Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7390
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7390, 321 aa
1>>>pF1KB7390 321 - 321 aa - 321 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1761+/-0.000903; mu= 16.8791+/- 0.054
mean_var=101.8398+/-29.420, 0's: 0 Z-trim(105.6): 110 B-trim: 479 in 1/47
Lambda= 0.127091
statistics sampled from 8360 (8494) to 8360 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.261), width: 16
Scan time: 2.480
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31625.1 MRGPRD gene_id:116512|Hs108|chr11 ( 321) 2129 401.2 5.6e-112
CCDS7831.1 MRGPRX4 gene_id:117196|Hs108|chr11 ( 322) 735 145.6 4.9e-35
CCDS7846.1 MRGPRX1 gene_id:259249|Hs108|chr11 ( 322) 725 143.8 1.8e-34
CCDS7847.1 MRGPRX2 gene_id:117194|Hs108|chr11 ( 330) 710 141.0 1.2e-33
CCDS7830.1 MRGPRX3 gene_id:117195|Hs108|chr11 ( 322) 686 136.6 2.5e-32
CCDS8188.1 MRGPRF gene_id:116535|Hs108|chr11 ( 343) 650 130.1 2.5e-30
CCDS41603.2 MRGPRE gene_id:116534|Hs108|chr11 ( 312) 642 128.6 6.5e-30
CCDS5272.1 MAS1 gene_id:4142|Hs108|chr6 ( 325) 597 120.3 2e-27
CCDS44520.1 MRGPRG gene_id:386746|Hs108|chr11 ( 289) 459 95.0 7.8e-20
CCDS4661.1 MAS1L gene_id:116511|Hs108|chr6 ( 378) 412 86.5 3.7e-17
>>CCDS31625.1 MRGPRD gene_id:116512|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 2129 init1: 2129 opt: 2129 Z-score: 2123.8 bits: 401.2 E(32554): 5.6e-112
Smith-Waterman score: 2129; 100.0% identity (100.0% similar) in 321 aa overlap (1-321:1-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MNQTLNSSGTVESALNYSRGSTVHTAYLVLSSLAMFTCLCGMAGNSMVIWLLGFRMHRNP
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CCDS31 MNQTLNSSGTVESALNYSRGSTVHTAYLVLSSLAMFTCLCGMAGNSMVIWLLGFRMHRNP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FCIYILNLAAADLLFLFSMASTLSLETQPLVNTTDKVHELMKRLMYFAYTVGLSLLTAIS
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CCDS31 FCIYILNLAAADLLFLFSMASTLSLETQPLVNTTDKVHELMKRLMYFAYTVGLSLLTAIS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 TQRCLSVLFPIWFKCHRPRHLSAWVCGLLWTLCLLMNGLTSSFCSKFLKFNEDRCFRVDM
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CCDS31 TQRCLSVLFPIWFKCHRPRHLSAWVCGLLWTLCLLMNGLTSSFCSKFLKFNEDRCFRVDM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VQAALIMGVLTPVMTLSSLTLFVWVRRSSQQWRRQPTRLFVVVLASVLVFLICSLPLSIY
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CCDS31 VQAALIMGVLTPVMTLSSLTLFVWVRRSSQQWRRQPTRLFVVVLASVLVFLICSLPLSIY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 WFVLYWLSLPPEMQVLCFSLSRLSSSVSSSANPVIYFLVGSRRSHRLPTRSLGTVLQQAL
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CCDS31 WFVLYWLSLPPEMQVLCFSLSRLSSSVSSSANPVIYFLVGSRRSHRLPTRSLGTVLQQAL
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB7 REEPELEGGETPTVGTNEMGA
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CCDS31 REEPELEGGETPTVGTNEMGA
310 320
>>CCDS7831.1 MRGPRX4 gene_id:117196|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 451 init1: 294 opt: 735 Z-score: 742.5 bits: 145.6 E(32554): 4.9e-35
Smith-Waterman score: 735; 42.8% identity (68.9% similar) in 318 aa overlap (1-310:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MNQTLNSSGTVESALNYSRGSTVHTAYLVLSSLAMFTCLCGMAGNSMVIWLLGFRMHRNP
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CCDS78 MDPTVPVFGTKLTPINGREETPCYNQTLSFTVLTCIISLVGLTGNAVVLWLLGYRMRRNA
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 FCIYILNLAAADLLFLFSMASTLSLETQPLVNTTDKVHELMKRLMYFAYTVGLSLLTAIS
