Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7347
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7347, 1103 aa
1>>>pF1KB7347 1103 - 1103 aa - 1103 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8449+/-0.00104; mu= 9.9382+/- 0.061
mean_var=194.9555+/-42.571, 0's: 0 Z-trim(110.2): 203 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.091856
statistics sampled from 11210 (11448) to 11210 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.695), E-opt: 0.2 (0.352), width: 16
Scan time: 5.440
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11127.1 GUCY2D gene_id:3000|Hs108|chr17 (1103) 7414 996.5 0
CCDS14545.1 GUCY2F gene_id:2986|Hs108|chrX (1108) 3512 479.4 2e-134
CCDS6590.1 NPR2 gene_id:4882|Hs108|chr9 (1047) 1677 236.2 3e-61
CCDS1051.1 NPR1 gene_id:4881|Hs108|chr1 (1061) 1656 233.4 2.1e-60
CCDS8664.1 GUCY2C gene_id:2984|Hs108|chr12 (1073) 1368 195.2 6.5e-49
CCDS8335.1 GUCY1A2 gene_id:2977|Hs108|chr11 ( 732) 568 89.1 4.1e-17
CCDS34085.1 GUCY1A3 gene_id:2982|Hs108|chr4 ( 690) 560 88.0 8.1e-17
CCDS77978.1 GUCY1B3 gene_id:2983|Hs108|chr4 ( 551) 545 85.9 2.7e-16
CCDS77977.1 GUCY1B3 gene_id:2983|Hs108|chr4 ( 599) 545 85.9 2.9e-16
CCDS47154.1 GUCY1B3 gene_id:2983|Hs108|chr4 ( 619) 545 85.9 3e-16
CCDS77975.1 GUCY1B3 gene_id:2983|Hs108|chr4 ( 641) 545 86.0 3.1e-16
CCDS54812.1 GUCY1A3 gene_id:2982|Hs108|chr4 ( 624) 533 84.4 9e-16
CCDS75203.1 GUCY1B3 gene_id:2983|Hs108|chr4 ( 594) 507 80.9 9.5e-15
>>CCDS11127.1 GUCY2D gene_id:3000|Hs108|chr17 (1103 aa)
initn: 7414 init1: 7414 opt: 7414 Z-score: 5321.6 bits: 996.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7414; 100.0% identity (100.0% similar) in 1103 aa overlap (1-1103:1-1103)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MTACARRAGGLPDPGLCGPAWWAPSLPRLPRALPRLPLLLLLLLLQPPALSAVFTVGVLG
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CCDS11 MTACARRAGGLPDPGLCGPAWWAPSLPRLPRALPRLPLLLLLLLLQPPALSAVFTVGVLG
10 20 30 40 50 60
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CCDS11 PWACDPIFSRARPDLAARLAAARLNRDPGLAGGPRFEVALLPEPCRTPGSLGAVSSALAR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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CCDS11 VSGLVGPVNPAACRPAELLAEEAGIALVPWGCPWTQAEGTTAPAVTPAADALYALLRAFG
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190 200 210 220 230 240
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CCDS11 WARVALVTAPQDLWVEAGRSLSTALRARGLPVASVTSMEPLDLSGAREALRKVRDGPRVT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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CCDS11 AVIMVMHSVLLGGEEQRYLLEAAEELGLTDGSLVFLPFDTIHYALSPGPEALAALANSSQ
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310 320 330 340 350 360
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CCDS11 LRRAHDAVLTLTRHCPSEGSVLDSLRRAQERRELPSDLNLQQVSPLFGTIYDAVFLLARG
310 320 330 340 350 360
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CCDS11 VAEARAAAGGRWVSGAAVARHIRDAQVPGFCGDLGGDEEPPFVLLDTDAAGDRLFATYML
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 DPARGSFLSAGTRMHFPRGGSAPGPDPSCWFDPNNICGGGLEPGLVFLGFLLVVGMGLAG
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CCDS11 DPARGSFLSAGTRMHFPRGGSAPGPDPSCWFDPNNICGGGLEPGLVFLGFLLVVGMGLAG
430 440 450 460 470 480
