Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7400
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7400, 305 aa
1>>>pF1KB7400 305 - 305 aa - 305 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8104+/-0.00116; mu= 12.0193+/- 0.068
mean_var=129.9715+/-44.841, 0's: 0 Z-trim(101.8): 367 B-trim: 812 in 2/48
Lambda= 0.112499
statistics sampled from 6193 (6659) to 6193 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.543), E-opt: 0.2 (0.205), width: 16
Scan time: 2.060
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1110 192.5 3.7e-49
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CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 988 172.7 3.3e-43
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CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 956 167.5 1.2e-41
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CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 952 166.8 1.9e-41
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 950 166.5 2.4e-41
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 947 166.0 3.3e-41
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 944 165.5 4.7e-41
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 942 165.2 6e-41
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 942 165.2 6.1e-41
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 939 164.7 8.2e-41
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CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 923 162.1 4.9e-40
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CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 916 161.0 1.1e-39
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CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 900 158.4 6.6e-39
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 899 158.2 7.4e-39
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 898 158.0 8.3e-39
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 893 157.2 1.4e-38
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 891 156.9 1.8e-38
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 891 156.9 1.8e-38
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 888 156.4 2.6e-38
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 886 156.1 3.2e-38
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 886 156.1 3.2e-38
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 886 156.2 3.5e-38
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 883 155.6 4.5e-38
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 879 155.0 7e-38
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 877 154.7 9e-38
CCDS31508.1 OR5D14 gene_id:219436|Hs108|chr11 ( 314) 874 154.1 1.2e-37
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 870 153.5 1.9e-37
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 870 153.5 1.9e-37
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 864 152.5 3.7e-37
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 864 152.5 3.8e-37
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 864 152.5 3.8e-37
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 863 152.4 4.3e-37
CCDS7782.1 OR5P2 gene_id:120065|Hs108|chr11 ( 322) 863 152.4 4.3e-37
>>CCDS31536.1 OR9G1 gene_id:390174|Hs108|chr11 (305 aa)
initn: 1989 init1: 1989 opt: 1989 Z-score: 1767.3 bits: 335.1 E(32554): 4e-92
Smith-Waterman score: 1989; 100.0% identity (100.0% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MQRSNHTVTEFILLGFTTDPGMQLGLFVVFLGVYSLTVVGNSTLIVLICNDSCLHTPMYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MQRSNHTVTEFILLGFTTDPGMQLGLFVVFLGVYSLTVVGNSTLIVLICNDSCLHTPMYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FTGNLSFLDLWYSSVYTPKILVTCISEDKSISFAGCLCQFFFSAGLAYSECYLLAAVAYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FTGNLSFLDLWYSSVYTPKILVTCISEDKSISFAGCLCQFFFSAGLAYSECYLLAAVAYD
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pF1KB7 RYVAISKPLLYAQAMSIKLCALLVAVSYCGGFINSSIITKKTFSFNFCRENIIDDFFCDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RYVAISKPLLYAQAMSIKLCALLVAVSYCGGFINSSIITKKTFSFNFCRENIIDDFFCDL
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pF1KB7 LPLVELACGEKGGYKIMMYFLLASNVICPAVLILASYLFIITSVLRISSSKGYLKAFSTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LPLVELACGEKGGYKIMMYFLLASNVICPAVLILASYLFIITSVLRISSSKGYLKAFSTC
