Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7738
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7738, 484 aa
1>>>pF1KB7738 484 - 484 aa - 484 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3616+/-0.000858; mu= 4.3657+/- 0.051
mean_var=173.6275+/-35.310, 0's: 0 Z-trim(113.4): 80 B-trim: 11 in 1/51
Lambda= 0.097334
statistics sampled from 14000 (14081) to 14000 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.768), E-opt: 0.2 (0.433), width: 16
Scan time: 3.460
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11465.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17 ( 484) 3431 493.8 1.7e-139
CCDS58553.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17 ( 445) 3173 457.5 1.3e-128
CCDS55088.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 477) 1678 247.6 2.1e-65
CCDS55085.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 437) 1543 228.7 1e-59
CCDS59292.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17 ( 207) 1457 216.4 2.4e-56
CCDS55083.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 419) 1442 214.5 1.8e-55
CCDS55086.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 459) 1438 213.9 2.9e-55
CCDS55084.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 374) 1271 190.4 2.8e-48
CCDS33906.1 ETV5 gene_id:2119|Hs108|chr3 ( 510) 1121 169.4 7.9e-42
CCDS55087.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 454) 1084 164.2 2.6e-40
CCDS53724.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11 ( 225) 409 69.2 5.1e-12
CCDS81648.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11 ( 354) 408 69.2 8.1e-12
CCDS8475.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11 ( 441) 409 69.4 8.8e-12
CCDS44767.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11 ( 485) 409 69.4 9.5e-12
CCDS13659.1 ETS2 gene_id:2114|Hs108|chr21 ( 469) 405 68.9 1.4e-11
CCDS1457.1 ELK4 gene_id:2005|Hs108|chr1 ( 405) 389 66.6 5.8e-11
CCDS1456.1 ELK4 gene_id:2005|Hs108|chr1 ( 431) 389 66.6 6.1e-11
CCDS59165.1 ELK1 gene_id:2002|Hs108|chrX ( 95) 376 64.4 6.3e-11
>>CCDS11465.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17 (484 aa)
initn: 3431 init1: 3431 opt: 3431 Z-score: 2617.8 bits: 493.8 E(32554): 1.7e-139
Smith-Waterman score: 3431; 100.0% identity (100.0% similar) in 484 aa overlap (1-484:1-484)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MERRMKAGYLDQQVPYTFSSKSPGNGSLREALIGPLGKLMDPGSLPPLDSEDLFQDLSHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MERRMKAGYLDQQVPYTFSSKSPGNGSLREALIGPLGKLMDPGSLPPLDSEDLFQDLSHF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 QETWLAEAQVPDSDEQFVPDFHSENLAFHSPTTRIKKEPQSPRTDPALSCSRKPPLPYHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QETWLAEAQVPDSDEQFVPDFHSENLAFHSPTTRIKKEPQSPRTDPALSCSRKPPLPYHH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GEQCLYSSAYDPPRQIAIKSPAPGALGQSPLQPFPRAEQRNFLRSSGTSQPHPGHGYLGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GEQCLYSSAYDPPRQIAIKSPAPGALGQSPLQPFPRAEQRNFLRSSGTSQPHPGHGYLGE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 HSSVFQQPLDICHSFTSQGGGREPLPAPYQHQLSEPCPPYPQQSFKQEYHDPLYEQAGQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HSSVFQQPLDICHSFTSQGGGREPLPAPYQHQLSEPCPPYPQQSFKQEYHDPLYEQAGQP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 AVDQGGVNGHRYPGAGVVIKQEQTDFAYDSDVTGCASMYLHTEGFSGPSPGDGAMGYGYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AVDQGGVNGHRYPGAGVVIKQEQTDFAYDSDVTGCASMYLHTEGFSGPSPGDGAMGYGYE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 