Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7426
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7426, 412 aa
1>>>pF1KB7426 412 - 412 aa - 412 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9864+/-0.000712; mu= 11.8147+/- 0.044
mean_var=161.1167+/-42.803, 0's: 0 Z-trim(114.7): 226 B-trim: 1759 in 2/50
Lambda= 0.101042
statistics sampled from 14884 (15266) to 14884 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.769), E-opt: 0.2 (0.469), width: 16
Scan time: 3.570
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9414.1 MLNR gene_id:2862|Hs108|chr13 ( 412) 2788 417.9 9e-117
CCDS46959.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3 ( 289) 645 105.3 7.7e-23
CCDS3218.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3 ( 366) 645 105.4 9.1e-23
CCDS1681.1 NTSR2 gene_id:23620|Hs108|chr2 ( 410) 507 85.3 1.1e-16
CCDS4321.1 NMUR2 gene_id:56923|Hs108|chr5 ( 415) 426 73.5 4e-13
CCDS13502.1 NTSR1 gene_id:4923|Hs108|chr20 ( 418) 419 72.5 8.2e-13
CCDS2486.1 NMUR1 gene_id:10316|Hs108|chr2 ( 426) 407 70.8 2.8e-12
>>CCDS9414.1 MLNR gene_id:2862|Hs108|chr13 (412 aa)
initn: 2788 init1: 2788 opt: 2788 Z-score: 2209.9 bits: 417.9 E(32554): 9e-117
Smith-Waterman score: 2788; 100.0% identity (100.0% similar) in 412 aa overlap (1-412:1-412)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGSPWNGSDGPEGAREPPWPALPPCDERRCSPFPLGALVPVTAVCLCLFVVGVSGNVVTV
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CCDS94 MGSPWNGSDGPEGAREPPWPALPPCDERRCSPFPLGALVPVTAVCLCLFVVGVSGNVVTV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MLIGRYRDMRTTTNLYLGSMAVSDLLILLGLPFDLYRLWRSRPWVFGPLLCRLSLYVGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 MLIGRYRDMRTTTNLYLGSMAVSDLLILLGLPFDLYRLWRSRPWVFGPLLCRLSLYVGEG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 CTYATLLHMTALSVERYLAICRPLRARVLVTRRRVRALIAVLWAVALLSAGPFLFLVGVE
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CCDS94 CTYATLLHMTALSVERYLAICRPLRARVLVTRRRVRALIAVLWAVALLSAGPFLFLVGVE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QDPGISVVPGLNGTARIASSPLASSPPLWLSRAPPPSPPSGPETAEAAALFSRECRPSPA
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CCDS94 QDPGISVVPGLNGTARIASSPLASSPPLWLSRAPPPSPPSGPETAEAAALFSRECRPSPA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 QLGALRVMLWVTTAYFFLPFLCLSILYGLIGRELWSSRRPLRGPAASGRERGHRQTVRVL
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CCDS94 QLGALRVMLWVTTAYFFLPFLCLSILYGLIGRELWSSRRPLRGPAASGRERGHRQTVRVL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LVVVLAFIICWLPFHVGRIIYINTEDSRMMYFSQYFNIVALQLFYLSASINPILYNLISK
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CCDS94 LVVVLAFIICWLPFHVGRIIYINTEDSRMMYFSQYFNIVALQLFYLSASINPILYNLISK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB7 KYRAAAFKLLLARKSRPRGFHRSRDTAGEVAGDTGGDTVGYTETSANVKTMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 KYRAAAFKLLLARKSRPRGFHRSRDTAGEVAGDTGGDTVGYTETSANVKTMG
370 380 390 400 410
>>CCDS46959.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3 (289 aa)
initn: 854 init1: 637 opt: 645 Z-score: 523.6 bits: 105.3 E(32554): 7.7e-23
Smith-Waterman score: 794; 45.1% identity (67.0% similar) in 306 aa overlap (5-300:2-265)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGSPWNGSDGPEGA-----REPPWPALPPCD---ERRCSPFPLGALVPVTAVCLCLFVVG
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CCDS46 MWNATPSEEPGFNLTLADLDWDASPGNDSLGDELLQLFPAPLLAGVTATCVALFVVG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 VSGNVVTVMLIGRYRDMRTTTNLYLGSMAVSDLLILLGLPFDLYRLWRSRPWVFGPLLCR
..::..:.....:.:..::::::::.::: :::::.: .:.:: :::. ::: :: :::.
