Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7438
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7438, 313 aa
1>>>pF1KB7438 313 - 313 aa - 313 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8715+/-0.00119; mu= 13.0151+/- 0.069
mean_var=179.2497+/-57.286, 0's: 0 Z-trim(104.5): 393 B-trim: 448 in 1/46
Lambda= 0.095795
statistics sampled from 7478 (7958) to 7478 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.587), E-opt: 0.2 (0.244), width: 16
Scan time: 2.200
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 2116 305.4 3.7e-83
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1240 184.4 1e-46
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1230 183.0 2.7e-46
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 1222 181.9 5.7e-46
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 1206 179.6 2.6e-45
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1203 179.2 3.5e-45
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1192 177.7 1e-44
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1180 176.1 3.2e-44
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 1174 175.2 5.6e-44
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1165 174.1 1.4e-43
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 1160 173.3 2.2e-43
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1153 172.3 4.2e-43
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 1151 172.1 5.1e-43
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1150 171.9 5.6e-43
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1148 171.6 6.8e-43
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 1146 171.3 8.2e-43
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 1141 170.7 1.3e-42
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 1139 170.5 1.7e-42
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1137 170.1 2e-42
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 1136 170.0 2.1e-42
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 1127 168.7 5.1e-42
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 1115 167.1 1.6e-41
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 1113 166.8 2e-41
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 1106 165.8 3.8e-41
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 1106 165.8 3.8e-41
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1102 165.4 6.2e-41
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 1092 163.9 1.5e-40
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 1088 163.4 2.1e-40
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1088 163.4 2.2e-40
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1087 163.3 2.5e-40
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 1079 162.1 5.1e-40
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 1075 161.5 7.4e-40
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 1073 161.3 8.9e-40
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1069 160.7 1.3e-39
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 1068 160.6 1.4e-39
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 1067 160.4 1.6e-39
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1058 159.2 3.8e-39
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 1052 158.4 6.7e-39
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 1052 158.4 6.7e-39
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 1031 155.5 5e-38
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 1022 154.2 1.2e-37
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 1019 153.8 1.6e-37
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 1011 152.7 3.4e-37
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 1010 152.6 3.8e-37
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 1010 152.6 3.8e-37
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 1010 152.6 3.8e-37
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 1007 152.2 5e-37
CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 1001 151.3 8.9e-37
CCDS32046.1 OR10G3 gene_id:26533|Hs108|chr14 ( 313) 976 147.9 9.8e-36
CCDS31702.1 OR10G4 gene_id:390264|Hs108|chr11 ( 311) 968 146.8 2.1e-35
>>CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 (313 aa)
initn: 2116 init1: 2116 opt: 2116 Z-score: 1606.5 bits: 305.4 E(32554): 3.7e-83
Smith-Waterman score: 2116; 100.0% identity (100.0% similar) in 313 aa overlap (1-313:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKKEQDSNVTEFVLLGLSSSWELQLFLFLLFLFFYIAIVLGNLLIVVTVQAHAHLLQSPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MKKEQDSNVTEFVLLGLSSSWELQLFLFLLFLFFYIAIVLGNLLIVVTVQAHAHLLQSPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YYFLGHLSFIDLCLSCVTVPKMLGDFLQQGKSISFSGCLAQIYFLHFLGASEMFLLTVMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YYFLGHLSFIDLCLSCVTVPKMLGDFLQQGKSISFSGCLAQIYFLHFLGASEMFLLTVMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YDRYVAICNPLRYLTVMNPQLCLWLVLACWCGGFIHSIMQVILVIQLPFCGPNELDNFYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YDRYVAICNPLRYLTVMNPQLCLWLVLACWCGGFIHSIMQVILVIQLPFCGPNELDNFYC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 DVPQVIKLACMDTYVVEVLVIANSGLLSLVCFLVLLFSYAIILITLRTHFCQGQNKVFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DVPQVIKLACMDTYVVEVLVIANSGLLSLVCFLVLLFSYAIILITLRTHFCQGQNKVFST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CASHLTVVSLIFVPCVFIYLRPFCSFSVDKIFSLFYTVITPMLNPLIYTLRNTDMKTAMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CASHLTVVSLIFVPCVFIYLRPFCSFSVDKIFSLFYTVITPMLNPLIYTLRNTDMKTAMK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 KLRIKPCGIPLPC