KPLRPFPDDVCVVPEKFEGDIKQEGVGAFREGPPYQRRGALQLWQFLVALLDDPTNAHFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KPLRPFPDDVCVVPEKFEGDIKQEGVGAFREGPPYQRRGALQLWQFLVALLDDPTNAHFI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 AWTGRGMEFKLIEPEEVARLWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AWTGRGMEFKLIEPEEVARLWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 VCEPEALFSLAFPDNQRPALKAEFDRPVSEEDTVPLSHLDESPAYLPELAGPAQPFGPKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VCEPEALFSLAFPDNQRPALKAEFDRPVSEEDTVPLSHLDESPAYLPELAGPAQPFGPKG
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 GYSY
::::
CCDS11 GYSY
>>CCDS58553.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17 (445 aa)
initn: 3173 init1: 3173 opt: 3173 Z-score: 2422.5 bits: 457.5 E(32554): 1.3e-128
Smith-Waterman score: 3173; 100.0% identity (100.0% similar) in 445 aa overlap (40-484:1-445)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 LDQQVPYTFSSKSPGNGSLREALIGPLGKLMDPGSLPPLDSEDLFQDLSHFQETWLAEAQ
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MDPGSLPPLDSEDLFQDLSHFQETWLAEAQ
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 VPDSDEQFVPDFHSENLAFHSPTTRIKKEPQSPRTDPALSCSRKPPLPYHHGEQCLYSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VPDSDEQFVPDFHSENLAFHSPTTRIKKEPQSPRTDPALSCSRKPPLPYHHGEQCLYSSA
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YDPPRQIAIKSPAPGALGQSPLQPFPRAEQRNFLRSSGTSQPHPGHGYLGEHSSVFQQPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YDPPRQIAIKSPAPGALGQSPLQPFPRAEQRNFLRSSGTSQPHPGHGYLGEHSSVFQQPL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 DICHSFTSQGGGREPLPAPYQHQLSEPCPPYPQQSFKQEYHDPLYEQAGQPAVDQGGVNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DICHSFTSQGGGREPLPAPYQHQLSEPCPPYPQQSFKQEYHDPLYEQAGQPAVDQGGVNG
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 HRYPGAGVVIKQEQTDFAYDSDVTGCASMYLHTEGFSGPSPGDGAMGYGYEKPLRPFPDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HRYPGAGVVIKQEQTDFAYDSDVTGCASMYLHTEGFSGPSPGDGAMGYGYEKPLRPFPDD
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 VCVVPEKFEGDIKQEGVGAFREGPPYQRRGALQLWQFLVALLDDPTNAHFIAWTGRGMEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VCVVPEKFEGDIKQEGVGAFREGPPYQRRGALQLWQFLVALLDDPTNAHFIAWTGRGMEF
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 KLIEPEEVARLWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCEPEALFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KLIEPEEVARLWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCEPEALFS
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 LAFPDNQRPALKAEFDRPVSEEDTVPLSHLDESPAYLPELAGPAQPFGPKGGYSY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LAFPDNQRPALKAEFDRPVSEEDTVPLSHLDESPAYLPELAGPAQPFGPKGGYSY
400 410 420 430 440
>>CCDS55088.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 (477 aa)
initn: 1654 init1: 868 opt: 1678 Z-score: 1287.5 bits: 247.6 E(32554): 2.1e-65
Smith-Waterman score: 1683; 55.1% identity (74.3% similar) in 490 aa overlap (8-484:3-477)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MERRMKAGYLDQQVPYTFSSKSPGNGSLREALIGPLGKLMDPGSLPPLDSEDLFQDLSHF
:. :::::: .... : . .. :... .: :::.::::::..
CCDS55 MDGFYDQQVPYMVTNSQRGRNCNEKPTNVRKRKFINR-DLAH-DSEELFQDLSQL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 QETWLAEAQVPDSDEQFVPDFHSENLAFHSPTTRIKKEPQSPRTDPALSCSRKPPLPYHH
::::::::::::.:::::::...:.::::. .:::::.:: .. . .::.. :. . .
