FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7388, 360 aa
1>>>pF1KB7388 360 - 360 aa - 360 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0788+/-0.00125; mu= 12.0639+/- 0.073
mean_var=176.4213+/-62.250, 0's: 0 Z-trim(101.9): 394 B-trim: 402 in 1/47
Lambda= 0.096560
statistics sampled from 6260 (6731) to 6260 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.541), E-opt: 0.2 (0.207), width: 16
Scan time: 2.440
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 1406 209.2 3.8e-54
CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 ( 309) 1402 208.6 5.6e-54
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 1401 208.5 6.2e-54
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 1131 170.9 1.3e-42
CCDS11022.1 OR1A1 gene_id:8383|Hs108|chr17 ( 309) 1095 165.9 4.2e-41
CCDS35125.1 OR1Q1 gene_id:158131|Hs108|chr9 ( 314) 1095 165.9 4.3e-41
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CCDS11024.1 OR1E1 gene_id:8387|Hs108|chr17 ( 314) 1077 163.4 2.4e-40
CCDS11019.1 OR1D2 gene_id:4991|Hs108|chr17 ( 312) 1069 162.3 5.2e-40
CCDS11020.1 OR1G1 gene_id:8390|Hs108|chr17 ( 313) 1063 161.4 9.3e-40
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 1062 161.3 1e-39
CCDS35120.1 OR1J1 gene_id:347168|Hs108|chr9 ( 322) 1056 160.5 1.9e-39
CCDS35123.1 OR1N2 gene_id:138882|Hs108|chr9 ( 330) 1056 160.5 1.9e-39
CCDS41481.1 OR1C1 gene_id:26188|Hs108|chr1 ( 314) 1050 159.6 3.3e-39
CCDS35122.1 OR1J4 gene_id:26219|Hs108|chr9 ( 313) 1043 158.6 6.4e-39
CCDS58499.1 OR1D5 gene_id:8386|Hs108|chr17 ( 312) 1040 158.2 8.6e-39
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CCDS32937.1 OR1I1 gene_id:126370|Hs108|chr19 ( 355) 1016 155.0 9.4e-38
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CCDS35132.1 OR1K1 gene_id:392392|Hs108|chr9 ( 316) 1003 153.1 3.1e-37
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CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 967 148.1 9.9e-36
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 965 147.8 1.2e-35
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 963 147.5 1.5e-35
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 962 147.3 1.6e-35
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 962 147.4 1.6e-35
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 960 147.1 1.9e-35
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 958 146.8 2.3e-35
CCDS12318.1 OR7A5 gene_id:26659|Hs108|chr19 ( 319) 958 146.8 2.4e-35
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 957 146.7 2.6e-35
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 945 145.0 8.3e-35
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 945 145.0 8.3e-35
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 944 144.9 9.2e-35
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 943 144.8 1.1e-34
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 942 144.6 1.1e-34
CCDS32936.1 OR7A10 gene_id:390892|Hs108|chr19 ( 309) 939 144.1 1.5e-34
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 938 144.0 1.7e-34
CCDS12319.1 OR7A17 gene_id:26333|Hs108|chr19 ( 309) 936 143.7 2e-34
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 935 143.6 2.2e-34
>>CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 (310 aa)
initn: 2036 init1: 2036 opt: 2036 Z-score: 1559.8 bits: 297.0 E(32554): 1.5e-80
Smith-Waterman score: 2036; 100.0% identity (100.0% similar) in 310 aa overlap (51-360:1-310)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 KNKRRNFGQIVSDVGRICYSVSLSLGEPTTMGRNNLTRPSEFILLGLSSRPEDQKPLFAV
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MGRNNLTRPSEFILLGLSSRPEDQKPLFAV
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 FLPIYLITVIGNLLIILAIRSDTRLQTPMYFFLSILSFVDICYVTVIIPKMLVNFLSETK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FLPIYLITVIGNLLIILAIRSDTRLQTPMYFFLSILSFVDICYVTVIIPKMLVNFLSETK
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 TISYSECLTQMYFFLAFGNTDSYLLAAMAIDRYVAICNPFHYITIMSHRCCVLLLVLSFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TISYSECLTQMYFFLAFGNTDSYLLAAMAIDRYVAICNPFHYITIMSHRCCVLLLVLSFC
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 IPHFHSLLHILLTNQLIFCASNVIHHFFCDDQPVLKLSCSSHFVKEITVMTEGLAVIMTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 IPHFHSLLHILLTNQLIFCASNVIHHFFCDDQPVLKLSCSSHFVKEITVMTEGLAVIMTP
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 FSCIIISYLRILITVLKIPSAAGKRKAFSTCGSHLTVVTLFYGSISYLYFQPLSNYTVKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FSCIIISYLRILITVLKIPSAAGKRKAFSTCGSHLTVVTLFYGSISYLYFQPLSNYTVKD
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360
pF1KB7 QIATIIYTVLTPMLNPFIYSLRNKDMKQGLAKLMHRMKCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QIATIIYTVLTPMLNPFIYSLRNKDMKQGLAKLMHRMKCQ
280 290 300 310
>>CCDS35128.1 OR1L3 gene_id:26735|Hs108|chr9 (324 aa)
initn: 1651 init1: 1606 opt: 1606 Z-score: 1235.9 bits: 237.1 E(32554): 1.6e-62
Smith-Waterman score: 1606; 78.1% identity (93.2% similar) in 310 aa overlap (51-360:1-310)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 KNKRRNFGQIVSDVGRICYSVSLSLGEPTTMGRNNLTRPSEFILLGLSSRPEDQKPLFAV
:: .:::: ::::::::::: :::.::::.
