Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7411
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7411, 314 aa
1>>>pF1KB7411 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8148+/-0.00144; mu= 12.7789+/- 0.085
mean_var=157.0175+/-52.734, 0's: 0 Z-trim(100.0): 393 B-trim: 344 in 1/46
Lambda= 0.102353
statistics sampled from 5472 (5943) to 5472 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.505), E-opt: 0.2 (0.183), width: 16
Scan time: 2.130
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31508.1 OR5D14 gene_id:219436|Hs108|chr11 ( 314) 2071 318.9 3.3e-87
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1456 228.0 7.2e-60
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 1393 218.8 4.7e-57
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 1129 179.8 2.5e-45
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1066 170.5 1.6e-42
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1032 165.4 5.1e-41
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1028 164.8 7.5e-41
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1005 161.4 7.9e-40
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1000 160.7 1.3e-39
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 983 158.2 7.8e-39
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 982 158.1 8.4e-39
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 980 157.8 1.1e-38
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 973 156.7 2.1e-38
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 971 156.4 2.6e-38
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 966 155.7 4.3e-38
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 963 155.2 5.8e-38
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 951 153.5 2e-37
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 948 153.0 2.7e-37
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 945 152.6 3.8e-37
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 944 152.4 4.1e-37
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 940 151.8 6.2e-37
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 940 151.9 6.2e-37
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 937 151.4 8.5e-37
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 936 151.3 9.3e-37
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 935 151.1 1e-36
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 932 150.7 1.4e-36
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 929 150.2 1.9e-36
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 929 150.2 1.9e-36
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 929 150.3 2e-36
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 928 150.1 2.1e-36
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 926 149.8 2.6e-36
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 923 149.3 3.5e-36
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 923 149.4 3.9e-36
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 920 148.9 4.8e-36
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 918 148.6 5.9e-36
CCDS31559.1 OR5AN1 gene_id:390195|Hs108|chr11 ( 311) 916 148.3 7.2e-36
CCDS31814.1 OR9K2 gene_id:441639|Hs108|chr12 ( 335) 916 148.3 7.5e-36
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 915 148.2 8e-36
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 911 147.6 1.3e-35
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 911 147.7 1.3e-35
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 908 147.2 1.7e-35
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 907 147.0 1.8e-35
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 902 146.3 3.1e-35
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 901 146.1 3.4e-35
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 897 145.5 5e-35
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 897 145.5 5.1e-35
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 896 145.4 5.6e-35
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 895 145.2 6.2e-35
