FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7767, 447 aa 1>>>pF1KB7767 447 - 447 aa - 447 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8378+/-0.000863; mu= 4.3500+/- 0.052 mean_var=220.7825+/-45.095, 0's: 0 Z-trim(115.6): 9 B-trim: 444 in 1/50 Lambda= 0.086316 statistics sampled from 16107 (16116) to 16107 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.8), E-opt: 0.2 (0.495), width: 16 Scan time: 3.800 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12761.1 TEAD2 gene_id:8463|Hs108|chr19 ( 447) 3052 392.3 5.4e-109 CCDS58671.1 TEAD2 gene_id:8463|Hs108|chr19 ( 450) 3036 390.3 2.2e-108 CCDS59406.1 TEAD2 gene_id:8463|Hs108|chr19 ( 451) 3034 390.0 2.6e-108 CCDS58670.1 TEAD2 gene_id:8463|Hs108|chr19 ( 319) 2163 281.4 8.8e-76 CCDS47414.1 TEAD3 gene_id:7005|Hs108|chr6 ( 435) 1302 174.3 2.1e-43 CCDS7810.2 TEAD1 gene_id:7003|Hs108|chr11 ( 426) 1198 161.4 1.6e-39 CCDS31729.1 TEAD4 gene_id:7004|Hs108|chr12 ( 434) 692 98.4 1.6e-20 CCDS41737.1 TEAD4 gene_id:7004|Hs108|chr12 ( 305) 675 96.1 5.1e-20 CCDS31730.1 TEAD4 gene_id:7004|Hs108|chr12 ( 391) 675 96.2 6.2e-20 >>CCDS12761.1 TEAD2 gene_id:8463|Hs108|chr19 (447 aa) initn: 3052 init1: 3052 opt: 3052 Z-score: 2070.3 bits: 392.3 E(32554): 5.4e-109 Smith-Waterman score: 3052; 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66.2% identity (80.9% similar) in 444 aa overlap (14-447:4-426) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MGEPRAGAALDDGSGWTGSEEGSEEGTGGSEGAGGDGGPDAEGVWSPDIEQSFQEALAIY :.:.::: .:. :..: ::::::::::::::::::::: CCDS78 MEPSSWSGSESPAENMERMSDSADKPIDNDAEGVWSPDIEQSFQEALAIY 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 PPCGRRKIILSDEGKMYGRNELIARYIKLRTGKTRTRKQVSSHIQVLARRKSREIQSKLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::...:::: CCDS78 PPCGRRKIILSDEGKMYGRNELIARYIKLRTGKTRTRKQVSSHIQVLARRKSRDFHSKLK 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KB7 DQVSKDKAFQTMATMSSAQLISAPSLQAKLG------PTGPQASELFQFWSG--GSGPPW ::..::::.: ::.:::::..:: ... ::: :: : : :: : .: : CCDS78 DQTAKDKALQHMAAMSSAQIVSATAIHNKLGLPGIPRPTFPGAP---GFWPGMIQTGQPG 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 NVPDVKPFSQT--PFTLSLTPPSTDLPGYEPPQALSPLPPPTPSPPAWQARGLGTARLQL . ::::: : :. ..: : .::.:: .: :.:: ::::.:..::..:.: CCDS78 SSQDVKPFVQQAYPIQPAVTAP---IPGFEPASA------PAPSVPAWQGRSIGTTKLRL 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 VEFSAFVEPPDAVDSYQRHLFVHISQHCPSPGAPPLESVDVRQIYDKFPEKKGGLRELYD ::::::.: :::..::::::.. : . : :::::.::::::::::::::.::. CCDS78 VEFSAFLEQQRDPDSYNKHLFVHIGHANHSYSDPLLESVDIRQIYDKFPEKKGGLKELFG 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 RGPPHAFFLVKFWADLNWGPSGEEAGAGGSISSGGFYGVSSQYESLEHMTLTCSSKVCSF .:: .:::::::::::: . . ..::: ::::.::::: :.::.:::.::::: CCDS78 KGPQNAFFLVKFWADLNCNIQ-DDAGA--------FYGVTSQYESSENMTVTCSTKVCSF 280 290 300 310 320 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 GKQVVEKVETERAQLEDGRFVYRLLRSPMCEYLVNFLHKLRQLPERYMMNSVLENFTILQ ::::::::::: :..:.::::::. :::::::..::.:::..:::.::::::::::::: CCDS78 GKQVVEKVETEYARFENGRFVYRINRSPMCEYMINFIHKLKHLPEKYMMNSVLENFTILL 