Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7419
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7419, 318 aa
1>>>pF1KB7419 318 - 318 aa - 318 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9552+/-0.00155; mu= 12.4319+/- 0.090
mean_var=181.8120+/-62.592, 0's: 0 Z-trim(100.2): 389 B-trim: 724 in 2/46
Lambda= 0.095118
statistics sampled from 5547 (6025) to 5547 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.504), E-opt: 0.2 (0.185), width: 16
Scan time: 2.200
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 2046 294.2 8.7e-80
CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 ( 347) 1788 258.9 4.2e-69
CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 ( 318) 1405 206.3 2.6e-53
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 1403 206.0 3.2e-53
CCDS6596.2 OR2S2 gene_id:56656|Hs108|chr9 ( 319) 1394 204.8 7.5e-53
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 ( 320) 1378 202.6 3.4e-52
CCDS35091.1 OR13C5 gene_id:138799|Hs108|chr9 ( 318) 1360 200.1 1.9e-51
CCDS35094.1 OR13D1 gene_id:286365|Hs108|chr9 ( 346) 1257 186.0 3.6e-47
CCDS6778.1 OR2K2 gene_id:26248|Hs108|chr9 ( 316) 1168 173.8 1.6e-43
CCDS35087.1 OR13F1 gene_id:138805|Hs108|chr9 ( 319) 1065 159.6 2.9e-39
CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 1060 158.9 4.6e-39
CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 1041 156.3 2.9e-38
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 1029 154.7 9e-38
CCDS35011.1 OR13J1 gene_id:392309|Hs108|chr9 ( 312) 1010 152.1 5.4e-37
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 1007 151.7 7.8e-37
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 980 148.0 9.5e-36
CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 977 147.5 1.2e-35
CCDS31090.1 OR2B11 gene_id:127623|Hs108|chr1 ( 317) 972 146.9 2e-35
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 969 146.4 2.7e-35
CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 957 144.8 8.4e-35
CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 955 144.5 1e-34
CCDS31421.1 OR10A3 gene_id:26496|Hs108|chr11 ( 314) 953 144.2 1.2e-34
CCDS4660.1 OR2H1 gene_id:26716|Hs108|chr6 ( 316) 953 144.3 1.2e-34
CCDS31092.1 OR2G2 gene_id:81470|Hs108|chr1 ( 317) 953 144.3 1.2e-34
CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 952 144.1 1.4e-34
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 951 144.0 1.5e-34
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 949 143.7 1.8e-34
CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 947 143.4 2.2e-34
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 947 143.4 2.2e-34
CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 946 143.3 2.4e-34
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 945 143.2 2.7e-34
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 939 142.3 4.7e-34
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 939 142.3 4.7e-34
CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 937 142.0 5.6e-34
CCDS35396.1 OR13H1 gene_id:347468|Hs108|chrX ( 308) 936 141.9 6.1e-34
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 ( 323) 936 141.9 6.3e-34
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 935 141.8 6.8e-34
CCDS34323.1 OR2Y1 gene_id:134083|Hs108|chr5 ( 311) 931 141.2 9.9e-34
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 930 141.1 1.1e-33
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 928 140.8 1.3e-33
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 924 140.3 1.9e-33
CCDS31514.1 OR10AG1 gene_id:282770|Hs108|chr11 ( 301) 919 139.6 3e-33
CCDS31099.1 OR2W3 gene_id:343171|Hs108|chr1 ( 314) 919 139.6 3.1e-33
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 915 139.0 4.5e-33
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 911 138.5 6.6e-33
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 911 138.5 6.6e-33
CCDS35129.1 OR1L4 gene_id:254973|Hs108|chr9 ( 311) 909 138.2 8e-33
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 904 137.5 1.3e-32
CCDS35130.2 OR1L6 gene_id:392390|Hs108|chr9 ( 311) 903 137.4 1.4e-32
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 903 137.4 1.4e-32
>>CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 (318 aa)
initn: 2046 init1: 2046 opt: 2046 Z-score: 1545.9 bits: 294.2 E(32554): 8.7e-80
