Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7445
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7445, 498 aa
1>>>pF1KB7445 498 - 498 aa - 498 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7352+/-0.00114; mu= 12.4182+/- 0.068
mean_var=165.8573+/-33.388, 0's: 0 Z-trim(107.3): 204 B-trim: 65 in 1/51
Lambda= 0.099588
statistics sampled from 9290 (9516) to 9290 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.653), E-opt: 0.2 (0.292), width: 16
Scan time: 2.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45835.1 POTEC gene_id:388468|Hs108|chr18 ( 542) 2082 311.9 1.1e-84
CCDS73690.1 POTEB3 gene_id:102724631|Hs108|chr15 ( 581) 2080 311.7 1.4e-84
CCDS59250.1 POTEB gene_id:100996331|Hs108|chr15 ( 544) 2079 311.5 1.5e-84
CCDS59248.1 POTEB2 gene_id:100287399|Hs108|chr15 ( 544) 2079 311.5 1.5e-84
CCDS13562.1 POTED gene_id:317754|Hs108|chr21 ( 584) 2077 311.2 1.9e-84
CCDS46409.1 POTEF gene_id:728378|Hs108|chr2 (1075) 2063 309.5 1.2e-83
CCDS59432.1 POTEJ gene_id:653781|Hs108|chr2 (1038) 2059 308.9 1.7e-83
CCDS59431.1 POTEI gene_id:653269|Hs108|chr2 (1075) 2059 308.9 1.8e-83
CCDS46414.1 POTEE gene_id:445582|Hs108|chr2 (1075) 2053 308.1 3.2e-83
CCDS74808.1 POTEH gene_id:23784|Hs108|chr22 ( 545) 2027 304.0 2.7e-82
CCDS73610.1 POTEG gene_id:404785|Hs108|chr14 ( 508) 2024 303.5 3.5e-82
CCDS73609.1 POTEM gene_id:641455|Hs108|chr14 ( 508) 2010 301.5 1.4e-81
CCDS67439.1 ANKRD62 gene_id:342850|Hs108|chr18 ( 917) 1000 156.7 1e-37
CCDS74543.1 ANKRD36B gene_id:57730|Hs108|chr2 (1353) 817 130.6 1.1e-29
CCDS55311.1 ANKRD18A gene_id:253650|Hs108|chr9 ( 992) 807 129.0 2.4e-29
CCDS43828.1 ANKRD20A4 gene_id:728747|Hs108|chr9 ( 823) 791 126.6 1e-28
CCDS35029.1 ANKRD20A3 gene_id:441425|Hs108|chr9 ( 823) 790 126.5 1.1e-28
CCDS35028.1 ANKRD20A2 gene_id:441430|Hs108|chr9 ( 823) 790 126.5 1.1e-28
CCDS6620.1 ANKRD20A1 gene_id:84210|Hs108|chr9 ( 823) 788 126.2 1.4e-28
CCDS41499.1 ANKRD26 gene_id:22852|Hs108|chr10 (1710) 788 126.5 2.2e-28
CCDS54182.1 ANKRD30B gene_id:374860|Hs108|chr18 (1392) 770 123.9 1.2e-27
CCDS54379.1 ANKRD36 gene_id:375248|Hs108|chr2 (1941) 745 120.4 1.8e-26
CCDS7193.1 ANKRD30A gene_id:91074|Hs108|chr10 (1341) 676 110.3 1.3e-23
CCDS43638.1 ANKRD7 gene_id:56311|Hs108|chr7 ( 254) 631 103.1 3.9e-22
CCDS45621.1 CCDC144A gene_id:9720|Hs108|chr17 (1427) 400 70.7 1.2e-11
>>CCDS45835.1 POTEC gene_id:388468|Hs108|chr18 (542 aa)
initn: 2515 init1: 2070 opt: 2082 Z-score: 1633.7 bits: 311.9 E(32554): 1.1e-84