CCDS35 MGMSNLTRLSEFILLGLSSRSEDQRPLFAL
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 FLPIYLITVIGNLLIILAIRSDTRLQTPMYFFLSILSFVDICYVTVIIPKMLVNFLSETK
:: :::.:..:::::::::.:: :::.:::::::::::.::::.:::.:::::::::: :
CCDS35 FLIIYLVTLMGNLLIILAIHSDPRLQNPMYFFLSILSFADICYTTVIVPKMLVNFLSEKK
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 TISYSECLTQMYFFLAFGNTDSYLLAAMAIDRYVAICNPFHYITIMSHRCCVLLLVLSFC
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CCDS35 TISYAECLAQMYFFLVFGNIDSYLLAAMAINRCVAICNPFHYVTVMNRRCCVLLLAFPIT
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 IPHFHSLLHILLTNQLIFCASNVIHHFFCDDQPVLKLSCSSHFVKEITVMTEGLAVIMTP
. .::::::.::.:.: ::.:::::::::: .::::::::: ::.::..:::::: .:.:
CCDS35 FSYFHSLLHVLLVNRLTFCTSNVIHHFFCDVNPVLKLSCSSTFVNEIVAMTEGLASVMAP
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 FSCIIISYLRILITVLKIPSAAGKRKAFSTCGSHLTVVTLFYGSISYLYFQPLSNYTVKD
: :::::::::::.::::::::::.::::::.:::::: ::::::::.:.::::.:::::
CCDS35 FVCIIISYLRILIAVLKIPSAAGKHKAFSTCSSHLTVVILFYGSISYVYLQPLSSYTVKD
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360
pF1KB7 QIATIIYTVLTPMLNPFIYSLRNKDMKQGLAKLMHRMKCQ
.:::: ::::: .::::::::::::::.:: ::....: :
CCDS35 RIATINYTVLTSVLNPFIYSLRNKDMKRGLQKLINKIKSQMSRFSTKTNKICGP
280 290 300 310 320
>>CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 (311 aa)
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Smith-Waterman score: 1406; 69.0% identity (88.2% similar) in 306 aa overlap (53-357:4-309)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 KRRNFGQIVSDVGRICYSVSLSLGEPTTMGRNNLTRPSEFILLGLSSRPEDQKPLFAVFL
.: . : :::::::: :. ::::::.::
CCDS35 MEIKNYSSSTSGFILLGLSSNPQLQKPLFAIFL
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90 100 110 120 130 140
pF1KB7 PIYLITVIGNLLIILAIRSDTRLQTPMYFFLSILSFVDICYVTVIIPKMLVNFLSETKTI
.::....::.::: :: :: ::.:::::::: :::.:::..:::.::::::::::::.:
CCDS35 IMYLLAAVGNVLIIPAIYSDPRLHTPMYFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSETKVI
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pF1KB7 SYSECLTQMYFFLAFGNTDSYLLAAMAIDRYVAICNPFHYITIMSHRCCVLLLVLSFCIP
:: ::.:::::.:::::::::::.::::: ::::::.:: ..:. : :.:.:. : :
CCDS35 SYVGCLAQMYFFMAFGNTDSYLLASMAIDRLVAICNPLHYDVVMKPRHCLLMLLGSCSIS
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210 220 230 240 250 260
pF1KB7 HFHSLLHILLTNQLIFCASNVIHHFFCDDQPVLKLSCSSHFVKEITVMTEGLAVIMTPFS
:.:::...:: ..: ::::..:.::::: :::::::::. ....:::: ::::.:::
CCDS35 HLHSLFRVLLMSRLSFCASHIIKHFFCDTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETLAVIVTPFL
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pF1KB7 CIIISYLRILITVLKIPSAAGKRKAFSTCGSHLTVVTLFYGSISYLYFQPLSNYTV-KDQ
:::.:::::..:::.::::::: :::::::::::.:.:::::: :.::.::: :.: .:.
