FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7419, 318 aa 1>>>pF1KB7419 318 - 318 aa - 318 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4070+/-0.000626; mu= 21.3545+/- 0.039 mean_var=114.3855+/-31.413, 0's: 0 Z-trim(106.0): 301 B-trim: 897 in 1/49 Lambda= 0.119919 statistics sampled from 13763 (14160) to 13763 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.484), E-opt: 0.2 (0.166), width: 16 Scan time: 6.860 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 977 181.0 2.8e-45 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 967 179.3 9.4e-45 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 967 179.3 9.4e-45 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 967 179.3 9.4e-45 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 957 177.5 3.1e-44 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 946 175.6 1.1e-43 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 937 174.0 3.3e-43 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 930 172.8 7.9e-43 NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 924 171.8 1.6e-42 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 919 170.9 3e-42 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 903 168.2 2e-41 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 864 161.4 2.2e-39 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 864 161.4 2.2e-39 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 864 161.4 2.2e-39 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 857 160.2 5.1e-39 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 846 158.3 1.9e-38 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 840 157.3 3.8e-38 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 840 157.3 3.8e-38 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 814 152.8 8.6e-37 NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 683 130.1 5.7e-30 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 556 108.2 2.4e-23 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 539 105.2 1.8e-22 NP_071640 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor iso ( 359) 215 49.2 1.5e-05 XP_006714928 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 362) 215 49.2 1.5e-05 NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 215 49.3 1.5e-05 NP_001124527 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor ( 397) 215 49.3 1.5e-05 NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 215 49.3 1.6e-05 XP_006714927 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 215 49.4 1.6e-05 XP_005265961 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 215 49.4 1.6e-05 XP_011532850 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 215 49.4 1.6e-05 XP_016864915 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 215 49.4 1.6e-05 XP_011532851 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 215 49.4 1.6e-05 NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 202 47.0 6.8e-05 NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 201 46.8 7.7e-05 NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 196 45.9 0.00014 XP_005263091 (OMIM: 162642) PREDICTED: neuropeptid ( 381) 190 45.0 0.0003 XP_005263090 (OMIM: 162642) PREDICTED: neuropeptid ( 381) 190 45.0 0.0003 NP_000901 (OMIM: 162642) neuropeptide Y receptor t ( 381) 190 45.0 0.0003 NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 188 44.7 0.00041 NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 188 44.7 0.00042 XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 188 44.7 0.00043 NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 182 43.6 0.00078 NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 181 43.3 0.00085 XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 179 43.1 0.0011 NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic ( 408) 179 43.1 0.0012 XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 179 43.1 0.0012 NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 179 43.1 0.0012 XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 179 43.1 0.0012 NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 177 42.6 0.0013 NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 172 41.7 0.0024 >>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa) initn: 1015 init1: 854 opt: 977 Z-score: 933.9 bits: 181.0 E(85289): 2.8e-45 Smith-Waterman score: 977; 46.3% identity (77.3% similar) in 309 aa overlap (3-311:6-308) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MDKINQTFVREFILLGLSGYPKLEIIFFALILVMYVVILIGNGVLIIASILDSRLHM :.: . :::.:.:..:.::...:...:..:.. :::: .:: : :::.:: NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 PMYFFLGNLSFLDICYTTSSIPSTLVSLISKKRNISFSGCAVQMFFGFAMGSTECFLLGM ::::::.::::::.::::::::. ::.: . ...::..:: .:..: .:.:.::: :: . 