Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7433
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7433, 319 aa
1>>>pF1KB7433 319 - 319 aa - 319 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8906+/-0.00143; mu= 12.6874+/- 0.084
mean_var=210.7829+/-78.887, 0's: 0 Z-trim(99.6): 375 B-trim: 333 in 1/47
Lambda= 0.088340
statistics sampled from 5352 (5787) to 5352 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.503), E-opt: 0.2 (0.178), width: 16
Scan time: 2.110
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 1939 261.1 8e-70
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 1204 167.5 1.3e-41
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 1192 165.9 3.7e-41
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 1192 165.9 3.7e-41
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 1180 164.4 1.1e-40
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 1177 164.0 1.4e-40
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 1146 160.0 2.1e-39
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 1135 158.6 5.6e-39
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 1130 158.0 8.8e-39
CCDS73407.1 OR8G1 gene_id:26494|Hs108|chr11 ( 311) 1122 157.0 1.8e-38
CCDS53629.1 OR5M11 gene_id:219487|Hs108|chr11 ( 305) 1117 156.3 2.7e-38
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 1115 156.1 3.3e-38
CCDS31550.1 OR5B2 gene_id:390190|Hs108|chr11 ( 309) 1111 155.6 4.7e-38
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 1110 155.5 5.2e-38
CCDS66256.1 OR8G5 gene_id:219865|Hs108|chr11 ( 346) 1109 155.4 5.9e-38
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 1107 155.1 6.7e-38
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 1104 154.7 8.7e-38
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 1104 154.7 8.8e-38
CCDS31525.1 OR5T1 gene_id:390155|Hs108|chr11 ( 326) 1101 154.3 1.2e-37
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 1095 153.6 2e-37
CCDS31698.1 OR8D4 gene_id:338662|Hs108|chr11 ( 314) 1091 153.0 2.8e-37
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 1091 153.1 2.8e-37
CCDS31517.1 OR8I2 gene_id:120586|Hs108|chr11 ( 310) 1088 152.7 3.6e-37
CCDS31533.1 OR5M8 gene_id:219484|Hs108|chr11 ( 311) 1084 152.1 5.1e-37
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 1084 152.2 5.1e-37
CCDS31708.1 OR8B2 gene_id:26595|Hs108|chr11 ( 313) 1080 151.6 7.3e-37
CCDS31522.1 OR5J2 gene_id:282775|Hs108|chr11 ( 312) 1079 151.5 7.9e-37
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 1072 150.6 1.5e-36
CCDS31524.1 OR5T3 gene_id:390154|Hs108|chr11 ( 340) 1071 150.6 1.7e-36
CCDS31526.1 OR8H1 gene_id:219469|Hs108|chr11 ( 311) 1067 150.0 2.3e-36
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 1066 149.9 2.5e-36
CCDS31711.1 OR8B12 gene_id:219858|Hs108|chr11 ( 310) 1062 149.3 3.6e-36
CCDS33801.1 OR5H2 gene_id:79310|Hs108|chr3 ( 314) 1062 149.4 3.6e-36
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 1061 149.2 3.9e-36
CCDS31511.1 OR5L2 gene_id:26338|Hs108|chr11 ( 311) 1059 149.0 4.6e-36
CCDS31510.1 OR5D18 gene_id:219438|Hs108|chr11 ( 313) 1056 148.6 6.1e-36
CCDS31513.1 OR5W2 gene_id:390148|Hs108|chr11 ( 310) 1054 148.3 7.2e-36
CCDS31523.1 OR5T2 gene_id:219464|Hs108|chr11 ( 359) 1053 148.3 8.5e-36
CCDS31532.1 OR5M3 gene_id:219482|Hs108|chr11 ( 307) 1050 147.8 1e-35
CCDS31542.1 OR9I1 gene_id:219954|Hs108|chr11 ( 314) 1050 147.8 1e-35
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 1047 147.5 1.4e-35
CCDS31531.1 OR5M9 gene_id:390162|Hs108|chr11 ( 310) 1043 146.9 1.9e-35
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 1041 146.7 2.3e-35
CCDS31518.1 OR8H2 gene_id:390151|Hs108|chr11 ( 312) 1040 146.5 2.5e-35
CCDS32042.1 OR5AU1 gene_id:390445|Hs108|chr14 ( 362) 1040 146.6 2.7e-35
CCDS31710.1 OR8B4 gene_id:283162|Hs108|chr11 ( 309) 1038 146.3 3e-35
CCDS31512.1 OR5D16 gene_id:390144|Hs108|chr11 ( 328) 1025 144.7 9.6e-35
CCDS31548.1 OR5B17 gene_id:219965|Hs108|chr11 ( 314) 1019 143.9 1.6e-34
CCDS35127.2 OR1L1 gene_id:26737|Hs108|chr9 ( 310) 1017 143.6 1.9e-34
CCDS33797.1 OR5H1 gene_id:26341|Hs108|chr3 ( 313) 1009 142.6 3.9e-34
>>CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 (309 aa)
initn: 1971 init1: 1939 opt: 1939 Z-score: 1367.0 bits: 261.1 E(32554): 8e-70
Smith-Waterman score: 1939; 94.8% identity (98.7% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTSLNTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTSLNTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMVSESLLLASMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS41 FFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMISESLLLASMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAVPYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHSNIVNHFYCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAVPYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHSNIVNHFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 DMPLLRLTCSDTRFKQLWILACAGITFICSVLIVFVSYMFIIFAILRMSSAEGRRKAFST