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 889 144.3 1.1e-34
CCDS31538.1 OR5AK2 gene_id:390181|Hs108|chr11 ( 309) 886 143.9 1.5e-34
>>CCDS31508.1 OR5D14 gene_id:219436|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 2071 init1: 2071 opt: 2071 Z-score: 1679.1 bits: 318.9 E(32554): 3.3e-87
Smith-Waterman score: 2071; 100.0% identity (100.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MMMVLRNLSMEPTFALLGFTDYPKLQIPLFLVFLLMYVITVVGNLGMIIIIKINPKFHTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MMMVLRNLSMEPTFALLGFTDYPKLQIPLFLVFLLMYVITVVGNLGMIIIIKINPKFHTP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MYFFLSHLSFVDFCYSSIVTPKLLENLVMADKSIFYFSCMMQYFLSCTAVVTESFLLAVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MYFFLSHLSFVDFCYSSIVTPKLLENLVMADKSIFYFSCMMQYFLSCTAVVTESFLLAVM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AYDRFVAICNPLLYTVAMSQRLCALLVAGSYLWGMFGPLVLLCYALRLNFSGPNVINHFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AYDRFVAICNPLLYTVAMSQRLCALLVAGSYLWGMFGPLVLLCYALRLNFSGPNVINHFF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 CEYTALISVSGSDILIPHLLLFSFATFNEMCTLLIILTSYVFIFVTVLKIRSVSGRHKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CEYTALISVSGSDILIPHLLLFSFATFNEMCTLLIILTSYVFIFVTVLKIRSVSGRHKAF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 STWASHLTSITIFHGTILFLYCVPNSKNSRQTVKVASVFYTVVNPMLNPLIYSLRNKDVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 STWASHLTSITIFHGTILFLYCVPNSKNSRQTVKVASVFYTVVNPMLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 DAFWKLIHTQVPFH
::::::::::::::
CCDS31 DAFWKLIHTQVPFH
310
>>CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 (313 aa)
initn: 1467 init1: 1445 opt: 1456 Z-score: 1188.3 bits: 228.0 E(32554): 7.2e-60
Smith-Waterman score: 1456; 71.1% identity (88.4% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-310)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MMMVLRNLSMEPTFALLGFTDYPKLQIPLFLVFLLMYVITVVGNLGMIIIIKINPKFHTP
:... :: : ::.::::.:::.::.::::::: .: .::.::.:.:.:::::::.:::
CCDS31 MLLTDRNTSGT-TFTLLGFSDYPELQVPLFLVFLAIYNVTVLGNIGLIVIIKINPKLHTP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MYFFLSHLSFVDFCYSSIVTPKLLENLVMADKSIFYFSCMMQYFLSCTAVVTESFLLAVM
::::::.:::::::::::..::.: :::. :..: ...:..:.:. :: :::::::::::
CCDS31 MYFFLSQLSFVDFCYSSIIAPKMLVNLVVKDRTISFLGCVVQFFFFCTFVVTESFLLAVM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AYDRFVAICNPLLYTVAMSQRLCALLVAGSYLWGMFGPLVLLCYALRLNFSGPNVINHFF
:::::::::::::::: :::.::.:::.::: ::. : : : ::.: : : :.:::::
CCDS31 AYDRFVAICNPLLYTVNMSQKLCVLLVVGSYAWGVSCSLELTCSALKLCFHGFNTINHFF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 CEYTALISVSGSDILIPHLLLFSFATFNEMCTLLIILTSYVFIFVTVLKIRSVSGRHKAF
::...:.:.: :: : . ::: .:::::. ::::.::::.:: ::.::.::::::.:::
CCDS31 CEFSSLLSLSCSDTYINQWLLFFLATFNEISTLLIVLTSYAFIVVTILKMRSVSGRRKAF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 STWASHLTSITIFHGTILFLYCVPNSKNSRQTVKVASVFYTVVNPMLNPLIYSLRNKDVK
:: :::::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS31 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRHTVKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KB7 DAFWKLIHTQVPFH
:. ... :.:
CCDS31 DTVTEILDTKVFSY
300 310
>>CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 (328 aa)
initn: 1409 init1: 1381 opt: 1393 Z-score: 1137.9 bits: 218.8 E(32554): 4.7e-57
Smith-Waterman score: 1393; 68.5% identity (87.6% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MMMVLRNLSMEPTFALLGFTDYPKLQIPLFLVFLLMYVITVVGNLGMIIIIKINPKFHTP
:... :: . : ::.::::.:: .::::::.::: .: ..::::::::.:::::::.:::
CCDS31 MFLTERNTTSEATFTLLGFSDYLELQIPLFFVFLAVYGFSVVGNLGMIVIIKINPKLHTP
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pF1KB7 MYFFLSHLSFVDFCYSSIVTPKLLENLVMADKSIFYFSCMMQYFLSCTAVVTESFLLAVM
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CCDS31 MYFFLNHLSFVDFCYSSIIAPMMLVNLVVEDRTISFSGCLVQFFFFCTFVVTELILFAVM
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130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AYDRFVAICNPLLYTVAMSQRLCALLVAGSYLWGMFGPLVLLCYALRLNFSGPNVINHFF
:::.:::::::::::::.::.:::.::. : ::. :.: : ::.:.: : :.:::::
