Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7360
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7360, 307 aa
1>>>pF1KB7360 307 - 307 aa - 307 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8330+/-0.00123; mu= 12.2537+/- 0.071
mean_var=153.2453+/-50.407, 0's: 0 Z-trim(103.1): 380 B-trim: 909 in 2/48
Lambda= 0.103605
statistics sampled from 6762 (7262) to 6762 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.568), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16
Scan time: 2.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 2027 315.7 2.9e-86
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 1779 278.6 4.2e-75
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 1759 275.6 3.3e-74
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1315 209.3 3.2e-54
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 1268 202.2 4.1e-52
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1205 192.8 2.9e-49
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1192 190.9 1.1e-48
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 1148 184.3 1e-46
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1142 183.4 1.9e-46
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1133 182.1 4.9e-46
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 1124 180.7 1.2e-45
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1123 180.6 1.4e-45
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 1100 177.1 1.5e-44
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 1095 176.4 2.5e-44
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1089 175.5 4.7e-44
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 1076 173.5 1.8e-43
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 1072 173.0 2.8e-43
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1067 172.3 5.1e-43
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 1063 171.6 6.9e-43
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1063 171.6 7.3e-43
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 1057 170.7 1.3e-42
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1056 170.6 1.5e-42
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1051 169.8 2.4e-42
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1051 169.9 2.5e-42
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1047 169.2 3.6e-42
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1045 168.9 4.4e-42
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 1043 168.6 5.4e-42
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1041 168.3 7e-42
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 1035 167.4 1.2e-41
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 1033 167.1 1.5e-41
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1033 167.1 1.5e-41
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 1032 167.0 1.7e-41
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 1025 165.9 3.5e-41
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 1016 164.6 9e-41
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 1016 164.6 9e-41
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 1016 164.6 9e-41
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 1013 164.1 1.2e-40
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 1011 163.8 1.5e-40
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 1009 163.5 1.8e-40
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 1005 162.9 2.8e-40
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 999 162.0 5.2e-40
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 996 161.6 7e-40
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 986 160.1 2e-39
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 981 159.3 3.4e-39
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 980 159.2 3.8e-39
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 972 158.0 8.5e-39
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 930 151.7 6.8e-37
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 927 151.3 9.1e-37
CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 ( 328) 927 151.3 9.4e-37
CCDS31705.1 OR10G7 gene_id:390265|Hs108|chr11 ( 311) 907 148.3 7.2e-36
>>CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 (307 aa)
initn: 2027 init1: 2027 opt: 2027 Z-score: 1662.2 bits: 315.7 E(32554): 2.9e-86
Smith-Waterman score: 2027; 100.0% identity (100.0% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MESENRTVIREFILLGLTQSQDIQLLVFVLVLIFYFIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MESENRTVIREFILLGLTQSQDIQLLVFVLVLIFYFIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSAKKIISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSAKKIISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYIAICRPLHYPTVMNPRTCYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DRYIAICRPLHYPTVMNPRTCYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VPQVIKLACTDTFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCRIRGSSSEAKNKAMSTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VPQVIKLACTDTFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCRIRGSSSEAKNKAMSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 ITHIIVIFFMFGPGIFIYTRPFRAFPADKVVSLFHTVIFPLLNPVIYTLRNQEVKASMKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ITHIIVIFFMFGPGIFIYTRPFRAFPADKVVSLFHTVIFPLLNPVIYTLRNQEVKASMKK
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VFNKHIA
:::::::
CCDS32 VFNKHIA
>>CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 (316 aa)
initn: 1804 init1: 1769 opt: 1779 Z-score: 1461.8 bits: 278.6 E(32554): 4.2e-75
Smith-Waterman score: 1779; 85.9% identity (95.8% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MESENRTVIREFILLGLTQSQDIQLLVFVLVLIFYFIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
:. : ::. ::::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::.::::::::::
CCDS32 MKIANNTVVTEFILLGLTQSQDIQLLVFVLILIFYLIILPGNFLIIFTIRSDPGLTAPLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSAKKIISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
.:::::::::::::::::::::::::: ::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSEKKVISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYIAICRPLHYPTVMNPRTCYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD
::::::::::: ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DRYIAICRPLHCSTVMNPRACYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VPQVIKLACTDTFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCRIRGSSSEAKNKAMSTC
: ::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::..: ..::.::::::::
CCDS32 VRQVIKLACTDMFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCHVRRAASEGKNKAMSTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 ITHIIVIFFMFGPGIFIYTRPFRAFPADKVVSLFHTVIFPLLNPVIYTLRNQEVKASMKK
:..:.:..::::.:::: ::::.::::.:::::::::::.::.::::::::::.:::.
CCDS32 TTRVIIILLMFGPAIFIYMCPFRALPADKMVSLFHTVIFPLMNPMIYTLRNQEVKTSMKR
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VFNKHIA
....:.
