Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7385
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7385, 317 aa
1>>>pF1KB7385 317 - 317 aa - 317 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3635+/-0.00113; mu= 15.4391+/- 0.067
mean_var=135.2357+/-43.106, 0's: 0 Z-trim(104.2): 382 B-trim: 958 in 2/45
Lambda= 0.110288
statistics sampled from 7272 (7770) to 7272 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.239), width: 16
Scan time: 2.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 2098 346.0 2.3e-95
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1124 191.0 1e-48
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 1100 187.2 1.5e-47
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1093 186.0 3.2e-47
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 1092 185.9 3.6e-47
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 1087 185.1 6.3e-47
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 1085 184.8 7.8e-47
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 1083 184.5 9.7e-47
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 1081 184.2 1.2e-46
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 1076 183.3 2.1e-46
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 1072 182.7 3.3e-46
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 1068 182.1 5.1e-46
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 1066 181.7 6.2e-46
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 1057 180.3 1.7e-45
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 1052 179.5 3e-45
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 1040 177.6 1.1e-44
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 1031 176.2 3e-44
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 1018 174.1 1.3e-43
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 1018 174.2 1.3e-43
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 1010 172.8 3e-43
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 1009 172.7 3.4e-43
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 993 170.1 2e-42
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 982 168.4 6.6e-42
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 982 168.4 6.6e-42
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 982 168.4 6.7e-42
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 979 167.9 9.2e-42
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 975 167.3 1.4e-41
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 957 164.4 1e-40
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 953 163.8 1.7e-40
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 945 162.5 4e-40
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 940 161.7 6.8e-40
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 937 161.2 9.4e-40
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 925 159.3 3.6e-39
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 925 159.4 3.7e-39
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 919 158.4 6.9e-39
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 913 157.5 1.4e-38
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 891 153.9 1.5e-37
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 891 154.0 1.6e-37
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 867 150.1 2.2e-36
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 755 132.3 5e-31
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 752 131.8 6.8e-31
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 728 128.0 9.7e-30
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 727 127.8 1.1e-29
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 726 127.7 1.3e-29
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 713 125.6 5.1e-29
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 711 125.3 6.4e-29
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 704 124.2 1.4e-28
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 639 113.8 1.8e-25
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 607 108.7 6e-24
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 597 107.1 1.8e-23
>>CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 (317 aa)
initn: 2098 init1: 2098 opt: 2098 Z-score: 1825.4 bits: 346.0 E(32554): 2.3e-95
Smith-Waterman score: 2098; 100.0% identity (100.0% similar) in 317 aa overlap (1-317:1-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLTFHNVCSVPSSFWLTGIPGLESLHVWLSIPFGSMYLVAVVGNVTILAVVKIERSLHQP
