Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7414
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7414, 422 aa
1>>>pF1KB7414 422 - 422 aa - 422 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3308+/-0.00179; mu= 8.6036+/- 0.106
mean_var=305.1342+/-61.689, 0's: 0 Z-trim(106.4): 929 B-trim: 35 in 1/49
Lambda= 0.073422
statistics sampled from 7910 (8959) to 7910 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.618), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16
Scan time: 2.560
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33740.1 ZNF620 gene_id:253639|Hs108|chr3 ( 422) 2974 329.6 3.6e-90
CCDS58825.1 ZNF620 gene_id:253639|Hs108|chr3 ( 308) 2196 246.9 2e-65
CCDS46807.1 ZNF662 gene_id:389114|Hs108|chr3 ( 452) 1349 157.5 2.5e-38
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 1302 152.5 7.9e-37
CCDS42557.1 ZNF829 gene_id:374899|Hs108|chr19 ( 432) 1238 145.7 8.3e-35
CCDS59380.1 ZNF829 gene_id:374899|Hs108|chr19 ( 513) 1238 145.8 9.1e-35
CCDS42712.1 ZNF2 gene_id:7549|Hs108|chr2 ( 425) 1187 140.3 3.5e-33
CCDS33005.1 ZFP30 gene_id:22835|Hs108|chr19 ( 519) 1151 136.6 5.4e-32
CCDS32980.1 ZNF708 gene_id:7562|Hs108|chr19 ( 563) 1141 135.6 1.2e-31
CCDS12493.1 ZFP82 gene_id:284406|Hs108|chr19 ( 532) 1134 134.8 1.9e-31
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1121 133.5 5.2e-31
CCDS46801.1 ZNF619 gene_id:285267|Hs108|chr3 ( 532) 1117 133.0 6.7e-31
CCDS46803.1 ZNF619 gene_id:285267|Hs108|chr3 ( 576) 1117 133.1 7e-31
CCDS46802.1 ZNF619 gene_id:285267|Hs108|chr3 ( 616) 1117 133.1 7.2e-31
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 1113 132.5 8.4e-31
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 1113 132.5 8.7e-31
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 1111 132.3 9.5e-31
CCDS31939.1 ZNF26 gene_id:7574|Hs108|chr12 ( 533) 1104 131.6 1.7e-30
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1102 131.9 2.9e-30
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1102 131.9 3e-30
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 1094 130.8 4.5e-30
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 1094 130.9 4.6e-30
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1091 130.3 4.7e-30
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1091 130.4 5.2e-30
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1086 129.7 6.2e-30
CCDS77346.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 492) 1084 129.5 7.2e-30
CCDS2708.1 ZNF662 gene_id:389114|Hs108|chr3 ( 426) 1077 128.6 1.1e-29
CCDS81756.1 ZNF26 gene_id:7574|Hs108|chr12 ( 513) 1077 128.7 1.2e-29
CCDS75608.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 554) 1077 128.8 1.3e-29
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1077 128.9 1.4e-29
CCDS34693.1 ZNF789 gene_id:285989|Hs108|chr7 ( 425) 1070 127.9 1.9e-29
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1071 128.2 2.1e-29
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1071 128.3 2.2e-29
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1071 128.3 2.2e-29
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1071 128.3 2.2e-29
CCDS74387.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 540) 1069 127.9 2.3e-29
CCDS46097.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 679) 1069 128.1 2.6e-29
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 1063 127.4 3.8e-29
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1063 127.4 3.8e-29
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1055 126.3 5.9e-29
CCDS42713.1 ZNF2 gene_id:7549|Hs108|chr2 ( 383) 1052 125.9 6.6e-29
CCDS82408.1 ZIK1 gene_id:284307|Hs108|chr19 ( 432) 1049 125.7 8.8e-29
CCDS82407.1 ZIK1 gene_id:284307|Hs108|chr19 ( 474) 1049 125.7 9.3e-29
CCDS33135.1 ZIK1 gene_id:284307|Hs108|chr19 ( 487) 1049 125.7 9.4e-29
CCDS35500.2 ZNF550 gene_id:162972|Hs108|chr19 ( 422) 1047 125.4 1e-28
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 1049 126.0 1.1e-28
CCDS74348.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 ( 540) 1047 125.6 1.2e-28
CCDS54257.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 ( 563) 1047 125.6 1.2e-28
