FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7425, 479 aa 1>>>pF1KB7425 479 - 479 aa - 479 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4221+/-0.000807; mu= 17.2144+/- 0.048 mean_var=67.2911+/-13.372, 0's: 0 Z-trim(107.5): 27 B-trim: 0 in 0/49 Lambda= 0.156349 statistics sampled from 9598 (9623) to 9598 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.669), E-opt: 0.2 (0.296), width: 16 Scan time: 3.050 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS41255.1 PRAMEF10 gene_id:343071|Hs108|chr1 ( 474) 1964 452.0 6.5e-127 CCDS41264.1 PRAMEF17 gene_id:391004|Hs108|chr1 ( 474) 1904 438.4 7.7e-123 CCDS148.1 PRAMEF1 gene_id:65121|Hs108|chr1 ( 474) 1871 431.0 1.3e-120 CCDS76109.1 PRAMEF14 gene_id:729528|Hs108|chr1 ( 474) 1842 424.5 1.2e-118 CCDS149.1 PRAMEF2 gene_id:65122|Hs108|chr1 ( 474) 1837 423.3 2.7e-118 CCDS41254.1 PRAMEF12 gene_id:390999|Hs108|chr1 ( 483) 1609 371.9 8.4e-103 CCDS41265.1 PRAMEF20 gene_id:645425|Hs108|chr1 ( 475) 1558 360.4 2.4e-99 CCDS72709.1 PRAMEF8 gene_id:391002|Hs108|chr1 ( 474) 1511 349.8 3.7e-96 CCDS30593.1 PRAMEF7 gene_id:441871|Hs108|chr1 ( 474) 1506 348.7 8.1e-96 CCDS81265.1 PRAMEF25 gene_id:441873|Hs108|chr1 ( 478) 1441 334.0 2.1e-91 CCDS76106.1 PRAMEF26 gene_id:645359|Hs108|chr1 ( 478) 1441 334.0 2.1e-91 CCDS44059.1 PRAMEF15 gene_id:653619|Hs108|chr1 ( 478) 1431 331.7 1e-90 CCDS72708.1 PRAMEF5 gene_id:343068|Hs108|chr1 ( 476) 1427 330.8 1.9e-90 CCDS30594.1 PRAMEF6 gene_id:440561|Hs108|chr1 ( 476) 1425 330.4 2.6e-90 CCDS53268.2 PRAMEF11 gene_id:440560|Hs108|chr1 ( 478) 1413 327.7 1.7e-89 CCDS30592.1 PRAMEF4 gene_id:400735|Hs108|chr1 ( 478) 1413 327.7 1.7e-89 CCDS76108.1 PRAMEF9 gene_id:343070|Hs108|chr1 ( 478) 1412 327.5 2e-89 CCDS72704.1 PRAMEF27 gene_id:101929983|Hs108|chr1 ( 478) 1402 325.2 9.4e-89 CCDS13801.1 PRAME gene_id:23532|Hs108|chr22 ( 509) 753 178.8 1.2e-44 CCDS6432.1 LRRC14 gene_id:9684|Hs108|chr8 ( 493) 346 87.0 4.9e-17 >>CCDS41255.1 PRAMEF10 gene_id:343071|Hs108|chr1 (474 aa) initn: 1990 init1: 1964 opt: 1964 Z-score: 2392.0 bits: 452.0 E(32554): 6.5e-127 Smith-Waterman score: 1964; 62.8% identity (81.0% similar) in 473 aa overlap (1-473:1-473) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MSLQAPRRLLELAGQSLLGDQALAISILDELPRELFPPLFVEAFTSRRCEVLKVMVQAWP :::::: ::::::::::: .: :.: :::::::.:: .:.:::. :: :.::.:::::: CCDS41 MSLQAPSRLLELAGQSLLRNQFLTIFTLDELPREVFPLMFMEAFSMRRFEALKLMVQAWP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 