Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7741
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7741, 436 aa
1>>>pF1KB7741 436 - 436 aa - 436 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9664+/-0.00171; mu= 17.1132+/- 0.103
mean_var=303.9087+/-54.445, 0's: 0 Z-trim(107.8): 918 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.073570
statistics sampled from 8730 (9776) to 8730 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.3), width: 16
Scan time: 2.650
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32971.1 ZNF101 gene_id:94039|Hs108|chr19 ( 436) 3127 346.3 3.4e-95
CCDS77271.1 ZNF101 gene_id:94039|Hs108|chr19 ( 316) 2305 258.8 5.4e-69
CCDS42502.1 ZNF627 gene_id:199692|Hs108|chr19 ( 461) 1547 178.7 1.1e-44
CCDS12272.1 ZNF490 gene_id:57474|Hs108|chr19 ( 529) 1522 176.1 7.1e-44
CCDS42505.1 ZNF564 gene_id:163050|Hs108|chr19 ( 553) 1447 168.2 1.8e-41
CCDS12268.1 ZNF439 gene_id:90594|Hs108|chr19 ( 499) 1393 162.4 9.2e-40
CCDS42503.1 ZNF440 gene_id:126070|Hs108|chr19 ( 595) 1369 160.0 5.8e-39
CCDS12270.1 ZNF563 gene_id:147837|Hs108|chr19 ( 476) 1326 155.3 1.2e-37
CCDS45988.1 ZNF44 gene_id:51710|Hs108|chr19 ( 615) 1296 152.3 1.3e-36
CCDS45985.1 ZNF844 gene_id:284391|Hs108|chr19 ( 666) 1229 145.2 1.8e-34
CCDS42504.1 ZNF709 gene_id:163051|Hs108|chr19 ( 641) 1202 142.3 1.3e-33
CCDS12099.1 ZNF77 gene_id:58492|Hs108|chr19 ( 545) 1180 139.9 6.1e-33
CCDS12409.1 ZNF14 gene_id:7561|Hs108|chr19 ( 642) 1107 132.2 1.4e-30
CCDS45984.2 ZNF878 gene_id:729747|Hs108|chr19 ( 531) 1080 129.2 9.4e-30
CCDS32915.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 742) 1064 127.8 3.5e-29
CCDS74289.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 745) 1064 127.8 3.6e-29
CCDS12273.1 ZNF791 gene_id:163049|Hs108|chr19 ( 576) 1052 126.3 7.7e-29
CCDS7195.1 ZNF25 gene_id:219749|Hs108|chr10 ( 456) 1048 125.7 9.3e-29
CCDS77240.1 ZNF433 gene_id:163059|Hs108|chr19 ( 638) 1049 126.1 1e-28
CCDS45983.1 ZNF433 gene_id:163059|Hs108|chr19 ( 673) 1049 126.1 1e-28
CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19 ( 499) 1042 125.1 1.5e-28
CCDS14278.1 ZNF157 gene_id:7712|Hs108|chrX ( 506) 1038 124.7 2e-28
CCDS45986.1 ZNF20 gene_id:7568|Hs108|chr19 ( 532) 1031 124.0 3.5e-28
CCDS77346.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 492) 1016 122.4 1e-27
CCDS74279.1 ZNF426 gene_id:79088|Hs108|chr19 ( 516) 1012 122.0 1.4e-27
CCDS12215.1 ZNF426 gene_id:79088|Hs108|chr19 ( 554) 1012 122.0 1.4e-27
CCDS59329.1 ZNF555 gene_id:148254|Hs108|chr19 ( 627) 1002 121.1 3.2e-27
CCDS12096.1 ZNF555 gene_id:148254|Hs108|chr19 ( 628) 1002 121.1 3.2e-27
CCDS55112.1 ZNF716 gene_id:441234|Hs108|chr7 ( 495) 999 120.6 3.5e-27
CCDS46029.1 ZNF486 gene_id:90649|Hs108|chr19 ( 463) 994 120.0 5e-27
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 993 120.1 6.1e-27
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 993 120.2 6.2e-27
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 993 120.2 6.3e-27
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 993 120.2 6.3e-27
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 986 119.4 1e-26
CCDS32918.1 ZNF443 gene_id:10224|Hs108|chr19 ( 671) 986 119.4 1.1e-26
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 984 119.2 1.2e-26
CCDS42495.1 ZNF699 gene_id:374879|Hs108|chr19 ( 642) 983 119.1 1.3e-26
CCDS33931.1 ZNF141 gene_id:7700|Hs108|chr4 ( 474) 978 118.3 1.6e-26
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 966 117.2 4.4e-26
CCDS34646.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 586) 965 117.1 4.7e-26
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 964 117.1 5.3e-26
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 964 117.1 5.3e-26
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 964 117.1 5.4e-26
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 960 116.6 6.9e-26
CCDS59368.1 ZNF729 gene_id:100287226|Hs108|chr19 (1252) 964 117.6 7e-26
CCDS31087.1 ZNF670 gene_id:93474|Hs108|chr1 ( 389) 954 115.6 8.7e-26
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 955 115.9 9e-26
