Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7446
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7446, 311 aa
1>>>pF1KB7446 311 - 311 aa - 311 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0555+/-0.00151; mu= 11.7955+/- 0.087
mean_var=186.1636+/-63.136, 0's: 0 Z-trim(100.5): 411 B-trim: 692 in 2/45
Lambda= 0.094000
statistics sampled from 5629 (6132) to 5629 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.52), E-opt: 0.2 (0.188), width: 16
Scan time: 1.650
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 ( 311) 2027 288.4 4.9e-78
CCDS31818.1 OR6C1 gene_id:390321|Hs108|chr12 ( 312) 1596 229.9 1.9e-60
CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 ( 312) 1542 222.6 3.1e-58
CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12 ( 312) 1499 216.8 1.8e-56
CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 ( 312) 1478 213.9 1.3e-55
CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 ( 309) 1442 209.0 3.7e-54
CCDS31824.1 OR6C2 gene_id:341416|Hs108|chr12 ( 312) 1442 209.0 3.7e-54
CCDS31825.1 OR6C70 gene_id:390327|Hs108|chr12 ( 312) 1419 205.9 3.2e-53
CCDS31817.1 OR6C6 gene_id:283365|Hs108|chr12 ( 314) 1414 205.3 5.2e-53
CCDS58241.1 OR2AP1 gene_id:121129|Hs108|chr12 ( 309) 1386 201.4 7.1e-52
CCDS31821.1 OR6C65 gene_id:403282|Hs108|chr12 ( 312) 1376 200.1 1.8e-51
CCDS31826.2 OR6C68 gene_id:403284|Hs108|chr12 ( 312) 1316 192.0 5.2e-49
CCDS31700.1 OR6T1 gene_id:219874|Hs108|chr11 ( 323) 995 148.4 6.7e-36
CCDS31696.1 OR6M1 gene_id:390261|Hs108|chr11 ( 313) 986 147.2 1.5e-35
CCDS31695.1 OR6X1 gene_id:390260|Hs108|chr11 ( 312) 968 144.8 8.3e-35
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 945 141.7 7.3e-34
CCDS31095.1 OR6F1 gene_id:343169|Hs108|chr1 ( 308) 941 141.1 1e-33
CCDS31520.1 OR8J3 gene_id:81168|Hs108|chr11 ( 315) 932 139.9 2.5e-33
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 931 139.8 2.7e-33
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 926 139.1 4.4e-33
CCDS31552.1 OR5B21 gene_id:219968|Hs108|chr11 ( 309) 924 138.8 5.2e-33
CCDS43661.1 OR9A4 gene_id:130075|Hs108|chr7 ( 314) 906 136.4 2.8e-32
CCDS31529.1 OR8J1 gene_id:219477|Hs108|chr11 ( 316) 906 136.4 2.9e-32
CCDS31528.1 OR8K1 gene_id:390157|Hs108|chr11 ( 319) 906 136.4 2.9e-32
CCDS47728.1 OR6V1 gene_id:346517|Hs108|chr7 ( 313) 905 136.2 3.1e-32
CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 905 136.2 3.1e-32
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 903 136.0 4.1e-32
CCDS31709.1 OR8B3 gene_id:390271|Hs108|chr11 ( 313) 901 135.7 4.5e-32
CCDS53631.1 OR5M1 gene_id:390168|Hs108|chr11 ( 315) 900 135.5 5e-32
CCDS32038.1 OR6S1 gene_id:341799|Hs108|chr14 ( 331) 894 134.8 9e-32
CCDS31098.1 OR11L1 gene_id:391189|Hs108|chr1 ( 322) 893 134.6 9.8e-32
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 892 134.5 1.1e-31
CCDS7774.1 OR10A4 gene_id:283297|Hs108|chr11 ( 315) 891 134.3 1.2e-31
CCDS10496.1 OR1F1 gene_id:4992|Hs108|chr16 ( 312) 889 134.1 1.4e-31
CCDS53630.1 OR5M10 gene_id:390167|Hs108|chr11 ( 315) 889 134.1 1.4e-31
CCDS31521.1 OR8K5 gene_id:219453|Hs108|chr11 ( 307) 887 133.8 1.7e-31
CCDS43667.1 OR6B1 gene_id:135946|Hs108|chr7 ( 311) 885 133.5 2e-31
CCDS8446.1 OR8B8 gene_id:26493|Hs108|chr11 ( 311) 884 133.4 2.2e-31
CCDS31537.1 OR9G4 gene_id:283189|Hs108|chr11 ( 327) 884 133.4 2.3e-31
CCDS32033.1 OR11H6 gene_id:122748|Hs108|chr14 ( 330) 883 133.3 2.5e-31
CCDS41647.1 OR8U1 gene_id:219417|Hs108|chr11 ( 309) 882 133.1 2.7e-31
CCDS35121.1 OR1J2 gene_id:26740|Hs108|chr9 ( 313) 882 133.1 2.7e-31
