Result of FASTA (omim) for pF1KB7766
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7766, 503 aa
  1>>>pF1KB7766 503 - 503 aa - 503 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8999+/-0.000785; mu= 12.4583+/- 0.049
 mean_var=309.5947+/-60.460, 0's: 0 Z-trim(108.9): 2123  B-trim: 115 in 2/52
 Lambda= 0.072892
 statistics sampled from 14657 (17011) to 14657 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.499), E-opt: 0.2 (0.199), width:  16
 Scan time:  8.510

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 ( 572) 2739 303.4 1.1e-81
XP_016867177 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 569) 2603 289.1 2.3e-77
NP_066971 (OMIM: 604756) zinc finger protein 273 [ ( 569) 2603 289.1 2.3e-77
XP_011526007 (OMIM: 603980) PREDICTED: zinc finger ( 531) 2538 282.2 2.5e-75
NP_258429 (OMIM: 606957) zinc finger protein 257 i ( 563) 2510 279.3   2e-74
XP_016867181 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2400 267.7 5.7e-71
XP_016867180 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2400 267.7 5.7e-71
XP_016867182 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2400 267.7 5.7e-71
XP_016867184 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2400 267.7 5.7e-71
XP_016867183 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2400 267.7 5.7e-71
XP_016867187 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2400 267.7 5.7e-71
XP_016867186 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2400 267.7 5.7e-71
XP_016867179 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2400 267.7 5.7e-71
XP_016867185 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2400 267.7 5.7e-71
XP_016867178 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2400 267.7 5.7e-71
NP_066385 (OMIM: 606954) zinc finger protein 253 i ( 499) 2367 264.2 6.3e-70
NP_001303925 (OMIM: 606957) zinc finger protein 25 ( 531) 2332 260.6 8.4e-69
XP_011514048 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 537) 2150 241.4 4.9e-63
NP_056936 (OMIM: 194624) zinc finger protein 117 [ ( 483) 2076 233.6   1e-60
NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 625) 1981 223.8 1.2e-57
NP_001243583 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 1788 203.6 1.6e-51
NP_001243580 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 1788 203.6 1.6e-51
XP_016882696 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1788 203.6 1.7e-51
XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1788 203.6 1.7e-51
NP_001243578 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 1788 203.6 1.7e-51
XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1788 203.6 1.7e-51
XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1788 203.6 1.7e-51
XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1788 203.6 1.7e-51
XP_016882703 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1788 203.6 1.7e-51
NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 1788 203.6 1.7e-51
XP_011526561 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1788 203.6 1.7e-51
XP_016882704 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1788 203.6 1.7e-51
XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1788 203.6 1.7e-51
XP_016882697 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1788 203.6 1.7e-51
NP_001243579 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 1788 203.6 1.7e-51
XP_011526559 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1788 203.6 1.7e-51
XP_016882705 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1788 203.6 1.7e-51
NP_003414 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 is ( 809) 1788 203.7 1.7e-51
XP_011526568 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 1790 204.1 1.7e-51
XP_006722943 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 1790 204.1 1.7e-51
NP_001243582 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 818) 1788 203.7 1.7e-51
XP_016882725 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1118) 1790 204.1 1.7e-51
XP_016882724 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 1790 204.1 1.8e-51
XP_011526567 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 1790 204.1 1.8e-51
NP_001287880 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 (1159) 1790 204.1 1.8e-51
NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 1790 204.1 1.8e-51
NP_001265607 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 574) 1742 198.6 4.1e-50
NP_001265592 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 574) 1742 198.6 4.1e-50
XP_011526750 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 574) 1742 198.6 4.1e-50
XP_016883007 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 586) 1742 198.6 4.2e-50


>>NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 [Ho  (572 aa)
 initn: 2534 init1: 1556 opt: 2739  Z-score: 1587.3  bits: 303.4 E(85289): 1.1e-81
Smith-Waterman score: 2739; 77.4% identity (89.7% similar) in 504 aa overlap (1-503:10-513)