CCDS31 AYDHFVAICNPLLYTVAISQKLCAMLVVVLYAWGVACSLTLACSALKLSFHGFNTINHFF
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190 200 210 220 230 240
pF1KB7 CEYTALISVSGSDILIPHLLLFSFATFNEMCTLLIILTSYVFIFVTVLKIRSVSGRHKAF
:: ..:::.: : . .::::. :::::. :::::::::.::.::.::. :.::..:.:
CCDS31 CELSSLISLSYPDSYLSQLLLFTVATFNEISTLLIILTSYAFIIVTTLKMPSASGHRKVF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 STWASHLTSITIFHGTILFLYCVPNSKNSRQTVKVASVFYTVVNPMLNPLIYSLRNKDVK
:: :::::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::: :.::::::::::::::
CCDS31 STCASHLTAITIFHGTILFLYCVPNSKNSRHTVKVASVFYTVVIPLLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 DAFWKLIHTQVPFH
::. :.:.:. ::
CCDS31 DAIRKIINTKY-FHIKHRHWYPFNFVIEQ
310 320
>>CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1167 init1: 1121 opt: 1129 Z-score: 927.4 bits: 179.8 E(32554): 2.5e-45
Smith-Waterman score: 1129; 56.7% identity (80.0% similar) in 305 aa overlap (7-311:5-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MMMVLRNLSMEPTFALLGFTDYPKLQIPLFLVFLLMYVITVVGNLGMIIIIKINPKFHTP
: . : :::..: :.:.. :::.:::.: .:...:::: .:... ..:::
CCDS31 MGKENCTTVAEFILLGLSDVPELRVCLFLLFLLIYGVTLLANLGMTALIQVSSRLHTP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MYFFLSHLSFVDFCYSSIVTPKLLENLVMADKSIFYFSCMMQYFLSCTAVVTESFLLAVM
.:::::::::::::::::..::.: :. ::.: ...::.:..: :: ::: ::::::
CCDS31 VYFFLSHLSFVDFCYSSIIVPKMLANIFNKDKAISFLGCMVQFYLFCTCGVTEVFLLAVM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AYDRFVAICNPLLYTVAMSQRLCALLVAGSYLWGMFGPLVLLCYALRLNFSGPNVINHFF
:::::::::::::: :.:::.: . :.. :. : :. :::. : :::::::
CCDS31 AYDRFVAICNPLLYMVTMSQKLRVELTSCCYFCGTVCSLIHSSLALRILFYRSNVINHFF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 CEYTALISVSGSDILIPHLLLFSFATFNEMCTLLIILTSYVFIFVTVLKIRSVSGRHKAF
:. :.:.. ::. . . ::: ::.:: :..::::::..:..:.:::.:. .:::::
CCDS31 CDLPPLLSLACSDVTVNETLLFLVATLNESVTIMIILTSYLLILTTILKIHSAESRHKAF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 STWASHLTSITIFHGTILFLYCVPNSKNSRQTVKVASVFYTVVNPMLNPLIYSLRNKDVK
:: :::::.::. :::::..:: :.: :: .. :::.:::::: :::::::::::::::.
CCDS31 STCASHLTAITVSHGTILYIYCRPSSGNSGDVDKVATVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKDVN
240 250 260 270 280 290
310
pF1KB7 DAFWKLIHTQVPFH
:. :.. ...
CCDS31 KALRKVMGSKIHS
300 310
>>CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1053 init1: 1053 opt: 1066 Z-score: 877.1 bits: 170.5 E(32554): 1.6e-42
Smith-Waterman score: 1066; 52.1% identity (78.8% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MMMVLRNLSMEPTFALLGFTDYPKLQIPLFLVFLLMYVITVVGNLGMIIIIKINPKFHTP
: .. :: .. : :::: :.::: :::.:: .:.: ..::.:....:.:.:...::
CCDS79 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MYFFLSHLSFVDFCYSSIVTPKLLENLVMADKSIFYFSCMMQYFLSCTAVVTESFLLAVM
::::::.:::::.:: : ..::.: :.. .::: :..: .:... :: . ::::.::.:
CCDS79 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AYDRFVAICNPLLYTVAMSQRLCALLVAGSYLWGMFGPLVLLCYALRLNFSGPNVINHFF
::::.:::::::::::.::. .: :.. ::: : .. :: .:. :.. :::::::
CCDS79 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 CEYTALISVSGSDILIPHLLLFSFATFNEMCTLLIILTSYVFIFVTVLKIRSVSGRHKAF
:. :...: .: : . :: .... :. ..::. :: ::...:::::: :::.:.:
CCDS79 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 STWASHLTSITIFHGTILFLYCVPNSKNSRQTVKVASVFYTVVNPMLNPLIYSLRNKDVK
:: ::::::.::..::.::.: :. : .: :. :::::. :.::::::::::::::
CCDS79 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 DAFWKLIHTQVPFH
:: :.....:
CCDS79 DAAEKVLRSKVDSS
310
>>CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1075 init1: 1009 opt: 1032 Z-score: 850.0 bits: 165.4 E(32554): 5.1e-41
Smith-Waterman score: 1032; 51.2% identity (79.2% similar) in 303 aa overlap (5-307:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MMMVLRNLSMEPTFALLGFTDYPKLQIPLFLVFLLMYVITVVGNLGMIIIIKINPKFHTP
..: . : :.:.:: :.::::::.:::..:.::.::::::: .: .. .:::
CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTP
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70 80 90 100 110 120
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