:::::::::::::
CCDS32 KLRIKPCGIPLPC
310
>>CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 (310 aa)
initn: 1264 init1: 1076 opt: 1240 Z-score: 952.3 bits: 184.4 E(32554): 1e-46
Smith-Waterman score: 1240; 57.9% identity (84.4% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKKEQDSNVTEFVLLGLSSSWELQLFLFLLFLFFYIAIVLGNLLIVVTVQAHAHLLQSPM
:. .. ..:. :::::.:.. ::: :::::::. :.. ..:::::.::: .: ..::
CCDS42 MEPQNTTQVSMFVLLGFSQTQELQKFLFLLFLLVYVTTIVGNLLIMVTVTFDCRL-HTPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YYFLGHLSFIDLCLSCVTVPKMLGDFLQQGKSISFSGCLAQIYFLHFLGASEMFLLTVMA
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CCDS42 YFLLRNLALIDLCYSTVTSPKMLVDFLHETKTISYQGCMAQIFFFHLLGGGTVFFLSVMA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YDRYVAICNPLRYLTVMNPQLCLWLVLACWCGGFIHSIMQVILVIQLPFCGPNELDNFYC
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CCDS42 YDRYIAISQPLRYVTIMNTQLCVGLVVAAWVGGFVHSIVQLALILPLPFCGPNILDNFYC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 DVPQVIKLACMDTYVVEVLVIANSGLLSLVCFLVLLFSYAIILITLRTHFCQGQNKVFST
:::::..::: :: ..: :.:.::::: .. ::.::.::..::. ::.: ... :. ::
CCDS42 DVPQVLRLACTDTSLLEFLMISNSGLLVIIWFLLLLISYTVILVMLRSHSGKARRKAAST
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CASHLTVVSLIFVPCVFIYLRPFCSFSVDKIFSLFYTVITPMLNPLIYTLRNTDMKTAMK
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CCDS42 CTTHIIVVSMIFIPCIYIYTWPFTPFLMDKAVSISYTVMTPMLNPMIYTLRNQDMKAAMR
240 250 260 270 280 290
310
pF1KB7 KLRIKPCGIPLPC
.:
CCDS42 RLGKCLVICRE
300 310
>>CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 1088 init1: 1088 opt: 1230 Z-score: 944.7 bits: 183.0 E(32554): 2.7e-46
Smith-Waterman score: 1230; 56.7% identity (82.2% similar) in 314 aa overlap (1-311:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKKEQDSNVTEFVLLGLSSSWELQLFLFLLFLFFYIAIVLGNLLIVVTVQAHAHLLQSPM
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CCDS31 MNPANHSQVAGFVLLGLSQVWELRFVFFTVFSAVYFMTVVGNLLIVVIVTSDPHL-HTTM
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pF1KB7 YYFLGHLSFIDLCLSCVTVPKMLGDFLQQGKSISFSGCLAQIYFLHFLGASEMFLLTVMA
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CCDS31 YFLLGNLSFLDFCYSSITAPRMLVDLLSGNPTISFGGCLTQLFFFHFIGGIKIFLLTVMA
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pF1KB7 YDRYVAICNPLRYLTVMNPQLCLWLVLACWCGGFIHSIMQVILVIQLPFCGPNELDNFYC
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CCDS31 YDRYIAISQPLHYTLIMNQTVCALLMAASWVGGFIHSIVQIALTIQLPFCGPDKLDNFYC
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pF1KB7 DVPQVIKLACMDTYVVEVLVIANSGLLSLVCFLVLLFSYAIILITLRTHFCQGQNKVFST
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CCDS31 DVPQLIKLACTDTFVLELLMVSNNGLVTLMCFLVLLGSYTALLVMLRSHSREGRSKALST
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pF1KB7 CASHLTVVSLIFVPCVFIYLRPFCSFSVDKIFSLFYTVITPMLNPLIYTLRNTDMKTAMK
::::..::.::::::...: ::: .: .:: :..::..:::::: :::::: .. :::
CCDS31 CASHIAVVTLIFVPCIYVYTRPFRTFPMDKAVSVLYTIVTPMLNPAIYTLRNKEVIMAMK
240 250 260 270 280 290
310
pF1KB7 KL--RIK-PCGIPLPC
:: : : : : ::
CCDS31 KLWRRKKDPIG-PLEHRPLH
300 310
>>CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 (310 aa)
initn: 1235 init1: 1210 opt: 1222 Z-score: 938.8 bits: 181.9 E(32554): 5.7e-46
Smith-Waterman score: 1222; 57.4% identity (85.1% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKKEQDSNVTEFVLLGLSSSWELQLFLFLLFLFFYIAIVLGNLLIVVTVQAHAHLLQSPM
: .. : :.:::: :: .: .:: :.:..:. :.::.::::::.::: . : .:::
CCDS32 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPM
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 YYFLGHLSFIDLCLSCVTVPKMLGDFLQQGKSISFSGCLAQIYFLHFLGASEMFLLTVMA
:..::.:.:.:. :. ..:::. :::.. : :::.::.:::.:::: :..:: ::. ::
CCDS32 YFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLISFGGCMAQIFFLHFTGGAEMVLLVSMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YDRYVAICNPLRYLTVMNPQLCLWLVLACWCGGFIHSIMQVILVIQLPFCGPNELDNFYC
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CCDS32 YDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRLVLASWVVGFVHSISQVAFTVNLPYCGPNEVDSFFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 DVPQVIKLACMDTYVVEVLVIANSGLLSLVCFLVLLFSYAIILITLRTHFCQGQNKVFST
:.: :::::::::::. ...:..:::::: :::.::.::..::...: . . .:..::
CCDS32 DLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAIRQRAAGSTSKALST
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CASHLTVVSLIFVPCVFIYLRPFCSFSVDKIFSLFYTVITPMLNPLIYTLRNTDMKTAMK
:..:. ::.:.: ::.:.:.::: :::::..:.:::..::.:::.:::::: .::.:::
CCDS32 CSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSVDKLLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEEMKAAMK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 KLRIKPCGIPLPC
::.
