Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7654
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7654, 371 aa
1>>>pF1KB7654 371 - 371 aa - 371 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5487+/-0.000802; mu= 12.4944+/- 0.049
mean_var=118.7499+/-23.248, 0's: 0 Z-trim(112.2): 45 B-trim: 104 in 1/52
Lambda= 0.117695
statistics sampled from 12957 (13001) to 12957 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.764), E-opt: 0.2 (0.399), width: 16
Scan time: 3.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6588.1 CREB3 gene_id:10488|Hs108|chr9 ( 371) 2453 427.0 1.3e-119
CCDS58029.1 CREB3L4 gene_id:148327|Hs108|chr1 ( 375) 519 98.7 9.1e-21
CCDS1056.1 CREB3L4 gene_id:148327|Hs108|chr1 ( 395) 519 98.7 9.4e-21
CCDS62499.1 CREB3L3 gene_id:84699|Hs108|chr19 ( 459) 508 96.9 3.9e-20
CCDS62500.1 CREB3L3 gene_id:84699|Hs108|chr19 ( 460) 508 96.9 3.9e-20
CCDS12121.1 CREB3L3 gene_id:84699|Hs108|chr19 ( 461) 508 96.9 3.9e-20
CCDS53620.1 CREB3L1 gene_id:90993|Hs108|chr11 ( 519) 387 76.4 6.5e-14
CCDS34760.1 CREB3L2 gene_id:64764|Hs108|chr7 ( 520) 378 74.8 1.9e-13
>>CCDS6588.1 CREB3 gene_id:10488|Hs108|chr9 (371 aa)
initn: 2453 init1: 2453 opt: 2453 Z-score: 2261.2 bits: 427.0 E(32554): 1.3e-119
Smith-Waterman score: 2453; 100.0% identity (100.0% similar) in 371 aa overlap (1-371:1-371)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MELELDAGDQDLLAFLLEESGDLGTAPDEAVRAPLDWALPLSEVPSDWEVDDLLCSLLSP
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CCDS65 MELELDAGDQDLLAFLLEESGDLGTAPDEAVRAPLDWALPLSEVPSDWEVDDLLCSLLSP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PASLNILSSSNPCLVHHDHTYSLPRETVSMDLESESCRKEGTQMTPQHMEELAEQEIARL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 PASLNILSSSNPCLVHHDHTYSLPRETVSMDLESESCRKEGTQMTPQHMEELAEQEIARL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 VLTDEEKSLLEKEGLILPETLPLTKTEEQILKRVRRKIRNKRSAQESRRKKKVYVGGLES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 VLTDEEKSLLEKEGLILPETLPLTKTEEQILKRVRRKIRNKRSAQESRRKKKVYVGGLES
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 RVLKYTAQNMELQNKVQLLEEQNLSLLDQLRKLQAMVIEISNKTSSSSTCILVLLVSFCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 RVLKYTAQNMELQNKVQLLEEQNLSLLDQLRKLQAMVIEISNKTSSSSTCILVLLVSFCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LLVPAMYSSDTRGSLPAEHGVLSRQLRALPSEDPYQLELPALQSEVPKDSTHQWLDGSDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LLVPAMYSSDTRGSLPAEHGVLSRQLRALPSEDPYQLELPALQSEVPKDSTHQWLDGSDC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 VLQAPGNTSCLLHYMPQAPSAEPPLEWPFPDLFSEPLCRGPILPLQANLTRKGGWLPTGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 VLQAPGNTSCLLHYMPQAPSAEPPLEWPFPDLFSEPLCRGPILPLQANLTRKGGWLPTGS
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB7 PSVILQDRYSG
:::::::::::
CCDS65 PSVILQDRYSG
370
>>CCDS58029.1 CREB3L4 gene_id:148327|Hs108|chr1 (375 aa)
initn: 534 init1: 488 opt: 519 Z-score: 486.3 bits: 98.7 E(32554): 9.1e-21
Smith-Waterman score: 519; 46.6% identity (72.1% similar) in 204 aa overlap (120-319:167-360)
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 MDLESESCRKEGTQMTPQHMEELAEQEIARLVLTDEEKSLLEKEGLILPETLPLTKTEEQ
: :::::: :: .::. :: :::::.::.