Smith-Waterman score: 2046; 100.0% identity (100.0% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDKINQTFVREFILLGLSGYPKLEIIFFALILVMYVVILIGNGVLIIASILDSRLHMPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MDKINQTFVREFILLGLSGYPKLEIIFFALILVMYVVILIGNGVLIIASILDSRLHMPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLGNLSFLDICYTTSSIPSTLVSLISKKRNISFSGCAVQMFFGFAMGSTECFLLGMMAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FFLGNLSFLDICYTTSSIPSTLVSLISKKRNISFSGCAVQMFFGFAMGSTECFLLGMMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYVAICNPLRYPIIMNKVVYVLLTSVSWLSGGINSTVQTSLAMRWPFCGNNIINHFLCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DRYVAICNPLRYPIIMNKVVYVLLTSVSWLSGGINSTVQTSLAMRWPFCGNNIINHFLCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ILAVLKLACSDISVNIVTLAVSNIAFLVLPLLVIFFSYMFILYTILRTNSATGRHKAFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ILAVLKLACSDISVNIVTLAVSNIAFLVLPLLVIFFSYMFILYTILRTNSATGRHKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLLGKDNLQATEGLVSMFYGVVTPMLNPIIYSLRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 CSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLLGKDNLQATEGLVSMFYGVVTPMLNPIIYSLRN
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 KDVKAAIKYLLSRKAINQ
::::::::::::::::::
CCDS35 KDVKAAIKYLLSRKAINQ
310
>>CCDS35089.1 OR13C3 gene_id:138803|Hs108|chr9 (347 aa)
initn: 1808 init1: 1781 opt: 1788 Z-score: 1354.1 bits: 258.9 E(32554): 4.2e-69
Smith-Waterman score: 1788; 83.9% identity (96.8% similar) in 317 aa overlap (1-317:31-347)
10 20 30
pF1KB7 MDKINQTFVREFILLGLSGYPKLEIIFFAL
: .::::.: ::.:::::::::.::..:::
CCDS35 MIVQLICTVCFLAVNTFHVRSSFDFLKADDMGEINQTLVSEFLLLGLSGYPKIEIVYFAL
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40 50 60 70 80 90
pF1KB7 ILVMYVVILIGNGVLIIASILDSRLHMPMYFFLGNLSFLDICYTTSSIPSTLVSLISKKR
:::::.::::::::::::::.::..: :::::::::::::::::.::.::::::::::::
CCDS35 ILVMYLVILIGNGVLIIASIFDSHFHTPMYFFLGNLSFLDICYTSSSVPSTLVSLISKKR
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 NISFSGCAVQMFFGFAMGSTECFLLGMMAFDRYVAICNPLRYPIIMNKVVYVLLTSVSWL
::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::..::.:::..:::::
CCDS35 NISFSGCAVQMFFGFAMGSTECLLLGMMAFDRYVAICNPLRYPIILSKVAYVLMASVSWL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 SGGINSTVQTSLAMRWPFCGNNIINHFLCEILAVLKLACSDISVNIVTLAVSNIAFLVLP
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CCDS35 SGGINSAVQTLLAMRLPFCGNNIINHFACEILAVLKLACADISLNIITMVISNMAFLVLP
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 LLVIFFSYMFILYTILRTNSATGRHKAFSTCSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLLGK
:.::::::::::::::. ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:.
CCDS35 LMVIFFSYMFILYTILQMNSATGRRKAFSTCSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLIGE
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310
pF1KB7 DNLQATEGLVSMFYGVVTPMLNPIIYSLRNKDVKAAIKYLLSRKAINQ
..::: . :.:.::::::::::::.:::::::::::.::::..: :.
CCDS35 EKLQALDKLISLFYGVVTPMLNPILYSLRNKDVKAAVKYLLNKKPIH
310 320 330 340
>>CCDS35092.1 OR13C2 gene_id:392376|Hs108|chr9 (318 aa)
initn: 1425 init1: 1392 opt: 1405 Z-score: 1070.5 bits: 206.3 E(32554): 2.6e-53
Smith-Waterman score: 1405; 65.3% identity (88.9% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDKINQTFVREFILLGLSGYPKLEIIFFALILVMYVVILIGNGVLIIASILDSRLHMPMY
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CCDS35 MEWENHTILVEFFLKGLSGHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
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pF1KB7 FFLGNLSFLDICYTTSSIPSTLVSLISKKRNISFSGCAVQMFFGFAMGSTECFLLGMMAF
:::::::::::::::.::::::::..:....::.::::::::.:.:::.::: :::::::
CCDS35 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISLSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
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pF1KB7 DRYVAICNPLRYPIIMNKVVYVLLTSVSWLSGGINSTVQTSLAMRWPFCGNNIINHFLCE
::::::::::::::::.: .:: ... ::. :..::.::. .... ::: ::::::: ::
CCDS35 DRYVAICNPLRYPIIMSKDAYVPMAAGSWIIGAVNSAVQSVFVVQLPFCRNNIINHFTCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ILAVLKLACSDISVNIVTLAVSNIAFLVLPLLVIFFSYMFILYTILRTNSATGRHKAFST
::::.::::.::: : . :.. :.. :::.:. :: .:. .:.. .:. :: :: ::
CCDS35 ILAVMKLACADISDNEFIMLVATTLFILTPLLLIIVSYTLIIVSIFKISSSEGRSKASST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLLGKDNLQATEGLVSMFYGVVTPMLNPIIYSLRN
:::::::::::::::.::: ::::.. :..:.:.::. ..::::::.:::.::.::::::
CCDS35 CSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRN
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 KDVKAAIKYLLSRKAINQ
:::: :.:.::.:.
