Result of FASTA (ccds) for pF1KB7633
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7633, 321 aa
  1>>>pF1KB7633 321 - 321 aa - 321 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2258+/-0.0019; mu= 8.0497+/- 0.114
 mean_var=267.4125+/-50.580, 0's: 0 Z-trim(105.2): 988  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.078430
 statistics sampled from 7219 (8294) to 7219 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.581), E-opt: 0.2 (0.255), width:  16
 Scan time:  1.820

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS12212.1 ZNF177 gene_id:7730|Hs108|chr19        ( 321) 2255 269.0 3.6e-72
CCDS54214.1 ZNF177 gene_id:7730|Hs108|chr19        ( 481) 1499 183.7 2.5e-46
CCDS7195.1 ZNF25 gene_id:219749|Hs108|chr10        ( 456) 1021 129.6 4.7e-30
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 665) 1000 127.4   3e-29
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 667) 1000 127.4   3e-29
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 692) 1000 127.5 3.1e-29
CCDS42504.1 ZNF709 gene_id:163051|Hs108|chr19      ( 641)  998 127.2 3.5e-29
CCDS46160.1 ZNF577 gene_id:84765|Hs108|chr19       ( 426)  995 126.6 3.5e-29
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 616)  990 126.3 6.3e-29
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 658)  990 126.3 6.6e-29
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 670)  990 126.3 6.6e-29
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 682)  990 126.3 6.7e-29
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5           ( 461)  987 125.7 6.8e-29
CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9           ( 630)  979 125.0 1.5e-28
CCDS65109.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9          ( 631)  979 125.0 1.5e-28
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9          ( 645)  979 125.0 1.5e-28
CCDS42640.1 ZNF586 gene_id:54807|Hs108|chr19       ( 402)  957 122.3 6.6e-28
CCDS12316.1 ZNF333 gene_id:84449|Hs108|chr19       ( 665)  959 122.8 7.5e-28
CCDS45984.2 ZNF878 gene_id:729747|Hs108|chr19      ( 531)  957 122.4 7.8e-28
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9          ( 364)  950 121.4 1.1e-27
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9          ( 474)  950 121.6 1.3e-27
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9           ( 498)  950 121.6 1.3e-27
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8         ( 539)  950 121.6 1.4e-27
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19      ( 475)  949 121.5 1.4e-27
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8         ( 560)  950 121.7 1.4e-27
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5       ( 563)  948 121.4 1.6e-27
CCDS12099.1 ZNF77 gene_id:58492|Hs108|chr19        ( 545)  947 121.3 1.7e-27
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5        ( 568)  945 121.1 2.1e-27
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5         ( 604)  945 121.2 2.1e-27
CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX         ( 620)  945 121.2 2.2e-27
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5        ( 620)  945 121.2 2.2e-27
CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX         ( 639)  945 121.2 2.2e-27
CCDS12972.1 ZNF329 gene_id:79673|Hs108|chr19       ( 541)  942 120.7 2.5e-27
CCDS12409.1 ZNF14 gene_id:7561|Hs108|chr19         ( 642)  943 121.0 2.6e-27
CCDS42495.1 ZNF699 gene_id:374879|Hs108|chr19      ( 642)  942 120.9 2.8e-27
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX          ( 779)  943 121.1 2.9e-27
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1          ( 470)  939 120.3   3e-27
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19      ( 536)  938 120.3 3.5e-27
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3        ( 754)  940 120.7 3.6e-27
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19      ( 592)  938 120.3 3.7e-27
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9        (1059)  942 121.2 3.7e-27
CCDS12211.1 ZNF559 gene_id:84527|Hs108|chr19       ( 538)  936 120.1 4.1e-27
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19      ( 580)  936 120.1 4.2e-27
CCDS62531.1 ZNF559 gene_id:84527|Hs108|chr19       ( 602)  936 120.1 4.3e-27
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12         ( 738)  937 120.4 4.5e-27
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19      ( 644)  936 120.2 4.5e-27
CCDS77773.1 ZNF717 gene_id:100131827|Hs108|chr3    ( 864)  938 120.6 4.5e-27
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9       ( 699)  935 120.1 5.1e-27
CCDS6354.1 ZNF572 gene_id:137209|Hs108|chr8        ( 529)  931 119.5 5.9e-27
CCDS43429.1 ZNF391 gene_id:346157|Hs108|chr6       ( 358)  927 118.8 6.5e-27