CCDS58 ELPFDAHAHILPRAGTVAPVPCTTLLPCQTLFLTDEEKRLLGQEGVSLPSHLPLTKAEER
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 ILKRVRRKIRNKRSAQESRRKKKVYVGGLESRVLKYTAQNMELQNKVQLLEEQNLSLLDQ
.::.::::::::.:::.:::.:: :. :::::: .:::.:::.::: ::..:.::. :
CCDS58 VLKKVRRKIRNKQSAQDSRRRKKEYIDGLESRVAACSAQNQELQKKVQELERHNISLVAQ
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 LRKLQAMVIEISNKTSSSSTCILVLLVSFCLLLVPAMYSSDTRGSLPAE----HGVLSRQ
::.::... . :::....:::.:.:: :. :...:.. ..: .: ::: ::.
CCDS58 LRQLQTLIAQTSNKAAQTSTCVLILLFSLALIILPSFSPFQSRPEAGSEDYQPHGVTSRN
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 LRALPSEDPYQLELPALQSEVPKDSTHQWLDGSDCVLQAPGNTSCLLHYMPQAPSAEPPL
. : .: . :...: .. .. ..: : :.: ::. : :
CCDS58 I--LTHKDVTE----NLETQVVESRLREPPGAKD----ANGSTRTLLEKMGGKPRPSGRI
320 330 340 350 360
330 340 350 360 370
pF1KB7 EWPFPDLFSEPLCRGPILPLQANLTRKGGWLPTGSPSVILQDRYSG
CCDS58 RSVLHADEM
370
>>CCDS1056.1 CREB3L4 gene_id:148327|Hs108|chr1 (395 aa)
initn: 534 init1: 488 opt: 519 Z-score: 486.0 bits: 98.7 E(32554): 9.4e-21
Smith-Waterman score: 519; 46.6% identity (72.1% similar) in 204 aa overlap (120-319:187-380)
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 MDLESESCRKEGTQMTPQHMEELAEQEIARLVLTDEEKSLLEKEGLILPETLPLTKTEEQ
: :::::: :: .::. :: :::::.::.
CCDS10 ELPFDAHAHILPRAGTVAPVPCTTLLPCQTLFLTDEEKRLLGQEGVSLPSHLPLTKAEER
160 170 180 190 200 210
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 ILKRVRRKIRNKRSAQESRRKKKVYVGGLESRVLKYTAQNMELQNKVQLLEEQNLSLLDQ
.::.::::::::.:::.:::.:: :. :::::: .:::.:::.::: ::..:.::. :
CCDS10 VLKKVRRKIRNKQSAQDSRRRKKEYIDGLESRVAACSAQNQELQKKVQELERHNISLVAQ
220 230 240 250 260 270
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 LRKLQAMVIEISNKTSSSSTCILVLLVSFCLLLVPAMYSSDTRGSLPAE----HGVLSRQ
::.::... . :::....:::.:.:: :. :...:.. ..: .: ::: ::.
CCDS10 LRQLQTLIAQTSNKAAQTSTCVLILLFSLALIILPSFSPFQSRPEAGSEDYQPHGVTSRN
280 290 300 310 320 330
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 LRALPSEDPYQLELPALQSEVPKDSTHQWLDGSDCVLQAPGNTSCLLHYMPQAPSAEPPL
. : .: . :...: .. .. ..: : :.: ::. : :
CCDS10 I--LTHKDVTE----NLETQVVESRLREPPGAKD----ANGSTRTLLEKMGGKPRPSGRI
340 350 360 370 380
330 340 350 360 370
pF1KB7 EWPFPDLFSEPLCRGPILPLQANLTRKGGWLPTGSPSVILQDRYSG
CCDS10 RSVLHADEM
390
>>CCDS62499.1 CREB3L3 gene_id:84699|Hs108|chr19 (459 aa)
initn: 561 init1: 503 opt: 508 Z-score: 475.0 bits: 96.9 E(32554): 3.9e-20
Smith-Waterman score: 508; 47.3% identity (74.7% similar) in 186 aa overlap (120-298:211-396)
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 MDLESESCRKEGTQMTPQHMEELAEQEIARLVLTDEEKSLLEKEGLILPETLPLTKTEEQ
::::..::.:: :::. :: ::::: ::.
