVK--GGHQTSESCRGAGHHHTL 750 760 770 780 790 800 690 700 710 720 730 pF1KB7 RECREGGLNMN-----------FMESYFCQKAYAYADEDEGRPSNDCLLIYDIEGVGSPA :: : ... : . . .:.: .... . ..: .: :. :: :: : CCDS11 DSCRGGHTEVDNCRYTYSEWHSFTQPRLGEKVYLCNQDENHKHAQDYVLTYNYEGRGSVA 810 820 830 840 850 860 740 750 760 770 780 790 pF1KB7 GSVGCCSFIGEDLDDSFLDTLGPKFKKLADISLGKESYPDLDPSWPPQSTEPVCLPQETE ::::::: :. :::.: :::. ::. . . CCDS11 GSVGCCSERQEEDGLEFLDNLEPKFRTLAEACMKR 870 880 890 900 800 810 820 830 840 850 pF1KB7 PVVSGHPPISPHFGTTTVISESTYPSGPGVLHPKPILDPLGYGNVTVTESYTTSDTLKPS 1049 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 23:52:30 2016 done: Sun Nov 6 23:52:31 2016 Total Scan time: 4.130 Total Display time: 0.360 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]