>>CCDS12212.1 ZNF177 gene_id:7730|Hs108|chr19             (321 aa)
 initn: 2255 init1: 2255 opt: 2255  Z-score: 1409.2  bits: 269.0 E(32554): 3.6e-72
Smith-Waterman score: 2255; 100.0% identity (100.0% similar) in 321 aa overlap (1-321:1-321)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MAAGWLTTWSQNSVTFQEVAVDFSQEEWALLDPAQKNLYKDVMLENFRNLASVGYQLCRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAAGWLTTWSQNSVTFQEVAVDFSQEEWALLDPAQKNLYKDVMLENFRNLASVGYQLCRH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 SLISKVDQEQLKTDERGILQGDCADWETQLKPKDTIAMQNIPGGKTSNGINTNCVRTHSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SLISKVDQEQLKTDERGILQGDCADWETQLKPKDTIAMQNIPGGKTSNGINTNCVRTHSG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 EMPYECSDCGKAFIFQSSLKKHMRSHTGEKPYECDHCGKSFSQSSHLNVHKRTHTGEKPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EMPYECSDCGKAFIFQSSLKKHMRSHTGEKPYECDHCGKSFSQSSHLNVHKRTHTGEKPY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 DCKECGKAFTVPSSLQKHVRTHTGEKPYECSDCGKAFIDQSSLKKHTRSHTGEKPYECNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DCKECGKAFTVPSSLQKHVRTHTGEKPYECSDCGKAFIDQSSLKKHTRSHTGEKPYECNQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 CGKSFSTGSYLIVHKRTHTGEKTYECKECGKAFRNSSCLRVHVRTHTGEKPYKCIQCEKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CGKSFSTGSYLIVHKRTHTGEKTYECKECGKAFRNSSCLRVHVRTHTGEKPYKCIQCEKA
              250       260       270       280       290       300

              310       320 
pF1KB7 FSTSTNLIMHKRIHNGQKLHE
       :::::::::::::::::::::
CCDS12 FSTSTNLIMHKRIHNGQKLHE
              310       320 

>>CCDS54214.1 ZNF177 gene_id:7730|Hs108|chr19             (481 aa)
 initn: 3279 init1: 1499 opt: 1499  Z-score: 945.1  bits: 183.7 E(32554): 2.5e-46
Smith-Waterman score: 1506; 70.6% identity (82.8% similar) in 326 aa overlap (7-321:162-481)

                                       10        20        30      
pF1KB7                         MAAGWLTTWSQNSVTFQEVAVDFSQEEWAL-LDPAQ
                                     :  :. :. . : ...:.. . :.  . . 
CCDS54 KNTRFICTRYCKGEKCYKYIKYSKVFNHPSTLRSHVSIHIGEKTLEFTDCRKAFNQESSL
             140       150       160       170       180       190 

          40        50        60        70        80        90     
pF1KB7 KNLYKDVMLENFRNLASVGYQLCRHSLISKVDQEQLKTDERGILQGDCADWETQLKPKDT
       ..  .    ..:..  .  ...  ::  :   .::. : :.:    .:.:.  ...: ..
CCDS54 RKHLRTPTGQKFQEYEQCDMSFSLHSSCSV--REQIPTGEKG---DECSDY-GKISPLSV
             200       210       220         230           240     

          100               110        120       130       140     
pF1KB7 -IAMQNIPGG-------KT-SNGINT-NCVRTHSGEMPYECSDCGKAFIFQSSLKKHMRS
            ..  :       :: .. ..  :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HTKTGSVEEGLECNEHEKTFTDPLSLQNCVRTHSGEMPYECSDCGKAFIFQSSLKKHMRS
         250       260       270       280       290       300     

         150       160       170       180       190       200     
pF1KB7 HTGEKPYECDHCGKSFSQSSHLNVHKRTHTGEKPYDCKECGKAFTVPSSLQKHVRTHTGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HTGEKPYECDHCGKSFSQSSHLNVHKRTHTGEKPYDCKECGKAFTVPSSLQKHVRTHTGE
         310       320       330       340       350       360     

         210       220       230       240       250       260     
pF1KB7 KPYECSDCGKAFIDQSSLKKHTRSHTGEKPYECNQCGKSFSTGSYLIVHKRTHTGEKTYE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KPYECSDCGKAFIDQSSLKKHTRSHTGEKPYECNQCGKSFSTGSYLIVHKRTHTGEKTYE
         370       380       390       400       410       420     

         270       280       290       300       310       320 
pF1KB7 CKECGKAFRNSSCLRVHVRTHTGEKPYKCIQCEKAFSTSTNLIMHKRIHNGQKLHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CKECGKAFRNSSCLRVHVRTHTGEKPYKCIQCEKAFSTSTNLIMHKRIHNGQKLHE
         430       440       450       460       470       480 

>--
 initn: 861 init1: 756 opt: 810  Z-score: 523.8  bits: 105.7 E(32554): 7.5e-23
Smith-Waterman score: 810; 77.1% identity (85.5% similar) in 166 aa overlap (1-165:1-161)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MAAGWLTTWSQNSVTFQEVAVDFSQEEWALLDPAQKNLYKDVMLENFRNLASVGYQLCRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MAAGWLTTWSQNSVTFQEVAVDFSQEEWALLDPAQKNLYKDVMLENFRNLASVGYQLCRH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 SLISKVDQEQLKTDERGILQGDCADWETQLKPKDTIAMQNIPGGKTSNGINTNCVRTHSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::  .... :
CCDS54 SLISKVDQEQLKTDERGILQGDCADWETQLKPKDTIAMQNIPGGKTSNGINT--AENQPG
               70        80        90       100       110          

