Result of FASTA (omim) for pF1KB7741
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7741, 436 aa
  1>>>pF1KB7741 436 - 436 aa - 436 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4617+/-0.000646; mu= 20.9750+/- 0.040
 mean_var=355.3513+/-69.457, 0's: 0 Z-trim(114.7): 1899  B-trim: 87 in 1/54
 Lambda= 0.068037
 statistics sampled from 22343 (24635) to 22343 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.637), E-opt: 0.2 (0.289), width:  16
 Scan time:  8.990

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_149981 (OMIM: 603983) zinc finger protein 101 i ( 436) 3127 321.8 2.2e-87
NP_001287878 (OMIM: 603983) zinc finger protein 10 ( 316) 2305 240.8 3.8e-63
NP_660338 (OMIM: 612248) zinc finger protein 627 i ( 461) 1547 166.7 1.1e-40
XP_006722936 (OMIM: 194543) PREDICTED: zinc finger ( 569) 1415 154.0 9.4e-37
XP_011526082 (OMIM: 612248) PREDICTED: zinc finger ( 429) 1356 147.9 4.7e-35
NP_001277012 (OMIM: 612248) zinc finger protein 62 ( 429) 1356 147.9 4.7e-35
NP_057348 (OMIM: 194542) zinc finger protein 44 is ( 615) 1296 142.4 3.2e-33
NP_067040 (OMIM: 194551) zinc finger protein 77 [H ( 545) 1180 130.9 8.1e-30
NP_066358 (OMIM: 194556) zinc finger protein 14 [H ( 642) 1107 123.9 1.2e-27
NP_001277013 (OMIM: 612248) zinc finger protein 62 ( 351) 1078 120.5 7.1e-27
NP_001277014 (OMIM: 612248) zinc finger protein 62 ( 351) 1078 120.5 7.1e-27
XP_016882570 (OMIM: 194551) PREDICTED: zinc finger ( 365) 1048 117.6 5.6e-26
XP_016882571 (OMIM: 194551) PREDICTED: zinc finger ( 365) 1048 117.6 5.6e-26
NP_001316579 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 456) 1048 117.8 6.1e-26
NP_001316581 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 456) 1048 117.8 6.1e-26
NP_001316580 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 456) 1048 117.8 6.1e-26
NP_001316583 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 456) 1048 117.8 6.1e-26
NP_659448 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 is ( 456) 1048 117.8 6.1e-26
NP_001316582 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 456) 1048 117.8 6.1e-26
NP_001316578 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 460) 1048 117.8 6.1e-26
NP_001316576 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 460) 1048 117.8 6.1e-26
NP_001316577 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 460) 1048 117.8 6.1e-26
XP_011517656 (OMIM: 194528) PREDICTED: zinc finger ( 460) 1048 117.8 6.1e-26
XP_016881830 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1042 117.2 9.4e-26
XP_011524814 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1042 117.2 9.4e-26
NP_689690 (OMIM: 614275) zinc finger protein 565 [ ( 499) 1042 117.2 9.4e-26
XP_011524816 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1042 117.2 9.4e-26
NP_001035939 (OMIM: 614275) zinc finger protein 56 ( 499) 1042 117.2 9.4e-26
NP_003437 (OMIM: 300024) zinc finger protein 157 [ ( 506) 1038 116.9 1.2e-25
NP_001316584 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 455) 1037 116.7 1.3e-25
NP_001190179 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 ( 529) 1031 116.2   2e-25
NP_066966 (OMIM: 194557) zinc finger protein 20 is ( 532) 1031 116.2   2e-25
NP_001284553 (OMIM: 613910) zinc finger protein 48 ( 492) 1016 114.7 5.5e-25
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616)  993 112.6 2.9e-24
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621)  993 112.6 2.9e-24
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628)  993 112.6 2.9e-24
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658)  993 112.7 2.9e-24
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658)  993 112.7 2.9e-24
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670)  993 112.7 2.9e-24
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670)  993 112.7 2.9e-24
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670)  993 112.7 2.9e-24
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670)  993 112.7 2.9e-24
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682)  993 112.7   3e-24
XP_011525924 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 639)  986 112.0 4.7e-24
XP_016881629 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 673)  986 112.0 4.8e-24
XP_016881628 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 685)  986 112.0 4.8e-24
XP_011525925 (OMIM: 606697) PREDICTED: zinc finger ( 718)  986 112.1 4.9e-24
NP_005806 (OMIM: 606697) zinc finger protein 443 [ ( 671)  985 111.9 5.1e-24
NP_940937 (OMIM: 609571) zinc finger protein 699 [ ( 642)  983 111.7 5.7e-24
XP_016881640 (OMIM: 604750) PREDICTED: zinc finger ( 669)  983 111.7 5.8e-24