CCDS55 QETWLAEAQVPDNDEQFVPDYQAESLAFHGLPLKIKKEPHSPCSEISSACSQEQPFKFSY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB7 GEQCLYS-SAYDPPRQIAIKSPAPGALGQSPLQPFPRAE---------QRNFLRSSGTSQ
::.:::. :::: :.... : . ...:..:. .: .: : ::
CCDS55 GEKCLYNVSAYDQKPQVGMRPSNPPTPSSTPVSPLHHASPNSTHTPKPDRAFPAHLPPSQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB7 PHPGHGYLGEHSSVFQQPL-DICHSFTSQGG-GREPLPAPYQHQLSEPCPPYPQQSFKQE
: .: .: :.. : . :.:: :: : ::.:.::: :.: :.::::
CCDS55 SIPDSSYPMDHR--FRRQLSEPCNSFPPLPTMPREGRPM-YQRQMSEPNIPFPPQGFKQE
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 YHDPLYEQAGQPAVDQGGVNGHRYPGAGVVIKQEQTDFAYDSDVTGCASMYLHTEGF-SG
::::.::. . :.. .. .: ..:::: ::::::.: .: :.:.. ::: .
CCDS55 YHDPVYEHNTMV----GSAASQSFPPP-LMIKQEPRDFAYDSEVPSCHSIYMRQEGFLAH
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 PSPGDGAMGYGYEKPLRPFPDDVCVVPEKFEGDIKQEGVGAFREGPPYQRRGALQLWQFL
:: .: : .:: : : ::.:::::::.:::::: : .:::: :::::.:::::::
CCDS55 PSRTEGCM---FEKGPRQFYDDTCVVPEKFDGDIKQEP-GMYREGPTYQRRGSLQLWQFL
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 VALLDDPTNAHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARLWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGI
:::::::.:.:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VALLDDPSNSHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARRWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGI
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 MQKVAGERYVYKFVCEPEALFSLAFPDNQRPALKAEFDRPVSEEDTVPLSHLDESPAYLP
:::::::::::::::.::::::.:::::::: ::....: ..:::::::::.::: ::.:
CCDS55 MQKVAGERYVYKFVCDPEALFSMAFPDNQRPLLKTDMERHINEEDTVPLSHFDESMAYMP
410 420 430 440 450 460
470 480
pF1KB7 ELAGPAQPFGPKGGYSY
: .: .: . :: :
CCDS55 E-GGCCNPHPYNEGYVY
470
>>CCDS55085.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 (437 aa)
initn: 1507 init1: 868 opt: 1543 Z-score: 1185.6 bits: 228.7 E(32554): 1e-59
Smith-Waterman score: 1548; 56.7% identity (75.1% similar) in 430 aa overlap (68-484:21-437)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 KLMDPGSLPPLDSEDLFQDLSHFQETWLAEAQVPDSDEQFVPDFHSENLAFHSPTTRIKK
:::::.:::::::...:.::::. .:::
CCDS55 MLQDLSASVFFPPCSQHRTLAQVPDNDEQFVPDYQAESLAFHGLPLKIKK
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 EPQSPRTDPALSCSRKPPLPYHHGEQCLYS-SAYDPPRQIAIKSPAPGALGQSPLQPFPR
::.:: .. . .::.. :. . .::.:::. :::: :.... : . ...:..:. .