Smith-Waterman score: 2082; 77.1% identity (91.0% similar) in 401 aa overlap (20-420:94-493)
10 20 30 40
pF1KB7 MVAEVSPKLAASPMKKPFGFRGKMGKWCCCCFPCCRGSGKNNMGAWRDH
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CCDS45 CCHHCFPCCRGSGTSNVGTSGDHDNSFMKTLRSKMGKWCCHCFPCCRGSGKSNVGAWGDY
70 80 90 100 110 120
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 DDSAFTEPRYHVRREDLGKLHRAAWWGEVPRADLIVMLRGPGINKRDKKKRTALHLACAN
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CCDS45 DDSAFMEPRYHVRREDLDKLHRAAWWGKVPRKDLIVMLRDTDMNKRDKQKRTALHLASAN
130 140 150 160 170 180
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 GNSEVVSLLLDRQCQLHVFDSKKRTALIKAVQCQEDECALMLLQHGTDPNLPDMYGNTAL
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CCDS45 GNSEVVQLLLDRRCQLNVLDNKKRTALIKAVQCQEDECVLMLLEHGADQNIPDEYGNTTL
190 200 210 220 230 240
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 HYAVYNEDKLMAKTLLLYGADIESKNKGGLTPLLLAVHGQKQRMVKFLIKKKANLNALDR
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CCDS45 HYAVHNEDKLMAKALLLYGADIESKNKCGLTPLLLGVHEQKQQVVKFLIKKKANLNALDR
250 260 270 280 290 300
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 FGRTALILAVRCGSASIVSLLLQQNIDVFSQDVFGQTAEDYAVSSHHSIICQLLSDYKEN
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CCDS45 YGRTALILAVCCGSASIVNLLLEQNVDVSSQDLSGQTAREYAVSSHHHVICELLSDYKEK
310 320 330 340 350 360
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 QMPNNSSGNSNPEQDLKLTSEEEPQRLKGSENSQHEKVTQEPDINKDCDREVEEEMQKHG
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CCDS45 QMLKISSENSNPEQDLKLTSEEESQRLKVSENSQPEKMSQEPEINKDCDREVEEEIKKHG
370 380 390 400 410 420
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 SNNVGLSENLTDGAAAGNGDGGLVPQRKSRKHENQQFPNTEIEEYHRPEKKSNEKNKVKS
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CCDS45 SNPVGLPENLTNGASAGNGDDGLIPQRRSRKPENQQFPDTENEEYHSDEQNDTRKQLSEE
430 440 450 460 470 480
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 QIHSVDNLDDITWPSEIASEDYDLLFSNYETFTLLIEQLKMDFNDSASLSKIQDAVISEE
: .... :.:
CCDS45 QNTGISQ-DEILTNKQKQIEVAEKKMNSELSLSHKKEEDLLRENSMLQEEIAMLISGDWN
490 500 510 520 530 540
>>CCDS73690.1 POTEB3 gene_id:102724631|Hs108|chr15 (581 aa)
initn: 2493 init1: 2068 opt: 2080 Z-score: 1631.7 bits: 311.7 E(32554): 1.4e-84
Smith-Waterman score: 2085; 68.8% identity (85.6% similar) in 464 aa overlap (20-469:94-557)
10 20 30 40
pF1KB7 MVAEVSPKLAASPMKKPFGFRGKMGKWCCCCFPCCRGSGKNNMGAWRDH
.:.::::::: ::::::::::.:.:.: :.