CCDS32 KLQNRRVTFQ
310
>>CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 (308 aa)
initn: 1205 init1: 1069 opt: 1206 Z-score: 926.9 bits: 179.6 E(32554): 2.6e-45
Smith-Waterman score: 1206; 55.6% identity (83.4% similar) in 302 aa overlap (1-302:1-301)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKKEQDSNVTEFVLLGLSSSWELQLFLFLLFLFFYIAIVLGNLLIVVTVQAHAHLLQSPM
:. .. . ::::.::::..: . ::..:.: :.::. :. ::.::. :... : .:.
CCDS32 METQNLTVVTEFILLGLTQSQDAQLLVFVLVLIFYLIILPGNFLIIFTIKSDPGLT-APL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YYFLGHLSFIDLCLSCVTVPKMLGDFLQQGKSISFSGCLAQIYFLHFLGASEMFLLTVMA
:.:::.:...: : ..::.:: :::.. : ::. .:..:..:::::::.:::::.:::
CCDS32 YFFLGNLALLDASYSFIVVPRMLVDFLSEKKVISYRSCITQLFFLHFLGAGEMFLLVVMA
60 70 80 90 100 110
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pF1KB7 YDRYVAICNPLRYLTVMNPQLCLWLVLACWCGGFIHSIMQVILVIQLPFCGPNELDNFYC
.:::.::: ::.: :.:::. : : :. : :::::::.:: :...:::::::.::::.:
CCDS32 FDRYIAICRPLHYSTIMNPRACYALSLVLWLGGFIHSIVQVALILHLPFCGPNQLDNFFC
120 130 140 150 160 170
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pF1KB7 DVPQVIKLACMDTYVVEVLVIANSGLLSLVCFLVLLFSYAIILITLRTHFCQGQNKVFST
:::::::::: .:.:::.:...:::::::.::: :: :::.:: .: : .:..:..::
CCDS32 DVPQVIKLACTNTFVVELLMVSNSGLLSLLCFLGLLASYAVILCRIREHSSEGKSKAIST
180 190 200 210 220 230
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pF1KB7 CASHLTVVSLIFVPCVFIYLRPFCSFSVDKIFSLFYTVITPMLNPLIYTLRNTDMKTAMK
:..:. .. :.: : .::: :: .: .::. :::.::: :..::.:::::: ..:..:.
CCDS32 CTTHIIIIFLMFGPAIFIYTCPFQAFPADKVVSLFHTVIFPLMNPVIYTLRNQEVKASMR
240 250 260 270 280 290
310
pF1KB7 KLRIKPCGIPLPC
::
CCDS32 KLLSQHMFC
300
>>CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1205 init1: 1061 opt: 1203 Z-score: 924.6 bits: 179.2 E(32554): 3.5e-45
Smith-Waterman score: 1203; 56.5% identity (84.6% similar) in 299 aa overlap (4-302:2-299)
10 20 30 40 50 60
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::
CCDS31 KLWGRNVFLEAKGK
300 310
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CCDS32 KVFNKHIA
300
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CCDS32 DITQVVRIACANTFPEELVMICSSGLISVVCFIALLMSYAFLLALLKKHSGSGENTNRAM
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CCDS32 STCYSHITIVVLMFGPSIYIYARPFDSFSLDKVVSVFHTVIFPLLNPIIYTLRNKEVKAA
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300 310
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CCDS32 MRKVVTKYILCEEK
300 310
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CCDS32 METGNLTWVSDFVFLGLSQTRELQRFLFLMFLFVYITTVMGNILIIITVTSDSQL-HTPM
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300
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]