FPCLPLGSLMKTPDLEILHYVVDGIDCLLAQKVRPRRRKLQVLELRDVDENFWTIWSGAR : :::::::::: :: :. :. :.: :.:::::::: :::::.:::::::::::::::: CCDS41 FLRLPLGSLMKTPHLETLQAVLRGLDTLVAQKVRPRRWKLQVLDLRDVDENFWTIWSGAR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 PLSCSPEAMSKRQTVEDCPRTGEKQPLKVFMDVCLKEKFMDEDLSFFSGWVQHRRGSVHL ::::::::::::::::::: ::.::::::.:.::::. .:: ::.. ::...::: ::: CCDS41 VLSCSPEAMSKRQTVEDCPRMGERQPLKVFIDLCLKESTLDECLSYLFGWIHYRRGLVHL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 CCTKVVNYSMSILNFRNILETVYPDSIQVLEIWNMCWPCMIVEFIRYLSQMRNLRKLFIS ::.:: :::: .:::.:: .:::::: ::.:. : .: ::::: :::.::.. 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CCDS41 FGYDDELYVSGQQQFVPDLDCPFLCLYYPQMLYIRKISNIKEHLEHLLRCLKNPLGTFIF 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 TYGFLEKVDLKCLPRYPSLSQLKQLNLSHGALRFIRLEPLRALLEKVAATLQTLFLVDCG ...: :..:: .::::::::.:.: : . :::: ::::::::::. : : :: CCDS41 CHAYLADQDMECLSQYPSLSQLKELHLIHILMWTTNLEPLGALLEKVAATLEILTLKDCQ 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB7 IRDSKLRVILPALSCCSNLTTFCFHGNDTSMDGLKDLLRHTGRLSNLSLETYPAPRESLD :.::.:::.::::: ::.:::: :.::.:: ..::::: ::: ::.:.:: :::: : :: CCDS41 IQDSQLRVLLPALSRCSQLTTFYFRGNETSTNALKDLLCHTGGLSKLGLELYPAPLECLD 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 DRGRVISELLTPLQAELMRILREVREPKRIFFGPVSCPCCGTSPTEQLEFNFCLWGRPA .::.: :.:.:..:::: :::::.::::::::. :: ::. :.:...:..: CCDS41 NRGHVNWEILAPIRAELMCTLREVRQPKRIFFGPIPCPSCGSWPSEKVDFHLCS 430 440 450 460 470 >>CCDS148.1 PRAMEF1 gene_id:65121|Hs108|chr1 (474 aa) initn: 1907 init1: 1869 opt: 1871 Z-score: 2278.6 bits: 431.0 E(32554): 1.3e-120 Smith-Waterman score: 1871; 61.6% identity (81.0% similar) in 474 aa overlap (1-473:1-473) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MSLQAPRRLLELAGQSLLGDQALAISILDELPRELFPPLFVEAFTSRRCEVLKVMVQAWP ::.::: ::::::::::: ::::.:: ..:::: :. :::.:::. :. ..: ::::::: CCDS14 MSIQAPPRLLELAGQSLLRDQALSISAMEELPRVLYLPLFMEAFSRRHFQTLTVMVQAWP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 FPCLPLGSLMKTPDLEILHYVVDGIDCLLAQKVRPRRRKLQVLELRDVDENFWTIWSGAR : :::::::::: :: :. ...:. ::.:: :::: :::::.:::::::::. : :: CCDS14 FTCLPLGSLMKTLHLETLKALLEGLHMLLTQKDRPRRWKLQVLDLRDVDENFWARWPGAW 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 PLSCSPEAMSKRQTVEDCPRTGEKQPLKVFMDVCLKEKFMDEDLSFFSGWVQHRRGSVHL ::: ::. :::::.::::: ::.::::::.:.:::: .:: : .. :: .::: ::: CCDS14 ALSCFPETTSKRQTAEDCPRMGEHQPLKVFIDICLKEIPQDECLRYLFQWVYQRRGLVHL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 