                        10        20        30        40        50 
pF1KB7          MGALTFRDVAIEFSLEEWQCLDTEQQNLYRNVMLDNYRNLVFLGIAVSKPD
                ::.:::::::.:::::::::::: ::::::::::.:::::::.:::.::::
NP_001 MPGPLGSLEMGVLTFRDVALEFSLEEWQCLDTAQQNLYRNVMLENYRNLVFVGIAASKPD
               10        20        30        40        50        60

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB7 LITCLEQEKEPWNLKTHDMVAKPPVICSHIAQDLWPEQGIKDYFQEVILRQYKKCRHENL
       ::::::: :::::.: :.::..:::. :..::::::.:: :.:::.:::: :::: .:::
NP_001 LITCLEQGKEPWNVKRHEMVTEPPVVYSYFAQDLWPKQGKKNYFQKVILRTYKKCGRENL
               70        80        90       100       110       120

             120       130       140       150       160       170 
pF1KB7 LLRKGCKNVDEFKMHKKGYNRHNQCLTTSHSKIFQCDKYVKVFHKFSNSNRHKIRHTSKK
        ::: ::..:: :.::. ::  ::::::...:::: :::::::::::::::::: ::.::
NP_001 QLRKYCKSMDECKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQYDKYVKVFHKFSNSNRHKIGHTGKK
              130       140       150       160       170       180

             180       190       200       210       220        230
pF1KB7 PFKCKECGKLFCILSHLAQHKKIHTGEKSYKCEEYGKAFNESSNCTTHKRI-TEKKPYKC
        :::::: : ::.::::::::.::.::: :::.: :::.::.:: .::::: : ::::::
NP_001 SFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKAYNEASNLSTHKRIHTGKKPYKC
              190       200       210       220       230       240

              240       250       260       270       280       290
pF1KB7 KECGKAFNWFSHFTTHKRIHTGEKPYQCEKCGKFFNQSTNLTTHKRIHTGEKPYKCEECG
       .::::::: .::.:::: ::::.:::.::.::: ::::.:::::::::::::::::::::
NP_001 EECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSANLTTHKRIHTGEKPYKCEECG
              250       260       270       280       290       300

              300       310       320       330       340       350
pF1KB7 KAFNQSSNLTEHKKIHTKEQPYKCEKCGKAFKWSSTLTKHKRIHNGEKPYKCEECGKAFN
       .::.:::.:: :: ::. :.:::::.:::::. ::::: :: ::.::: ::::::::::.
NP_001 RAFSQSSTLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKIIHTGEKFYKCEECGKAFS
              310       320       330       340       350       360

              360       370       380       390       400       410
pF1KB7 RSSTLNRHKITHTGEKPYKYKECGKAFNQSSTLTIHKIIHTVEKFYKCEECGKAFSRISH
       : : :. ::  :.:::::: .::::::.:::::: :: ::. ::::::: :.:::::.::
NP_001 RLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKRIHAGEKFYKCEVCSKAFSRFSH
              370       380       390       400       410       420

              420       430       440       450       460       470
pF1KB7 LTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFNQSSTLTTHKRIHTGEKPYECEECGKAFNRSSTLTTH
       ::::::::::::::::::::.::: :: ::::: ::::::::.:::::::::.::::. :
NP_001 LTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSKH
              430       440       450       460       470       480

              480       490       500                              
pF1KB7 KIIHSGEKIYKCKECGKAFRRFSHLTRHKTIHT                           
       :.::.::: :::.:::::: . :::: :: :::                           
NP_001 KVIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPYKCEECGKAFNNSSILNRHKMIH
              490       500       510       520       530       540

NP_001 TGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK
              550       560       570  

>>XP_016867177 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger pro  (569 aa)
 initn: 3655 init1: 1448 opt: 2603  Z-score: 1510.0  bits: 289.1 E(85289): 2.3e-77
Smith-Waterman score: 2603; 75.2% identity (85.7% similar) in 504 aa overlap (1-503:34-537)

