Result of FASTA (omim) for
pF1KB7414
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7414, 422 aa
1>>>pF1KB7414 422 - 422 aa - 422 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9536+/-0.000724; mu= 17.6297+/- 0.045
mean_var=394.4747+/-78.899, 0's: 0 Z-trim(113.2): 1880 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.064575
statistics sampled from 20234 (22445) to 20234 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.605), E-opt: 0.2 (0.263), width: 16
Scan time: 8.560
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_066574 (OMIM: 194500) zinc finger protein 2 iso ( 425) 1187 125.8 2.1e-28
NP_001291423 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1121 119.9 1.7e-26
NP_001291422 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1121 119.9 1.7e-26
NP_001309189 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1113 119.0 2.6e-26
XP_006717342 (OMIM: 194552) PREDICTED: zinc finger ( 474) 1113 119.0 2.6e-26
NP_001273626 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1113 119.0 2.6e-26
NP_001273625 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1113 119.0 2.6e-26
NP_009066 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 is ( 498) 1113 119.0 2.6e-26
NP_116313 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 iso ( 446) 1111 118.8 2.9e-26
NP_001265216 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 ( 446) 1111 118.8 2.9e-26
NP_001265219 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 ( 446) 1111 118.8 2.9e-26
NP_001265213 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 ( 446) 1111 118.8 2.9e-26
NP_001305064 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 ( 446) 1111 118.8 2.9e-26
XP_016868071 (OMIM: 194510) PREDICTED: zinc finger ( 410) 1110 118.6 3e-26
NP_001265220 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 ( 410) 1110 118.6 3e-26
XP_006716174 (OMIM: 194510) PREDICTED: zinc finger ( 410) 1110 118.6 3e-26
NP_001265221 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 ( 410) 1110 118.6 3e-26
XP_016868072 (OMIM: 194510) PREDICTED: zinc finger ( 410) 1110 118.6 3e-26
NP_001305065 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 ( 453) 1110 118.7 3.1e-26
NP_062537 (OMIM: 194537) zinc finger protein 26 is ( 533) 1104 118.3 4.8e-26
XP_016875410 (OMIM: 194537) PREDICTED: zinc finger ( 546) 1101 118.0 5.9e-26
NP_001243208 (OMIM: 194537) zinc finger protein 26 ( 566) 1101 118.0 6e-26
XP_016875409 (OMIM: 194537) PREDICTED: zinc finger ( 575) 1101 118.1 6e-26
NP_001284553 (OMIM: 613910) zinc finger protein 48 ( 492) 1084 116.3 1.7e-25
NP_001317442 (OMIM: 194537) zinc finger protein 26 ( 513) 1077 115.7 2.7e-25
NP_001317443 (OMIM: 194537) zinc finger protein 26 ( 513) 1077 115.7 2.7e-25
XP_016875412 (OMIM: 194537) PREDICTED: zinc finger ( 513) 1077 115.7 2.7e-25
XP_005266240 (OMIM: 194537) PREDICTED: zinc finger ( 513) 1077 115.7 2.7e-25
XP_016875411 (OMIM: 194537) PREDICTED: zinc finger ( 513) 1077 115.7 2.7e-25
NP_001274461 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 ( 554) 1077 115.8 2.8e-25
NP_001291421 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 643) 1077 115.9 3e-25
NP_666016 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 is ( 643) 1077 115.9 3e-25
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1071 115.3 4.3e-25
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1071 115.3 4.3e-25
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1071 115.3 4.3e-25
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1071 115.4 4.4e-25
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1071 115.4 4.4e-25
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1071 115.4 4.4e-25
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1071 115.4 4.4e-25
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1071 115.4 4.4e-25
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1071 115.4 4.4e-25
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1071 115.4 4.5e-25
XP_011525824 (OMIM: 604668) PREDICTED: zinc finger ( 595) 1057 114.0 1e-24
NP_001017396 (OMIM: 194500) zinc finger protein 2 ( 383) 1052 113.1 1.2e-24
XP_011525788 (OMIM: 608640) PREDICTED: zinc finger ( 436) 1047 112.8 1.8e-24
NP_001309757 (OMIM: 608640) zinc finger protein 46 ( 475) 1047 112.9 1.8e-24
NP_003424 (OMIM: 604074) zinc finger protein 132 [ ( 706) 1049 113.4 1.9e-24
NP_001309755 (OMIM: 608640) zinc finger protein 46 ( 509) 1047 112.9 1.9e-24
NP_001309756 (OMIM: 608640) zinc finger protein 46 ( 509) 1047 112.9 1.9e-24
XP_016882959 (OMIM: 608640) PREDICTED: zinc finger ( 519) 1047 112.9 1.9e-24
>>NP_066574 (OMIM: 194500) zinc finger protein 2 isoform (425 aa)
initn: 1828 init1: 946 opt: 1187 Z-score: 631.0 bits: 125.8 E(85289): 2.1e-28
Smith-Waterman score: 1187; 43.6% identity (69.3% similar) in 417 aa overlap (8-417:11-422)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MFQTAWRQEPVTFEDVAVYFTQNEWASLDSVQRALYREVMLENYANVASLAFPFTTP
:: :::::::: ::..::. : .:: ::.::::::: ...::..: :
NP_066 MAAVSPTTRCQESVTFEDVAVVFTDEEWSRLVPIQRDLYKEVMLENYNSIVSLGLPVPQP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 VLVSQLEQGELPWGLDPWEPMGREALRGICPGDEARTEKEGLTPKDHVSKETE-SFRLMV
.. ::..:. :: .: :: ... :.. : . : .:..: :.: .