CCTKVVNYSMSILNFRNILETVYPDSIQVLEIWNMCWPCMIVEFIRYLSQMRNLRKLFIS ::.:.::: : .:. :. .: .::: ::: :: :: .: .. ::..:.::::: .: CCDS14 CCSKLVNYLTPIKYLRKSLKIIYLNSIQELEIRNMSWPRLIRKLRCYLKEMKNLRKLVFS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 DGCRYLLSSDSQE-QLVAEFSSVLLRLEYLQMLYVRRVCFFRGHLDQLIRCLRSPLETLA :.. :.. : .:::.::::.::::.::.: .. . :: :::.::::::..:::.: CCDS14 R-CHHYTSDNELEGRLVAKFSSVFLRLEHLQLLKIKLITFFSGHLEQLIRCLQNPLENLE 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 LTYGFLEKVDLKCLPRYPSLSQLKQLNLSHGALRFIRLEPLRALLEKVAATLQTLFLVDC ::::.: . :.::: .::::. ::.::::. : : :::: :::::.::.:.::.: : CCDS14 LTYGYLLEEDMKCLSQYPSLGYLKHLNLSYVLLFRISLEPLGALLEKIAASLKTLILEGC 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 GIRDSKLRVILPALSCCSNLTTFCFHGNDTSMDGLKDLLRHTGRLSNLSLETYPAPRESL :. :.: .:::.:: ::.:::: : : :.:.::::::::. ::.:::::::::.::: CCDS14 QIHYSQLSAILPGLSRCSQLTTFYFGRNCMSIDALKDLLRHTSGLSKLSLETYPAPEESL 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 DDRGRVISELLTPLQAELMRILREVREPKRIFFGPVSCPCCGTSPTEQLEFNFCLWGRPA .. :: :..:::.:::: :::::.:::::.::. :: ::.::.:.::...: CCDS14 NSLVRVNWEIFTPLRAELMCTLREVRQPKRIFIGPTPCPSCGSSPSEELELHLCC 420 430 440 450 460 470 >>CCDS76109.1 PRAMEF14 gene_id:729528|Hs108|chr1 (474 aa) initn: 1858 init1: 1832 opt: 1842 Z-score: 2243.3 bits: 424.5 E(32554): 1.2e-118 Smith-Waterman score: 1842; 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60.8% identity (80.0% similar) in 474 aa overlap (1-473:1-473) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MSLQAPRRLLELAGQSLLGDQALAISILDELPRELFPPLFVEAFTSRRCEVLKVMVQAWP ::.::: ::::::::::: ::::.:: ..:::: :. ::: :::. :. ..: ::::::: CCDS14 MSIQAPPRLLELAGQSLLRDQALSISAMEELPRVLYLPLFREAFSRRHFQTLTVMVQAWP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 FPCLPLGSLMKTPDLEILHYVVDGIDCLLAQKVRPRRRKLQVLELRDVDENFWTIWSGAR : :::: ::::: :: :. ...:. ::.:: :::: :::::.:::::::::. : :: CCDS14 FTCLPLVSLMKTLHLEPLKALLEGLHMLLTQKDRPRRWKLQVLDLRDVDENFWARWPGAW 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 PLSCSPEAMSKRQTVEDCPRTGEKQPLKVFMDVCLKEKFMDEDLSFFSGWVQHRRGSVHL ::: :::::::::.::::::::.::::::.:.:::: .:: : .. :: .::: ::: CCDS14 ALSCFPEAMSKRQTAEDCPRTGEHQPLKVFIDICLKEIPQDECLRYLFQWVYQRRGLVHL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 CCTKVVNYSMSILNFRNILETVYPDSIQVLEIWNMCWPCMIVEFIRYLSQMRNLRKLFIS ::.:.::: : .:. :. .: .:: ::: : ::: .: .. ::..:..: :: .: CCDS14 CCSKLVNYLTPIKYLRKSLKIIYINSIGELEIHNTCWPHLIRKLYCYLKEMKTLCKLVFS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 