                                             10        20        30
pF1KB7                               MGALTFRDVAIEFSLEEWQCLDTEQQNLYR
                                     :: :::::::::::::::::::: ::::::
XP_016 APRGPPSVAPLPAGIGRSTAKTPGLPGSLEMGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTSQQNLYR
            10        20        30        40        50        60   

               40        50        60        70        80        90
pF1KB7 NVMLDNYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQEKEPWNLKTHDMVAKPPVICSHIAQDLWPEQG
       :::::::::::::::::::::::::::: ::: :.: : :::::::.:::.::::::.::
XP_016 NVMLDNYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQGKEPCNMKRHAMVAKPPVVCSHFAQDLWPKQG
            70        80        90       100       110       120   

              100       110       120       130       140       150
pF1KB7 IKDYFQEVILRQYKKCRHENLLLRKGCKNVDEFKMHKKGYNRHNQCLTTSHSKIFQCDKY
       .:: ::.::::.: :  :::: ::::::..:: :.::.:::  ::::::..:::::::::
XP_016 LKDSFQKVILRRYGKYGHENLQLRKGCKSADEHKVHKRGYNGLNQCLTTTQSKIFQCDKY
           130       140       150       160       170       180   

              160       170       180       190       200       210
pF1KB7 VKVFHKFSNSNRHKIRHTSKKPFKCKECGKLFCILSHLAQHKKIHTGEKSYKCEEYGKAF
       :::.::::::: :: :.:.:::::::::::  ::::.:.::::  :  . :::.  ::::
XP_016 VKVLHKFSNSNIHKKRQTGKKPFKCKECGKSCCILSQLTQHKKTATRVNFYKCKTCGKAF
           190       200       210       220       230       240   

              220        230       240       250       260         
pF1KB7 NESSNCTTHKRI-TEKKPYKCKECGKAFNWFSHFTTHKRIHTGEKPYQCEKCGKFFNQST
       :. :: : :: :  : .::::.:::::::    .: ::.::: ::::.:: ::: :.  .
XP_016 NQFSNLTKHKIIHPEVNPYKCEECGKAFNQSLTLTKHKKIHTEEKPYKCEDCGKVFSVFS
           250       260       270       280       290       300   

     270       280       290       300       310       320         
pF1KB7 NLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLTEHKKIHTKEQPYKCEKCGKAFKWSSTLTK
        :: :: :::: :::.::::::.:.  :.::.:: ::: :.::::..:::::.:::::::
XP_016 VLTKHKIIHTGTKPYNCEECGKGFSIFSTLTKHKIIHTGEKPYKCNECGKAFNWSSTLTK
           310       320       330       340       350       360   

     330       340       350       360       370       380         
pF1KB7 HKRIHNGEKPYKCEECGKAFNRSSTLNRHKITHTGEKPYKYKECGKAFNQSSTLTIHKII
       :::::.:::::::::::::::.::::.::::.:::::::: .::::::..:.::: :: :
XP_016 HKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTRHKIVHTGEKPYKCEECGKAFKRSTTLTKHKRI
           370       380       390       400       410       420   

     390       400       410       420       430       440         
pF1KB7 HTVEKFYKCEECGKAFSRISHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFNQSSTLTTHKRIHTGE
       .: :: ::::::::::: .: :: :: :::: ::::::::: ::   :::: :::.::::
XP_016 YTKEKPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKIIHTGAKPYKCEECGSAFRAFSTLTEHKRVHTGE
           430       440       450       460       470       480   

     450       460       470       480       490       500         
pF1KB7 KPYECEECGKAFNRSSTLTTHKIIHSGEKIYKCKECGKAFRRFSHLTRHKTIHT      
       :::.:.::::::: ::::: :: ::.::: :::.:::::: : :.::::: :::      
XP_016 KPYKCNECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTRHKKIHTGEKPYK
           490       500       510       520       530       540   