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pF1KB7 AFLAHYVRHRLLHMQMVSGPNKIILTVDDITFLHPHGGTSRKVAQGSRSSLGARSMSDIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AFLAHYVRHRLLHMQMVSGPNKIILTVDDITFLHPHGGTSRKVAQGSRSSLGARSMSDIR
490 500 510 520 530 540
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pF1KB7 SGPSQHLDSPNIGVYEGDRVWLKKFPGDQHIAIRPATKTAFSKLQELRHENVALYLGLFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SGPSQHLDSPNIGVYEGDRVWLKKFPGDQHIAIRPATKTAFSKLQELRHENVALYLGLFL
550 560 570 580 590 600
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pF1KB7 ARGAEGPAALWEGNLAVVSEHCTRGSLQDLLAQREIKLDWMFKSSLLLDLIKGIRYLHHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ARGAEGPAALWEGNLAVVSEHCTRGSLQDLLAQREIKLDWMFKSSLLLDLIKGIRYLHHR
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pF1KB7 GVAHGRLKSRNCIVDGRFVLKITDHGHGRLLEAQKVLPEPPRAEDQLWTAPELLRDPALE
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CCDS11 GVAHGRLKSRNCIVDGRFVLKITDHGHGRLLEAQKVLPEPPRAEDQLWTAPELLRDPALE
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pF1KB7 RRGTLAGDVFSLAIIMQEVVCRSAPYAMLELTPEEVVQRVRSPPPLCRPLVSMDQAPVEC
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CCDS11 RRGTLAGDVFSLAIIMQEVVCRSAPYAMLELTPEEVVQRVRSPPPLCRPLVSMDQAPVEC
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pF1KB7 ILLMKQCWAEQPELRPSMDHTFDLFKNINKGRKTNIIDSMLRMLEQYSSNLEDLIRERTE
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CCDS11 ILLMKQCWAEQPELRPSMDHTFDLFKNINKGRKTNIIDSMLRMLEQYSSNLEDLIRERTE
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pF1KB7 ELELEKQKTDRLLTQMLPPSVAEALKTGTPVEPEYFEQVTLYFSDIVGFTTISAMSEPIE
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CCDS11 ELELEKQKTDRLLTQMLPPSVAEALKTGTPVEPEYFEQVTLYFSDIVGFTTISAMSEPIE
850 860 870 880 890 900
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pF1KB7 VVDLLNDLYTLFDAIIGSHDVYKVETIGDAYMVASGLPQRNGQRHAAEIANMSLDILSAV
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CCDS11 VVDLLNDLYTLFDAIIGSHDVYKVETIGDAYMVASGLPQRNGQRHAAEIANMSLDILSAV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB7 GTFRMRHMPEVPVRIRIGLHSGPCVAGVVGLTMPRYCLFGDTVNTASRMESTGLPYRIHV
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CCDS11 GTFRMRHMPEVPVRIRIGLHSGPCVAGVVGLTMPRYCLFGDTVNTASRMESTGLPYRIHV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB7 NLSTVGILRALDSGYQVELRGRTELKGKGAEDTFWLVGRRGFNKPIPKPPDLQPGSSNHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NLSTVGILRALDSGYQVELRGRTELKGKGAEDTFWLVGRRGFNKPIPKPPDLQPGSSNHG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100
pF1KB7 ISLQEIPPERRRKLEKARPGQFS
:::::::::::::::::::::::
CCDS11 ISLQEIPPERRRKLEKARPGQFS
1090 1100
>>CCDS14545.1 GUCY2F gene_id:2986|Hs108|chrX (1108 aa)
initn: 3233 init1: 2342 opt: 3512 Z-score: 2526.9 bits: 479.4 E(32554): 2e-134
Smith-Waterman score: 3579; 51.6% identity (76.2% similar) in 1083 aa overlap (39-1096:38-1101)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 GGLPDPGLCGPAWWAPSLPRLPRALPRLPLLLLLLLLQPPALSAVFTVGVLGPWACDPIF
:: .. : . . . .::.:::::: .:
CCDS14 FSRLVLWFAAFRKLLGHHGLASAKFLWCLCLLSVMSLPQQVWTLPYKIGVVGPWACDSLF
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 SRARPDLAARLAAARLNRDPGLAGGPRFEVALLPEPCRTPGSLGAVSSALARVSGLVGPV
:.: :..::::: :.::::.. . :: ..: : :.: .:.. : .::..::.