NP_066 DVIFQLKRGDKPWMVDLHGSEEREWPESVSLDWETKPEIH-----DASDKKSEGSLRECL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 G---GLPGNVSQHLD---FGSSLEQPQGHWIIKTKSKRRHFTDTSARHHEAYEVKNGEKF
: : . : .:. ..:.:. :. :. . . :: .: . ..
NP_066 GRQSPLCPKFEVHTPNGRMGTEKQSPSGETRKKSLSRDKGLRRRSALSREILTKERHQEC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 EKLGKNISVSTQLTTNQTNPSGQISYECGQCGRYFIQMADFHRHEKCHTGEKSFECKECG
::.. ..:: .: . .:. :.: .::. : . ... :: ::::. .::. :.
NP_066 SDCGKTFFDHSSLTRHQRTHTGEKPYDCRECGKAFSHRSSLSRHLMSHTGESPYECSVCS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 KYFRYNSLLIRHQIIHTGKKPFKCKECGKGLSSDTALIQHQRIHTGEKPYECKECGKAFS
: : : : :: ::::.:::.:.::::.. . ..: .::::::::.::::..::::::
NP_066 KAFFDRSSLTVHQRIHTGEKPFQCNECGKAFFDRSSLTRHQRIHTGESPYECHQCGKAFS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 SSSVFLQHQRFHTGEKLYECNECWKTFSCSSSFTVHQRMHTGEKPYECKECGKRLSSNTA
..:.. .:: .:::.: :::::: :.: ::.. ::. :.:. :.:.:::: . . ..
NP_066 QKSILTRHQLIHTGRKPYECNECGKAFYGVSSLNRHQKAHAGDPRYQCNECGKAFFDRSS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 LTQHQRIHTGEKPFECKECGKAFNQKITLIQHQRVHTGEKPYECKVCGKTFSWCGRFILH
:::::.::::.::.::.::::::.:. : .::::::::::.:: ::::.:: . : :
NP_066 LTQHQKIHTGDKPYECSECGKAFSQRCRLTRHQRVHTGEKPFECTVCGKVFSSKSSVIQH
360 370 380 390 400 410
420
pF1KB7 QKLHTQKTPVQA
:. ....