XP_016 PKRCDSAFDNTPNFSRHKRNHMGEKS
           550       560         

>>NP_066971 (OMIM: 604756) zinc finger protein 273 [Homo  (569 aa)
 initn: 3655 init1: 1448 opt: 2603  Z-score: 1510.0  bits: 289.1 E(85289): 2.3e-77
Smith-Waterman score: 2603; 75.2% identity (85.7% similar) in 504 aa overlap (1-503:34-537)

                                             10        20        30
pF1KB7                               MGALTFRDVAIEFSLEEWQCLDTEQQNLYR
                                     :: :::::::::::::::::::: ::::::
NP_066 APRGPPSVAPLPAGIGRSTAKTPGLPGSLEMGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTSQQNLYR
            10        20        30        40        50        60   

               40        50        60        70        80        90
pF1KB7 NVMLDNYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQEKEPWNLKTHDMVAKPPVICSHIAQDLWPEQG
       :::::::::::::::::::::::::::: ::: :.: : :::::::.:::.::::::.::
NP_066 NVMLDNYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQGKEPCNMKRHAMVAKPPVVCSHFAQDLWPKQG
            70        80        90       100       110       120   

              100       110       120       130       140       150
pF1KB7 IKDYFQEVILRQYKKCRHENLLLRKGCKNVDEFKMHKKGYNRHNQCLTTSHSKIFQCDKY
       .:: ::.::::.: :  :::: ::::::..:: :.::.:::  ::::::..:::::::::
NP_066 LKDSFQKVILRRYGKYGHENLQLRKGCKSADEHKVHKRGYNGLNQCLTTTQSKIFQCDKY
           130       140       150       160       170       180   

              160       170       180       190       200       210
pF1KB7 VKVFHKFSNSNRHKIRHTSKKPFKCKECGKLFCILSHLAQHKKIHTGEKSYKCEEYGKAF
       :::.::::::: :: :.:.:::::::::::  ::::.:.::::  :  . :::.  ::::
NP_066 VKVLHKFSNSNIHKKRQTGKKPFKCKECGKSCCILSQLTQHKKTATRVNFYKCKTCGKAF
           190       200       210       220       230       240   

              220        230       240       250       260         
pF1KB7 NESSNCTTHKRI-TEKKPYKCKECGKAFNWFSHFTTHKRIHTGEKPYQCEKCGKFFNQST
       :. :: : :: :  : .::::.:::::::    .: ::.::: ::::.:: ::: :.  .
NP_066 NQFSNLTKHKIIHPEVNPYKCEECGKAFNQSLTLTKHKKIHTEEKPYKCEDCGKVFSVFS
           250       260       270       280       290       300   

     270       280       290       300       310       320         
pF1KB7 NLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLTEHKKIHTKEQPYKCEKCGKAFKWSSTLTK
        :: :: :::: :::.::::::.:.  :.::.:: ::: :.::::..:::::.:::::::
NP_066 VLTKHKIIHTGTKPYNCEECGKGFSIFSTLTKHKIIHTGEKPYKCNECGKAFNWSSTLTK
           310       320       330       340       350       360   

     330       340       350       360       370       380         
pF1KB7 HKRIHNGEKPYKCEECGKAFNRSSTLNRHKITHTGEKPYKYKECGKAFNQSSTLTIHKII
       :::::.:::::::::::::::.::::.::::.:::::::: .::::::..:.::: :: :
NP_066 HKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTRHKIVHTGEKPYKCEECGKAFKRSTTLTKHKRI
           370       380       390       400       410       420   

     390       400       410       420       430       440         
pF1KB7 HTVEKFYKCEECGKAFSRISHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFNQSSTLTTHKRIHTGE
       .: :: ::::::::::: .: :: :: :::: ::::::::: ::   :::: :::.::::
NP_066 YTKEKPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKIIHTGAKPYKCEECGSAFRAFSTLTEHKRVHTGE
           430       440       450       460       470       480   