CCDS31549.1 OR5B3 gene_id:441608|Hs108|chr11 ( 314) 882 133.1 2.7e-31
CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 882 133.1 2.7e-31
CCDS7949.1 OR5I1 gene_id:10798|Hs108|chr11 ( 314) 880 132.8 3.3e-31
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 879 132.7 3.6e-31
CCDS31519.1 OR8H3 gene_id:390152|Hs108|chr11 ( 312) 879 132.7 3.6e-31
CCDS31561.1 OR5A1 gene_id:219982|Hs108|chr11 ( 315) 879 132.7 3.6e-31
CCDS53391.1 OR6P1 gene_id:128366|Hs108|chr1 ( 317) 879 132.7 3.6e-31
CCDS7773.1 OR10A5 gene_id:144124|Hs108|chr11 ( 317) 878 132.6 4e-31
>>CCDS31819.1 OR6C3 gene_id:254786|Hs108|chr12 (311 aa)
initn: 2027 init1: 2027 opt: 2027 Z-score: 1514.5 bits: 288.4 E(32554): 4.9e-78
Smith-Waterman score: 2027; 100.0% identity (100.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MNHTMVTEFVLLGLSDDPDLQIVIFLFLFITYILSVTGNLTIITLTFVDSHLQTPMYFFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MNHTMVTEFVLLGLSDDPDLQIVIFLFLFITYILSVTGNLTIITLTFVDSHLQTPMYFFL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 RNFSFLEISFTTVCIPRFLGAIITRNKTISYNNCAAQLFFFIFMGVTEFYILTAMSYDRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RNFSFLEISFTTVCIPRFLGAIITRNKTISYNNCAAQLFFFIFMGVTEFYILTAMSYDRY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 VAICKPLHYTSIMNRKLCTLLVLCAWLSGFLTIFPPLMLLLQLDYCASNVIDHFACDYFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VAICKPLHYTSIMNRKLCTLLVLCAWLSGFLTIFPPLMLLLQLDYCASNVIDHFACDYFP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LLQLSCSDTWLLEVIGFYFALVTLLFTLALVILSYMYIIRTILRIPSASQRKKAFSTCSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LLQLSCSDTWLLEVIGFYFALVTLLFTLALVILSYMYIIRTILRIPSASQRKKAFSTCSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 HMIVISISYGSCIFMYANPSAKEKASLTKGIAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HMIVISISYGSCIFMYANPSAKEKASLTKGIAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFKN
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 VVHKVVFYANQ
:::::::::::
CCDS31 VVHKVVFYANQ
310
>>CCDS31818.1 OR6C1 gene_id:390321|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1641 init1: 1596 opt: 1596 Z-score: 1198.6 bits: 229.9 E(32554): 1.9e-60
Smith-Waterman score: 1596; 74.8% identity (93.2% similar) in 309 aa overlap (2-310:3-311)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNHTMVTEFVLLGLSDDPDLQIVIFLFLFITYILSVTGNLTIITLTFVDSHLQTPMYFF
::: .:::.::::.:::..:.:::.::.:::.::.:::::.::.:..:::::::::::
CCDS31 MRNHTEITEFILLGLTDDPNFQVVIFVFLLITYMLSITGNLTLITITLLDSHLQTPMYFF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LRNFSFLEISFTTVCIPRFLGAIITRNKTISYNNCAAQLFFFIFMGVTEFYILTAMSYDR
:::::.:::::::: ::.::: ::. .::::.::: .::::::..::::::.:.::::::
CCDS31 LRNFSILEISFTTVSIPKFLGNIISGDKTISFNNCIVQLFFFILLGVTEFYLLAAMSYDR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 YVAICKPLHYTSIMNRKLCTLLVLCAWLSGFLTIFPPLMLLLQLDYCASNVIDHFACDYF
::::::::: :::::..:::::. .:: .:: ::: :::::.: :: ::.::::.::::
CCDS31 YVAICKPLHCLSIMNRRVCTLLVFTSWLVSFLIIFPALMLLLKLHYCRSNIIDHFTCDYF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 PLLQLSCSDTWLLEVIGFYFALVTLLFTLALVILSYMYIIRTILRIPSASQRKKAFSTCS
:::::.:::: .:::.:: : ::.:::::..:::.:::::::::::.::: :::::::
CCDS31 PLLQLACSDTKFLEVMGFSCAAFTLMFTLALIFLSYIYIIRTILRIPSTSQRTKAFSTCS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 SHMIVISISYGSCIFMYANPSAKEKASLTKGIAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFK
:::.:.::::::::::: .::::...::.::.::::::::::.:::::.::::::::::
CCDS31 SHMVVVSISYGSCIFMYIKPSAKDRVSLSKGVAILNTSVAPMMNPFIYSLRNQQVKQAFI
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 NVVHKVVFYANQ
:...:.::...