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CCDS78 VSIYILNLAAADFLFLSFQIIRLPLR---LINISHLIRKILVSVMTFPYFTGLSMLSAIS
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB7 TQRCLSVLFPIWFKCHRPRHLSAWVCGLLWTLCLLMNGLTSSFCSKFLKFNEDR--CFRV
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CCDS78 TERCLSVLWPIWYRCRRPTHLSAVVCVLLWGLSLLFSMLEWRFCD-FLFSGADSSWCETS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 DMVQAALIMGVLTPVMTLSSLTLFVWVRRSSQQWRRQP-TRLFVVVLASVLVFLICSLPL
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CCDS78 DFIPVAWLI-FLCVVLCVSSLVLLVRILCGS---RKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 SIYWFVLYWLSLPPEM-----QVLCFSLSRLSSSVSSSANPVIYFLVGSRRSHRLPTRSL
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CCDS78 GILGALIYRMHLNLEVLYCHVYLVCMSLS----SLNSSANPIIYFFVGSFR-QRQNRQNL
240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KB7 GTVLQQALREEPELEGGETPTVGTNEMGA
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CCDS78 KLVLQRALQDKPEVDKGEGQLPEESLELSGSRLGP
290 300 310 320
>>CCDS7846.1 MRGPRX1 gene_id:259249|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 501 init1: 272 opt: 725 Z-score: 732.6 bits: 143.8 E(32554): 1.8e-34
Smith-Waterman score: 725; 42.1% identity (69.8% similar) in 321 aa overlap (1-312:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MNQTLNSSGTVESALNYSRGSTVHTAYLVLSSLAMFTCLCGMAGNSMVIWLLGFRMHRNP
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CCDS78 MDPTISTLDTELTPINGTEETLCYKQTLSLTVLTCIVSLVGLTGNAVVLWLLGCRMRRNA
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 FCIYILNLAAADLLFLFS--MASTLSLETQPLVNTTDKVHELMKRLMYFAYTVGLSLLTA
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CCDS78 FSIYILNLAAADFLFLSGRLIYSLLSFISIP--HTISKI---LYPVMMFSYFAGLSFLSA
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 ISTQRCLSVLFPIWFKCHRPRHLSAWVCGLLWTLCLLMNGLTSSFCSKFLKFNEDR--CF
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CCDS78 VSTERCLSVLWPIWYRCHRPTHLSAVVCVLLWALSLLRSILEWMLCG-FLFSGADSAWCQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 RVDMVQAALIMGVLTPVMTLSSLTLFVWVRRSSQQWRRQP-TRLFVVVLASVLVFLICSL
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CCDS78 TSDFITVAWLI-FLCVVLCGSSLVLLIRILCGS---RKIPLTRLYVTILLTVLVFLLCGL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 PLSIYWFVLYWLSLPPEMQVLCFS--LSRLSSSVSSSANPVIYFLVGSRRSHRLPTRSLG
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CCDS78 PFGIQFFLFLWIHVDREV-LFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFR-QRQNRQNLK
240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KB7 TVLQQALREEPELE--GGETPTVGTNEMGA
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CCDS78 LVLQRALQDASEVDEGGGQLPEEILELSGSRLEQ
290 300 310 320
>>CCDS7847.1 MRGPRX2 gene_id:117194|Hs108|chr11 (330 aa)
initn: 621 init1: 299 opt: 710 Z-score: 717.6 bits: 141.0 E(32554): 1.2e-33
Smith-Waterman score: 710; 43.1% identity (70.5% similar) in 295 aa overlap (33-319:36-324)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 QTLNSSGTVESALNYSRGSTVHTAYLVLSSLAMFTCLCGMAGNSMVIWLLGFRMHRNPFC
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CCDS78 PAWGTESTTVNGNDQALLLLCGKETLIPVFLILFIALVGLVGNGFVLWLLGFRMRRNAFS
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 IYILNLAAADLLFL-FSMASTLSLETQPLVNTTDKVHELMKRLMYFAYTVGLSLLTAIST
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CCDS78 VYVLSLAGADFLFLCFQIINCLVYLSNFFCSISINFPSFFTTVMTCAYLAGLSMLSTVST
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB7 QRCLSVLFPIWFKCHRPRHLSAWVCGLLWTLCLLMNGLTSSFCSKFLKFNEDR--CFRVD
