FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7717, 425 aa 1>>>pF1KB7717 425 - 425 aa - 425 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6476+/-0.0018; mu= 7.6802+/- 0.107 mean_var=295.7043+/-58.310, 0's: 0 Z-trim(107.5): 944 B-trim: 39 in 1/50 Lambda= 0.074584 statistics sampled from 8539 (9593) to 8539 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.632), E-opt: 0.2 (0.295), width: 16 Scan time: 2.320 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS42712.1 ZNF2 gene_id:7549|Hs108|chr2 ( 425) 2994 336.4 3.2e-92 CCDS42713.1 ZNF2 gene_id:7549|Hs108|chr2 ( 383) 2720 306.9 2.2e-83 CCDS77435.1 ZNF2 gene_id:7549|Hs108|chr2 ( 345) 2393 271.6 8.2e-73 CCDS62957.1 ZNF2 gene_id:7549|Hs108|chr2 ( 387) 2393 271.7 8.8e-73 CCDS77434.1 ZNF2 gene_id:7549|Hs108|chr2 ( 438) 2378 270.1 2.9e-72 CCDS14278.1 ZNF157 gene_id:7712|Hs108|chrX ( 506) 1359 160.6 3.2e-39 CCDS9282.1 ZNF140 gene_id:7699|Hs108|chr12 ( 457) 1299 154.1 2.6e-37 CCDS12494.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 418) 1260 149.8 4.6e-36 CCDS33002.1 ZFP14 gene_id:57677|Hs108|chr19 ( 533) 1258 149.8 6.1e-36 CCDS33005.1 ZFP30 gene_id:22835|Hs108|chr19 ( 519) 1253 149.2 8.8e-36 CCDS46097.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 679) 1253 149.4 1e-35 CCDS46061.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 419) 1248 148.5 1.1e-35 CCDS6754.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 626) 1247 148.7 1.5e-35 CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1227 146.5 6.7e-35 CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1227 146.5 7e-35 CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1227 146.6 7e-35 CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1227 146.6 7.1e-35 CCDS31939.1 ZNF26 gene_id:7574|Hs108|chr12 ( 533) 1215 145.1 1.5e-34 CCDS33026.2 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 641) 1210 144.7 2.4e-34 CCDS46079.1 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 642) 1198 143.4 6e-34 CCDS33740.1 ZNF620 gene_id:253639|Hs108|chr3 ( 422) 1187 142.0 1.1e-33 CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1191 142.7 1.1e-33 CCDS75608.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 554) 1182 141.6 1.8e-33 CCDS81756.1 ZNF26 gene_id:7574|Hs108|chr12 ( 513) 1178 141.1 2.3e-33 CCDS65096.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 612) 1175 140.9 3.2e-33 CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 1170 140.3 4.4e-33 CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 1170 140.4 4.6e-33 CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 1168 140.2 5.5e-33 CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1168 140.3 6.1e-33 CCDS12210.1 ZNF317 gene_id:57693|Hs108|chr19 ( 595) 1165 139.8 6.7e-33 CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 1160 139.5 1.2e-32 CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 1160 139.5 1.2e-32 CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 1160 139.5 1.2e-32 CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1158 139.2 1.3e-32 CCDS4441.1 ZNF454 gene_id:285676|Hs108|chr5 ( 522) 1154 138.6 1.4e-32 CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1154 138.8 1.8e-32 CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1150 138.1 1.8e-32 CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 1149 138.0 1.9e-32 CCDS47931.