NP_066 QRRYAKQGID
420
>>NP_001291423 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 iso (585 aa)
initn: 10126 init1: 1071 opt: 1121 Z-score: 596.8 bits: 119.9 E(85289): 1.7e-26
Smith-Waterman score: 1121; 47.4% identity (73.7% similar) in 331 aa overlap (91-421:145-475)
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 SQLEQGELPWGLDPWEPMGREALRGICPGDEARTEKEGLTPKDHVSKETESFRLMVGGLP
.: . .: : .... . . :. . :
NP_001 LVEPFRCDSQLIQHQENNTEEKPYQCSECGKAFSINEKLIWHQRLHSGEKPFKCVECGKS
120 130 140 150 160 170
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GNVSQHLDFGSSLEQPQGHWIIKTKSKRRHFTDTSARHHEAYEVKNGEKFEKLGKNISVS
. :.: ..... . . : .: . . .::.. . .. . .. :...: :
NP_001 FSYSSHYITHQTIHSGEKPYQCKMCGKAFSVNGSLSRHQRIHTGEKPYQCKECGNGFSCS
180 190 200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 TQLTTNQTNPSGQISYECGQCGRYFIQMADFHRHEKCHTGEKSFECKECGKYFRYNSLLI
. :.: .:. :::..::. : : . .:.. ::::: .::.:::: :: .: :
NP_001 SAYITHQRVHTGEKPYECNDCGKAFNVNAKLIQHQRIHTGEKPYECNECGKGFRCSSQLR
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RHQIIHTGKKPFKCKECGKGLSSDTALIQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSSSVFLQHQR
.:: ::::.::..:::::::....: :::::::::::::::: ::::::: .. ..::::
NP_001 QHQSIHTGEKPYQCKECGKGFNNNTKLIQHQRIHTGEKPYECTECGKAFSVKGKLIQHQR
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 FHTGEKLYECNECWKTFSCSSSFTVHQRMHTGEKPYECKECGKRLSSNTALTQHQRIHTG
.::::: :::::: :.: :.:.: : :.:::::::::.:::: .: : : .:::::::
NP_001 IHTGEKPYECNECGKAFRCNSQFRQHLRIHTGEKPYECNECGKAFSVNGKLMRHQRIHTG
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 EKPFECKECGKAFNQKITLIQHQRVHTGEKPYECKVCGKTFSWCGRFILHQKLHTQKTPV
::::::.:::. :..: .:..:.:.:::::::.:: :::.:: ... ::..:: . :
NP_001 EKPFECNECGRCFTSKRNLLDHHRIHTGEKPYQCKECGKAFSINAKLTRHQRIHTGEKPF
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 QA
.
NP_001 KCMECEKAFSCSSNYIVHQRIHTGEKPFQCKECGKAFHVNAHLIRHQRSHTGEKPFRCVE
480 490 500 510 520 530
>--
initn: 1464 init1: 454 opt: 465 Z-score: 266.6 bits: 58.8 E(85289): 4.1e-08
Smith-Waterman score: 465; 57.0% identity (78.5% similar) in 107 aa overlap (310-416:476-582)
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 YECKECGKAFSSSSVFLQHQRFHTGEKLYECNECWKTFSCSSSFTVHQRMHTGEKPYECK
: :: :.:::::.. ::::.::::::..::
NP_001 YQCKECGKAFSINAKLTRHQRIHTGEKPFKCMECEKAFSCSSNYIVHQRIHTGEKPFQCK
450 460 470 480 490 500
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 ECGKRLSSNTALTQHQRIHTGEKPFECKECGKAFNQKITLIQHQRVHTGEKPYECKVCGK
:::: . :. : .::: :::::::.: ::::.:. . : :: ::: .::: :.::::
NP_001 ECGKAFHVNAHLIRHQRSHTGEKPFRCVECGKGFSFSSDYIIHQTVHTWKKPYMCSVCGK
510 520 530 540 550 560
400 410 420
pF1KB7 TFSWCGRFILHQKLHTQKTPVQA
.: . .. ::..:..
NP_001 AFRFSFQLSQHQSVHSEGKS
570 580
>>NP_001291422 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 iso (585 aa)
initn: 10126 init1: 1071 opt: 1121 Z-score: 596.8 bits: 119.9 E(85289): 1.7e-26
Smith-Waterman score: 1121; 47.4% identity (73.7% similar) in 331 aa overlap (91-421:145-475)
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 SQLEQGELPWGLDPWEPMGREALRGICPGDEARTEKEGLTPKDHVSKETESFRLMVGGLP
.: . .: : .... . . :. . :
NP_001 LVEPFRCDSQLIQHQENNTEEKPYQCSECGKAFSINEKLIWHQRLHSGEKPFKCVECGKS
120 130 140 150 160 170
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GNVSQHLDFGSSLEQPQGHWIIKTKSKRRHFTDTSARHHEAYEVKNGEKFEKLGKNISVS
. :.: ..... . . : .: . . .::.. . .. . .. :...: :
NP_001 FSYSSHYITHQTIHSGEKPYQCKMCGKAFSVNGSLSRHQRIHTGEKPYQCKECGNGFSCS
180 190 200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 TQLTTNQTNPSGQISYECGQCGRYFIQMADFHRHEKCHTGEKSFECKECGKYFRYNSLLI
. :.: .:. :::..::. : : . .:.. ::::: .::.:::: :: .: :
NP_001 SAYITHQRVHTGEKPYECNDCGKAFNVNAKLIQHQRIHTGEKPYECNECGKGFRCSSQLR
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RHQIIHTGKKPFKCKECGKGLSSDTALIQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSSSVFLQHQR
.:: ::::.::..:::::::....: :::::::::::::::: ::::::: .. ..::::
NP_001 QHQSIHTGEKPYQCKECGKGFNNNTKLIQHQRIHTGEKPYECTECGKAFSVKGKLIQHQR
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 FHTGEKLYECNECWKTFSCSSSFTVHQRMHTGEKPYECKECGKRLSSNTALTQHQRIHTG
.::::: :::::: :.: :.:.: : :.:::::::::.:::: .: : : .:::::::
NP_001 IHTGEKPYECNECGKAFRCNSQFRQHLRIHTGEKPYECNECGKAFSVNGKLMRHQRIHTG
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 EKPFECKECGKAFNQKITLIQHQRVHTGEKPYECKVCGKTFSWCGRFILHQKLHTQKTPV
::::::.:::. :..: .:..:.:.:::::::.:: :::.:: ... ::..:: . :
NP_001 EKPFECNECGRCFTSKRNLLDHHRIHTGEKPYQCKECGKAFSINAKLTRHQRIHTGEKPF
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 QA
.