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CCDS78 ERCLSVLWPIWYRCRRPRHLSAVVCVLLWALSLLLSILEGKFCG-FLFSDGDSGWCQTFD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 MVQAALIMGVLTPVMTLSSLTLFVWVRRSSQQWRRQP-TRLFVVVLASVLVFLICSLPLS
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CCDS78 FITAAWLI-FLFMVLCGSSLALLVRILCGS---RGLPLTRLYLTILLTVLVFLLCGLPFG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 IYWFVLYWLSLPPEMQVLCF--SLSRLSSSVSSSANPVIYFLVGS-RRSHRLPTRSLGTV
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CCDS78 IQWFLILWIWKDSDV-LFCHIHPVSVVLSSLNSSANPIIYFFVGSFRKQWRLQQPILKLA
250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KB7 LQQALREEPELEGGE-TPTVGTNEMGA
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CCDS78 LQRALQDIAEVDHSEGCFRQGTPEMSRSSLV
300 310 320 330
>>CCDS7830.1 MRGPRX3 gene_id:117195|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 671 init1: 275 opt: 686 Z-score: 693.9 bits: 136.6 E(32554): 2.5e-32
Smith-Waterman score: 686; 40.4% identity (68.2% similar) in 314 aa overlap (1-309:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MNQTLNSSGTVESALNYSRGSTVHTAYLVLSSLAMFTCLCGMAGNSMVIWLLGFRMHRNP
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CCDS78 MDSTIPVLGTELTPINGREETPCYKQTLSFTGLTCIVSLVALTGNAVVLWLLGCRMRRNA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FCIYILNLAAADLLFLFSMASTLSLETQPLVNTTDKVHELMKRLMYFAYTVGLSLLTAIS
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CCDS78 VSIYILNLVAADFLFLSGHIICSPLR---LINIRHPISKILSPVMTFPYFIGLSMLSAIS
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130 140 150 160 170
pF1KB7 TQRCLSVLFPIWFKCHRPRHLSAWVCGLLWTLCLLMNGLTSSFCS-KFLKFNEDRCFRVD
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CCDS78 TERCLSILWPIWYHCRRPRYLSSVMCVLLWALSLLRSILEWMFCDFLFSGANSVWCETSD
120 130 140 150 160 170
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pF1KB7 MVQAALIMGVLTPVMTLSSLTLFVWVRRSSQQWRRQP-TRLFVVVLASVLVFLICSLPLS
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CCDS78 FITIAWLV-FLCVVLCGSSLVLLVRILCGS---RKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFG
180 190 200 210 220 230
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pF1KB7 IYWFVLYWLSLPPEMQVLCFS--LSRLSSSVSSSANPVIYFLVGSRRSHRLPTRSLGTVL
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CCDS78 IQWALFSRIHLDWKV-LFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFR-QRQNRQNLKLVL
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KB7 QQALREEPEL-EGGETPTVGTNEMGA
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CCDS78 QRALQDTPEVDEGGGWLPQETLELSGSRLEQ
300 310 320
>>CCDS8188.1 MRGPRF gene_id:116535|Hs108|chr11 (343 aa)
initn: 599 init1: 256 opt: 650 Z-score: 657.9 bits: 130.1 E(32554): 2.5e-30
Smith-Waterman score: 650; 37.3% identity (67.2% similar) in 332 aa overlap (2-319:13-335)
10 20 30 40
pF1KB7 MNQTLNSSGTVESALNYSRG--STVHTAYL----VLSSLAMFTCLCGMA
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CCDS81 MAGNCSWEAHPGNRNKMCPGLSEAPELYSRGFLTIEQIAMLPPPAVMNYIFLLLCLCGLV
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 GNSMVIWLLGFRMHRNPFCIYILNLAAADLLFLFSMASTLSLETQPLVNT-TDKVHELMK
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CCDS81 GNGLVLWFFGFSIKRNPFSIYFLHLASADVGYLFSKAVFSILNTGGFLGTFADYIRSVCR
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 RLMYFAYTVGLSLLTAISTQRCLSVLFPIWFKCHRPRHLSAWVCGLLWTLCLLMNGLTSS
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CCDS81 VLGLCMFLTGVSLLPAVSAERCASVIFPAWYWRRRPKRLSAVVCALLWVLSLLVTCLHNY
