Result of FASTA (omim) for
pF1KB7347
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7347, 1103 aa
1>>>pF1KB7347 1103 - 1103 aa - 1103 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3943+/-0.0005; mu= 7.8988+/- 0.030
mean_var=394.0560+/-92.269, 0's: 0 Z-trim(117.0): 299 B-trim: 32 in 1/55
Lambda= 0.064609
statistics sampled from 28231 (28630) to 28231 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.681), E-opt: 0.2 (0.336), width: 16
Scan time: 13.690
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000171 (OMIM: 204000,600179,601777) retinal gua (1103) 7414 707.5 1.1e-202
XP_011522118 (OMIM: 204000,600179,601777) PREDICTE (1103) 7414 707.5 1.1e-202
NP_001513 (OMIM: 300041) retinal guanylyl cyclase (1108) 3512 343.8 3.4e-93
XP_005251535 (OMIM: 108961,602875,615923,616255) P (1050) 1712 175.9 1.1e-42
NP_003986 (OMIM: 108961,602875,615923,616255) atri (1047) 1677 172.7 1e-41
NP_000897 (OMIM: 108960) atrial natriuretic peptid (1061) 1656 170.7 4e-41
XP_011516192 (OMIM: 108961,602875,615923,616255) P ( 721) 1633 168.3 1.4e-40
XP_005251536 (OMIM: 108961,602875,615923,616255) P ( 721) 1633 168.3 1.4e-40
XP_016870234 (OMIM: 108961,602875,615923,616255) P ( 721) 1633 168.3 1.4e-40
XP_011516194 (OMIM: 108961,602875,615923,616255) P ( 721) 1633 168.3 1.4e-40
XP_011516195 (OMIM: 108961,602875,615923,616255) P ( 721) 1633 168.3 1.4e-40
XP_011516193 (OMIM: 108961,602875,615923,616255) P ( 721) 1633 168.3 1.4e-40
XP_016870235 (OMIM: 108961,602875,615923,616255) P ( 718) 1598 165.1 1.4e-39
XP_016870236 (OMIM: 108961,602875,615923,616255) P ( 718) 1598 165.1 1.4e-39
XP_016870238 (OMIM: 108961,602875,615923,616255) P ( 579) 1567 162.0 9.1e-39
XP_016870239 (OMIM: 108961,602875,615923,616255) P ( 579) 1567 162.0 9.1e-39
XP_016870237 (OMIM: 108961,602875,615923,616255) P ( 579) 1567 162.0 9.1e-39
XP_011516197 (OMIM: 108961,602875,615923,616255) P ( 582) 1567 162.0 9.1e-39
XP_005245275 (OMIM: 108960) PREDICTED: atrial natr (1035) 1555 161.3 2.7e-38
XP_011518933 (OMIM: 601330,614616,614665) PREDICTE ( 991) 1368 143.8 4.6e-33
NP_004954 (OMIM: 601330,614616,614665) heat-stable (1073) 1368 143.9 4.9e-33
NP_000846 (OMIM: 601244) guanylate cyclase soluble ( 732) 568 69.1 1.1e-10
XP_005263013 (OMIM: 139396,615750) PREDICTED: guan ( 455) 560 68.0 1.4e-10
NP_001124157 (OMIM: 139396,615750) guanylate cycla ( 455) 560 68.0 1.4e-10
XP_006714261 (OMIM: 139396,615750) PREDICTED: guan ( 455) 560 68.0 1.4e-10
XP_005263014 (OMIM: 139396,615750) PREDICTED: guan ( 455) 560 68.0 1.4e-10
XP_011530202 (OMIM: 139396,615750) PREDICTED: guan ( 455) 560 68.0 1.4e-10
NP_001124154 (OMIM: 139396,615750) guanylate cycla ( 690) 560 68.3 1.8e-10
XP_006714260 (OMIM: 139396,615750) PREDICTED: guan ( 690) 560 68.3 1.8e-10
NP_001243378 (OMIM: 139396,615750) guanylate cycla ( 690) 560 68.3 1.8e-10
XP_006714259 (OMIM: 139396,615750) PREDICTED: guan ( 690) 560 68.3 1.8e-10
NP_000847 (OMIM: 139396,615750) guanylate cyclase ( 690) 560 68.3 1.8e-10
NP_001124155 (OMIM: 139396,615750) guanylate cycla ( 690) 560 68.3 1.8e-10
NP_001124156 (OMIM: 139396,615750) guanylate cycla ( 690) 560 68.3 1.8e-10
XP_005263012 (OMIM: 139396,615750) PREDICTED: guan ( 690) 560 68.3 1.8e-10
NP_001278884 (OMIM: 139397) guanylate cyclase solu ( 551) 545 66.7 4.2e-10
XP_016863622 (OMIM: 139397) PREDICTED: guanylate c ( 551) 545 66.7 4.2e-10
XP_016863621 (OMIM: 139397) PREDICTED: guanylate c ( 551) 545 66.7 4.2e-10
NP_001278881 (OMIM: 139397) guanylate cyclase solu ( 599) 545 66.8 4.4e-10
NP_000848 (OMIM: 139397) guanylate cyclase soluble ( 619) 545 66.8 4.5e-10