CCDS33102.1 ZNF331 gene_id:55422|Hs108|chr19 ( 463) 1045 125.3 1.2e-28
CCDS47931.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8 ( 496) 1045 125.3 1.3e-28
>>CCDS33740.1 ZNF620 gene_id:253639|Hs108|chr3 (422 aa)
initn: 2974 init1: 2974 opt: 2974 Z-score: 1732.3 bits: 329.6 E(32554): 3.6e-90
Smith-Waterman score: 2974; 100.0% identity (100.0% similar) in 422 aa overlap (1-422:1-422)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MFQTAWRQEPVTFEDVAVYFTQNEWASLDSVQRALYREVMLENYANVASLAFPFTTPVLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MFQTAWRQEPVTFEDVAVYFTQNEWASLDSVQRALYREVMLENYANVASLAFPFTTPVLV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 SQLEQGELPWGLDPWEPMGREALRGICPGDEARTEKEGLTPKDHVSKETESFRLMVGGLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SQLEQGELPWGLDPWEPMGREALRGICPGDEARTEKEGLTPKDHVSKETESFRLMVGGLP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GNVSQHLDFGSSLEQPQGHWIIKTKSKRRHFTDTSARHHEAYEVKNGEKFEKLGKNISVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GNVSQHLDFGSSLEQPQGHWIIKTKSKRRHFTDTSARHHEAYEVKNGEKFEKLGKNISVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 TQLTTNQTNPSGQISYECGQCGRYFIQMADFHRHEKCHTGEKSFECKECGKYFRYNSLLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TQLTTNQTNPSGQISYECGQCGRYFIQMADFHRHEKCHTGEKSFECKECGKYFRYNSLLI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RHQIIHTGKKPFKCKECGKGLSSDTALIQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSSSVFLQHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RHQIIHTGKKPFKCKECGKGLSSDTALIQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSSSVFLQHQR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 FHTGEKLYECNECWKTFSCSSSFTVHQRMHTGEKPYECKECGKRLSSNTALTQHQRIHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FHTGEKLYECNECWKTFSCSSSFTVHQRMHTGEKPYECKECGKRLSSNTALTQHQRIHTG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 EKPFECKECGKAFNQKITLIQHQRVHTGEKPYECKVCGKTFSWCGRFILHQKLHTQKTPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EKPFECKECGKAFNQKITLIQHQRVHTGEKPYECKVCGKTFSWCGRFILHQKLHTQKTPV
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 QA
::
CCDS33 QA
>>CCDS58825.1 ZNF620 gene_id:253639|Hs108|chr3 (308 aa)
initn: 2196 init1: 2196 opt: 2196 Z-score: 1288.2 bits: 246.9 E(32554): 2e-65
Smith-Waterman score: 2196; 100.0% identity (100.0% similar) in 308 aa overlap (115-422:1-308)
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 GICPGDEARTEKEGLTPKDHVSKETESFRLMVGGLPGNVSQHLDFGSSLEQPQGHWIIKT
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MVGGLPGNVSQHLDFGSSLEQPQGHWIIKT
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 KSKRRHFTDTSARHHEAYEVKNGEKFEKLGKNISVSTQLTTNQTNPSGQISYECGQCGRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KSKRRHFTDTSARHHEAYEVKNGEKFEKLGKNISVSTQLTTNQTNPSGQISYECGQCGRY
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 FIQMADFHRHEKCHTGEKSFECKECGKYFRYNSLLIRHQIIHTGKKPFKCKECGKGLSSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FIQMADFHRHEKCHTGEKSFECKECGKYFRYNSLLIRHQIIHTGKKPFKCKECGKGLSSD
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 TALIQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSSSVFLQHQRFHTGEKLYECNECWKTFSCSSSFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TALIQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSSSVFLQHQRFHTGEKLYECNECWKTFSCSSSFT
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 VHQRMHTGEKPYECKECGKRLSSNTALTQHQRIHTGEKPFECKECGKAFNQKITLIQHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VHQRMHTGEKPYECKECGKRLSSNTALTQHQRIHTGEKPFECKECGKAFNQKITLIQHQR
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420
pF1KB7 VHTGEKPYECKVCGKTFSWCGRFILHQKLHTQKTPVQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VHTGEKPYECKVCGKTFSWCGRFILHQKLHTQKTPVQA
280 290 300
>>CCDS46807.1 ZNF662 gene_id:389114|Hs108|chr3 (452 aa)
initn: 3872 init1: 1313 opt: 1349 Z-score: 801.7 bits: 157.5 E(32554): 2.5e-38
Smith-Waterman score: 1349; 48.6% identity (71.2% similar) in 416 aa overlap (7-419:29-441)
10 20 30
pF1KB7 MFQTAWRQEPVTFEDVAVYFTQNEWASLDSVQRALYRE
:.: ::::::::::..::: .: .::::::.