130 140 150 160 170 180
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pF1KB7 FCSKFLKFNED--RCFRVDMVQAALIMGVLTPVMTLSSLTLFVWVRRSSQQWRRQPTRLF
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CCDS81 FCV-FLGRGAPGAACRHMDIFLGILLFLLCCPLMVLPCLALILHVECRARR-RQRSAKLN
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KB7 VVVLASVLVFLICSLPLSIYWFVLYWLSLP---PEMQVLCFSLSRLSSSVSSSANPVIYF
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CCDS81 HVILAMVSVFLVSSIYLGIDWFLFWVFQIPAPFPEY------VTDLCICINSSAKPIVYF
240 250 260 270 280 290
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pF1KB7 LVGSRRSHRLPTRSLGTVLQQALREEPEL--EGGETPTVGTNEMGA
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CCDS81 LAGRDKSQRL-WEPLRVVFQRALRDGAELGEAGGSTPNTVTMEMQCPPGNAS
300 310 320 330 340
>>CCDS41603.2 MRGPRE gene_id:116534|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 597 init1: 318 opt: 642 Z-score: 650.5 bits: 128.6 E(32554): 6.5e-30
Smith-Waterman score: 642; 38.8% identity (66.8% similar) in 307 aa overlap (20-321:16-312)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNQTLNSSGTVESALNYSRGSTVHTAY-LVLSSLAMFTCLCGMAGNSMVIWLLGFRMHRN
:. .:. :.. ::. : :. ::. :.:::. ..::
CCDS41 MMEPREAGQHVGAANGAQEDVAFNLIILSLTEGLGLGGLLGNGAVLWLLSSNVYRN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 PFCIYILNLAAADLLFL-FSMASTLSLETQPLVNTTDKVHELMKRLMYFAYTVGLSLLTA
:: ::.:..: :::.:: :.. . : .. :. . : .: : ::::::.:
CCDS41 PFAIYLLDVACADLIFLGCHMVAIVPDLLQGRLDFPGFVQTSLATLRFFCYIVGLSLLAA
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120 130 140 150 160 170
pF1KB7 ISTQRCLSVLFPIWFKCHRPRHLSAWVCGLLWTLCLLMNGLTSSFCSKFLKFNEDRCFRV
.:...::..::: :..:.:::::.. ::.: :.::::.. : :. :..:. . :.
CCDS41 VSVEQCLAALFPAWYSCRRPRHLTTCVCALTWALCLLLHLLLSGACTQFFGEPSRHLCRT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 DMVQAALIMGVLTPVMTLSSLTLFVWVRRSSQQWRRQPTRLFV-VVLASVLVFLICSLPL
. ::.....: .: .:: :.. :.:. : : : : : ..: .::.::.:.::.
CCDS41 LWLVAAVLLALLCCTMCGASLMLLLRVERGPQ---RPPPRGFPGLILLTVLLFLFCGLPF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 SIYWFVLYWLSLPPEMQVLCFSLSRLSSSVSSSANPVIYFLVGSRRSHRLPTRSLGTVLQ
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CCDS41 GIYWLSRNLLWYIPHY---FYHFSFLMAAVHCAAKPVVYFCLGSAQGRRLPLR---LVLQ
240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KB7 QALREEPELEGG--ETPTVGTNEMGA
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CCDS41 RALGDEAEL-GAVRETSRRGLVDIAA
290 300 310
>>CCDS5272.1 MAS1 gene_id:4142|Hs108|chr6 (325 aa)
initn: 480 init1: 325 opt: 597 Z-score: 605.7 bits: 120.3 E(32554): 2e-27
Smith-Waterman score: 597; 34.0% identity (65.1% similar) in 315 aa overlap (1-303:1-306)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNQTLNSSGTVESALNYSRG-----STVHTAYLVLSSLAMFTCLCGMAGNSMVIWLLGFR
:. . .: .:: : : : ...: .. . : :.. :....:.: ::
CCDS52 MDGSNVTSFVVEEPTNISTGRNASVGNAHRQIPIVHWVIMSISPVGFVENGILLWFLCFR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 MHRNPFCIYILNLAAADLLFLFSMASTLSLETQPLVNTTDKVHELMKRL---MYFAYTVG
:.:::: .:: .:. ::. .:: . ::.. . .. . . : . :.:..:
CCDS52 MRRNPFTVYITHLSIADISLLFCIF-ILSIDYALDYELSSGHYYTIVTLSVTFLFGYNTG
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LSLLTAISTQRCLSVLFPIWFKCHRPRHLSAWVCGLLWTLCLLMNGLTSSFCSKFLKFNE
: ::::::..::::::.:::..::::.. :: ::.:::.: :.. . .: . ..
CCDS52 LYLLTAISVERCLSVLYPIWYRCHRPKYQSALVCALLWALSCLVTTMEYVMCIDREEESH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]