CCDS73 CCHHCFPCCRGSGTSNVGTSGDHDNSFMKTLRSKMGKWCCHCFPCCRGSGKSNVGTWGDY
70 80 90 100 110 120
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 DDSAFTEPRYHVRREDLGKLHRAAWWGEVPRADLIVMLRGPGINKRDKKKRTALHLACAN
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CCDS73 DDSAFMEPRYHVRREDLDKLHRAAWWGKVPRKDLIVMLRDTDMNKRDKQKRTALHLASAN
130 140 150 160 170 180
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 GNSEVVSLLLDRQCQLHVFDSKKRTALIKAVQCQEDECALMLLQHGTDPNLPDMYGNTAL
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CCDS73 GNSEVVQLLLDRRCQLNVLDNKKRTALIKAVQCQEDECVLMLLEHGADGNIQDEYGNTAL
190 200 210 220 230 240
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 HYAVYNEDKLMAKTLLLYGADIESKNKGGLTPLLLAVHGQKQRMVKFLIKKKANLNALDR
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CCDS73 HYAIYNEDKLMAKALLLYGADIESKNKCGLTPLLLGVHEQKQQVVKFLIKKKANLNALDR
250 260 270 280 290 300
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 FGRTALILAVRCGSASIVSLLLQQNIDVFSQDVFGQTAEDYAVSSHHSIICQLLSDYKEN
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CCDS73 YGRTALILAVCCGSASIVNLLLEQNVDVSSQDLSGQTAREYAVSSHHHVICELLSDYKEK
310 320 330 340 350 360
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 QMPNNSSGNSNPEQDLKLTSEEEPQRLKGSENSQHEKVTQEPDINKDCDREVEEEMQKHG
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CCDS73 QMLKISSENSNPEQDLKLTSEEESQRLKVSENSQPEKMSQEPEINKDCDREVEEEIKKHG
370 380 390 400 410 420
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 SNNVGLSENLTDGAAAGNGDGGLVPQRKSRKHENQQFPNTEIEEYHRPEKKSNEKNKVKS
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CCDS73 SNPVGLPENLTNGASAGNGDDGLIPQRKSRKPENQQFPDTENEEYHSDEQNDTQKQLSEE
430 440 450 460 470 480
410 420 430 440 450
pF1KB7 QIHSVDNLDDITWPS---EIASEDYD--LLFSNYETFTLL---------IEQLKMDFNDS
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CCDS73 QNTGISQDEILTNKQKQIEVAEKEMNSKLSLSHKKEEDLLRENSMLREEIAMLRLELDET
490 500 510 520 530 540
460 470 480 490
pF1KB7 ASLSKIQDAVISEEHLLELKNSHYEQLTVEVEQMENMVHVLQK
..... : ::
CCDS73 KHQNQLRENKILEEIESVKEKLLKAIQLNEEALTKTSI
550 560 570 580
>>CCDS59250.1 POTEB gene_id:100996331|Hs108|chr15 (544 aa)
initn: 2581 init1: 2067 opt: 2079 Z-score: 1631.3 bits: 311.5 E(32554): 1.5e-84
Smith-Waterman score: 2086; 68.8% identity (85.6% similar) in 464 aa overlap (20-469:57-520)
10 20 30 40
pF1KB7 MVAEVSPKLAASPMKKPFGFRGKMGKWCCCCFPCCRGSGKNNMGAWRDH
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CCDS59 WCHHRFPCCRGSGTSNVGTSGDHDDSFMKTLRSKMGKWCCHCFPCCRGSGKSNVGTWGDY
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 DDSAFTEPRYHVRREDLGKLHRAAWWGEVPRADLIVMLRGPGINKRDKKKRTALHLACAN
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CCDS59 DDSAFMEPRYHVRREDLDKLHRAAWWGKVPRKDLIVMLRDTDMNKRDKQKRTALHLASAN
90 100 110 120 130 140
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 GNSEVVSLLLDRQCQLHVFDSKKRTALIKAVQCQEDECALMLLQHGTDPNLPDMYGNTAL
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CCDS59 GNSEVVQLLLDRRCQLNVLDNKKRTALIKAVQCQEDECVLMLLEHGADGNIQDEYGNTAL
150 160 170 180 190 200
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 HYAVYNEDKLMAKTLLLYGADIESKNKGGLTPLLLAVHGQKQRMVKFLIKKKANLNALDR
