Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7352
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7352, 843 aa
1>>>pF1KB7352 843 - 843 aa - 843 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9085+/-0.000919; mu= 17.4214+/- 0.055
mean_var=74.8134+/-14.867, 0's: 0 Z-trim(105.0): 29 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.148281
statistics sampled from 8150 (8171) to 8150 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.611), E-opt: 0.2 (0.251), width: 16
Scan time: 4.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32140.1 TTC7B gene_id:145567|Hs108|chr14 ( 843) 5475 1181.3 0
CCDS74510.1 TTC7A gene_id:57217|Hs108|chr2 ( 824) 2712 590.2 4.9e-168
CCDS33193.1 TTC7A gene_id:57217|Hs108|chr2 ( 858) 2712 590.2 5.1e-168
CCDS74511.1 TTC7A gene_id:57217|Hs108|chr2 ( 882) 1980 433.6 7.2e-121
>>CCDS32140.1 TTC7B gene_id:145567|Hs108|chr14 (843 aa)
initn: 5475 init1: 5475 opt: 5475 Z-score: 6324.5 bits: 1181.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5475; 100.0% identity (100.0% similar) in 843 aa overlap (1-843:1-843)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MATKKAGSRLETEIERCRSECQWERIPELVKQLSAKLIANDDMAELLLGESKLEQYLKEH
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CCDS32 MATKKAGSRLETEIERCRSECQWERIPELVKQLSAKLIANDDMAELLLGESKLEQYLKEH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PLRQGASPRGPKPQLTEVRKHLTAALDRGNLKSEFLQESNLIMAKLNYVEGDYKEALNIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PLRQGASPRGPKPQLTEVRKHLTAALDRGNLKSEFLQESNLIMAKLNYVEGDYKEALNIY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 ARVGLDDLPLTAVPPYRLRVIAEAYATKGLCLEKLPISSSTSNLHVDREQDVITCYEKAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ARVGLDDLPLTAVPPYRLRVIAEAYATKGLCLEKLPISSSTSNLHVDREQDVITCYEKAG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 DIALLYLQEIERVILSNIQNRSPKPGPAPHDQELGFFLETGLQRAHVLYFKNGNLTRGVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DIALLYLQEIERVILSNIQNRSPKPGPAPHDQELGFFLETGLQRAHVLYFKNGNLTRGVG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RFRELLRAVETRTTQNLRMTIARQLAEILLRGMCEQSYWNPLEDPPCQSPLDDPLRKGAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RFRELLRAVETRTTQNLRMTIARQLAEILLRGMCEQSYWNPLEDPPCQSPLDDPLRKGAN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 TKTYTLTRRARVYSGENIFCPQENTEEALLLLLISESMANRDAVLSRIPEHKSDRLISLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TKTYTLTRRARVYSGENIFCPQENTEEALLLLLISESMANRDAVLSRIPEHKSDRLISLQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 SASVVYDLLTIALGRRGQYEMLSECLERAMKFAFEEFHLWYQFALSLMAAGKSARAVKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SASVVYDLLTIALGRRGQYEMLSECLERAMKFAFEEFHLWYQFALSLMAAGKSARAVKVL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 KECIRLKPDDATIPLLAAKLCMGSLHWLEEAEKFAKTVVDVGEKTSEFKAKGYLALGLTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KECIRLKPDDATIPLLAAKLCMGSLHWLEEAEKFAKTVVDVGEKTSEFKAKGYLALGLTY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 