Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7648
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7648, 392 aa
1>>>pF1KB7648 392 - 392 aa - 392 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0723+/-0.000844; mu= 18.7050+/- 0.051
mean_var=71.6431+/-15.021, 0's: 0 Z-trim(107.3): 25 B-trim: 575 in 2/49
Lambda= 0.151526
statistics sampled from 9458 (9474) to 9458 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.291), width: 16
Scan time: 2.740
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS58734.1 CERS6 gene_id:253782|Hs108|chr2 ( 392) 2736 607.2 8e-174
CCDS2228.1 CERS6 gene_id:253782|Hs108|chr2 ( 384) 2644 587.1 8.9e-168
CCDS8801.1 CERS5 gene_id:91012|Hs108|chr12 ( 392) 1777 397.6 1e-110
CCDS61120.1 CERS5 gene_id:91012|Hs108|chr12 ( 334) 1581 354.7 7.2e-98
CCDS973.1 CERS2 gene_id:29956|Hs108|chr1 ( 380) 1063 241.5 9.7e-64
CCDS12197.1 CERS4 gene_id:79603|Hs108|chr19 ( 394) 1062 241.3 1.2e-63
CCDS10384.1 CERS3 gene_id:204219|Hs108|chr15 ( 383) 1012 230.4 2.2e-60
CCDS46021.1 CERS1 gene_id:10715|Hs108|chr19 ( 337) 258 65.5 8.3e-11
CCDS46020.1 CERS1 gene_id:10715|Hs108|chr19 ( 350) 258 65.5 8.6e-11
>>CCDS58734.1 CERS6 gene_id:253782|Hs108|chr2 (392 aa)
initn: 2736 init1: 2736 opt: 2736 Z-score: 3234.2 bits: 607.2 E(32554): 8e-174
Smith-Waterman score: 2736; 100.0% identity (100.0% similar) in 392 aa overlap (1-392:1-392)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAGILAWFWNERFWLPHNVTWADLKNTEEATFPQAEDLYLAFPLAFCIFMVRLIFERFVA
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CCDS58 MAGILAWFWNERFWLPHNVTWADLKNTEEATFPQAEDLYLAFPLAFCIFMVRLIFERFVA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KPCAIALNIQANGPQIAPPNAILEKVFTAITKHPDEKRLEGLSKQLDWDVRSIQRWFRQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KPCAIALNIQANGPQIAPPNAILEKVFTAITKHPDEKRLEGLSKQLDWDVRSIQRWFRQR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RNQEKPSTLTRFCESMWRFSFYLYVFTYGVRFLKKTPWLWNTRHCWYNYPYQPLTTDLHY
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CCDS58 RNQEKPSTLTRFCESMWRFSFYLYVFTYGVRFLKKTPWLWNTRHCWYNYPYQPLTTDLHY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 YYILELSFYWSLMFSQFTDIKRKDFGIMFLHHLVSIFLITFSYVNNMARVGTLVLCLHDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YYILELSFYWSLMFSQFTDIKRKDFGIMFLHHLVSIFLITFSYVNNMARVGTLVLCLHDS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 ADALLEAAKMANYAKFQKMCDLLFVMFAVVFITTRLGIFPLWVLNTTLFESWEIVGPYPS
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CCDS58 ADALLEAAKMANYAKFQKMCDLLFVMFAVVFITTRLGIFPLWVLNTTLFESWEIVGPYPS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 WWVFNLLLLLVQGLNCFWSYLIVKIACKAVSRGKAGKWNPLHVSKDDRSDIESSSDEEDS
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CCDS58 WWVFNLLLLLVQGLNCFWSYLIVKIACKAVSRGKAGKWNPLHVSKDDRSDIESSSDEEDS
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB7 EPPGKNPHTATTTNGTSGTNGYLLTGSCSMDD
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CCDS58 EPPGKNPHTATTTNGTSGTNGYLLTGSCSMDD
370 380 390
>>CCDS2228.1 CERS6 gene_id:253782|Hs108|chr2 (384 aa)
initn: 2343 init1: 2343 opt: 2644 Z-score: 3125.6 bits: 587.1 E(32554): 8.9e-168
Smith-Waterman score: 2644; 98.0% identity (98.0% similar) in 392 aa overlap (1-392:1-384)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAGILAWFWNERFWLPHNVTWADLKNTEEATFPQAEDLYLAFPLAFCIFMVRLIFERFVA
