FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7360, 307 aa 1>>>pF1KB7360 307 - 307 aa - 307 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1941+/-0.000482; mu= 16.0542+/- 0.030 mean_var=107.4773+/-28.828, 0's: 0 Z-trim(108.8): 304 B-trim: 2154 in 2/50 Lambda= 0.123713 statistics sampled from 16420 (16917) to 16420 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.539), E-opt: 0.2 (0.198), width: 16 Scan time: 6.720 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1057 200.2 4.5e-51 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 827 159.1 1e-38 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 827 159.1 1e-38 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 826 159.0 1.2e-38 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 821 158.1 2.2e-38 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 797 153.8 4.2e-37 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 781 150.9 3.1e-36 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 781 150.9 3.1e-36 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 781 150.9 3.1e-36 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 780 150.7 3.4e-36 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 780 150.7 3.4e-36 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 780 150.7 3.4e-36 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 780 150.8 3.5e-36 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 773 149.5 8.2e-36 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 772 149.3 9.1e-36 NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 772 149.3 9.3e-36 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 765 148.1 2.2e-35 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 757 146.6 5.8e-35 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 751 145.6 1.2e-34 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 751 145.6 1.2e-34 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 553 110.2 5.5e-24 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 488 98.6 1.7e-20 NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 203 47.8 3.7e-05 NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 194 46.2 0.00011 NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 195 46.5 0.00012 XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 195 46.6 0.00013 NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 186 44.8 0.0003 NP_005192 (OMIM: 601834) C-C chemokine receptor ty ( 355) 184 44.4 0.00039 NP_001471 (OMIM: 600377) galanin receptor type 1 [ ( 349) 182 44.1 0.0005 NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 179 43.5 0.0007 NP_001041 (OMIM: 182452) somatostatin receptor typ ( 369) 177 43.2 0.00095 NP_000697 (OMIM: 600821) vasopressin V1a receptor ( 418) 176 43.1 0.0012 NP_062874 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 432) 174 42.7 0.0015 NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364) 173 42.5 0.0016 NP_000863 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 445) 174 42.8 0.0016 NP_062873 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 479) 174 42.8 0.0016 NP_064445 (OMIM: 300822,303700,303900) long-wave-s ( 364) 172 42.3 0.0018 XP_005265876 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 328) 171 42.1 0.0019 XP_006714884 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 331) 171 42.1 0.0019 XP_005265875 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 366) 171 42.1 0.002 XP_011532740 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 389) 171 42.2 0.0021 XP_011532739 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 402) 171 42.2 0.0021 NP_000670 (OMIM: 104220) alpha-1B adrenergic recep ( 520) 171 42.3 0.0025 XP_011532737 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 556) 171 42.3 0.0026 NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 168 41.5 0.0027 NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 168 41.5 0.0027 NP_001025186 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 2 [ ( 489) 170 42.1 0.0027 XP_016872444 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 539) 170 42.1 0.0029 NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 168 41.6 0.003 NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 168 41.6 0.003 >>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa) initn: 1076 init1: 1057 opt: 1057 Z-score: 1038.0 bits: 200.2 E(85289): 4.5e-51 Smith-Waterman score: 1057; 47.8% identity (80.7% similar) in 301 aa overlap (4-304:2-302) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MESENRTVIREFILLGLTQSQDIQLLVFVLVLIFYFIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY :::. . ::.:::::.. .: ..::. ...:.: . : ::. :: ..:.: .:.: NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMY 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 FFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSAKKIISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF . :. :.:.:: :: . .: ... : .:: : . ::.::.: ::.::.::.::.:::. 