>>NP_149981 (OMIM: 603983) zinc finger protein 101 isofo  (436 aa)
 initn: 3127 init1: 3127 opt: 3127  Z-score: 1689.8  bits: 321.8 E(85289): 2.2e-87
Smith-Waterman score: 3127; 100.0% identity (100.0% similar) in 436 aa overlap (1-436:1-436)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDSVAFEDVAVNFTQEEWALLSPSQKNLYRDVTLETFRNLASVGIQWKDQDIENLYQNLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 MDSVAFEDVAVNFTQEEWALLSPSQKNLYRDVTLETFRNLASVGIQWKDQDIENLYQNLG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 IKLRSLVERLCGRKEGNEHRETFSQIPDCHLNKKSQTGVKPCKCSVCGKVFLRHSFLDRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 IKLRSLVERLCGRKEGNEHRETFSQIPDCHLNKKSQTGVKPCKCSVCGKVFLRHSFLDRH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 MRAHAGHKRSECGGEWRETPRKQKQHGKASISPSSGARRTVTPTRKRPYECKVCGKAFNS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 MRAHAGHKRSECGGEWRETPRKQKQHGKASISPSSGARRTVTPTRKRPYECKVCGKAFNS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 PNLFQIHQRTHTGKRSYKCREIVRAFTVSSFFRKHGKMHTGEKRYECKYCGKPIDYPSLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 PNLFQIHQRTHTGKRSYKCREIVRAFTVSSFFRKHGKMHTGEKRYECKYCGKPIDYPSLF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 QIHVRTHTGEKPYKCKQCGKAFISAGYLRTHEIRSHALEKSHQCQECGKKLSCSSSLHRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 QIHVRTHTGEKPYKCKQCGKAFISAGYLRTHEIRSHALEKSHQCQECGKKLSCSSSLHRH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 ERTHSGGKLYECQKCAKVFRCPTSLQAHERAHTGERPYECNKCGKTFNYPSCFRRHKKTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 ERTHSGGKLYECQKCAKVFRCPTSLQAHERAHTGERPYECNKCGKTFNYPSCFRRHKKTH
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 SGEKPYECTRCGKAFGWCSSLRRHEMTHTGEKPFDCKQCGKVFTFSNYLRLHERTHLAGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 SGEKPYECTRCGKAFGWCSSLRRHEMTHTGEKPFDCKQCGKVFTFSNYLRLHERTHLAGR
              370       380       390       400       410       420

              430      
pF1KB7 SQCFGRRQGDHLSPGV
       ::::::::::::::::
NP_149 SQCFGRRQGDHLSPGV
              430      

>>NP_001287878 (OMIM: 603983) zinc finger protein 101 is  (316 aa)
 initn: 2305 init1: 2305 opt: 2305  Z-score: 1254.6  bits: 240.8 E(85289): 3.8e-63
Smith-Waterman score: 2305; 100.0% identity (100.0% similar) in 316 aa overlap (121-436:1-316)

              100       110       120       130       140       150
pF1KB7 LNKKSQTGVKPCKCSVCGKVFLRHSFLDRHMRAHAGHKRSECGGEWRETPRKQKQHGKAS
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001                               MRAHAGHKRSECGGEWRETPRKQKQHGKAS
                                             10        20        30

              160       170       180       190       200       210
pF1KB7 ISPSSGARRTVTPTRKRPYECKVCGKAFNSPNLFQIHQRTHTGKRSYKCREIVRAFTVSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISPSSGARRTVTPTRKRPYECKVCGKAFNSPNLFQIHQRTHTGKRSYKCREIVRAFTVSS
               40        50        60        70        80        90

              220       230       240       250       260       270
pF1KB7 FFRKHGKMHTGEKRYECKYCGKPIDYPSLFQIHVRTHTGEKPYKCKQCGKAFISAGYLRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FFRKHGKMHTGEKRYECKYCGKPIDYPSLFQIHVRTHTGEKPYKCKQCGKAFISAGYLRT
              100       110       120       130       140       150

              280       290       300       310       320       330
pF1KB7 HEIRSHALEKSHQCQECGKKLSCSSSLHRHERTHSGGKLYECQKCAKVFRCPTSLQAHER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HEIRSHALEKSHQCQECGKKLSCSSSLHRHERTHSGGKLYECQKCAKVFRCPTSLQAHER
              160       170       180       190       200       210

              340       350       360       370       380       390
pF1KB7 AHTGERPYECNKCGKTFNYPSCFRRHKKTHSGEKPYECTRCGKAFGWCSSLRRHEMTHTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AHTGERPYECNKCGKTFNYPSCFRRHKKTHSGEKPYECTRCGKAFGWCSSLRRHEMTHTG
              220       230       240       250       260       270

              400       410       420       430      
pF1KB7 EKPFDCKQCGKVFTFSNYLRLHERTHLAGRSQCFGRRQGDHLSPGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKPFDCKQCGKVFTFSNYLRLHERTHLAGRSQCFGRRQGDHLSPGV
              280       290       300       310      

>>NP_660338 (OMIM: 612248) zinc finger protein 627 isofo  (461 aa)
 initn: 2538 init1: 640 opt: 1547  Z-score: 851.4  bits: 166.7 E(85289): 1.1e-40
Smith-Waterman score: 1598; 52.6% identity (74.5% similar) in 443 aa overlap (1-416:1-441)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDSVAFEDVAVNFTQEEWALLSPSQKNLYRDVTLETFRNLASVGIQWKDQDIENLYQNLG
       :::::::::::::: ::::::.::::::::::  :::::::::: ::.::.::. ..   
NP_660 MDSVAFEDVAVNFTLEEWALLDPSQKNLYRDVMRETFRNLASVGKQWEDQNIEDPFKIPR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 IKLRSLVERLCGRKEGNEHRETFSQIPDCHLNKKSQTGVKPCKCSVCGKVFLRHSFLDRH
        ..  . ::::  :::.. .::::::::  ::::.  :::::. ::::.: .  : :.::
NP_660 RNISHIPERLCESKEGGQGEETFSQIPDGILNKKTP-GVKPCESSVCGEVGMGPSSLNRH
               70        80        90        100       110         

