FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7377, 449 aa 1>>>pF1KB7377 449 - 449 aa - 449 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4826+/-0.000284; mu= 18.1511+/- 0.018 mean_var=85.8222+/-17.301, 0's: 0 Z-trim(120.5): 239 B-trim: 29 in 1/51 Lambda= 0.138444 statistics sampled from 35499 (35740) to 35499 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.76), E-opt: 0.2 (0.419), width: 16 Scan time: 10.440 The best scores are: opt bits E(85289) NP_963840 (OMIM: 612320) CUB domain-containing pro ( 449) 3209 650.3 2.9e-186 XP_011518012 (OMIM: 261100,602997) PREDICTED: cubi (2277) 768 163.4 5.8e-39 XP_011518011 (OMIM: 261100,602997) PREDICTED: cubi (2285) 768 163.4 5.8e-39 XP_011518013 (OMIM: 261100,602997) PREDICTED: cubi (2237) 767 163.1 6.6e-39 XP_011518010 (OMIM: 261100,602997) PREDICTED: cubi (2867) 747 159.2 1.3e-37 NP_001072 (OMIM: 261100,602997) cubilin precursor (3623) 747 159.3 1.5e-37 NP_037495 (OMIM: 607064) procollagen C-endopeptida ( 415) 494 108.0 4.8e-23 NP_001019800 (OMIM: 602069) neuropilin-1 isoform c ( 609) 397 88.8 4.3e-17 NP_001019799 (OMIM: 602069) neuropilin-1 isoform b ( 644) 397 88.8 4.5e-17 NP_001316997 (OMIM: 602069) neuropilin-1 isoform f ( 906) 397 88.9 5.9e-17 NP_001231902 (OMIM: 602069) neuropilin-1 isoform e ( 916) 397 88.9 5.9e-17 NP_001231901 (OMIM: 602069) neuropilin-1 isoform d ( 917) 397 88.9 5.9e-17 NP_003864 (OMIM: 602069) neuropilin-1 isoform a pr ( 923) 397 88.9 6e-17 XP_011518058 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 628) 392 87.8 8.9e-17 XP_011518057 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 656) 392 87.8 9.2e-17 XP_006717589 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 663) 392 87.8 9.3e-17 XP_006717588 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 888) 392 87.9 1.2e-16 XP_006717587 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 889) 392 87.9 1.2e-16 XP_016872354 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 899) 392 87.9 1.2e-16 XP_006717585 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 907) 392 87.9 1.2e-16 XP_006717584 (OMIM: 602069) PREDICTED: neuropilin- ( 924) 392 87.9 1.2e-16 NP_113621 (OMIM: 606227,609549,611040) membrane fr ( 579) 380 85.4 4.4e-16 NP_957716 (OMIM: 602070) neuropilin-2 isoform 6 pr ( 555) 370 83.4 1.7e-15 XP_016860677 (OMIM: 602070) PREDICTED: neuropilin- ( 848) 370 83.5 2.3e-15 XP_016860676 (OMIM: 602070) PREDICTED: neuropilin- ( 853) 370 83.5 2.4e-15 NP_957719 (OMIM: 602070) neuropilin-2 isoform 5 pr ( 901) 370 83.5 2.5e-15 XP_016860675 (OMIM: 602070) PREDICTED: neuropilin- ( 901) 370 83.5 2.5e-15 NP_061004 (OMIM: 602070) neuropilin-2 isoform 4 pr ( 906) 370 83.5 2.5e-15 NP_958436 (OMIM: 602070) neuropilin-2 isoform 3 pr ( 909) 370 83.5 2.5e-15 NP_003863 (OMIM: 602070) neuropilin-2 isoform 2 pr ( 926) 370 83.5 2.5e-15 XP_016860674 (OMIM: 602070) PREDICTED: neuropilin- ( 926) 370 83.5 2.5e-15 XP_005246990 (OMIM: 602070) PREDICTED: neuropilin- ( 931) 370 83.6 2.5e-15 XP_005246991 (OMIM: 602070) PREDICTED: neuropilin- ( 931) 370 83.6 2.5e-15 NP_957718 (OMIM: 602070) neuropilin-2 isoform 1 pr ( 931) 370 83.6 2.5e-15 NP_036597 (OMIM: 606743) tolloid-like protein 2 pr (1015) 331 75.8 5.9e-13 NP_001307573 (OMIM: 601969) deleted in malignant b (2412) 328 75.5 1.7e-12 XP_011537691 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (2541) 328 75.5 1.8e-12 XP_011530516 (OMIM: 606742,613087) PREDICTED: toll ( 837) 313 72.1 6.2e-12 XP_016864059 (OMIM: 606742,613087) PREDICTED: toll ( 964) 313 72.2 6.9e-12 NP_036596 (OMIM: 606742,613087) tolloid-like prote (1013) 313 72.2 7.2e-12 XP_016869220 (OMIM: 608397) PREDICTED: CUB and sus (3327) 312 72.4 2e-11 XP_011533054 (OMIM: 608397) PREDICTED: CUB and sus (3549) 312 72.4 2.1e-11 NP_150094 (OMIM: 608397) CUB and sushi domain-cont (3564) 312 72.4 2.1e-11 XP_011542919 (OMIM: 112264,614856) PREDICTED: bone ( 622) 298 69.0 4e-11 XP_011537717 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (1766) 303 70.4 4.4e-11 XP_011537716 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (1783) 303 70.4 4.4e-11 XP_016869227 (OMIM: 112264,614856) PREDICTED: bone ( 717) 298 69.1 4.4e-11 NP_004397 (OMIM: 601969) deleted in malignant brai (1785) 303 70.4 4.4e-11 NP_001190 (OMIM: 112264,614856) bone morphogenetic ( 730) 298 69.1 4.5e-11 XP_016871287 (OMIM: 601969) PREDICTED: deleted in (1990) 303 70.4 4.8e-11 >>NP_963840 (OMIM: 612320) CUB domain-containing protein (449 aa) initn: 3209 init1: 3209 opt: 3209 Z-score: 3465.0 bits: 650.3 E(85289): 2.9e-186 Smith-Waterman score: 3209; 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XP_011 SPYRSNTDCSWVIRVDRNHRVLLNFTDFDLEPQDSCIMAYDGL--SSTMSRLARTCGREQ 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 -PPTLVSLGHELQVVFKSDFNIGGRGFKAYYFSGECQEVYMAMRGNFSSPQYPSSYPNNI .:: :. : . :.: . .:::.: . .. .. . . :::..:..:::: XP_011 LANPIVSSGNSLFLRFQSGPSRQNRGFRAQFRQACGGHILTSSFDTVSSPRFPANYPNNQ 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 RCHWTIRL-PPGYQVKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNWCGHHL : : :. :: .. . : ..::. . :: : . .::. :.::: : .:: . XP_011 NCSWIIQAQPPLNHITLSFTHFELER----STTCARDFVEILDGGHEDAPLRGRYCGTDM 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KB7 PPPVTSSHNQLLLLLHTDRSTTRRGFSVAYIGGQLGCGSGSTEGEGEALQPQSLQSPSSI : :.:: . : : . .: : . :: .. .. .::. .:: .: :. XP_011 PHPITSFSSALTLRFVSDSSISAGGFHTTVTASVSACGGTFYMAEGIFNSPGY---PDIY 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 pF1KB7 PPV--CP----APPMNGL-LQLLLHWL---HPCPLSGPLRLDGTAPACF--HYCRASFPS :: : . : : : :... : . : . .:.: . . .:: ::: XP_011 PPNVECVWNIVSSPGNRLQLSFISFQLEDSQDCSRDFVEIREGNATGHLVGRYCGNSFPL 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 F XP_011 NYSSIVGHTLWVRFISDGSGSGTGFQATFMKIFGNDNIVGTHGKVASPFWPENYPHNSNY 480 490 500 510 520 530 >-- initn: 531 init1: 214 opt: 615 Z-score: 655.3 bits: 132.8 E(85289): 9.2e-30 Smith-Waterman score: 632; 32.4% identity (62.5% similar) in 355 aa overlap (14-358:1442-1789) 10 20 30 40 pF1KB7 MLAEWGACLLLAVALLGPGLQAQ-AMEGVKCGGVLSAPSGNFS .: : :. : . . :::.. . .:.. XP_011 PIIGQYCGNSNPRTIQSGSNQLVVTFNSDHSLQGGGFYATWNTQTLGCGGIFHSDNGTIR 1420 1430 1440 1450 1460 1470 50 60 70 80 90 100 pF1KB7 SPNFPRLYPYNTECSWLIVVAEGSSVLLTF-HAFDLEYHD-TCSFDFLEIYNGASPDKGN ::..:. .: :..::: .. ... . ..: . : . : :. .:.... :. XP_011 SPHWPQNFPENSRCSWTAITHKSKHLEISFDNNFLIPSGDGQCQNSFVKVWAGTEEVDKA 1480 1490 1500 1510 1520 1530 110 120 130 140 150 160 pF1KB7 LLGRFCGKVPPPPFTSSWHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQKDVCGGVLTGLSGVLTSPE ::. ::.: : : . ......:.: ... ..::::.. . ::. .:: :: . ::. XP_011 LLATGCGNVAPGPVITPSNTFTAVFQS-QEAPAQGFSASFVSR-CGSNFTGPSGYIISPN 1540 1550 1560 1570 1580 170 180 190 200 210 pF1KB7 YPNNYPNSMECHWVIRAAGPAHVKLVFVDFQVEGNEE----CTYDYVAVLGGPG--PTRG ::..: :.:.: .::.: . : :.::.:..:. :. : : .. : . : XP_011 YPKQYDNNMNCTYVIEANPLSVVLLTFVSFHLEARSAVTGSCVNDGVHIIRGYSVMSTPF 1590 1600 1610 1620 1630 1640 220 230 240 250 260 270 pF1KB7 HHYCGSTRPPTLVSLGHELQVVFKSDFNIGGRGFKAYYFSGECQEVYMAMRGNFSSPQYP ::. : :. : : . : :. .: ::: : : :. : ..:: : XP_011 ATVCGDEMPAPLTIAGPVL-LNFYSNEQITDFGFKFSYRIISCGGVFNFSSGIITSPAYS 1650 1660 1670 1680 1690 1700 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 -SSYPNNIRCHWTIRLPPGYQVKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLG ..:::...: .:: . ... : :.:. :.. .:. :.:: .:::. :::: XP_011 YADYPNDMHCLYTITVSDDKVIELKFSDFDVV-PST---SCSHDYLAIYDGANTSDPLLG 1710 1720 1730 1740 1750 1760 340 350 360 370 380 390 pF1KB7 NWCGHHLPPPVTSSHNQLLLLLHTDRSTTRRGFSVAYIGGQLGCGSGSTEGEGEALQPQS ..:: . :: : ::.:..::...:: XP_011 KFCGSKRPPNVKSSNNSMLLVFKTDSFQTAKGWKMSFRQTLGPQQGCGGYLTGSNNTFAS 1770 1780 1790 1800 1810 1820 >-- initn: 450 init1: 217 opt: 597 Z-score: 635.9 bits: 129.2 E(85289): 1.1e-28 Smith-Waterman score: 597; 29.4% identity (60.6% similar) in 343 aa overlap (29-358:1105-1440) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MLAEWGACLLLAVALLGPGLQAQAMEGVKCGGVLSAPSGNFSSPNFPRLYPYNTECSW .::: :.. :.:.:::.: :.. : : XP_011 TSSNTAVVRFVTDGSVTASGFRLRFESSMEECGGDLQGSIGTFTSPNYPNPNPHGRICEW 1080 1090 1100 1110 1120 1130 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 LIVVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVP-PPPFTSS :.. :: . : :. . : : .:. . . ..:: .. .: ..:..: . :: XP_011 RITAPEGRRITLMFNNLRLATHPSCNNEHVIVFNGIRSNSPQLE-KLCSSVNVSNEIKSS 1140 1150 1160 1170 1180 1190 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 WHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQKD---VCGGVLTGLS-GVLTSPEYPN--NYPNSMEC ..:.::: .: ::.:.: .. :::: : . : .::: : . :: ...: XP_011 GNTMKVIFFTDGSRPYGGFTASYTSSEDAVCGGSLPNTPEGNFTSPGYDGVRNYSRNLNC 1200 1210 1220 1230 1240 1250 180 190 200 210 220 pF1KB7 HWVIRAA--GPAHVKLVFVDFQVEGNEECTYDYVAVLGGP--GPTRGHHYCGSTRP--PT .:.. : . ... : :: .:....: .: . : :: . :: ..: : XP_011 EWTLSNPNQGNSSISIHFEDFYLESHQDCQFDVLEFRVGDADGPLMWR-LCGPSKPTLPL 1260 1270 1280 1290 1300 1310 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 LVSLGHELQVVFKSDFNIGGRGFKAYYFSGECQEVYMAMRGNFSSPQYPSSYPNNIRCHW .. . .. . : .. . ::.: : .: . .. : ..::.::..: . .: XP_011 VIPYS-QVWIHFVTNERVEHIGFHAKYSFTDCGGIQIGDSGVITSPNYPNAYDSLTHCSS 1320 1330 1340 1350 1360 1370 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 TIRLPPGYQVKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNWCGHHLPPPVT .. : :. . . : :.:.: :.. :: .: ... .:.: :.:..:..::. : . XP_011 LLEAPQGHTITLTFSDFDIE-PHT---TCAWDSVTVRNGGSPESPIIGQYCGNSNPRTIQ 1380 1390 1400 1410 1420 350 360 370 380 390 400 pF1KB7 SSHNQLLLLLHTDRSTTRRGFSVAYIGGQLGCGSGSTEGEGEALQPQSLQSPSSIPPVCP :. :::.. ...: XP_011 SGSNQLVVTFNSDHSLQGGGFYATWNTQTLGCGGIFHSDNGTIRSPHWPQNFPENSRCSW 1430 1440 1450 1460 1470 1480 >-- initn: 381 init1: 165 opt: 405 Z-score: 428.6 bits: 90.9 E(85289): 3.9e-17 Smith-Waterman score: 423; 28.3% identity (57.0% similar) in 286 aa overlap (96-370:822-1099) 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 SSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVPPPPFTSSWHVMSVIF : :: :.:::. . .: . : : : XP_011 FQIPNGDSSCNQGDYLVLRNGPDICSPPLGPPGGN--GHFCGSHASSTLFTSDNQMFVQF 800 810 820 830 840 130 140 150 160 170 pF1KB7 HSDKHVASHGFSAGYQKD--VCGGVL----TGLSGVLTSPEYPNNYPNSMECHWVIRAAG ::. ..::. :. .::: . . .: .:::..:.::: .: :.. : XP_011 ISDHSNEGQGFKIKYEAKSLACGGNVYIHDADSAGYVTSPNHPHNYPPHADCIWILAAPP 850 860 870 880 890 900 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 PAHVKLVFVD-FQVEGNEECTYDYVAVLGG---PGPTRGHHYCGSTRPPTLVSLGHELQV ....: : : :..: . .:: .:. . : .: .. .::.. : . : :. . . XP_011 ETRIQLQFEDRFDIEVTPNCTSNYLELRDGVDSDAPILSK-FCGTSLPSSQWSSGEVMYL 910 920 930 940 950 960 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 VFKSDFNIGGRGFKAYYFSGECQEVYMAMRGNFSSPQYPS-SYPNNIRCHWTIRLPPGYQ :.:: . :::: : ..: .. : : .:. : .:. :.: .. :. XP_011 RFRSDNSPTHVGFKAKYSIAQCGGRVPGQSGVVESIGHPTLPYRDNLFCEWHLQGLSGHY 970 980 990 1000 1010 1020 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 VKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNWCGHHLPPPVTSSHNQLLLL . . : :..:.. .. :. : . .:. . . .:: .::. .: . .: : .. XP_011 LTISFEDFNLQNSSG----CEKDFVEIWDNHTS-GNILGRYCGNTIPDSIDTSSNTAVVR 1030 1040 1050 1060 1070 1080 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 LHTDRSTTRRGFSVAYIGGQLGCGSGSTEGEGEALQPQSLQSPSSIPPVCPAPPMNGLLQ . :: :.: :: . . 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XP_011 RYCGNSFPLNYSSIVGHTLWVRFISDGSGSGTGFQATFMKIFGNDNIVGT-HGKVASPFW 470 480 490 500 510 520 50 60 70 80 90 100 pF1KB7 PRLYPYNTECSWLIVVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFC :. ::.:.. .: . : . : . .:.: ..: .: :.::.: : .. :.: .: XP_011 PENYPHNSNYQWTVNVNASHVVHGRILEMDIEEIQNCYYDKLRIYDGPSI-HARLIGAYC 530 540 550 560 570 580 110 120 130 140 150 pF1KB7 GKVPPPPFTSSWHVMSVIFHSDKHVASHGF---------SAGYQKDV----CGGVL-TGL : . :.:. . .. :.::. ....:: : . ::: : :: XP_011 G-TQTESFSSTGNSLTFHFYSDSSISGKGFLLEWFAVDAPDGVLPTIAPGACGGFLRTGD 590 600 610 620 630 640 160 170 180 190 200 210 pF1KB7 SGV-LTSPEYPNNYPNSMECHWVIRAAGPAHVKLVFVDFQVEGNEECTYDYVAVLGGPGP . : : :: .:..: : ..: :.:.: . :.: ......:... :.:: ... : . XP_011 APVFLFSPGWPDSYSNRVDCTWLIQAPD-STVELNILSLDIESHRTCAYDSLVIRDGDNN 650 660 670 680 690 220 230 240 250 260 pF1KB7 TRGHH--YCGSTRPPTLVSLGHELQVVFKSDFNIGGRGFKAYYFSGECQEVYMAMRGNFS . :: : . : :. . . : :: .. ::.: : : : :: .. XP_011 LAQQLAVLCGREIPGPIRSTGEYMFIRFTSDSSVTRAGFNAS-FHKSCGGYLHADRGIIT 700 710 720 730 740 750 270 280 290 300 310 320 pF1KB7 SPQYPSSYPNNIRCHWTIRLPPGYQVKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEA ::.:: .::.:. : : . . : . : : . .. ::. .. . :.:. .: . . 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XP_011 VASSNQVFIKFHADYARRPSAFRLTWDS 2250 2260 2270 >>XP_011518011 (OMIM: 261100,602997) PREDICTED: cubilin (2285 aa) initn: 396 init1: 305 opt: 768 Z-score: 820.4 bits: 163.4 E(85289): 5.8e-39 Smith-Waterman score: 769; 33.2% identity (59.0% similar) in 449 aa overlap (19-447:43-479) 10 20 30 40 pF1KB7 MLAEWGACLLLAVALLGPGLQAQAMEGVKCGGVLSAPSGNFSSPNFPR :.: : . ::: ::. .:.::::.:: XP_011 CGVDLPPPGSTTSSKLQVLLLTDGVGRREKGFQMQWFV-YGCGGELSGATGSFSSPGFPN 20 30 40 50 60 70 50 60 70 80 90 100 pF1KB7 LYPYNTECSWLIVVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPD-KGNLLGRFCG :: : :: : : . :::. ::.: ::.:::. :.:: ::::.: :: .. ....: XP_011 RYPPNKECIWYIRTDPGSSIQLTIHDFDVEYHSRCNFDVLEIYGG--PDFHSPRIAQLCT 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB7 -KVPPPPF--TSSWHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQKDV--CGGVLTGLSGVLTSPEYP . : :. .:. . ... :..: . ..::.:..: . :::.. . :: . ::.:: XP_011 QRSPENPMQVSSTGNELAIRFKTDLSINGRGFNASWQAVTGGCGGIFQAPSGEIHSPNYP 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KB7 NNYPNSMECHWVIRAAGPAHVKLVFVDFQVEGNEECTYDYVAVLGGPGPTRGHHYCGSTR . : .. .: ::::. .: : :.::..: .. : . : .. . .: . :: . 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XP_011 SPHWPQNFPENSRCSWTAITHKSKHLEISFDNNFLIPSGDGQCQNSFVKVWAGTEEVDKA 1480 1490 1500 1510 1520 1530 110 120 130 140 150 160 pF1KB7 LLGRFCGKVPPPPFTSSWHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQKDVCGGVLTGLSGVLTSPE ::. ::.: : : . ......:.: ... ..::::.. . ::. .:: :: . ::. 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XP_011 ETRIQLQFEDRFDIEVTPNCTSNYLELRDGVDSDAPILSK-FCGTSLPSSQWSSGEVMYL 920 930 940 950 960 970 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 VFKSDFNIGGRGFKAYYFSGECQEVYMAMRGNFSSPQYPS-SYPNNIRCHWTIRLPPGYQ :.:: . :::: : ..: .. : : .:. : .:. :.: .. :. XP_011 RFRSDNSPTHVGFKAKYSIAQCGGRVPGQSGVVESIGHPTLPYRDNLFCEWHLQGLSGHY 980 990 1000 1010 1020 1030 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 VKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNWCGHHLPPPVTSSHNQLLLL . . : :..:.. .. :. : . .:. . . .:: .::. .: . .: : .. XP_011 LTISFEDFNLQNSSG----CEKDFVEIWDNHTS-GNILGRYCGNTIPDSIDTSSNTAVVR 1040 1050 1060 1070 1080 1090 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 LHTDRSTTRRGFSVAYIGGQLGCGSGSTEGEGEALQPQSLQSPSSIPPVCPAPPMNGLLQ . :: :.: :: . . 