DGCRYLLSSDSQE-QLVAEFSSVLLRLEYLQMLYVRRVCFFRGHLDQLIRCLRSPLETLA :.. :.. : ::..:.::.::::.::.: .. . :: :::.::::::..:::.: CCDS14 R-CHHYTSDNELEGWLVTRFTSVFLRLEHLQLLKIKLITFFSGHLEQLIRCLQNPLENLE 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 LTYGFLEKVDLKCLPRYPSLSQLKQLNLSHGALRFIRLEPLRALLEKVAATLQTLFLVDC :: : : . ::::: ..:::. ::.::::. : : :::: :::::.::.:.:: : : CCDS14 LTCGNLLEEDLKCLSQFPSLGYLKHLNLSYVLLFRISLEPLGALLEKIAASLETLVLEGC 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 GIRDSKLRVILPALSCCSNLTTFCFHGNDTSMDGLKDLLRHTGRLSNLSLETYPAPRESL :. :.: .:::.:::::.:::: : .: :.:.::::::::. ::.:::::::::.::: CCDS14 QIHYSQLSAILPGLSCCSQLTTFYFGSNCMSIDALKDLLRHTSGLSKLSLETYPAPEESL 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 DDRGRVISELLTPLQAELMRILREVREPKRIFFGPVSCPCCGTSPTEQLEFNFCLWGRPA .. :: :..:::.:::: ::: :.:::::.::. :: ::.::.:.::...: CCDS14 NSLVRVNWEIFTPLRAELMCTLREFRQPKRIFIGPTPCPSCGSSPSEELELHLCC 420 430 440 450 460 470 >>CCDS41254.1 PRAMEF12 gene_id:390999|Hs108|chr1 (483 aa) initn: 1614 init1: 713 opt: 1609 Z-score: 1959.1 bits: 371.9 E(32554): 8.4e-103 Smith-Waterman score: 1609; 54.5% identity (75.3% similar) in 477 aa overlap (1-474:1-473) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MSLQAPRRLLELAGQSLLGDQALAISILDELPRELFPPLFVEAFTSRRCEVLKVMVQAWP :::::: :::::: :::: :.:::: :.:::::::::::.:::: : ::.: .:::::: CCDS41 MSLQAPPRLLELAEQSLLRDRALAIPTLEELPRELFPPLFMEAFTRRCCETLTTMVQAWP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 FPCLPLGSLMKTPDLEILHYVVDGIDCLLAQKVRPRRRKLQVLELRDVDENFWTIWSGAR : :::::::::. .:::.. :..:.: :::::::::: :::::.::.:::::: ::::: CCDS41 FTCLPLGSLMKSCNLEIFRAVLEGLDALLAQKVRPRRWKLQVLDLRNVDENFWGIWSGAS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 PLSCSPEAMSKRQTVEDCPRTGEKQPLKVFMDVCLKEKFMDEDLSFFSGWVQHRRGSVHL :: :::.:::.:. .::: : .::: :..:.:.:. .:: :. : : ..:.: .:. CCDS41 ALS--PEALSKRRTAGNCPRPGGQQPLMVILDLCFKNGTLDECLTHFLEWGKQRKGLLHV 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KB7 CCTKVVNYSMSILNFRNILETVYPDSIQVLEIWNMC-WP-CMIVEFIRYLSQMRNLRKLF :: .. ....: . ..:.:: : :: .:. : : ....: ::.:::::::: CCDS41 CCKELQIFGIAIHRIIEVLNTVELDCIQEVEV--CCPWELSILIRFAPYLGQMRNLRKLV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 ISD-GCRYLLSSDSQEQLVAEFSSVLLRLEYLQMLYVRRVCFFRGHLDQLIRCLRSPLET . . . : .::.: .:.: .:.:.:.: ::.. : :..::::::.:::..:::: CCDS41 LFNIHVSACIPLDRKEQFVIQFTSQFLKLDYFQKLYMHSVSFLEGHLDQLLRCLQAPLET 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 