CCDS32 LLSRHVVCQVDFIIRN
310
>>CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 (308 aa)
initn: 1794 init1: 1759 opt: 1759 Z-score: 1445.7 bits: 275.6 E(32554): 3.3e-74
Smith-Waterman score: 1759; 84.6% identity (96.1% similar) in 306 aa overlap (1-306:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MESENRTVIREFILLGLTQSQDIQLLVFVLVLIFYFIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
::..: ::. :::::::::::: ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS32 METQNLTVVTEFILLGLTQSQDAQLLVFVLVLIFYLIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSAKKIISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
:::::::.:::::::::.::::::::: ::.::::.::::::::::::.:: .:::::::
CCDS32 FFLGNLALLDASYSFIVVPRMLVDFLSEKKVISYRSCITQLFFLHFLGAGEMFLLVVMAF
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130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYIAICRPLHYPTVMNPRTCYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD
:::::::::::: :.::::.:::. :.::::::.:::.::.:::.:::::::::::::::
CCDS32 DRYIAICRPLHYSTIMNPRACYALSLVLWLGGFIHSIVQVALILHLPFCGPNQLDNFFCD
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190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VPQVIKLACTDTFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCRIRGSSSEAKNKAMSTC
::::::::::.::::::::: ::::..::::::::::::::::::: :::.:.::.:::
CCDS32 VPQVIKLACTNTFVVELLMVSNSGLLSLLCFLGLLASYAVILCRIREHSSEGKSKAISTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 ITHIIVIFFMFGPGIFIYTRPFRAFPADKVVSLFHTVIFPLLNPVIYTLRNQEVKASMKK
::::.::.::::.::::: ::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::.:
CCDS32 TTHIIIIFLMFGPAIFIYTCPFQAFPADKVVSLFHTVIFPLMNPVIYTLRNQEVKASMRK
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VFNKHIA
....:.
CCDS32 LLSQHMFC
>>CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 (313 aa)
initn: 1305 init1: 970 opt: 1315 Z-score: 1087.0 bits: 209.3 E(32554): 3.2e-54
Smith-Waterman score: 1315; 59.4% identity (85.4% similar) in 308 aa overlap (1-306:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MESENRTVIREFILLGLTQSQDIQLLVFVLVLIFYFIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
::. : : . ::.: ::.:....::..::. : ::..:::::.::: ::. :: ::.:.:
CCDS32 METANYTKVTEFVLTGLSQTREVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTIRLDPHLTSPMY
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pF1KB7 FFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSAKKIISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
:.:.:::.:: :: :.::.::.::. .::::. :::.:::::::.:..: .::.:::.
CCDS32 FLLANLALLDIWYSSITAPKMLIDFFVERKIISFGGCIAQLFFLHFVGASEMFLLTVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYIAICRPLHYPTVMNPRTCYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD
::: :::::::: :.:: : : .. :.:::.::::::.::.::::::::.::..:::
CCDS32 DRYAAICRPLHYATIMNRRLCCILVALSWMGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSYFCD
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pF1KB7 VPQVIKLACTDTFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCRIR--GSSSEAKNKAMS
. ::...::..:: ::.:. .:::....::..:: ::: .: .. ..:.: :.:::
CCDS32 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCFIALLMSYAFLLALLKKHSGSGENTNRAMS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 TCITHIIVIFFMFGPGIFIYTRPFRAFPADKVVSLFHTVIFPLLNPVIYTLRNQEVKASM
:: .:: .. .::::.:.::.::: .: :::::.:::::::::::.::::::.::::.:
CCDS32 TCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLDKVVSVFHTVIFPLLNPIIYTLRNKEVKAAM
250 260 270 280 290 300
300
pF1KB7 KKVFNKHIA
.:: .:.:
CCDS32 RKVVTKYILCEEK
310
>>CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 (313 aa)
initn: 1256 init1: 946 opt: 1268 Z-score: 1049.0 bits: 202.2 E(32554): 4.1e-52
Smith-Waterman score: 1268; 58.1% identity (83.8% similar) in 308 aa overlap (1-306:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MESENRTVIREFILLGLTQSQDIQLLVFVLVLIFYFIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
::. : : . ::.: ::.:. ..::..::. : ::..:::::.::: ::. :: ::.:.:
CCDS32 METANYTKVTEFVLTGLSQTPEVQLVLFVIFLSFYLFILPGNILIICTISLDPHLTSPMY
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 FFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSAKKIISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
:.:.:::::: :: :.::.::.::. .::::. :::.::::::: :..: .::.::::
CCDS32 FLLANLAFLDIWYSSITAPEMLIDFFVERKIISFDGCIAQLFFLHFAGASEMFLLTVMAF
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pF1KB7 DRYIAICRPLHYPTVMNPRTCYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD
: : :::::::: :.:: : : .. : :::.::::::.::.::::::::.::..:::
CCDS32 DLYTAICRPLHYATIMNQRLCCILVALSWRGGFIHSIIQVALIVRLPFCGPNELDSYFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KB7 VPQVIKLACTDTFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCRIR--GSSSEAKNKAMS
. ::...::..:: ::.:. .:::....:...:: ::: .: .. ..:.: :.:::
CCDS32 ITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCLIALLMSYAFLLALFKKLSGSGENTNRAMS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 TCITHIIVIFFMFGPGIFIYTRPFRAFPADKVVSLFHTVIFPLLNPVIYTLRNQEVKASM
:: .:: .. .::::.:.::.::: .: :::::.:.:.:::: ::.::::::.::::.:
CCDS32 TCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLDKVVSVFNTLIFPLRNPIIYTLRNKEVKAAM
250 260 270 280 290 300
300
pF1KB7 KKVFNKHIA
.:. .:.:
CCDS32 RKLVTKYILCKEK
310
>>CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 1206 init1: 1183 opt: 1205 Z-score: 998.1 bits: 192.8 E(32554): 2.9e-49
Smith-Waterman score: 1205; 54.9% identity (82.2% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MESENRTVIREFILLGLTQSQDIQLLVFVLVLIFYFIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY
:. :.. . :.::::.: ..... :.. ::. . ::.::. . ::: : . .:
CCDS31 MNPANHSQVAGFVLLGLSQVWELRFVFFTVFSAVYFMTVVGNLLIVVIVTSDPHLHTTMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSAKKIISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF
:.::::.::: :: :.:::::::.::.. ::. ::.:::::.::.:: . .::.:::.
CCDS31 FLLGNLSFLDFCYSSITAPRMLVDLLSGNPTISFGGCLTQLFFFHFIGGIKIFLLTVMAY
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CCDS41 LRQRQVFFTKSYT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]