:::::::::::::::::::.::::: :: :.::::::::::: ::::: :::::.:::::
CCDS41 DMPLLRLTCSDTRFKQLWIFACAGIMFISSLLIVFVSYMFIISAILRMHSAEGRQKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CSSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHSLDADKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLRNKDVKDA
:.::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::::::::::::.::.::.:
CCDS41 CGSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHALDTDKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLQNKEVKEA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LKKVIINRNHAFIFLKLRK
:::.:::.:
CCDS41 LKKIIINKN
>>CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 (316 aa)
initn: 1204 init1: 1024 opt: 1204 Z-score: 860.7 bits: 167.5 E(32554): 1.3e-41
Smith-Waterman score: 1204; 57.8% identity (82.7% similar) in 313 aa overlap (1-312:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTSLNTPMY
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CCDS31 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYGLTMAGNLGIITLTSVDSRLQTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMVSESLLLASMAY
:::..::.... :.::.:::: ::: :... :: :::::: :: :.::: ..:: :::
CCDS31 FFLQHLALINLGNSTVIAPKMLINFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVIMLALMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 DRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAVPYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHSNIVNHFYCD
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CCDS31 DRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSSYVFSVSYCSSNIINHFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 DMPLLRLTCSDTRFKQLWILACAGITFICSVLIVFVSYMFIIFAILRMSSAEGRRKAFST
..::: :.:::: . . .. :. . . :..::.:::. :...::.. :.:::.:::::
CCDS31 NVPLLALSCSDTYLPETVVFISAATNVVGSLIIVLVSYFNIVLSILKICSSEGRKKAFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB7 CSSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHSLDAD-KMASVFYTVIIPMLNPLIYSLRNKDVKD
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CCDS31 CASHMMAVTIFYGTLLFMYVQPRSNHSLDTDDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNKDVKT
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 ALKKVIINRNHAFIFLKLRK
::.. . : ..:
CCDS31 ALQRFMTNLCYSFKTM
310
>>CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 (315 aa)
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Smith-Waterman score: 1192; 57.1% identity (82.1% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTSLNTPMY
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CCDS31 MAPENFTRVTEFILTGVSSCPELQIPLFLVFLVLYVLTMAGNLGIITLTSVDSRLQNPMY
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pF1KB7 FFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMVSESLLLASMAY
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CCDS31 FFLRHLAIINLGNSTVIAPKMLMNFLVKKKTTSFYECATQLGGFLFFIVSEVMMLAVMAY
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pF1KB7 DRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAVPYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHSNIVNHFYCD
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CCDS31 DRYVAICNPLLYMVVVSRRLCLLLVSLTYLYGFSTAIVVSPCIFSVSYCSSNIINHFYCD
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pF1KB7 DMPLLRLTCSDTRFKQLWILACAGITFICSVLIVFVSYMFIIFAILRMSSAEGRRKAFST
::: :.:::: . . .. :. ... :.. :.:::. :...:::. : :::.:::::
CCDS31 IAPLLALSCSDTYIPETIVFISAATNLVFSMITVLVSYFNIVLSILRIRSPEGRKKAFST
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pF1KB7 CSSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHSLDADKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLRNKDVKDA
:.:::.:::.::::..::::::...::::.:::::::::..:::::::::::::.::. :
CCDS31 CASHMIAVTVFYGTMLFMYLQPQTNHSLDTDKMASVFYTLVIPMLNPLIYSLRNNDVNVA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LKKVIINRNHAFIFLKLRK
::: . : ..:
CCDS31 LKKFMENPCYSFKSM
310
>>CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 (319 aa)
initn: 1192 init1: 1192 opt: 1192 Z-score: 852.4 bits: 165.9 E(32554): 3.7e-41
Smith-Waterman score: 1192; 58.2% identity (82.4% similar) in 306 aa overlap (3-308:9-314)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTS
: :..:::::.:.::. :. ::: ::: ::: ::.::::...: :..
CCDS31 MNHVVKHNHTAVTKVTEFILMGITDNPGLQAPLFGLFLIIYLVTVIGNLGMVILTYLDSK
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pF1KB7 LNTPMYFFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMVSESLL
:.::::::: .:...:. ::.::.:::: ::. ..:.::.. ::::. : :..:: ..