     450       460       470       480       490       500         
pF1KB7 KPYECEECGKAFNRSSTLTTHKIIHSGEKIYKCKECGKAFRRFSHLTRHKTIHT      
       :::.:.::::::: ::::: :: ::.::: :::.:::::: : :.::::: :::      
NP_066 KPYKCNECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTRHKKIHTGEKPYK
           490       500       510       520       530       540   

NP_066 PKRCDSAFDNTPNFSRHKRNHMGEKS
           550       560         

>>XP_011526007 (OMIM: 603980) PREDICTED: zinc finger pro  (531 aa)
 initn: 1556 init1: 1556 opt: 2538  Z-score: 1473.3  bits: 282.2 E(85289): 2.5e-75
Smith-Waterman score: 2538; 76.5% identity (89.2% similar) in 472 aa overlap (33-503:1-472)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KB7 ALTFRDVAIEFSLEEWQCLDTEQQNLYRNVMLDNYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQEKEP
                                     ::.:::::::.:::.::::::::::: :::
XP_011                               MLENYRNLVFVGIAASKPDLITCLEQGKEP
                                             10        20        30

             70        80        90       100       110       120  
pF1KB7 WNLKTHDMVAKPPVICSHIAQDLWPEQGIKDYFQEVILRQYKKCRHENLLLRKGCKNVDE
       ::.: :.::..:::. :..::::::.:: :.:::.:::: :::: .::: ::: ::..::
XP_011 WNVKRHEMVTEPPVVYSYFAQDLWPKQGKKNYFQKVILRTYKKCGRENLQLRKYCKSMDE
               40        50        60        70        80        90

            130       140       150       160       170       180  
pF1KB7 FKMHKKGYNRHNQCLTTSHSKIFQCDKYVKVFHKFSNSNRHKIRHTSKKPFKCKECGKLF
        :.::. ::  ::::::...:::: :::::::::::::::::: ::.:: :::::: : :
XP_011 CKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQYDKYVKVFHKFSNSNRHKIGHTGKKSFKCKECEKSF
              100       110       120       130       140       150

            190       200       210       220        230       240 
pF1KB7 CILSHLAQHKKIHTGEKSYKCEEYGKAFNESSNCTTHKRI-TEKKPYKCKECGKAFNWFS
       :.::::::::.::.::: :::.: :::.::.:: .::::: : ::::::.::::::: .:
XP_011 CMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKAYNEASNLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLS
              160       170       180       190       200       210

             250       260       270       280       290       300 
pF1KB7 HFTTHKRIHTGEKPYQCEKCGKFFNQSTNLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLTE
       :.:::: ::::.:::.::.::: ::::.:::::::::::::::::::::.::.:::.:: 
XP_011 HLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSANLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTA
              220       230       240       250       260       270

             310       320       330       340       350       360 
pF1KB7 HKKIHTKEQPYKCEKCGKAFKWSSTLTKHKRIHNGEKPYKCEECGKAFNRSSTLNRHKIT
       :: ::. :.:::::.:::::. ::::: :: ::.::: ::::::::::.: : :. ::  
XP_011 HKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKIIHTGEKFYKCEECGKAFSRLSHLTTHKRI
              280       290       300       310       320       330

             370       380       390       400       410       420 
pF1KB7 HTGEKPYKYKECGKAFNQSSTLTIHKIIHTVEKFYKCEECGKAFSRISHLTTHKRIHTGE
       :.:::::: .::::::.:::::: :: ::. ::::::: :.:::::.:::::::::::::
XP_011 HSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKRIHAGEKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGE
              340       350       360       370       380       390

             430       440       450       460       470       480 
pF1KB7 KPYKCEECGRAFNQSSTLTTHKRIHTGEKPYECEECGKAFNRSSTLTTHKIIHSGEKIYK
       :::::::::.::: :: ::::: ::::::::.:::::::::.::::. ::.::.::: ::
XP_011 KPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYK
              400       410       420       430       440       450

             490       500                                         
pF1KB7 CKECGKAFRRFSHLTRHKTIHT                                      
       :.:::::: . :::: :: :::                                      
XP_011 CEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPYKCEECGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESC
              460       470       480       490       500       510