CCDS62 KDLLLSGSSGDLHHLGASYLLRPGAGHCQELVLTEDEKKLLAKEGITLPTQLPLTKYEER
190 200 210 220 230 240
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 ILKRVRRKIRNKRSAQESRRKKKVYVGGLESRVLKYTAQNMELQNKVQLLEEQNLSLLDQ
.::..:::::::.::::::.::: :. :::.:. ::::.::: :: ::.::::::.:
CCDS62 VLKKIRRKIRNKQSAQESRKKKKEYIDGLETRMSACTAQNQELQRKVLHLEKQNLSLLEQ
250 260 270 280 290 300
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 LRKLQAMVIEISNKTSSSSTCILVLLVSFCLLLVPAMYS-SDTRGSLPAEHG---VLSRQ
:.::::.:.. ..:.....::. :::.:: :...:.. . .. :.. . :.::
CCDS62 LKKLQAIVVQSTSKSAQTGTCVAVLLLSFALIILPSISPFGPNKTESPGDFAPVRVFSRT
310 320 330 340 350 360
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 LRALPSEDPYQLELPALQSEVPK---DSTHQWLDGSDCVLQAPGNTSCLLHYMPQAPSAE
:. . .:. .. :. :.:.. ::
CCDS62 LHNDAASRVAADAVPGSEAPGPRPEADTTREESPGSPGADWGFQDTANLTNSTEELDNAT
370 380 390 400 410 420
330 340 350 360 370
pF1KB7 PPLEWPFPDLFSEPLCRGPILPLQANLTRKGGWLPTGSPSVILQDRYSG
CCDS62 LVLRNATEGLGQVALLDWVAPGPSTGSGRAGLEAAGDEL
430 440 450
>>CCDS62500.1 CREB3L3 gene_id:84699|Hs108|chr19 (460 aa)
initn: 561 init1: 503 opt: 508 Z-score: 475.0 bits: 96.9 E(32554): 3.9e-20
Smith-Waterman score: 508; 47.3% identity (74.7% similar) in 186 aa overlap (120-298:212-397)
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 MDLESESCRKEGTQMTPQHMEELAEQEIARLVLTDEEKSLLEKEGLILPETLPLTKTEEQ
::::..::.:: :::. :: ::::: ::.
CCDS62 LLLSGSSGDLQQHHLGASYLLRPGAGHCQELVLTEDEKKLLAKEGITLPTQLPLTKYEER
190 200 210 220 230 240
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 ILKRVRRKIRNKRSAQESRRKKKVYVGGLESRVLKYTAQNMELQNKVQLLEEQNLSLLDQ
.::..:::::::.::::::.::: :. :::.:. ::::.::: :: ::.::::::.:
CCDS62 VLKKIRRKIRNKQSAQESRKKKKEYIDGLETRMSACTAQNQELQRKVLHLEKQNLSLLEQ
250 260 270 280 290 300
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 LRKLQAMVIEISNKTSSSSTCILVLLVSFCLLLVPAMYS-SDTRGSLPAEHG---VLSRQ
:.::::.:.. ..:.....::. :::.:: :...:.. . .. :.. . :.::
CCDS62 LKKLQAIVVQSTSKSAQTGTCVAVLLLSFALIILPSISPFGPNKTESPGDFAPVRVFSRT
310 320 330 340 350 360
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 LRALPSEDPYQLELPALQSEVPK---DSTHQWLDGSDCVLQAPGNTSCLLHYMPQAPSAE
:. . .:. .. :. :.:.. ::
CCDS62 LHNDAASRVAADAVPGSEAPGPRPEADTTREESPGSPGADWGFQDTANLTNSTEELDNAT
370 380 390 400 410 420
330 340 350 360 370
pF1KB7 PPLEWPFPDLFSEPLCRGPILPLQANLTRKGGWLPTGSPSVILQDRYSG
CCDS62 LVLRNATEGLGQVALLDWVAPGPSTGSGRAGLEAAGDEL
430 440 450 460
>>CCDS12121.1 CREB3L3 gene_id:84699|Hs108|chr19 (461 aa)
initn: 561 init1: 503 opt: 508 Z-score: 475.0 bits: 96.9 E(32554): 3.9e-20
Smith-Waterman score: 508; 47.3% identity (74.7% similar) in 186 aa overlap (120-298:213-398)
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 MDLESESCRKEGTQMTPQHMEELAEQEIARLVLTDEEKSLLEKEGLILPETLPLTKTEEQ
::::..::.:: :::. :: ::::: ::.
