Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7656
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7656, 394 aa
1>>>pF1KB7656 394 - 394 aa - 394 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8434+/-0.00102; mu= 16.3243+/- 0.062
mean_var=116.4773+/-24.692, 0's: 0 Z-trim(107.9): 23 B-trim: 372 in 1/50
Lambda= 0.118838
statistics sampled from 9839 (9852) to 9839 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.642), E-opt: 0.2 (0.303), width: 16
Scan time: 2.820
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10384.1 CERS3 gene_id:204219|Hs108|chr15 ( 383) 2673 469.3 2.7e-132
CCDS973.1 CERS2 gene_id:29956|Hs108|chr1 ( 380) 1438 257.5 1.4e-68
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CCDS2228.1 CERS6 gene_id:253782|Hs108|chr2 ( 384) 1032 187.9 1.3e-47
CCDS58734.1 CERS6 gene_id:253782|Hs108|chr2 ( 392) 1012 184.5 1.4e-46
CCDS61120.1 CERS5 gene_id:91012|Hs108|chr12 ( 334) 895 164.4 1.4e-40
>>CCDS10384.1 CERS3 gene_id:204219|Hs108|chr15 (383 aa)
initn: 2673 init1: 2673 opt: 2673 Z-score: 2488.7 bits: 469.3 E(32554): 2.7e-132
Smith-Waterman score: 2673; 99.7% identity (99.7% similar) in 383 aa overlap (12-394:1-383)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLHTTARRAARMFWTFKEWFWLERFWLPPTIKWSDLEDHDGLVFVKPSHLYVTIPYAFLL
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10 20 30 40
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CCDS10 LIIRRVFEKFVASPLAKSFGIKETVRKVTPNTVLENFFKHSTRQPLQTDIYGLAKKCNLT
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pF1KB7 ERQVERWFRSRRNQERPSRLKKFQEACWRFAFYLMITVAGIAFLYDKPWLYDLWEVWNGY
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CCDS10 ERQVERWFRSRRNQERPSRLKKFQEACWRFAFYLMITVAGIAFLYDKPWLYDLWEVWNGY
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
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CCDS10 PKQPLLPSQYWYYILEMSFYWSLLFRLGFDVKRKDFLAHIIHHLAAISLMSFSWCANYIR
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CCDS10 SGTLVMIVHDVADIWLESAKMFSYAGWTQTCNTLFFIFSTIFFISRLIVFPFWILYCTLI
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LPMYHLEPFFSYIFLNLQLMILQVLHLYWGYYILKMLNRCIFMKSIQDVRSDDEDYEEEE
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CCDS10 LPMYHLEPFFSYIFLNLQLMILQVLHLYWGYYILKMLNRCIFMKSIQDVRSDDEDYEEEE
290 300 310 320 330 340
370 380 390
pF1KB7 EEEEEEATKGKEMDCLKNGLGAERHLIPNGQHGH
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CCDS10 EEEEEEATKGKEMDCLKNGLRAERHLIPNGQHGH
350 360 370 380
>>CCDS973.1 CERS2 gene_id:29956|Hs108|chr1 (380 aa)
initn: 1198 init1: 1156 opt: 1438 Z-score: 1344.4 bits: 257.5 E(32554): 1.4e-68
Smith-Waterman score: 1438; 52.6% identity (77.5% similar) in 382 aa overlap (12-392:1-376)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLHTTARRAARMFWTFKEWFWLERFWLPPTIKWSDLEDHDGLVFVKPSHLYVTIPYAFLL
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CCDS97 MLQTLYDYFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLF
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB7 LIIRRVFEKFVASPLAKSFGIKETVR-KVTPNTVLENFFKHSTRQPLQTDIYGLAKKCNL
::.: :: .::.::: ..::: .: .. ::..::.:. : .:: :... :... .:
CCDS97 LIVRYFFELYVATPLAALLNIKEKTRLRAPPNATLEHFYLTSGKQPKQVEVELLSRQSGL
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 TERQVERWFRSRRNQERPSRLKKFQEACWRFAFYLMITVAGIAFLYDKPWLYDLWEVWNG
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CCDS97 SGRQVERWFRRRRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDMKKVWEG
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 YPKQPLLPSQYWYYILEMSFYWSLLFRLGFDVKRKDFLAHIIHHLAAISLMSFSWCANYI