CCDS35 CIIFSYLRIMVTVLRIPSAAGKWKAFSTCGSHLTAVALFYGSIIYVYFRPLSMYSVVRDR
220 230 240 250 260 270
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pF1KB7 IATIIYTVLTPMLNPFIYSLRNKDMKQGLAKLMHRMKCQ
.::..:::.:::::::::::::::::.:: ::. :.
CCDS35 VATVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDMKRGLKKLQDRIYR
280 290 300 310
>>CCDS35124.1 OR1L8 gene_id:138881|Hs108|chr9 (309 aa)
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Smith-Waterman score: 1402; 69.6% identity (87.8% similar) in 303 aa overlap (54-356:5-307)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 RRNFGQIVSDVGRICYSVSLSLGEPTTMGRNNLTRPSEFILLGLSSRPEDQKPLFAVFLP
:. . :::::::::::::::: ::..::
CCDS35 MERINHTSSVSEFILLGLSSRPEDQKTLFVLFLI
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 IYLITVIGNLLIILAIRSDTRLQTPMYFFLSILSFVDICYVTVIIPKMLVNFLSETKTIS
.::.:. :::::::::: . .::::::::::.::..:::..: ..::::.::::: ::::
CCDS35 VYLVTITGNLLIILAIRFNPHLQTPMYFFLSFLSLTDICFTTSVVPKMLMNFLSEKKTIS
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pF1KB7 YSECLTQMYFFLAFGNTDSYLLAAMAIDRYVAICNPFHYITIMSHRCCVLLLVLSFCIPH
:. :::::::. :.::.:: :::.::.:::::.:.::::.: :::. ::::...: .::
CCDS35 YAGCLTQMYFLYALGNSDSCLLAVMAFDRYVAVCDPFHYVTTMSHHHCVLLVAFSCSFPH
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pF1KB7 FHSLLHILLTNQLIFCASNVIHHFFCDDQPVLKLSCSSHFVKEITVMTEGLAVIMTPFSC
.::::: :: :.: :: :::::::.:: .::::::::: ::.::. :::. :..: : :
CCDS35 LHSLLHTLLLNRLTFCDSNVIHHFLCDLSPVLKLSCSSIFVNEIVQMTEAPIVLVTRFLC
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pF1KB7 IIISYLRILITVLKIPSAAGKRKAFSTCGSHLTVVTLFYGSISYLYFQPLSNYTVKDQIA
: .::.::: :::::::..:::::::::: .::::::::::: .:.:: :.:.:::..:
CCDS35 IAFSYIRILTTVLKIPSTSGKRKAFSTCGFYLTVVTLFYGSIFCVYLQPPSTYAVKDHVA
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360
pF1KB7 TIIYTVLTPMLNPFIYSLRNKDMKQGLAKLMHRMKCQ
::.::::. :::::::::::::.:::: ::: .
CCDS35 TIVYTVLSSMLNPFIYSLRNKDLKQGLRKLMSKRS
280 290 300
>>CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 (311 aa)
initn: 1430 init1: 1204 opt: 1401 Z-score: 1081.7 bits: 208.5 E(32554): 6.2e-54
Smith-Waterman score: 1401; 69.0% identity (86.9% similar) in 306 aa overlap (53-357:4-309)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 KRRNFGQIVSDVGRICYSVSLSLGEPTTMGRNNLTRPSEFILLGLSSRPEDQKPLFAVFL
.: . : :::::::: :. ::::::.::
CCDS35 METKNYSSSTSGFILLGLSSNPKLQKPLFAIFL
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 PIYLITVIGNLLIILAIRSDTRLQTPMYFFLSILSFVDICYVTVIIPKMLVNFLSETKTI
.::.:..::.:::::: :: ::.:::::::: :::.:::..:::.:::::::::::: :
CCDS35 IMYLLTAVGNVLIILAIYSDPRLHTPMYFFLSNLSFMDICFTTVIVPKMLVNFLSETKII
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 SYSECLTQMYFFLAFGNTDSYLLAAMAIDRYVAICNPFHYITIMSHRCCVLLLVLSFCIP
:: :: :::::.:::::::::::.::::: ::::::.:: ..:. :.:.:. : :
CCDS35 SYVGCLIQMYFFMAFGNTDSYLLASMAIDRLVAICNPLHYDVVMKPWHCLLMLLGSCSIS
100 110 120 130 140 150
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pF1KB7 HFHSLLHILLTNQLIFCASNVIHHFFCDDQPVLKLSCSSHFVKEITVMTEGLAVIMTPFS
:.:::...:: ..: ::::..:.::::: :::::::::. ....:::: ::::.:::
CCDS35 HLHSLFRVLLMSRLSFCASHIIKHFFCDTQPVLKLSCSDTSSSQMVVMTETLAVIVTPFL
160 170 180 190 200 210
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pF1KB7 CIIISYLRILITVLKIPSAAGKRKAFSTCGSHLTVVTLFYGSISYLYFQPLSNYTV-KDQ
: :.:::.:..:::.::::::: :::::::::::::.:::::. :.::.::: :.: : .