LALTYGFLEKVDLKCLPRYPSLSQLKQLNLSHGALRFIRLEPLRALLEKVAATLQTLFLV ...: .: . ::: : ::. :::.:.: .: . ::: .:::.. :::::: : CCDS41 VVMTECLLSESDLKHLSWCPSIRQLKELDLRGITLTHFSPEPLSVLLEQAEATLQTLDLE 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 DCGIRDSKLRVILPALSCCSNLTTFCFHGNDTSMDGLKDLLRHTGRLSNLSLETYPAPRE :::: ::.: .:::::: ::.:.:: : :: :: .:..::::: ::.:::: :::: : CCDS41 DCGIVDSQLSAILPALSRCSQLSTFSFCGNLISMAALENLLRHTVGLSKLSLELYPAPLE 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 SLDDRGRVISELLTPLQAELMRILREVREPKRIFFGPVSCPCCGTSPTEQLEFNFCLWGR : : .: . .. : ::::. ::..:.:: : :. : :: :: . .:: . :: CCDS41 SYDAQGALCWGRFSQLGAELMKTLRDLRQPKIIVFSTVPCPRCGIRASYDLEPSHCLLNA 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 PA CCDS41 CCQGGFI 480 >>CCDS41265.1 PRAMEF20 gene_id:645425|Hs108|chr1 (475 aa) initn: 1576 init1: 1543 opt: 1558 Z-score: 1897.1 bits: 360.4 E(32554): 2.4e-99 Smith-Waterman score: 1558; 53.0% identity (74.1% similar) in 474 aa overlap (1-473:1-473) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MSLQAPRRLLELAGQSLLGDQALAISILDELPRELFPPLFVEAFTSRRCEVLKVMVQAWP ::...: :::::::.::: :.::::: :.::: :::::::.:::. :.::.::.:::::: CCDS41 MSIRTPPRLLELAGRSLLRDEALAISTLEELPTELFPPLFMEAFSRRHCEALKLMVQAWP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 FPCLPLGSLMKTPDLEILHYVVDGIDCLLAQKVRPRRRKLQVLELRDVDENFWTIWSGAR : :::::::: : : .. :.::.: ::...:: :: :::::.:.::.:::: .:: : CCDS41 FLRLPLGSLMKRPCPETFQAVLDGLDALLTHRVRLRRWKLQVLDLQDVSENFWMVWSEAM 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 PLSCSPEAMSKRQTVEDCPRTGEKQPLKVFMDVCLKEKFMDEDLSFFSGWVQHRRGSVHL : :.:: .:. ..:::: .::: ::.:.:::.. .:: .. . ::..:.: ::: CCDS41 ARRCLPNAMMNRKPLQDCPRMRGQQPLTVFIDLCLKNRTLDEYFTCLFLWVKQREGLVHL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 CCTKVVNYSMSILNFRNILETVYPDSIQVLEIWNMCWPC-MIVEFIRYLSQMRNLRKLFI :: :. .: . :.::::.:: : :: .:. : : ...:: ::.:::::::: . CCDS41 CCKKLKMLGMLFHNIRNILKTVNLDCIQEVEV-NCNWTLPVLAEFTPYLGQMRNLRKLVL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 SDGCRYLLSSDSQEQLVAEFSSVLLRLEYLQMLYVRRVCFFRGHLDQLIRCLRSPLETLA :: .: ......:..:.. .:.:. :: ::. : :..:::::.. ::.. :. :: CCDS41 SDIDSRYISPEQKKEFVTQFTTQFLKLRCLQKLYMNSVSFLEGHLDQMLSCLKTSLNILA 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 LTYGFLEKVDLKCLPRYPSLSQLKQLNLSHGALRFIRLEPLRALLEKVAATLQTLFLVDC .: : . ::: : .:::..::: :.:: : . : ::..:::::::::. : : :: CCDS41 ITNCVLLESDLKHLSKYPSIGQLKTLDLSGTRLANFSLVPLQVLLEKVAATLEYLDLDDC 