>>NP_258429 (OMIM: 606957) zinc finger protein 257 isofo  (563 aa)
 initn: 3958 init1: 1132 opt: 2510  Z-score: 1457.2  bits: 279.3 E(85289): 2e-74
Smith-Waterman score: 2510; 71.6% identity (85.3% similar) in 510 aa overlap (1-503:1-510)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MGALTFRDVAIEFSLEEWQCLDTEQQNLYRNVMLDNYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQEK
       :: ::.:::..:::::::.:::: ::::::.:::.::::::::::::::::::::::: :
NP_258 MGPLTIRDVTVEFSLEEWHCLDTAQQNLYRDVMLENYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQGK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 EPWNLKTHDMVAKPPVICSHIAQDLWPEQGIKDYFQEVILRQYKKCRHENLLLRKGCKNV
       :: :.: :.:::::::.:::::.:: ::. :: .::.::::.: ::.:::: ::::::.:
NP_258 EPCNMKRHEMVAKPPVMCSHIAEDLCPERDIKYFFQKVILRRYDKCEHENLQLRKGCKSV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 DEFKMHKKGYNRHNQCLTTSHSKIFQCDKYVKVFHKFSNSNRHKIRHTSKKPFKCKECGK
       :: :. : :::  :::: :..::..:::::::::.:::::.::::::: ::  :::::::
NP_258 DECKVCKGGYNGLNQCLITTQSKMYQCDKYVKVFYKFSNSDRHKIRHTEKKTCKCKECGK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220        230         
pF1KB7 LFCILSHLAQHKKIHTGEKSYKCEEYGKAFNESSNCTTHKRI-TEKKPYKCKECGKAFNW
        ::.::.:..::.::  :.:.:::: :::::.::  : ::   : .:::::.::::::: 
NP_258 SFCMLSQLTRHKRIHIRENSHKCEECGKAFNQSSALTRHKMTHTGEKPYKCEECGKAFNR
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB7 FSHFTTHKRIHTGEKPYQCEKCGKFFNQSTNLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSS--
        ::.: :: ::: ::::.::.::: ::.:...: :::::. :::.: .:: :::. ::  
NP_258 SSHLTQHKVIHTREKPYKCEECGKAFNRSSHITQHKRIHNREKPFKYDECCKAFKWSSAL
              250       260       270       280       290       300

        300       310       320       330       340       350      
pF1KB7 -NLTEHKKIHTKEQPYKCEKCGKAFKWSSTLTKHKRIHNGEKPYKCEECGKAFNRSSTLN
        .::.::.::: :.:::::.:::::. ::.::.:: ::.::::..:::::::::::: :.
NP_258 TTLTQHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSALTRHKMIHTGEKPFQCEECGKAFNRSSHLT
              310       320       330       340       350       360

        360       370       380       390       400          410   
pF1KB7 RHKITHTGEKPYKYKECGKAFNQSSTLTIHKIIHTVEKFYKCEECGKAF---SRISHLTT
       .::: :: ::::: .:::::::.:: :: :: ::: :: :::.:  :::   : .. :: 
NP_258 QHKIIHTKEKPYKCEECGKAFNRSSHLTKHKRIHTREKAYKCDEYCKAFNWSSALTTLTQ
              370       380       390       400       410       420

           420       430       440       450       460       470   
pF1KB7 HKRIHTGEKPYKCEECGRAFNQSSTLTTHKRIHTGEKPYECEECGKAFNRSSTLTTHKII
       :: ::::::::::::::.:::.:: :  :: ::::::::.:::::::::.:: :: ::::
NP_258 HKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSYLIRHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSHLTQHKII
              430       440       450       460       470       480

           480       490       500                                 
pF1KB7 HSGEKIYKCKECGKAFRRFSHLTRHKTIHT                              
       :.::: :::.:::::: : :::..:: :::                              
NP_258 HTGEKPYKCEECGKAFNRSSHLSQHKIIHTGEKPYKCEECGKPFNRFSYLTVHKRIHAGE
              490       500       510       520       530       540