CCDS46 IAGNLLTMLVVSRFRELRTTTNLYLSSMAFSDLLIFLCMPLDLVRLWQYRPWNFGDLLCK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LSLYVGEGCTYATLLHMTALSVERYLAICRPLRARVLVTRRRVRALIAVLWAVALLSAGP
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CCDS46 LFQFVSESCTYATVLTITALSVERYFAICFPLRAKVVVTKGRVKLVIFVIWAVAFCSAGP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 FLFLVGVEQDPGISVVPGLNGTARIASSPLASSPPLWLSRAPPPSPPSGPETAEAAALFS
.. :::::.. ::: .: : .
CCDS46 IFVLVGVEHE---------NGT-----DP-------WDTN--------------------
180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 RECRPSP--AQLGALRVMLWVTTAYFFLPFLCLSILYGLIGRELWSSRRPLRGPAASGRE
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CCDS46 -ECRPTEFAVRSGLLTVMVWVSSIFFFLPVFCLTVLYSLIGRKLWRRRRGDAVVGASLRD
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 RGHRQTVRVLLVVVLAFIICWLPFHVGRIIYINTEDSRMMYFSQYFNIVALQLFYLSASI
..:.:::..:
CCDS46 QNHKQTVKMLGGSQRALRLSLAGPILSLCLLPSL
260 270 280
>>CCDS3218.1 GHSR gene_id:2693|Hs108|chr3 (366 aa)
initn: 1137 init1: 637 opt: 645 Z-score: 522.3 bits: 105.4 E(32554): 9.1e-23
Smith-Waterman score: 1073; 45.0% identity (68.8% similar) in 407 aa overlap (5-398:2-366)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGSPWNGSDGPEGA-----REPPWPALPPCD---ERRCSPFPLGALVPVTAVCLCLFVVG
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CCDS32 MWNATPSEEPGFNLTLADLDWDASPGNDSLGDELLQLFPAPLLAGVTATCVALFVVG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 VSGNVVTVMLIGRYRDMRTTTNLYLGSMAVSDLLILLGLPFDLYRLWRSRPWVFGPLLCR
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CCDS32 IAGNLLTMLVVSRFRELRTTTNLYLSSMAFSDLLIFLCMPLDLVRLWQYRPWNFGDLLCK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LSLYVGEGCTYATLLHMTALSVERYLAICRPLRARVLVTRRRVRALIAVLWAVALLSAGP
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CCDS32 LFQFVSESCTYATVLTITALSVERYFAICFPLRAKVVVTKGRVKLVIFVIWAVAFCSAGP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 FLFLVGVEQDPGISVVPGLNGTARIASSPLASSPPLWLSRAPPPSPPSGPETAEAAALFS
.. :::::.. ::: .: : .
CCDS32 IFVLVGVEHE---------NGT-----DP-------WDTN--------------------
180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 RECRPSP--AQLGALRVMLWVTTAYFFLPFLCLSILYGLIGRELWSSRRPLRGPAASGRE
::::. .. : : ::.::.. .:::: .::..::.::::.:: :: .:: :.