CCDS55 EPHSPCSEISSACSQEQPFKFSYGEKCLYNVSAYDQKPQVGMRPSNPPTPSSTPVSPLHH
60 70 80 90 100 110
160 170 180 190 200
pF1KB7 AE---------QRNFLRSSGTSQPHPGHGYLGEHSSVFQQPL-DICHSFTSQGG-GREPL
: .: : :: : .: .: :.. : . :.:: ::
CCDS55 ASPNSTHTPKPDRAFPAHLPPSQSIPDSSYPMDHR--FRRQLSEPCNSFPPLPTMPREGR
120 130 140 150 160
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 PAPYQHQLSEPCPPYPQQSFKQEYHDPLYEQAGQPAVDQGGVNGHRYPGAGVVIKQEQTD
: ::.:.::: :.: :.::::::::.::. . :.. .. .: ..:::: :
CCDS55 PM-YQRQMSEPNIPFPPQGFKQEYHDPVYEHNTMV----GSAASQSFPPP-LMIKQEPRD
170 180 190 200 210 220
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 FAYDSDVTGCASMYLHTEGF-SGPSPGDGAMGYGYEKPLRPFPDDVCVVPEKFEGDIKQE
:::::.: .: :.:.. ::: . :: .: : .:: : : ::.:::::::.::::::
CCDS55 FAYDSEVPSCHSIYMRQEGFLAHPSRTEGCM---FEKGPRQFYDDTCVVPEKFDGDIKQE
230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 GVGAFREGPPYQRRGALQLWQFLVALLDDPTNAHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARLWGIQ
: .:::: :::::.::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::: ::::
CCDS55 P-GMYREGPTYQRRGSLQLWQFLVALLDDPSNSHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARRWGIQ
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 KNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCEPEALFSLAFPDNQRPALKAEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::: ::...
CCDS55 KNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCDPEALFSMAFPDNQRPLLKTDM
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480
pF1KB7 DRPVSEEDTVPLSHLDESPAYLPELAGPAQPFGPKGGYSY
.: ..:::::::::.::: ::.:: .: .: . :: :
CCDS55 ERHINEEDTVPLSHFDESMAYMPE-GGCCNPHPYNEGYVY
400 410 420 430
>>CCDS59292.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17 (207 aa)
initn: 1457 init1: 1457 opt: 1457 Z-score: 1125.1 bits: 216.4 E(32554): 2.4e-56
Smith-Waterman score: 1457; 100.0% identity (100.0% similar) in 207 aa overlap (278-484:1-207)
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 NGHRYPGAGVVIKQEQTDFAYDSDVTGCASMYLHTEGFSGPSPGDGAMGYGYEKPLRPFP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MYLHTEGFSGPSPGDGAMGYGYEKPLRPFP
10 20 30
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 DDVCVVPEKFEGDIKQEGVGAFREGPPYQRRGALQLWQFLVALLDDPTNAHFIAWTGRGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DDVCVVPEKFEGDIKQEGVGAFREGPPYQRRGALQLWQFLVALLDDPTNAHFIAWTGRGM
40 50 60 70 80 90
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 EFKLIEPEEVARLWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCEPEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EFKLIEPEEVARLWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCEPEAL
100 110 120 130 140 150
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 FSLAFPDNQRPALKAEFDRPVSEEDTVPLSHLDESPAYLPELAGPAQPFGPKGGYSY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 FSLAFPDNQRPALKAEFDRPVSEEDTVPLSHLDESPAYLPELAGPAQPFGPKGGYSY
160 170 180 190 200
>>CCDS55083.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 (419 aa)
initn: 1401 init1: 868 opt: 1442 Z-score: 1109.3 bits: 214.5 E(32554): 1.8e-55
Smith-Waterman score: 1447; 55.5% identity (73.6% similar) in 416 aa overlap (82-484:17-419)
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 DLFQDLSHFQETWLAEAQVPDSDEQFVPDFHSENLAFHSPTTRIKKEPQSPRTDPALSCS
: .:::. .:::::.:: .. . .::
CCDS55 MLQDLSASVFFPPCSQHRTLVAFHGLPLKIKKEPHSPCSEISSACS
10 20 30 40
120 130 140 150 160