NP_001 KCMECEKAFSCSSNYIVHQRIHTGEKPFQCKECGKAFHVNAHLIRHQRSHTGEKPFRCVE
480 490 500 510 520 530
>--
initn: 1464 init1: 454 opt: 465 Z-score: 266.6 bits: 58.8 E(85289): 4.1e-08
Smith-Waterman score: 465; 57.0% identity (78.5% similar) in 107 aa overlap (310-416:476-582)
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 YECKECGKAFSSSSVFLQHQRFHTGEKLYECNECWKTFSCSSSFTVHQRMHTGEKPYECK
: :: :.:::::.. ::::.::::::..::
NP_001 YQCKECGKAFSINAKLTRHQRIHTGEKPFKCMECEKAFSCSSNYIVHQRIHTGEKPFQCK
450 460 470 480 490 500
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 ECGKRLSSNTALTQHQRIHTGEKPFECKECGKAFNQKITLIQHQRVHTGEKPYECKVCGK
:::: . :. : .::: :::::::.: ::::.:. . : :: ::: .::: :.::::
NP_001 ECGKAFHVNAHLIRHQRSHTGEKPFRCVECGKGFSFSSDYIIHQTVHTWKKPYMCSVCGK
510 520 530 540 550 560
400 410 420
pF1KB7 TFSWCGRFILHQKLHTQKTPVQA
.: . .. ::..:..
NP_001 AFRFSFQLSQHQSVHSEGKS
570 580
>>NP_001309189 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 iso (474 aa)
initn: 1014 init1: 1014 opt: 1113 Z-score: 593.4 bits: 119.0 E(85289): 2.6e-26
Smith-Waterman score: 1122; 41.1% identity (68.9% similar) in 418 aa overlap (13-421:16-422)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MFQTAWRQEPVTFEDVAVYFTQNEWASLDSVQRALYREVMLENYANVASLAFPFTTP
: .:.: :.:..: : :. : ..: . . ... :..: . :
NP_001 MAAGLLTAGPRGSTFFSSVTVAFAQERWRCLVSTPRDRFKEGIPGKSRSLVLLGLPVSQP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 VLVSQLEQGELPWGLDPWEPMGREALRGICPGDEARTEKEGLTPKDHVSKETESFRLMVG
. ::::: : : :. : ::. :: . . : :.. .:. ::.
NP_001 GMNSQLEQREGAWMLEG------EDLRSPSPGWKIIS---GSPPEQALSEA--SFQDPCV
70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 GLPGNVSQH--LDFGSSLE-----QPQGHWIIKTKSKRRHFTDTSARHHEAYEVKNGEKF
.: . :.: :. .:.. .:: . .... .. . : .. : . . .. .
NP_001 EMPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVPVEARPRKCETHTESFKNSEILKPHRAKPY
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KB7 --EKLGKNISVSTQLTTNQTNPSGQISYECGQCGRYFIQMADFHRHEKCHTGEKSFECKE
.. :: .: ..:. .: . .:. :::..::. : : ... .:.. ::::: ..:.:
NP_001 ACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSE
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 CGKYFRYNSLLIRHQIIHTGKKPFKCKECGKGLSSDTALIQHQRIHTGEKPYECKECGKA
::. : :. : .:: :::.::..:.:: :..:. .::.::::::::::::::..::::
NP_001 CGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKA
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 FSSSSVFLQHQRFHTGEKLYECNECWKTFSCSSSFTVHQRMHTGEKPYECKECGKRLSSN
: :. . .::: ::::: :.:.:: :.:: ..: :::.:::::::.: ::: .:..
