Result of FASTA (omim) for
pF1KB7446
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7446, 311 aa
1>>>pF1KB7446 311 - 311 aa - 311 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3628+/-0.00062; mu= 15.6239+/- 0.038
mean_var=114.7409+/-31.122, 0's: 0 Z-trim(105.7): 357 B-trim: 1586 in 2/46
Lambda= 0.119733
statistics sampled from 13320 (13834) to 13320 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.494), E-opt: 0.2 (0.162), width: 16
Scan time: 5.780
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 889 165.6 1.2e-40
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XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 889 165.6 1.2e-40
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 880 164.0 3.5e-40
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 878 163.7 4.5e-40
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 869 162.1 1.3e-39
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NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 862 160.9 3.1e-39
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 862 160.9 3.1e-39
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 862 160.9 3.1e-39
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 844 157.8 2.6e-38
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 840 157.1 4.3e-38
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 833 155.9 9.7e-38
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 820 153.6 4.6e-37
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 812 152.3 1.2e-36
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 812 152.3 1.2e-36
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 800 150.2 5e-36
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 793 149.0 1.2e-35
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 771 145.2 1.6e-34
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 771 145.2 1.6e-34
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 525 102.7 1e-21
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 511 100.3 5.5e-21
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 216 49.3 1.2e-05
NP_001041 (OMIM: 182452) somatostatin receptor typ ( 369) 208 48.0 3.4e-05
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 207 48.0 4.6e-05
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 207 48.0 4.9e-05
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 206 47.8 4.9e-05
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 206 47.8 5e-05
NP_001040 (OMIM: 182451) somatostatin receptor typ ( 391) 205 47.5 5.1e-05
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 205 47.6 5.4e-05
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 201 46.8 7.6e-05
NP_001471 (OMIM: 600377) galanin receptor type 1 [ ( 349) 200 46.6 8.6e-05
NP_003599 (OMIM: 604620) psychosine receptor [Homo ( 337) 196 45.9 0.00014
XP_011515565 (OMIM: 188545) PREDICTED: thyrotropin ( 398) 193 45.5 0.00022
NP_003292 (OMIM: 188545) thyrotropin-releasing hor ( 398) 193 45.5 0.00022
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 193 45.5 0.00022
NP_005950 (OMIM: 125853,600804) melatonin receptor ( 362) 191 45.1 0.00026
XP_011541141 (OMIM: 125853,600804) PREDICTED: mela ( 362) 191 45.1 0.00026
XP_011509323 (OMIM: 602886) PREDICTED: G-protein c ( 293) 188 44.4 0.00032
NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 188 44.5 0.00036
NP_001499 (OMIM: 602886) G-protein coupled recepto ( 453) 188 44.7 0.00043
NP_000903 (OMIM: 165196) kappa-type opioid recepto ( 380) 187 44.4 0.00043
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 187 44.4 0.00045
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 186 44.2 0.00049
XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 186 44.3 0.00052
XP_016856594 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 186 44.3 0.00052
NP_001516 (OMIM: 602392) orexin receptor type 1 [H ( 425) 186 44.3 0.00052
NP_001154889 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339) 184 43.8 0.00057
NP_001154888 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339) 184 43.8 0.00057
XP_016859322 (OMIM: 603071) PREDICTED: uracil nucl ( 367) 184 43.9 0.0006
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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pF1KB7 AFKNVVHKVVFYANQ
:.:.:: .:::
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300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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pF1KB7 YDRYVAICKPLHYTSIMNRKLCTLLVLCAWLSGFLTIFPPLMLLLQLDYCASNVIDHFAC
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pF1KB7 DYFPLLQLSCSDTWLLEVIGFYFALVTLLFTLALVILSYMYIIRTILRIPSASQRKKAFS
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pF1KB7 TCSSHMIVISISYGSCIFMYANPSAKEKASLTKGIAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQ
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300 310
pF1KB7 AFKNVVHKVVFYANQ
:.:.:: .:::
XP_011 ALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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Smith-Waterman score: 889; 44.3% identity (75.9% similar) in 307 aa overlap (2-307:15-320)
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pF1KB7 MNHTMVTEFVLLGLSDDPDLQIVIFLFLFITYILSVTGNLTIITLTF
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:.. : ::::::.::. :. . :.. : .: :: ....: ..: : :.:::::::
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pF1KB7 YTLRNQQVKQAFKNVVHKVVFYANQ
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XP_011 YSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
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>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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pF1KB7 MNHTMVTEFVLLGLSDDPDLQIVIFLFLFITYILSVTGNLTIITLTFVDSHLQTP
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pF1KB7 MYFFLRNFSFLEISFTTVCIPRFLGAIITRNKTISYNNCAAQLFFFIFMGVTEFYILTAM
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:: :::.:::.:: ::: . : .. .. ..:.::..:. ..:.: : : :
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::.::::.::. ..: :. .:.:. :: . . : :... : :.:::.::.:::
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pF1KB7 QQVKQAFKNVVHKVVFYANQ
..::.: ..:... :
NP_006 KDVKDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
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pF1KB7 MNHTMVTEFVLLGLSDDP-DLQIVIFLFLFITYILSVTGNLTIITLTFVDSHLQTPM
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pF1KB7 YFFLRNFSFLEISFTTVCIPRFLGAIITRNKTISYNNCAAQLFFFIFMGVTEFYILTAMS
::::::.:::::.:. : .:..::...... :::. .::.:..::.:.::.: ..:..:.