330 340 350 360 370 380 420 430 440 pF1KB7 VVTNRDTQELLLCTAYVFEVSTSERGAQHHIYRLVRD ::::::::: ::: : :::::.::.::::::::::.: CCDS78 VVTNRDTQETLLCMACVFEVSNSEHGAQHHIYRLVKD 390 400 410 420 >>CCDS31729.1 TEAD4 gene_id:7004|Hs108|chr12 (434 aa) initn: 1714 init1: 655 opt: 692 Z-score: 482.2 bits: 98.4 E(32554): 1.6e-20 Smith-Waterman score: 1830; 64.9% identity (82.6% similar) in 436 aa overlap (16-447:13-434) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MGEPRAGAALDDGSGWTG--SEEGSEEGTGGSEGAGGDGGPDAEGVWSPDIEQSFQEALA :.. : ::: ..:::.. ::::::::::::::::::: CCDS31 MEGTAGTITSNEWSSPTSPEGST-ASGGSQALDKPIDNDAEGVWSPDIEQSFQEALA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 IYPPCGRRKIILSDEGKMYGRNELIARYIKLRTGKTRTRKQVSSHIQVLARRKSREIQSK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.: CCDS31 IYPPCGRRKIILSDEGKMYGRNELIARYIKLRTGKTRTRKQVSSHIQVLARRKAREIQAK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 LKDQVSKDKAFQTMATMSSAQLISAPSLQAKLG-PTGPQASELFQFWSGG-SGPPWNVPD ::::..::::.:.::.:::::.::: ....... :: . ::.:. : . : CCDS31 LKDQAAKDKALQSMAAMSSAQIISATAFHSSMALARGPGRPAVSGFWQGALPGQAGTSHD 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 VKPFSQTPFTLSLTPPSTDLPGYEPPQALSPLPPPTPSPPAWQARGLGTARLQLVEFSAF :::::: : .. :: :::.: : . .: : :.:: ::.:......: ..::::: CCDS31 VKPFSQQ--TYAVQPP-LPLPGFESPAGPAPSPSAPPAPP-WQGRSVASSKLWMLEFSAF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 VEPPDAVDSYQRHLFVHISQHCPSPGAPPLESVDVRQIYDKFPEKKGGLRELYDRGPPHA .: . :.:..::::::.: :: . : ::.::.::::::::::::::..:..::: .: CCDS31 LEQQQDPDTYNKHLFVHIGQSSPSYSDPYLEAVDIRQIYDKFPEKKGGLKDLFERGPSNA 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 FFLVKFWADLNWGPSGEEAGAGGSISSGGFYGVSSQYESLEHMTLTCSSKVCSFGKQVVE ::::::::::: . :. :.. :::::::::: :.: .:::.::::::::::: CCDS31 FFLVKFWADLN--TNIEDEGSS-------FYGVSSQYESPENMIITCSTKVCSFGKQVVE 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 KVETERAQLEDGRFVYRLLRSPMCEYLVNFLHKLRQLPERYMMNSVLENFTILQVVTNRD ::::: :. :.:.. ::. :::.:::..::.:::..:::.:::::::::::::::::::: CCDS31 KVETEYARYENGHYSYRIHRSPLCEYMINFIHKLKHLPEKYMMNSVLENFTILQVVTNRD 350 360 370 380 390 400 420 430 440 pF1KB7 TQELLLCTAYVFEVSTSERGAQHHIYRLVRD ::: ::: :::::::.::.::::::::::.. CCDS31 TQETLLCIAYVFEVSASEHGAQHHIYRLVKE 410 420 430 >>CCDS41737.1 TEAD4 gene_id:7004|Hs108|chr12 (305 aa) initn: 1132 init1: 655 opt: 675 Z-score: 472.8 bits: 96.1 E(32554): 5.1e-20 Smith-Waterman score: 1235; 59.4% identity (79.9% similar) in 318 aa overlap (132-447:1-305) 110 120 130 140 150 160 pF1KB7 SHIQVLARRKSREIQSKLKDQVSKDKAFQTMATMSSAQLISAPSLQAKLG-PTGPQASEL ::.:::::.::: ....... :: . CCDS41 MAAMSSAQIISATAFHSSMALARGPGRPAV 10 20 30 170 180 190 200 210 pF1KB7 FQFWSGG-SGPPWNVPDVKPFSQTPFTLSLTPPSTDLPGYEPPQALSPLPPPTPSPPAWQ ::.:. : . ::::::: : .. :: :::.: : . .: : :.:: :: CCDS41 SGFWQGALPGQAGTSHDVKPFSQQ--TYAVQPP-LPLPGFESPAGPAPSPSAPPAPP-WQ 40 50 60 70 80 220 230 240 250 260 270 pF1KB7 ARGLGTARLQLVEFSAFVEPPDAVDSYQRHLFVHISQHCPSPGAPPLESVDVRQIYDKFP .:......: ..:::::.: . :.:..::::::.: :: . : ::.::.:::::::: CCDS41 