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CCDS97 YPIQSTIPSQYWYYMIELSFYWSLLFSIASDVKRKDFKEQIIHHVATIILISFSWFANYI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 RSGTLVMIVHDVADIWLESAKMFSYAGWTQTCNTLFFIFSTIFFISRLIVFPFWILYCTL
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CCDS97 RAGTLIMALHDSSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIVFAIVFIITRLVILPFWILHCTL
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 ILPMYHLEPFFSYIFLNLQLMILQVLHLYWGYYILKMLNRCIFMKSIQDVRSDDEDYEEE
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CCDS97 VYPLELYPAFFGYYFFNSMMGVLQLLHIFWAYLILRMAHKFITGKLVEDERSDREE-TES
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390
pF1KB7 EEEEEEEATKGKEMDCLKNGLGAERHLIPNGQHGH
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CCDS97 SEGEEAAAGGGAKSRPLANG-----HPILNNNHRKND
350 360 370 380
>>CCDS12197.1 CERS4 gene_id:79603|Hs108|chr19 (394 aa)
initn: 907 init1: 870 opt: 1187 Z-score: 1111.7 bits: 214.5 E(32554): 1.3e-55
Smith-Waterman score: 1187; 46.4% identity (71.9% similar) in 384 aa overlap (12-390:1-377)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLHTTARRAARMFWTFKEWFWLERFWLPPTIKWSDLEDHDGLVFVKPSHLYVTIPYAFLL
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CCDS12 MLSSFNEWFWQDRFWLPPNVTWTELEDRDGRVYPHPQDLLAALPLALVL
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB7 LIIRRVFEKFVASPLAKSFGIKE-TVRKVTPNTVLENFFKHSTRQPLQTDIYGLAKKCNL
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CCDS12 LAMRLAFERFIGLPLSRWLGVRDQTRRQVKPNATLEKHFLTEGHRPKEPQLSLLAAQCGL
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 TERQVERWFRSRRNQERPSRLKKFQEACWRFAFYLMITVAGIAFLYDKPWLYDLWEVWNG
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CCDS12 TLQQTQRWFRRRRNQDRPQLTKKFCEASWRFLFYLSSFVGGLSVLYHESWLWAPVMCWDR
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 YPKQPLLPSQYWYYILEMSFYWSLLFRLGFDVKRKDFLAHIIHHLAAISLMSFSWCANYI
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CCDS12 YPNQTLKPSLYWWYLLELGFYLSLLIRLPFDVKRKDFKEQVIHHFVAVILMTFSYSANLL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 RSGTLVMIVHDVADIWLESAKMFSYAGWTQTCNTLFFIFSTIFFISRLIVFPFWILYCTL
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CCDS12 RIGSLVLLLHDSSDYLLEACKMVNYMQYQQVCDALFLIFSFVFFYTRLVLFPTQILYTTY
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 ILPMYHLEPFFSYIFLNLQLMILQVLHLYWGYYILKMLNRCIFMKSIQ---DVRSDDEDY
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CCDS12 YESISNRGPFFGYYFFNGLLMLLQLLHVFWSCLILRMLYS--FMKKGQMEKDIRSD----
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390
pF1KB7 EEEEEEEEEEATKGKEMDCLKNGL-GAERHLIPNGQHGH
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CCDS12 -VEESDSSEEAAAAQEPLQLKNGAAGGPRPAPTDGPRSRVAGRLTNRHTTAT
350 360 370 380 390
>>CCDS8801.1 CERS5 gene_id:91012|Hs108|chr12 (392 aa)
initn: 981 init1: 841 opt: 1056 Z-score: 990.3 bits: 192.1 E(32554): 7.7e-49
Smith-Waterman score: 1056; 42.4% identity (70.5% similar) in 363 aa overlap (2-361:1-360)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MLHTTARRAARMFWTFKEWFWLERFWLPPTIKWSDLEDH-DGLVFVKPSHLYVTIPYAFL
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CCDS88 MATAAQGPLSLLWG---WLWSERFWLPENVSWADLEGPADGYGYPRGRHILSVFPLAAG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LLIIRRVFEKFVASPLAKSFGIKET-VRKVTPNTVLENFFKHSTRQPLQTDIYGLAKKCN
....: .::.:.:.: : .::... .. ::..::. : :. : . . ::.:. .
CCDS88 IFFVRLLFERFIAKPCALCIGIEDSGPYQAQPNAILEKVFISITKYPDKKRLEGLSKQLD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LTERQVERWFRSRRNQERPSRLKKFQEACWRFAFYLMITVAGIAFLYDKPWLYDLWEVWN
. :... ::: ::::..: : :: :. :::.::: : :: ::...::..:. . :.