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CCDS59 HYAIYNEDKLMAKALLLYGADIESKNKCGLTPLLLGVHEQKQEVVKFLIKKKANLNALDR
210 220 230 240 250 260
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 FGRTALILAVRCGSASIVSLLLQQNIDVFSQDVFGQTAEDYAVSSHHSIICQLLSDYKEN
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CCDS59 YGRTALILAVCCGSASIVNLLLEQNVDVSSQDLSGQTAREYAVSSHHHVICELLSDYKEK
270 280 290 300 310 320
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 QMPNNSSGNSNPEQDLKLTSEEEPQRLKGSENSQHEKVTQEPDINKDCDREVEEEMQKHG
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CCDS59 QMLKISSENSNPEQDLKLTSEEESQRLKVSENSQPEKMSQEPEINKDCDREVEEEIKKHG
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350 360 370 380 390 400
pF1KB7 SNNVGLSENLTDGAAAGNGDGGLVPQRKSRKHENQQFPNTEIEEYHRPEKKSNEKNKVKS
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CCDS59 SNPVGLPENLTNGASAGNGDDGLIPQRKSRKPENQQFPDTENEEYHSDEQNDTQKQLSEE
390 400 410 420 430 440
410 420 430 440 450
pF1KB7 QIHSVDNLDDITWPS---EIASEDYD--LLFSNYETFTLL---------IEQLKMDFNDS
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CCDS59 QNTGISQDEILTNKQKQIEVAEKEMNSELSLSHKKEEDLLRENSMLREEIAKLRLELDET
450 460 470 480 490 500
460 470 480 490
pF1KB7 ASLSKIQDAVISEEHLLELKNSHYEQLTVEVEQMENMVHVLQK
..... : ::
CCDS59 KHQNQLRENKILEEIESVKEKLLKTIQLNEEALTKTSI
510 520 530 540
>>CCDS59248.1 POTEB2 gene_id:100287399|Hs108|chr15 (544 aa)
initn: 2581 init1: 2067 opt: 2079 Z-score: 1631.3 bits: 311.5 E(32554): 1.5e-84
Smith-Waterman score: 2086; 68.8% identity (85.6% similar) in 464 aa overlap (20-469:57-520)
10 20 30 40
pF1KB7 MVAEVSPKLAASPMKKPFGFRGKMGKWCCCCFPCCRGSGKNNMGAWRDH
.:.::::::: ::::::::::.:.:.: :.
CCDS59 WCHHRFPCCRGSGTSNVGTSGDHDDSFMKTLRSKMGKWCCHCFPCCRGSGKSNVGTWGDY
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 DDSAFTEPRYHVRREDLGKLHRAAWWGEVPRADLIVMLRGPGINKRDKKKRTALHLACAN
::::: ::::::::::: :::::::::.::: ::::::: .:::::.:::::::: ::
CCDS59 DDSAFMEPRYHVRREDLDKLHRAAWWGKVPRKDLIVMLRDTDMNKRDKQKRTALHLASAN
90 100 110 120 130 140
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 GNSEVVSLLLDRQCQLHVFDSKKRTALIKAVQCQEDECALMLLQHGTDPNLPDMYGNTAL
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CCDS59 GNSEVVQLLLDRRCQLNVLDNKKRTALIKAVQCQEDECVLMLLEHGADGNIQDEYGNTAL
150 160 170 180 190 200
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 HYAVYNEDKLMAKTLLLYGADIESKNKGGLTPLLLAVHGQKQRMVKFLIKKKANLNALDR
:::.:::::::::.::::::::::::: :::::::.:: :::..::::::::::::::::
CCDS59 HYAIYNEDKLMAKALLLYGADIESKNKCGLTPLLLGVHEQKQEVVKFLIKKKANLNALDR
210 220 230 240 250 260
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 FGRTALILAVRCGSASIVSLLLQQNIDVFSQDVFGQTAEDYAVSSHHSIICQLLSDYKEN
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CCDS59 YGRTALILAVCCGSASIVNLLLEQNVDVSSQDLSGQTAREYAVSSHHHVICELLSDYKEK
270 280 290 300 310 320
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 QMPNNSSGNSNPEQDLKLTSEEEPQRLKGSENSQHEKVTQEPDINKDCDREVEEEMQKHG
:: . :: ::::::::::::::: :::: ::::: ::..:::.::::::::::::..:::
CCDS59 QMLKISSENSNPEQDLKLTSEEESQRLKVSENSQPEKMSQEPEINKDCDREVEEEIKKHG
330 340 350 360 370 380
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 SNNVGLSENLTDGAAAGNGDGGLVPQRKSRKHENQQFPNTEIEEYHRPEKKSNEKNKVKS
:: ::: ::::.::.::::: ::.::::::: ::::::.:: :::: :.....:. .