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XP_011 RYCGNSFPLNYSSIVGHTLWVRFISDGSGSGTGFQATFMKIFGNDNIVGT-HGKVASPFW 480 490 500 510 520 530 50 60 70 80 90 100 pF1KB7 PRLYPYNTECSWLIVVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFC :. ::.:.. .: . : . : . .:.: ..: .: :.::.: : .. :.: .: XP_011 PENYPHNSNYQWTVNVNASHVVHGRILEMDIEEIQNCYYDKLRIYDGPSI-HARLIGAYC 540 550 560 570 580 110 120 130 140 150 pF1KB7 GKVPPPPFTSSWHVMSVIFHSDKHVASHGF---------SAGYQKDV----CGGVL-TGL : . :.:. . .. :.::. ....:: : . ::: : :: XP_011 G-TQTESFSSTGNSLTFHFYSDSSISGKGFLLEWFAVDAPDGVLPTIAPGACGGFLRTGD 590 600 610 620 630 640 160 170 180 190 200 210 pF1KB7 SGV-LTSPEYPNNYPNSMECHWVIRAAGPAHVKLVFVDFQVEGNEECTYDYVAVLGGPGP . : : :: .:..: : ..: :.:.: . :.: ......:... :.:: ... : . XP_011 APVFLFSPGWPDSYSNRVDCTWLIQAPD-STVELNILSLDIESHRTCAYDSLVIRDGDNN 650 660 670 680 690 700 220 230 240 250 260 pF1KB7 TRGHH--YCGSTRPPTLVSLGHELQVVFKSDFNIGGRGFKAYYFSGECQEVYMAMRGNFS . :: : . : :. . . : :: .. ::.: : : : :: .. XP_011 LAQQLAVLCGREIPGPIRSTGEYMFIRFTSDSSVTRAGFNAS-FHKSCGGYLHADRGIIT 710 720 730 740 750 760 270 280 290 300 310 320 pF1KB7 SPQYPSSYPNNIRCHWTIRLPPGYQVKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEA ::.:: .::.:. : : . . : . : : . .. ::. .. . :.:. .: . . XP_011 SPKYPETYPSNLNCSWHVLVQSGLTIAVHF-EQPFQIPNGDSSCNQGDYLVLRNGPDICS 770 780 790 800 810 820 330 340 350 360 370 380 pF1KB7 PLLGNWCGHHLPPPVTSSHNQLLLLLHTDRSTTRRGFSVAYIGGQLGCGSGSTEGEGEAL : :: XP_011 PPLGPPGGNGHFCGSHASSTLFTSDNQMFVQFISDHSNEGQGFKIKYEAKSLACGGNVYI 830 840 850 860 870 880 >-- initn: 273 init1: 173 opt: 254 Z-score: 265.6 bits: 60.7 E(85289): 4.7e-08 Smith-Waterman score: 373; 32.4% identity (61.3% similar) in 225 aa overlap (30-239:1819-2039) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MLAEWGACLLLAVALLGPGLQAQAMEGVKCGGVLSAPSGNFSSPNFPR--LYPYNTECS ::: :.. ...:.::. .: : .: XP_011 SMLLVFKTDSFQTAKGWKMSFRQTLGPQQGCGGYLTGSNNTFASPDSDSNGMYDKNLNCV 1790 1800 1810 1820 1830 1840 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 WLIVVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDT---CSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVPPPPF :.:.. .. . :::..: :: .: : .:....:.: : ...:: : :::.. : :: XP_011 WIIIAPVNKVIHLTFNTFALEAASTRQRCLYDYVKLYDGDS-ENANLAGTFCGSTVPAPF 1850 1860 1870 1880 1890 1900 120 130 140 150 160 pF1KB7 TSSWHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQ-KDV-CGGVL--TGLSGVLTSPEYPN-NYPNSM :: . ..: : :: . .::.: : :. :::. : ..::. . . : :. 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XP_011 VASSNQVFIKFHADYARRPSAFRLTWDS 2260 2270 2280 >>XP_011518013 (OMIM: 261100,602997) PREDICTED: cubilin (2237 aa) initn: 305 init1: 305 opt: 767 Z-score: 819.5 bits: 163.1 E(85289): 6.6e-39 Smith-Waterman score: 768; 33.3% identity (59.4% similar) in 438 aa overlap (30-447:5-431) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MLAEWGACLLLAVALLGPGLQAQAMEGVKCGGVLSAPSGNFSSPNFPRLYPYNTECSWLI ::: ::. .:.::::.:: :: : :: : : XP_011 MIQGCGGELSGATGSFSSPGFPNRYPPNKECIWYI 10 20 30 70 80 90 100 110 pF1KB7 VVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPD-KGNLLGRFCG-KVPPPPF--TS . :::. ::.: ::.:::. :.:: ::::.: :: .. ....: . : :. .: XP_011 RTDPGSSIQLTIHDFDVEYHSRCNFDVLEIYGG--PDFHSPRIAQLCTQRSPENPMQVSS 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 SWHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQKDV--CGGVLTGLSGVLTSPEYPNNYPNSMECHWV . . ... :..: . ..::.:..: . :::.. . :: . ::.::. : .. .: :: XP_011 TGNELAIRFKTDLSINGRGFNASWQAVTGGCGGIFQAPSGEIHSPNYPSPYRSNTDCSWV 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 IRAAGPAHVKLVFVDFQVEGNEECTYDYVAVLGGPGPTRGHHYCGSTR-PPTLVSLGHEL ::. .: : :.::..: .. : . : .. . .: . :: . .:: :. : XP_011 IRVDRNHRVLLNFTDFDLEPQDSCIMAYDGL--SSTMSRLARTCGREQLANPIVSSGNSL 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 QVVFKSDFNIGGRGFKAYYFSGECQEVYMAMRGNFSSPQYPSSYPNNIRCHWTIRL-PPG . :.: . .:::.: . .. .. . . :::..:..:::: : : :. :: XP_011 FLRFQSGPSRQNRGFRAQFRQACGGHILTSSFDTVSSPRFPANYPNNQNCSWIIQAQPPL 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 YQVKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNWCGHHLPPPVTSSHNQLL .. . : ..::. . :: : . .::. :.::: : .:: .: :.:: . : XP_011 NHITLSFTHFELER----STTCARDFVEILDGGHEDAPLRGRYCGTDMPHPITSFSSALT 280 290 300 310 320 360 370 380 390 400 pF1KB7 LLLHTDRSTTRRGFSVAYIGGQLGCGSGSTEGEGEALQPQSLQSPSSIPPV--CP----A : . .: : . :: .. .. .::. .:: .: :. :: : . 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XP_011 SPHWPQNFPENSRCSWTAITHKSKHLEISFDNNFLIPSGDGQCQNSFVKVWAGTEEVDKA 1440 1450 1460 1470 1480 1490 110 120 130 140 150 160 pF1KB7 LLGRFCGKVPPPPFTSSWHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQKDVCGGVLTGLSGVLTSPE ::. ::.: : : . ......:.: ... ..::::.. . ::. .:: :: . ::. 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XP_011 ETRIQLQFEDRFDIEVTPNCTSNYLELRDGVDSDAPILSK-FCGTSLPSSQWSSGEVMYL 870 880 890 900 910 920 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 VFKSDFNIGGRGFKAYYFSGECQEVYMAMRGNFSSPQYPS-SYPNNIRCHWTIRLPPGYQ :.:: . :::: : ..: .. : : .:. : .:. :.: .. :. XP_011 RFRSDNSPTHVGFKAKYSIAQCGGRVPGQSGVVESIGHPTLPYRDNLFCEWHLQGLSGHY 930 940 950 960 970 980 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 VKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNWCGHHLPPPVTSSHNQLLLL . . : :..:.. .. :. : . .:. . . .:: .::. .: . .: : .. XP_011 LTISFEDFNLQNSSG----CEKDFVEIWDNHTS-GNILGRYCGNTIPDSIDTSSNTAVVR 990 1000 1010 1020 1030 1040 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 LHTDRSTTRRGFSVAYIGGQLGCGSGSTEGEGEALQPQSLQSPSSIPPVCPAPPMNGLLQ . :: :.: :: . . 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XP_011 RYCGNSFPLNYSSIVGHTLWVRFISDGSGSGTGFQATFMKIFGNDNIVGT-HGKVASPFW 430 440 450 460 470 480 50 60 70 80 90 100 pF1KB7 PRLYPYNTECSWLIVVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFC :. ::.:.. .: . : . : . .:.: ..: .: :.::.: : .. :.: .: XP_011 PENYPHNSNYQWTVNVNASHVVHGRILEMDIEEIQNCYYDKLRIYDGPSI-HARLIGAYC 490 500 510 520 530 540 110 120 130 140 150 pF1KB7 GKVPPPPFTSSWHVMSVIFHSDKHVASHGF---------SAGYQKDV----CGGVL-TGL : . :.:. . .. :.::. ....:: : . ::: : :: XP_011 G-TQTESFSSTGNSLTFHFYSDSSISGKGFLLEWFAVDAPDGVLPTIAPGACGGFLRTGD 550 560 570 580 590 600 160 170 180 190 200 210 pF1KB7 SGV-LTSPEYPNNYPNSMECHWVIRAAGPAHVKLVFVDFQVEGNEECTYDYVAVLGGPGP . : : :: .:..: : ..: :.:.: . :.: ......:... :.:: ... : . XP_011 APVFLFSPGWPDSYSNRVDCTWLIQAPD-STVELNILSLDIESHRTCAYDSLVIRDGDNN 610 620 630 640 650 220 230 240 250 260 pF1KB7 TRGHH--YCGSTRPPTLVSLGHELQVVFKSDFNIGGRGFKAYYFSGECQEVYMAMRGNFS . :: : . : :. . . : :: .. ::.: : : : :: .. 