              130       140        150       160       170         
pF1KB7 EMPYECSDCGKAFIFQSSLK-KHMRSHTGEKPYECDHCGKSFSQSSHLNVHKRTHTGEKP
       :   ::. :::   :... .    :   ::: :.  . .: :.. :              
CCDS54 EHSLECNHCGK---FRKNTRFICTRYCKGEKCYKYIKYSKVFNHPSTLRSHVSIHIGEKT
      120          130       140       150       160       170     

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB7 YDCKECGKAFTVPSSLQKHVRTHTGEKPYECSDCGKAFIDQSSLKKHTRSHTGEKPYECN
                                                                   
CCDS54 LEFTDCRKAFNQESSLRKHLRTPTGQKFQEYEQCDMSFSLHSSCSVREQIPTGEKGDECS
         180       190       200       210       220       230     

>>CCDS7195.1 ZNF25 gene_id:219749|Hs108|chr10             (456 aa)
 initn: 6004 init1: 996 opt: 1021  Z-score: 653.0  bits: 129.6 E(32554): 4.7e-30
Smith-Waterman score: 1021; 47.2% identity (73.0% similar) in 318 aa overlap (11-321:5-315)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MAAGWLTTWSQNSVTFQEVAVDFSQEEWALLDPAQKNLYKDVMLENFRNLASVGYQLCRH
                 :. ::...: :.:..::: :: :::..:::::::::. .:.::::.. . 
CCDS71       MNKFQGPVTLKDVIVEFTKEEWKLLTPAQRTLYKDVMLENYSHLVSVGYHVNKP
                     10        20        30        40        50    

               70        80        90       100              110   
pF1KB7 SLISKVDQEQLKTDERGILQGDCADWETQLKPKDTIAMQNIPG-------GKTSNGINTN
       . . :. : .    :  ::.   ...  .  :.:  ..... .       :.. ::  :.
CCDS71 NAVFKLKQGK----EPWILE---VEFPHRGFPEDLWSIHDLEARYQESQAGNSRNGELTK
           60            70           80        90       100       

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB7 CVRTHSGEMPYECSDCGKAFIFQSSLKKHMRSHTGEKPYECDHCGKSFSQSSHLNVHKRT
         .::. :   ::..::: :  .:.:  :...:.  : :.::.::::::..  :  :.. 
CCDS71 HQKTHTTEKACECKECGKFFCQKSALIVHQHTHSKGKSYDCDKCGKSFSKNEDLIRHQKI
       110       120       130       140       150       160       

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB7 HTGEKPYDCKECGKAFTVPSSLQKHVRTHTGEKPYECSDCGKAFIDQSSLKKHTRSHTGE
       :: .: :.:::: : :   :::..:.:::.:::::::..: :.: ..  : .: ..::::
CCDS71 HTRDKTYECKECKKIFYHLSSLSRHLRTHAGEKPYECNQCEKSFYQKPHLTEHQKTHTGE
       170       180       190       200       210       220       

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pF1KB7 KPYECNQCGKSFSTGSYLIVHKRTHTGEKTYECKECGKAFRNSSCLRVHVRTHTGEKPYK
       ::.::..::: : . .::.::..:::::: :::::::::: ..: : :: : ::::::::
CCDS71 KPFECTECGKFFYVKAYLMVHQKTHTGEKPYECKECGKAFSQKSHLTVHQRMHTGEKPYK
       230       240       250       260       270       280       

           300       310       320                                 
pF1KB7 CIQCEKAFSTSTNLIMHKRIHNGQKLHE                                
       : .: : :: ...:  :.: :.:.: .:                                
CCDS71 CKECGKFFSRNSHLKTHQRSHTGEKPYECKECRKCFYQKSALTVHQRTHTGEKPFECNKC
       290       300       310       320       330       340       

>--
 initn: 1435 init1: 575 opt: 575  Z-score: 380.3  bits: 79.1 E(32554): 7.3e-15
Smith-Waterman score: 611; 58.4% identity (81.0% similar) in 137 aa overlap (154-290:316-452)

           130       140       150       160       170       180   
pF1KB7 YECSDCGKAFIFQSSLKKHMRSHTGEKPYECDHCGKSFSQSSHLNVHKRTHTGEKPYDCK
                                     : .: : : :.: :.::.::::::::..:.
CCDS71 YKCKECGKFFSRNSHLKTHQRSHTGEKPYECKECRKCFYQKSALTVHQRTHTGEKPFECN
         290       300       310       320       330       340     