CCDS12 LLLSGSSGDLQQHHLGASYLLRPGAGHCQELVLTEDEKKLLAKEGITLPTQLPLTKYEER
190 200 210 220 230 240
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 ILKRVRRKIRNKRSAQESRRKKKVYVGGLESRVLKYTAQNMELQNKVQLLEEQNLSLLDQ
.::..:::::::.::::::.::: :. :::.:. ::::.::: :: ::.::::::.:
CCDS12 VLKKIRRKIRNKQSAQESRKKKKEYIDGLETRMSACTAQNQELQRKVLHLEKQNLSLLEQ
250 260 270 280 290 300
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 LRKLQAMVIEISNKTSSSSTCILVLLVSFCLLLVPAMYS-SDTRGSLPAEHG---VLSRQ
:.::::.:.. ..:.....::. :::.:: :...:.. . .. :.. . :.::
CCDS12 LKKLQAIVVQSTSKSAQTGTCVAVLLLSFALIILPSISPFGPNKTESPGDFAPVRVFSRT
310 320 330 340 350 360
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 LRALPSEDPYQLELPALQSEVPK---DSTHQWLDGSDCVLQAPGNTSCLLHYMPQAPSAE
:. . .:. .. :. :.:.. ::
CCDS12 LHNDAASRVAADAVPGSEAPGPRPEADTTREESPGSPGADWGFQDTANLTNSTEELDNAT
370 380 390 400 410 420
330 340 350 360 370
pF1KB7 PPLEWPFPDLFSEPLCRGPILPLQANLTRKGGWLPTGSPSVILQDRYSG
CCDS12 LVLRNATEGLGQVALLDWVAPGPSTGSGRAGLEAAGDEL
430 440 450 460
>>CCDS53620.1 CREB3L1 gene_id:90993|Hs108|chr11 (519 aa)
initn: 341 init1: 341 opt: 387 Z-score: 363.3 bits: 76.4 E(32554): 6.5e-14
Smith-Waterman score: 389; 35.2% identity (58.0% similar) in 307 aa overlap (26-327:173-451)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MELELDAGDQDLLAFLLEESGDLGTAPDEAVRAPLDWALPLSEVPSDWEV--DDL
:: : .. :. : :: :: . .: .::
CCDS53 APSAMAAAAAMATTPLLGLSPLSRLPIPHQAPGEMTQLPVIKAEPL-EVNQFLKVTPEDL
150 160 170 180 190 200
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LCSLLSPPASLNILSSSNPCLVHHDHTYSLPRETVSMDLESESCRKEGTQMTPQHMEELA
. .::.: . :.:. .. : : . : : . .:.... .