CCDS31 LHTPMYFFLRHLSITDLGYSTVIAPKMLVNFIVHKNTISYNWYATQLAFFEIFIISELFI
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pF1KB7 LASMAYDRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAVPYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHSNIV
:..::::::::::.::::...:. . :: ::: :: ...:: :: :.::.: :::.
CCDS31 LSAMAYDRYVAICKPLLYVIIMAEKVLWVLVIVPYLYSTFVSLFLTIKLFKLSFCGSNII
130 140 150 160 170 180
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pF1KB7 NHFYCDDMPLLRLTCSDTRFKQLWILACAGITFICSVLIVFVSYMFIIFAILRMSSAEGR
..:::: .::. . :::: .: :: .: ... :. ::..:::::. :::::.: .::
CCDS31 SYFYCDCIPLMSILCSDTNELELIILIFSGCNLLFSLSIVLISYMFILVAILRMNSRKGR
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240 250 260 270 280 290
pF1KB7 RKAFSTCSSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHSLDADKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLRN
:::::::::. .: .:::::.:.::::.:::.: :::::::::..:::::::::::::
CCDS31 YKAFSTCSSHLTVVIMFYGTLLFIYLQPKSSHTLAIDKMASVFYTLLIPMLNPLIYSLRN
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 KDVKDALKKVIINRNHAFIFLKLRK
:.::::::... ::
CCDS31 KEVKDALKRTLTNRFKIPI
310
>>CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 (308 aa)
initn: 1183 init1: 1152 opt: 1180 Z-score: 844.2 bits: 164.4 E(32554): 1.1e-40
Smith-Waterman score: 1180; 56.2% identity (84.4% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTSLNTPMY
:. : ..:..:.: :::.. ::..:::.:::.::. :::::::.:::: .. :.::::
CCDS31 MTMENYSMAAQFVLDGLTQQAELQLPLFLLFLGIYVVTVVGNLGMILLIAVSPLLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FFLSNLAFVDFCYSSVITPKMLGNFLYKQNVISFDACATQLGCFLTFMVSESLLLASMAY
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CCDS31 YFLSSLSFVDFCYSSVITPKMLVNFLGKKNTILYSECMVQLFFFVVFVVAEGYLLTAMAY
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 DRYVAICNPLLYMVVMTPGICIQLVAVPYSYSFLMALFHTILTFRLSYCHSNIVNHFYCD
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CCDS31 DRYVAICSPLLYNAIMSSWVCSLLVLAAFFLGFLSALTHTSAMMKLSFCKSHIINHYFCD
130 140 150 160 170 180
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pF1KB7 DMPLLRLTCSDTRFKQLWILACAGITFICSVLIVFVSYMFIIFAILRMSSAEGRRKAFST
.::: :.::.:....: .. ::.. . .: : ::: ::...::.. :.::: :::.:
CCDS31 VLPLLNLSCSNTHLNELLLFIIAGFNTLVPTLAVAVSYAFILYSILHIRSSEGRSKAFGT
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pF1KB7 CSSHMLAVTIFYGTLIFMYLQPSSSHSLDADKMASVFYTVIIPMLNPLIYSLRNKDVKDA
::::..::.::.:.. :::..: ::.::: .:..:::::..::::::::::::::::: :
CCDS31 CSSHLMAVVIFFGSITFMYFKPPSSNSLDQEKVSSVFYTTVIPMLNPLIYSLRNKDVKKA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LKKVIINRNHAFIFLKLRK
:.::....
CCDS31 LRKVLVGK
>>CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1193 init1: 1164 opt: 1177 Z-score: 842.1 bits: 164.0 E(32554): 1.4e-40
Smith-Waterman score: 1177; 56.4% identity (84.0% similar) in 312 aa overlap (5-314:3-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAHINCTQATEFILVGLTDHQELKMPLFVLFLSIYLFTVVGNLGLILLIRADTSLNTPMY
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CCDS31 MENNTEVTEFILVGLTDDPELQIPLFIVFLFIYLITLVGNLGMIELILLDSCLHTPMY
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CCDS31 FKKTVGKAKASIGFIF
300 310
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CCDS31 FYKLFEN
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CCDS84 FFLYNLSFIDFCYSSVITPKMLMSFVLKKNSISYAGCMTQLFFFLFFVVSESFILSAMAY
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CCDS84 LKK-ILNKN-AFS
310
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CCDS31 HKAFSTCASYLMAVTIFFGTILFMYLRPTSSYSMEQDKVVSVFYTVIIPVLNPLIYSLKN
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CCDS31 KDVKKALKKILWKHIL
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CCDS73 LLPLLKLSCSSIYVNKLLILCVGAFNILVPSLTILCSYIFIIASILHIRSTEGRSKAFST
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310
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]