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pF1KB7 ECGKAFTVPSSLQKHVRTHTGEKPYECSDCGKAFIDQSSLKKHTRSHTGEKPYECNQCGK
       .:::.:   :.: :: : :::::::::..:::.:  .: :. : :.::::::: :..:::
CCDS71 KCGKTFYYKSDLTKHQRKHTGEKPYECTECGKSFAVNSVLRLHQRTHTGEKPYACKECGK
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pF1KB7 SFSTGSYLIVHKRTHTGEKTYECKECGKAFRNSSCLRVHVRTHTGEKPYKCIQCEKAFST
       :::  :..:.:.: ::::: :::.:::..: ..: : .: .::: ..             
CCDS71 SFSQKSHFIIHQRKHTGEKPYECQECGETFIQKSQLTAHQKTHTKKRNAEK         
         410       420       430       440       450               

           310       320 
pF1KB7 STNLIMHKRIHNGQKLHE

>>CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19             (665 aa)
 initn: 6147 init1: 1000 opt: 1000  Z-score: 638.5  bits: 127.4 E(32554): 3e-29
Smith-Waterman score: 1000; 66.0% identity (84.2% similar) in 203 aa overlap (116-318:430-632)

          90       100       110       120       130       140     
pF1KB7 WETQLKPKDTIAMQNIPGGKTSNGINTNCVRTHSGEMPYECSDCGKAFIFQSSLKKHMRS
                                     :::.:: ::::..:::.:: . .:  :.: 
CCDS62 HQRTHTGEKPYECNQCGKSFRQSYKLIAHQRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIAHQRI
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pF1KB7 HTGEKPYECDHCGKSFSQSSHLNVHKRTHTGEKPYDCKECGKAFTVPSSLQKHVRTHTGE
       :::::::::..:::::::: .: .:.::::::::..:..:::.:.  :.:  : ::::::
CCDS62 HTGEKPYECNQCGKSFSQSYKLVAHQRTHTGEKPFECNQCGKSFSWSSQLVAHQRTHTGE
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pF1KB7 KPYECSDCGKAFIDQSSLKKHTRSHTGEKPYECNQCGKSFSTGSYLIVHKRTHTGEKTYE
       ::::::.:::.:  .: :  : : ::::::::::::::::: .  :.::.::::::: ::
CCDS62 KPYECSECGKSFNRSSHLVMHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYE
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pF1KB7 CKECGKAFRNSSCLRVHVRTHTGEKPYKCIQCEKAFSTSTNLIMHKRIHNGQKLHE    
       :..:::.::.::::  : ::::::::..: :: :.:: :. ::.:.: :.:.:       
CCDS62 CSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPFECNQCGKTFSLSARLIVHQRTHTGEKPFTCIQC
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CCDS62 GKAFINSYKLIRHQATHTEEKLYECN
     640       650       660     

>--
 initn: 1608 init1: 558 opt: 572  Z-score: 376.8  bits: 79.0 E(32554): 1.1e-14
Smith-Waterman score: 614; 43.5% identity (69.2% similar) in 214 aa overlap (99-311:220-429)

       70        80        90       100       110        120       
pF1KB7 EQLKTDERGILQGDCADWETQLKPKDTIAMQNIPGGKTSNGINT-NCVRTHSGEMPYECS
                                     .:   ::  ..:.  . .::.. .  :  :
CCDS62 FHKHVSHAKKWHLNAAVNSHQKINENETLYENNECGKPPQSIHLIQFTRTQTKDKSYGFS
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       130       140       150       160       170       180       
pF1KB7 DCGKAFIFQSSLKKHMRSHTGEKPYECDHCGKSFSQSSHLNVHKRTHTGEKPYDCKECGK
       :  ..:   . :. : . : : : ..  .::. .. .   : ..:    :. : :.: ..
CCDS62 DRIQSFCHGTPLHIHEKIHGGGKTFDFKECGQVLNPKISHNEQQRIPFEESQYKCSETSH
     250       260       270       280       290       300         

       190       200       210       220       230       240       
pF1KB7 AFTVPSSLQKHVRTHTGEKPYECSDCGKAFIDQSSLKKHTRSHTGEKPYECNQCGKSFST
       .    ::: ...:... :::.::..:::.:  .: :  : :.:::::::::..:::::: 
CCDS62 S----SSLTQNMRNNSEEKPFECNQCGKSFSWSSHLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFSR
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       250       260       270       280       290       300       
pF1KB7 GSYLIVHKRTHTGEKTYECKECGKAFRNSSCLRVHVRTHTGEKPYKCIQCEKAFSTSTNL
       .:.:. :.::::::: :.:..:::.: .:  : :: :::::::::.: :: :.:  : .:
CCDS62 SSHLVSHQRTHTGEKPYRCNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECNQCGKSFRQSYKL
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       310       320                                               
pF1KB7 IMHKRIHNGQKLHE                                              
       : :.                                                        
CCDS62 IAHQRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIAHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYKLVAHQ
         430       440       450       460       470       480     

>>CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19             (667 aa)
 initn: 6147 init1: 1000 opt: 1000  Z-score: 638.5  bits: 127.4 E(32554): 3e-29
Smith-Waterman score: 1000; 66.0% identity (84.2% similar) in 203 aa overlap (116-318:432-634)

