Result of FASTA (omim) for
pF1KB7425
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7425, 479 aa
1>>>pF1KB7425 479 - 479 aa - 479 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2164+/-0.000362; mu= 18.5172+/- 0.023
mean_var=70.6992+/-14.133, 0's: 0 Z-trim(114.2): 21 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.152534
statistics sampled from 23860 (23879) to 23860 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.28), width: 16
Scan time: 8.130
The best scores are: opt bits E(85289)
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NP_001278646 (OMIM: 606021) melanoma antigen prefe ( 493) 753 175.0 4.1e-43
NP_001305055 (OMIM: 606021) melanoma antigen prefe ( 493) 753 175.0 4.1e-43
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NP_006106 (OMIM: 606021) melanoma antigen preferen ( 509) 753 175.0 4.2e-43
NP_996838 (OMIM: 606021) melanoma antigen preferen ( 509) 753 175.0 4.2e-43
NP_996836 (OMIM: 606021) melanoma antigen preferen ( 509) 753 175.0 4.2e-43
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>>NP_001278648 (OMIM: 606021) melanoma antigen preferent (493 aa)
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479 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 07:40:41 2016 done: Fri Nov 4 07:40:42 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]