NP_001 FRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRIHTGEKPYRCAACGKAFSQS
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 TALTQHQRIHTGEKPFECKECGKAFNQKITLIQHQRVHTGEKPYECKVCGKTFSWCGRFI
. ::.::: ::::::..:.::::::.:. .:: ::..:::::::.:. ::: :: . .:
NP_001 ANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCNECGKFFSESSALI
350 360 370 380 390 400
410 420
pF1KB7 LHQKLHTQKTPVQA
:. .:: . : .
NP_001 RHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSECGKAFRCSSAFVRHQR
410 420 430 440 450 460
>>XP_006717342 (OMIM: 194552) PREDICTED: zinc finger pro (474 aa)
initn: 1014 init1: 1014 opt: 1113 Z-score: 593.4 bits: 119.0 E(85289): 2.6e-26
Smith-Waterman score: 1122; 41.1% identity (68.9% similar) in 418 aa overlap (13-421:16-422)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MFQTAWRQEPVTFEDVAVYFTQNEWASLDSVQRALYREVMLENYANVASLAFPFTTP
: .:.: :.:..: : :. : ..: . . ... :..: . :
XP_006 MAAGLLTAGPRGSTFFSSVTVAFAQERWRCLVSTPRDRFKEGIPGKSRSLVLLGLPVSQP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 VLVSQLEQGELPWGLDPWEPMGREALRGICPGDEARTEKEGLTPKDHVSKETESFRLMVG
. ::::: : : :. : ::. :: . . : :.. .:. ::.
XP_006 GMNSQLEQREGAWMLEG------EDLRSPSPGWKIIS---GSPPEQALSEA--SFQDPCV
70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 GLPGNVSQH--LDFGSSLE-----QPQGHWIIKTKSKRRHFTDTSARHHEAYEVKNGEKF
.: . :.: :. .:.. .:: . .... .. . : .. : . . .. .
XP_006 EMPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVPVEARPRKCETHTESFKNSEILKPHRAKPY
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KB7 --EKLGKNISVSTQLTTNQTNPSGQISYECGQCGRYFIQMADFHRHEKCHTGEKSFECKE
.. :: .: ..:. .: . .:. :::..::. : : ... .:.. ::::: ..:.:
XP_006 ACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSE
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 CGKYFRYNSLLIRHQIIHTGKKPFKCKECGKGLSSDTALIQHQRIHTGEKPYECKECGKA
::. : :. : .:: :::.::..:.:: :..:. .::.::::::::::::::..::::
XP_006 CGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKA
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 FSSSSVFLQHQRFHTGEKLYECNECWKTFSCSSSFTVHQRMHTGEKPYECKECGKRLSSN
: :. . .::: ::::: :.:.:: :.:: ..: :::.:::::::.: ::: .:..
XP_006 FRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRIHTGEKPYRCAACGKAFSQS
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 TALTQHQRIHTGEKPFECKECGKAFNQKITLIQHQRVHTGEKPYECKVCGKTFSWCGRFI
. ::.::: ::::::..:.::::::.:. .:: ::..:::::::.:. ::: :: . .:
XP_006 ANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCNECGKFFSESSALI
350 360 370 380 390 400
410 420
pF1KB7 LHQKLHTQKTPVQA
:. .:: . : .
XP_006 RHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSECGKAFRCSSAFVRHQR
410 420 430 440 450 460
>>NP_001273626 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 iso (474 aa)
initn: 1014 init1: 1014 opt: 1113 Z-score: 593.4 bits: 119.0 E(85289): 2.6e-26
Smith-Waterman score: 1122; 41.1% identity (68.9% similar) in 418 aa overlap (13-421:16-422)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MFQTAWRQEPVTFEDVAVYFTQNEWASLDSVQRALYREVMLENYANVASLAFPFTTP
: .:.: :.:..: : :. : ..: . . ... :..: . :
NP_001 MAAGLLTAGPRGSTFFSSVTVAFAQERWRCLVSTPRDRFKEGIPGKSRSLVLLGLPVSQP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 VLVSQLEQGELPWGLDPWEPMGREALRGICPGDEARTEKEGLTPKDHVSKETESFRLMVG
. ::::: : : :. : ::. :: . . : :.. .:. ::.
NP_001 GMNSQLEQREGAWMLEG------EDLRSPSPGWKIIS---GSPPEQALSEA--SFQDPCV
70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 GLPGNVSQH--LDFGSSLE-----QPQGHWIIKTKSKRRHFTDTSARHHEAYEVKNGEKF
.: . :.: :. .:.. .:: . .... .. . : .. : . . .. .
