Result of FASTA (omim) for
pF1KB7382
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7382, 313 aa
1>>>pF1KB7382 313 - 313 aa - 313 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4268+/-0.00058; mu= 21.1540+/- 0.036
mean_var=106.8738+/-30.449, 0's: 0 Z-trim(106.4): 338 B-trim: 840 in 1/49
Lambda= 0.124062
statistics sampled from 13995 (14472) to 13995 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.497), E-opt: 0.2 (0.17), width: 16
Scan time: 5.710
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1036 197.1 4e-50
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NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 918 175.9 9.1e-44
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 918 176.0 9.2e-44
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NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 830 160.2 5e-39
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 823 158.9 1.2e-38
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XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 821 158.6 1.5e-38
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 810 156.6 6e-38
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 808 156.2 7.5e-38
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 790 153.0 7.2e-37
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 531 106.7 6.5e-23
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NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 263 58.8 1.9e-08
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 210 49.2 1.3e-05
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NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 203 48.0 3.1e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 202 47.8 3.6e-05
NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 197 46.9 6.3e-05
NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 197 47.0 6.8e-05
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 195 46.6 8.5e-05
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NP_000863 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 445) 194 46.6 0.00011
NP_062873 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 479) 194 46.6 0.00012
NP_000504 (OMIM: 300821,303700,303800) medium-wave ( 364) 189 45.6 0.00019
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 186 45.0 0.00026
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 186 45.2 0.00031
NP_473362 (OMIM: 300393,300943) probable G-protein ( 508) 186 45.2 0.00033
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 184 44.6 0.00033
XP_005265876 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 328) 181 44.1 0.00048
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 181 44.1 0.00051
XP_016881270 (OMIM: 202200,607397) PREDICTED: adre ( 297) 180 43.8 0.00051
NP_000520 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotropi ( 297) 180 43.8 0.00051
NP_001278840 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotr ( 297) 180 43.8 0.00051
NP_004215 (OMIM: 300207) melatonin-related recepto ( 617) 183 44.8 0.00053
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XP_011532740 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 389) 179 43.8 0.00067
XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 178 43.5 0.00068
XP_011532739 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 402) 179 43.8 0.00068
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
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pF1KB7 LRQRQVFFTKSYT
: .:.
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>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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pF1KB7 MKQLRQRQVFFTKSYT
.:.. : ::
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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pF1KB7 MDSLNQTRVTEFVFLGLTDNRVLEMLFFMAFSAIYMLTLSGNILIIIATVFTPSLHTPMY
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pF1KB7 MKQLRQRQVFFTKSYT
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NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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pF1KB7 MDSLNQTRVTEFVFLGLTDNRVLEMLFFMAFSAIYMLTLSGNILIIIATV
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pF1KB7 FTPSLHTPMYFFLSNLSFIDICHSSVTVPKMLEGLLLERKTISFDNCITQLFFLHLFACA
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310 320
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
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pF1KB7 SAMKQLRQRQVFFTKSYT
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NP_006 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
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70 80 90 100 110 120
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
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300 310
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.. :
NP_003 KVATRNFP
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
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300 310
pF1KB7 MKQLRQRQVFFTKSYT
. .. .:.
NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 807 init1: 565 opt: 860 Z-score: 850.7 bits: 165.6 E(85289): 1.2e-40
Smith-Waterman score: 860; 42.6% identity (74.8% similar) in 305 aa overlap (5-305:6-309)
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pF1KB7 MDSLNQTRVTEFVFLGLTD-NRVLEMLFFMAFSAIYMLTLSGNILIIIATVFTPSLHTP
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pF1KB7 AYDRYVAICTPLHYPNVMNMRVCIQLVFALWLGGTVHSLGQTFLTIRLPYCGPNIIDSYF
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pF1KB7 CDVPLVIKLACTDTYLTGILIVTNSGTISLSCFLAVVTSYMVILVSLRK-HSAEGRQKAL
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pF1KB7 STCSAHFMVVALFFGPCIFIYTRPDT--SFSIDKVVSVFYTVVTPLLNPFIYTLRNEEVK
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NP_001 NTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIK
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pF1KB7 SAMKQLRQRQVFFTKSYT
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NP_001 DALKRLQKRKCC
300 310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
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pF1KB7 MDSLNQTRVTEFVFLGLTD-NRVLEMLFFMAFSAIYMLTLSGNILIIIATVFTPSLHTPM
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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pF1KB7 TCSAHFMVVALFFGPCIFIYTRPDTSFSID--KVVSVFYTVVTPLLNPFIYTLRNEEVKS
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:...
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
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NP_001 VFLLTLAVVDIICTTSI-IPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMA
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NP_001 GIRKVFAFLKH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]