Result of FASTA (omim) for
pF1KB7438
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7438, 313 aa
1>>>pF1KB7438 313 - 313 aa - 313 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9458+/-0.000469; mu= 18.4853+/- 0.029
mean_var=126.6050+/-33.276, 0's: 0 Z-trim(110.3): 301 B-trim: 1106 in 1/46
Lambda= 0.113985
statistics sampled from 18166 (18605) to 18166 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.558), E-opt: 0.2 (0.218), width: 16
Scan time: 7.020
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 1073 188.3 1.7e-47
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 909 161.4 2.2e-39
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 892 158.6 1.5e-38
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XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 884 157.3 3.8e-38
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 872 155.3 1.5e-37
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 872 155.3 1.5e-37
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 872 155.3 1.5e-37
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 871 155.1 1.7e-37
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NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 851 151.8 1.6e-36
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 846 151.0 2.9e-36
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 830 148.4 1.8e-35
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 813 145.6 1.2e-34
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 809 144.9 2e-34
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 800 143.5 5.5e-34
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 794 142.4 1.1e-33
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 793 142.3 1.2e-33
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 792 142.1 1.4e-33
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 573 106.1 9.5e-23
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 489 92.3 1.4e-18
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 219 48.0 3.3e-05
NP_000902 (OMIM: 165195) delta-type opioid recepto ( 372) 215 47.4 5.5e-05
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 210 46.5 9.4e-05
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 210 46.6 0.00011
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 203 45.5 0.00023
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 203 45.5 0.00023
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 203 45.5 0.00023
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 203 45.5 0.00023
NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 203 45.5 0.00023
NP_001035262 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 360) 202 45.2 0.00024
NP_955525 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 378) 202 45.2 0.00024
NP_001035259 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 387) 202 45.2 0.00025
NP_000861 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine recep ( 388) 202 45.2 0.00025
NP_001273339 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 411) 202 45.3 0.00026
NP_001035263 (OMIM: 602164) 5-hydroxytryptamine re ( 428) 202 45.3 0.00026
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 200 44.8 0.00028
NP_000520 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotropi ( 297) 191 43.3 0.00075
XP_016881270 (OMIM: 202200,607397) PREDICTED: adre ( 297) 191 43.3 0.00075
NP_001278840 (OMIM: 202200,607397) adrenocorticotr ( 297) 191 43.3 0.00075
XP_011521963 (OMIM: 600446) PREDICTED: adenosine r ( 116) 185 41.7 0.00087
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 186 42.6 0.0015
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 186 42.6 0.0015
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 185 42.4 0.0016
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 184 42.2 0.0018
NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 183 42.0 0.002
NP_000907 (OMIM: 167055) oxytocin receptor [Homo s ( 389) 183 42.1 0.0022
XP_011532064 (OMIM: 167055) PREDICTED: oxytocin re ( 389) 183 42.1 0.0022
NP_000015 (OMIM: 109690,600807,601665) beta-2 adre ( 413) 183 42.2 0.0022
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
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pF1KB7 MKKEQDSNVTEFVLLGLSSSWELQLFLFLLFLFFYIAIVLGNLLIVVTVQAHAHLLQSPM
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310
pF1KB7 KLRIKPCGIPLPC
::
NP_001 KLCSRKDISGDK
300
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
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pF1KB7 MKKEQDSNVTEFVLLGLSSSWELQLFLFLLFLFFYIAIVLGNLLIVVTVQAHAHLLQSP
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pF1KB7 CDVPQVIKLACMDTYVVEVLVIANSGLLSLVCFLVLLFSYAIILIT-LRTHFCQGQNKVF
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pF1KB7 STCASHLTVVSLIFVPCVFIYLRPFC--SFSVDKIFSLFYTVITPMLNPLIYTLRNTDMK
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NP_001 NTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIK
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pF1KB7 TAMKKLRIKPCGIPLPC
:.:.:. . :
NP_001 DALKRLQKRKCC
300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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pF1KB7 MKKEQDSNVTEFVLLGLSSSWELQLFLFLLFLFFYIAIVLGNLLIVVTVQAHAHLLQS
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pF1KB7 YCDVPQVIKLACMDTYVVEVLVIANSGLLSLVCFLVLLFSYAIILIT-LRTHFCQGQNKV
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NP_006 FSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDV
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pF1KB7 KTAMKK-LRIKPCGIPLPC
: : .: :: :
NP_006 KDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KB7 MKKEQDSNVTEFVLLGLSSSWELQLFLFLLFLFFYIAIVLGNLLIVVTVQAHAHLLQSPM
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.. :..:::.:: :: ....: .: .. : ..:.:: :. : :. . .:..:.:
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:::::::::.: . .: :..: : :: .:.::.::...::::::.::.::: ..:
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pF1KB7 AMKKLRIKPCGIPLPC
: .:: : :.
XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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pF1KB7 MKKEQDSNVTEFVLLGLSSSWELQLFLFLLFLFFYIAIVLGNLLIVVTVQAHAHLLQSPM
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.. :..:::.:: :: ....: .: .. : ..:.:: :. : :. . .:..:.:
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NP_036 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG
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pF1KB7 AMKKLRIKPCGIPLPC
: .:: : :.
NP_036 AWQKLLWKFSGLTSKLAT
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>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KB7 MKKEQDSNVTEFVLLGLSSSWELQLFLFLLFLFFYIAIVLGNLLIVVTVQAHAHLLQSPM
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300 310
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XP_011 ALKKVVGRVVFSV
300 310
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pF1KB7 MKKEQDSNVTEFVLLGLSSSWELQLFLFLLFLFFYIAIVLGNLLIVVTVQAHAHLLQSPM
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NP_036 ALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
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Smith-Waterman score: 871; 41.8% identity (77.2% similar) in 294 aa overlap (12-302:15-307)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]