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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 DRYVAICNPLRYPIIMNKVVYVLLTSVSWLSGGINSTVQTSLAMRWPFCGNNIINHFLCE :::::.:. ::: ::. . . :. .::.:: :.: :::..... :.: :..:.:. :: XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 ILAVLKLACSDISVNIVTLAVSNIAFLVLPLLVIFFSYMFILYTILRTNSATGRHKAFST .:::..::: : : : ::. ::.:..:. :. ....::. :. :::. .: ::.::: : XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 CSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLLGKDNLQATEGLVSMFYGVVTPMLNPIIYSLRN :..::::: . ::. .: : .:.:. . :: : : :.::...::::::.:::::: XP_011 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSV----LQ--EKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRN 250 260 270 280 290 310 pF1KB7 KDVKAAIKYLLSRKAINQ :.::.: . :: XP_011 KEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT 300 310 >>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa) initn: 963 init1: 858 opt: 957 Z-score: 915.2 bits: 177.5 E(85289): 3.1e-44 Smith-Waterman score: 957; 45.7% identity (76.2% similar) in 311 aa overlap (4-314:2-306) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MDKINQTFVREFILLGLSGYPKLEIIFFALILVMYVVILIGNGVLIIASILDSRLHMPMY .::. . :.:::.: .: :: .:...:. :.. :.:: ..:. : :: .:: ::: NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 FFLGNLSFLDICYTTSSIPSTLVSLISKKRNISFSGCAVQMFFGFAMGSTECFLLGMMAF :::.::::::.:.::: .:. ::.: . :..::: :.::.:. ...:.:::.:: .::: NP_009 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 DRYVAICNPLRYPIIMNKVVYVLLTSVSWLSGGINSTVQTSLAMRWPFCGNNIINHFLCE :::::.:.::.: :.. . :.::.:. : ..:.::: ... ::: . .. :.:: NP_009 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 ILAVLKLACSDISVNIVTLAVSNIAFLVLPLLVIFFSYMFILYTILRTNSATGRHKAFST . :...:.: : : : . .::... .::.:: .:. :: : ...:: ::: ::.:::.: NP_009 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 CSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLLGKDNLQATEGLVSMFYGVVTPMLNPIIYSLRN ::.::::: .::.... .: .::. : . ..::.: :: :::.::.::: NP_009 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNP------YAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRN 240 250 260 270 280 290 310 pF1KB7 KDVKAAIKYLLSRKAINQ :.: :.. ::... NP_009 KEVTRAFRRLLGKEMGLTQS 300 310 >>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa) initn: 957 init1: 806 opt: 946 Z-score: 904.9 bits: 175.6 E(85289): 1.1e-43 Smith-Waterman score: 946; 47.0% identity (76.0% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-305) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MDKINQTFVREFILLGLSGYPKLEIIFFALILVMYVVILIGNGVLIIASILDSRLHMPMY : .:::: : ::.::::: :. : ..: ..: .:.: ..:: .:: .::.:: ::: NP_003 MRQINQTQVTEFLLLGLSDGPHTEQLLFIVLLGVYLVTVLGNLLLISLVHVDSQLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 FFLGNLSFLDICYTTSSIPSTLVSLISKKRNISFSGCAVQMFFGFAMGSTECFLLGMMAF ::: :::. :.:..:. .:..:: :.:.:. :.:. ::....: . .: :.: ::..:.. NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 DRYVAICNPLRYPIIMNKVVYVLLTSVSWLSGGINSTVQTSLAMRWPFCGNNIINHFLCE ::::::::::::: ::. : : :.. :: :: . :.:.:.. .: :. :.: : ::.:: NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 ILAVLKLACSDISVNIVTLAVSNIAFLVLPLLVIFFSYMFILYTILRTNSATGRHKAFST :.: :: .: .. ... . ....:..:...:. :: :. :... .:..: ::::: NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 CSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLLGKDNLQATEGLVSMFYGVVTPMLNPIIYSLRN :..:: :::.:::. .. : :::. . : ::.::..:::::::.:::::: NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSS--------KQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRN 250 260 270 280 290 310 pF1KB7 KDVKAAIKYLLSRKAINQ ::::::.. . .: NP_003 KDVKAALRKVATRNFP 300 >>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa) initn: 943 init1: 858 opt: 937 Z-score: 896.6 bits: 174.0 E(85289): 3.3e-43 Smith-Waterman score: 937; 46.2% identity (76.1% similar) in 301 aa overlap (4-304:2-296) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MDKINQTFVREFILLGLSGYPKLEIIFFALILVMYVVILIGNGVLIIASILDSRLHMPMY .::. . :.:::.: .: :: .:...:. :.. :.:: ..:. : :: .:: ::: XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 FFLGNLSFLDICYTTSSIPSTLVSLISKKRNISFSGCAVQMFFGFAMGSTECFLLGMMAF :::.::::::.:.::: .:. ::.: . :..::: :.::.:. ...:.:::.:: .::: XP_011 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 DRYVAICNPLRYPIIMNKVVYVLLTSVSWLSGGINSTVQTSLAMRWPFCGNNIINHFLCE :::::.:.::.: :.. . :.::.:. : ..:.::: ... ::: . .. :.:: XP_011 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 ILAVLKLACSDISVNIVTLAVSNIAFLVLPLLVIFFSYMFILYTILRTNSATGRHKAFST . :...:.: : : : . .::... .::.:: .:. :: : ...:: ::: ::.:::.: XP_011 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 CSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLLGKDNLQATEGLVSMFYGVVTPMLNPIIYSLRN ::.::::: .::.... .: .::. : . ..::.: :: :::.::.::: XP_011 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNP------YAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRN 240 250 260 270 280 290 310 pF1KB7 KDVKAAIKYLLSRKAINQ :. : XP_011 KEQKRRGS 300 >>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa) initn: 907 init1: 797 opt: 930 Z-score: 889.9 bits: 172.8 E(85289): 7.9e-43 Smith-Waterman score: 930; 44.1% identity (78.1% similar) in 311 aa overlap (5-314:7-310) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MDKINQTFVREFILLGLSGYPKLEIIFFALILVMYVVILIGN-GVLIIASILDSRLHM : :.: ::::::. :.:.:..: ..:..:..::::: :.... : : .:. NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRI-DPHLQT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 PMYFFLGNLSFLDICYTTSSIPSTLVSLISKKRNISFSGCAVQMFFGFAMGSTECFLLGM ::::::.::::.:.:: .. .:. ::...:....::. :::.:..: ....:: :.:. NP_006 PMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 MAFDRYVAICNPLRYPIIMNKVVYVLLTSVSWLSGGINSTVQTSLAMRWPFCGNNIINHF ::.:::::::::: : ..:.. . . : .:.:.:...: :.::.:. .: .:.:::: NP_006 MAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 LCEILAVLKLACSDISVNIVTLAVSNIAFLVLPLLVIFFSYMFILYTILRTNSATGRHKA .:.. .:::.:.: ..: :.. . . .. ...:..::.::: ..:. : .::.:. NP_006 FCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKT 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 FSTCSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLLGKDNLQATEGLVSMFYGVVTPMLNPIIYS ::::..::: : :. ::..:.:..: . : . : :. ..:.:: . :.:::.::: NP_006 FSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRP---SYLYSPN---TDKIISVFYTIFIPVLNPLIYS 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KB7 LRNKDVKAAIKYLLSRKAINQ ::::::: : . .: : NP_006 LRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS 300 310 >>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa) initn: 953 init1: 776 opt: 924 Z-score: 884.3 bits: 171.8 E(85289): 1.6e-42 Smith-Waterman score: 924; 44.5% identity (77.3% similar) in 317 aa overlap (1-314:1-308) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MDKINQTFVREFILLGLSGYPKLEIIFFALILVMYVVILIGNGVLIIASILDSRLHMPMY : . : : . ::.::::. .:.::.: ..::.:.. ..:: .:. .::.:: ::: NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 FFLGNLSFLDICYTTSSIPSTLVSLISKKRNISFSGCAVQMFFGFAMGSTECFLLGMMAF :::.::::.:.: .:. :. :..:.:.:..:::.:: .::.: .....:::.:.:.::. NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 DRYVAICNPLRYPIIMNKVVYVLLTSVSWLSGGINSTVQTSLAMRWPFCGNNIINHFLCE :::.::: :: : .::...::. ... .. .: .: :.:: . :: .:.:.::.:. NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 ILAVLKLACSDISVNIVTLAVSNI---AFLVLPLLVIFFSYMFILYTILRTNSATGRHKA ..::.::: .:. ..:.: . .: ::::. :: ..:..:. .:. :::.: NP_003 SPPLFKLSCSD---TILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 FSTCSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLLGKDNLQATEGLVSMFYGVVTPMLNPIIYS ::::..:::..:.::.: .. : .:.:. :..:.. .:.:: :: :::::.::: NP_003 FSTCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKV------ASVFYTVVIPMLNPLIYS 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KB7 LRNKDVKAAIKYLLSRKAINQ ::.:.:: :. ..::: NP_003 LRSKEVKKALANVISRKRTSSFL 300 310 >>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa) initn: 969 init1: 801 opt: 919 Z-score: 879.6 bits: 170.9 E(85289): 3e-42 Smith-Waterman score: 919; 43.8% identity (77.2% similar) in 320 aa overlap (1-318:1-313) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MDKINQTFVREFILLGLSGYPKLEIIFFALILVMYVVILIGNGVLIIASILDSRLHMPMY :: : . .:::::.: :.:: :.:..::. :.. :.:: ..:..: :: .:: ::: NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 FFLGNLSFLDICYTTSSIPSTLVSLISKKRNISFSGCAVQMFFGFAMGSTECFLLGMMAF :::..:::::. .::::::. : .: . ..::. :::.:.:. ...:..::.::..::. NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 DRYVAICNPLRYPIIMNKVVYVLLTSVSWLSGGINSTVQTSLAMRWPFCGNNIINHFLCE :: ::::.::.: .::: . :.::.: : :: ... ...: : ::.. ..::: : NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 ILAVLKLAC-SDISVNIVTLAVSNIAFLVLPLLVIFFSYMFILYTILRTNSATGRHKAFS . :....:: : .... :. : .. .. ::. :..:: .:. ..:. ::.::.:::. NP_001 MPALIRMACVSTVAIEG-TVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 TCSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLLGKDNLQATEGLVSMFYGVVTPMLNPIIYSLR ::..::::: .:::.:..:: .: : .. : .. .::..:::.:::.::.:: NP_001 TCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQP------GASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLR 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KB7 NKDVKAAI-KYLLSRKAINQ :..::.:. . ::... ... NP_001 NREVKGALGRLLLGKRELGKE 300 310 318 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 07:37:35 2016 done: Fri Nov 4 07:37:36 2016 Total Scan time: 6.860 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]