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CCDS31 MLTFHNVCSVPSSFWLTGIPGLESLHVWLSIPFGSMYLVAVVGNVTILAVVKIERSLHQP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MYFFLCMLAAIDLVLSTSTIPKLLGIFWFGACDIGLDACLGQMFLIHCFATVESGIFLAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MYFFLCMLAAIDLVLSTSTIPKLLGIFWFGACDIGLDACLGQMFLIHCFATVESGIFLAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AFDRYVAICNPLRHSMVLTYTVVGRLGLVSLLRGVLYIGPLPLMIRLRLPLYKTHVISHS
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CCDS31 AFDRYVAICNPLRHSMVLTYTVVGRLGLVSLLRGVLYIGPLPLMIRLRLPLYKTHVISHS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 YCEHMAVVALTCGDSRVNNVYGLSIGFLVLILDSVAIAASYVMIFRAVMGLATPEARLKT
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CCDS31 YCEHMAVVALTCGDSRVNNVYGLSIGFLVLILDSVAIAASYVMIFRAVMGLATPEARLKT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LGTCASHLCAILIFYVPIAVSSLIHRFGQCVPPPVHTLLANFYLLIPPILNPIVYAVRTK
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CCDS31 LGTCASHLCAILIFYVPIAVSSLIHRFGQCVPPPVHTLLANFYLLIPPILNPIVYAVRTK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 QIRESLLQIPRIEMKIR
:::::::::::::::::
CCDS31 QIRESLLQIPRIEMKIR
310
>>CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1138 init1: 605 opt: 1124 Z-score: 987.9 bits: 191.0 E(32554): 1e-48
Smith-Waterman score: 1124; 51.5% identity (82.6% similar) in 305 aa overlap (11-314:11-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLTFHNVCSVPSSFWLTGIPGLESLHVWLSIPFGSMYLVAVVGNVTILAVVKIERSLHQP
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CCDS31 MSASNITLTHPTAFLLVGIPGLEHLHIWISIPFCLAYTLALLGNCTLLLIIQADAALHEP
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pF1KB7 MYFFLCMLAAIDLVLSTSTIPKLLGIFWFGACDIGLDACLGQMFLIHCFATVESGIFLAM
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CCDS31 MYLFLAMLAAIDLVLSSSALPKMLAIFWFRDREINFFACLAQMFFLHSFSIMESAVLLAM
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pF1KB7 AFDRYVAICNPLRHSMVLTYTVVGRLGLVSLLRGVLYIGPLPLMIRLRLPLYKTHVISHS
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CCDS31 AFDRYVAICKPLHYTKVLTGSLITKIGMAAVARAVTLMTPLPFLLRC-FHYCRGPVIAHC
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190 200 210 220 230 240
pF1KB7 YCEHMAVVALTCGDSRVNNVYGLSIGFLVLILDSVAIAASYVMIFRAVMGLATPEARLKT
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CCDS31 YCEHMAVVRLACGDTSFNNIYGIAVAMFIVVLDLLLVILSYIFILQAVLLLASQEARYKA
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250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LGTCASHLCAILIFYVPIAVSSLIHRFGQCVPPPVHTLLANFYLLIPPILNPIVYAVRTK
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CCDS31 FGTCVSHIGAILAFYTTVVISSVMHRVARHAAPHVHILLANFYLLFPPMVNPIIYGVKTK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KB7 QIRESLLQI-PRIEMKIR
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CCDS31 QIRESILGVFPRKDM
300 310
>>CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 (314 aa)
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Smith-Waterman score: 1100; 52.7% identity (82.1% similar) in 296 aa overlap (9-304:12-306)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MLTFHNVCSVPSSFWLTGIPGLESLHVWLSIPFGSMYLVAVVGNVTILAVVKIERSL
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CCDS31 MTLGSLGNSSSSVSATFLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKTERSL
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pF1KB7 HQPMYFFLCMLAAIDLVLSTSTIPKLLGIFWFGACDIGLDACLGQMFLIHCFATVESGIF
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pF1KB7 LAMAFDRYVAICNPLRHSMVLTYTVVGRLGLVSLLRGVLYIGPLPLMIRLRLPLYKTHVI
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CCDS31 LSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLK-RFPYCGSPVL
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pF1KB7 SHSYCEHMAVVALTCGDSRVNNVYGLSIGFLVLILDSVAIAASYVMIFRAVMGLATPEAR
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CCDS31 SHSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLSIASRAER
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pF1KB7 LKTLGTCASHLCAILIFYVPIAVSSLIHRFGQCVPPPVHTLLANFYLLIPPILNPIVYAV
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CCDS31 FKALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQAPHLVQVVMGFMYLLFPPVMNPIVYSV
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300 310
pF1KB7 RTKQIRESLLQIPRIEMKIR
.:::::.
CCDS31 KTKQIRDRVTHAFCY
300 310
>>CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1109 init1: 594 opt: 1093 Z-score: 961.3 bits: 186.0 E(32554): 3.2e-47
Smith-Waterman score: 1093; 50.8% identity (82.0% similar) in 305 aa overlap (6-309:5-308)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MLTFHNVCSV-PSSFWLTGIPGLESLHVWLSIPFGSMYLVAVVGNVTILAVVKIERSLHQ
:. :. :. : :.:::::: ::.:.:::: : .:..:: :.: ... . .::.