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8 ( 496) 1148 137.9 2.1e-32 CCDS34957.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8 ( 536) 1148 137.9 2.2e-32 CCDS12316.1 ZNF333 gene_id:84449|Hs108|chr19 ( 665) 1149 138.2 2.4e-32 CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1148 138.1 2.6e-32 CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 1147 138.0 2.8e-32 CCDS12273.1 ZNF791 gene_id:163049|Hs108|chr19 ( 576) 1144 137.5 3.2e-32 CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1145 137.8 3.4e-32 CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1140 137.1 4.2e-32 CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1140 137.1 4.4e-32 CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1140 137.2 4.4e-32 CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1140 137.2 4.6e-32 CCDS46077.1 ZNF780B gene_id:163131|Hs108|chr19 ( 833) 1140 137.3 5.2e-32 >>CCDS42712.1 ZNF2 gene_id:7549|Hs108|chr2 (425 aa) initn: 2994 init1: 2994 opt: 2994 Z-score: 1769.2 bits: 336.4 E(32554): 3.2e-92 Smith-Waterman score: 2994; 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47.6% identity (73.0% similar) in 422 aa overlap (6-419:19-436) 10 20 30 40 pF1KB7 MAAVSPTTRCQESVTFEDVAVVFTDEEWSRLVPIQRDLYKEVMLENY : . ::.:::::: :: .:: :: : :: ..:.::::.: CCDS14 MPANGTSPQRFPALIPGEPGRSFEGSVSFEDVAVDFTRQEWHRLDPAQRTMHKDVMLETY 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB7 NSIVSLGLPVPQPDVIFQLKRGDKPWMVDLHGSEEREWPESVSLDWETKPEIHDASDKKS ....:.:: : .:..::.:.::.. :... ..: . . :.:: . . : . ... CCDS14 SNLASVGLCVAKPEMIFKLERGEELWILEEESSGHG-YSGSLSL-LCGNGSVGDNALRHD 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KB7 EGSLR----ECLGRQSPL--CPKFEVHTPNGRMGTEKQSPSGETRKKSLSRDKGLRRRSA . :. . : .. : : : .: . .:..: :. . :. :.: CCDS14 NDLLHHQKIQTLDQNVEYNGCRK-AFHEKTGFV-RRKRTPRGDKNFECHECGKAYCRKSN 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 pF1KB7 LSRE--ILTKERHQECSDCGKTFFDHSSLTRHQRTHTGEKPYDCRECGKAFSHRSSLSRH : .. : : :: ::..:.::: .: : ::.:::::.:..: ::::.:...:.: : CCDS14 LVEHLRIHTGERPYECGECAKTFSARSYLIAHQKTHTGERPFECNECGKSFGRKSQLILH 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KB7 LMSHTGESPYECSVCSKAFFDRSSLTVHQRIHTGEKPFQCNECGKAFFDRSSLTRHQRIH .:::: ::::. :.:.: ....::.::: ::::::..:.::::.: . :::.:.: : CCDS14 TRTHTGERPYECTECGKTFSEKATLTIHQRTHTGEKPYECSECGKTFRVKISLTQHHRTH 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 TGESPYECHQCGKAFSQKSILTRHQLIHTGRKPYECNECGKAFYGVSSLNRHQKAHAGDP :::.:::: .::: : :. :..:: ::::.:::::.:::: : .:: ::..:.:. CCDS14 TGEKPYECGECGKNFRAKKSLNQHQRIHTGEKPYECGECGKFFRMKMTLNNHQRTHTGEK 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KB7 