SLQATDASLRGMQEVLQRKALLAFQRAHSLSPTDHQAAFYLALQLAISRQIPEALGYVRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SLQATDASLRGMQEVLQRKALLAFQRAHSLSPTDHQAAFYLALQLAISRQIPEALGYVRQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 ALQLQGDDANSLHLLALLLSAQKHYHDALNIIDMALSEYPENFILLFSKVKLQSLCRGPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ALQLQGDDANSLHLLALLLSAQKHYHDALNIIDMALSEYPENFILLFSKVKLQSLCRGPD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 EALLTCKHMLQIWKSCYNLTNPSDSGRGSSLLDRTIADRRQLNTITLPDFSDPETGSVHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EALLTCKHMLQIWKSCYNLTNPSDSGRGSSLLDRTIADRRQLNTITLPDFSDPETGSVHA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 TSVAASRVEQALSEVASSLQSSAPKQGPLHPWMTLAQIWLHAAEVYIGIGKPAEATACTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TSVAASRVEQALSEVASSLQSSAPKQGPLHPWMTLAQIWLHAAEVYIGIGKPAEATACTQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 EAANLFPMSHNVLYMRGQIAELRGSMDEARRWYEEALAISPTHVKSMQRLALILHQLGRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EAANLFPMSHNVLYMRGQIAELRGSMDEARRWYEEALAISPTHVKSMQRLALILHQLGRY
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 SLAEKILRDAVQVNSTAHEVWNGLGEVLQAQGNDAAATECFLTALELEASSPAVPFTIIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SLAEKILRDAVQVNSTAHEVWNGLGEVLQAQGNDAAATECFLTALELEASSPAVPFTIIP
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 RVL
:::
CCDS32 RVL
>>CCDS74510.1 TTC7A gene_id:57217|Hs108|chr2 (824 aa)
initn: 2550 init1: 1447 opt: 2712 Z-score: 3130.2 bits: 590.2 E(32554): 4.9e-168
Smith-Waterman score: 2712; 50.9% identity (82.0% similar) in 806 aa overlap (41-843:28-824)
20 30 40 50 60
pF1KB7 ETEIERCRSECQWERIPELVKQLSAKLIANDDMAELLLGESKLEQYLKE-HPLRQGASPR
::...:::.:. ::: ::: : . . :
CCDS74 MVPSSSRTPGFKQSSHHLRLPKCWDYRDDFGKLLLAEALLEQCLKENHAKIKDSMPL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 GPK--PQLTEVRKHLTAALDRGNLKSEFLQESNLIMAKLNYVEGDYKEALNIYARVGLDD
: :...:....:.. :..: :. ... :. ::..::.::::.:..:...:::.:.::
CCDS74 LEKNEPKMSEAKNYLSSILNHGRLSPQYMCEAMLILGKLHYVEGSYRDAISMYARAGIDD
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LPLTAVPPYRLRVIAEAYATKGLCLEKLPISSSTSNLHVDREQDVITCYEKAGDIALLYL
. . : :..:...::.. ::: ::.:: : .. ..::..::::.:.:. :: ..:
CCDS74 MSMENKPLYQMRLLSEAFVIKGLSLERLPNSIASRFRLTEREEEVITCFERASWIAQVFL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QEIERVILSNIQNRSPKPGPAPHDQELGFFLETGLQRAHVLYFKNGNLTRGVGRFRELLR
::.:.. .: .: : : : : :: .:::..:: :.: .:.::...:. ..::.::
CCDS74 QELEKTT-NNSTSRHLK-GCHPLDYELTYFLEAALQSAYVKNLKKGNIVKGMRELREVLR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 AVETRTTQNLRMTIARQLAEILLRGMCEQSYWNPLEDPPCQSPLDDPLRKGANTKTYTLT
.:::..:::... :..:: .::... :. ::.:: . :: . . : .. .
CCDS74 TVETKATQNFKVMAAKHLAGVLLHSLSEECYWSPL-----SHPLPEFMGKEESSFATQAL
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 RRARVYSGENIFCPQENTEEALLLLLISESMANRDAVLSRIPEHKSDRLISLQSASVVYD
:. ..: :.:..::..: ::::::::::::::.::.::::.::.. :: .:::.:...::
CCDS74 RKPHLYEGDNLYCPKDNIEEALLLLLISESMATRDVVLSRVPEQEEDRTVSLQNAAAIYD
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 LLTIALGRRGQYEMLSECLERAMKFAFEEFHLWYQFALSLMAAGKSARAVKVLKECIRLK
::.:.::::::: :::::::::::::: ::::::: :::..: :::: ::..:.::..:.