NP_001 EMPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVPVEARPRKCETHTESFKNSEILKPHRAKPY
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KB7 --EKLGKNISVSTQLTTNQTNPSGQISYECGQCGRYFIQMADFHRHEKCHTGEKSFECKE
.. :: .: ..:. .: . .:. :::..::. : : ... .:.. ::::: ..:.:
NP_001 ACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSE
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 CGKYFRYNSLLIRHQIIHTGKKPFKCKECGKGLSSDTALIQHQRIHTGEKPYECKECGKA
::. : :. : .:: :::.::..:.:: :..:. .::.::::::::::::::..::::
NP_001 CGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKA
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 FSSSSVFLQHQRFHTGEKLYECNECWKTFSCSSSFTVHQRMHTGEKPYECKECGKRLSSN
: :. . .::: ::::: :.:.:: :.:: ..: :::.:::::::.: ::: .:..
NP_001 FRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRIHTGEKPYRCAACGKAFSQS
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 TALTQHQRIHTGEKPFECKECGKAFNQKITLIQHQRVHTGEKPYECKVCGKTFSWCGRFI
. ::.::: ::::::..:.::::::.:. .:: ::..:::::::.:. ::: :: . .:
NP_001 ANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCNECGKFFSESSALI
350 360 370 380 390 400
410 420
pF1KB7 LHQKLHTQKTPVQA
:. .:: . : .
NP_001 RHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSECGKAFRCSSAFVRHQR
410 420 430 440 450 460
>>NP_001273625 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 iso (474 aa)
initn: 1014 init1: 1014 opt: 1113 Z-score: 593.4 bits: 119.0 E(85289): 2.6e-26
Smith-Waterman score: 1122; 41.1% identity (68.9% similar) in 418 aa overlap (13-421:16-422)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MFQTAWRQEPVTFEDVAVYFTQNEWASLDSVQRALYREVMLENYANVASLAFPFTTP
: .:.: :.:..: : :. : ..: . . ... :..: . :
NP_001 MAAGLLTAGPRGSTFFSSVTVAFAQERWRCLVSTPRDRFKEGIPGKSRSLVLLGLPVSQP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 VLVSQLEQGELPWGLDPWEPMGREALRGICPGDEARTEKEGLTPKDHVSKETESFRLMVG
. ::::: : : :. : ::. :: . . : :.. .:. ::.
NP_001 GMNSQLEQREGAWMLEG------EDLRSPSPGWKIIS---GSPPEQALSEA--SFQDPCV
70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 GLPGNVSQH--LDFGSSLE-----QPQGHWIIKTKSKRRHFTDTSARHHEAYEVKNGEKF
.: . :.: :. .:.. .:: . .... .. . : .. : . . .. .
NP_001 EMPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVPVEARPRKCETHTESFKNSEILKPHRAKPY
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KB7 --EKLGKNISVSTQLTTNQTNPSGQISYECGQCGRYFIQMADFHRHEKCHTGEKSFECKE
.. :: .: ..:. .: . .:. :::..::. : : ... .:.. ::::: ..:.:
NP_001 ACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSE
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 CGKYFRYNSLLIRHQIIHTGKKPFKCKECGKGLSSDTALIQHQRIHTGEKPYECKECGKA
::. : :. : .:: :::.::..:.:: :..:. .::.::::::::::::::..::::
NP_001 CGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKA
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 FSSSSVFLQHQRFHTGEKLYECNECWKTFSCSSSFTVHQRMHTGEKPYECKECGKRLSSN
: :. . .::: ::::: :.:.:: :.:: ..: :::.:::::::.: ::: .:..
NP_001 FRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRIHTGEKPYRCAACGKAFSQS
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 TALTQHQRIHTGEKPFECKECGKAFNQKITLIQHQRVHTGEKPYECKVCGKTFSWCGRFI
. ::.::: ::::::..:.::::::.:. .:: ::..:::::::.:. ::: :: . .:
NP_001 ANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCNECGKFFSESSALI
350 360 370 380 390 400
410 420
pF1KB7 LHQKLHTQKTPVQA
:. .:: . : .