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pF1KB7 SSHLTSVTLYYGSILYIYALPRSSYSFDMDKIVSTFYTVVFPMLNLMIYSLRNKDVKEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SSHLTSVTLYYGSILYIYALPRSSYSFDMDKIVSTFYTVVFPMLNLMIYSLRNKDVKEAL
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 KKLLP
:::::
CCDS31 KKLLP
>>CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 (327 aa)
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Smith-Waterman score: 1110; 56.1% identity (79.2% similar) in 303 aa overlap (1-302:16-318)
10 20 30 40
pF1KB7 MQRSNHTV-TEFILLGFTTDPGMQLGLFVVFLGVYSLTVVGNSTL
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50 60 70 80 90 100
pF1KB7 IVLICNDSCLHTPMYFFTGNLSFLDLWYSSVYTPKILVTCISEDKSISFAGCLCQFFFSA
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CCDS31 VILIRTDSHLHTPMYFFIGNLSFLDFWYTSVYTPKILASCVSEDKRISLAGCGAQLFFSC
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pF1KB7 GLAYSECYLLAAVAYDRYVAISKPLLYAQAMSIKLCALLVAVSYCGGFINSSIITKKTFS
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CCDS31 VVAYTECYLLAAMAYDRHAAICNPLLYSGTMSTALCTGLVAGSYIGGFLNAIAHTANTFR
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170 180 190 200 210 220
pF1KB7 FNFCRENIIDDFFCDLLPLVELACGEKGGYKIMMYFLLASNVICPAVLILASYLFIITSV
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CCDS31 LHFCGKNIIDHFFCDAPPLVKMSCTNTRVYEKVLLGVVGFTVLSSILAILISYVNILLAI
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230 240 250 260 270 280
pF1KB7 LRISSSKGYLKAFSTCSSHLTSVTLYYGSILYIYALPRSSYSFDMDKIVSTFYTVVFPML
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CCDS31 LRIHSASGRHKAFSTCASHLISVMLFYGSLLFMYSRPSSTYSLERDKVAALFYTVINPLL
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290 300
pF1KB7 NLMIYSLRNKDVKEALKKLLP
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CCDS31 NPLIYSLRNKDIKEAFRKATQTIQPQT
310 320
>>CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 (309 aa)
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Smith-Waterman score: 993; 50.3% identity (78.6% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MQRSNHTVTEFILLGFTTDPGMQLGLFVVFLGVYSLTVVGNSTLIVLICNDSCLHTPMYF
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pF1KB7 FTGNLSFLDLWYSSVYTPKILVTCISEDKSISFAGCLCQFFFSAGLAYSECYLLAAVAYD
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pF1KB7 RYVAISKPLLYAQAMSIKLCALLVAVSYCGGFINSSIITKKTFSFNFCRENIIDDFFCDL
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CCDS31 RHAAVCRPLHYTTTMTAGVCALLATGSYVSGFLNASIHAAGTFRLSFCGSNEINHFFCDI
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pF1KB7 LPLVELACGEKGGYKIMMYFLLASNVICPAVLILASYLFIITSVLRISSSKGYLKAFSTC
::. :.:.. :... :. . ::. ..:: ::.:: .. :. :..: :.::::
CCDS31 PPLLALSCSDTRISKLVV-FVAGFNVFFTLLVILISYFFICITIQRMHSAEGQKKVFSTC
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pF1KB7 SSHLTSVTLYYGSILYIYALPRSSYSFDMDKIVSTFYTVVFPMLNLMIYSLRNKDVKEAL
.::::.....::.:...: : :: : : :::.:.:::::.:::: .:::::::.:: ::
CCDS31 ASHLTALSIFYGTIIFMYLQPNSSQSVDTDKIASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEVKSAL
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pF1KB7 KKLLP
:.:
CCDS31 WKILNKLYPQY
300
>>CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 (314 aa)
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Smith-Waterman score: 988; 48.2% identity (77.6% similar) in 299 aa overlap (4-302:3-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MQRSNHTVTEFILLGFTTDPGMQLGLFVVFLGVYSLTVVGNSTLIVLICNDSCLHTPMYF
.: ::::::.:.: :: .:. ::.::: .: .:.::: .: :: ::::::::::
CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPMYF
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pF1KB7 FTGNLSFLDLWYSSVYTPKILVTCISEDKSISFAGCLCQFFFSAGLAYSECYLLAAVAYD
: .:::..:. :::. :::..: .. :: : . .: :::: ... .: .:::..:::
CCDS31 FLSNLSLVDFGYSSAVTPKVMVGFLTGDKFILYNACATQFFFFVAFITAESFLLASMAYD
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pF1KB7 RYVAISKPLLYAQAMSIKLCALLVAVSYCGGFINSSIITKKTFSFNFCRENIIDDFFCDL
::.:. ::: :. .:. ..:: :. :: ::.:.:: : .:: ..::: :... ::::
CCDS31 RYAALCKPLHYTTTMTTNVCACLAIGSYICGFLNASIHTGNTFRLSFCRSNVVEHFFCDA
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::. :.:... .....:... : . ..:: :::::. ..... : .: ::::::
CCDS31 PPLLTLSCSDNYISEMVIFFVVGFNDLFSILVILISYLFIFITIMKMRSPEGRQKAFSTC
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pF1KB7 SSHLTSVTLYYGSILYIYALPRSSYSFDMDKIVSTFYTVVFPMLNLMIYSLRNKDVKEAL
.::::.:...::. ...: : ::. . ::..:.::..:.:::: ..::::::.:: :.