CCDS74 LLSITLGRRGQYVMLSECLERAMKFAFGEFHLWYQVALSMVACGKSAYAVSLLRECVKLR
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 PDDATIPLLAAKLCMGSLHWLEEAEKFAKTVVDVGEKTSEFKAKGYLALGLTYSLQATDA
:.: :.::.:::.:.:::.::::::.:: :...::...:: :::::::::::::::::
CCDS74 PSDPTVPLMAAKVCIGSLRWLEEAEHFAMMVISLGEEAGEFLPKGYLALGLTYSLQATDA
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 SLRGMQEVLQRKALLAFQRAHSLSPTDHQAAFYLALQLAISRQIPEALGYVRQALQLQGD
.:.. :. :.:::: ...::..:.:.: :. .:..::::. ::: :. ...::... :
CCDS74 TLKSKQDELHRKALQTLERAQQLAPSDPQVILYVSLQLALVRQISSAMEQLQEALKVRKD
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 DANSLHLLALLLSAQKHYHDALNIIDMALSEYPENFILLFSKVKLQSLCRGPDEALLTCK
::..:::::::.:::::.. ::....::..:.:::: :.:.::::... .::.:::.::.
CCDS74 DAHALHLLALLFSAQKHHQHALDVVNMAITEHPENFNLMFTKVKLEQVLKGPEEALVTCR
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 HMLQIWKSCYNLTNPSDSGRGSSLLDRTIADRRQLNTITLPDFSDPETGSVHATSVAASR
..:..:.. :.... . . .:. . ... .:::: : ..:: .:.:.::::
CCDS74 QVLRLWQTLYSFSQLGGLEKDGSFGEGLTMKKQSGMHLTLPDAHDADSGSRRASSIAASR
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 VEQALSEVASSLQSSAPKQGPLHPWMTLAQIWLHAAEVYIGIGKPAEATACTQEAANLFP
.:.:.::. .. ::. ::::.. : :: ::::.:::... . :: : ::::.:::
CCDS74 LEEAMSEL--TMPSSVLKQGPMQLWTTLEQIWLQAAELFMEQQHLKEAGFCIQEAAGLFP
660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 MSHNVLYMRGQIAELRGSMDEARRWYEEALAISPTHVKSMQRLALILHQLGRYSLAEKIL
::.::::::..::..:...::.. :.:::...: :. :. :.:.: .::. :::.:.:
CCDS74 TSHSVLYMRGRLAEVKGNLEEAKQLYKEALTVNPDGVRIMHSLGLMLSRLGHKSLAQKVL
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 RDAVQVNSTAHEVWNGLGEVLQAQGNDAAATECFLTALELEASSPAVPFTIIPRVL
::::. .:: ::.:.::::::::::.. ::..:::::::::::::..::.:::: :
CCDS74 RDAVERQSTCHEAWQGLGEVLQAQGQNEAAVDCFLTALELEASSPVLPFSIIPREL
770 780 790 800 810 820
>>CCDS33193.1 TTC7A gene_id:57217|Hs108|chr2 (858 aa)
initn: 2604 init1: 1447 opt: 2712 Z-score: 3129.9 bits: 590.2 E(32554): 5.1e-168
Smith-Waterman score: 2796; 50.1% identity (80.2% similar) in 867 aa overlap (1-843:1-858)
10 20 30
pF1KB7 MATKKA-GSRL--ETEIERCRSECQWERIPELVKQL----------------SAKLI--A
::.: : :: : :.:.::::.: .:.:.::::.:: :: .
CCDS33 MAAKGAHGSYLKVESELERCRAEGHWDRMPELVRQLQTLSMPGGGGNRRGSPSAAFTFPD
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 NDDMAELLLGESKLEQYLKE-HPLRQGASPRGPK--PQLTEVRKHLTAALDRGNLKSEFL
.::...:::.:. ::: ::: : . . : : :...:....:.. :..: :. ...