RYQCNECGKAFFDRSSLTQHQKIHTGDKPYECSECGKAFSQRCRLTRHQRVHTGEKPFEC ::::::::.: .::: ::.::::.:::::.:::.:: . :: .:::.:.::::.:: CCDS14 PYQCNECGKSFRVHSSLGIHQRIHTGEKPYECNECGNAFYVKARLIEHQRMHSGEKPYEC 360 370 380 390 400 410 400 410 420 pF1KB7 TVCGKVFSSKSSVIQHQRRYAKQGID . :::.:: :.:. ::.: . CCDS14 SECGKIFSMKKSLCQHRRTHTGEKPYECSECGNAFYVKVRLIEHQRIHTGERPFECQECG 420 430 440 450 460 470 >>CCDS9282.1 ZNF140 gene_id:7699|Hs108|chr12 (457 aa) initn: 4409 init1: 1035 opt: 1299 Z-score: 783.2 bits: 154.1 E(32554): 2.6e-37 Smith-Waterman score: 1299; 49.3% identity (69.7% similar) in 416 aa overlap (11-419:3-407) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MAAVSPTTRCQESVTFEDVAVVFTDEEWSRLVPIQRDLYKEVMLENYNSIVSLGLPVPQP : ::::.:::. :..:::. : : :::::. ::::::. .::::: . .: CCDS92 MSQGSVTFRDVAIDFSQEEWKWLQPAQRDLYRCVMLENYGHLVSLGLSISKP 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KB7 DVIFQLKRGDKPWMVDLHGSEEREWPE-SVSLDWETKPEIHDAS------DKKSEGSLRE ::. :..: .::. :..: . ::: :.. ::.: : : .:. . : CCDS92 DVVSLLEQGKEPWL----GKREVKRDLFSVS---ESSGEIKDFSPKNVIYDDSSQYLIME 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 CLGRQSPLCPKFEVHTPNGRMGTEKQSPSGETRKKSLSRDKGLRRRSALSREILTKERHQ . :.:. .:. : .: :: ..:....: .. .: : :: CCDS92 RILSQGPVYSSFKGGWKCKDHTEMLQENQGCIRKVTVSHQEALAQHMNIS----TVERPY 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 ECSDCGKTFFDHSSLTRHQRTHTGEKPYDCRECGKAFSHRSSLSRHLMSHTGESPYECSV : .::::: . ::. ::::::::::: :.::::.::. :.: .: : :::..:.::. CCDS92 GCHECGKTFGRRFSLVLHQRTHTGEKPYACKECGKTFSQISNLVKHQMIHTGKKPHECKD 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 CSKAFFDRSSLTVHQRIHTGEKPFQCNECGKAFFDRSSLTRHQRIHTGESPYECHQCGKA :.:.: : : ::: ::::::..:.:::::: :.:::::::: :.. : :..:::: CCDS92 CNKTFSYLSFLIEHQRTHTGEKPYECTECGKAFSRASNLTRHQRIHIGKKQYICRKCGKA 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 FSQKSILTRHQLIHTGRKPYECNECGKAFYGVSSLNRHQKAHAGDPRYQCNECGKAFFDR ::. : : :::. :::.::::: :::::: : :.:::. :. :.:::: ::: . CCDS92 FSSGSELIRHQITHTGEKPYECIECGKAFRRFSHLTRHQSIHTTKTPYECNECRKAFRCH 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 SSLTQHQKIHTGDKPYECSECGKAFSQRCRLTRHQRVHTGEKPFECTVCGKVFSSKSSVI : : .::.::.:.: :::.::::.:. . : .: . ::::::. :. : :.:: . :.: CCDS92 SFLIKHQRIHAGEKLYECDECGKVFTWHASLIQHTKSHTGEKPYACAECDKAFSRSFSLI 350 360 370 380 390 400 420 pF1KB7 QHQRRYAKQGID ::: . CCDS92 LHQRTHTGEKPYVCKVCNKSFSWSSNLAKHQRTHTLDNPYEYENSFNYHSFLTEHQ 410 420 430 440 450 >>CCDS12494.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 (418 aa) initn: 1924 init1: 1023 opt: 1260 Z-score: 760.9 bits: 149.8 E(32554): 4.6e-36 Smith-Waterman score: 1260; 46.2% identity (72.0% similar) in 418 aa overlap (11-419:3-417) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MAAVSPTTRCQESVTFEDVAVVFTDEEWSRLVPIQRDLYKEVMLENYNSIVSLGLPVPQP :::: : ::.: :..::: : :::::..::::::...::.: . .: CCDS12 MAQESVMFSDVSVDFSQEEWECLNDDQRDLYRDVMLENYSNLVSMGHSISKP 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KB7 DVIFQLKRGDKPWMVDLHGSEEREWP--ESVSLDWET--KPEIHDASDKKSEGSLRECLG .:: :..: .::..: . .. .:: :: . : ::.. . . : . : : CCDS12 