CCDS31 ASHLTAVSIFYGTGIFMYLRPNSSHFMGTDKMASVFYAIVIPMLNPLVYSLRNKEVKSAF
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 KKLLP
::
CCDS31 KKTVGKAKASIGFIF
300 310
>>CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 (326 aa)
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Smith-Waterman score: 976; 49.5% identity (77.0% similar) in 305 aa overlap (1-304:18-321)
10 20 30 40
pF1KB7 MQRSNH-TVTEFILLGFTTDPGMQLGLFVVFLGVYSLTVVGNS
: .:: ::::::: :.: .:: ::..:::.: .:.:::
CCDS31 MGFLSPMHPCRPPTQRRMAAGNHSTVTEFILKGLTKRADLQLPLFLLFLGIYLVTIVGNL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 TLIVLICNDSCLHTPMYFFTGNLSFLDLWYSSVYTPKILVTCISEDKSISFAGCLCQFFF
.:.::: .: ::::::.: .:::..:: :::: :::.::. .:: . ::.:::. :..:
CCDS31 GMITLICLNSQLHTPMYYFLSNLSLMDLCYSSVITPKMLVNFVSEKNIISYAGCMSQLYF
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pF1KB7 SAGLAYSECYLLAAVAYDRYVAISKPLLYAQAMSIKLCALLVAVSYCGGFINSSIITKKT
.. .:::.:...:::::::: .:::: :: . : ::::: : :.:.:.: :
CCDS31 FLVFVIAECYMLTVMAYDRYVAICHPLLYNIIMSHHTCLLLVAVVYAIGLIGSTIETGLM
130 140 150 160 170 180
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pF1KB7 FSFNFCRENIIDDFFCDLLPLVELACGEKGGYKIMMYFLLASNVICPAVLILASYLFIIT
... .: :..:. .:::.:::..:.:. .. ..: . :.: .. .:.:: ::..
CCDS31 LKLPYC-EHLISHYFCDILPLMKLSCSSTYDVEMTVFFSAGFNIIVTSLTVLVSYTFILS
190 200 210 220 230
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pF1KB7 SVLRISSSKGYLKAFSTCSSHLTSVTLYYGSILYIYALPRSSYSFDMDKIVSTFYTVVFP
:.: ::...: ::::::::::..: ..::: ..: : . :. .....:.:::.:.:
CCDS31 SILGISTTEGRSKAFSTCSSHLAAVGMFYGSTAFMYLKPSTISSLTQENVASVFYTTVIP
240 250 260 270 280 290
290 300
pF1KB7 MLNLMIYSLRNKDVKEALKKLLP
::: .:::::::.:: :..: :
CCDS31 MLNPLIYSLRNKEVKAAVQKTLRGKLF
300 310 320
>>CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 (362 aa)
initn: 968 init1: 968 opt: 968 Z-score: 870.9 bits: 169.5 E(32554): 3.5e-42
Smith-Waterman score: 968; 49.3% identity (79.6% similar) in 294 aa overlap (10-303:62-355)
10 20 30
pF1KB7 MQRSNHTVTEFILLGFTTDPGMQLGLFVVFLGVYSLTVV
:: :::.:::: .: :::::::.:. :..
CCDS32 RCSTSFMVVPSFSIAEHWRRMKGANLSQGMEFELLGLTTDPQLQRLLFVVFLGMYTATLL
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40 50 60 70 80 90
pF1KB7 GNSTLIVLICNDSCLHTPMYFFTGNLSFLDLWYSSVYTPKILVTCISEDKSISFAGCLCQ
:: ....:: .. :::::: . .:::::. :::. .:. ::. ... : ::. ::. :
CCDS32 GNLVMFLLIHVSATLHTPMYSLLKSLSFLDFCYSSTVVPQTLVNFLAKRKVISYFGCMTQ
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160 170 180 190 200 210
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CCDS32 GCIFSLKFCGAHVVTHFFCDGPPILSLSCVDTSLCEILLFIFAGFNLLSCTLTILISYFL
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220 230 240 250 260 270
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280 290 300
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CCDS31 KDVKKALKKILWKHIL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]