CCDS35 KDVKEAVKHLLNRRFFSK
310
>>CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 (318 aa)
initn: 1440 init1: 1401 opt: 1403 Z-score: 1069.0 bits: 206.0 E(32554): 3.2e-53
Smith-Waterman score: 1403; 65.6% identity (88.5% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDKINQTFVREFILLGLSGYPKLEIIFFALILVMYVVILIGNGVLIIASILDSRLHMPMY
:. :::.. ::.: : : .:.::..::.::..::::::.:::.::. :::: .:: :::
CCDS35 MEWENQTILVEFFLKGHSVHPRLELLFFVLIFIMYVVILLGNGTLILISILDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLGNLSFLDICYTTSSIPSTLVSLISKKRNISFSGCAVQMFFGFAMGSTECFLLGMMAF
:::::::::::::::.::::::::..:....:::::::::::.:.:::.::: :::::::
CCDS35 FFLGNLSFLDICYTTTSIPSTLVSFLSERKTISFSGCAVQMFLGLAMGTTECVLLGMMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYVAICNPLRYPIIMNKVVYVLLTSVSWLSGGINSTVQTSLAMRWPFCGNNIINHFLCE
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CCDS35 DRYVAICNPLRYPIIMSKNAYVPMAVGSWFAGIVNSAVQTTFVVQLPFCRKNVINHFSCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ILAVLKLACSDISVNIVTLAVSNIAFLVLPLLVIFFSYMFILYTILRTNSATGRHKAFST
::::.::::.::: : . :..: : ..:::.: .:: .:. .::. .:. :: :::::
CCDS35 ILAVMKLACADISGNEFLMLVATILFTLMPLLLIVISYSLIISSILKIHSSEGRSKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLLGKDNLQATEGLVSMFYGVVTPMLNPIIYSLRN
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CCDS35 CSAHLTVVIIFYGTILFMYMKPKSKETLNSDDLDATDKIISMFYGVMTPMMNPLIYSLRN
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 KDVKAAIKYLLSRKAINQ
:::: :.:.: .:.
CCDS35 KDVKEAVKHLPNRRFFSK
310
>>CCDS6596.2 OR2S2 gene_id:56656|Hs108|chr9 (319 aa)
initn: 1393 init1: 1369 opt: 1394 Z-score: 1062.3 bits: 204.8 E(32554): 7.5e-53
Smith-Waterman score: 1394; 64.6% identity (87.5% similar) in 319 aa overlap (1-318:1-319)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MDKINQTF-VREFILLGLSGYPKLEIIFFALILVMYVVILIGNGVLIIASILDSRLHMPM
:.: :.: : :.:: ::..:.:: ::.:::.::.:::.::::::...::::::: ::
CCDS65 MEKANETSPVMGFVLLRLSAHPELEKTFFVLILLMYLVILLGNGVLILVTILDSRLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 YFFLGNLSFLDICYTTSSIPSTLVSLISKKRNISFSGCAVQMFFGFAMGSTECFLLGMMA
:::::::::::::.::::.: .: :... ...::::.::::: ..:::..:::.::.:::
CCDS65 YFFLGNLSFLDICFTTSSVPLVLDSFLTPQETISFSACAVQMALSFAMAGTECLLLSMMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 FDRYVAICNPLRYPIIMNKVVYVLLTSVSWLSGGINSTVQTSLAMRWPFCGNNIINHFLC
::::::::::::: .::.:..:. ... :: :: :.:.::::.. ::::.:.:::: :
CCDS65 FDRYVAICNPLRYSVIMSKAAYMPMAASSWAIGGAASVVHTSLAIQLPFCGDNVINHFTC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 EILAVLKLACSDISVNIVTLAVSNIAFLVLPLLVIFFSYMFILYTILRTNSATGRHKAFS
::::::::::.:::.:.... :.:. :: .:.: : :::.::. :::: :: ::.:.::
CCDS65 EILAVLKLACADISINVISMEVTNVIFLGVPVLFISFSYVFIITTILRIPSAEGRKKVFS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 TCSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLLGKDNLQATEGLVSMFYGVVTPMLNPIIYSLR
::::::::::.::::.::::.::::.: .: :. . .. :. .:::::::::::::::::
CCDS65 TCSAHLTVVIVFYGTLFFMYGKPKSKDSMGADKEDLSDKLIPLFYGVVTPMLNPIIYSLR
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 NKDVKAAIKYLLSRKAINQ
:::::::.. :: :...:
CCDS65 NKDVKAAVRRLLRPKGFTQ
310
>>CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9 (320 aa)
initn: 1363 init1: 1363 opt: 1378 Z-score: 1050.4 bits: 202.6 E(32554): 3.4e-52
Smith-Waterman score: 1378; 63.1% identity (87.9% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDKINQTFVREFILLGLSGYPKLEIIFFALILVMYVVILIGNGVLIIASILDSRLHMPMY
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CCDS35 MERTNDSTSTEFFLVGLSAHPKLQTVFFVLILWMYLMILLGNGVLISVIIFDSHLHTPMY
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310 320
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]