>>XP_016867181 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger pro  (504 aa)
 initn: 3452 init1: 1448 opt: 2400  Z-score: 1395.1  bits: 267.7 E(85289): 5.7e-71
Smith-Waterman score: 2400; 73.9% identity (85.2% similar) in 472 aa overlap (33-503:1-472)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KB7 ALTFRDVAIEFSLEEWQCLDTEQQNLYRNVMLDNYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQEKEP
                                     :::::::::::::::::::::::::: :::
XP_016                               MLDNYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQGKEP
                                             10        20        30

             70        80        90       100       110       120  
pF1KB7 WNLKTHDMVAKPPVICSHIAQDLWPEQGIKDYFQEVILRQYKKCRHENLLLRKGCKNVDE
        :.: : :::::::.:::.::::::.::.:: ::.::::.: :  :::: ::::::..::
XP_016 CNMKRHAMVAKPPVVCSHFAQDLWPKQGLKDSFQKVILRRYGKYGHENLQLRKGCKSADE
               40        50        60        70        80        90

            130       140       150       160       170       180  
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        :.::.:::  ::::::..::::::::::::.::::::: :: :.:.:::::::::::  
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       ::::.:.::::  :  . :::.  :::::. :: : :: :  : .::::.:::::::   
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        .: ::.::: ::::.:: ::: :.  . :: :: :::: :::.::::::.:.  :.::.
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       :: ::: :.::::..:::::.::::::::::::.:::::::::::::::.::::.::::.
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       :::::::: .::::::..:.::: :: :.: :: ::::::::::: .: :: :: :::: 
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       ::::::::: ::   :::: :::.:::::::.:.::::::: ::::: :: ::.::: ::
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       :.:::::: : :.::::: :::                                
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        :.: : :::::::.:::.::::::.::.:: ::.::::.: :  :::: ::::::..::
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        :.::.:::  ::::::..::::::::::::.::::::: :: :.:.:::::::::::  
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       :: ::: :.::::..:::::.::::::::::::.:::::::::::::::.::::.::::.
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       :::::::: .::::::..:.::: :: :.: :: ::::::::::: .: :: :: :::: 
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       ::::::::: ::   :::: :::.:::::::.:.::::::: ::::: :: ::.::: ::
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       :.:::::: : :.::::: :::                                
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pF1KB7 WNLKTHDMVAKPPVICSHIAQDLWPEQGIKDYFQEVILRQYKKCRHENLLLRKGCKNVDE
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XP_016 CNMKRHAMVAKPPVVCSHFAQDLWPKQGLKDSFQKVILRRYGKYGHENLQLRKGCKSADE
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pF1KB7 FKMHKKGYNRHNQCLTTSHSKIFQCDKYVKVFHKFSNSNRHKIRHTSKKPFKCKECGKLF
        :.::.:::  ::::::..::::::::::::.::::::: :: :.:.:::::::::::  
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pF1KB7 WNLKTHDMVAKPPVICSHIAQDLWPEQGIKDYFQEVILRQYKKCRHENLLLRKGCKNVDE
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XP_016 CNMKRHAMVAKPPVVCSHFAQDLWPKQGLKDSFQKVILRRYGKYGHENLQLRKGCKSADE
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pF1KB7 FKMHKKGYNRHNQCLTTSHSKIFQCDKYVKVFHKFSNSNRHKIRHTSKKPFKCKECGKLF
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XP_016 HKVHKRGYNGLNQCLTTTQSKIFQCDKYVKVLHKFSNSNIHKKRQTGKKPFKCKECGKSC
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pF1KB7 CILSHLAQHKKIHTGEKSYKCEEYGKAFNESSNCTTHKRI-TEKKPYKCKECGKAFNWFS
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       ::::::::: ::   :::: :::.:::::::.:.::::::: ::::: :: ::.::: ::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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