FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7719, 427 aa 1>>>pF1KB7719 427 - 427 aa - 427 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3982+/-0.000769; mu= 12.5794+/- 0.047 mean_var=93.1872+/-18.451, 0's: 0 Z-trim(110.8): 123 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.132861 statistics sampled from 11764 (11890) to 11764 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.735), E-opt: 0.2 (0.365), width: 16 Scan time: 3.320 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8757.1 VDR gene_id:7421|Hs108|chr12 ( 427) 2897 565.2 4.2e-161 CCDS55820.1 VDR gene_id:7421|Hs108|chr12 ( 477) 2897 565.2 4.7e-161 CCDS43136.1 NR1I2 gene_id:8856|Hs108|chr3 ( 434) 965 194.9 1.3e-49 CCDS2995.1 NR1I2 gene_id:8856|Hs108|chr3 ( 473) 965 194.9 1.4e-49 CCDS54627.1 NR1I2 gene_id:8856|Hs108|chr3 ( 397) 534 112.3 8.9e-25 CCDS53405.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 ( 296) 479 101.7 1e-21 CCDS44262.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 ( 309) 479 101.7 1.1e-21 CCDS41428.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 ( 314) 479 101.7 1.1e-21 CCDS44260.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 ( 339) 479 101.7 1.2e-21 CCDS44261.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 ( 340) 479 101.7 1.2e-21 CCDS1228.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 ( 348) 479 101.7 1.2e-21 CCDS41430.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 ( 352) 479 101.7 1.2e-21 CCDS41429.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 ( 357) 479 101.7 1.2e-21 CCDS53409.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 ( 319) 437 93.6 2.9e-19 CCDS58673.1 NR1H2 gene_id:7376|Hs108|chr19 ( 363) 426 91.5 1.4e-18 CCDS42593.1 NR1H2 gene_id:7376|Hs108|chr19 ( 460) 426 91.6 1.7e-18 CCDS44585.1 NR1H3 gene_id:10062|Hs108|chr11 ( 402) 385 83.7 3.5e-16 CCDS7929.1 NR1H3 gene_id:10062|Hs108|chr11 ( 447) 385 83.7 3.9e-16 CCDS73285.1 NR1H3 gene_id:10062|Hs108|chr11 ( 453) 385 83.7 3.9e-16 CCDS44584.1 NR1H3 gene_id:10062|Hs108|chr11 ( 387) 381 82.9 5.8e-16 CCDS2641.1 THRB gene_id:7068|Hs108|chr3 ( 461) 375 81.8 1.5e-15 CCDS42316.1 THRA gene_id:7067|Hs108|chr17 ( 410) 368 80.5 3.4e-15 CCDS58546.1 THRA gene_id:7067|Hs108|chr17 ( 451) 368 80.5 3.7e-15 CCDS11360.1 THRA gene_id:7067|Hs108|chr17 ( 490) 368 80.5 4e-15 CCDS9078.1 NR1H4 gene_id:9971|Hs108|chr12 ( 472) 353 77.6 2.9e-14 CCDS55875.1 NR1H4 gene_id:9971|Hs108|chr12 ( 482) 353 77.6 2.9e-14 CCDS41790.1 RARG gene_id:5916|Hs108|chr12 ( 443) 351 77.2 3.5e-14 CCDS8850.1 RARG gene_id:5916|Hs108|chr12 ( 454) 351 77.2 3.6e-14 CCDS58236.1 RARG gene_id:5916|Hs108|chr12 ( 382) 347 76.4 5.3e-14 CCDS55873.1 NR1H4 gene_id:9971|Hs108|chr12 ( 476) 344 75.9 9.5e-14 CCDS55876.1 NR1H4 gene_id:9971|Hs108|chr12 ( 486) 344 75.9 9.7e-14 CCDS68131.