CCDS14 SKALPEVAARLAIERINRDPSFDLSYSFEYVILNEDCQTSRALSSFISHHQMASGFIGPT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 NPAACRPAELLAEEAGIALVPWGCPWTQAEGTTA-PAVT---PAA-DALYALLRAFGWAR
::. :. : ::.. .. :.: . .. . :. . :. .: .... : ::.
CCDS14 NPGYCEAASLLGNSWDKGIFSWACVNYELDNKISYPTFSRTLPSPIRVLVTVMKYFQWAH
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190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VALVTAPQDLWVEAGRSLSTALRARGLPVASVTSMEPLDLSGAREALRKVRDGPRVTAVI
...... .:.::... ...:::..::::. : . : .. :.::...... :. .:
CCDS14 AGVISSDEDIWVHTANRVASALRSHGLPVGVVLTT-GQDSQSMRKALQRIHQADRIRIII
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 MVMHSVLLGGEEQRYLLEAAEELGLTDGSLVFLPFDTIHYALSPGPEALAALANSSQLRR
: :::.:.::: : .::: :..: .:::. ::.:.:.. :.: .: :. .::.
CCDS14 MCMHSALIGGETQMHLLECAHDLKMTDGTYVFVPYDALLYSLPYKHTPYRVLRNNPKLRE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 AHDAVLTLTRHCPSEGSVLDSLRRAQERRELPSDLNLQQVSPLFGTIYDAVFLLARGVAE
:.:::::.: . .: . ... .: : :.: :...::::::::::......:... .
CCDS14 AYDAVLTITVES-QEKTFYQAFTEAAARGEIPEKLEFDQVSPLFGTIYNSIYFIAQAMNN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB7 ARAAAGGRWVSGAAVARHIRDAQVPGFCG----DLGGDEEPPFVLLDTDAAGDRLFATYM
: : ...:....: :. : :: : .:. .:.:::. .: .::
CCDS14 AMKENG--QAGAASLVQHSRNMQFHGFNQLMRTDSNGNGISEYVILDTNLKEWELHSTYT
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 LDPARGSFLSAGTRMHFPRGGSAPGPDPSCWFDPNNICGGGLEPGLVFLGFLLVVGMGLA
.: . .:: .::: :: : : .::: ..:: ::..:..... : .. :.
CCDS14 VDMEMELLRFGGTPIHFP-GGRPPRADAKCWFAEGKICHGGIDPAFAMMVCLTLLIALLS
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 GAFLAHYVRHRLLHMQMVSGPNKIILTVDDITFLHPHGGTSRKVAQGSRSSLGARSMSDI
.:...:.:. ..:...:::.:.::..:.::..:: :..: :::.:.. . :..
CCDS14 INGFAYFIRRRINKIQLIKGPNRILLTLEDVTFINPHFGSKR----GSRASVSFQITSEV
490 500 510 520 530
540 550 560 570 580
pF1KB7 RSGPSQHLD------SP------NIGVYEGDRVWLKKFP-GD--QHIAIRPATKTAFSKL
.:: : .:. .: ::..:::: :::::: :: . .:. .. .: .