NP_001278880 (OMIM: 139397) guanylate cyclase solu ( 641) 545 66.8 4.5e-10
NP_001124159 (OMIM: 139396,615750) guanylate cycla ( 624) 533 65.7 9.7e-10
XP_016863619 (OMIM: 139397) PREDICTED: guanylate c ( 594) 507 63.3 5.1e-09
XP_016863620 (OMIM: 139397) PREDICTED: guanylate c ( 594) 507 63.3 5.1e-09
NP_001278882 (OMIM: 139397) guanylate cyclase solu ( 594) 507 63.3 5.1e-09
XP_011530203 (OMIM: 139397) PREDICTED: guanylate c ( 662) 507 63.3 5.4e-09
NP_001278883 (OMIM: 139397) guanylate cyclase solu ( 586) 406 53.8 3.4e-06
XP_016874232 (OMIM: 600294,616287) PREDICTED: aden (1067) 365 50.4 6.7e-05
XP_006719273 (OMIM: 600294,616287) PREDICTED: aden (1168) 365 50.5 7.1e-05
NP_056085 (OMIM: 600294,616287) adenylate cyclase (1168) 365 50.5 7.1e-05
>>NP_000171 (OMIM: 204000,600179,601777) retinal guanyly (1103 aa)
initn: 7414 init1: 7414 opt: 7414 Z-score: 3759.8 bits: 707.5 E(85289): 1.1e-202
Smith-Waterman score: 7414; 100.0% identity (100.0% similar) in 1103 aa overlap (1-1103:1-1103)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MTACARRAGGLPDPGLCGPAWWAPSLPRLPRALPRLPLLLLLLLLQPPALSAVFTVGVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MTACARRAGGLPDPGLCGPAWWAPSLPRLPRALPRLPLLLLLLLLQPPALSAVFTVGVLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PWACDPIFSRARPDLAARLAAARLNRDPGLAGGPRFEVALLPEPCRTPGSLGAVSSALAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PWACDPIFSRARPDLAARLAAARLNRDPGLAGGPRFEVALLPEPCRTPGSLGAVSSALAR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 VSGLVGPVNPAACRPAELLAEEAGIALVPWGCPWTQAEGTTAPAVTPAADALYALLRAFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VSGLVGPVNPAACRPAELLAEEAGIALVPWGCPWTQAEGTTAPAVTPAADALYALLRAFG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 WARVALVTAPQDLWVEAGRSLSTALRARGLPVASVTSMEPLDLSGAREALRKVRDGPRVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 WARVALVTAPQDLWVEAGRSLSTALRARGLPVASVTSMEPLDLSGAREALRKVRDGPRVT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 AVIMVMHSVLLGGEEQRYLLEAAEELGLTDGSLVFLPFDTIHYALSPGPEALAALANSSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AVIMVMHSVLLGGEEQRYLLEAAEELGLTDGSLVFLPFDTIHYALSPGPEALAALANSSQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LRRAHDAVLTLTRHCPSEGSVLDSLRRAQERRELPSDLNLQQVSPLFGTIYDAVFLLARG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LRRAHDAVLTLTRHCPSEGSVLDSLRRAQERRELPSDLNLQQVSPLFGTIYDAVFLLARG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 VAEARAAAGGRWVSGAAVARHIRDAQVPGFCGDLGGDEEPPFVLLDTDAAGDRLFATYML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VAEARAAAGGRWVSGAAVARHIRDAQVPGFCGDLGGDEEPPFVLLDTDAAGDRLFATYML
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 DPARGSFLSAGTRMHFPRGGSAPGPDPSCWFDPNNICGGGLEPGLVFLGFLLVVGMGLAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DPARGSFLSAGTRMHFPRGGSAPGPDPSCWFDPNNICGGGLEPGLVFLGFLLVVGMGLAG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 AFLAHYVRHRLLHMQMVSGPNKIILTVDDITFLHPHGGTSRKVAQGSRSSLGARSMSDIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AFLAHYVRHRLLHMQMVSGPNKIILTVDDITFLHPHGGTSRKVAQGSRSSLGARSMSDIR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 SGPSQHLDSPNIGVYEGDRVWLKKFPGDQHIAIRPATKTAFSKLQELRHENVALYLGLFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SGPSQHLDSPNIGVYEGDRVWLKKFPGDQHIAIRPATKTAFSKLQELRHENVALYLGLFL
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610 620 630 640 650 660