CCDS88 WNVRKIQCWFRHRRNQDKPPTLTKFCESMWRFTFYLCIFCYGIRFLWSSPWFWDIRQCWH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 GYPKQPLLPSQYWYYILEMSFYWSLLFRLGFDVKRKDFLAHIIHHLAAISLMSFSWCANY
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CCDS88 NYPFQPLSSGLYHYYIMELAFYWSLMFSQFTDIKRKDFLIMFVHHLVTIGLISFSYINNM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 IRSGTLVMIVHDVADIWLESAKMFSYAGWTQTCNTLFFIFSTIFFISRLIVFPFWILYCT
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CCDS88 VRVGTLIMCLHDVSDFLLEAAKLANYAKYQRLCDTLFVIFSAVFMVTRLGIYPFWILNTT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 LILPMYHLEPFFSYIFLNLQLMILQVLHLYWGYYILKM-LNRCIFMKSIQDVRSDDEDYE
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CCDS88 LFESWEIIGPYASWWLLNGLLLTLQLLHVIWSYLIARIALKALIRGKVSKDDRSDVESSS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB7 EEEEEEEEEATKGKEMDCLKNGLGAERHLIPNGQHGH
:::.
CCDS88 EEEDVTTCTKSPCDSSSSNGANRVNGHMGGSYWAEE
360 370 380 390
>>CCDS2228.1 CERS6 gene_id:253782|Hs108|chr2 (384 aa)
initn: 1103 init1: 805 opt: 1032 Z-score: 968.2 bits: 187.9 E(32554): 1.3e-47
Smith-Waterman score: 1032; 41.5% identity (71.2% similar) in 347 aa overlap (19-363:7-353)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLHTTARRAARMFWTFKEWFWLERFWLPPTIKWSDLEDHDGLVFVKPSHLYVTIPYAFLL
::: :::::: .. :.::.. . .: . ::...: :: .
CCDS22 MAGILAWFWNERFWLPHNVTWADLKNTEEATFPQAEDLYLAFPLAFCI
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70 80 90 100 110
pF1KB7 LIIRRVFEKFVASPLAKSFGIKETVRKVTP-NTVLENFFKHSTRQPLQTDIYGLAKKCNL
...: .::.:::.: : ...:. . ...: :..::. : :..: . . ::.:. .
CCDS22 FMVRLIFERFVAKPCAIALNIQANGPQIAPPNAILEKVFTAITKHPDEKRLEGLSKQLDW
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pF1KB7 TERQVERWFRSRRNQERPSRLKKFQEACWRFAFYLMITVAGIAFLYDKPWLYDLWEVWNG
:...::::.:::::.:: : .: :. :::.:::.. . :. :: :::.. . : .
CCDS22 DVRSIQRWFRQRRNQEKPSTLTRFCESMWRFSFYLYVFTYGVRFLKKTPWLWNTRHCWYN
110 120 130 140 150 160
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pF1KB7 YPKQPLLPSQYWYYILEMSFYWSLLFRLGFDVKRKDFLAHIIHHLAAISLMSFSWCANYI
:: ::: . ..:::::.::::::.: :.::::: ..:::..: :..::. :.
CCDS22 YPYQPLTTDLHYYYILELSFYWSLMFSQFTDIKRKDFGIMFLHHLVSIFLITFSYVNNMA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 RSGTLVMIVHDVADIWLESAKMFSYAGWTQTCNTLFFIFSTIFFISRLIVFPFWILYCTL
: ::::. .:: :: ::.::: .:: . . :. :: .:...:. .:: .::.:.: ::
CCDS22 RVGTLVLCLHDSADALLEAAKMANYAKFQKMCDLLFVMFAVVFITTRLGIFPLWVLNTTL
230 240 250 260 270 280
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pF1KB7 ILPMYHLEPFFSYIFLNLQLMILQVLHLYWGYYILKMLNRCIFMKSI-QDVRSDDEDYEE
. . :. :. .:: :...: :. .:.: :.:. . . .. .: ::: :. .
CCDS22 FESWEIVGPYPSWWVFNLLLLLVQGLNCFWSYLIVKIACKAVSRGKVSKDDRSDIESSSD
290 300 310 320 330 340
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pF1KB7 EEEEEEEEATKGKEMDCLKNGLGAERHLIPNGQHGH
::. :
CCDS22 EEDSEPPGKNPHTATTTNGTSGTNGYLLTGSCSMDD
350 360 370 380
>>CCDS58734.1 CERS6 gene_id:253782|Hs108|chr2 (392 aa)
initn: 1093 init1: 793 opt: 1012 Z-score: 949.6 bits: 184.5 E(32554): 1.4e-46
Smith-Waterman score: 1014; 40.6% identity (69.6% similar) in 355 aa overlap (19-363:7-361)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLHTTARRAARMFWTFKEWFWLERFWLPPTIKWSDLEDHDGLVFVKPSHLYVTIPYAFLL
::: :::::: .. :.::.. . .: . ::...: :: .