CCDS14 QSGRSPRLSFSSGSLTPATYENSNIAIYEGDWVWLKKFSLGDFGDLKSIKSRASDVFEMM
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pF1KB7 QELRHENVALYLGLFLARGAEGPAALWEGNLAVVSEHCTRGSLQDLLAQREIKLDWMFKS
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CCDS14 KDLRHENINPLLGFFYDSGM----------FAIVTEFCSRGSLEDILTNQDVKLDWMFKS
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pF1KB7 SLLLDLIKGIRYLHHRGVAHGRLKSRNCIVDGRFVLKITDHGHGRLLEAQKVLPEPPRAE
:::::::::..::::: .:::::::::.::::::::.::.: . .:: .. : :
CCDS14 SLLLDLIKGMKYLHHREFVHGRLKSRNCVVDGRFVLKVTDYGFNDILEMLRLSEEESSME
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pF1KB7 DQLWTAPELLRDPALERRGTLAGDVFSLAIIMQEVVCRSAPYAMLELTPEEVVQRVRSPP
. ::::::::: : : :..::::.:.:::::::. :..:. :..: .:...:...::
CCDS14 ELLWTAPELLRAPRGSRLGSFAGDVYSFAIIMQEVMVRGTPFCMMDLPAQEIINRLKKPP
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pF1KB7 PLCRPLVSMDQAPVECILLMKQCWAEQPELRPSMDHTFDLFKNINKGRKTNIIDSMLRML
:. ::.: ..:: ::. :::::::: : ::..:. :. ::..:::.::::::::::::
CCDS14 PVYRPVVPPEHAPPECLQLMKQCWAEAAEQRPTFDEIFNQFKTFNKGKKTNIIDSMLRML
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pF1KB7 EQYSSNLEDLIRERTEELELEKQKTDRLLTQMLPPSVAEALKTGTPVEPEYFEQVTLYFS
:::::::::::::::::::.:::::..::::::::::::.:: : :::: :. ::::::
CCDS14 EQYSSNLEDLIRERTEELEIEKQKTEKLLTQMLPPSVAESLKKGCTVEPEGFDLVTLYFS
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pF1KB7 DIVGFTTISAMSEPIEVVDLLNDLYTLFDAIIGSHDVYKVETIGDAYMVASGLPQRNGQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:
CCDS14 DIVGFTTISAMSEPIEVVDLLNDLYTLFDAIIGSHDVYKVETIGDAYMVASGLPKRNGSR
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pF1KB7 HAAEIANMSLDILSAVGTFRMRHMPEVPVRIRIGLHSGPCVAGVVGLTMPRYCLFGDTVN
::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS14 HAAEIANMSLDILSSVGTFKMRHMPEVPVRIRIGLHSGPVVAGVVGLTMPRYCLFGDTVN
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1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB7 TASRMESTGLPYRIHVNLSTVGILRALDSGYQVELRGRTELKGKGAEDTFWLVGRRGFNK
::::::::::::::::.:::: ::. :. ::.:::::::::::::.:.::::.:..:: :
CCDS14 TASRMESTGLPYRIHVSLSTVTILQNLSEGYEVELRGRTELKGKGTEETFWLIGKKGFMK
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1070 1080 1090 1100
pF1KB7 PIPKPPDL-QPGSSNHGISLQEIPPERRRKLEKARPGQFS
:.: :: . . :. .::.. :: .::: :.
CCDS14 PLPVPPPVDKDGQVGHGLQPVEIAAFQRRKAERQLVRNKP
1070 1080 1090 1100
>>CCDS6590.1 NPR2 gene_id:4882|Hs108|chr9 (1047 aa)
initn: 1481 init1: 980 opt: 1677 Z-score: 1213.0 bits: 236.2 E(32554): 3e-61
Smith-Waterman score: 1745; 35.3% identity (61.3% similar) in 1084 aa overlap (32-1060:2-1040)
10 20 30 40 50
pF1KB7 TACARRAGGLPDPGLCGPAWWAPSLPRLPRALPRLPLLLLLLL--LQPPALSAVFTVGVL
::: : ::. : ..::. . . ::
CCDS65 MALPSLLLLVAALAGGVRPPGARNLTLAVVL
10 20 30
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pF1KB7 GPWACDPIFSRARPDLAARLAAARLNRDPGLAGGPRFEVALLPEPCRTP-GSLGAVSSAL
. .. : :. ::. :.: .: :: . : : . :.::. :
CCDS65 PEHNLSYAWAWPRVGPAVALAVEALGR--ALPVDLRFVSSELEGACSEYLAPLSAVDLKL
40 50 60 70 80
120 130 140 150 160
pF1KB7 ARVSGLVGPVNPAACRPAELLAEEAGIALVPWGCPWTQAEGTTA------------PAVT
. :. ..:. :: .:. :. .: . : : .: :..
