FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7355, 1088 aa 1>>>pF1KB7355 1088 - 1088 aa - 1088 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6202+/-0.000529; mu= 19.8148+/- 0.033 mean_var=61.5949+/-12.245, 0's: 0 Z-trim(105.7): 65 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.163419 statistics sampled from 13834 (13886) to 13834 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.492), E-opt: 0.2 (0.163), width: 16 Scan time: 11.070 The best scores are: opt bits E(85289) NP_075048 (OMIM: 606141) ran-binding protein 17 [H (1088) 7138 1692.6 0 XP_011532929 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding (1092) 7120 1688.3 0 XP_011532933 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding (1090) 7099 1683.4 0 XP_016865226 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding (1094) 7081 1679.1 0 XP_016865232 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding (1010) 6601 1566.0 0 XP_016865231 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 986) 6436 1527.1 0 XP_016865230 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 990) 6418 1522.8 0 XP_016865225 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding (1052) 5121 1217.0 0 XP_016865234 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 792) 5078 1206.9 0 NP_055839 (OMIM: 606140) exportin-7 [Homo sapiens] (1087) 5027 1194.9 0 XP_016868735 (OMIM: 606140) PREDICTED: exportin-7 (1088) 5005 1189.7 0 XP_016865233 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 746) 4863 1156.2 0 XP_016865229 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 999) 4774 1135.2 0 XP_016865228 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding (1039) 4774 1135.2 0 XP_016865227 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding (1043) 4756 1131.0 0 XP_016868734 (OMIM: 606140) PREDICTED: exportin-7 (1096) 4291 1021.4 0 XP_016868733 (OMIM: 606140) PREDICTED: exportin-7 (1097) 4291 1021.4 0 XP_016865235 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 580) 3735 890.2 0 XP_011532939 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 576) 3734 890.0 0 XP_011532938 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 588) 3734 890.0 0 XP_016865236 (OMIM: 606141) PREDICTED: ran-binding ( 549) 3396 810.3 0 XP_016868736 (OMIM: 606140) PREDICTED: exportin-7 ( 754) 2596 621.7 5e-177 XP_011533499 (OMIM: 611449) PREDICTED: exportin-4 (1077) 220 61.6 2.9e-08 XP_005266559 (OMIM: 611449) PREDICTED: exportin-4 (1077) 220 61.6 2.9e-08 XP_005266560 (OMIM: 611449) PREDICTED: exportin-4 (1037) 219 61.3 3.4e-08 NP_071904 (OMIM: 611449) exportin-4 [Homo sapiens] (1151) 219 61.3 3.7e-08 XP_005266561 (OMIM: 611449) PREDICTED: exportin-4 ( 861) 180 52.1 1.7e-05 XP_016876195 (OMIM: 611449) PREDICTED: exportin-4 ( 875) 180 52.1 1.7e-05 XP_016876193 (OMIM: 611449) PREDICTED: exportin-4 ( 976) 148 44.6 0.0035 XP_011533502 (OMIM: 611449) PREDICTED: exportin-4 ( 972) 146 44.1 0.0048 XP_016876194 (OMIM: 611449) PREDICTED: exportin-4 ( 972) 146 44.1 0.0048 XP_011533501 (OMIM: 611449) PREDICTED: exportin-4 ( 972) 146 44.1 0.0048 XP_011533500 (OMIM: 611449) PREDICTED: exportin-4 ( 972) 146 44.1 0.0048 >>NP_075048 (OMIM: 606141) ran-binding protein 17 [Homo (1088 aa) initn: 7138 init1: 7138 opt: 7138 Z-score: 9083.9 bits: 1692.6 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 7138; 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