CCDS32 -ECRPTEFAVRSGLLTVMVWVSSIFFFLPVFCLTVLYSLIGRKLWRRRRGDAVVGASLRD
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340
pF1KB7 RGHRQTVRVLLVVVLAFIICWLPFHVGRIIYINTEDS---RMMYFSQYFNIVALQLFYLS
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CCDS32 QNHKQTVKMLAVVVFAFILCWLPFHVGRYLFSKSFEPGSLEIAQISQYCNLVSFVLFYLS
260 270 280 290 300 310
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 ASINPILYNLISKKYRAAAFKLLLARKSRPRGFHRSRDTAGEVAGDTGGDTVGYTETSAN
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CCDS32 AAINPILYNIMSKKYRVAVFRLLGFEPFSQRKLSTLKDESSRAWTESSINT
320 330 340 350 360
410
pF1KB7 VKTMG
>>CCDS1681.1 NTSR2 gene_id:23620|Hs108|chr2 (410 aa)
initn: 477 init1: 260 opt: 507 Z-score: 412.9 bits: 85.3 E(32554): 1.1e-16
Smith-Waterman score: 511; 31.5% identity (57.6% similar) in 387 aa overlap (17-381:8-380)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGSPWNGSDGPEGAREPPWPALPP---CDERRCSPFPLGALVPVTAVCLCLFVVGVSGNV
:: :. : : : : : : ::. ....:..::.
CCDS16 METSSPRPPRPSSNPGLSLDARLGVDTRLWAKVLFTALYALIWALGAAGNA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 VTVMLIGRYRDMRT-TTNLYLGSMAVSDLLILL-GLPFDLYRL-WRSRPWVFGPLLCRLS
... .. . : :. .. :.:.. ::.:: :.: .:: . : ::::: : ::
CCDS16 LSAHVVLKARAGRAGRLRHHVLSLALAGLLLLLVGVPVELYSFVWFHYPWVFGDLGCRGY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LYVGEGCTYATLLHMTALSVERYLAICRPLRARVLVTRRRVRALIAVLWAVALLSAGPFL
.: : :.:::.: ...::.:: ::.:.::::: :.: ::.: :.:. ::..: : :.
CCDS16 YFVHELCAYATVLSVAGLSAERCLAVCQPLRARSLLTPRRTRWLVALSWAASLGLALPMA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB7 FLVGVEQDPGISVVPGLNGTARIASSPLASSPPLWL--------SRAPPPSPPS---GPE
..: : . .. : : . . :.: : . : . : . . :
CCDS16 VIMG--QKHELETADGEPEPASRVCTVLVSRTALQVFIQVNVLVSFVLPLALTAFLNGVT
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 TAEAAALFSRECRPSPAQLGALR-VMLWVTTAYFFLPFLCLSILYGLIGRELWSSRRPLR
... :: :. :: . :. : . . .: :. . . :. .. .:
CCDS16 VSHLLALCSQV--PSTSTPGSSTPSRLELLSEEGLLSFIVWKKTFIQGGQVSLVRHKDVR
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KB7 GPAASGRERGHRQTVRVLLVVVLAFIICWLPFHVGRIIYINTEDSR----MMYFSQYFNI
: :. ...:.:: ..:. ..:::::.:. :..: . :. .. : .:: .
CCDS16 ------RIRSLQRSVQVLRAIVVMYVICWLPYHARRLMYCYVPDDAWTDPLYNFYHYFYM
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 VALQLFYLSASINPILYNLISKKYRAAAFKLLLARKSRPRGFHRSRDTAGEVAGDTGGDT
:. :::.:....:.::: .:...: ::.: : : :
CCDS16 VTNTLFYVSSAVTPLLYNAVSSSFR----KLFLEAVSSLCGEHHPMKRLPPKPQSPTLMD
350 360 370 380 390
400 410
pF1KB7 VGYTETSANVKTMG
CCDS16 TASGFGDPPETRT
400 410
>>CCDS4321.1 NMUR2 gene_id:56923|Hs108|chr5 (415 aa)
initn: 435 init1: 266 opt: 426 Z-score: 349.0 bits: 73.5 E(32554): 4e-13
Smith-Waterman score: 590; 31.1% identity (62.8% similar) in 363 aa overlap (30-385:37-354)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGSPWNGSDGPEGAREPPWPALPPCDERRCSPFPLGALVPVTAVCLCLFVVGVSGNVVT
:.: ..::..: . .::::: :::..