CCDS65 YHDPDLL--LGPGCVYPAASVARFASHWRLPLLTAGAVASGFSAKNDHYRTLVRTGPSAP
90 100 110 120 130 140
170 180 190 200 210
pF1KB7 PAADALYALLRAFGW-ARVALV-------TAPQDLWVEAGRSLSTALRARGLPVA-SVTS
.. . .: :.: ::.::. :. . .: .. ::.. .: : .: .
CCDS65 KLGEFVVTLHGHFNWTARAALLYLDARTDDRPHYFTIE---GVFEALQGSNLSVQHQVYA
150 160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 MEPLDLSGAREALRKVRDGPRVTAV---IMVMHSVLLGGEEQRYLLEAAEELGLTDGSLV
:: .: ..: . .: . :.. . . ..: .:: . :: .::.:. :
CCDS65 REP---GGPEQATHFIRANGRIVYICGPLEMLHEILL--QAQRE--------NLTNGDYV
210 220 230 240 250
280 290 300 310 320
pF1KB7 FLPFDTIHYALSPGPEALAALA--------NSSQLRRAHDAVLTLTRHCPSEGSVLDSLR
:. .:.. .: :: .. ... ::.: ..::..: . : . .
CCDS65 FFYLDVFGESLRAGPTRATGRPWQDNRTREQAQALREAFQTVLVITYREPPNPEYQEFQN
260 270 280 290 300 310
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 R--AQERRELPSDLNLQQVSPLFGTIYDAVFLLARGVAEARAAAGGRWVSGAAVARHIRD
: . :... .:. . .. . : .::...: :. . :. :: .: ......
CCDS65 RLLIRAREDFGVELGPSLMNLIAGCFYDGILLYAEVLNET-IQEGGTREDGLRIVEKMQG
320 330 340 350 360 370
390 400 410 420 430
pF1KB7 AQVPGFCG----DLGGDEEPPFVLL---DTDAAGDRLFATYMLDPARGSFLSAGTRMHFP
. : : : ..:.: ::: : :. :: :... . :. .. .: . .
CCDS65 RRYHGVTGLVVMDKNNDRETDFVLWAMGDLDS-GDFQPAAHY-SGAEKQIWWTGRPIPWV
380 390 400 410 420
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 RGGSAPGPDPSCWFDPNNI-CGGGLEPGLVFLGFLLVVGMGLAGAFLAHYVRHRLLHMQM
.: . :. .: : :: .. : : :. : .:..: . .:. : :. ..
CCDS65 KG-APPSDNPPCAFDLDDPSCDK--TP----LSTLAIVALGTGITFIMFGVSSFLIFRKL
430 440 450 460 470 480
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 VSGPNKIILTVDDITFLHPHGGTSRKVAQG--SRSSLGAR--SMSDIRSGPSQHLDSPNI
. ... . : . . . :.:.. .: :: .:. : :.... .. ... :
CCDS65 ML-EKELASMLWRIRWEELQFGNSERYHKGAGSRLTLSLRGSSYGSLMTAHGKYQIFANT
490 500 510 520 530 540
560 570 580 590 600 610
pF1KB7 GVYEGDRVWLKKFPGDQHIAIRPATKTAFSKLQELRHENVALYLGLFLARGAEGPAALWE
: ..:. : .:. . ..: . :. .. .:...: . .: :.. . :
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CCDS34 VITMLNALYTRFDQQCGELDVYKVETIGDAYCVAGGL-HKESDTHAVQIALMALKMMELS
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CCDS34 DEVMSPHGE--PIKMRIGLHSGSVFAGVVGVKMPRYCLFGNNVTLANKFESCSVPRKINV
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CCDS34 SPTTYRLLKDCP-GFVFTPRSREELPPNFPSEIPGICHFLDAYQQGTNSKPCFQKKDVED
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pF1KB7 GSSNHGISLQEIPPERRRKLEKARPGQFS
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CCDS34 GNANFLGKASGID
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CCDS77 RRGLYLSDIPLHDATRDLVLLGEQFREEYKLTQELEILTDRLQLTLRALEDEKKKTDTLL
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CCDS77 YSVLPPSVANELRHKRPVPAKRYDNVTILFSGIVGFNAFCSKHASGEGAMKIVNLLNDLY
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