          90       100       110       120       130       140     
pF1KB7 WETQLKPKDTIAMQNIPGGKTSNGINTNCVRTHSGEMPYECSDCGKAFIFQSSLKKHMRS
                                     :::.:: ::::..:::.:: . .:  :.: 
CCDS62 HQRTHTGEKPYECNQCGKSFRQSYKLIAHQRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIAHQRI
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pF1KB7 HTGEKPYECDHCGKSFSQSSHLNVHKRTHTGEKPYDCKECGKAFTVPSSLQKHVRTHTGE
       :::::::::..:::::::: .: .:.::::::::..:..:::.:.  :.:  : ::::::
CCDS62 HTGEKPYECNQCGKSFSQSYKLVAHQRTHTGEKPFECNQCGKSFSWSSQLVAHQRTHTGE
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pF1KB7 KPYECSDCGKAFIDQSSLKKHTRSHTGEKPYECNQCGKSFSTGSYLIVHKRTHTGEKTYE
       ::::::.:::.:  .: :  : : ::::::::::::::::: .  :.::.::::::: ::
CCDS62 KPYECSECGKSFNRSSHLVMHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYE
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pF1KB7 CKECGKAFRNSSCLRVHVRTHTGEKPYKCIQCEKAFSTSTNLIMHKRIHNGQKLHE    
       :..:::.::.::::  : ::::::::..: :: :.:: :. ::.:.: :.:.:       
CCDS62 CSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPFECNQCGKTFSLSARLIVHQRTHTGEKPFTCIQC
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CCDS62 GKAFINSYKLIRHQATHTEEKLYECN
             650       660       

>--
 initn: 1600 init1: 558 opt: 572  Z-score: 376.8  bits: 79.0 E(32554): 1.1e-14
Smith-Waterman score: 614; 43.5% identity (69.2% similar) in 214 aa overlap (99-311:222-431)

       70        80        90       100       110        120       
pF1KB7 EQLKTDERGILQGDCADWETQLKPKDTIAMQNIPGGKTSNGINT-NCVRTHSGEMPYECS
                                     .:   ::  ..:.  . .::.. .  :  :
CCDS62 FHKHVSHAKKWHLNAAVNSHQKINENETLYENNECGKPPQSIHLIQFTRTQTKDKSYGFS
             200       210       220       230       240       250 

       130       140       150       160       170       180       
pF1KB7 DCGKAFIFQSSLKKHMRSHTGEKPYECDHCGKSFSQSSHLNVHKRTHTGEKPYDCKECGK
       :  ..:   . :. : . : : : ..  .::. .. .   : ..:    :. : :.: ..
CCDS62 DRIQSFCHGTPLHIHEKIHGGGKTFDFKECGQVLNPKISHNEQQRIPFEESQYKCSETSH
             260       270       280       290       300       310 

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pF1KB7 AFTVPSSLQKHVRTHTGEKPYECSDCGKAFIDQSSLKKHTRSHTGEKPYECNQCGKSFST
       .    ::: ...:... :::.::..:::.:  .: :  : :.:::::::::..:::::: 
CCDS62 S----SSLTQNMRNNSEEKPFECNQCGKSFSWSSHLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFSR
                 320       330       340       350       360       

       250       260       270       280       290       300       
pF1KB7 GSYLIVHKRTHTGEKTYECKECGKAFRNSSCLRVHVRTHTGEKPYKCIQCEKAFSTSTNL
       .:.:. :.::::::: :.:..:::.: .:  : :: :::::::::.: :: :.:  : .:
CCDS62 SSHLVSHQRTHTGEKPYRCNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECNQCGKSFRQSYKL
       370       380       390       400       410       420       

       310       320                                               
pF1KB7 IMHKRIHNGQKLHE                                              
       : :.                                                        
CCDS62 IAHQRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIAHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYKLVAHQ
       430       440       450       460       470       480       

>>CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19             (692 aa)
 initn: 6147 init1: 1000 opt: 1000  Z-score: 638.4  bits: 127.5 E(32554): 3.1e-29
Smith-Waterman score: 1000; 66.0% identity (84.2% similar) in 203 aa overlap (116-318:457-659)

          90       100       110       120       130       140     
pF1KB7 WETQLKPKDTIAMQNIPGGKTSNGINTNCVRTHSGEMPYECSDCGKAFIFQSSLKKHMRS
                                     :::.:: ::::..:::.:: . .:  :.: 
CCDS12 HQRTHTGEKPYECNQCGKSFRQSYKLIAHQRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIAHQRI
        430       440       450       460       470       480      

         150       160       170       180       190       200     
pF1KB7 HTGEKPYECDHCGKSFSQSSHLNVHKRTHTGEKPYDCKECGKAFTVPSSLQKHVRTHTGE
       :::::::::..:::::::: .: .:.::::::::..:..:::.:.  :.:  : ::::::
CCDS12 HTGEKPYECNQCGKSFSQSYKLVAHQRTHTGEKPFECNQCGKSFSWSSQLVAHQRTHTGE
        490       500       510       520       530       540      