CCDS31 NMARKTVFFTST
310
>>CCDS31820.1 OR6C75 gene_id:390323|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1582 init1: 1532 opt: 1542 Z-score: 1159.0 bits: 222.6 E(32554): 3.1e-58
Smith-Waterman score: 1542; 71.9% identity (91.9% similar) in 310 aa overlap (2-311:3-312)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNHTMVTEFVLLGLSDDPDLQIVIFLFLFITYILSVTGNLTIITLTFVDSHLQTPMYFF
: : ::.:.::::..::. :.:.:.::..::.::::::: :::::. : :::::::::
CCDS31 MRNSTAVTDFILLGLTSDPQWQVVLFIFLLVTYMLSVTGNLIIITLTLSDPHLQTPMYFF
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pF1KB7 LRNFSFLEISFTTVCIPRFLGAIITRNKTISYNNCAAQLFFFIFMGVTEFYILTAMSYDR
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CCDS31 LRNFSFLEISFTSVCIPRFLVTVVTGNRTISYNGCVAQLFFFIFLGVTEFYLLAAMSYDR
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pF1KB7 YVAICKPLHYTSIMNRKLCTLLVLCAWLSGFLTIFPPLMLLLQLDYCASNVIDHFACDYF
.::::::::: ::. ..:::::. .::.::: ::::.:::::::.::::::::: ::
CCDS31 CMAICKPLHYTIIMSTRVCTLLVFSSWLAGFLIIFPPVMLLLQLDFCASNVIDHFICDSS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 PLLQLSCSDTWLLEVIGFYFALVTLLFTLALVILSYMYIIRTILRIPSASQRKKAFSTCS
:.:::::..: .::...:..:.:::. ::.:::::: ::::::.::: :::::::::::
CCDS31 PMLQLSCTNTHFLELMAFFLAVVTLMVTLTLVILSYTNIIRTILKIPSMSQRKKAFSTCS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 SHMIVISISYGSCIFMYANPSAKEKASLTKGIAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFK
:::::.::::.:::::: . ::.:...:.::.:.:::::::.::::::::::.:::::::
CCDS31 SHMIVVSISYSSCIFMYIKTSARERVTLSKGVAVLNTSVAPLLNPFIYTLRNKQVKQAFK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 NVVHKVVFYANQ
..:.:..: :.
CCDS31 SMVQKMIFSLNK
310
>>CCDS31823.1 OR6C76 gene_id:390326|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1546 init1: 1184 opt: 1499 Z-score: 1127.5 bits: 216.8 E(32554): 1.8e-56
Smith-Waterman score: 1499; 73.4% identity (91.1% similar) in 304 aa overlap (2-305:3-305)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNHTMVTEFVLLGLSDDPDLQIVIFLFLFITYILSVTGNLTIITLTFVDSHLQTPMYFF
:.: ::.:.::::.:.:.::.::: :::.::.::::::::::.::..::::.::::::
CCDS31 MKNRTSVTDFILLGLTDNPQLQVVIFSFLFLTYVLSVTGNLTIISLTLLDSHLKTPMYFF
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 LRNFSFLEISFTTVCIPRFLGAIITRNKTISYNNCAAQLFFFIFMGVTEFYILTAMSYDR
::::: ::::::.:: :::: .:.: .:.:::: ::::::::::.: :::..:..::::
CCDS31 LRNFS-LEISFTSVCNPRFLISILTGDKSISYNACAAQLFFFIFLGSTEFFLLASMSYDC
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 YVAICKPLHYTSIMNRKLCTLLVLCAWLSGFLTIFPPLMLLLQLDYCASNVIDHFACDYF
:::::::::::.::. ..: :.. .::.:::.::::: . ::::.: :::::::.::
CCDS31 YVAICKPLHYTTIMSDRICYQLIISSWLAGFLVIFPPLAMGLQLDFCDSNVIDHFTCDSA
120 130 140 150 160 170
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pF1KB7 PLLQLSCSDTWLLEVIGFYFALVTLLFTLALVILSYMYIIRTILRIPSASQRKKAFSTCS
::::.::.:: ::...: .:: ::. :: :::::: ::::::::::::.::::::::::
CCDS31 PLLQISCTDTSTLELMSFILALFTLISTLILVILSYTYIIRTILRIPSAQQRKKAFSTCS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 SHMIVISISYGSCIFMYANPSAKEKASLTKGIAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFK
::.::.:::::::::::.. :::: ..::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SHVIVVSISYGSCIFMYVKTSAKEGVALTKGVAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFK
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KB7 NVVHKVVFYANQ
.:..:.