CCDS82297.1 ZNF799 gene_id:90576|Hs108|chr19 ( 611) 953 115.9 1.1e-25
CCDS74387.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 540) 952 115.7 1.2e-25
>>CCDS32971.1 ZNF101 gene_id:94039|Hs108|chr19 (436 aa)
initn: 3127 init1: 3127 opt: 3127 Z-score: 1822.5 bits: 346.3 E(32554): 3.4e-95
Smith-Waterman score: 3127; 100.0% identity (100.0% similar) in 436 aa overlap (1-436:1-436)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDSVAFEDVAVNFTQEEWALLSPSQKNLYRDVTLETFRNLASVGIQWKDQDIENLYQNLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MDSVAFEDVAVNFTQEEWALLSPSQKNLYRDVTLETFRNLASVGIQWKDQDIENLYQNLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 IKLRSLVERLCGRKEGNEHRETFSQIPDCHLNKKSQTGVKPCKCSVCGKVFLRHSFLDRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IKLRSLVERLCGRKEGNEHRETFSQIPDCHLNKKSQTGVKPCKCSVCGKVFLRHSFLDRH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 MRAHAGHKRSECGGEWRETPRKQKQHGKASISPSSGARRTVTPTRKRPYECKVCGKAFNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MRAHAGHKRSECGGEWRETPRKQKQHGKASISPSSGARRTVTPTRKRPYECKVCGKAFNS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 PNLFQIHQRTHTGKRSYKCREIVRAFTVSSFFRKHGKMHTGEKRYECKYCGKPIDYPSLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PNLFQIHQRTHTGKRSYKCREIVRAFTVSSFFRKHGKMHTGEKRYECKYCGKPIDYPSLF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 QIHVRTHTGEKPYKCKQCGKAFISAGYLRTHEIRSHALEKSHQCQECGKKLSCSSSLHRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QIHVRTHTGEKPYKCKQCGKAFISAGYLRTHEIRSHALEKSHQCQECGKKLSCSSSLHRH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ERTHSGGKLYECQKCAKVFRCPTSLQAHERAHTGERPYECNKCGKTFNYPSCFRRHKKTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ERTHSGGKLYECQKCAKVFRCPTSLQAHERAHTGERPYECNKCGKTFNYPSCFRRHKKTH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 SGEKPYECTRCGKAFGWCSSLRRHEMTHTGEKPFDCKQCGKVFTFSNYLRLHERTHLAGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SGEKPYECTRCGKAFGWCSSLRRHEMTHTGEKPFDCKQCGKVFTFSNYLRLHERTHLAGR
370 380 390 400 410 420
430
pF1KB7 SQCFGRRQGDHLSPGV
::::::::::::::::
CCDS32 SQCFGRRQGDHLSPGV
430
>>CCDS77271.1 ZNF101 gene_id:94039|Hs108|chr19 (316 aa)
initn: 2305 init1: 2305 opt: 2305 Z-score: 1352.1 bits: 258.8 E(32554): 5.4e-69
Smith-Waterman score: 2305; 100.0% identity (100.0% similar) in 316 aa overlap (121-436:1-316)
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 LNKKSQTGVKPCKCSVCGKVFLRHSFLDRHMRAHAGHKRSECGGEWRETPRKQKQHGKAS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MRAHAGHKRSECGGEWRETPRKQKQHGKAS
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 ISPSSGARRTVTPTRKRPYECKVCGKAFNSPNLFQIHQRTHTGKRSYKCREIVRAFTVSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ISPSSGARRTVTPTRKRPYECKVCGKAFNSPNLFQIHQRTHTGKRSYKCREIVRAFTVSS
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 FFRKHGKMHTGEKRYECKYCGKPIDYPSLFQIHVRTHTGEKPYKCKQCGKAFISAGYLRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FFRKHGKMHTGEKRYECKYCGKPIDYPSLFQIHVRTHTGEKPYKCKQCGKAFISAGYLRT
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 HEIRSHALEKSHQCQECGKKLSCSSSLHRHERTHSGGKLYECQKCAKVFRCPTSLQAHER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HEIRSHALEKSHQCQECGKKLSCSSSLHRHERTHSGGKLYECQKCAKVFRCPTSLQAHER
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 AHTGERPYECNKCGKTFNYPSCFRRHKKTHSGEKPYECTRCGKAFGWCSSLRRHEMTHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AHTGERPYECNKCGKTFNYPSCFRRHKKTHSGEKPYECTRCGKAFGWCSSLRRHEMTHTG
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430
pF1KB7 EKPFDCKQCGKVFTFSNYLRLHERTHLAGRSQCFGRRQGDHLSPGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 EKPFDCKQCGKVFTFSNYLRLHERTHLAGRSQCFGRRQGDHLSPGV
280 290 300 310
>>CCDS42502.1 ZNF627 gene_id:199692|Hs108|chr19 (461 aa)
initn: 2538 init1: 640 opt: 1547 Z-score: 916.0 bits: 178.7 E(32554): 1.1e-44
Smith-Waterman score: 1598; 52.6% identity (74.5% similar) in 443 aa overlap (1-416:1-441)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDSVAFEDVAVNFTQEEWALLSPSQKNLYRDVTLETFRNLASVGIQWKDQDIENLYQNLG
:::::::::::::: ::::::.:::::::::: :::::::::: ::.::.::. ..