         210       220       230       240       250       260     
pF1KB7 KPYECSDCGKAFIDQSSLKKHTRSHTGEKPYECNQCGKSFSTGSYLIVHKRTHTGEKTYE
       ::::::.:::.:  .: :  : : ::::::::::::::::: .  :.::.::::::: ::
CCDS12 KPYECSECGKSFNRSSHLVMHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYE
        550       560       570       580       590       600      

         270       280       290       300       310       320     
pF1KB7 CKECGKAFRNSSCLRVHVRTHTGEKPYKCIQCEKAFSTSTNLIMHKRIHNGQKLHE    
       :..:::.::.::::  : ::::::::..: :: :.:: :. ::.:.: :.:.:       
CCDS12 CSQCGKSFRQSSCLTQHQRTHTGEKPFECNQCGKTFSLSARLIVHQRTHTGEKPFTCIQC
        610       620       630       640       650       660      

CCDS12 GKAFINSYKLIRHQATHTEEKLYECN
        670       680       690  

>--
 initn: 1704 init1: 558 opt: 572  Z-score: 376.6  bits: 79.0 E(32554): 1.2e-14
Smith-Waterman score: 614; 43.5% identity (69.2% similar) in 214 aa overlap (99-311:247-456)

       70        80        90       100       110        120       
pF1KB7 EQLKTDERGILQGDCADWETQLKPKDTIAMQNIPGGKTSNGINT-NCVRTHSGEMPYECS
                                     .:   ::  ..:.  . .::.. .  :  :
CCDS12 FHKHVSHAKKWHLNAAVNSHQKINENETLYENNECGKPPQSIHLIQFTRTQTKDKSYGFS
        220       230       240       250       260       270      

       130       140       150       160       170       180       
pF1KB7 DCGKAFIFQSSLKKHMRSHTGEKPYECDHCGKSFSQSSHLNVHKRTHTGEKPYDCKECGK
       :  ..:   . :. : . : : : ..  .::. .. .   : ..:    :. : :.: ..
CCDS12 DRIQSFCHGTPLHIHEKIHGGGKTFDFKECGQVLNPKISHNEQQRIPFEESQYKCSETSH
        280       290       300       310       320       330      

       190       200       210       220       230       240       
pF1KB7 AFTVPSSLQKHVRTHTGEKPYECSDCGKAFIDQSSLKKHTRSHTGEKPYECNQCGKSFST
       .    ::: ...:... :::.::..:::.:  .: :  : :.:::::::::..:::::: 
CCDS12 S----SSLTQNMRNNSEEKPFECNQCGKSFSWSSHLVAHQRTHTGEKPYECSECGKSFSR
            340       350       360       370       380       390  

       250       260       270       280       290       300       
pF1KB7 GSYLIVHKRTHTGEKTYECKECGKAFRNSSCLRVHVRTHTGEKPYKCIQCEKAFSTSTNL
       .:.:. :.::::::: :.:..:::.: .:  : :: :::::::::.: :: :.:  : .:
CCDS12 SSHLVSHQRTHTGEKPYRCNQCGKSFSQSYVLVVHQRTHTGEKPYECNQCGKSFRQSYKL
            400       410       420       430       440       450  

       310       320                                               
pF1KB7 IMHKRIHNGQKLHE                                              
       : :.                                                        
CCDS12 IAHQRTHTGEKPYECNQCGKSFIQSYKLIAHQRIHTGEKPYECNQCGKSFSQSYKLVAHQ
            460       470       480       490       500       510  

>>CCDS42504.1 ZNF709 gene_id:163051|Hs108|chr19           (641 aa)
 initn: 9221 init1: 998 opt: 998  Z-score: 637.5  bits: 127.2 E(32554): 3.5e-29
Smith-Waterman score: 998; 64.6% identity (84.0% similar) in 206 aa overlap (116-321:384-589)

          90       100       110       120       130       140     
pF1KB7 WETQLKPKDTIAMQNIPGGKTSNGINTNCVRTHSGEMPYECSDCGKAFIFQSSLKKHMRS
                                     :::.:: ::::..:::::  .::.. : :.
CCDS42 HMIMHTGNGPYKCKECGKAFDCPSSFQIHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCSSSFRMHERT
           360       370       380       390       400       410   

         150       160       170       180       190       200     
pF1KB7 HTGEKPYECDHCGKSFSQSSHLNVHKRTHTGEKPYDCKECGKAFTVPSSLQKHVRTHTGE
       ::::::.:: .:::.:: :: . .:.:::::::::.::.:::::.  ::.. : : ::::
CCDS42 HTGEKPHECKQCGKAFSCSSSVRIHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCSSSFRMHERIHTGE
           420       430       440       450       460       470   