NVISYLEQGKEPWLADRELTRG-QWPVLESRCETKKLFLKKEIYEIESTQWE--IMEKLT 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 RQSPLCPKFEVHTPNGRM-GTEKQSPSGETRKKSLSRDK--GLRRRSALSREILTKERHQ :.. : .:. .:. : : .:. . .... : .. ... . . . ... CCDS12 RRDFQCSSFRDDWECNRQFKKELGSQGGHFNQLVFTHEDLPTLSHHPSFTLQQIINSKKK 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 ECS--DCGKTFFDHSSLTRHQRTHTGEKPYDCRECGKAFSHRSSLSRHLMSHTGESPYEC :. . ::: :... :. :: ::::.:.::::.: : : :..: :::..:.:: CCDS12 FCASKEYRKTFRHGSQFATHEIIHTIEKPYECKECGKSFRHPSRLTHHQKIHTGKKPFEC 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 SVCSKAFFDRSSLTVHQRIHTGEKPFQCNECGKAFFDRSSLTRHQRIHTGESPYECHQCG . :.:.:. :.:: :.::::::::..:.:::::: . :..::::::::::.::::..:: CCDS12 KECGKTFICGSDLTRHHRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSNFTRHQRIHTGEKPYECKECG 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 KAFSQKSILTRHQLIHTGRKPYECNECGKAFYGVSSLNRHQKAHAGDPRYQCNECGKAFF ::::. : .:.:: ::::.:::::.:::.:: :.: .::. :.:. :.:.:: ::: CCDS12 KAFSSGSNFTQHQRIHTGEKPYECKECGNAFSQSSQLIKHQRIHTGEKPYECKECEKAFR 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 DRSSLTQHQKIHTGDKPYECSECGKAFSQRCRLTRHQRVHTGEKPFECTVCGKVFSSKSS . :.::.::.::::.:::::. ::::.:: .: :.:.::.:::.: ::: :. . CCDS12 SGSDLTRHQRIHTGEKPYECKICGKAYSQSSQLISHHRIHTSEKPYEYRECGKNFNYDPQ 350 360 370 380 390 400 420 pF1KB7 VIQHQRRYAKQGID .:::: : CCDS12 LIQHQNLYW 410 >>CCDS33002.1 ZFP14 gene_id:57677|Hs108|chr19 (533 aa) initn: 2101 init1: 1070 opt: 1258 Z-score: 758.7 bits: 149.8 E(32554): 6.1e-36 Smith-Waterman score: 1260; 47.4% identity (71.0% similar) in 420 aa overlap (13-416:5-415) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MAAVSPTTRCQESVTFEDVAVVFTDEEWSRLVPIQRDLYKEVMLENYNSIVSLGLPVPQP ::::.:::. :..::: : : :::::..:: :::....::: . .: CCDS33 MAHGSVTFRDVAIDFSQEEWEFLDPAQRDLYRDVMWENYSNFISLGPSISKP 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KB7 DVIFQLKRGDK-PWMVDLHGSEEREWPESVSLDWETKPEIHDASDKKSEGSLRECLGRQS ::: : . : : :: .:.. : : : :.. . . : .: .. : . : CCDS33 DVITLLDEERKEPGMVVREGTR-RYCP-----DLESRYRTNTLSPEK---DIYEIYSFQW 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 pF1KB7 PLCPKFEVHTPNG-----------RMGTEKQSPSGETRKKSLSRDK--GLRRRSALSREI . ... .. .: .. ::.. : . ... .: .:.. :.. CCDS33 DIMERIKSYSLQGSIFRNDWECKSKIEGEKEQQEGYFGQVKITSEKMTTYKRHNFLTEYQ 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KB7 LTK--ERHQECSDCGKTFFDHSSLTRHQRTHTGEKPYDCRECGKAFSHRSSLSRHLMSHT ... :. ::..: :::. .:.:..: : ::::::: :.:::.:: .:. : :: :: CCDS33 IVHNGEKVYECKECRKTFIRRSTLSQHLRIHTGEKPYKCKECGQAFRQRAHLIRHHKLHT 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 GESPYECSVCSKAFFDRSSLTVHQRIHTGEKPFQCNECGKAFFDRSSLTRHQRIHTGESP ::.::::. :.::: . :: :::.::::::..:.:::::: ...:.:::::::::.: CCDS33 GEKPYECKECGKAFTVLQELTQHQRLHTGEKPYECKECGKAFRVHQQLARHQRIHTGEKP 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 YECHQCGKAFSQKSILTRHQLIHTGRKPYECNECGKAFYGVSSLNRHQKAHAGDPRYQCN :::..:::.: : . ::::: .::..: :::.:::::: .: ::: : :. :.:. 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