pF1KB7 ARGAEGPAALWEGNLAVVSEHCTRGSLQDLLAQREIKLDWMFKSSLLLDLIKGIRYLHHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ARGAEGPAALWEGNLAVVSEHCTRGSLQDLLAQREIKLDWMFKSSLLLDLIKGIRYLHHR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 GVAHGRLKSRNCIVDGRFVLKITDHGHGRLLEAQKVLPEPPRAEDQLWTAPELLRDPALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GVAHGRLKSRNCIVDGRFVLKITDHGHGRLLEAQKVLPEPPRAEDQLWTAPELLRDPALE
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pF1KB7 RRGTLAGDVFSLAIIMQEVVCRSAPYAMLELTPEEVVQRVRSPPPLCRPLVSMDQAPVEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RRGTLAGDVFSLAIIMQEVVCRSAPYAMLELTPEEVVQRVRSPPPLCRPLVSMDQAPVEC
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pF1KB7 ILLMKQCWAEQPELRPSMDHTFDLFKNINKGRKTNIIDSMLRMLEQYSSNLEDLIRERTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ILLMKQCWAEQPELRPSMDHTFDLFKNINKGRKTNIIDSMLRMLEQYSSNLEDLIRERTE
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pF1KB7 ELELEKQKTDRLLTQMLPPSVAEALKTGTPVEPEYFEQVTLYFSDIVGFTTISAMSEPIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ELELEKQKTDRLLTQMLPPSVAEALKTGTPVEPEYFEQVTLYFSDIVGFTTISAMSEPIE
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pF1KB7 VVDLLNDLYTLFDAIIGSHDVYKVETIGDAYMVASGLPQRNGQRHAAEIANMSLDILSAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VVDLLNDLYTLFDAIIGSHDVYKVETIGDAYMVASGLPQRNGQRHAAEIANMSLDILSAV
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pF1KB7 GTFRMRHMPEVPVRIRIGLHSGPCVAGVVGLTMPRYCLFGDTVNTASRMESTGLPYRIHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GTFRMRHMPEVPVRIRIGLHSGPCVAGVVGLTMPRYCLFGDTVNTASRMESTGLPYRIHV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB7 NLSTVGILRALDSGYQVELRGRTELKGKGAEDTFWLVGRRGFNKPIPKPPDLQPGSSNHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NLSTVGILRALDSGYQVELRGRTELKGKGAEDTFWLVGRRGFNKPIPKPPDLQPGSSNHG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100
pF1KB7 ISLQEIPPERRRKLEKARPGQFS
:::::::::::::::::::::::
NP_000 ISLQEIPPERRRKLEKARPGQFS
1090 1100
>>XP_011522118 (OMIM: 204000,600179,601777) PREDICTED: r (1103 aa)
initn: 7414 init1: 7414 opt: 7414 Z-score: 3759.8 bits: 707.5 E(85289): 1.1e-202
Smith-Waterman score: 7414; 100.0% identity (100.0% similar) in 1103 aa overlap (1-1103:1-1103)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MTACARRAGGLPDPGLCGPAWWAPSLPRLPRALPRLPLLLLLLLLQPPALSAVFTVGVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MTACARRAGGLPDPGLCGPAWWAPSLPRLPRALPRLPLLLLLLLLQPPALSAVFTVGVLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PWACDPIFSRARPDLAARLAAARLNRDPGLAGGPRFEVALLPEPCRTPGSLGAVSSALAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PWACDPIFSRARPDLAARLAAARLNRDPGLAGGPRFEVALLPEPCRTPGSLGAVSSALAR
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 VSGLVGPVNPAACRPAELLAEEAGIALVPWGCPWTQAEGTTAPAVTPAADALYALLRAFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSGLVGPVNPAACRPAELLAEEAGIALVPWGCPWTQAEGTTAPAVTPAADALYALLRAFG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 WARVALVTAPQDLWVEAGRSLSTALRARGLPVASVTSMEPLDLSGAREALRKVRDGPRVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WARVALVTAPQDLWVEAGRSLSTALRARGLPVASVTSMEPLDLSGAREALRKVRDGPRVT
190 200 210 220 230 240
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pF1KB7 AVIMVMHSVLLGGEEQRYLLEAAEELGLTDGSLVFLPFDTIHYALSPGPEALAALANSSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AVIMVMHSVLLGGEEQRYLLEAAEELGLTDGSLVFLPFDTIHYALSPGPEALAALANSSQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LRRAHDAVLTLTRHCPSEGSVLDSLRRAQERRELPSDLNLQQVSPLFGTIYDAVFLLARG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LRRAHDAVLTLTRHCPSEGSVLDSLRRAQERRELPSDLNLQQVSPLFGTIYDAVFLLARG
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pF1KB7 VAEARAAAGGRWVSGAAVARHIRDAQVPGFCGDLGGDEEPPFVLLDTDAAGDRLFATYML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VAEARAAAGGRWVSGAAVARHIRDAQVPGFCGDLGGDEEPPFVLLDTDAAGDRLFATYML
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 DPARGSFLSAGTRMHFPRGGSAPGPDPSCWFDPNNICGGGLEPGLVFLGFLLVVGMGLAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DPARGSFLSAGTRMHFPRGGSAPGPDPSCWFDPNNICGGGLEPGLVFLGFLLVVGMGLAG
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pF1KB7 AFLAHYVRHRLLHMQMVSGPNKIILTVDDITFLHPHGGTSRKVAQGSRSSLGARSMSDIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AFLAHYVRHRLLHMQMVSGPNKIILTVDDITFLHPHGGTSRKVAQGSRSSLGARSMSDIR
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pF1KB7 SGPSQHLDSPNIGVYEGDRVWLKKFPGDQHIAIRPATKTAFSKLQELRHENVALYLGLFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SGPSQHLDSPNIGVYEGDRVWLKKFPGDQHIAIRPATKTAFSKLQELRHENVALYLGLFL
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pF1KB7 ARGAEGPAALWEGNLAVVSEHCTRGSLQDLLAQREIKLDWMFKSSLLLDLIKGIRYLHHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ARGAEGPAALWEGNLAVVSEHCTRGSLQDLLAQREIKLDWMFKSSLLLDLIKGIRYLHHR
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670 680 690 700 710 720
pF1KB7 GVAHGRLKSRNCIVDGRFVLKITDHGHGRLLEAQKVLPEPPRAEDQLWTAPELLRDPALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GVAHGRLKSRNCIVDGRFVLKITDHGHGRLLEAQKVLPEPPRAEDQLWTAPELLRDPALE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 RRGTLAGDVFSLAIIMQEVVCRSAPYAMLELTPEEVVQRVRSPPPLCRPLVSMDQAPVEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RRGTLAGDVFSLAIIMQEVVCRSAPYAMLELTPEEVVQRVRSPPPLCRPLVSMDQAPVEC
730 740 750 760 770 780
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pF1KB7 ILLMKQCWAEQPELRPSMDHTFDLFKNINKGRKTNIIDSMLRMLEQYSSNLEDLIRERTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ILLMKQCWAEQPELRPSMDHTFDLFKNINKGRKTNIIDSMLRMLEQYSSNLEDLIRERTE
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XP_011 ELELEKQKTDRLLTQMLPPSVAEALKTGTPVEPEYFEQVTLYFSDIVGFTTISAMSEPIE
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XP_011 VVDLLNDLYTLFDAIIGSHDVYKVETIGDAYMVASGLPQRNGQRHAAEIANMSLDILSAV
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XP_011 GTFRMRHMPEVPVRIRIGLHSGPCVAGVVGLTMPRYCLFGDTVNTASRMESTGLPYRIHV
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XP_011 ISLQEIPPERRRKLEKARPGQFS
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...... .:.::... ...:::..::::. : . : .. :.::...... :. .:
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.:...:.:. ..:...:::.:.::..:.::..:: :..: :::.:.. . :..
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:. .:.. .: :: .. ... ::.: ..::..: . : . .
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.: . :. .: : :: .. : : : :: . . .:... .. . :. .:.
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..:::..: ::.. . ... .:: :.:.:..: .:::..::: :..:::.
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:::::: ::::: . ::::::::::::::.:::: ::::::: ::: :.: .:.::..::
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pF1KB7 EIPPERRRKLEKARPGQFS
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pF1KB7 PAADALYALLRAFGW-ARVALV-------TAPQDLWVEAGRSLSTALRARGLPVA-SVTS
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. ... . : . . . :.:.. .: :: .:. : :.... .. ... :
NP_003 ML-EKELASMLWRIRWEELQFGNSERYHKGAGSRLTLSLRGSSYGSLMTAHGKYQIFANT
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pF1KB7 GVYEGDRVWLKKFPGDQHIAIRPATKTAFSKLQELRHENVALYLGLFLARGAEGPAALWE
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NP_003 GHFKGNVVAIKHV-NKKRIEL---TRQVLFELKHMRDVQFN-HLTRFIGACIDPP-----
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]