CCDS33 TDDFGKLLLAEALLEQCLKENHAKIKDSMPLLEKNEPKMSEAKNYLSSILNHGRLSPQYM
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 QESNLIMAKLNYVEGDYKEALNIYARVGLDDLPLTAVPPYRLRVIAEAYATKGLCLEKLP
:. ::..::.::::.:..:...:::.:.::. . : :..:...::.. ::: ::.::
CCDS33 CEAMLILGKLHYVEGSYRDAISMYARAGIDDMSMENKPLYQMRLLSEAFVIKGLSLERLP
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 ISSSTSNLHVDREQDVITCYEKAGDIALLYLQEIERVILSNIQNRSPKPGPAPHDQELGF
: .. ..::..::::.:.:. :: ..:::.:.. .: .: : : : : :: .
CCDS33 NSIASRFRLTEREEEVITCFERASWIAQVFLQELEKTT-NNSTSRHLK-GCHPLDYELTY
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 FLETGLQRAHVLYFKNGNLTRGVGRFRELLRAVETRTTQNLRMTIARQLAEILLRGMCEQ
:::..:: :.: .:.::...:. ..::.::.:::..:::... :..:: .::... :.
CCDS33 FLEAALQSAYVKNLKKGNIVKGMRELREVLRTVETKATQNFKVMAAKHLAGVLLHSLSEE
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 SYWNPLEDPPCQSPLDDPLRKGANTKTYTLTRRARVYSGENIFCPQENTEEALLLLLISE
::.:: . :: . . : .. . :. ..: :.:..::..: :::::::::::
CCDS33 CYWSPL-----SHPLPEFMGKEESSFATQALRKPHLYEGDNLYCPKDNIEEALLLLLISE
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 SMANRDAVLSRIPEHKSDRLISLQSASVVYDLLTIALGRRGQYEMLSECLERAMKFAFEE
:::.::.::::.::.. :: .:::.:...::::.:.::::::: :::::::::::::: :
CCDS33 SMATRDVVLSRVPEQEEDRTVSLQNAAAIYDLLSITLGRRGQYVMLSECLERAMKFAFGE
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 FHLWYQFALSLMAAGKSARAVKVLKECIRLKPDDATIPLLAAKLCMGSLHWLEEAEKFAK
:::::: :::..: :::: ::..:.::..:.:.: :.::.:::.:.:::.::::::.::
CCDS33 FHLWYQVALSMVACGKSAYAVSLLRECVKLRPSDPTVPLMAAKVCIGSLRWLEEAEHFAM
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 TVVDVGEKTSEFKAKGYLALGLTYSLQATDASLRGMQEVLQRKALLAFQRAHSLSPTDHQ
:...::...:: :::::::::::::::::.:.. :. :.:::: ...::..:.:.: :
CCDS33 MVISLGEEAGEFLPKGYLALGLTYSLQATDATLKSKQDELHRKALQTLERAQQLAPSDPQ
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KB7 AAFYLALQLAISRQIPEALGYVRQALQLQGDDANSLHLLALLLSAQKHYHDALNIIDMAL
. .:..::::. ::: :. ...::... :::..:::::::.:::::.. ::....::.
CCDS33 VILYVSLQLALVRQISSAMEQLQEALKVRKDDAHALHLLALLFSAQKHHQHALDVVNMAI
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KB7 SEYPENFILLFSKVKLQSLCRGPDEALLTCKHMLQIWKSCYNLTNPSDSGRGSSLLDRTI
.:.:::: :.:.::::... .::.:::.::...:..:.. :.... . . .:. .