pF1KB7 RKPPLPYHHGEQCLYS-SAYDPPRQIAIKSPAPGALGQSPLQPFPRAE---------QRN
.. :. . .::.:::. :::: :.... : . ...:..:. .: .:
CCDS55 QEQPFKFSYGEKCLYNVSAYDQKPQVGMRPSNPPTPSSTPVSPLHHASPNSTHTPKPDRA
50 60 70 80 90 100
170 180 190 200 210
pF1KB7 FLRSSGTSQPHPGHGYLGEHSSVFQQPL-DICHSFTSQGG-GREPLPAPYQHQLSEPCPP
: :: : .: .: :.. : . :.:: :: : ::.:.::: :
CCDS55 FPAHLPPSQSIPDSSYPMDHR--FRRQLSEPCNSFPPLPTMPREGRPM-YQRQMSEPNIP
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 YPQQSFKQEYHDPLYEQAGQPAVDQGGVNGHRYPGAGVVIKQEQTDFAYDSDVTGCASMY
.: :.::::::::.::. . :.. .. .: ..:::: ::::::.: .: :.:
CCDS55 FPPQGFKQEYHDPVYEHNTM----VGSAASQSFP-PPLMIKQEPRDFAYDSEVPSCHSIY
170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 LHTEGF-SGPSPGDGAMGYGYEKPLRPFPDDVCVVPEKFEGDIKQEGVGAFREGPPYQRR
.. ::: . :: .: : .:: : : ::.:::::::.:::::: : .:::: ::::
CCDS55 MRQEGFLAHPSRTEGCM---FEKGPRQFYDDTCVVPEKFDGDIKQEP-GMYREGPTYQRR
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 GALQLWQFLVALLDDPTNAHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARLWGIQKNRPAMNYDKLSRS
:.::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS55 GSLQLWQFLVALLDDPSNSHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARRWGIQKNRPAMNYDKLSRS
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 LRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCEPEALFSLAFPDNQRPALKAEFDRPVSEEDTVPLSH
::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::: ::....: ..:::::::::
CCDS55 LRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCDPEALFSMAFPDNQRPLLKTDMERHINEEDTVPLSH
340 350 360 370 380 390
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CCDS55 VALLDDPSNSHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARRWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGI
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CCDS55 MQKVAGERYVYKFVCDPEALFSMAFPDNQRPLLKTDMERHINEEDTVPLSHFDESMAYMP
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CCDS55 E-GGCCNPHPYNEGYVY
450
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CCDS55 -------------PLP------------TMPRE----------GR-PM---YQRQMSEPN
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CCDS55 IYMRQEGFLAHPSRTEGCM---FEKGPRQFYDDTCVVPEKFDGDIKQEP-GMYREGPTYQ
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CCDS55 SHFDESMAYMPE-GGCCNPHPYNEGYVY
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CCDS33 YGEKCLYNYCAYDRKPPSGFKPLTPPTTPLSPTHQNPLFPPPQATLPTSGHAPAAGPVQG
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CCDS55 QETWLAEAQVPDNDEQFVPDYQAESLAFHGLPLKIKKEPHSPCSEISSACSQEQPFKFSY
60 70 80 90 100 110
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CCDS55 SIPDSSYPMDHR--FRRQLSEPCNSFPPLPTMPREGRPM-YQRQMSEPNIPFPPQGFKQE
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CCDS55 YHDPVYEHNTMV----GSAASQSFPPP-LMIKQEPRDFAYDS---GCM------------
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CCDS55 ----------FEKGPRQFYDDTCVVPEKFDGDIKQEP-GMYREGPTYQRRGSLQLWQFLV
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CCDS55 ALLDDPSNSHFIAWTGRGMEFKLIEPEEVARRWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIM
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pF1KB7 QKVAGERYVYKFVCEPEALFSLAFPDNQRPALKAEFDRPVSEEDTVPLSHLDESPAYLPE
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CCDS55 QKVAGERYVYKFVCDPEALFSMAFPDNQRPLLKTDMERHINEEDTVPLSHFDESMAYMPE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]