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CCDS22 MAGILAWFWNERFWLPHNVTWADLKNTEEATFPQAEDLYLAFPLAFCIFMVRLIFERFVA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KPCAIALNIQANGPQIAPPNAILEKVFTAITKHPDEKRLEGLSKQLDWDVRSIQRWFRQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 KPCAIALNIQANGPQIAPPNAILEKVFTAITKHPDEKRLEGLSKQLDWDVRSIQRWFRQR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RNQEKPSTLTRFCESMWRFSFYLYVFTYGVRFLKKTPWLWNTRHCWYNYPYQPLTTDLHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 RNQEKPSTLTRFCESMWRFSFYLYVFTYGVRFLKKTPWLWNTRHCWYNYPYQPLTTDLHY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 YYILELSFYWSLMFSQFTDIKRKDFGIMFLHHLVSIFLITFSYVNNMARVGTLVLCLHDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 YYILELSFYWSLMFSQFTDIKRKDFGIMFLHHLVSIFLITFSYVNNMARVGTLVLCLHDS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 ADALLEAAKMANYAKFQKMCDLLFVMFAVVFITTRLGIFPLWVLNTTLFESWEIVGPYPS
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CCDS22 ADALLEAAKMANYAKFQKMCDLLFVMFAVVFITTRLGIFPLWVLNTTLFESWEIVGPYPS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 WWVFNLLLLLVQGLNCFWSYLIVKIACKAVSRGKAGKWNPLHVSKDDRSDIESSSDEEDS
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CCDS22 WWVFNLLLLLVQGLNCFWSYLIVKIACKAVSRGK--------VSKDDRSDIESSSDEEDS
310 320 330 340 350
370 380 390
pF1KB7 EPPGKNPHTATTTNGTSGTNGYLLTGSCSMDD
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 EPPGKNPHTATTTNGTSGTNGYLLTGSCSMDD
360 370 380
>>CCDS8801.1 CERS5 gene_id:91012|Hs108|chr12 (392 aa)
initn: 1776 init1: 1538 opt: 1777 Z-score: 2101.2 bits: 397.6 E(32554): 1e-110
Smith-Waterman score: 1777; 63.8% identity (86.8% similar) in 378 aa overlap (7-383:15-384)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAGILAWFWNERFWLPHNVTWADLKNTEEAT-FPQAEDLYLAFPLAFCIFMV
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CCDS88 MATAAQGPLSLLWGWLWSERFWLPENVSWADLEGPADGYGYPRGRHILSVFPLAAGIFFV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 RLIFERFVAKPCAIALNIQANGPQIAPPNAILEKVFTAITKHPDEKRLEGLSKQLDWDVR
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CCDS88 RLLFERFIAKPCALCIGIEDSGPYQAQPNAILEKVFISITKYPDKKRLEGLSKQLDWNVR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 SIQRWFRQRRNQEKPSTLTRFCESMWRFSFYLYVFTYGVRFLKKTPWLWNTRHCWYNYPY
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CCDS88 KIQCWFRHRRNQDKPPTLTKFCESMWRFTFYLCIFCYGIRFLWSSPWFWDIRQCWHNYPF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 QPLTTDLHYYYILELSFYWSLMFSQFTDIKRKDFGIMFLHHLVSIFLITFSYVNNMARVG
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CCDS88 QPLSSGLYHYYIMELAFYWSLMFSQFTDIKRKDFLIMFVHHLVTIGLISFSYINNMVRVG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 TLVLCLHDSADALLEAAKMANYAKFQKMCDLLFVMFAVVFITTRLGIFPLWVLNTTLFES
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CCDS88 TLIMCLHDVSDFLLEAAKLANYAKYQRLCDTLFVIFSAVFMVTRLGIYPFWILNTTLFES
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 WEIVGPYPSWWVFNLLLLLVQGLNCFWSYLIVKIACKAVSRGKAGKWNPLHVSKDDRSDI
:::.::: :::..: ::: .: :. .:::::..:: ::. ::: ::::::::.
CCDS88 WEIIGPYASWWLLNGLLLTLQLLHVIWSYLIARIALKALIRGK--------VSKDDRSDV
310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB7 ESSSDEEDSEPPGKNPHTATTTNGTSGTNGYLLTGSCSMDD
::::.::: :.: ....::.. .::..