                           130          140                  150   
pF1KB7 MRAHAGHK-------------RSECG---GEWRETPRKQKQH-----------GKASISP
       .: :.:..             :..::   .  :  : ... :           :.. :: 
NP_660 IRDHTGREPNEYQEYGKKSYTRNQCGRALSYHRSFPVRERTHPGGKPYDCKECGETFISL
     120       130       140       150       160       170         

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB7 SSGARRTVTPTRKRPYECKVCGKAFNSPNLFQIHQRTHTGKRSYKCREIVRAFTVSSFFR
        :  :. .:     ::.::::::::. :.::.::.:.:::.. :.:..  .::. ::..:
NP_660 VSIRRHMLTHRGGVPYKCKVCGKAFDYPSLFRIHERSHTGEKPYECKQCGKAFSCSSYIR
     180       190       200       210       220       230         

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB7 KHGKMHTGEKRYECKYCGKPIDYPSLFQIHVRTHTGEKPYKCKQCGKAFISAGYLRTHEI
        : . :::.: :::: ::: ..  . ..:: :::::::::.::::::::  :. .:.:: 
NP_660 IHERTHTGDKPYECKQCGKAFSCSKYIRIHERTHTGEKPYECKQCGKAFRCASSVRSHE-
     240       250       260       270       280       290         

           280       290       300       310       320       330   
pF1KB7 RSHALEKSHQCQECGKKLSCSSSLHRHERTHSGGKLYECQKCAKVFRCPTSLQAHERAHT
       :.:. ::  .:.:::: :.: .:..::   :.:.  :.:. :.:.:  :.:.. :::.::
NP_660 RTHTGEKLFECKECGKALTCLASVRRHMIKHTGNGPYKCKVCGKAFDFPSSFRIHERTHT
      300       310       320       330       340       350        

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pF1KB7 GERPYECNKCGKTFNYPSCFRRHKKTHSGEKPYECTRCGKAFGWCSSLRRHEMTHTGEKP
       ::.::.:..:::.:.  : ::.:.. :.:::::.::.:::::.  : .: :: :::::::
NP_660 GEKPYDCKQCGKAFSCSSSFRKHERIHTGEKPYKCTKCGKAFSRSSYFRIHERTHTGEKP
      360       370       380       390       400       410        

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pF1KB7 FDCKQCGKVFTFSNYLRLHERTHLAGRSQCFGRRQGDHLSPGV
       ..::::::.:. :.:.:.::. :                    
NP_660 YECKQCGKAFSRSTYFRVHEKIHTGEKPYENPNPNASVVPVLS
      420       430       440       450       460 

>>XP_006722936 (OMIM: 194543) PREDICTED: zinc finger pro  (569 aa)
 initn: 1548 init1: 623 opt: 1415  Z-score: 780.8  bits: 154.0 E(85289): 9.4e-37
Smith-Waterman score: 1415; 51.2% identity (70.1% similar) in 432 aa overlap (2-423:25-449)

                                      10        20        30       
pF1KB7                        MDSVAFEDVAVNFTQEEWALLSPSQKNLYRDVTLETF
                               : :::.::::::::::::::. ::..::..: ::::
XP_006 MPCCSHRRCREDPGTSESQEMMFQDPVAFDDVAVNFTQEEWALLDISQRKLYKEVMLETF
               10        20        30        40        50        60

        40        50        60        70         80        90      
pF1KB7 RNLASVGIQWKDQDIENLYQNLGIKLRSLVERLCGRKEGNEH-RETFSQIPDCHLN---K
       :::.::: .::::.::  :::   ..:::.:.  .. . . :  :::.:.:: .::   :
XP_006 RNLTSVGKSWKDQNIEYEYQNPRRNFRSLIEKKVNEIKDDSHCGETFTQVPDDRLNFQEK
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pF1KB7 KSQTGVKPCKCSVCGKVFLRHSFLDRHMRAHAGHKRSECGGEWRETPRKQKQHGKA-SIS
       :..  .: :   :::.: : .: .. ..:.  :::  :   :.   : : .:  ::    
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pF1KB7 PSSGARRTVTPTR----KRPYECKVCGKAFNSPNLFQIHQRTHTGKRSYKCREIVRAFTV
       ::       :: :    ..:: :: :::.: : . .: :   :.:   :::.   .::  
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pF1KB7 SSFFRKHGKMHTGEKRYECKYCGKPIDYPSLFQIHVRTHTGEKPYKCKQCGKAFISAGYL
        :..  : ..::::: :::: ::: ..: . ..:: :::::::::.:.:::::: :    
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pF1KB7 RTHEIRSHALEKSHQCQECGKKLSCSSSLHRHERTHSGGKLYECQKCAKVFRCPTSLQAH
       : :: : :. ::..::.:::: ..: . .. ::::::  : ::: .:.:..   ::.:.:
XP_006 RRHE-RIHTGEKAYQCKECGKAFTCPQYVRIHERTHSRKKPYECTQCGKALSSLTSFQTH
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pF1KB7 ERAHTGERPYECNKCGKTFNYPSCFRRHKKTHSGEKPYECTRCGKAFGWCSSLRRHEMTH
        : :.:::::::. ::: :   . :.::.:::::::::.: .:::::   :::: ::  :
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pF1KB7 TGEKPFDCKQCGKVFTFSNYLRLHERTHLAGRS-QCFGRRQGDHLSPGV           
       :::::..::::::.:  :..:.:: ::: . .  .:                        
XP_006 TGEKPYECKQCGKAFRSSSHLQLHGRTHTGEKPYECQECGKAFRSMKNLQSHERTQTHVR
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XP_006 IHSGERPYKCKLCGKGFYCPKSLQRHEKTHTGEKLYECKQCGEAFSSSSSFRYHERTHTG
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>--
 initn: 429 init1: 429 opt: 464  Z-score: 276.3  bits: 60.6 E(85289): 1.2e-08
Smith-Waterman score: 464; 52.5% identity (72.5% similar) in 120 aa overlap (285-398:450-569)