CCDS42 MDSVAFEDVAVNFTLEEWALLDPSQKNLYRDVMRETFRNLASVGKQWEDQNIEDPFKIPR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 IKLRSLVERLCGRKEGNEHRETFSQIPDCHLNKKSQTGVKPCKCSVCGKVFLRHSFLDRH
.. . :::: :::.. .:::::::: ::::. :::::. ::::.: . : :.::
CCDS42 RNISHIPERLCESKEGGQGEETFSQIPDGILNKKTP-GVKPCESSVCGEVGMGPSSLNRH
70 80 90 100 110
130 140 150
pF1KB7 MRAHAGHK-------------RSECG---GEWRETPRKQKQH-----------GKASISP
.: :.:.. :..:: . : : ... : :.. ::
CCDS42 IRDHTGREPNEYQEYGKKSYTRNQCGRALSYHRSFPVRERTHPGGKPYDCKECGETFISL
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 SSGARRTVTPTRKRPYECKVCGKAFNSPNLFQIHQRTHTGKRSYKCREIVRAFTVSSFFR
: :. .: ::.::::::::. :.::.::.:.:::.. :.:.. .::. ::..:
CCDS42 VSIRRHMLTHRGGVPYKCKVCGKAFDYPSLFRIHERSHTGEKPYECKQCGKAFSCSSYIR
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 KHGKMHTGEKRYECKYCGKPIDYPSLFQIHVRTHTGEKPYKCKQCGKAFISAGYLRTHEI
: . :::.: :::: ::: .. . ..:: :::::::::.:::::::: :. .:.::
CCDS42 IHERTHTGDKPYECKQCGKAFSCSKYIRIHERTHTGEKPYECKQCGKAFRCASSVRSHE-
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 RSHALEKSHQCQECGKKLSCSSSLHRHERTHSGGKLYECQKCAKVFRCPTSLQAHERAHT
:.:. :: .:.:::: :.: .:..:: :.:. :.:. :.:.: :.:.. :::.::
CCDS42 RTHTGEKLFECKECGKALTCLASVRRHMIKHTGNGPYKCKVCGKAFDFPSSFRIHERTHT
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 GERPYECNKCGKTFNYPSCFRRHKKTHSGEKPYECTRCGKAFGWCSSLRRHEMTHTGEKP
::.::.:..:::.:. : ::.:.. :.:::::.::.:::::. : .: :: :::::::
CCDS42 GEKPYDCKQCGKAFSCSSSFRKHERIHTGEKPYKCTKCGKAFSRSSYFRIHERTHTGEKP
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430
pF1KB7 FDCKQCGKVFTFSNYLRLHERTHLAGRSQCFGRRQGDHLSPGV
..::::::.:. :.:.:.::. :
CCDS42 YECKQCGKAFSRSTYFRVHEKIHTGEKPYENPNPNASVVPVLS
420 430 440 450 460
>>CCDS12272.1 ZNF490 gene_id:57474|Hs108|chr19 (529 aa)
initn: 1757 init1: 645 opt: 1522 Z-score: 901.2 bits: 176.1 E(32554): 7.1e-44
Smith-Waterman score: 1522; 50.8% identity (73.0% similar) in 429 aa overlap (2-429:55-480)
10 20 30
pF1KB7 MDSVAFEDVAVNFTQEEWALLSPSQKNLYRD
::...:::::::: ::::::.:.:.:.:::
CCDS12 SSQGRTGTGGSDVLQMQNSEHHGQSIKTQTDSISLEDVAVNFTLEEWALLDPGQRNIYRD
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 VTLETFRNLASVGIQWKDQDIENLYQNLGIKLRS-LVERLCGRKEGNEHRETFSQIPDCH
: ::.::: .: .:::::::. ..: : .::: .:: :: :: .. ::::: .