CCDS33 TEHPENFNLMFTKVKLEQVLKGPEEALVTCRQVLRLWQTLYSFSQLGGLEKDGSFGEGLT
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KB7 ADRRQLNTITLPDFSDPETGSVHATSVAASRVEQALSEVASSLQSSAPKQGPLHPWMTLA
... .:::: : ..:: .:.:.::::.:.:.::. .. ::. ::::.. : ::
CCDS33 MKKQSGMHLTLPDAHDADSGSRRASSIAASRLEEAMSEL--TMPSSVLKQGPMQLWTTLE
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KB7 QIWLHAAEVYIGIGKPAEATACTQEAANLFPMSHNVLYMRGQIAELRGSMDEARRWYEEA
::::.:::... . :: : ::::.::: ::.::::::..::..:...::.. :.::
CCDS33 QIWLQAAELFMEQQHLKEAGFCIQEAAGLFPTSHSVLYMRGRLAEVKGNLEEAKQLYKEA
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800 810
pF1KB7 LAISPTHVKSMQRLALILHQLGRYSLAEKILRDAVQVNSTAHEVWNGLGEVLQAQGNDAA
:...: :. :. :.:.: .::. :::.:.:::::. .:: ::.:.::::::::::.. :
CCDS33 LTVNPDGVRIMHSLGLMLSRLGHKSLAQKVLRDAVERQSTCHEAWQGLGEVLQAQGQNEA
780 790 800 810 820 830
820 830 840
pF1KB7 ATECFLTALELEASSPAVPFTIIPRVL
:..:::::::::::::..::.:::: :
CCDS33 AVDCFLTALELEASSPVLPFSIIPREL
840 850
>>CCDS74511.1 TTC7A gene_id:57217|Hs108|chr2 (882 aa)
initn: 2608 init1: 1353 opt: 1980 Z-score: 2283.5 bits: 433.6 E(32554): 7.2e-121
Smith-Waterman score: 2763; 49.3% identity (78.7% similar) in 891 aa overlap (1-843:1-882)
10 20 30
pF1KB7 MATKKA-GSRL--ETEIERCRSECQWERIPELVKQL----------------SAKLI--A
::.: : :: : :.:.::::.: .:.:.::::.:: :: .
CCDS74 MAAKGAHGSYLKVESELERCRAEGHWDRMPELVRQLQTLSMPGGGGNRRGSPSAAFTFPD
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 NDDMAELLLGESKLEQYLKE-HPLRQGASPRGPK--PQLTEVRKHLTAALDRGNLKSEFL
.::...:::.:. ::: ::: : . . : : :...:....:.. :..: :. ...
CCDS74 TDDFGKLLLAEALLEQCLKENHAKIKDSMPLLEKNEPKMSEAKNYLSSILNHGRLSPQYM
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 QESNLIMAKLNYVEGDYKEALNIYARVGLDDLPLTAVPPYRLRVIAEAYATKGLCLEKLP
:. ::..::.::::.:..:...:::.:.::. . : :..:...::.. ::: ::.::
CCDS74 CEAMLILGKLHYVEGSYRDAISMYARAGIDDMSMENKPLYQMRLLSEAFVIKGLSLERLP
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 ISSSTSNLHVDREQDVITCYEKAGDIALLYLQEIERVILSNIQNRSPKPGPAPHDQELGF
: .. ..::..::::.:.:. :: ..:::.:.. .: .: : : : : :: .
CCDS74 NSIASRFRLTEREEEVITCFERASWIAQVFLQELEKTT-NNSTSRHLK-GCHPLDYELTY
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 FLETGLQRAHVLYFKNGNLTRGVGRFRELLRAVETRTTQNLRMTIARQLAEILLRGMCEQ
:::..:: :.: .:.::...:. ..::.::.:::..:::... :..:: .::... :.
CCDS74 FLEAALQSAYVKNLKKGNIVKGMRELREVLRTVETKATQNFKVMAAKHLAGVLLHSLSEE
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 SYWNPLEDPPCQSPLDDPLRKGANTKTYTLTRRARVYSGENIFCPQENTEEALLLLLISE
::.:: . :: . . : .. . :. ..: :.:..::..: :::::::::::
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