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pF1KB7 CKQCGKAFISAGYLRTHEIRSHALEKSHQCQECGKKLSCSSSLHRHERT------HSGGK
                                     ::::: .   ..:. ::::      ::: .
XP_006 ECKQCGKAFRSSSHLQLHGRTHTGEKPYECQECGKAFRSMKNLQSHERTQTHVRIHSGER
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pF1KB7 LYECQKCAKVFRCPTSLQAHERAHTGERPYECNKCGKTFNYPSCFRRHKKTHSGEKPYEC
        :.:. :.: : :: ::: ::..::::. :::..::..:.  : :: :..::.:::::.:
XP_006 PYKCKLCGKGFYCPKSLQRHEKTHTGEKLYECKQCGEAFSSSSSFRYHERTHTGEKPYKC
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pF1KB7 TRCGKAFGWCSSLRRHEMTHTGEKPFDCKQCGKVFTFSNYLRLHERTHLAGRSQCFGRRQ
        .:::::   : :: :  ::  .::..:::                              
XP_006 KQCGKAFRAASVLRMHGRTHPEDKPYECKQ                              
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>>XP_011526082 (OMIM: 612248) PREDICTED: zinc finger pro  (429 aa)
 initn: 1172 init1: 640 opt: 1356  Z-score: 750.3  bits: 147.9 E(85289): 4.7e-35
Smith-Waterman score: 1407; 49.6% identity (73.1% similar) in 409 aa overlap (35-416:3-409)

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pF1KB7 AFEDVAVNFTQEEWALLSPSQKNLYRDVTLETFRNLASVGIQWKDQDIENLYQNLGIKLR
                                     :::::::::: ::.::.::. ..    .. 
XP_011                             MRETFRNLASVGKQWEDQNIEDPFKIPRRNIS
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pF1KB7 SLVERLCGRKEGNEHRETFSQIPDCHLNKKSQTGVKPCKCSVCGKVFLRHSFLDRHMRAH
        . ::::  :::.. .::::::::  ::::.  :::::. ::::.: .  : :.::.: :
XP_011 HIPERLCESKEGGQGEETFSQIPDGILNKKTP-GVKPCESSVCGEVGMGPSSLNRHIRDH
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pF1KB7 AGHK-------------RSECG---GEWRETPRKQKQH-----------GKASISPSSGA
       .:..             :..::   .  :  : ... :           :.. ::  :  
XP_011 TGREPNEYQEYGKKSYTRNQCGRALSYHRSFPVRERTHPGGKPYDCKECGETFISLVSIR
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pF1KB7 RRTVTPTRKRPYECKVCGKAFNSPNLFQIHQRTHTGKRSYKCREIVRAFTVSSFFRKHGK
       :. .:     ::.::::::::. :.::.::.:.:::.. :.:..  .::. ::..: : .
XP_011 RHMLTHRGGVPYKCKVCGKAFDYPSLFRIHERSHTGEKPYECKQCGKAFSCSSYIRIHER
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pF1KB7 MHTGEKRYECKYCGKPIDYPSLFQIHVRTHTGEKPYKCKQCGKAFISAGYLRTHEIRSHA
        :::.: :::: ::: ..  . ..:: :::::::::.::::::::  :. .:.:: :.:.
XP_011 THTGDKPYECKQCGKAFSCSKYIRIHERTHTGEKPYECKQCGKAFRCASSVRSHE-RTHT
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pF1KB7 LEKSHQCQECGKKLSCSSSLHRHERTHSGGKLYECQKCAKVFRCPTSLQAHERAHTGERP
        ::  .:.:::: :.: .:..::   :.:.  :.:. :.:.:  :.:.. :::.::::.:
XP_011 GEKLFECKECGKALTCLASVRRHMIKHTGNGPYKCKVCGKAFDFPSSFRIHERTHTGEKP
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pF1KB7 YECNKCGKTFNYPSCFRRHKKTHSGEKPYECTRCGKAFGWCSSLRRHEMTHTGEKPFDCK
       :.:..:::.:.  : ::.:.. :.:::::.::.:::::.  : .: :: :::::::..::
XP_011 YDCKQCGKAFSCSSSFRKHERIHTGEKPYKCTKCGKAFSRSSYFRIHERTHTGEKPYECK
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pF1KB7 QCGKVFTFSNYLRLHERTHLAGRSQCFGRRQGDHLSPGV
       ::::.:. :.:.:.::. :                    
XP_011 QCGKAFSRSTYFRVHEKIHTGEKPYENPNPNASVVPVLS
              400       410       420         

>>NP_001277012 (OMIM: 612248) zinc finger protein 627 is  (429 aa)
 initn: 1172 init1: 640 opt: 1356  Z-score: 750.3  bits: 147.9 E(85289): 4.7e-35
Smith-Waterman score: 1407; 49.6% identity (73.1% similar) in 409 aa overlap (35-416:3-409)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KB7 AFEDVAVNFTQEEWALLSPSQKNLYRDVTLETFRNLASVGIQWKDQDIENLYQNLGIKLR
                                     :::::::::: ::.::.::. ..    .. 
NP_001                             MRETFRNLASVGKQWEDQNIEDPFKIPRRNIS
                                           10        20        30  