NP_001 RHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSECGKAFRCSSAFVRHQR
410 420 430 440 450 460
>>NP_009066 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 isofor (498 aa)
initn: 1014 init1: 1014 opt: 1113 Z-score: 593.3 bits: 119.0 E(85289): 2.6e-26
Smith-Waterman score: 1122; 41.1% identity (68.9% similar) in 418 aa overlap (13-421:40-446)
10 20 30 40
pF1KB7 MFQTAWRQEPVTFEDVAVYFTQNEWASLDSVQRALYREVMLE
: .:.: :.:..: : :. : ..: .
NP_009 PGPALPQEENTGEEGMAAGLLTAGPRGSTFFSSVTVAFAQERWRCLVSTPRDRFKEGIPG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 NYANVASLAFPFTTPVLVSQLEQGELPWGLDPWEPMGREALRGICPGDEARTEKEGLTPK
. ... :..: . : . ::::: : : :. : ::. :: . . : :.
NP_009 KSRSLVLLGLPVSQPGMNSQLEQREGAWMLEG------EDLRSPSPGWKIIS---GSPPE
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150
pF1KB7 DHVSKETESFRLMVGGLPGNVSQH--LDFGSSLE-----QPQGHWIIKTKSKRRHFTDTS
. .:. ::. .: . :.: :. .:.. .:: . .... .. . :
NP_009 QALSEA--SFQDPCVEMPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVPVEARPRKCETHTES
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 ARHHEAYEVKNGEKF--EKLGKNISVSTQLTTNQTNPSGQISYECGQCGRYFIQMADFHR
.. : . . .. . .. :: .: ..:. .: . .:. :::..::. : : ... .
NP_009 FKNSEILKPHRAKPYACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQ
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 HEKCHTGEKSFECKECGKYFRYNSLLIRHQIIHTGKKPFKCKECGKGLSSDTALIQHQRI
:.. ::::: ..:.:::. : :. : .:: :::.::..:.:: :..:. .::.:::::
NP_009 HQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSALVQHQRI
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 HTGEKPYECKECGKAFSSSSVFLQHQRFHTGEKLYECNECWKTFSCSSSFTVHQRMHTGE
:::::::::..::::: :. . .::: ::::: :.:.:: :.:: ..: :::.::::
NP_009 HTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRIHTGE
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 KPYECKECGKRLSSNTALTQHQRIHTGEKPFECKECGKAFNQKITLIQHQRVHTGEKPYE
:::.: ::: .:... ::.::: ::::::..:.::::::.:. .:: ::..:::::::.
NP_009 KPYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYK
360 370 380 390 400 410
400 410 420
pF1KB7 CKVCGKTFSWCGRFILHQKLHTQKTPVQA
:. ::: :: . .: :. .:: . : .
NP_009 CNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSEC
420 430 440 450 460 470
>>NP_116313 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 isoform (446 aa)
initn: 1869 init1: 956 opt: 1111 Z-score: 592.6 bits: 118.8 E(85289): 2.9e-26
Smith-Waterman score: 1207; 44.4% identity (69.5% similar) in 423 aa overlap (5-420:45-424)
10 20 30
pF1KB7 MFQTAWRQEPVTFEDVAVYFTQNEWASLDSVQRA
: :: :::::::::: ..:: :. .::
NP_116 LLDSALPSKVPAFSDKDSLGDEMLAAALLKAKSQELVTFEDVAVYFIRKEWKRLEPAQRD
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 LYREVMLENYANVASLAFPFTTPVLVSQLEQGELPWGLDPWEPMGREALRGICPGDEART
:::.::::::.:: :: :.::
NP_116 LYRDVMLENYGNVFSL--------------------------------------DRETRT
80 90
100 110 120 130 140
pF1KB7 EKEGLTPKDHVSKETESFRLMVGGLPGNVSQHLDFGS------SLEQPQGHWIIKTKSKR
:.. ...:..:.: ...: . ..:: : : ::..: :. . ...
NP_116 END-----QEISEDTRSHGVLLGRFQKDISQGLKFKEAYEREVSLKRPLGNSPGERLNRK
100 110 120 130 140 150
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 R-HFTDTSARHHEAYEVKNGEKFEKLGKNISVSTQLTTNQTNPSGQISYECGQCGRYFIQ
: ....... . . . .::.. .:....:...: ..: : :. ..: .:.. : .