CCDS31 DVLRKISHKKKKH
300 310
>>CCDS31816.1 OR6C74 gene_id:254783|Hs108|chr12 (312 aa)
initn: 1498 init1: 1478 opt: 1478 Z-score: 1112.1 bits: 213.9 E(32554): 1.3e-55
Smith-Waterman score: 1478; 68.8% identity (92.9% similar) in 308 aa overlap (2-309:3-310)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNHTMVTEFVLLGLSDDPDLQIVIFLFLFITYILSVTGNLTIITLTFVDSHLQTPMYFF
::: :..:.::::.:::.::..:::.::.::.::.::::::::::..: ::.::::::
CCDS31 MRNHTTVANFILLGLTDDPQLQVIIFLLLFFTYMLSITGNLTIITLTLLDLHLKTPMYFF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LRNFSFLEISFTTVCIPRFLGAIITRNKTISYNNCAAQLFFFIFMGVTEFYILTAMSYDR
::::::::.::::: ::.:: .. : .::::::.::::::: :..:.:::..:.::::.:
CCDS31 LRNFSFLEVSFTTVYIPKFLVSMATGDKTISYNDCAAQLFFTILLGATEFFLLAAMSYER
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 YVAICKPLHYTSIMNRKLCTLLVLCAWLSGFLTIFPPLMLLLQLDYCASNVIDHFACDYF
:::::::::::.::. ..:.:::. .:..::: :::::.. ::::.::.:..::: ::
CCDS31 YVAICKPLHYTTIMSSRVCSLLVFASWMAGFLIIFPPLLMGLQLDFCAANTVDHFFCDVS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 PLLQLSCSDTWLLEVIGFYFALVTLLFTLALVILSYMYIIRTILRIPSASQRKKAFSTCS
:.:::::.:: ..:.. . :..::: ::.:::::: ::::::.:::..::::::::::
CCDS31 PILQLSCTDTDIIELMMLLSAILTLLVTLVLVILSYTNIIRTILKIPSSQQRKKAFSTCS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 SHMIVISISYGSCIFMYANPSAKEKASLTKGIAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQAFK
:::.:.:::::::::::..:::::..::.::::.:.::::::::::::::::.:::..::
CCDS31 SHMVVVSISYGSCIFMYVKPSAKERVSLNKGIALLSTSVAPMLNPFIYTLRNKQVKDVFK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 NVVHKVVFYANQ
..:.:. ...
CCDS31 HTVKKIELFSMK
310
>>CCDS31827.1 OR6C4 gene_id:341418|Hs108|chr12 (309 aa)
initn: 1494 init1: 1435 opt: 1442 Z-score: 1085.8 bits: 209.0 E(32554): 3.7e-54
Smith-Waterman score: 1442; 67.5% identity (90.2% similar) in 305 aa overlap (2-306:3-307)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNHTMVTEFVLLGLSDDPDLQIVIFLFLFITYILSVTGNLTIITLTFVDSHLQTPMYFF
:.:: ::.::::...:.::..::.:::.::.::. :::::::::..: :::::::::
CCDS31 MKNRTMFGEFILLGLTNQPELQVMIFIFLFLTYMLSILGNLTIITLTLLDPHLQTPMYFF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
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. .....: ...
CCDS31 DSIKRIAFLSKK
310
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pF1KB7 NVVHKVVFYANQ
: .:.
CCDS31 AVFRKIFSASDK
310
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CCDS31 PILQISCTDTHVLELMSFTLAVVTLVVTLVLVILSYTCIIKTILKFSSAQQRNKAFSTCT
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CCDS31 DVLQKNLCFSKRPF
310
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CCDS58 LRNFSFLEISFTNIFIPRVLISITTGNKSISFAGCFTQYFFAMFLGATEFYLLAAMSYDR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]