GRSVASSKLWMLEFSAFLEQQQDPDTYNKHLFVHIGQSSPSYSDPYLEAVDIRQIYDKFP 90 100 110 120 130 140 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 EKKGGLRELYDRGPPHAFFLVKFWADLNWGPSGEEAGAGGSISSGGFYGVSSQYESLEHM ::::::..:..::: .:::::::::::: . :. :.. :::::::::: :.: CCDS41 EKKGGLKDLFERGPSNAFFLVKFWADLN--TNIEDEGSS-------FYGVSSQYESPENM 150 160 170 180 190 340 350 360 370 380 390 pF1KB7 TLTCSSKVCSFGKQVVEKVETERAQLEDGRFVYRLLRSPMCEYLVNFLHKLRQLPERYMM .:::.:::::::::::::::: :. :.:.. ::. :::.:::..::.:::..:::.::: CCDS41 IITCSTKVCSFGKQVVEKVETEYARYENGHYSYRIHRSPLCEYMINFIHKLKHLPEKYMM 200 210 220 230 240 250 400 410 420 430 440 pF1KB7 NSVLENFTILQVVTNRDTQELLLCTAYVFEVSTSERGAQHHIYRLVRD :::::::::::::::::::: ::: :::::::.::.::::::::::.. CCDS41 NSVLENFTILQVVTNRDTQETLLCIAYVFEVSASEHGAQHHIYRLVKE 260 270 280 290 300 >>CCDS31730.1 TEAD4 gene_id:7004|Hs108|chr12 (391 aa) initn: 1599 init1: 655 opt: 675 Z-score: 471.3 bits: 96.2 E(32554): 6.2e-20 Smith-Waterman score: 1627; 60.7% identity (75.2% similar) in 435 aa overlap (16-447:13-391) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MGEPRAGAALDDGSGWTG--SEEGSEEGTGGSEGAGGDGGPDAEGVWSPDIEQSFQEALA :.. : ::: ..:::.. ::::::::::::::::::: CCDS31 MEGTAGTITSNEWSSPTSPEGST-ASGGSQALDKPIDNDAEGVWSPDIEQSFQEALA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 IYPPCGRRKIILSDEGKMYGRNELIARYIKLRTGKTRTRKQVSSHIQVLARRKSREIQSK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.: CCDS31 IYPPCGRRKIILSDEGKMYGRNELIARYIKLRTGKTRTRKQVSSHIQVLARRKAREIQAK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 LKDQVSKDKAFQTMATMSSAQLISAPSLQAKLGPTGPQASELFQFWSGG-SGPPWNVPDV :: ::.:. : . :: CCDS31 LK------------------------------------------FWQGALPGQAGTSHDV 120 130 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 KPFSQTPFTLSLTPPSTDLPGYEPPQALSPLPPPTPSPPAWQARGLGTARLQLVEFSAFV ::::: : .. :: :::.: : . .: : :.:: ::.:......: ..:::::. CCDS31 KPFSQQ--TYAVQPP-LPLPGFESPAGPAPSPSAPPAPP-WQGRSVASSKLWMLEFSAFL 140 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 EPPDAVDSYQRHLFVHISQHCPSPGAPPLESVDVRQIYDKFPEKKGGLRELYDRGPPHAF : . :.:..::::::.: :: . : ::.::.::::::::::::::..:..::: .:: CCDS31 EQQQDPDTYNKHLFVHIGQSSPSYSDPYLEAVDIRQIYDKFPEKKGGLKDLFERGPSNAF 200 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 FLVKFWADLNWGPSGEEAGAGGSISSGGFYGVSSQYESLEHMTLTCSSKVCSFGKQVVEK :::::::::: . :. :.. :::::::::: :.: .:::.:::::::::::: CCDS31 FLVKFWADLN--TNIEDEGSS-------FYGVSSQYESPENMIITCSTKVCSFGKQVVEK 260 270 280 290 300 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 VETERAQLEDGRFVYRLLRSPMCEYLVNFLHKLRQLPERYMMNSVLENFTILQVVTNRDT :::: :. :.:.. ::. :::.:::..::.:::..:::.::::::::::::::::::::: CCDS31 VETEYARYENGHYSYRIHRSPLCEYMINFIHKLKHLPEKYMMNSVLENFTILQVVTNRDT 310 320 330 340 350 360 420 430 440 pF1KB7 QELLLCTAYVFEVSTSERGAQHHIYRLVRD :: ::: :::::::.::.::::::::::.. CCDS31 QETLLCIAYVFEVSASEHGAQHHIYRLVKE 370 380 390 447 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 22:12:55 2016 done: Fri Nov 4 22:12:55 2016 Total Scan time: 3.800 Total Display time: 0.050 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]