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NP_001 LCSRKDISGDK 300 >>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa) initn: 764 init1: 655 opt: 827 Z-score: 816.1 bits: 159.1 E(85289): 1e-38 Smith-Waterman score: 827; 40.6% identity (76.1% similar) in 293 aa overlap (12-301:15-307) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MESENRTVIREFILLGLTQSQDIQLLVFVLVLIFYFIILPGNFLIIFTIKSDPGLTA :::.:... .....::.:::::.. : ::..::. : : . NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 PLYFFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSAKKIISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVV :.::::.::.::: :. :..::.. . .: ::: ::. ::.:. :: : .:::: NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 MAFDRYIAICRPLHYPTVMNPRTCYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNF :..::: :.:::::: ..:.:: :. . .: :..::..: .. . . .:.:: :.:.: NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 FCDVPQVIKLACTDTFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASY-AVILCRIRGSSSEAKNKA ::.:: ...:.:.:: : :: ....:....:. .. .:.:: :.. .: .:. . .:. NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 MSTCITHIIVIFFMFGPGIFIYTRPFRAFPAD--KVVSLFHTVIFPLLNPVIYTLRNQEV ..:: .:.... ..: :.. .: .: . : : ..::.::. : :::.::::::. : NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV 250 260 270 280 290 300 300 pF1KB7 KASMKKVFNKHIA ....:.. NP_001 RGAVKRLMGWE 310 >>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa) initn: 796 init1: 611 opt: 827 Z-score: 816.0 bits: 159.1 E(85289): 1e-38 Smith-Waterman score: 827; 40.3% identity (73.7% similar) in 308 aa overlap (5-307:5-311) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MESENRTVIREFILLGLTQ-SQDIQLLVFVLVLIFYFIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPL : : : ::::..... .:: :.:. : .:.. : :: :::.. .:: : .:. NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 YFFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSAKKIISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMA :::: ::.::. .......:.:: .:. ::. :: ::..:. :.: .: .::..:: NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 FDRYIAICRPLHYPTVMNPRTCYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFC .:::.::: :::::..:: :: . : :. :: . .:.. .. .:::: :....::: NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 DVPQVIKLACTDTFVVELLMVFNSGLMTLL-CFLGLLASYAVILCRI-RGSSSEAKNKAM : : :.::.:.:: . :. . .. :.... :.: .: ::. : : . :...:.::. NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLL-ILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAF 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 STCITHIIVI--FFMFGPGIFIYTRPFRAFPADKVVSLFHTVIFPLLNPVIYTLRNQEVK ::: .:..:. :.. . ... . . . :..:: .::. :.:::.::.:::.::: NP_835 STCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVK 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 ASMKKVFNKHIA .....:.: .: NP_835 NALSRTFHKVLALRNCIP 300 310 >>NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [Homo (327 aa) initn: 634 init1: 399 opt: 826 Z-score: 814.9 bits: 159.0 E(85289): 1.2e-38 Smith-Waterman score: 826; 43.3% identity (72.6% similar) in 307 aa overlap (1-298:1-306) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MESENRT-VIREFILLGLTQSQDIQLLVFVLVLIFYFIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPL :: .:.. . ::.:::. .:.:.:.:.:. : ..: : :::..:.. : :. NP_003 MEWRNHSGRVSEFVLLGFPAPAPLQVLLFALLLLAYVLVLTENTLIIMAIRNHSTLHKPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 YFFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSAKK----IISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLL ::::.:..::. : .. :.::. :...:. .::..::.:::.:. :: : .:: NP_003 YFFLANMSFLEIWYVTVTIPKMLAGFVGSKQDHGQLISFEGCMTQLYFFLGLGCTECVLL 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 VVMAFDRYIAICRPLHYPTVMNPRTCYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLD .:::.:::.::: :::::.... : : : . : ::: :...: :: : .:::: .. NP_003 AVMAYDRYMAICYPLHYPVIVSGRLCVQMAAGSWAGGFGISMVKVFLISGLSYCGPNIIN 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 NFFCDVPQVIKLACTDTFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLL-ASYAVILCRIRGSSSEA-K .::::: ...:.::: ..:: : ... :: :.. :::..: . : : . NP_003 HFFCDVSPLLNLSCTDMSTAELTD-FILAIFILLGPLSVTGASYVAITGAVMHIPSAAGR 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 NKAMSTCITHIIVIFFMFGPGIFIYTRP--FRAFPADKVVSLFHTVIFPLLNPVIYTLRN ::.::: .:. :...... .::::.:: . :: ..:.::....:: :::::.:: ::: NP_003 YKAFSTCASHLTVVIIFYAASIFIYARPKALSAFDTNKLVSVLYAVIVPLLNPIIYCLRN 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 QEVKASMKKVFNKHIA :::: .. NP_003 QEVKRALCCTLHLYQHQDPDPKKASRNV 300 310 320 >>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa) initn: 842 init1: 606 opt: 821 Z-score: 810.2 bits: 158.1 E(85289): 2.2e-38 Smith-Waterman score: 821; 39.0% identity (73.1% similar) in 305 aa overlap (5-306:7-311) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MESENRTVIREFILLGLTQSQDIQLLVFVLVLIFYFIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAP : :.. ::::::. ..:...:.. : .: ::: ::. ... :. :: : .: NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 LYFFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSAKKIISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVM .::::.::.:.: : ..:.:::.::: .: ::: :: :..:. .. :...:..: NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 AFDRYIAICRPLHYPTVMNPRTCYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFF :.:::.::: :: : .::. :. ... .::: . :.... . . : .: : ...:: NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 CDVPQVIKLACTDTFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCRI-RGSSSEAKNKAM ::.: ..::.:::: . : :. .. . ..::. .. :: :: . . : ...:.. NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 STCITHIIVIFFMFGPGIFIYTRPFRAF-P-ADKVVSLFHTVIFPLLNPVIYTLRNQEVK ::: .:. . .. : .:::.:: . : .::..:.:.:...:.:::.::.:::..:: NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK 250 260 270 280 290 300 300 pF1KB7 ASMKKVFNKHIA . .::. ... NP_006 DAAEKVLRSKVDSS 310 >>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa) initn: 786 init1: 635 opt: 797 Z-score: 787.1 bits: 153.8 E(85289): 4.2e-37 Smith-Waterman score: 797; 37.5% identity (76.2% similar) in 307 aa overlap (1-304:1-307) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MESENRTVIREFILLGLTQSQDIQLLVFVLVLIFYFIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY ::.:: : . .:.::::... ..: ..: : : .:.. . ::.:::....:: : .:.: NP_001 MEAENLTELSKFLLLGLSDDPELQPVLFGLFLSMYLVTVLGNLLIILAVSSDSHLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 FFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSAKKIISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF :::.::.:.: . ..:.:::.. . .: ::: ::.::..:: ...: . .::.:::. NP_001 FFLSNLSFVDICFISTTVPKMLVSIQARSKDISYMGCLTQVYFLMMFAGMDTFLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 DRYIAICRPLHYPTVMNPRTCYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD ::..:::.:::: ..::: : ..:: :. : :.....:. :: : ... .:::. NP_001 DRFVAICHPLHYTVIMNPCLCGLLVLASWFIIFWFSLVHILLMKRLTFSTGTEIPHFFCE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 VPQVIKLACTDTFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCRIRG-SSSEAKNKAMST ::.:.::..:.. .... ..:. .. :.: ::. :. . : ::...: ::.:: NP_001 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLMGMSSTKGKYKAFST 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 CITHIIVIFFMFGPGIFIYTRP--FRAFPADKVVSLFHTVIFPLLNPVIYTLRNQEVKAS : .:. :. ...: :. .: .. .....:...... :.::: ::.:::..::.. NP_001 CGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKGA 250 260 270 280 290 300 300 pF1KB7 MKKVFNKHIA ....... NP_001 LERLLSRADSCP 310 >>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa) initn: 754 init1: 586 opt: 781 Z-score: 771.6 bits: 150.9 E(85289): 3.1e-36 Smith-Waterman score: 781; 38.3% identity (72.4% similar) in 308 aa overlap (1-304:1-307) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MESENRTVIREFILLGLTQSQDIQLLVFVLVLIFYFIILPGNFLIIFTIKSDPGLTAPLY : ..:.: . :::::::... : .. .::: :..: . . :: ::.. :. : : .:.: NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 FFLGNLAFLDASYSFIVAPRMLVDFLSAKKIISYRGCITQLFFLHFLGGGEGLLLVVMAF ::: ::...:.::. :.:..:. ::. .: : ...: .:::: ::: : .::.:::. NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 DRYIAICRPLHYPTVMNPRTCYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD :::.:.: :.: ..:. : . .. :..::. : .:... ..::.: . .:.. :. 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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 DRYIAICRPLHYPTVMNPRTCYAMMLALWLGGFVHSIIQVVLILRLPFCGPNQLDNFFCD :::.:.: :.: ..:. : . .. :..::. : .:... ..::.: . .:.. :. XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 VPQVIKLACTDTFVVELLMVFNSGLMTLLCFLGLLASYAVILCRI-RGSSSEAKNKAMST . :..:::.:: :. .. .: .. . : .: :: :. : . .: :...::. : XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 CITHIIVIFFMFGPGIFIYTRPFRAFPA---DKVVSLFHTVIFPLLNPVIYTLRNQEVKA : .:. :. . .: .:: : .: . :. .:. :.:.... :.:::.::.:::.:::. 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