CCDS88 ESSSEEEDVTTCTKSPCDSSSSNGANRVNGHMGGSYWAEE
360 370 380 390
>>CCDS61120.1 CERS5 gene_id:91012|Hs108|chr12 (334 aa)
initn: 1652 init1: 1470 opt: 1581 Z-score: 1870.6 bits: 354.7 E(32554): 7.2e-98
Smith-Waterman score: 1581; 65.5% identity (87.5% similar) in 328 aa overlap (56-383:7-326)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 NTEEATFPQAEDLYLAFPLAFCIFMVRLIFERFVAKPCAIALNIQANGPQIAPPNAILEK
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CCDS61 MMKPRPKRFIAKPCALCIGIEDSGPYQAQPNAILEK
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 VFTAITKHPDEKRLEGLSKQLDWDVRSIQRWFRQRRNQEKPSTLTRFCESMWRFSFYLYV
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CCDS61 VFISITKYPDKKRLEGLSKQLDWNVRKIQCWFRHRRNQDKPPTLTKFCESMWRFTFYLCI
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 FTYGVRFLKKTPWLWNTRHCWYNYPYQPLTTDLHYYYILELSFYWSLMFSQFTDIKRKDF
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CCDS61 FCYGIRFLWSSPWFWDIRQCWHNYPFQPLSSGLYHYYIMELAFYWSLMFSQFTDIKRKDF
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 GIMFLHHLVSIFLITFSYVNNMARVGTLVLCLHDSADALLEAAKMANYAKFQKMCDLLFV
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CCDS61 LIMFVHHLVTIGLISFSYINNMVRVGTLIMCLHDVSDFLLEAAKLANYAKYQRLCDTLFV
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 MFAVVFITTRLGIFPLWVLNTTLFESWEIVGPYPSWWVFNLLLLLVQGLNCFWSYLIVKI
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CCDS61 IFSAVFMVTRLGIYPFWILNTTLFESWEIIGPYASWWLLNGLLLTLQLLHVIWSYLIARI
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 ACKAVSRGKAGKWNPLHVSKDDRSDIESSSDEEDSEPPGKNPHTATTTNGTSGTNGYLLT
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CCDS61 ALKALIRGK--------VSKDDRSDVESSSEEEDVTTCTKSPCDSSSSNGANRVNGHMGG
280 290 300 310 320
390
pF1KB7 GSCSMDD
CCDS61 SYWAEE
330
>>CCDS973.1 CERS2 gene_id:29956|Hs108|chr1 (380 aa)
initn: 1123 init1: 1039 opt: 1063 Z-score: 1257.8 bits: 241.5 E(32554): 9.7e-64
Smith-Waterman score: 1063; 43.0% identity (72.1% similar) in 358 aa overlap (7-364:8-359)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAGILAWFWNERFWLPHNVTWADLKNTEEATFPQAEDLYLAFPLAFCIFMVRLIFERFV
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CCDS97 MLQTLYDYFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIVRYFFELYV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 AKPCAIALNIQANGPQIAPPNAILEKVFTAITKHPDEKRLEGLSKQLDWDVRSIQRWFRQ
: : : :::. . ::::: ::. . . :.: . ..: ::.: . :...::::.
CCDS97 ATPLAALLNIKEKTRLRAPPNATLEHFYLTSGKQPKQVEVELLSRQSGLSGRQVERWFRR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 RRNQEKPSTLTRFCESMWRFSFYLYVFTYGVRFLKKTPWLWNTRHCWYNYPYQPLTTDLH
::::..:: : .: :. :::.::: .: :. . ::... .. : .:: : . .
CCDS97 RRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDMKKVWEGYPIQSTIPSQY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 YYYILELSFYWSLMFSQFTDIKRKDFGIMFLHHLVSIFLITFSYVNNMARVGTLVLCLHD
.::..::::::::.:: .:.::::: ...::...:.::.::. :. :.:::.. :::
CCDS97 WYYMIELSFYWSLLFSIASDVKRKDFKEQIIHHVATIILISFSWFANYIRAGTLIMALHD
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 SADALLEAAKMANYAKFQKMCDLLFVMFAVVFITTRLGIFPLWVLNTTLFESWEIVGPYP
:.: :::.::: ::: ... :. .:..::.::: ::: :.:.:.:. :: :. .
CCDS97 SSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIVFAIVFIITRLVILPFWILHCTLVYPLELYPAFF
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 SWWVFNLLLLLVQGLNCFWSYLIVKIACKAVSRGKAGKWNPLHVSKDDRSDIESSSDEED
... :: .. ..: :. ::.:::...: : .. :: .. ..:: . ::: ::
CCDS97 GYYFFNSMMGVLQLLHIFWAYLILRMAHKFIT-GKL-----VEDERSDREETESSEGEEA
310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB7 SEPPGKNPHTATTTNGTSGTNGYLLTGSCSMDD
. :
CCDS97 AAGGGAKSRPLANGHPILNNNHRKND
360 370 380
>>CCDS12197.1 CERS4 gene_id:79603|Hs108|chr19 (394 aa)
initn: 1067 init1: 1029 opt: 1062 Z-score: 1256.4 bits: 241.3 E(32554): 1.2e-63
Smith-Waterman score: 1064; 42.5% identity (69.4% similar) in 372 aa overlap (7-378:8-368)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAGILAWFWNERFWLPHNVTWADLKNTEEATFPQAEDLYLAFPLAFCIFMVRLIFERFV
:::..::::: ::::..:.. . ..:. .:: :.:::. .. .:: ::::.