CCDS46 MAAVALASGTRLGLVLELLPGQPALPRARRESVTFEDVAVYFSENEWIGLGPAQRALYRD
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 VMLENYANVASLAFPFTTPVLVSQLEQGELPWGLDPWEPMGREALRGICPGDEARTEKEG
::::::. :::::::: :.:.::::.:: :: : . :: ::: . .::
CCDS46 VMLENYGAVASLAFPFPKPALISQLERGETPWCSVPRGALDGEAPRGISSEGVLKRKKED
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 LTPKDHVSKETESFRLMVGGLPGNVSQHLDFGSSLEQPQ--GHWIIKTKSKRRHFTDTSA
. :... .:.... .. .: ::.: ::.. :. . :.: .. : ..:.
CCDS46 FILKEEIIEEAQDLMVLSSGPQWCGSQELWFGKTCEEKSRLGRWPGYLNGGR---MESST
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 RHHEAYEVKNGE-KFEKLGKNISVSTQLTTNQTNPSGQISYECGQCGRYFIQMADFHRHE
::. . :. . : .:.. : .. . :: : : .::. : : :: .:.
CCDS46 NDIIEVIVKDEMISVEESSGNTDVNNLLGIHHKILNEQIFYICEECGKCFDQNEDFDQHQ
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 KCHTGEKSFECKECGKYFRYNSLLIRHQIIHTGKKPFKCKECGKGLSSDTALIQHQRIHT
: :.::: . :::::: : . : : :: ::.: ::..:.::.:.. . ::.::::::
CCDS46 KTHNGEKVYGCKECGKAFSFRSHCIAHQRIHSGVKPYECQECAKAFVWKSNLIRHQRIHT
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 GEKPYECKECGKAFSSSSVFLQHQRFHTGEKLYECNECWKTFSCSSSFTVHQRMHTGEKP
::::.:::::::.::... . ::::.::::: : :.:: :.:. . .. ::::::::::
CCDS46 GEKPFECKECGKGFSQNTSLTQHQRIHTGEKPYTCKECGKSFTRNPALLRHQRMHTGEKP
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 YECKECGKRLSSNTALTQHQRIHTGEKPFECKECGKAFNQKITLIQHQRVHTGEKPYECK
::::.::: . :. :.::::.:::.:: :: .:::.: : ::.:::.::::.::.:.
CCDS46 YECKDCGKGFMWNSDLSQHQRVHTGDKPHECTDCGKSFFCKAHLIRHQRIHTGERPYKCN
360 370 380 390 400 410
400 410 420
pF1KB7 VCGKTFSWCGRFILHQKLHTQKTPVQA
:::.:: . .: ::. :.. :
CCDS46 DCGKAFSQNSVLIKHQRRHARDKPYNCQISHLLEH
420 430 440 450
>>CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 (475 aa)
initn: 7220 init1: 1104 opt: 1302 Z-score: 774.6 bits: 152.5 E(32554): 7.9e-37
Smith-Waterman score: 1361; 48.9% identity (70.4% similar) in 425 aa overlap (11-421:6-423)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MFQTAWRQEPVTFEDVAVYFTQNEWASLDSVQRALYREVMLENYANVASLAFPFTTPVLV
: : ::.. :.:.:: :: ::: :::.::::::.:..:... : ..