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 395) 337 74.5 2.1e-13 CCDS13331.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 417) 337 74.5 2.2e-13 CCDS46604.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 442) 337 74.5 2.3e-13 CCDS74728.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 449) 337 74.5 2.3e-13 CCDS42876.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 452) 337 74.5 2.3e-13 CCDS46605.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 464) 337 74.5 2.4e-13 CCDS13330.1 HNF4A gene_id:3172|Hs108|chr20 ( 474) 337 74.5 2.4e-13 CCDS42317.1 RARA gene_id:5914|Hs108|chr17 ( 457) 336 74.3 2.7e-13 CCDS11366.1 RARA gene_id:5914|Hs108|chr17 ( 462) 336 74.3 2.7e-13 CCDS1517.1 ESRRG gene_id:2104|Hs108|chr1 ( 435) 335 74.1 2.9e-13 CCDS41468.1 ESRRG gene_id:2104|Hs108|chr1 ( 458) 335 74.1 3e-13 CCDS72970.1 RXRG gene_id:6258|Hs108|chr1 ( 340) 331 73.3 4e-13 CCDS1248.1 RXRG gene_id:6258|Hs108|chr1 ( 463) 331 73.4 5.2e-13 CCDS55340.1 NR6A1 gene_id:2649|Hs108|chr9 ( 475) 330 73.2 6.1e-13 CCDS65127.1 NR6A1 gene_id:2649|Hs108|chr9 ( 476) 330 73.2 6.1e-13 CCDS9850.2 ESRRB gene_id:2103|Hs108|chr14 ( 508) 328 72.8 8.4e-13 CCDS6220.2 HNF4G gene_id:3174|Hs108|chr8 ( 445) 327 72.6 8.6e-13 CCDS83303.1 HNF4G gene_id:3174|Hs108|chr8 ( 408) 326 72.4 9.1e-13 CCDS74905.1 NR2C2 gene_id:7182|Hs108|chr3 ( 596) 327 72.7 1.1e-12 >>CCDS8757.1 VDR gene_id:7421|Hs108|chr12 (427 aa) initn: 2897 init1: 2897 opt: 2897 Z-score: 3005.7 bits: 565.2 E(32554): 4.2e-161 Smith-Waterman score: 2897; 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CCDS29 LPESLQAPSREEAAKWSQVRKDLC----SLKVSLQLRGEDGSVWNYKPPADSGGKEIFSL 230 240 250 260 270 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 LPHLADLVSYSIQKVIGFAKMIPGFRDLTSEDQIVLLKSSAIEVIMLRSNESFTMDDMSW :::.::. .: .. .:.:::.: :::: :::: :::..:.:. .:: : :. . .: CCDS29 LPHMADMSTYMFKGIISFAKVISYFRDLPIEDQISLLKGAAFELCQLRFNTVFNAETGTW 280 290 300 310 320 330 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 TCGNQDYKYRVSDVTKAGHSLELIEPLIKFQVGLKKLNLHEEEHVLLMAICIVSPDRPGV :: .: . : : .: . :.::..::. ::::.:::::.::..:: . ::::::: CCDS29 ECGR--LSYCLED-TAGGFQQLLLEPMLKFHYMLKKLQLHEEEYVLMQAISLFSPDRPGV 340 350 360 370 380 390 350 360 370 380 390 400 pF1KB7 QDAALIEAIQDRLSNTLQTYIRCRHPPPGSHLLYAKMIQKLADLRSLNEEHSKQY-RCLS . ... .:.... ::..::.: .: :. ..:. :.. :..:::.: .:... : . CCDS29 LQHRVVDQLQEQFAITLKSYIECNRPQPAHRFLFLKIMAMLTELRSINAQHTQRLLRIQD 400 410 420 430 440 450 410 420 pF1KB7 FQPECSMKLTPLVLEVFGNEIS ..: :::. :.:: CCDS29 IHPFA----TPLMQELFGITGS 460 470 >>CCDS54627.1 NR1I2 gene_id:8856|Hs108|chr3 (397 aa) initn: 882 init1: 297 opt: 534 Z-score: 558.3 bits: 112.3 E(32554): 8.9e-25 Smith-Waterman score: 976; 40.8% identity (67.1% similar) in 407 aa overlap (21-423:38-393) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MEAMAASTSLPDPGDFDRNVPRICGVCGDRATGFHFNAMTCEGCKGFFRR :.:: ::::.:::.:::.:::::::::::: CCDS54 SWNHADFVHCEDTESVPGKPSVNADEEVGGPQICRVCGDKATGYHFNVMTCEGCKGFFRR 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KB7 SMKRKALFTCPF-NGDCRITKDNRRHCQACRLKRCVDIGMMKEFILTDEEVQRKREMILK .:::.: . ::: .: :.::. .::.::::::..:.. :: ::.:..:: :...: .: . CCDS54 AMKRNARLRCPFRKGACEITRKTRRQCQACRLRKCLESGMKKEMIMSDEAVEERRALIKR 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB7 RKEEEALKDSLRPK-LSEEQQRIIAILLDAHHKTYDPTYSDFCQFRPPVRVNDGGGSHPS .: :.. . : . :.:::. .: :.::. ::.: :.: : .:: ... :: . CCDS54 KKSERTGTQPLGVQGLTEEQRMMIRELMDAQMKTFDTTFSHFKNFRVSLQLRGEDGSVWN 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KB7 -RPNSRHTPSFSGDSSSSCSDHCITSSDMMDSSSFSNLDLSEEDSDDPSVTLELSQLSML .: :. :: . :. .:.: CCDS54 YKP-----PADSGGK-------------------------------------EI--FSLL 190 200 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 PHLADLVSYSIQKVIGFAKMIPGFRDLTSEDQIVLLKSSAIEVIMLRSNESFTMDDMSWT ::.::. .: .. .:.:::.: :::: :::: :::..:.:. .:: : :. . .: CCDS54 PHMADMSTYMFKGIISFAKVISYFRDLPIEDQISLLKGAAFELCQLRFNTVFNAETGTWE 210 220 230 240 250 260 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 CGNQDYKYRVSDVTKAGHSLELIEPLIKFQVGLKKLNLHEEEHVLLMAICIVSPDRPGVQ :: .: . : : .: . :.::..::. ::::.:::::.::..:: . ::::::: CCDS54 CGR--LSYCLED-TAGGFQQLLLEPMLKFHYMLKKLQLHEEEYVLMQAISLFSPDRPGVL 270 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 400 pF1KB7 DAALIEAIQDRLSNTLQTYIRCRHPPPGSHLLYAKMIQKLADLRSLNEEHSKQY-RCLSF . ... .:.... ::..::.: .: :. ..:. :.. :..:::.: .:... : .. CCDS54 QHRVVDQLQEQFAITLKSYIECNRPQPAHRFLFLKIMAMLTELRSINAQHTQRLLRIQDI 330 340 350 360 370 380 410 420 pF1KB7 QPECSMKLTPLVLEVFGNEIS .: :::. :.:: CCDS54 HPFA----TPLMQELFGITGS 390 >>CCDS53405.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 (296 aa) initn: 713 init1: 398 opt: 479 Z-score: 503.3 bits: 101.7 E(32554): 1e-21 Smith-Waterman score: 542; 34.4% identity (57.7% similar) in 279 aa overlap (22-299:9-228) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MEAMAASTSLPDPGDFDRNVPRICGVCGDRATGFHFNAMTCEGCKGFFRRSMKRKALFTC : : ::::.:::.::::.:::::::::::..... :: CCDS53 MASREDELRNCVVCGDQATGYHFNALTCEGCKGFFRRTVSKSIGPTC 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 PFNGDCRITKDNRRHCQACRLKRCVDIGMMKEFILTDEEVQRKREMILKRKEEEALKDSL :: :.:...: .:::: ::::..:.: :: :..::. : . .: .:. ... CCDS53 PFAGSCEVSKTQRRHCPACRLQKCLDAGMRKDMILSAEALALRRAKQAQRRAQQT----- 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 pF1KB7 RP-KLSEEQQRIIAILLDAHHKTYDPTYSDFCQFRPPVRVNDGGGSHPSRPNSRHTPSFS : .::.::...: :: :: . . . .: :::::... : : : CCDS53 -PVQLSKEQEELIRTLLGAHTRHMGTMFEQFVQFRPPAHLF----IH-------HQPL-- 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 GDSSSSCSDHCITSSDMMDSSSFSNLDLSEEDSDDPSVTLELSQLSMLPHLADLVSYSIQ :... : .. :.::. .. . CCDS53 -----------------------------------PTLA---PVLPLVTHFADINTFMVL 150 160 170 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 KVIGFAKMIPGFRDLTSEDQIVLLKSSAIEVIMLRSNESFTMDDMSWTCGNQDYKYRVSD .:: :.: .: ::.: :::: :::..:.:. . : .: .. ... :: .: . : CCDS53 QVIKFTKDLPVFRSLPIEDQISLLKGAAVEICHIVLNTTFCLQTQNFLCG--PLRYTIED 180 190 200 210 220 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 VTKAGHSLELIEPLIKFQVGLKKLNLHEEEHVLLMAICIVSPDRPGVQDAALIEAIQDRL CCDS53 GARDRPGVTQRDEIDQLQEEMALTLQSYIKGQQRRPRDRSPGTPWIHWSGKMLGPKIGPG 230 240 250 260 270 280 >>CCDS44262.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 (309 aa) initn: 788 init1: 398 opt: 479 Z-score: 503.0 bits: 101.7 E(32554): 1.1e-21 Smith-Waterman score: 613; 31.4% identity (54.4% similar) in 401 aa overlap (22-421:9-307) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MEAMAASTSLPDPGDFDRNVPRICGVCGDRATGFHFNAMTCEGCKGFFRRSMKRKALFTC : : ::::.:::.::::.:::::::::::..... :: CCDS44 MASREDELRNCVVCGDQATGYHFNALTCEGCKGFFRRTVSKSIGPTC 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 PFNGDCRITKDNRRHCQACRLKRCVDIGMMKEFILTDEEVQRKREMILKRKEEEALKDSL :: :.:...: .:::: ::::..:.: :: :..::. : . .: .:. ... CCDS44 PFAGSCEVSKTQRRHCPACRLQKCLDAGMRKDMILSAEALALRRAKQAQRRAQQT----- 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 pF1KB7 RP-KLSEEQQRIIAILLDAHHKTYDPTYSDFCQFRPPVRVNDGGGSHPSRPNSRHTPSFS : .::.::...: :: :: . . . .: :::::... .: : CCDS44 -PVQLSKEQEELIRTLLGAHTRHMGTMFEQFVQFRPPAHLF-----------IHHQPL-- 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 GDSSSSCSDHCITSSDMMDSSSFSNLDLSEEDSDDPSVTLELSQLSMLPHLADLVSYSIQ :... : .. :.::. .. . CCDS44 -----------------------------------PTLA---PVLPLVTHFADINTFMVL 150 160 170 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 KVIGFAKMIPGFRDLTSEDQIVLLKSSAIEVIMLRSNESFTMDDMSWTCGNQDYKYRVSD .:: :.: .: ::.: :::: :::..:.:. . : .: .. ... :: .: . : CCDS44 QVIKFTKDLPVFRSLPIEDQISLLKGAAVEICHIVLNTTFCLQTQNFLCG--PLRYTIED 180 190 200 210 220 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 VTKAGHSLELIEPLIKFQVGLKKLNLHEEEHVLLMAICIVSPDRPGVQDAALIEAIQDRL : . ::::: . :. .:... CCDS44 -------------------GAR--------------------DRPGVTQRDEIDQLQEEM 230 240 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 SNTLQTYIRCRHPPPGSHLLYAKMIQKLADLRSLNEEHSKQYRCLSFQPECSMKLTPLVL . :::.::. .. : ...::::.. ::.:::.:: .. : . .: .: ::. CCDS44 ALTLQSYIKGQQRRPRDRFLYAKLLGLLAELRSINEAYGYQIQ--HIQGLSAM--MPLLQ 250 260 270 280 290 300 420 pF1KB7 EVFGNEIS :. CCDS44 EICS >>CCDS41428.