CCDS31 MLPSNITSTHPAVFLLVGIPGLEHLHAWISIPFCFAYTLALLGNCTLLFIIQADAALHE
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pF1KB7 PMYFFLCMLAAIDLVLSTSTIPKLLGIFWFGACDIGLDACLGQMFLIHCFATVESGIFLA
:::.:: :::.::::::..:.::.:.:::: .:.. ::: :::..: :. .::...::
CCDS31 PMYLFLAMLATIDLVLSSTTLPKMLAIFWFRDQEINFFACLVQMFFLHSFSIMESAVLLA
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pF1KB7 MAFDRYVAICNPLRHSMVLTYTVVGRLGLVSLLRGVLYIGPLPLMIRLRLPLYKTHVISH
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CCDS31 MAFDRYVAICKPLHYTTVLTGSLITKIGMAAVARAVTLMTPLPFLLR-RFHYCRGPVIAH
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pF1KB7 SYCEHMAVVALTCGDSRVNNVYGLSIGFLVLILDSVAIAASYVMIFRAVMGLATPEARLK
:::::::: :.:::. ::.::.........:: . . :::.:..::. ::. ::: :
CCDS31 CYCEHMAVVRLACGDTSFNNIYGIAVAMFIVVLDLLFVILSYVFILQAVLQLASQEARYK
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pF1KB7 TLGTCASHLCAILIFYVPIAVSSLIHRFGQCVPPPVHTLLANFYLLIPPILNPIVYAVRT
..:::.::. ::: :.:...::..:: .. . : :: ::: ::::.::..:::.:.:.:
CCDS31 AFGTCVSHIGAILSTYTPVVISSVMHRVARHAAPRVHILLAIFYLLFPPMVNPIIYGVKT
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KB7 KQIRESLLQIPRIEMKIR
::::: .:..
CCDS31 KQIREYVLSLFQRKNM
300 310
>>CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 1089 init1: 1089 opt: 1092 Z-score: 960.4 bits: 185.9 E(32554): 3.6e-47
Smith-Waterman score: 1092; 52.1% identity (78.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLTFHNVCSVPSSFWLTGIPGLESLHVWLSIPFGSMYLVAVVGNVTILAVVKIERSLHQP
: ::.. .::.: : :::::::.. :..:::..:::..:.:: ::...: : ::: :
CCDS31 MPTFNGSVFMPSAFILIGIPGLESVQCWIGIPFSAMYLIGVIGNSLILVIIKYENSLHIP
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pF1KB7 MYFFLCMLAAIDLVLSTSTIPKLLGIFWFGACDIGLDACLGQMFLIHCFATVESGIFLAM
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CCDS31 MYIFLAMLAATDIALNTCILPKMLGIFWFHLPEISFDACLFQMWLIHSFQAIESGILLAM
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pF1KB7 AFDRYVAICNPLRHSMVLTYTVVGRLGLVSLLRGVLYIGPLPLMIRLRLPLYKTHVISHS
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CCDS31 ALDRYVAICIPLRHATIFSQQFLTHIGLGVTLRAAILIIPSLGLIKCCLKHYRTTVISHS
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pF1KB7 YCEHMAVVALTCGDSRVNNVYGLSIGFLVLILDSVAIAASYVMIFRAVMGLATPEARLKT
::::::.: :. : :::..::: ..: .: .: . :. :::.:: .:. : :::.:.
CCDS31 YCEHMAIVKLATEDIRVNKIYGLFVAFAILGFDIIFITLSYVQIFITVFQLPQKEARFKA
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pF1KB7 LGTCASHLCAILIFYVPIAVSSLIHRFGQCVPPPVHTLLANFYLLIPPILNPIVYAVRTK
..:: .:.:..: ::. : . ::::. .:: .: ::.:.:::.::.::::::.:.::
CCDS31 FNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSHIPPYIHILLSNLYLLVPPFLNPIVYGVKTK
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310
pF1KB7 QIRESLLQIPRIEMKIR
:::. ....
CCDS31 QIRDHIVKVFFFKKVT
310
>>CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 968 init1: 636 opt: 1087 Z-score: 956.0 bits: 185.1 E(32554): 6.3e-47
Smith-Waterman score: 1087; 49.0% identity (79.7% similar) in 310 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLTFHNVCSVPSSFWLTGIPGLESLHVWLSIPFGSMYLVAVVGNVTILAVVKIERSLHQP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]