         210       220       230       240       250       260     
pF1KB7 KPYECSDCGKAFIDQSSLKKHTRSHTGEKPYECNQCGKSFSTGSYLIVHKRTHTGEKTYE
       :::::..:::::  .::.. : :.:::::::::.::::.:: .: . .:.::::::: ::
CCDS42 KPYECKQCGKAFSFSSSFRMHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCSSSFRMHERTHTGEKPYE
           480       490       500       510       520       530   

         270       280       290       300       310       320     
pF1KB7 CKECGKAFRNSSCLRVHVRTHTGEKPYKCIQCEKAFSTSTNLIMHKRIHNGQKLHE    
       ::.:::::  :: .:.: :::::::::.: :: :::: :... ::.: :.: : .:    
CCDS42 CKQCGKAFSCSSSIRIHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCSSSVRMHERTHTGVKPYECKQC
           540       550       560       570       580       590   

CCDS42 DKAFSCSRSFRIHERTHTGEKPYACQQCGKAFKCSRSFRIHERVHSGE
           600       610       620       630       640 

>--
 initn: 2263 init1: 905 opt: 905  Z-score: 580.6  bits: 116.7 E(32554): 5.1e-26
Smith-Waterman score: 1075; 51.1% identity (74.3% similar) in 319 aa overlap (12-318:2-306)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MAAGWLTTWSQNSVTFQEVAVDFSQEEWALLDPAQKNLYKDVMLENFRNLASVGYQLCRH
                  .::.:..:::.:.::::::: :.::.::.::: :.: ::::.: .  ..
CCDS42           MDSVVFEDVAVNFTQEEWALLGPSQKKLYRDVMQETFVNLASIGENWEEK
                         10        20        30        40        50

                70        80         90       100       110        
pF1KB7 SLISKVDQ-EQLKTDERGILQGDCADWE-TQLKPKDTIAMQNIPGGKTSNGINTNCVRTH
       .. .. .: ..:..    ...  :   : .:.   .::..   :. : ..       .: 
CCDS42 NIEDHKNQGRKLRSH---MVERLCERKEGSQFG--ETISQT--PNPKPNK-------KTF
               60           70        80            90             

      120       130       140                 150       160        
pF1KB7 SGEMPYECSDCGKAFIFQSSLKKHMRSHT----------GEKPYECDHCGKSFSQSSHLN
       .   ::::: ::: .. .:::..::::::          ::: ::: .::: ::  : . 
CCDS42 TRVKPYECSVCGKDYMCHSSLNRHMRSHTEHRSYEYHKYGEKSYECKECGKRFSFRSSFR
        100       110       120       130       140       150      

      170       180       190       200       210       220        
pF1KB7 VHKRTHTGEKPYDCKECGKAFTVPSSLQKHVRTHTGEKPYECSDCGKAFIDQSSLKKHTR
       .:.::::::::: ::.:::::. :::.: : :::::::::::..:::::: ..... : :
CCDS42 IHERTHTGEKPYKCKQCGKAFSWPSSFQIHERTHTGEKPYECKECGKAFIYHTTFRGHMR
        160       170       180       190       200       210      

      230       240       250       260       270       280        
pF1KB7 SHTGEKPYECNQCGKSFSTGSYLIVHKRTHTGEKTYECKECGKAFRNSSCLRVHVRTHTG
        :::::::.:..:::.::  : .  :.:::.::: ::::.::::::  . ...: :::::
CCDS42 MHTGEKPYKCKECGKTFSHPSSFRNHERTHSGEKPYECKQCGKAFRYYQTFQIHERTHTG
        220       230       240       250       260       270      

      290       300       310       320                            
pF1KB7 EKPYKCIQCEKAFSTSTNLIMHKRIHNGQKLHE                           
       ::::.: :: ::.:  :..  :.:::.:.:                              
CCDS42 EKPYQCKQCGKALSCPTSFRSHERIHTGEKPYKCKKCGKAFSFPSSFRKHERIHTGEKPY
        280       290       300       310       320       330      

>>CCDS46160.1 ZNF577 gene_id:84765|Hs108|chr19            (426 aa)
 initn: 1631 init1: 832 opt: 995  Z-score: 637.4  bits: 126.6 E(32554): 3.5e-29
Smith-Waterman score: 995; 48.2% identity (72.5% similar) in 305 aa overlap (11-314:20-317)

                        10        20        30        40        50 
pF1KB7          MAAGWLTTWSQNSVTFQEVAVDFSQEEWALLDPAQKNLYKDVMLENFRNLA
                          ..:..:..::: :..::: .:: .:: :::.:::::. ::.
CCDS46 MKNATIVMSVRREQGSSSGEGSLSFEDVAVGFTREEWQFLDQSQKVLYKEVMLENYINLV
               10        20        30        40        50        60