CCDS12 VMRATFKNLACIGEKWKDQDIEDEHKNQGRNLRSPMVEALCENKEDCPCGKSTSQIPDLN
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 LNKKSQTGVKPCKCSVCGKVFLRHSFLDRHMRAHAGHKRSECGGEWRETPRKQKQHGKAS
: .. ::.::: :::::.::... :.::::.:. .: .:: :. : :.: :. ::.
CCDS12 TNLETPTGLKPCDCSVCGEVFMHQVSLNRHMRSHTEQKPNECH-EYGEKPHKCKECGKTF
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 ISPSSGARRTVTPTRKRPYECKVCGKAFNSPNLFQIHQRTHTGKRSYKCREIVRAFTVSS
:: . : ..::::: ::::: :. : : :::. :.:.: .:: .
CCDS12 TRSSSIRTHERIHTGEKPYECKECGKAFAFLFSFRNHIRIHTGETPYECKECGKAFRYLT
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 FFRKHGKMHTGEKRYECKYCGKPIDYPSLFQIHVRTHTGEKPYKCKQCGKAFISAGYLRT
.:.: : ::::: :.:: ::: . : . : : :::::::::.:::::::: :::.
CCDS12 ALRRHEKNHTGEKPYKCKQCGKAFIYYQPFLTHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYLRS
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 HEIRSHALEKSHQCQECGKKLSCSSSLHRHERTHSGGKLYECQKCAKVFRCPTSLQAHER
:: ..:. :: :.:::. . :::..: .::.: . : :.::...:. .: ..:::
CCDS12 HE-KTHTGEKPFVCRECGRAFFSHSSLRKHVKTHTGVQPYTCKKCGEAFKSSSSCEVHER
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 AHTGERPYECNKCGKTFNYPSCFRRHKKTHSGEKPYECTRCGKAFGWCSSLRRHEMTHTG
.: ::.::::..:::.:: : .. :...:.::: ::: .::::: . . .: :: :::
CCDS12 THFGEKPYECKQCGKAFNSSSYLQLHERVHTGEKTYECKECGKAFLYSTHFRIHERTHTR
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430
pF1KB7 EKPFDCKQCGKVFTFSNYLRLHERTHLAGRSQCFGRRQGDHLSPGV
:::..:::::.:: . ..:: :::.: .: . : .. :
CCDS12 EKPYECKQCGRVFIYFSHLRRHERSH-TGVKPCECKQCGKAFTCLNSLKVHKRIHTGERP
450 460 470 480 490 500
CCDS12 FQCRQCGKAFSYSKSLHVHERTHSRQKP
510 520
>>CCDS42505.1 ZNF564 gene_id:163050|Hs108|chr19 (553 aa)
initn: 2123 init1: 599 opt: 1447 Z-score: 858.0 bits: 168.2 E(32554): 1.8e-41
Smith-Waterman score: 1464; 49.8% identity (69.4% similar) in 454 aa overlap (1-423:1-451)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDSVAFEDVAVNFTQEEWALLSPSQKNLYRDVTLETFRNLASVGIQWKDQDIENLYQNLG
::::: :::::::: ::::::.::::.::::: ::::::: :: .:.::.::. :.: :
CCDS42 MDSVASEDVAVNFTLEEWALLDPSQKKLYRDVMRETFRNLACVGKKWEDQSIEDWYKNQG
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CCDS45 RTHTGERPYECKHCGKAFSRSSFCREHERTHTGEKPYECKECGKAFSSLSSFNRHKRTHW
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CCDS45 MDLVAFEDVAVNFTQEEWSLLDPSQKNLYREVMQETLRNLASIGEKWKDQNIEDQYKNPR
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CCDS45 NNLRSLLGERVDENTEENHCGETSSQIPDDTLNKKTSPGVKSCESSVCGEVFVGHSSLNR
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CCDS45 HIRADTAHK-----------PSEYQEYGQ------------------EPYKCQQRKKAFR
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CCDS45 CHPSFQMQEKAHTGEKLYDCKECGKTFISHSSIQRHMIMHNGDGTYKCKFCGKACPCLSI
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CCDS45 YLIHERVHTGEKPYKCKQCGKAFSYSTSLQIHE-RTHTGEKPYECKECGKAFGSPNSLYE
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CCDS45 HRRTHTGEKPYECKQCGKAFRWFHSFQIHERTHSEEKAYECTKCGKAFKCPSYLCRHEVT
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CCDS45 HSGKKPCECKQCGKALSYLN-FQRHMKMHTRMRPYKCKTVEKPLILPVRFEDMKELTLER
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pF1KB7 RSQCFGRRQGDHLSPGV
CCDS45 NLMNASTVVKPSIVPVPFTIMKGLTLERNPMNVSSVVKPSFLPLPFDIMKGLTLERNRMS
390 400 410 420 430 440
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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