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pF1KB7 SLVERLCGRKEGNEHRETFSQIPDCHLNKKSQTGVKPCKCSVCGKVFLRHSFLDRHMRAH
        . ::::  :::.. .::::::::  ::::.  :::::. ::::.: .  : :.::.: :
NP_001 HIPERLCESKEGGQGEETFSQIPDGILNKKTP-GVKPCESSVCGEVGMGPSSLNRHIRDH
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pF1KB7 AGHK-------------RSECG---GEWRETPRKQKQH-----------GKASISPSSGA
       .:..             :..::   .  :  : ... :           :.. ::  :  
NP_001 TGREPNEYQEYGKKSYTRNQCGRALSYHRSFPVRERTHPGGKPYDCKECGETFISLVSIR
             100       110       120       130       140       150 

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pF1KB7 RRTVTPTRKRPYECKVCGKAFNSPNLFQIHQRTHTGKRSYKCREIVRAFTVSSFFRKHGK
       :. .:     ::.::::::::. :.::.::.:.:::.. :.:..  .::. ::..: : .
NP_001 RHMLTHRGGVPYKCKVCGKAFDYPSLFRIHERSHTGEKPYECKQCGKAFSCSSYIRIHER
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pF1KB7 MHTGEKRYECKYCGKPIDYPSLFQIHVRTHTGEKPYKCKQCGKAFISAGYLRTHEIRSHA
        :::.: :::: ::: ..  . ..:: :::::::::.::::::::  :. .:.:: :.:.
NP_001 THTGDKPYECKQCGKAFSCSKYIRIHERTHTGEKPYECKQCGKAFRCASSVRSHE-RTHT
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pF1KB7 LEKSHQCQECGKKLSCSSSLHRHERTHSGGKLYECQKCAKVFRCPTSLQAHERAHTGERP
        ::  .:.:::: :.: .:..::   :.:.  :.:. :.:.:  :.:.. :::.::::.:
NP_001 GEKLFECKECGKALTCLASVRRHMIKHTGNGPYKCKVCGKAFDFPSSFRIHERTHTGEKP
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pF1KB7 YECNKCGKTFNYPSCFRRHKKTHSGEKPYECTRCGKAFGWCSSLRRHEMTHTGEKPFDCK
       :.:..:::.:.  : ::.:.. :.:::::.::.:::::.  : .: :: :::::::..::
NP_001 YDCKQCGKAFSCSSSFRKHERIHTGEKPYKCTKCGKAFSRSSYFRIHERTHTGEKPYECK
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pF1KB7 QCGKVFTFSNYLRLHERTHLAGRSQCFGRRQGDHLSPGV
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NP_001 QCGKAFSRSTYFRVHEKIHTGEKPYENPNPNASVVPVLS
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>>NP_057348 (OMIM: 194542) zinc finger protein 44 isofor  (615 aa)
 initn: 1133 init1: 575 opt: 1296  Z-score: 717.5  bits: 142.4 E(85289): 3.2e-33
Smith-Waterman score: 1380; 47.0% identity (69.2% similar) in 464 aa overlap (1-433:1-462)

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pF1KB7 MDSVAFEDVAVNFTQEEWALLSPSQKNLYRDVTLETFRNLASVGIQWKDQDIENLYQNLG
       ::::::::::::::.::::::.::::::::::  ::.:::  .:..:..:.:.. .::: 
NP_057 MDSVAFEDVAVNFTHEEWALLGPSQKNLYRDVMRETIRNLNCIGMKWENQNIDDQHQNLR
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB7 IKLR-SLVERLCGRKEGNEHRETFSQIPDCHLNKKSQTGVKPCKCSVCGKVFLRHSFLDR
        . : ..:::.   :.:..  ::.::: .  .::.. . :  :  :: :.:.. :: :. 
NP_057 RNPRCDVVERFGKSKDGSQCGETLSQIRNSIVNKNTPARVDACGSSVNGEVIMGHSSLNC
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     120       130                                  140       150  
pF1KB7 HMRAHAGHKRSEC---------------GGEWRET------------PRKQKQHGKASIS
       ..:. .:::. ::               :  .:..            :   :. ::.  :
NP_057 YIRVDTGHKHRECHEYAEKSYTHKQCGKGLSYRHSFQTCERPHTGKKPYDCKECGKTFSS
              130       140       150       160       170       180

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pF1KB7 PSSGARRTVTPTRKRPYECKVCGKAFNSPNLFQIHQRTHTGKRSYKCREIVRAFTVSSFF
       :..  :. :.     ::.:..:::::  :.:...:.:::::.. :.:..  .:: : : .
NP_057 PGNLRRHMVVKGGDGPYKCELCGKAFFWPSLLRMHERTHTGEKPYECKQCSKAFPVYSSY
              190       200       210       220       230       240

            220       230        240       250       260       270 
pF1KB7 RKHGKMHTGEKRYECKYCGKPI-DYPSLFQIHVRTHTGEKPYKCKQCGKAFISAGYLRTH
        .: :.::::: :::: :.: . :: : .. : ::::::::::::::::::  .: ::.:
NP_057 LRHEKIHTGEKPYECKQCSKAFPDYSSYLR-HERTHTGEKPYKCKQCGKAFSVSGSLRVH
              250       260       270        280       290         