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XP_011 SPKYPETYPSNLNCSWHVLVQSGLTIAVHF-EQPFQIPNGDSSCNQGDYLVLRNGPDICS 720 730 740 750 760 770 330 340 350 360 370 380 pF1KB7 PLLGNWCGHHLPPPVTSSHNQLLLLLHTDRSTTRRGFSVAYIGGQLGCGSGSTEGEGEAL : :: XP_011 PPLGPPGGNGHFCGSHASSTLFTSDNQMFVQFISDHSNEGQGFKIKYEAKSLACGGNVYI 780 790 800 810 820 830 >-- initn: 273 init1: 173 opt: 254 Z-score: 265.7 bits: 60.7 E(85289): 4.6e-08 Smith-Waterman score: 373; 32.4% identity (61.3% similar) in 225 aa overlap (30-239:1771-1991) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MLAEWGACLLLAVALLGPGLQAQAMEGVKCGGVLSAPSGNFSSPNFPR--LYPYNTECS ::: :.. ...:.::. .: : .: XP_011 SMLLVFKTDSFQTAKGWKMSFRQTLGPQQGCGGYLTGSNNTFASPDSDSNGMYDKNLNCV 1750 1760 1770 1780 1790 1800 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 WLIVVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDT---CSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVPPPPF :.:.. .. . :::..: :: .: : .:....:.: : ...:: : :::.. : :: XP_011 WIIIAPVNKVIHLTFNTFALEAASTRQRCLYDYVKLYDGDS-ENANLAGTFCGSTVPAPF 1810 1820 1830 1840 1850 120 130 140 150 160 pF1KB7 TSSWHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQ-KDV-CGGVL--TGLSGVLTSPEYPN-NYPNSM :: . ..: : :: . .::.: : :. :::. : ..::. . . : :. 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XP_011 VASSNQVFIKFHADYARRPSAFRLTWDS 2210 2220 2230 >>XP_011518010 (OMIM: 261100,602997) PREDICTED: cubilin (2867 aa) initn: 338 init1: 338 opt: 747 Z-score: 796.4 bits: 159.2 E(85289): 1.3e-37 Smith-Waterman score: 747; 33.4% identity (62.3% similar) in 374 aa overlap (30-397:1165-1529) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MLAEWGACLLLAVALLGPGLQAQAMEGVKCGGVLSAPSGNFSSPNFPRLYPYNTECSWL ::: :.. ::.: :::.: : ...:: : XP_011 HSNKLWLKFKSDQIDTRSGFSAYWDGSSTGCGGNLTTSSGTFISPNYPMPYYHSSECYWW 1140 1150 1160 1170 1180 1190 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 IVVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVPPPPFTSSWH . ..::. : :. : ::.: .:..:.: .:.: : .. .:: ..:: :: . :: XP_011 LKSSHGSAFELEFKDFHLEHHPNCTLDYLAVYDGPSSNS-HLLTQLCGDEKPPLIRSSGD 1200 1210 1220 1230 1240 1250 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 VMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQKDVCGGVLTGLS-GVLTSPEYPNNYPNSMECHWVIRAA : . ...:. ..::.: :.. . :... . :.: : ::: : ....:.:.:::. 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XP_011 LTIHDFDVE----YHSRCNFDVLEIYGGPDFHSPRIAQLCTQRSPENPMQVSSTGNELAI 1440 1450 1460 1470 1480 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 LLHTDRSTTRRGFSVAYIGGQLGCGSGSTEGEGEALQPQSLQSPSSIPPVCPAPPMNGLL ..:: : . :::.... . :::. :: .: . :: XP_011 RFKTDLSINGRGFNASWQAVTGGCGGIFQAPSGEIHSP-NYPSPYRSNTDCSWVIRVDRN 1490 1500 1510 1520 1530 1540 420 430 440 pF1KB7 QLLLHWLHPCPLSGPLRLDGTAPACFHYCRASFPSF XP_011 HRVLLNFTDFDLEPQDSCIMAYDGLSSTMSRLARTCGREQLANPIVSSGNSLFLRFQSGP 1550 1560 1570 1580 1590 1600 >-- initn: 700 init1: 266 opt: 695 Z-score: 740.3 bits: 148.9 E(85289): 1.7e-34 Smith-Waterman score: 695; 34.0% identity (61.3% similar) in 362 aa overlap (23-376:810-1164) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MLAEWGACLLLAVALLGPGLQAQAMEGVKCGGVLSAPSGNFSSPNFPRLYPY .:. : :: :.. : . :: :: .:: XP_011 GNGTISHIKSITNSVWIRFKIDASVEKASFRAVYQVACGDELTGE-GVIRSPFFPNVYPG 780 790 800 810 820 830 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 NTECSWLIVVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGR-FCGKVPP . : : : ... .::.: .:.. : :..:: :.: :. .. .:: : XP_011 ERTCRWTIHQPQSQVILLNFTVFEIGSSAHCETDYVEI--GSSSILGSPENKKYCGTDIP 840 850 860 870 880 890 120 130 140 150 160 pF1KB7 PPFTSSWHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQKD--VCGGVLTGLSGVLTSPEYPNNYPNSM .:: .. . : : ... . .::: : .. . .:: .:: .:.. :: .:: ::... XP_011 SFITSVYNFLYVTFVKSSSTENHGFMAKFSAEDLACGEILTESTGTIQSPGHPNVYPHGI 900 910 920 930 940 950 170 180 190 200 210 220 pF1KB7 ECHWVIRAAGPAH-VKLVFVDFQVEGNEECTYDYVAVLGGPGPTRGHHYCGSTRPPTLVS .: : : . : : ..:.: :..: . .:: ::. : . : .:::.. ::.:.: XP_011 NCTWHI-LVQPNHLIHLMFETFHLEFHYNCTNDYLEVYDTDSETSLGRYCGKSIPPSLTS 960 970 980 990 1000 1010 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 LGHELQVVFKSDFNIGGRGF----KAYYFSGECQEVYMAMRGNFSSPQYPSSYPNNIRCH :. :..:: .: ... .:: .: . : . : :.:.::..:..:::: .: XP_011 SGNSLMLVFVTDSDLAYEGFLINYEAISAATACLQDYTDDLGTFTSPNFPNNYPNNWECI 1020 1030 1040 1050 1060 1070 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 WTIRLPPGYQVKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNWCGHHLPPPV . : . : . : : ...::: . : : : ::. :..:::: . : .::: . XP_011 YRITVRTGQLIAVHFTNFSLEEAIGNYYT---DFLEIRDGGYEKSPLLGIFYGSNLPPTI 1080 1090 1100 1110 1120 1130 350 360 370 380 390 400 pF1KB7 TSSHNQLLLLLHTDRSTTRRGFSVAYIGGQLGCGSGSTEGEGEALQPQSLQSPSSIPPVC : :.: : ...:. :: :::. . :.. : XP_011 ISHSNKLWLKFKSDQIDTRSGFSAYWDGSSTGCGGNLTTSSGTFISPNYPMPYYHSSECY 1140 1150 1160 1170 1180 1190 410 420 430 440 pF1KB7 PAPPMNGLLQLLLHWLHPCPLSGPLRLDGTAPACFHYCRASFPSF XP_011 WWLKSSHGSAFELEFKDFHLEHHPNCTLDYLAVYDGPSSNSHLLTQLCGDEKPPLIRSSG 1200 1210 1220 1230 1240 1250 >-- initn: 545 init1: 209 opt: 646 Z-score: 687.4 bits: 139.1 E(85289): 1.5e-31 Smith-Waterman score: 646; 31.2% identity (59.8% similar) in 391 aa overlap (30-400:1738-2116) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MLAEWGACLLLAVALLGPGLQAQAMEGVKCGGVLSAPSGNFSSPNFPRLYPYNTECSWL :::.. : :.::..: .:: :.:: : XP_011 FSSALTLRFVSDSSISAGGFHTTVTASVSACGGTFYMAEGIFNSPGYPDIYPPNVECVWN 1710 1720 1730 1740 1750 1760 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 IVVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVPPPPFTS-SW :: . :. . :.: .:.:: . :: ::.:: .: . :.:.::.::. : ..: XP_011 IVSSPGNRLQLSFISFQLEDSQDCSRDFVEIREGNAT--GHLVGRYCGNSFPLNYSSIVG 1770 1780 1790 1800 1810 1820 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 HVMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQKDVCGGVLTGLSGVLTSPEYPNNYPNSMECHWVIRAA :.. : : :: .. ::.: ..: . ..: : ..:: .:.:::.. . .:.. . XP_011 HTLWVRFISDGSGSGTGFQATFMKIFGNDNIVGTHGKVASPFWPENYPHNSNYQWTVNVN 1830 1840 1850 1860 1870 1880 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 GPAHVKLVFVDFQVEGNEECTYDYVAVLGGPG-PTR--GHHYCGSTRPPTLVSLGHELQV . :. ......: ..: :: . . ::. .: : ::: :. .. : :. : XP_011 ASHVVHGRILEMDIEEIQNCYYDKLRIYDGPSIHARLIGA-YCG-TQTESFSSTGNSLTF 1890 1900 1910 1920 1930 1940 240 250 260 270 280 pF1KB7 VFKSDFNIGGRGFKAYYFS-----GECQEVYMAMRGNFS----------SPQYPSSYPNN : :: .:.:.:: .:. : . . :.: :: .:.:: : XP_011 HFYSDSSISGKGFLLEWFAVDAPDGVLPTIAPGACGGFLRTGDAPVFLFSPGWPDSYSNR 1950 1960 1970 1980 1990 2000 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 IRCHWTIRLPPGYQVKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNWCGHHL . : : :. : . :.. .:.::.: .:: .: :. :: .. : :. ::... XP_011 VDCTWLIQAPDS-TVELNILSLDIESH----RTCAYDSLVIRDGDNNLAQQLAVLCGREI 2010 2020 2030 2040 2050 350 360 370 380 390 pF1KB7 PPPVTSSHNQLLLLLHTDRSTTRRGFSVAYIGGQLGCGSGSTEGEGEALQPQSLQS-PSS : :. :. . ... . .: :.:: ::.... . .::. .: .:. .. ::. XP_011 PGPIRSTGEYMFIRFTSDSSVTRAGFNASF---HKSCGGYLHADRGIITSPKYPETYPSN 2060 2070 2080 2090 2100 2110 400 410 420 430 440 pF1KB7 IPPVCPAPPMNGLLQLLLHWLHPCPLSGPLRLDGTAPACFHYCRASFPSF . XP_011 LNCSWHVLVQSGLTIAVHFEQPFQIPNGDSSCNQGDYLVLRNGPDICSPPLGPPGGNGHF 2120 2130 2140 2150 2160 2170 >-- initn: 441 init1: 156 opt: 431 Z-score: 455.3 bits: 96.1 E(85289): 1.3e-18 Smith-Waterman score: 431; 36.6% identity (63.4% similar) in 205 aa overlap (50-248:1530-1727) 20 30 40 50 60 70 pF1KB7 LQAQAMEGVKCGGVLSAPSGNFSSPNFPRLYPYNTECSWLIVVAEGSSVLLTFHAFDLEY : ::.:::.: : .. :::.: :::: XP_011 NASWQAVTGGCGGIFQAPSGEIHSPNYPSPYRSNTDCSWVIRVDRNHRVLLNFTDFDLEP 1500 1510 1520 1530 1540 1550 80 90 100 110 120 130 pF1KB7 HDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVP-PPPFTSSWHVMSVIFHSDKHVASHGFSA .:.: . :.: : . : .: ::. :..:: . . . :.: ..:: : XP_011 QDSC----IMAYDGLSSTMSRL-ARTCGREQLANPIVSSGNSLFLRFQSGPSRQNRGFRA 