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 GIRDSKLRVILPALSCCSNLTTFCFHGNDTSMDGLKDLLRHTGRLSNLSLETYPAPRESL :: ::.. .:::::: : .:::: :.:: : :..:: :: ::.:: :: ::::::: CCDS41 GIVDSQVNAILPALSRCFELTTFSFRGNPISTATLENLLCHTIRLNNLCLELYPAPRESY 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 DDRGRVISELLTPLQAELMRILREVREPKRIFFGPVSCPCCGTSPTEQLEFNFCLWGRPA : :: : .. : :::: .: .:::.::.: :: ::. .:: . : CCDS41 DVRGIVCRSRFAQLGAELMGRVRALREPERILFCTDYCPQCGNRSLYDLEVDRCCC 420 430 440 450 460 470 >>CCDS72709.1 PRAMEF8 gene_id:391002|Hs108|chr1 (474 aa) initn: 1512 init1: 675 opt: 1511 Z-score: 1839.8 bits: 349.8 E(32554): 3.7e-96 Smith-Waterman score: 1511; 51.7% identity (74.4% similar) in 480 aa overlap (1-474:1-473) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MSLQAPRRLLELAGQSLLGDQALAISILDELPRELFPPLFVEAFTSRRCEVLKVMVQAWP ::..:: :::::: : :: ::::::: ..:::::::: ::.:::. ::::.::.:::::: CCDS72 MSIRAPPRLLELARQRLLRDQALAISTMEELPRELFPTLFMEAFSRRRCETLKTMVQAWP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 FPCLPLGSLMKTPDLEILHYVVDGIDCLLAQKVRPRRRKLQVLELRDVDENFWTIWSGAR : ::::::::.: :: :. :..:.: ::.:.::::. :::::.::.::::: :.::: CCDS72 FTRLPLGSLMKSPHLESLKSVLEGVDVLLTQEVRPRQSKLQVLDLRNVDENFCDIFSGA- 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 PLSCSPEAMSKRQTVEDCPRTGEKQPLKVFMDVCLKEKFMDEDLSFFSGWVQHRRGSVHL . :::.:..::...:: ::..::. ::.:.:::.. .:: :. . : ..:.: .:. CCDS72 -TASFPEALSQKQTADNCPGTGRQQPFMVFIDLCLKNRTLDECLTHLLEWGKQRKGLLHV 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KB7 CCTKVVNYSMSILNFRNILETVYPDSIQVLEIWNMC-WP-CMIVEFIRYLSQMRNLRKLF :: .. ..: : .. ..:. : : :: .:. : : .:.: ::.:::::::: CCDS72 CCKELQVFGMPIHSIIEVLNMVELDCIQEVEV--CCPWELSTLVKFAPYLGQMRNLRKLV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 I----SDGCRYLLSSDSQEQLVAEFSSVLLRLEYLQMLYVRRVCFFRGHLDQLIRCLRSP . ...: . :.. :..:.:.: .:.:.:.: : .. : :..::::::.:::.. CCDS72 LFNIRASAC---IPPDNKGQFIARFTSQFLKLDYFQNLSMHSVSFLEGHLDQLLRCLQAS 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 LETLALTYGFLEKVDLKCLPRYPSLSQLKQLNLSHGALRFIRLEPLRALLEKVAATLQTL :: ...: .: . ::: : ::. :::.:.: .: . ::: .:::.:.:::::: CCDS72 LEMVVMTDCLLSESDLKHLSWCPSIRQLKELDLRGVTLTHFSPEPLTGLLEQVVATLQTL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 FLVDCGIRDSKLRVILPALSCCSNLTTFCFHGNDTSMDGLKDLLRHTGRLSNLSLETYPA : :::: ::.: .:::.:: ::.:.:: : :: :: .:..::::: ::.:::: ::: CCDS72 DLEDCGIMDSQLSAILPVLSRCSQLSTFSFCGNLISMAALENLLRHTVGLSKLSLELYPA 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 