CCDS43 LQNASWIYQQKLEDPFQKHLNSTEEYLAFLCGPRRSHFFLPVSVVYVPIFVVGVIGNVLV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 VMLIGRYRDMRTTTNLYLGSMAVSDLLILL-GLPFDLYRLWRSRPWVFGPLLCRLSLYVG
..: ... :.: :: :: :.::::::.:: :.:...:..::. :..:::. : .. .
CCDS43 CLVILQHQAMKTPTNYYLFSLAVSDLLVLLLGMPLEVYEMWRNYPFLFGPVGCYFKTALF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 EGCTYATLLHMTALSVERYLAICRPLRARVLVTRRRVRALIAVLWAVALLSAGPFLFLVG
: .:..: .:..:::::.:: .:.::.. ::::. .....:. ..: . : . :
CCDS43 ETVCFASILSITTVSVERYVAILHPFRAKLQSTRRRALRILGIVWGFSVLFSLPNTSIHG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VEQD--PGISVVPGLNGTARIASSPLASSPPLWLSRAPPPSPPSGPETAEAAALFSRECR
.. :. :.::: ..: . . :.:.
CCDS43 IKFHYFPNGSLVPG-SATCTVIK-------PMWI--------------------------
190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 PSPAQLGALRVMLWVTTAYFFL-PFLCLSILYGLIGRELWSSRRPLRGPAASGRERGHRQ
.. ::. :.: :. .:.:: :.. .: ... . .. .: :.
CCDS43 --------YNFIIQVTSFLFYLLPMTVISVLYYLMALRLKKDKSLEADEGNANIQRPCRK
220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 TV-RVLLVVVLAFIICWLPFHVGRIIYINTED--SRMMYFSQYFNIVALQLFYLSASINP
.: ..:.:.::.: ::: :::. :... .:. . . ..:. .::::...::
CCDS43 SVNKMLFVLVLVFAICWAPFHIDRLFFSFVEEWSESLAAVFNLVHVVSGVFFYLSSAVNP
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 ILYNLISKKYRAAAFKLLLARKSRPRGFHRSRDTAGEVAGDTGGDTVGYTETSANVKTMG
:.:::.:....:: :. ... : . .: ..:
CCDS43 IIYNLLSRRFQAA-FQNVIS--SFHKQWHSQHDPQLPPAQRNIFLTECHFVELTEDIGPQ
330 340 350 360 370 380
CCDS43 FPCQSSMHNSHLPAALSSEQMSRTNYQSFHFNKT
390 400 410
>>CCDS13502.1 NTSR1 gene_id:4923|Hs108|chr20 (418 aa)
initn: 576 init1: 257 opt: 419 Z-score: 343.5 bits: 72.5 E(32554): 8.2e-13
Smith-Waterman score: 598; 34.7% identity (62.6% similar) in 380 aa overlap (39-386:64-401)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 DGPEGAREPPWPALPPCDERRCSPFPLGALVPVTAVCLCLFVVGVSGNVVTVMLIGRYRD
: :::: : :::::. ::.::.. ..: ..
CCDS13 GFGNASGNASERVLAAPSSELDVNTDIYSKVLVTAVYLALFVVGTVGNTVTAFTLARKKS
40 50 60 70 80 90
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MRT---TTNLYLGSMAVSDLL-ILLGLPFDLYR-LWRSRPWVFGPLLCRLSLYVGEGCTY
... :.. .:::.:.:::: .::..: .:: .: .::.:: :: .. ..:::
CCDS13 LQSLQSTVHYHLGSLALSDLLTLLLAMPVELYNFIWVHHPWAFGDAGCRGYYFLRDACTY
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 ATLLHMTALSVERYLAICRPLRARVLVTRRRVRALIAVLWAVALLSAGPFLFLVGVEQDP
:: :....::::::::::.:..:..:..: :.. .:...: .. : : :.:: .: ::.