1560 1570 1580 1590 1600 1610 140 150 160 170 180 190 pF1KB7 GYQKDVCGG-VLTGLSGVLTSPEYPNNYPNSMECHWVIRAAGP-AHVKLVFVDFQVEGNE . ...::: .::. ...::..: ::::...: :.:.: : :. : :. :..: . XP_011 QF-RQACGGHILTSSFDTVSSPRFPANYPNNQNCSWIIQAQPPLNHITLSFTHFELERST 1620 1630 1640 1650 1660 1670 200 210 220 230 240 250 pF1KB7 ECTYDYVAVLGG---PGPTRGHHYCGSTRPPTLVSLGHELQVVFKSDFNIGGRGFKAYYF :. :.: .: : .: ::. :::. : ..:.. : . : :: .:.. :: XP_011 TCARDFVEILDGGHEDAPLRGR-YCGTDMPHPITSFSSALTLRFVSDSSISAGGFHTTVT 1680 1690 1700 1710 1720 1730 260 270 280 290 300 310 pF1KB7 SGECQEVYMAMRGNFSSPQYPSSYPNNIRCHWTIRLPPGYQVKVFFLDLDLEEPNSLTKT XP_011 ASVSACGGTFYMAEGIFNSPGYPDIYPPNVECVWNIVSSPGNRLQLSFISFQLEDSQDCS 1740 1750 1760 1770 1780 1790 >-- initn: 421 init1: 220 opt: 402 Z-score: 424.0 bits: 90.3 E(85289): 7e-17 Smith-Waterman score: 430; 26.6% identity (59.3% similar) in 290 aa overlap (86-366:530-809) 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 CSWLIVVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVPPPPFT .::..:.: : ... ::::::. : . XP_011 CFWVIKTEMGKVLRITFTFFRLESMDNCPHEFLQVYDGDS-SSAFQLGRFCGSSLPHELL 500 510 520 530 540 550 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 SSWHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGY--QKDVCGGVLTGLSGVLTSPEYPNNYPNSMECHW :: ... ..:.. ..::.. . :. :::.::: : . :: ::.::: . .: : XP_011 SSDNALYFHLYSEHLRNGRGFTVRWETQQPECGGILTGPYGSIKSPGYPGNYPPGRDCVW 560 570 580 590 600 610 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 VIRAAGPAHVKLVFVDFQVEGNEECTYDYVAVLGGP---GPTRGHHYCGSTRPPTLVSLG .. .. : ..: ...: ...:. ::. . :: : :. .: . : : . : XP_011 IVVTSPDLLVTFTFGTLSLEHHDDCNKDYLEIRDGPLYQDPLLGK-FCTTFSVPPLQTTG 620 630 640 650 660 670 240 250 260 270 280 pF1KB7 HELQVVFKSDFNIGGRGFKAYYFSG----ECQEVYMAMRGNFSSPQYPSSYPNNIRCHWT .. :.:: .:. .::. :... .: : .:.. :. . . .. .: . XP_011 PFARIHFHSDSQISDQGFHITYLTSPSDLRCGGNYTDPEGELFLPELSGPFTHTRQCVYM 680 690 700 710 720 730 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 IRLPPGYQVKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNWCGHHLPPPVTS .. : : :... : ..:. .. .. ... . :: . :::. ::. . : XP_011 MKQPQGEQIQINFTHVELQCQSDSSQ----NYIEVRDGET----LLGKVCGNGTISHIKS 740 750 760 770 780 350 360 370 380 390 400 pF1KB7 SHNQLLLLLHTDRSTTRRGFSVAYIGGQLGCGSGSTEGEGEALQPQSLQSPSSIPPVCPA :.. . .. : :. . .: XP_011 ITNSVWIRFKIDASVEKASFRAVYQVACGDELTGEGVIRSPFFPNVYPGERTCRWTIHQP 790 800 810 820 830 840 >-- initn: 600 init1: 214 opt: 399 Z-score: 420.8 bits: 89.7 E(85289): 1.1e-16 Smith-Waterman score: 444; 33.2% identity (60.2% similar) in 226 aa overlap (83-299:2628-2847) 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 NTECSWLIVVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVPP- :.:: ::. : . : :. :.:: : XP_011 NCEWTLSNPNQGNSSISIHFEDFYLESHQDCQFDVLEFRVGDAD--GPLMWRLCGPSKPT 2600 2610 2620 2630 2640 2650 120 130 140 150 160 pF1KB7 -P---PFTSSWHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQKDVCGGVLTGLSGVLTSPEYPNNYPN : :... : . : ....: :: : :. :::. : :::.:::.::: : . XP_011 LPLVIPYSQVW----IHFVTNERVEHIGFHAKYSFTDCGGIQIGDSGVITSPNYPNAYDS 2660 2670 2680 2690 2700 2710 170 180 190 200 210 220 pF1KB7 SMECHWVIRAAGPAHVKLVFVDFQVEGNEECTYDYVAVLGGPGPTRG--HHYCGSTRPPT .: ...: . :.: ::..: . :..: :.: .: .: .:::.. : : XP_011 LTHCSSLLEAPQGHTITLTFSDFDIEPHTTCAWDSVTVRNGGSPESPIIGQYCGNSNPRT 2720 2730 2740 2750 2760 2770 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 LVSLGHELQVVFKSDFNIGGRGFKAYYFSGE--CQEVYMAMRGNFSSPQYPSSYPNNIRC . : ...: :.:.:: .. : :: : . . : .. . :.. ::..:...:.: :: XP_011 IQSGSNQLVVTFNSDHSLQGGGFYATWNTQTLGCGGIFHSDNGTIRSPHWPQNFPENSRC 2780 2790 2800 2810 2820 2830 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 HWTIRLPPGYQVKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNWCGHHLPPP :: . .... : XP_011 SWTAITHKSKHLEISFDNNFLIPSGDGQCQNSFVKE 2840 2850 2860 >-- initn: 165 init1: 165 opt: 337 Z-score: 353.8 bits: 77.4 E(85289): 5.7e-13 Smith-Waterman score: 343; 28.9% identity (57.0% similar) in 228 aa overlap (96-312:2168-2392) 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 SSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVPPPPFTSSWHVMSVIF : :: :.:::. . .: . : : : XP_011 FQIPNGDSSCNQGDYLVLRNGPDICSPPLGPPGGN--GHFCGSHASSTLFTSDNQMFVQF 2140 2150 2160 2170 2180 2190 130 140 150 160 170 pF1KB7 HSDKHVASHGFSAGYQKD--VCGGVL----TGLSGVLTSPEYPNNYPNSMECHWVIRAAG ::. ..::. :. .::: . . .: .:::..:.::: .: :.. : XP_011 ISDHSNEGQGFKIKYEAKSLACGGNVYIHDADSAGYVTSPNHPHNYPPHADCIWILAAPP 2200 2210 2220 2230 2240 2250 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 PAHVKLVFVD-FQVEGNEECTYDYVAVLGG---PGPTRGHHYCGSTRPPTLVSLGHELQV ....: : : :..: . .:: .:. . : .: .. .::.. : . : :. . . XP_011 ETRIQLQFEDRFDIEVTPNCTSNYLELRDGVDSDAPILSK-FCGTSLPSSQWSSGEVMYL 2260 2270 2280 2290 2300 2310 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 VFKSDFNIGGRGFKAYYFSGECQEVYMAMRGNFSSPQYPS-SYPNNIRCHWTIRLPPGYQ :.:: . :::: : ..: .. : : .:. : .:. :.: .. :. XP_011 RFRSDNSPTHVGFKAKYSIAQCGGRVPGQSGVVESIGHPTLPYRDNLFCEWHLQGLSGHY 2320 2330 2340 2350 2360 2370 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 VKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNWCGHHLPPPVTSSHNQLLLL . . : :..:.. .. : XP_011 LTISFEDFNLQNSSGCEKDFVEIWDNHTSGNILGRYCGNTIPDSIDTSSNTAVVRFVTDG 2380 2390 2400 2410 2420 2430 >-- initn: 446 init1: 217 opt: 322 Z-score: 337.7 bits: 74.4 E(85289): 4.5e-12 Smith-Waterman score: 376; 30.9% identity (61.4% similar) in 233 aa overlap (86-305:2393-2623) 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 CSWLIVVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVPPPPFT ::.::... . .::.:::.::.. : . XP_011 CEWHLQGLSGHYLTISFEDFNLQNSSGCEKDFVEIWDNHT--SGNILGRYCGNTIPDSID 2370 2380 2390 2400 2410 2420 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 SSWHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQKDV--CGGVLTGLSGVLTSPEYPNNYPNSMECHW .: .. : : .: :.. :: ..... ::: : : :..:::.::: :.. :.: XP_011 TSSNTAVVRFVTDGSVTASGFRLRFESSMEECGGDLQGSIGTFTSPNYPNPNPHGRICEW 2430 2440 2450 2460 2470 2480 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 VIRAAGPAHVKLVFVDFQVEGNEECTYDYVAVLGG--PGPTRGHHYCGSTRPPTLV-SLG : : .. :.: .... . :. ..: :..: . . .. :.:. . . : : XP_011 RITAPEGRRITLMFNNLRLATHPSCNNEHVIVFNGIRSNSPQLEKLCSSVNVSNEIKSSG 2490 2500 2510 2520 2530 2540 240 250 260 270 280 pF1KB7 HELQVVFKSDFNIGGRGFKAYYFSGE---CQ-EVYMAMRGNFSSPQYPS--SYPNNIRCH . ..:.: .: . :: : : :.: : . . .:::.:: : . .: :. :. XP_011 NTMKVIFFTDGSRPYGGFTASYTSSEDAVCGGSLPNTPEGNFTSPGYDGVRNYSRNLNCE 2550 2560 2570 2580 2590 2600 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 WTIRLPP--GYQVKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNWCGHHLPP ::. : . .... : :. :: XP_011 WTLSNPNQGNSSISIHFEDFYLESHQDCQFDVLEFRVGDADGPLMWRLCGPSKPTLPLVI 2610 2620 2630 2640 2650 2660 >>NP_001072 (OMIM: 261100,602997) cubilin precursor [Hom (3623 aa) initn: 338 init1: 338 opt: 747 Z-score: 795.0 bits: 159.3 E(85289): 1.5e-37 Smith-Waterman score: 747; 33.4% identity (62.3% similar) in 374 aa overlap (30-397:1165-1529) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MLAEWGACLLLAVALLGPGLQAQAMEGVKCGGVLSAPSGNFSSPNFPRLYPYNTECSWL ::: :.. ::.: :::.: : ...:: : NP_001 HSNKLWLKFKSDQIDTRSGFSAYWDGSSTGCGGNLTTSSGTFISPNYPMPYYHSSECYWW 1140 1150 1160 1170 1180 1190 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 IVVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVPPPPFTSSWH . ..::. : :. : ::.: .:..:.: .:.: : .. .:: ..:: :: . :: NP_001 LKSSHGSAFELEFKDFHLEHHPNCTLDYLAVYDGPSSNS-HLLTQLCGDEKPPLIRSSGD 1200 1210 1220 1230 1240 1250 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 VMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQKDVCGGVLTGLS-GVLTSPEYPNNYPNSMECHWVIRAA : . ...:. ..::.: :.. . :... . :.: : ::: : ....:.:.:::. NP_001 SMFIKLRTDEGQQGRGFKAEYRQTCENVVIVNQTYGILESIGYPNPYSENQHCNWTIRAT 1260 1270 1280 1290 1300 1310 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 GPAHVKLVFVDFQVEGNEECTYDYVAVLGGPGPTRGHHYCGSTRPPTLVSLGHELQVVFK :. .:. :..: . .:. ::. . : : . .::: :: . . .:::.. NP_001 TGNTVNYTFLAFDLEHHINCSTDYLELYDG--PRQMGRYCGVDLPPPGSTTSSKLQVLLL 1320 1330 1340 1350 1360 1370 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 SDFNIGGR--GFKAYYFSGECQEVYMAMRGNFSSPQYPSSYPNNIRCHWTIRLPPGYQVK .: ..: : ::. .: : . :.:::: .:. :: : .: : :: :: ... NP_001 TD-GVGRREKGFQMQWFVYGCGGELSGATGSFSSPGFPNRYPPNKECIWYIRTDPGSSIQ 1380 1390 1400 1410 1420 1430 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 VFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNWCGHHLPP-P--VTSSHNQLLL . . :.:.: . :.:: : . : . ..: ... : .. : : :.:. :.: . NP_001 LTIHDFDVE----YHSRCNFDVLEIYGGPDFHSPRIAQLCTQRSPENPMQVSSTGNELAI 1440 1450 1460 1470 1480 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 LLHTDRSTTRRGFSVAYIGGQLGCGSGSTEGEGEALQPQSLQSPSSIPPVCPAPPMNGLL ..:: : . :::.... . :::. :: .: . :: NP_001 RFKTDLSINGRGFNASWQAVTGGCGGIFQAPSGEIHSP-NYPSPYRSNTDCSWVIRVDRN 1490 1500 1510 1520 1530 1540 420 430 440 pF1KB7 QLLLHWLHPCPLSGPLRLDGTAPACFHYCRASFPSF NP_001 HRVLLNFTDFDLEPQDSCIMAYDGLSSTMSRLARTCGREQLANPIVSSGNSLFLRFQSGP 1550 1560 1570 1580 1590 1600 >-- initn: 700 init1: 266 opt: 695 Z-score: 738.9 bits: 148.9 E(85289): 2e-34 Smith-Waterman score: 695; 34.0% identity (61.3% similar) in 362 aa overlap (23-376:810-1164) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MLAEWGACLLLAVALLGPGLQAQAMEGVKCGGVLSAPSGNFSSPNFPRLYPY .:. : :: :.. : . :: :: .:: NP_001 GNGTISHIKSITNSVWIRFKIDASVEKASFRAVYQVACGDELTGE-GVIRSPFFPNVYPG 780 790 800 810 820 830 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 NTECSWLIVVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGR-FCGKVPP . : : : ... .::.: .:.. : :..:: :.: :. .. .:: : NP_001 ERTCRWTIHQPQSQVILLNFTVFEIGSSAHCETDYVEI--GSSSILGSPENKKYCGTDIP 840 850 860 870 880 890 120 130 140 150 160 pF1KB7 PPFTSSWHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQKD--VCGGVLTGLSGVLTSPEYPNNYPNSM .:: .. . : : ... . .::: : .. . .:: .:: .:.. :: .:: ::... NP_001 SFITSVYNFLYVTFVKSSSTENHGFMAKFSAEDLACGEILTESTGTIQSPGHPNVYPHGI 900 910 920 930 940 950 170 180 190 200 210 220 pF1KB7 ECHWVIRAAGPAH-VKLVFVDFQVEGNEECTYDYVAVLGGPGPTRGHHYCGSTRPPTLVS .: : : . : : ..:.: :..: . .:: ::. : . : .:::.. ::.:.: NP_001 NCTWHI-LVQPNHLIHLMFETFHLEFHYNCTNDYLEVYDTDSETSLGRYCGKSIPPSLTS 960 970 980 990 1000 1010 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 LGHELQVVFKSDFNIGGRGF----KAYYFSGECQEVYMAMRGNFSSPQYPSSYPNNIRCH :. :..:: .: ... .:: .: . : . : :.:.::..:..:::: .: NP_001 SGNSLMLVFVTDSDLAYEGFLINYEAISAATACLQDYTDDLGTFTSPNFPNNYPNNWECI 1020 1030 1040 1050 1060 1070 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 WTIRLPPGYQVKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNWCGHHLPPPV . : . : . : : ...::: . : : : ::. :..:::: . : .::: . NP_001 YRITVRTGQLIAVHFTNFSLEEAIGNYYT---DFLEIRDGGYEKSPLLGIFYGSNLPPTI 1080 1090 1100 1110 1120 1130 350 360 370 380 390 400 pF1KB7 TSSHNQLLLLLHTDRSTTRRGFSVAYIGGQLGCGSGSTEGEGEALQPQSLQSPSSIPPVC : :.: : ...:. :: :::. . :.. : NP_001 ISHSNKLWLKFKSDQIDTRSGFSAYWDGSSTGCGGNLTTSSGTFISPNYPMPYYHSSECY 1140 1150 1160 1170 1180 1190 410 420 430 440 pF1KB7 PAPPMNGLLQLLLHWLHPCPLSGPLRLDGTAPACFHYCRASFPSF NP_001 WWLKSSHGSAFELEFKDFHLEHHPNCTLDYLAVYDGPSSNSHLLTQLCGDEKPPLIRSSG 1200 1210 1220 1230 1240 1250 >-- initn: 545 init1: 209 opt: 646 Z-score: 686.0 bits: 139.1 E(85289): 1.8e-31 Smith-Waterman score: 646; 31.2% identity (59.8% similar) in 391 aa overlap (30-400:1738-2116) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MLAEWGACLLLAVALLGPGLQAQAMEGVKCGGVLSAPSGNFSSPNFPRLYPYNTECSWL :::.. : :.::..: .:: :.:: : NP_001 FSSALTLRFVSDSSISAGGFHTTVTASVSACGGTFYMAEGIFNSPGYPDIYPPNVECVWN 1710 1720 1730 1740 1750 1760 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 IVVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVPPPPFTS-SW :: . :. . :.: .:.:: . :: ::.:: .: . :.:.::.::. : ..: NP_001 IVSSPGNRLQLSFISFQLEDSQDCSRDFVEIREGNAT--GHLVGRYCGNSFPLNYSSIVG 1770 1780 1790 1800 1810 1820 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 HVMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQKDVCGGVLTGLSGVLTSPEYPNNYPNSMECHWVIRAA :.. : : :: .. ::.: ..: . ..: : ..:: .:.:::.. . .:.. . NP_001 HTLWVRFISDGSGSGTGFQATFMKIFGNDNIVGTHGKVASPFWPENYPHNSNYQWTVNVN 1830 1840 1850 1860 1870 1880 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 GPAHVKLVFVDFQVEGNEECTYDYVAVLGGPG-PTR--GHHYCGSTRPPTLVSLGHELQV . :. ......: ..: :: . . ::. .: : ::: :. .. : :. : NP_001 ASHVVHGRILEMDIEEIQNCYYDKLRIYDGPSIHARLIGA-YCG-TQTESFSSTGNSLTF 1890 1900 1910 1920 1930 1940 240 250 260 270 280 pF1KB7 VFKSDFNIGGRGFKAYYFS-----GECQEVYMAMRGNFS----------SPQYPSSYPNN : :: .:.:.:: .:. : . . :.: :: .:.:: : NP_001 HFYSDSSISGKGFLLEWFAVDAPDGVLPTIAPGACGGFLRTGDAPVFLFSPGWPDSYSNR 1950 1960 1970 1980 1990 2000 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 IRCHWTIRLPPGYQVKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNWCGHHL . : : :. : . :.. .:.::.: .:: .: :. :: .. : :. ::... NP_001 VDCTWLIQAPDS-TVELNILSLDIESH----RTCAYDSLVIRDGDNNLAQQLAVLCGREI 2010 2020 2030 2040 2050 350 360 370 380 390 pF1KB7 PPPVTSSHNQLLLLLHTDRSTTRRGFSVAYIGGQLGCGSGSTEGEGEALQPQSLQS-PSS : :. :. . ... . .: :.:: ::.... . .::. .: .:. .. ::. NP_001 PGPIRSTGEYMFIRFTSDSSVTRAGFNASF---HKSCGGYLHADRGIITSPKYPETYPSN 2060 2070 2080 2090 2100 2110 400 410 420 430 440 pF1KB7 IPPVCPAPPMNGLLQLLLHWLHPCPLSGPLRLDGTAPACFHYCRASFPSF . NP_001 LNCSWHVLVQSGLTIAVHFEQPFQIPNGDSSCNQGDYLVLRNGPDICSPPLGPPGGNGHF 2120 2130 2140 2150 2160 2170 >-- initn: 572 init1: 214 opt: 615 Z-score: 652.5 bits: 133.0 E(85289): 1.3e-29 Smith-Waterman score: 632; 32.4% identity (62.5% similar) in 355 aa overlap (14-358:2788-3135) 10 20 30 40 pF1KB7 MLAEWGACLLLAVALLGPGLQAQ-AMEGVKCGGVLSAPSGNFS .: : :. : . . :::.. . .:.. NP_001 PIIGQYCGNSNPRTIQSGSNQLVVTFNSDHSLQGGGFYATWNTQTLGCGGIFHSDNGTIR 2760 2770 2780 2790 2800 2810 50 60 70 80 90 100 pF1KB7 SPNFPRLYPYNTECSWLIVVAEGSSVLLTF-HAFDLEYHD-TCSFDFLEIYNGASPDKGN ::..:. .: :..::: .. ... . ..: . : . : :. .:.... :. NP_001 SPHWPQNFPENSRCSWTAITHKSKHLEISFDNNFLIPSGDGQCQNSFVKVWAGTEEVDKA 2820 2830 2840 2850 2860 2870 110 120 130 140 150 160 pF1KB7 LLGRFCGKVPPPPFTSSWHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQKDVCGGVLTGLSGVLTSPE ::. ::.: : : . ......:.: ... ..::::.. . ::. .:: :: . ::. NP_001 LLATGCGNVAPGPVITPSNTFTAVFQS-QEAPAQGFSASFVSR-CGSNFTGPSGYIISPN 2880 2890 2900 2910 2920 2930 170 180 190 200 210 pF1KB7 YPNNYPNSMECHWVIRAAGPAHVKLVFVDFQVEGNEE----CTYDYVAVLGGPG--PTRG ::..: :.:.: .::.: . : :.::.:..:. :. : : .. : . : NP_001 YPKQYDNNMNCTYVIEANPLSVVLLTFVSFHLEARSAVTGSCVNDGVHIIRGYSVMSTPF 2940 2950 2960 2970 2980 2990 220 230 240 250 260 270 pF1KB7 HHYCGSTRPPTLVSLGHELQVVFKSDFNIGGRGFKAYYFSGECQEVYMAMRGNFSSPQYP ::. : :. : : . : :. .: ::: : : :. : ..:: : NP_001 ATVCGDEMPAPLTIAGPVL-LNFYSNEQITDFGFKFSYRIISCGGVFNFSSGIITSPAYS 3000 3010 3020 3030 3040 3050 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 -SSYPNNIRCHWTIRLPPGYQVKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLG ..:::...: .:: . ... : :.:. :.. .:. :.:: .:::. :::: NP_001 YADYPNDMHCLYTITVSDDKVIELKFSDFDVV-PST---SCSHDYLAIYDGANTSDPLLG 3060 3070 3080 3090 3100 3110 340 350 360 370 380 390 pF1KB7 NWCGHHLPPPVTSSHNQLLLLLHTDRSTTRRGFSVAYIGGQLGCGSGSTEGEGEALQPQS ..:: . :: : ::.:..::...:: NP_001 KFCGSKRPPNVKSSNNSMLLVFKTDSFQTAKGWKMSFRQTLGPQQGCGGYLTGSNNTFAS 3120 3130 3140 3150 3160 3170 >-- initn: 441 init1: 156 opt: 431 Z-score: 453.9 bits: 96.2 E(85289): 1.5e-18 Smith-Waterman score: 431; 36.6% identity (63.4% similar) in 205 aa overlap (50-248:1530-1727) 20 30 40 50 60 70 pF1KB7 LQAQAMEGVKCGGVLSAPSGNFSSPNFPRLYPYNTECSWLIVVAEGSSVLLTFHAFDLEY : ::.:::.: : .. :::.: :::: NP_001 NASWQAVTGGCGGIFQAPSGEIHSPNYPSPYRSNTDCSWVIRVDRNHRVLLNFTDFDLEP 1500 1510 1520 1530 1540 1550 80 90 100 110 120 130 pF1KB7 HDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVP-PPPFTSSWHVMSVIFHSDKHVASHGFSA .:.: . :.: : . : .: ::. :..:: . . . :.: ..:: : NP_001 QDSC----IMAYDGLSSTMSRL-ARTCGREQLANPIVSSGNSLFLRFQSGPSRQNRGFRA 1560 1570 1580 1590 1600 1610 140 150 160 170 180 190 pF1KB7 GYQKDVCGG-VLTGLSGVLTSPEYPNNYPNSMECHWVIRAAGP-AHVKLVFVDFQVEGNE . ...::: .::. ...::..: ::::...: :.:.: : :. : :. :..: . NP_001 QF-RQACGGHILTSSFDTVSSPRFPANYPNNQNCSWIIQAQPPLNHITLSFTHFELERST 1620 1630 1640 1650 1660 1670 200 210 220 230 240 250 pF1KB7 ECTYDYVAVLGG---PGPTRGHHYCGSTRPPTLVSLGHELQVVFKSDFNIGGRGFKAYYF :. :.: .: : .: ::. :::. : ..:.. : . : :: .:.. :: NP_001 TCARDFVEILDGGHEDAPLRGR-YCGTDMPHPITSFSSALTLRFVSDSSISAGGFHTTVT 1680 1690 1700 1710 1720 1730 260 270 280 290 300 310 pF1KB7 SGECQEVYMAMRGNFSSPQYPSSYPNNIRCHWTIRLPPGYQVKVFFLDLDLEEPNSLTKT NP_001 ASVSACGGTFYMAEGIFNSPGYPDIYPPNVECVWNIVSSPGNRLQLSFISFQLEDSQDCS 1740 1750 1760 1770 1780 1790 >-- initn: 421 init1: 220 opt: 402 Z-score: 422.6 bits: 90.4 E(85289): 8.4e-17 Smith-Waterman score: 430; 26.6% identity (59.3% similar) in 290 aa overlap (86-366:530-809) 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 CSWLIVVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVPPPPFT .::..:.: : ... ::::::. : . NP_001 CFWVIKTEMGKVLRITFTFFRLESMDNCPHEFLQVYDGDS-SSAFQLGRFCGSSLPHELL 500 510 520 530 540 550 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 SSWHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGY--QKDVCGGVLTGLSGVLTSPEYPNNYPNSMECHW :: ... ..:.. ..::.. . :. :::.::: : . :: ::.::: . .: : NP_001 SSDNALYFHLYSEHLRNGRGFTVRWETQQPECGGILTGPYGSIKSPGYPGNYPPGRDCVW 560 570 580 590 600 610 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 VIRAAGPAHVKLVFVDFQVEGNEECTYDYVAVLGGP---GPTRGHHYCGSTRPPTLVSLG .. .. : ..: ...: ...:. ::. . :: : :. .: . : : . : NP_001 IVVTSPDLLVTFTFGTLSLEHHDDCNKDYLEIRDGPLYQDPLLGK-FCTTFSVPPLQTTG 620 630 640 650 660 670 240 250 260 270 280 pF1KB7 HELQVVFKSDFNIGGRGFKAYYFSG----ECQEVYMAMRGNFSSPQYPSSYPNNIRCHWT .. :.:: .:. .::. :... .: : .:.. :. . . .. .: . NP_001 PFARIHFHSDSQISDQGFHITYLTSPSDLRCGGNYTDPEGELFLPELSGPFTHTRQCVYM 680 690 700 710 720 730 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 IRLPPGYQVKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNWCGHHLPPPVTS .. : : :... : ..:. .. .. ... . :: . :::. ::. . : NP_001 MKQPQGEQIQINFTHVELQCQSDSSQ----NYIEVRDGET----LLGKVCGNGTISHIKS 740 750 760 770 780 350 360 370 380 390 400 pF1KB7 SHNQLLLLLHTDRSTTRRGFSVAYIGGQLGCGSGSTEGEGEALQPQSLQSPSSIPPVCPA :.. . .. : :. . .: NP_001 ITNSVWIRFKIDASVEKASFRAVYQVACGDELTGEGVIRSPFFPNVYPGERTCRWTIHQP 790 800 810 820 830 840 >-- initn: 165 init1: 165 opt: 337 Z-score: 352.5 bits: 77.4 E(85289): 6.8e-13 Smith-Waterman score: 343; 28.9% identity (57.0% similar) in 228 aa overlap (96-312:2168-2392) 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 SSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVPPPPFTSSWHVMSVIF : :: :.:::. . .: . : : : NP_001 FQIPNGDSSCNQGDYLVLRNGPDICSPPLGPPGGN--GHFCGSHASSTLFTSDNQMFVQF 2140 2150 2160 2170 2180 2190 130 140 150 160 170 pF1KB7 HSDKHVASHGFSAGYQKD--VCGGVL----TGLSGVLTSPEYPNNYPNSMECHWVIRAAG ::. ..::. :. .::: . . .: .:::..:.::: .: :.. : NP_001 ISDHSNEGQGFKIKYEAKSLACGGNVYIHDADSAGYVTSPNHPHNYPPHADCIWILAAPP 2200 2210 2220 2230 2240 2250 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 PAHVKLVFVD-FQVEGNEECTYDYVAVLGG---PGPTRGHHYCGSTRPPTLVSLGHELQV ....: : : :..: . .:: .:. . : .: .. .::.. : . : :. . . NP_001 ETRIQLQFEDRFDIEVTPNCTSNYLELRDGVDSDAPILSK-FCGTSLPSSQWSSGEVMYL 2260 2270 2280 2290 2300 2310 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 VFKSDFNIGGRGFKAYYFSGECQEVYMAMRGNFSSPQYPS-SYPNNIRCHWTIRLPPGYQ :.:: . :::: : ..: .. : : .:. : .:. :.: .. :. NP_001 RFRSDNSPTHVGFKAKYSIAQCGGRVPGQSGVVESIGHPTLPYRDNLFCEWHLQGLSGHY 2320 2330 2340 2350 2360 2370 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 VKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNWCGHHLPPPVTSSHNQLLLL . . : :..:.. .. : NP_001 LTISFEDFNLQNSSGCEKDFVEIWDNHTSGNILGRYCGNTIPDSIDTSSNTAVVRFVTDG 2380 2390 2400 2410 2420 2430 >-- initn: 446 init1: 217 opt: 322 Z-score: 336.3 bits: 74.4 E(85289): 5.4e-12 Smith-Waterman score: 376; 30.9% identity (61.4% similar) in 233 aa overlap (86-305:2393-2623) 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 CSWLIVVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVPPPPFT ::.::... . .::.:::.::.. : . NP_001 CEWHLQGLSGHYLTISFEDFNLQNSSGCEKDFVEIWDNHT--SGNILGRYCGNTIPDSID 2370 2380 2390 2400 2410 2420 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 SSWHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQKDV--CGGVLTGLSGVLTSPEYPNNYPNSMECHW .: .. : : .: :.. :: ..... ::: : : :..:::.::: :.. :.: NP_001 TSSNTAVVRFVTDGSVTASGFRLRFESSMEECGGDLQGSIGTFTSPNYPNPNPHGRICEW 2430 2440 2450 2460 2470 2480 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 VIRAAGPAHVKLVFVDFQVEGNEECTYDYVAVLGG--PGPTRGHHYCGSTRPPTLV-SLG : : .. :.: .... . :. ..: :..: . . .. :.:. . . : : NP_001 RITAPEGRRITLMFNNLRLATHPSCNNEHVIVFNGIRSNSPQLEKLCSSVNVSNEIKSSG 2490 2500 2510 2520 2530 2540 240 250 260 270 280 pF1KB7 HELQVVFKSDFNIGGRGFKAYYFSGE---CQ-EVYMAMRGNFSSPQYPS--SYPNNIRCH . ..:.: .: . :: : : :.: : . . .:::.:: : . .: :. :. NP_001 NTMKVIFFTDGSRPYGGFTASYTSSEDAVCGGSLPNTPEGNFTSPGYDGVRNYSRNLNCE 2550 2560 2570 2580 2590 2600 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 WTIRLPP--GYQVKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNWCGHHLPP ::. : . .... : :. :: NP_001 WTLSNPNQGNSSISIHFEDFYLESHQDCQFDVLEFRVGDADGPLMWRLCGPSKPTLPLVI 2610 2620 2630 2640 2650 2660 >-- initn: 497 init1: 214 opt: 265 Z-score: 274.7 bits: 63.1 E(85289): 1.5e-08 Smith-Waterman score: 334; 35.8% identity (60.6% similar) in 165 aa overlap (83-240:2628-2786) 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 NTECSWLIVVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVPP- :.:: ::. : . : :. :.:: : NP_001 NCEWTLSNPNQGNSSISIHFEDFYLESHQDCQFDVLEFRVGDAD--GPLMWRLCGPSKPT 2600 2610 2620 2630 2640 2650 120 130 140 150 160 pF1KB7 -P---PFTSSWHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQKDVCGGVLTGLSGVLTSPEYPNNYPN : :... : . : ....: :: : :. :::. : :::.:::.::: : . 