CCDS35 CTIFSYLQIIVTVLRIPSAAGKWKAFSTCGSHLTVVVLFYGSVIYVYFRPLSMYSVMKGR
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360
pF1KB7 IATIIYTVLTPMLNPFIYSLRNKDMKQGLAKLMHRMKCQ
.::..:::.:::::::::::::::::.:: :: ::.
CCDS35 VATVMYTVVTPMLNPFIYSLRNKDMKRGLKKLRHRIYS
280 290 300 310
>>CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 (312 aa)
initn: 1232 init1: 973 opt: 1131 Z-score: 878.4 bits: 170.9 E(32554): 1.3e-42
Smith-Waterman score: 1131; 54.2% identity (80.2% similar) in 308 aa overlap (51-357:1-308)
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CCDS10 DTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
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CCDS11 DAVITVMYTAVTPMLNPFIYSLRNRDMKAALRKLFNKRISS
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CCDS35 FSLMYAINISGNLAIITLILSAPRLHIPMYIFLSNLALTDICFTSTTVPKMLQIIFSPTK
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CCDS35 VISYTGCLAQTYFFICFAVMENFILAVMAYDRYIAICHPFHYTMILTRMLCVKMVVMCHA
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CCDS35 LSHLHAMLHTFLIGQLIFCADNRIPHFFCDLYALMKISCTSTYLNTLMIHTEGAVVISGA
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CCDS35 LAFITASYACIILVVLRIPSAKGRWKTFSTCGSHLTVVAIFYGTLSWVYFRPLSSYSVTK
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CCDS35 GRIITVVYTVVTPMLNPFIYSLRNGDVKGGFMKWMSRMQTFFFR
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CCDS32 MEPRNQTSASQFILLGLSEKPEQETLLFSLFFCM
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CCDS32 YLVMVVGNLLIILAISIDSHLHTPMYFFLANLSLVDFCLATNTIPKMLVSLQTGSKAISY
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pF1KB7 SECLTQMYFFLAFGNTDSYLLAAMAIDRYVAICNPFHYITIMSHRCCVLLLVLSFCIPHF
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CCDS32 PCCLIQMYFFHFFGIVDSVIIAMMAYDRFVAICHPLHYAKIMSLRLCRLLVGALWAFSCF
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CCDS32 ISLTHILLMARLVFCGSHEVPHYFCDLTPILRLSCTDTSVNRIFILIVAGMVIATPFVCI
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CCDS32 LASYARILVAIMKVPSAGGRKKAFSTCSSHLSVVALFYGTTIGVYLCPSSVLTTVKEKAS
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CCDS32 AVMYTAVTPMLNPFIYSLRNRDLKGALRKLVNRKITSSS
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CCDS11 MMGQNQ-TSISDFLLLGLPIQPEQQNLCYAL
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CCDS11 FLAMYLTTLLGNLLIIVLIRLDSHLHTPMYLFLSNLSFSDLCFSSVTIPKLLQNMQNQDP
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CCDS11 SIPYADCLTQMYFFLLFGDLESFLLVAMAYDRYVAICFPLHYTAIMSPMLCLALVALSWV
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CCDS11 LTTFHAMLHTLLMARLCFCADNVIPHFFCDMSALLKLAFSDTRVNEWVIFIMGGLILVIP
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CCDS11 FLLILGSYARIVSSILKVPSSKGICKAFSTCGSHLSVVSLFYGTVIGLYLCSSANSSTLK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]