NP_116 MPDFGQVTVEEKLTPRGERSEKYNDFGNSFTVNSNLISHQRLPVGDRPHKCDECSKSFNR
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 MADFHRHEKCHTGEKSFECKECGKYFRYNSLLIRHQIIHTGKKPFKCKECGKGLSSDTAL
.:. .:.. ::::: .::.:::: : .: ::.:: ::::.::..:..::: .: ..::
NP_116 TSDLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLIQHQRIHTGEKPYECSDCGKTFSCSSAL
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 IQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSSSVFLQHQRFHTGEKLYECNECWKTFSCSSSFTVHQ
: :.:::::::::::.::::.:: ::.. .:::.::::: : :::: :.:: ::.. ::
NP_116 ILHRRIHTGEKPYECNECGKTFSWSSTLTHHQRIHTGEKPYACNECGKAFSRSSTLIHHQ
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 RMHTGEKPYECKECGKRLSSNTALTQHQRIHTGEKPFECKECGKAFNQKITLIQHQRVHT
:.:::::::::.:::: .:... : :::::::::::.:: ::: :. . ::::::.::
NP_116 RIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLYQHQRIHTGEKPYECMECGGKFTYSSGLIQHQRIHT
340 350 360 370 380 390
390 400 410 420
pF1KB7 GEKPYECKVCGKTFSWCGRFILHQKLHTQKTPVQA
::.::::. :::.: . . .. ::..:: . :.
NP_116 GENPYECSECGKAFRYSSALVRHQRIHTGEKPLNGIGMSKSSLRVTTELNIREST
400 410 420 430 440
>>NP_001265216 (OMIM: 194510) zinc finger protein 3 isof (446 aa)
initn: 1869 init1: 956 opt: 1111 Z-score: 592.6 bits: 118.8 E(85289): 2.9e-26
Smith-Waterman score: 1207; 44.4% identity (69.5% similar) in 423 aa overlap (5-420:45-424)
10 20 30
pF1KB7 MFQTAWRQEPVTFEDVAVYFTQNEWASLDSVQRA
: :: :::::::::: ..:: :. .::
NP_001 LLDSALPSKVPAFSDKDSLGDEMLAAALLKAKSQELVTFEDVAVYFIRKEWKRLEPAQRD
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 LYREVMLENYANVASLAFPFTTPVLVSQLEQGELPWGLDPWEPMGREALRGICPGDEART
:::.::::::.:: :: :.::
NP_001 LYRDVMLENYGNVFSL--------------------------------------DRETRT
80 90
100 110 120 130 140
pF1KB7 EKEGLTPKDHVSKETESFRLMVGGLPGNVSQHLDFGS------SLEQPQGHWIIKTKSKR
:.. ...:..:.: ...: . ..:: : : ::..: :. . ...
NP_001 END-----QEISEDTRSHGVLLGRFQKDISQGLKFKEAYEREVSLKRPLGNSPGERLNRK
100 110 120 130 140 150
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 R-HFTDTSARHHEAYEVKNGEKFEKLGKNISVSTQLTTNQTNPSGQISYECGQCGRYFIQ
: ....... . . . .::.. .:....:...: ..: : :. ..: .:.. : .
NP_001 MPDFGQVTVEEKLTPRGERSEKYNDFGNSFTVNSNLISHQRLPVGDRPHKCDECSKSFNR
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 MADFHRHEKCHTGEKSFECKECGKYFRYNSLLIRHQIIHTGKKPFKCKECGKGLSSDTAL
.:. .:.. ::::: .::.:::: : .: ::.:: ::::.::..:..::: .: ..::
NP_001 TSDLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLIQHQRIHTGEKPYECSDCGKTFSCSSAL
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 IQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSSSVFLQHQRFHTGEKLYECNECWKTFSCSSSFTVHQ
: :.:::::::::::.::::.:: ::.. .:::.::::: : :::: :.:: ::.. ::
NP_001 ILHRRIHTGEKPYECNECGKTFSWSSTLTHHQRIHTGEKPYACNECGKAFSRSSTLIHHQ
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 RMHTGEKPYECKECGKRLSSNTALTQHQRIHTGEKPFECKECGKAFNQKITLIQHQRVHT
:.:::::::::.:::: .:... : :::::::::::.:: ::: :. . ::::::.::
NP_001 RIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLYQHQRIHTGEKPYECMECGGKFTYSSGLIQHQRIHT
340 350 360 370 380 390
390 400 410 420
pF1KB7 GEKPYECKVCGKTFSWCGRFILHQKLHTQKTPVQA
::.::::. :::.: . . .. ::..:: . :.
NP_001 GENPYECSECGKAFRYSSALVRHQRIHTGEKPLNGIGMSKSSLRVTTELNIREST
400 410 420 430 440
422 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 07:34:45 2016 done: Fri Nov 4 07:34:46 2016
Total Scan time: 8.560 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]