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 (314 aa) initn: 768 init1: 378 opt: 479 Z-score: 502.9 bits: 101.7 E(32554): 1.1e-21 Smith-Waterman score: 628; 31.7% identity (55.1% similar) in 401 aa overlap (22-421:9-312) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MEAMAASTSLPDPGDFDRNVPRICGVCGDRATGFHFNAMTCEGCKGFFRRSMKRKALFTC : : ::::.:::.::::.:::::::::::..... :: CCDS41 MASREDELRNCVVCGDQATGYHFNALTCEGCKGFFRRTVSKSIGPTC 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 PFNGDCRITKDNRRHCQACRLKRCVDIGMMKEFILTDEEVQRKREMILKRKEEEALKDSL :: :.:...: .:::: ::::..:.: :: :..::. : . .: .:. ... CCDS41 PFAGSCEVSKTQRRHCPACRLQKCLDAGMRKDMILSAEALALRRAKQAQRRAQQT----- 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 pF1KB7 RP-KLSEEQQRIIAILLDAHHKTYDPTYSDFCQFRPPVRVNDGGGSHPSRPNSRHTPSFS : .::.::...: :: :: . . . .: :::::... .: : CCDS41 -PVQLSKEQEELIRTLLGAHTRHMGTMFEQFVQFRPPAHLF-----------IHHQPL-- 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 GDSSSSCSDHCITSSDMMDSSSFSNLDLSEEDSDDPSVTLELSQLSMLPHLADLVSYSIQ :... : .. :.::. .. . CCDS41 -----------------------------------PTLA---PVLPLVTHFADINTFMVL 150 160 170 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 KVIGFAKMIPGFRDLTSEDQIVLLKSSAIEVIMLRSNESFTMDDMSWTCGNQDYKYRVSD .:: :.: .: ::.: :::: :::..:.:. . : .: .. ... :: .: . : CCDS41 QVIKFTKDLPVFRSLPIEDQISLLKGAAVEICHIVLNTTFCLQTQNFLCG--PLRYTIED 180 190 200 210 220 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 VTKAGHSLELIEPLIKFQVGLKKLNLHEEEHVLLMAICIVSPDRPGVQDAALIEAIQDRL ..: : . ::::: . :. .:... CCDS41 GARA--------PYLT--------------------------DRPGVTQRDEIDQLQEEM 230 240 250 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 SNTLQTYIRCRHPPPGSHLLYAKMIQKLADLRSLNEEHSKQYRCLSFQPECSMKLTPLVL . :::.::. .. : ...::::.. ::.:::.:: .. : . .: .: ::. CCDS41 ALTLQSYIKGQQRRPRDRFLYAKLLGLLAELRSINEAYGYQIQ--HIQGLSAM--MPLLQ 260 270 280 290 300 310 420 pF1KB7 EVFGNEIS :. CCDS41 EICS >>CCDS44260.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 (339 aa) initn: 779 init1: 398 opt: 479 Z-score: 502.4 bits: 101.7 E(32554): 1.2e-21 Smith-Waterman score: 710; 34.9% identity (60.5% similar) in 375 aa overlap (22-384:9-324) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MEAMAASTSLPDPGDFDRNVPRICGVCGDRATGFHFNAMTCEGCKGFFRRSMKRKALFTC : : ::::.:::.::::.:::::::::::..... :: CCDS44 MASREDELRNCVVCGDQATGYHFNALTCEGCKGFFRRTVSKSIGPTC 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 PFNGDCRITKDNRRHCQACRLKRCVDIGMMKEFILTDEEVQRKREMILKRKEEEALKDSL :: :.:...: .:::: ::::..:.: :: :..::. : . .: .:. ... CCDS44 PFAGSCEVSKTQRRHCPACRLQKCLDAGMRKDMILSAEALALRRAKQAQRRAQQT----- 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 pF1KB7 RP-KLSEEQQRIIAILLDAHHKTYDPTYSDFCQFRPPVRVNDGGGSHPSRPNSRHTPSFS : .::.::...: :: :: . . . .: :::::... : : : CCDS44 -PVQLSKEQEELIRTLLGAHTRHMGTMFEQFVQFRPPAHLF----IH-------HQPL-- 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 GDSSSSCSDHCITSSDMMDSSSFSNLDLSEEDSDDPSVTLELSQLSMLPHLADLVSYSIQ :... : .. :.::. .. . CCDS44 -----------------------------------PTLA---PVLPLVTHFADINTFMVL 150 160 170 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 