CCDS59 SNPVGLPENLTNGASAGNGDDGLIPQRKSRKPENQQFPDTENEEYHSDEQNDTQKQLSEE
390 400 410 420 430 440
410 420 430 440 450
pF1KB7 QIHSVDNLDDITWPS---EIASEDYD--LLFSNYETFTLL---------IEQLKMDFNDS
: .... . .: . :.: .... : .:. . :: : .:.......
CCDS59 QNTGISQDEILTNKQKQIEVAEKEMNSELSLSHKKEEDLLRENSMLREEIAKLRLELDET
450 460 470 480 490 500
460 470 480 490
pF1KB7 ASLSKIQDAVISEEHLLELKNSHYEQLTVEVEQMENMVHVLQK
..... : ::
CCDS59 KHQNQLRENKILEEIESVKEKLLKTIQLNEEALTKTSI
510 520 530 540
>>CCDS13562.1 POTED gene_id:317754|Hs108|chr21 (584 aa)
initn: 2576 init1: 2061 opt: 2077 Z-score: 1629.4 bits: 311.2 E(32554): 1.9e-84
Smith-Waterman score: 2083; 67.4% identity (83.2% similar) in 487 aa overlap (20-498:94-564)
10 20 30 40
pF1KB7 MVAEVSPKLAASPMKKPFGFRGKMGKWCCCCFPCCRGSGKNNMGAWRDH
.:.::::::: ::::::::::.:.::: :.
CCDS13 CCRHCFPCCRGSGTSNVGTSGDHENSFMKMLRSKMGKWCCHCFPCCRGSGKSNVGAWGDY
70 80 90 100 110 120
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 DDSAFTEPRYHVRREDLGKLHRAAWWGEVPRADLIVMLRGPGINKRDKKKRTALHLACAN
: ::: :::::.::::: :::::::::.::: ::::::: .:::::.:::::::: ::
CCDS13 DHSAFMEPRYHIRREDLDKLHRAAWWGKVPRKDLIVMLRDTDMNKRDKEKRTALHLASAN
130 140 150 160 170 180
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 GNSEVVSLLLDRQCQLHVFDSKKRTALIKAVQCQEDECALMLLQHGTDPNLPDMYGNTAL
::::::.:::::.:::.:.:.:::::::::.:::::::.::::.::.: :.:: ::::::
CCDS13 GNSEVVQLLLDRRCQLNVLDNKKRTALIKAIQCQEDECVLMLLEHGADRNIPDEYGNTAL
190 200 210 220 230 240
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 HYAVYNEDKLMAKTLLLYGADIESKNKGGLTPLLLAVHGQKQRMVKFLIKKKANLNALDR
:::.:::::::::.::::::::::::: :::::::.:: :::..::::::::::::.:::
CCDS13 HYAIYNEDKLMAKALLLYGADIESKNKCGLTPLLLGVHEQKQQVVKFLIKKKANLNVLDR
250 260 270 280 290 300
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 FGRTALILAVRCGSASIVSLLLQQNIDVFSQDVFGQTAEDYAVSSHHSIICQLLSDYKEN
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CCDS13 YGRTALILAVCCGSASIVNLLLEQNVDVSSQDLSGQTAREYAVSSHHHVICELLSDYKEK
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CCDS46 PKYSSENSNPEQDLKLTSEEESQRLKGSENGQPEKRSQEPEINKDGDRELENFMAIEEMK
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CCDS74 STHMGFPENLTNGATADNGDDGLIPPRKSRTPESQQFPDTENEQYHSDEQNDTQKQLSEE
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:
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]