CCDS58 MAGILAWFWNERFWLPHNVTWADLKNTEEATFPQAEDLYLAFPLAFCI
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB7 LIIRRVFEKFVASPLAKSFGIKETVRKVTP-NTVLENFFKHSTRQPLQTDIYGLAKKCNL
...: .::.:::.: : ...:. . ...: :..::. : :..: . . ::.:. .
CCDS58 FMVRLIFERFVAKPCAIALNIQANGPQIAPPNAILEKVFTAITKHPDEKRLEGLSKQLDW
50 60 70 80 90 100
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pF1KB7 TERQVERWFRSRRNQERPSRLKKFQEACWRFAFYLMITVAGIAFLYDKPWLYDLWEVWNG
:...::::.:::::.:: : .: :. :::.:::.. . :. :: :::.. . : .
CCDS58 DVRSIQRWFRQRRNQEKPSTLTRFCESMWRFSFYLYVFTYGVRFLKKTPWLWNTRHCWYN
110 120 130 140 150 160
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pF1KB7 YPKQPLLPSQYWYYILEMSFYWSLLFRLGFDVKRKDFLAHIIHHLAAISLMSFSWCANYI
:: ::: . ..:::::.::::::.: :.::::: ..:::..: :..::. :.
CCDS58 YPYQPLTTDLHYYYILELSFYWSLMFSQFTDIKRKDFGIMFLHHLVSIFLITFSYVNNMA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 RSGTLVMIVHDVADIWLESAKMFSYAGWTQTCNTLFFIFSTIFFISRLIVFPFWILYCTL
: ::::. .:: :: ::.::: .:: . . :. :: .:...:. .:: .::.:.: ::
CCDS58 RVGTLVLCLHDSADALLEAAKMANYAKFQKMCDLLFVMFAVVFITTRLGIFPLWVLNTTL
230 240 250 260 270 280
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pF1KB7 ILPMYHLEPFFSYIFLNLQLMILQVLHLYWGYYILKMLNRCIF---------MKSIQDVR
. . :. :. .:: :...: :. .:.: :.:. . . .. .: :
CCDS58 FESWEIVGPYPSWWVFNLLLLLVQGLNCFWSYLIVKIACKAVSRGKAGKWNPLHVSKDDR
290 300 310 320 330 340
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pF1KB7 SDDEDYEEEEEEEEEEATKGKEMDCLKNGLGAERHLIPNGQHGH
:: :. .::. :
CCDS58 SDIESSSDEEDSEPPGKNPHTATTTNGTSGTNGYLLTGSCSMDD
350 360 370 380 390
>>CCDS61120.1 CERS5 gene_id:91012|Hs108|chr12 (334 aa)
initn: 927 init1: 841 opt: 895 Z-score: 842.0 bits: 164.4 E(32554): 1.4e-40
Smith-Waterman score: 895; 44.3% identity (72.3% similar) in 296 aa overlap (68-361:7-302)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 DHDGLVFVKPSHLYVTIPYAFLLLIIRRVFEKFVASPLAKSFGIKET-VRKVTPNTVLEN
..:.:.: : .::... .. ::..::.
CCDS61 MMKPRPKRFIAKPCALCIGIEDSGPYQAQPNAILEK
10 20 30
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pF1KB7 FFKHSTRQPLQTDIYGLAKKCNLTERQVERWFRSRRNQERPSRLKKFQEACWRFAFYLMI
: :. : . . ::.:. . . :... ::: ::::..: : :: :. :::.::: :
CCDS61 VFISITKYPDKKRLEGLSKQLDWNVRKIQCWFRHRRNQDKPPTLTKFCESMWRFTFYLCI
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 TVAGIAFLYDKPWLYDLWEVWNGYPKQPLLPSQYWYYILEMSFYWSLLFRLGFDVKRKDF
:: ::...::..:. . :..:: ::: . : :::.:..:::::.: :.:::::
CCDS61 FCYGIRFLWSSPWFWDIRQCWHNYPFQPLSSGLYHYYIMELAFYWSLMFSQFTDIKRKDF
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 LAHIIHHLAAISLMSFSWCANYIRSGTLVMIVHDVADIWLESAKMFSYAGWTQTCNTLFF
: ..:::..:.:.:::. :..: :::.: .:::.:. ::.::. .:: . . :.:::
CCDS61 LIMFVHHLVTIGLISFSYINNMVRVGTLIMCLHDVSDFLLEAAKLANYAKYQRLCDTLFV
160 170 180 190 200 210
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