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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pF1KB7 AFKNVVHKVVFYANQ
:.. . :::. :
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 869; 43.2% identity (74.9% similar) in 303 aa overlap (2-304:5-307)
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pF1KB7 MNHTMVTEFVLLGLSDDPDLQIVIFLFLFITYILSVTGNLTIITLTFVDSHLQTPMY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
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pF1KB7 DRYVAICKPLHYTSIMNRKLCTLLVLCAWLSGFLTIFPPLMLLLQLDYCASNVIDHFACD
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
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180 190 200 210 220 230
pF1KB7 YFPLLQLSCSDTWLLEVIGFYFALVTLLFTLALVILSYMYIIRTILRIPSASQRKKAFST
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
190 200 210 220 230 240
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 FKNVVHKVVFYANQ
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NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa)
initn: 875 init1: 829 opt: 862 Z-score: 825.6 bits: 160.9 E(85289): 3e-39
Smith-Waterman score: 862; 43.2% identity (76.1% similar) in 301 aa overlap (2-299:6-303)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNHTMVTEFVLLGLSDDPDLQIVIFLFLFITYILSVTGNLTIITLTFVDSHLQTPM
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NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
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pF1KB7 YDRYVAICKPLHYTSIMNRKLCTLLVLCAWLSGFLTIFPPLMLLLQLDYCASNVIDHFAC
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NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
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pF1KB7 DYFPLLQLSCSDTWLLEVIGFYFALVTLLFTLA---LVILSYMYIIRTILRIPSASQRKK
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NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMT---AILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSK
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pF1KB7 AFSTCSSHMIVISISYGSCIFMYANPSAKEKASLTKGIAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQ
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NP_001 AFNTCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKE
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300 310
pF1KB7 VKQAFKNVVHKVVFYANQ
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NP_001 IKDALKRLQKRKCC
300 310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 862; 41.3% identity (75.6% similar) in 303 aa overlap (2-304:5-307)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNHTMVTEFVLLGLSDDPDLQIVIFLFLFITYILSVTGNLTIITLTFVDSHLQTPMY
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NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KB7 FFLRNFSFLEISFTTVCIPRFLGAIITRNKTISYNNCAAQLFFFIFMGVTEFYILTAMSY
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NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KB7 DRYVAICKPLHYTSIMNRKLCTLLVLCAWLSGFLTIFPPLMLLLQLDYCASNVIDHFACD
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NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KB7 YFPLLQLSCSDTWLLEVIGFYFALVTLLFTLALVILSYMYIIRTILRIPSASQRKKAFST
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NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CSSHMIVISISYGSCIFMYANPSAKEKASLTKGIAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQA
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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300 310
pF1KB7 FKNVVHKVVFYANQ
..... :
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 862; 41.3% identity (75.6% similar) in 303 aa overlap (2-304:5-307)
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pF1KB7 MNHTMVTEFVLLGLSDDPDLQIVIFLFLFITYILSVTGNLTIITLTFVDSHLQTPMY
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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pF1KB7 FFLRNFSFLEISFTTVCIPRFLGAIITRNKTISYNNCAAQLFFFIFMGVTEFYILTAMSY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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pF1KB7 DRYVAICKPLHYTSIMNRKLCTLLVLCAWLSGFLTIFPPLMLLLQLDYCASNVIDHFACD
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
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pF1KB7 YFPLLQLSCSDTWLLEVIGFYFALVTLLFTLALVILSYMYIIRTILRIPSASQRKKAFST
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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300 310
pF1KB7 FKNVVHKVVFYANQ
..... :
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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10 20 30 40 50
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY
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XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY
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XP_011 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE
130 140 150 160 170 180
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XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 CSSHMIVISISYGSCIFMYANPSAKEKASLTKGIAILNTSVAPMLNPFIYTLRNQQVKQA
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300 310
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XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
311 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]