             280       290       300       310       320       330 
pF1KB7 EIRSHALEKSHQCQECGKKLSCSSSLHRHERTHSGGKLYECQKCAKVFRCPTSLQAHERA
       : : :. :: . :..::: .   .:..::   :::   ..:. :.: :  : : . :: .
NP_057 E-RIHTGEKPYTCKQCGKAFCHLGSFQRHMIMHSGDGPHKCKICGKGFDFPGSARIHEGT
     300        310       320       330       340       350        

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pF1KB7 HTGERPYECNKCGKTFNYPSCFRRHKKTHSGEKPYECTRCGKAFGWCSSLRRHEMTHTGE
       :: :.::::..::: ... : ::::  .:.:. :..:: :::::   : ..::: :::::
NP_057 HTLEKPYECKQCGKLLSHRSSFRRHMMAHTGDGPHKCTVCGKAFDSPSVFQRHERTHTGE
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pF1KB7 KPFDCKQCGKVFTFSNYLRLHERTHLAGRS-QC-FGRRQGDHLSPGV             
       ::..::::::.:  :. :: :: :: . .  .:  :.  .: .:                
NP_057 KPYECKQCGKAFRTSSSLRKHETTHTGEQPYKCKCGKAFSDLFSFQSHETTHSEEEPYEC
      420       430       440       450       460       470        

NP_057 KECGKAFSSFKYFCRHERTHSEEKSYECQICGKAFSRFSYLKTHERTHTAEKPYECKQCR
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>--
 initn: 662 init1: 572 opt: 579  Z-score: 337.1  bits: 72.0 E(85289): 4.9e-12
Smith-Waterman score: 607; 57.0% identity (77.2% similar) in 149 aa overlap (240-388:463-610)

     210       220       230       240       250       260         
pF1KB7 SFFRKHGKMHTGEKRYECKYCGKPIDYPSLFQIHVRTHTGEKPYKCKQCGKAFISAGYLR
                                     :: :  ::. :.::.::.::::: :  :. 
NP_057 SSSLRKHETTHTGEQPYKCKCGKAFSDLFSFQSHETTHSEEEPYECKECGKAFSSFKYFC
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pF1KB7 THEIRSHALEKSHQCQECGKKLSCSSSLHRHERTHSGGKLYECQKCAKVFRCPTSLQAHE
        :: :.:. :::..:: ::: .:  : :. :::::.. : :::..: :.:  :. :  ::
NP_057 RHE-RTHSEEKSYECQICGKAFSRFSYLKTHERTHTAEKPYECKQCRKAFFWPSFLLRHE
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pF1KB7 RAHTGERPYECNKCGKTFNYPSCFRRHKKTHSGEKPYECTRCGKAFGWCSSLRRHEMTHT
       :.:::::::::..:::.:.  :  :.:..::.::::::: .:::::.  ::. ::. :: 
NP_057 RTHTGERPYECKHCGKAFSRSSFCREHERTHTGEKPYECKECGKAFSSLSSFNRHKRTHW
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pF1KB7 GEKPFDCKQCGKVFTFSNYLRLHERTHLAGRSQCFGRRQGDHLSPGV
                                                      
NP_057 KDIL                                           
                                                      

>>NP_067040 (OMIM: 194551) zinc finger protein 77 [Homo   (545 aa)
 initn: 1065 init1: 659 opt: 1180  Z-score: 656.3  bits: 130.9 E(85289): 8.1e-30
Smith-Waterman score: 1244; 44.3% identity (66.0% similar) in 456 aa overlap (11-416:11-458)

               10        20        30        40                    
pF1KB7 MDSVAFEDVAVNFTQEEWALLSPSQKNLYRDVTLETFRNLASV-----------------
                 :::: ::::::. .:..::::: ::: :::::.                 
NP_067 MDCVIFEEVAVNFTPEEWALLDHAQRSLYRDVMLETCRNLASLDCYIYVRTSGSSSQRDV
               10        20        30        40        50        60

               50                      60               70         
pF1KB7 ---GIQWKDQDI-------------ENL-YQNLGIK-------LRSLVERLCGRKEGNEH
          ::. .:..:             ::  ..: : .       ::: . :::  .::.. 
NP_067 FGNGIS-NDEEIVKFTGSDSWSIFGENWRFDNTGDQHQIPQRHLRSQLGRLCESNEGHQC
                70        80        90       100       110         

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pF1KB7 RETFSQIPDCHLNKKSQTGVKPCKCSVCGKVFLRHSFLDRHMRAHAGHKR-SECGGEWR-
        ::.::  .  ..:.  : .:: .:. :::.:      . ..:.:.:..  .:::     
NP_067 GETLSQTANLLVHKSYPTEAKPSECTKCGKAF------ENRQRSHTGQRPCKECGQACSC
     120       130       140       150             160       170   

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pF1KB7 ---ETPRKQKQHGKASISPSSGARRTVTPTR----KRPYECKVCGKAFNSPNLFQIHQRT
          ..:  . :  .   . ...   .:: ..    :. :::. :::::  :. :. :  .
NP_067 LSCQSPPMKTQTVEKPCNCQDSRTASVTYVKSLSSKKSYECQKCGKAFICPSSFRGHVNS
           180       190       200       210       220       230   