CCDS12 MLSSFNEWFWQDRFWLPPNVTWTELEDRDGRVYPHPQDLLAALPLALVLLAMRLAFERFI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 AKPCAIALNIQANGPQIAPPNAILEKVFTAITKHPDEKRLEGLSKQLDWDVRSIQRWFRQ
. : . :... . . . ::: ::: : . ..: : .: :. : ... :::::.
CCDS12 GLPLSRWLGVRDQTRRQVKPNATLEKHFLTEGHRPKEPQLSLLAAQCGLTLQQTQRWFRR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 RRNQEKPSTLTRFCESMWRFSFYLYVFTYGVRFLKKTPWLWNTRHCWYNYPYQPLTTDLH
::::..:. .:::. ::: ::: :. :. : . ::: :: :: : : .:.
CCDS12 RRNQDRPQLTKKFCEASWRFLFYLSSFVGGLSVLYHESWLWAPVMCWDRYPNQTLKPSLY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 YYYILELSFYWSLMFSQFTDIKRKDFGIMFLHHLVSIFLITFSYVNNMARVGTLVLCLHD
..:.:::.:: ::.. :.::::: . .::.:...:.:::: :. :.:.::: :::
CCDS12 WWYLLELGFYLSLLIRLPFDVKRKDFKEQVIHHFVAVILMTFSYSANLLRIGSLVLLLHD
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 SADALLEAAKMANYAKFQKMCDLLFVMFAVVFITTRLGIFPLWVLNTTLFESWEIVGPYP
:.: :::: ::.:: ..:..:: ::..:. ::. ::: .:: .: :: .:: ::.
CCDS12 SSDYLLEACKMVNYMQYQQVCDALFLIFSFVFFYTRLVLFPTQILYTTYYESISNRGPFF
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 SWWVFNLLLLLVQGLNCFWSYLIVKIACKAVSRGKAGKWNPLHVSKDDRSDIESSSDEED
... :: ::.:.: :. ::: ::... . ...:. . :: :::.: :.. :.
CCDS12 GYYFFNGLLMLLQLLHVFWSCLILRMLYSFMKKGQ--------MEKDIRSDVEESDSSEE
310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB7 SEPPGKNPHTATTTNGTSGTNGYLLTGSCSMDD
. ...: ::..:
CCDS12 AAA-AQEP--LQLKNGAAGGPRPAPTDGPRSRVAGRLTNRHTTAT
360 370 380 390
>>CCDS10384.1 CERS3 gene_id:204219|Hs108|chr15 (383 aa)
initn: 1093 init1: 793 opt: 1012 Z-score: 1197.5 bits: 230.4 E(32554): 2.2e-60
Smith-Waterman score: 1014; 40.6% identity (69.6% similar) in 355 aa overlap (7-361:8-352)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAGILAWFWNERFWLPHNVTWADLKNTEEATFPQAEDLYLAFPLAFCIFMVRLIFERFV
::: :::::: .. :.::.. . .: . ::...: :: ....: .::.::
CCDS10 MFWTFKEWFWLERFWLPPTIKWSDLEDHDGLVFVKPSHLYVTIPYAFLLLIIRRVFEKFV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 AKPCAIALNIQANGPQIAPPNAILEKVFTAITKHPDEKRLEGLSKQLDWDVRSIQRWFRQ
:.: : ...:. . ...: :..::. : :..: . . ::.:. . :...::::.
CCDS10 ASPLAKSFGIKETVRKVTP-NTVLENFFKHSTRQPLQTDIYGLAKKCNLTERQVERWFRS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 RRNQEKPSTLTRFCESMWRFSFYLYVFTYGVRFLKKTPWLWNTRHCWYNYPYQPLTTDLH
:::::.:: : .: :. :::.:::.. . :. :: :::.. . : .:: ::: . .
CCDS10 RRNQERPSRLKKFQEACWRFAFYLMITVAGIAFLYDKPWLYDLWEVWNGYPKQPLLPSQY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 YYYILELSFYWSLMFSQFTDIKRKDFGIMFLHHLVSIFLITFSYVNNMARVGTLVLCLHD
.:::::.::::::.: :.::::: ..:::..: :..::. :. : ::::. .::
CCDS10 WYYILEMSFYWSLLFRLGFDVKRKDFLAHIIHHLAAISLMSFSWCANYIRSGTLVMIVHD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 SADALLEAAKMANYAKFQKMCDLLFVMFAVVFITTRLGIFPLWVLNTTLFESWEIVGPYP
:: ::.::: .:: . . :. :: .:...:. .:: .::.:.: ::. . :.
CCDS10 VADIWLESAKMFSYAGWTQTCNTLFFIFSTIFFISRLIVFPFWILYCTLILPMYHLEPFF
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