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NP_001 CTVTLTAPQNHTISLFFHSLGIENSVECRNDFLEVRNGSNSNSPLLGK-YCGTLLPNPVF 3430 3440 3450 3460 3470 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 SLGHELQVVFKSDFNIGGRGFKAYYFSGE--CQEVYMAMRGNFSSPQYPSSYPNNIRCHW : ..:: . :::: . ::.. . :. : . .. ::.:.:: ::..:::: :.: NP_001 SQNNELYLRFKSDSVTSDRGYEIIWTSSPSGCGGTLYGDRGSFTSPGYPGTYPNNTYCEW 3480 3490 3500 3510 3520 3530 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 TIRLPPGYQVKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNWCGHHLP-PPV .. : : : . : .....:.. : ..:. .:: . .: : .:: : NP_001 VLVAPAGRLVTINFYFISIDDPGD----CVQNYLTLYDGPNASSPSSGPYCGGDTSIAPF 3540 3550 3560 3570 3580 3590 350 360 370 380 390 400 pF1KB7 TSSHNQLLLLLHTDRSTTRRGFSVAYIGGQLGCGSGSTEGEGEALQPQSLQSPSSIPPVC ..: ::... .:.: . .: ... NP_001 VASSNQVFIKFHADYARRPSAFRLTWDS 3600 3610 3620 >>NP_037495 (OMIM: 607064) procollagen C-endopeptidase e (415 aa) initn: 535 init1: 258 opt: 494 Z-score: 534.8 bits: 108.0 E(85289): 4.8e-23 Smith-Waterman score: 568; 37.2% identity (62.8% similar) in 261 aa overlap (5-252:7-265) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MLAEWGA-CLLLAVALLGPGLQAQAMEGVKCGGVLSAPSGNFSSPNFPRLYPYNTECS :. :::::.: :. :::.:.. :: ..: .:: .:: :..:. NP_037 MRGANAWAPLCLLLAAATQLSRQQSPERPVFTCGGILTGESGFIGSEGFPGVYPPNSKCT 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 WLIVVAEGSSVLLTFHAFDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVPPPPFTSS : :.: ::. :.:.:. .::: . : .::...::: . .:. .::::: : ..:: NP_037 WKITVPEGKVVVLNFRFIDLESDNLCRYDFVDVYNGHA--NGQRIGRFCGTFRPGALVSS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KB7 WHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQK--------DVCGGVLTGLSGVLTSPEYPN-NYPNS . : : . :: ..:..:: : .. . :::.: :: . .:..:. .:: . NP_037 GNKMMVQMISDANTAGNGFMAMFSAAEPNERGDQYCGGLLDRPSGSFKTPNWPDRDYPAG 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB7 MECHWVIRAAGPAHVKLVFVDFQVEGNEECTYDYVAVLGGP---GPTRGHHYCGSTRPPT . : : : : ..: : :.:: .. : ::::::..: : .:::.. : NP_037 VTCVWHIVAPKNQLIELKFEKFDVERDNYCRYDYVAVFNGGEVNDARRIGKYCGDSPPAP 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 LVSLGHELQVVFKSDFNIGGRGFKAYYFSGECQEVYMAMRGNFSSPQYPSSYPNNIRCHW .:: .:: . : ::... . :: ..: NP_037 IVSERNELLIQFLSDLSLTADGFIGHYIFRPKKLPTTTEQPVTTTFPVTTGLKPTVALCQ 240 250 260 270 280 290 >>NP_001019800 (OMIM: 602069) neuropilin-1 isoform c pre (609 aa) initn: 401 init1: 165 opt: 397 Z-score: 427.8 bits: 88.8 E(85289): 4.3e-17 Smith-Waterman score: 491; 32.0% identity (60.4% similar) in 303 aa overlap (8-286:9-302) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MLAEWGACLLLAVALLGPGLQAQAMEGVKCGGVLSAPS-GNFSSPNFPRLYPYNTECSW : .::. .:.: : :... ::: ... : : ..::..:. : . .: : NP_001 MERGLPLLCAVLAL-VLAP---AGAFRNDKCGDTIKIESPGYLTSPGYPHSYHPSEKCEW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 LIVVAEG-SSVLLTFHA-FDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVPPPPFTS :: . . . ....:. :::: .: :..:..:...: . ..:.. :.::::. ::: .: NP_001 LIQAPDPYQRIMINFNPHFDLEDRD-CKYDYVEVFDGEN-ENGHFRGKFCGKIAPPPVVS 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 SWHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQ----KDVCGGVLTGLSGVLTSPEYPNNYPNSMECH : . . : :: .. . ::: :. :. : :::. :: .:..::::.:: NP_001 SGPFLFIKFVSDYETHGAGFSIRYEIFKRGPECSQNYTTPSGVIKSPGFPEKYPNSLECT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KB7 WVIRAAGPAHVKLVFVDFQVE------GNEECTYDYVAVLGG-P--GPTRGHHYCGSTRP ... : ... : : .:..: :. : :: . . : : :: :. :::. : NP_001 YIVFAPKMSEIILEFESFDLEPDSNPPGGMFCRYDRLEIWDGFPDVGPHIGR-YCGQKTP 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KB7 PTLVSLGHELQVVFKSDFNIGGRGFKAYYF--------SGECQEVYMAMRGNFSSPQYPS . : . :..:: .: :. .::.: : . .:.:. :.. : : . 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NP_001 S--SQYSTNWSAERSRLNYPENGWTPGEDSYREWIQVDLGLLRFVTAVGTQGAISKETKK 300 310 320 330 340 350 >>NP_001019799 (OMIM: 602069) neuropilin-1 isoform b pre (644 aa) initn: 401 init1: 165 opt: 397 Z-score: 427.5 bits: 88.8 E(85289): 4.5e-17 Smith-Waterman score: 491; 32.0% identity (60.4% similar) in 303 aa overlap (8-286:9-302) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MLAEWGACLLLAVALLGPGLQAQAMEGVKCGGVLSAPS-GNFSSPNFPRLYPYNTECSW : .::. .:.: : :... ::: ... : : ..::..:. : . .: : NP_001 MERGLPLLCAVLAL-VLAP---AGAFRNDKCGDTIKIESPGYLTSPGYPHSYHPSEKCEW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 LIVVAEG-SSVLLTFHA-FDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVPPPPFTS :: . . . ....:. :::: .: :..:..:...: . ..:.. :.::::. ::: .: NP_001 LIQAPDPYQRIMINFNPHFDLEDRD-CKYDYVEVFDGEN-ENGHFRGKFCGKIAPPPVVS 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 SWHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQ----KDVCGGVLTGLSGVLTSPEYPNNYPNSMECH : . . : :: .. . ::: :. :. : :::. :: .:..::::.:: NP_001 SGPFLFIKFVSDYETHGAGFSIRYEIFKRGPECSQNYTTPSGVIKSPGFPEKYPNSLECT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KB7 WVIRAAGPAHVKLVFVDFQVE------GNEECTYDYVAVLGG-P--GPTRGHHYCGSTRP ... : ... : : .:..: :. : :: . . : : :: :. :::. : NP_001 YIVFAPKMSEIILEFESFDLEPDSNPPGGMFCRYDRLEIWDGFPDVGPHIGR-YCGQKTP 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KB7 PTLVSLGHELQVVFKSDFNIGGRGFKAYYF--------SGECQEVYMAMRGNFSSPQYPS . : . :..:: .: :. .::.: : . .:.:. :.. : : . NP_001 GRIRSSSGILSMVFYTDSAIAKEGFSANYSVLQSSVSEDFKCMEALGMESGEIHSDQITA 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 SYPNNIRCHWTIRLPPGYQVKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNW : .. .:. NP_001 S--SQYSTNWSAERSRLNYPENGWTPGEDSYREWIQVDLGLLRFVTAVGTQGAISKETKK 300 310 320 330 340 350 >>NP_001316997 (OMIM: 602069) neuropilin-1 isoform f pre (906 aa) initn: 401 init1: 165 opt: 397 Z-score: 425.4 bits: 88.9 E(85289): 5.9e-17 Smith-Waterman score: 491; 32.0% identity (60.4% similar) in 303 aa overlap (8-286:9-302) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MLAEWGACLLLAVALLGPGLQAQAMEGVKCGGVLSAPS-GNFSSPNFPRLYPYNTECSW : .::. .:.: : :... ::: ... : : ..::..:. : . .: : NP_001 MERGLPLLCAVLAL-VLAP---AGAFRNDKCGDTIKIESPGYLTSPGYPHSYHPSEKCEW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 LIVVAEG-SSVLLTFHA-FDLEYHDTCSFDFLEIYNGASPDKGNLLGRFCGKVPPPPFTS :: . . . ....:. :::: .: :..:..:...: . ..:.. :.::::. ::: .: NP_001 LIQAPDPYQRIMINFNPHFDLEDRD-CKYDYVEVFDGEN-ENGHFRGKFCGKIAPPPVVS 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 SWHVMSVIFHSDKHVASHGFSAGYQ----KDVCGGVLTGLSGVLTSPEYPNNYPNSMECH : . . : :: .. . ::: :. :. : :::. :: .:..::::.:: NP_001 SGPFLFIKFVSDYETHGAGFSIRYEIFKRGPECSQNYTTPSGVIKSPGFPEKYPNSLECT 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KB7 WVIRAAGPAHVKLVFVDFQVE------GNEECTYDYVAVLGG-P--GPTRGHHYCGSTRP ... : ... : : .:..: :. : :: . . : : :: :. :::. : NP_001 YIVFAPKMSEIILEFESFDLEPDSNPPGGMFCRYDRLEIWDGFPDVGPHIGR-YCGQKTP 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KB7 PTLVSLGHELQVVFKSDFNIGGRGFKAYYF--------SGECQEVYMAMRGNFSSPQYPS . : . :..:: .: :. .::.: : . .:.:. :.. : : . NP_001 GRIRSSSGILSMVFYTDSAIAKEGFSANYSVLQSSVSEDFKCMEALGMESGEIHSDQITA 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 SYPNNIRCHWTIRLPPGYQVKVFFLDLDLEEPNSLTKTCDFDHLAAFDGASEEAPLLGNW : .. .:. NP_001 S--SQYSTNWSAERSRLNYPENGWTPGEDSYREWIQVDLGLLRFVTAVGTQGAISKETKK 300 310 320 330 340 350 449 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 07:01:09 2016 done: Fri Nov 4 07:01:10 2016 Total Scan time: 10.440 Total Display time: 0.230 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]