              200       210       220       230       240       250
pF1KB7 HTGKRSYKCREIVRAFTVSSFFRKHGKMHTGEKRYECKYCGKPIDYPSLFQIHVRTHTGE
       : :.... :.   ..:   :.. .: . ::::: :::: ::: .. :: :. ::::::::
NP_067 HHGQKTHACKVCGKTFMYYSYLTRHVRTHTGEKPYECKECGKAFSCPSYFREHVRTHTGE
           240       250       260       270       280       290   

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pF1KB7 KPYKCKQCGKAFISAGYLRTHEIRSHALEKSHQCQECGKKLSCSSSLHRHERTHSGGKLY
       :::.::.:::.:   . .: : .:.:. ::  ::..::: ..: :::..: ::::: : :
NP_067 KPYECKHCGKSFSCYSSFRDH-VRTHTGEKPCQCKHCGKAFTCYSSLREHGRTHSGEKPY
           300       310        320       330       340       350  

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pF1KB7 ECQKCAKVFRCPTSLQAHERAHTGERPYECNKCGKTFNYPSCFRRHKKTHSGEKPYECTR
       ::..:.:.:: :.::.:: : ::::.:: :..:::.:. :. :::: ::::: :::.: .
NP_067 ECKECGKAFRYPSSLRAHMRMHTGEKPYVCKQCGKAFGCPTYFRRHVKTHSGVKPYQCKE
            360       370       380       390       400       410  

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pF1KB7 CGKAFGWCSSLRRHEMTHTGEKPFDCKQCGKVFTFSNYLRLHERTHLAGRSQCFGRRQGD
       ::::... :::: :  ::::::::.::.:::.:.  . :: : :::              
NP_067 CGKAYSFSSSLRIHVRTHTGEKPFECKHCGKAFSCHSSLREHVRTHSGEKPYECNQCGKA
            420       430       440       450       460       470  

                                                                   
pF1KB7 HLSPGV                                                      
                                                                   
NP_067 FSHAQYFQKHVRSHSGVKPYECTECGKAYSCSSSLRVHVRTHTGERPYECKQCGKTFRYL
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>--
 initn: 389 init1: 389 opt: 390  Z-score: 237.2  bits: 53.3 E(85289): 1.8e-06
Smith-Waterman score: 390; 58.6% identity (81.6% similar) in 87 aa overlap (333-419:459-544)

            310       320       330       340       350       360  
pF1KB7 THSGGKLYECQKCAKVFRCPTSLQAHERAHTGERPYECNKCGKTFNYPSCFRRHKKTHSG
                                     .::.:::::.:::.:.. . :..: ..:::
NP_067 THTGEKPFECKHCGKAFSCHSSLREHVRTHSGEKPYECNQCGKAFSHAQYFQKHVRSHSG
      430       440       450       460       470       480        

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pF1KB7 EKPYECTRCGKAFGWCSSLRRHEMTHTGEKPFDCKQCGKVFTFSNYLRLHERTHLAGRSQ
        ::::::.::::..  :::: :  :::::.:..::::::.: .   :. : ::: ::   
NP_067 VKPYECTECGKAYSCSSSLRVHVRTHTGERPYECKQCGKTFRYLASLQAHVRTH-AGA  
      490       500       510       520       530       540        

            430      
pF1KB7 CFGRRQGDHLSPGV

>>NP_066358 (OMIM: 194556) zinc finger protein 14 [Homo   (642 aa)
 initn: 2911 init1: 672 opt: 1107  Z-score: 617.1  bits: 123.9 E(85289): 1.2e-27
Smith-Waterman score: 1237; 50.0% identity (72.2% similar) in 360 aa overlap (81-423:148-505)

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pF1KB7 DIENLYQNLGIKLRSLVERLCGRKEGNEHRETFSQIPDCHLNKKSQTGVKPCKCSVCGKV
                                     .:::     . .....::::: .:. :::.
NP_066 LNRHMRSHTGQKPNEYQEYEKQPCKCKAVGKTFSYHHCFRKHERTHTGVKPYECKQCGKA
       120       130       140       150       160       170       

              120       130                      140       150     
pF1KB7 FLRHSFLDRHMRAHAGHKRSECGGEWR---------------ETPRKQKQHGKASISPSS
       :. .. ..:: :.:::.:  ::    .               . : . :: ::: :  .:
NP_066 FIYYQPFQRHERTHAGQKPYECKQCGKTFIYYQSFQKHAHTGKKPYECKQCGKAFICYQS
       180       190       200       210       220       230       

         160       170       180       190       200       210     
pF1KB7 GARRTVTPTRKRPYECKVCGKAFNSPNLFQIHQRTHTGKRSYKCREIVRAFTVSSFFRKH
         :.  : : ..::::: :::::. :. :. :.:::::.. :::.:  .::.  : ::.:
NP_066 FQRHKRTHTGEKPYECKQCGKAFSCPTYFRTHERTHTGEKPYKCKECGKAFSFLSSFRRH
       240       250       260       270       280       290       

         220       230       240       250       260       270     
pF1KB7 GKMHTGEKRYECKYCGKPIDYPSLFQIHVRTHTGEKPYKCKQCGKAFISAGYLRTHEIRS
        . :.::: :::: ::: . : . :. ::  ::: .:::::.::::: :..  :.:: :.
NP_066 KRTHSGEKPYECKECGKAFFYSASFRAHVIIHTGARPYKCKECGKAFNSSNSCRVHE-RT
       300       310       320       330       340       350       