CCDS53 VQMPPTPPSSHG--SDSDGSQSPRSLPPSSPVRP--MARSSTAISTSPLLTAPHKLQGTS
210 220 230 240 250
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 EQEIARLVLTDEEKSLLEKEGLILPETLPLTKTEEQILKRVRRKIRNKRSAQESRRKKKV
. :.::.::: : :: .: :::::.::. ::::::::.:: ::::::::::
CCDS53 ----GPLLLTEEEKRTLIAEGYPIPTKLPLTKAEEKALKRVRRKIKNKISAQESRRKKKE
260 270 280 290 300 310
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 YVGGLESRVLKYTAQNMELQNKVQLLEEQNLSLLDQLRKLQAMVI-EISN--KTSSSSTC
:: ::..: .:..: :: .::. ::. : .::.::.:::..: .:: : ....:
CCDS53 YVECLEKKVETFTSENNELWKKVETLENANRTLLQQLQKLQTLVTNKISRPYKMAATQTG
320 330 340 350 360 370
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 ILVLLVSFCLLLVPAMYSSDTRGSLPAEHGVLSRQLRALPSEDPYQLELPALQSEVPKDS
......:..:: .. :: : . :. .. ::: . :..:. :
CCDS53 TCLMVAALCFVLV----LGSLVPCLP-EFSSGSQTVK----EDPLAADGVYTASQMPSRS
380 390 400 410 420
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 THQWLDGSDCVLQAPGNTSCLLHYMPQAPSAEPPLEWPFPDLFSEPLCRGPILPLQANLT
. ::. : : .. : :. ::: :
CCDS53 LLFYDDGAG--LWEDGRSTLL----PM----EPPDGWEINPGGPAEQRPRDHLQHDHLDS
430 440 450 460 470
360 370
pF1KB7 RKGGWLPTGSPSVILQDRYSG
CCDS53 THETTKYLSEAWPKDGGNGTSPDFSHSKEWFHDRDLGPNTTIKLS
480 490 500 510
>>CCDS34760.1 CREB3L2 gene_id:64764|Hs108|chr7 (520 aa)
initn: 342 init1: 342 opt: 378 Z-score: 355.0 bits: 74.8 E(32554): 1.9e-13
Smith-Waterman score: 392; 37.1% identity (63.7% similar) in 237 aa overlap (41-261:188-415)
20 30 40 50 60
pF1KB7 DLLAFLLEESGDLGTAPDEAVRAPLDWALPLSEVPSDWEVDDLLCSLLSPPASLNILS--
:. :.. :: : .::.: . :
CCDS34 PPLEMNTGVDSSCQTIIPKIKLEPHEVDQFLNFSPKEAPVDHLHLPP-TPPSSHGSDSEG
160 170 180 190 200 210
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 --SSNPCLVHHDHTYSLPRETVSMDLESESCRKEGTQMT--PQHMEELAEQEIARLVLTD
: :: : : .::: .: : :.. . . .. : : . ::::.
CCDS34 SLSPNPRL----HPFSLP-QTHS---PSRAAPRAPSALSSSPLLTAPHKLQGSGPLVLTE
220 230 240 250 260
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 EEKSLLEKEGLILPETLPLTKTEEQILKRVRRKIRNKRSAQESRRKKKVYVGGLESRVLK
::: : :: .: :::.:.::. ::..::::.:: :::::::::: :. .::..: .
CCDS34 EEKRTLIAEGYPIPTKLPLSKSEEKALKKIRRKIKNKISAQESRRKKKEYMDSLEKKVES
270 280 290 300 310 320
190 200 210 220 230
pF1KB7 YTAQNMELQNKVQLLEEQNLSLLDQLRKLQAMVIEISNKT-----SSSSTCILVLLVSFC
...:.::..::..::. : .::.::.:::..:. ..: ....::..:... :
CCDS34 CSTENLELRKKVEVLENTNRTLLQQLQKLQTLVMGKVSRTCKLAGTQTGTCLMVVVLCFA
330 340 350 360 370 380
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 LLLVPAM-----YSSDTRGSLPAEHGVLSRQLRALPSEDPYQLELPALQSEVPKDSTHQW
. . . : : :. .::..:..
CCDS34 VAFGSFFQGYGPYPSATKMALPSQHSLQEPYTASVVRSRNLLIYEEHSPPEESSSPGSAG
390 400 410 420 430 440
371 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 09:07:34 2016 done: Fri Nov 4 09:07:35 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]