KVIGFAKMIPGFRDLTSEDQIVLLKSSAIEVIMLRSNESFTMDDMSWTCGNQDYKYRVSD .:: :.: .: ::.: :::: :::..:.:. . : .: .. ... :: .: . : CCDS44 QVIKFTKDLPVFRSLPIEDQISLLKGAAVEICHIVLNTTFCLQTQNFLCG--PLRYTIED 180 190 200 210 220 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 VTKA----GHSLELIEPLIKFQVGLKKLNLHEEEHVLLMAICIVSPDRPGVQDAALIEAI ... : ..:..: :..:. :.::.:.: :.::: :. . ::::::: . :. . CCDS44 GARVSPTVGFQVEFLELLFHFHGTLRKLQLQEPEYVLLAAMALFSPDRPGVTQRDEIDQL 230 240 250 260 270 280 360 370 380 390 400 pF1KB7 QDRLSNTLQTYIRC--RHP---PPGSHLLY--AKMIQKLADLRSLNEEHSKQYRCLSFQP :.... :::.::. :.: ::. .. .::. CCDS44 QEEMALTLQSYIKGQQRRPRDRSPGTPWIHWSGKMLGPKIGPGSKGAQWLQ 290 300 310 320 330 410 420 pF1KB7 ECSMKLTPLVLEVFGNEIS >>CCDS44261.1 NR1I3 gene_id:9970|Hs108|chr1 (340 aa) initn: 775 init1: 398 opt: 479 Z-score: 502.4 bits: 101.7 E(32554): 1.2e-21 Smith-Waterman score: 708; 34.8% identity (60.4% similar) in 376 aa overlap (22-384:9-325) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MEAMAASTSLPDPGDFDRNVPRICGVCGDRATGFHFNAMTCEGCKGFFRRSMKRKALFTC : : ::::.:::.::::.:::::::::::..... :: CCDS44 MASREDELRNCVVCGDQATGYHFNALTCEGCKGFFRRTVSKSIGPTC 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 PFNGDCRITKDNRRHCQACRLKRCVDIGMMKEFILTDEEVQRKREMILKRKEEEALKDSL :: :.:...: .:::: ::::..:.: :: :..::. : . .: .:. ... CCDS44 PFAGSCEVSKTQRRHCPACRLQKCLDAGMRKDMILSAEALALRRAKQAQRRAQQT----- 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 pF1KB7 RP-KLSEEQQRIIAILLDAHHKTYDPTYSDFCQFRPPVRVNDGGGSHPSRPNSRHTPSFS : .::.::...: :: :: . . . .: :::::... : : : CCDS44 -PVQLSKEQEELIRTLLGAHTRHMGTMFEQFVQFRPPAHLF----IH-------HQPL-- 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 GDSSSSCSDHCITSSDMMDSSSFSNLDLSEEDSDDPSVTLELSQLSMLPHLADLVSYSIQ :... : .. :.::. .. . CCDS44 -----------------------------------PTLA---PVLPLVTHFADINTFMVL 150 160 170 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 KVIGFAKMIPGFRDLTSEDQIVLLKSSAIEVIMLRSNESFTMDDMSWTCGNQDYKYRVSD .:: :.: .: ::.: :::: :::..:.:. . : .: .. ... :: .: . : CCDS44 QVIKFTKDLPVFRSLPIEDQISLLKGAAVEICHIVLNTTFCLQTQNFLCG--PLRYTIED 180 190 200 210 220 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 VTKAGHSLELIEPLIKFQVGLKKLNLHEEEHVLLMAICIVSP-----DRPGVQDAALIEA ...: ..:..: :..:. :.::.:.: :.::: :. . :: ::::: . :. CCDS44 GARVGFQVEFLELLFHFHGTLRKLQLQEPEYVLLAAMALFSPAPYLTDRPGVTQRDEIDQ 230 240 250 260 270 280 360 370 380 390 400 pF1KB7 IQDRLSNTLQTYIRC--RHP---PPGSHLLY--AKMIQKLADLRSLNEEHSKQYRCLSFQ .:.... :::.::. :.: ::. .. .::. CCDS44 LQEEMALTLQSYIKGQQRRPRDRSPGTPWIHWSGKMLGPKIGPGSKGAQWLQ 290 300 310 320 330 340 410 420 pF1KB7 PECSMKLTPLVLEVFGNEIS 427 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 09:15:22 2016 done: Fri Nov 4 09:15:22 2016 Total Scan time: 3.320 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]