         280       290       300       310       320       330     
pF1KB7 HALEKSHQCQECGKKLSCSSSLHRHERTHSGGKLYECQKCAKVFRCPTSLQAHERAHTGE
       :  :: ..:..:::..: : ::. :::::.: : :::..: :.:   .::. :: .::::
NP_066 HIGEKPYECKRCGKSFSWSISLRLHERTHTGEKPYECKQCHKTFSFSSSLREHETTHTGE
        360       370       380       390       400       410      

         340       350       360       370       380        390    
pF1KB7 RPYECNKCGKTFNYPSCFRRHKKTHSGEKPYECTRCGKAFGWCSS-LRRHEMTHTGEKPF
       .::::..:::::.. : ..::..::..:::::: .:::::  ::: .: :: .::::::.
NP_066 KPYECKQCGKTFSFSSSLQRHERTHNAEKPYECKQCGKAFR-CSSYFRIHERSHTGEKPY
        420       430       440       450        460       470     

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pF1KB7 DCKQCGKVFTFSNYLRLHERTHLAGRS-QCFGRRQGDHLSPGV                 
       .::::::::  :. .::::::: . .  .:                              
NP_066 ECKQCGKVFIRSSSFRLHERTHTGEKPYECKLCGKTFSFSSSLREHEKIHTGNKPFECKQ
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>--
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Smith-Waterman score: 592; 57.3% identity (84.7% similar) in 131 aa overlap (287-417:508-638)

        260       270       280       290       300       310      
pF1KB7 QCGKAFISAGYLRTHEIRSHALEKSHQCQECGKKLSCSSSLHRHERTHSGGKLYECQKCA
                                     ::: .: ::::..::. :.:.: .::..:.
NP_066 KQCGKVFIRSSSFRLHERTHTGEKPYECKLCGKTFSFSSSLREHEKIHTGNKPFECKQCG
       480       490       500       510       520       530       

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pF1KB7 KVFRCPTSLQAHERAHTGERPYECNKCGKTFNYPSCFRRHKKTHSGEKPYECTRCGKAFG
       :.:   .... :::.::::.::.:..:::.:   : :: :..::.:::::.: .::::: 
NP_066 KAFLRSSQIRLHERTHTGEKPYQCKQCGKAFISSSKFRMHERTHTGEKPYRCKQCGKAFR
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pF1KB7 WCSSLRRHEMTHTGEKPFDCKQCGKVFTFSNYLRLHERTHLAGRSQCFGRRQGDHLSPGV
       . ::.: :: .::::::..::::::.:  :...:::::::.                   
NP_066 FSSSVRIHERSHTGEKPYECKQCGKAFISSSHFRLHERTHMGEKV               
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>--
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Smith-Waterman score: 510; 53.4% identity (78.4% similar) in 148 aa overlap (1-147:1-147)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDSVAFEDVAVNFTQEEWALLSPSQKNLYRDVTLETFRNLASVGIQWKDQDIENLYQNLG
       ::::.::::::::: ::::::. :::.::.::  :::.::. .: .:.:::::. ..: :
NP_066 MDSVSFEDVAVNFTLEEWALLDSSQKKLYEDVMQETFKNLVCLGKKWEDQDIEDDHRNQG
               10        20        30        40        50        60

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        . :  .:::::  ..:..  :: ::.:. ..::.. ::.:: .:: ::. :..:: :.:
NP_066 KNRRCHMVERLCESRRGSKCGETTSQMPNVNINKETFTGAKPHECSFCGRDFIHHSSLNR
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pF1KB7 HMRAHAGHKRSECGGEWRETPRKQKQHGKASISPSSGARRTVTPTRKRPYECKVCGKAFN
       :::.:.:.: .:   :... : : :  :                                
NP_066 HMRSHTGQKPNEYQ-EYEKQPCKCKAVGKTFSYHHCFRKHERTHTGVKPYECKQCGKAFI
              130        140       150       160       170         

>>NP_001277013 (OMIM: 612248) zinc finger protein 627 is  (351 aa)
 initn: 1172 init1: 640 opt: 1078  Z-score: 603.4  bits: 120.5 E(85289): 7.1e-27
Smith-Waterman score: 1146; 48.3% identity (73.5% similar) in 325 aa overlap (92-416:19-331)

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                                     :. .. : :    . ::...  :  .  . 
NP_001             MGPSSLNRHIRDHTGREPNEYQEYGKKSYTRNQCGRALSYHRSFPVRE
                           10        20        30        40        

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pF1KB7 RAHAGHKRSECGGEWRETPRKQKQHGKASISPSSGARRTVTPTRKRPYECKVCGKAFNSP
       :.: : :  .:           :. :.. ::  :  :. .:     ::.::::::::. :
NP_001 RTHPGGKPYDC-----------KECGETFISLVSIRRHMLTHRGGVPYKCKVCGKAFDYP
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pF1KB7 NLFQIHQRTHTGKRSYKCREIVRAFTVSSFFRKHGKMHTGEKRYECKYCGKPIDYPSLFQ
       .::.::.:.:::.. :.:..  .::. ::..: : . :::.: :::: ::: ..  . ..
NP_001 SLFRIHERSHTGEKPYECKQCGKAFSCSSYIRIHERTHTGDKPYECKQCGKAFSCSKYIR
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pF1KB7 IHVRTHTGEKPYKCKQCGKAFISAGYLRTHEIRSHALEKSHQCQECGKKLSCSSSLHRHE
       :: :::::::::.::::::::  :. .:.:: :.:. ::  .:.:::: :.: .:..:: 
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         :.:.  :.:. :.:.:  :.:.. :::.::::.::.:..:::.:.  : ::.:.. :.
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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