CCDS13 ATALNVASLSVERYLAICHPFKAKTLMSRSRTKKFISAIWLASALLAVPMLFTMG-EQN-
160 170 180 190 200 210
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 GISVVPGLNGTARIASSPLASSPPLWLSRAPPPSPPSGPETAEAAALFSRECRPSPAQLG
: :.. .:..: : :. . .
CCDS13 ------------RSADGQ------------------------HAGGLV---CTPT-IHTA
220 230
250 260 270 280
pF1KB7 ALRVMLWVTTAY-FFLPFLCLSILYGLIGRELWSSRRPL--RGPAAS-------------
...:.. :.: . :..:.. .:.: .:. .: : .: . .
CCDS13 TVKVVIQVNTFMSFIFPMVVISVLNTIIANKLTVMVRQAAEQGQVCTVGGEHSTFSMAIE
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 -GRERGHRQTVRVLLVVVLAFIICWLPFHVGRII--YINTED-SRMMY-FSQYFNIVALQ
:: .. :. :::: .::.::..::::.:: :.. ::. :. . ..: : .:: .:.
CCDS13 PGRVQALRHGVRVLRAVVIAFVVCWLPYHVRRLMFCYISDEQWTPFLYDFYHYFYMVTNA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KB7 LFYLSASINPILYNLISKKYRAAAFKLL-----LARKSRPR-GFHRSRDTAGEVAGDTGG
:::.:..::::::::.: ..: . : . :. : : .: :. :.
CCDS13 LFYVSSTINPILYNLVSANFRHIFLATLACLCPVWRRRRKRPAFSRKADSVSSNHTLSSN
360 370 380 390 400 410
400 410
pF1KB7 DTVGYTETSANVKTMG
CCDS13 ATRETLY
>>CCDS2486.1 NMUR1 gene_id:10316|Hs108|chr2 (426 aa)
initn: 496 init1: 263 opt: 407 Z-score: 333.9 bits: 70.8 E(32554): 2.8e-12
Smith-Waterman score: 592; 34.3% identity (60.8% similar) in 385 aa overlap (38-395:60-402)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 SDGPEGAREPPWPALPPCDERRCSPFPLGALVPVTAVCLCLFVVGVSGNVVTVMLIGRYR
..:. :. : .::::. :: .: ..: :..
CCDS24 AARGHFDPEDLNLTDEALRLKYLGPQQTELFMPICATYLLIFVVGAVGNGLTCLVILRHK
30 40 50 60 70 80
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 DMRTTTNLYLGSMAVSDLLILL-GLPFDLYRLWRSRPWVFGPLLCRLSLYVGEGCTYATL
::: :: :: :.::::::.:: :::..::..:.. :...: : . . : :..
CCDS24 AMRTPTNYYLFSLAVSDLLVLLVGLPLELYEMWHNYPFLLGVGGCYFRTLLFEMVCLASV
90 100 110 120 130 140
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LHMTALSVERYLAICRPLRARVLVTRRRVRALIAVLWAVALLSAGPFLFLVGVEQDPGIS
:..::::::::.:. .::.:: .::: .:: .....:..:.: . : : :..: .
CCDS24 LNVTALSVERYVAVVHPLQARSMVTRAHVRRVLGAVWGLAMLCSLPNTSLHGIRQ---LH
150 160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VVPGLNGTARIASSPLASSPPLWLSRAPPPSPPSGPETAEAAALFSRECRPSPAQLGALR
: : :: :. .. :: ::
CCDS24 V------------------------------PCRGPVPDSAVCML---VRPR-----ALY
210 220
250 260 270 280
pF1KB7 VMLWVTTA--YFFLPFLCLSILYGLIGRELWSSRRPL------RGPAAS---------GR
:. ::: .: ::. .:.:: ::: .: : : :: ::. .
CCDS24 NMVVQTTALLFFCLPMAIMSVLYLLIGLRLRRERLLLMQEAKGRGSAAARSRYTCRLQQH
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 ERGHRQTVRVLLVVVLAFIICWLPFHVGRIIY-INTEDSRMMYFS-QYFNIVALQLFYLS
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