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB7 SVGYQLCRHSLISKVDQEQLKTDERGILQGDCADWETQLKPKDTIAMQNIPGGKTSNGIN
       :.::.  . . . :..:     .  :: .:     ..:. :       .. :   :   .
CCDS46 SIGYRGTKPDSLFKLEQ----GEPPGIAEGAA---HSQICPGGKPHECSVCGRAFSRKAQ
               70            80           90       100       110   

              120       130       140       150       160       170
pF1KB7 T-NCVRTHSGEMPYECSDCGKAFIFQSSLKKHMRSHTGEKPYECDHCGKSFSQSSHLNVH
         .  ::. :: :. :..:::.:. . .: .:.:.::::::.::..:::.::..:.: ::
CCDS46 LIQHQRTERGEKPHGCGECGKTFMRKIQLTEHQRTHTGEKPHECSECGKAFSRKSQLMVH
           120       130       140       150       160       170   

              180       190       200       210       220       230
pF1KB7 KRTHTGEKPYDCKECGKAFTVPSSLQKHVRTHTGEKPYECSDCGKAFIDQSSLKKHTRSH
       .::::::::: :..:::::.    :..: :.::::: : :: ::::: ... :  : : :
CCDS46 QRTHTGEKPYRCSKCGKAFSRKCRLNRHQRSHTGEKLYGCSVCGKAFSQKAYLTAHQRLH
           180       190       200       210       220       230   

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pF1KB7 TGEKPYECNQCGKSFSTGSYLIVHKRTHTGEKTYECKECGKAFRNSSCLRVHVRTHTGEK
       ::.:::.:..::..:   : :  :.: ::::: :::.:: ::::..: :  : ::::::.
CCDS46 TGDKPYKCSDCGRTFYFKSDLTRHQRIHTGEKPYECSECEKAFRSKSKLIQHQRTHTGER
           240       250       260       270       280       290   

              300       310       320                              
pF1KB7 PYKCIQCEKAFSTSTNLIMHKRIHNGQKLHE                             
       ::.: .: :::.  . :: :.. :                                    
CCDS46 PYSCRECGKAFAHMSVLIKHEKTHIRETAINSLTVEKPSSRSHTSLYMSELIQEQKTVNT
           300       310       320       330       340       350   

>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (616 aa)
 initn: 8304 init1: 989 opt: 990  Z-score: 632.8  bits: 126.3 E(32554): 6.3e-29
Smith-Waterman score: 990; 62.3% identity (79.1% similar) in 220 aa overlap (104-321:234-453)

            80        90       100       110         120       130 
pF1KB7 DERGILQGDCADWETQLKPKDTIAMQNIPGGKTSNGINT--NCVRTHSGEMPYECSDCGK
                                     :.: : :    .  :::.:: :::::.:::
CCDS74 ECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGK
           210       220       230       240       250       260   

             140       150       160       170       180       190 
pF1KB7 AFIFQSSLKKHMRSHTGEKPYECDHCGKSFSQSSHLNVHKRTHTGEKPYDCKECGKAFTV
       .: :.::...: :.:::::::::..:::.: :: ::. : : :::::::.: ::::::. 
CCDS74 SFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSH
           270       280       290       300       310       320   

             200       210       220       230       240       250 
pF1KB7 PSSLQKHVRTHTGEKPYECSDCGKAFIDQSSLKKHTRSHTGEKPYECNQCGKSFSTGSYL
        ::: :: : ::::::::: .::::: . . : .: :.:::::::::..:::.:: .. :
CCDS74 SSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLL
           330       340       350       360       370       380   

             260       270       280       290       300       310 
pF1KB7 IVHKRTHTGEKTYECKECGKAFRNSSCLRVHVRTHTGEKPYKCIQCEKAFSTSTNLIMHK
         :.: ::::: : :.::::.: .:: :  : :::::::::.: :: :::  ::.: .:.
CCDS74 TEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQ
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       :::.:.: .:                                                  
CCDS74 RIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHT
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>--
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                                     :.::::::  .::: ::.: :::::::::.
CCDS74 YECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECN
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       .::..::: . :  :.: :::::::.:..::.::.  : : .: : :: :::: :..:::
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       .:  .:::..: :.:::::::::..:::::  ...:  :.: ::::: : :..::::: .
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       :: :  : :::::                                 
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       .: :.::...: :.:::::::::..:::.: :: ::. : : :::::::.: ::::::. 
CCDS74 SFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSH
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        ::: :: : ::::::::: .::::: . . : .: :.:::::::::..:::.:: .. :
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CCDS74 TEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQ
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pF1KB7 IAMQNIPGGKTSNGINTNCVRTHSGEMPYECSDCGKAFIFQSSLKKHMRSHTGEKPYECD
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CCDS74 YECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECN
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pF1KB7 HCGKSFSQSSHLNVHKRTHTGEKPYDCKECGKAFTVPSSLQKHVRTHTGEKPYECSDCGK
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       .:  .:::..: :.:::::::::..:::::  ...:  :.: ::::: : :..::::: .
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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