PRESLDDRGRVISELLTPLQAELMRILREVREPKRIFFGPVSCPCCGTSPTEQLEFNFCL : :: : .: . .. : :::: ::..:.:: : : : :: :: . .:: . :: CCDS72 PLESYDTQGALCWGRFAELGAELMNTLRDLRQPKIIVFCTVPCPRCGIRASYDLEPSHCL 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 WGRPA CCDS72 C >>CCDS30593.1 PRAMEF7 gene_id:441871|Hs108|chr1 (474 aa) initn: 1507 init1: 670 opt: 1506 Z-score: 1833.7 bits: 348.7 E(32554): 8.1e-96 Smith-Waterman score: 1506; 51.5% identity (74.4% similar) in 480 aa overlap (1-474:1-473) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MSLQAPRRLLELAGQSLLGDQALAISILDELPRELFPPLFVEAFTSRRCEVLKVMVQAWP ::..:: :::::: : :: ::::::: ..:::::::: ::.:::. ::::.::.:::::: CCDS30 MSIRAPPRLLELARQRLLRDQALAISTMEELPRELFPTLFMEAFSRRRCETLKTMVQAWP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 FPCLPLGSLMKTPDLEILHYVVDGIDCLLAQKVRPRRRKLQVLELRDVDENFWTIWSGAR : ::::::::.: :: :. :..:.: ::.:.::::. :::::.::.::::: :.::: CCDS30 FTRLPLGSLMKSPHLESLKSVLEGVDVLLTQEVRPRQSKLQVLDLRNVDENFCDIFSGA- 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 PLSCSPEAMSKRQTVEDCPRTGEKQPLKVFMDVCLKEKFMDEDLSFFSGWVQHRRGSVHL . :::.:..::...:: ::..::. ::.:.:::.. .:: :. . : ..:.: .:. CCDS30 -TASFPEALSQKQTADNCPGTGRQQPFMVFIDLCLKNRTLDECLTHLLEWGKQRKGLLHV 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KB7 CCTKVVNYSMSILNFRNILETVYPDSIQVLEIWNMC-WP-CMIVEFIRYLSQMRNLRKLF :: .. ..: : .. ..:. : : :: .:. : : .:.: ::.:::::::: CCDS30 CCKELQVFGMPIHSIIEVLNMVELDCIQEVEV--CCPWELSTLVKFAPYLGQMRNLRKLV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 I----SDGCRYLLSSDSQEQLVAEFSSVLLRLEYLQMLYVRRVCFFRGHLDQLIRCLRSP . ...: . :.. :..:.:.: .:.:.:.: : .. : :..::::::.:::.. CCDS30 LFNIRASAC---IPPDNKGQFIARFTSQFLKLDYFQNLSMHSVSFLEGHLDQLLRCLQAS 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 LETLALTYGFLEKVDLKCLPRYPSLSQLKQLNLSHGALRFIRLEPLRALLEKVAATLQTL :: ...: .: . ::: : ::. :::.:.: .: . ::: .:::...:::::: CCDS30 LEMVVMTDCLLSESDLKHLSWCPSIRQLKELDLRGVTLTHFSPEPLTGLLEQAVATLQTL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 FLVDCGIRDSKLRVILPALSCCSNLTTFCFHGNDTSMDGLKDLLRHTGRLSNLSLETYPA : :::: ::.: .:::.:: ::.:.:: : :: :: .:..::::: ::.:::: ::: CCDS30 DLEDCGIMDSQLSAILPVLSRCSQLSTFSFCGNLISMAALENLLRHTVGLSKLSLELYPA 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 PRESLDDRGRVISELLTPLQAELMRILREVREPKRIFFGPVSCPCCGTSPTEQLEFNFCL : :: : .: . .. : :::: ::..:.:: : : : :: :: . .:: . :: CCDS30 PLESYDTQGALCWGRFAELGAELMNTLRDLRQPKIIVFCTVPCPRCGIRASYDLEPSHCL 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 