CCDS12 MAEGSVMFSDVSIDFSQEEWDCLDPVQRDLYRDVMLENYGNLVSMGLYTPKPQVI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 SQLEQGELPWGLDPWEPMGREALRGICPGDEARTEKEGLTPKDHVSKETESFRLMVGGLP
: ::::. :: . ::: ::.: :. : . :. : .: : : . . ::
CCDS12 SLLEQGKEPWMV------GRELTRGLCSDLESMCETKLLSLKKEVY-EIELCQREIMGLT
60 70 80 90 100
130 140 150 160
pF1KB7 GNVSQHLDFGSSLEQ----------PQGHWIIKTKSKRRHFTDTSARHHEAYEVKNGE--
. .. .::. :: :.::. . . . : . ... :.:
CCDS12 KHGLEYSSFGDVLEYRSHLAKQLGYPNGHFSQEIFTPEYMPTFIQQTFLTLHQIINNEDR
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 --KFEKLGKNISVSTQLTTNQTNPSGQISYECGQCGRYFIQMADFHRHEKCHTGEKSFEC
. .: :: .: ..:. .: :. :::: .::..: . :: : ::::: :::
CCDS12 PYECKKCGKAFSQNSQFIQHQRIHIGEKSYECKECGKFFSCGSHVTRHLKIHTGEKPFEC
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 KECGKYFRYNSLLIRHQIIHTGKKPFKCKECGKGLSSDTALIQHQRIHTGEKPYECKECG
::::: : .: : .:: :::::::..::::::..: . ::.:::::::::::::: ::
CCDS12 KECGKAFSCSSYLSQHQRIHTGKKPYECKECGKAFSYCSNLIDHQRIHTGEKPYECKVCG
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 KAFSSSSVFLQHQRFHTGEKLYECNECWKTFSCSSSFTVHQRMHTGEKPYECKECGKRLS
:::..:: ..:: :.::::: :::.:: :.:. ::... :::.:::::::::::::: .:
CCDS12 KAFTKSSQLFQHARIHTGEKPYECKECGKAFTQSSKLVQHQRIHTGEKPYECKECGKAFS
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 SNTALTQHQRIHTGEKPFECKECGKAFNQKITLIQHQRVHTGEKPYECKVCGKTFSWCGR
:..:::.::::::::::..::::::::.:. : ::::.:.::::.:: :::.:. ..
CCDS12 SGSALTNHQRIHTGEKPYDCKECGKAFTQSSQLRQHQRIHAGEKPFECLECGKAFTQNSQ
350 360 370 380 390 400
410 420
pF1KB7 FILHQKLHTQKTPVQA
.. ::..::.. : .
CCDS12 LFQHQRIHTDEKPYECNECGKAFNKCSNLTRHLRIHTGEKPYNCKECGKAFSSGSDLIRH
410 420 430 440 450 460
>>CCDS42557.1 ZNF829 gene_id:374899|Hs108|chr19 (432 aa)
initn: 1004 init1: 1004 opt: 1238 Z-score: 738.4 bits: 145.7 E(32554): 8.3e-35
Smith-Waterman score: 1238; 45.2% identity (70.5% similar) in 407 aa overlap (10-415:34-431)
10 20 30
pF1KB7 MFQTAWRQEPVTFEDVAVYFTQNEWASLDSVQRALYREV
:: :.::.. :.:.:: ::. : ::.::
CCDS42 SPLISIPHVWCHPEEEERMHDELLQAVSKGPVMFRDVSIDFSQEEWECLDADQMNLYKEV
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 MLENYANVASLAFPFTTPVLVSQLEQGELPWGLDPWEPMGREALRGICPGDEARTEKEGL
::::..:..:... . :...: ::::. :: .: :: ::.: :. : . :
CCDS42 MLENFSNLVSVGLSNSKPAVISLLEQGKEPWMVD------RELTRGLCSDLESMCETKIL
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CCDS59 KAFGSRSDLIRHEGIHTG
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CCDS42 QRRYAKQGID
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]