WGRPA CCDS30 C >>CCDS81265.1 PRAMEF25 gene_id:441873|Hs108|chr1 (478 aa) initn: 1418 init1: 795 opt: 1441 Z-score: 1754.4 bits: 334.0 E(32554): 2.1e-91 Smith-Waterman score: 1441; 50.0% identity (72.8% similar) in 478 aa overlap (1-473:3-477) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MSLQAPRRLLELAGQSLLGDQALAISILDELPRELFPPLFVEAFTSRRCEVLKVMVQA ::...: :::::::.:.: :::::.: :.::: :::::::.:::. ::::.::.:::: CCDS81 MKMSIRTPPRLLELAGRSVLRDQALAMSTLEELPTELFPPLFMEAFSRRRCEALKLMVQA 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 WPFPCLPLGSLMKTPDLEILHYVVDGIDCLLAQKVRPRRRKLQVLELRDVDENFWTIWSG ::: ::: :.: : :: .. :..:.: ::.. ::::: :::::.:.:: :::: .:: CCDS81 WPFRRLPLRPLIKMPCLETFQAVLNGLDALLTHGVRPRRWKLQVLDLQDVCENFWMVWSE 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 ARPLSCSPEAMSKRQTVEDCPRTGEKQPLKVFMDVCLKEKFMDEDLSFFSGWVQHRRGSV : .: .: ... :.:::: .::: ::... ::.. .:: :. . ::..:. . CCDS81 AMARGCFLNAKRNKKPVQDCPRMRGRQPLTVFVELWLKNRTLDEHLTCLLLWVKQRKDLL 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 HLCCTKVVNYSMSILNFRNILETVYPDSIQVLEIWNMCW--PCMIVEFIRYLSQMRNLRK :::: :. .: . :.:.::. : : :: .:. : : : ....: ::..::::.: CCDS81 HLCCKKLKILGMPFRNIRSILKMVNLDCIQEVEV-NCKWVLP-ILTQFTPYLGHMRNLQK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 LFIS--DGCRYLLSSDSQEQLVAEFSSVLLRLEYLQMLYVRRVCFFRGHLDQLIRCLRSP : .: : ::. : ......:..:.. .:.:. :: ::. : :..::::::. ::.. CCDS81 LVLSHMDVSRYV-SPEQKKEIVTQFTTQFLKLHCLQKLYMNSVSFLEGHLDQLLSCLKTS 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 LETLALTYGFLEKVDLKCLPRYPSLSQLKQLNLSHGALRFIRLEPLRALLEKVAATLQTL :..:..: : . ::: : . ::.:::: :.:: : : ::. :::::::::. : CCDS81 LKVLTITNCVLLESDLKHLSQCPSISQLKTLDLSGIRLTNYSLVPLQILLEKVAATLEYL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 FLVDCGIRDSKLRVILPALSCCSNLTTFCFHGNDTSMDGLKDLLRHTGRLSNLSLETYPA : :::: ::.. .:::::: : .:.:: : :: :: :..:: :: :.:: :: ::: CCDS81 DLDDCGIIDSQVNAILPALSRCFELNTFSFCGNPISMATLENLLSHTIILKNLCLELYPA 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 PRESLDDRGRVISELLTPLQAELMRILREVREPKRIFFGPVSCPCCGTSPTEQLEFN-FC :::: : . .: ..::::. .:..:.::::.:: :: ::. .:: . .: CCDS81 PRESYGADGTLCWSRFTQIRAELMKRVRDLRHPKRILFGTDYCPDCGNRSFYDLEADQYC 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 LWGRPA CCDS81 C 479 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 07:40:40 2016 done: Fri Nov 4 07:40:40 2016 Total Scan time: 3.050 Total Display time: 0.110 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]