FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7774, 506 aa 1>>>pF1KB7774 506 - 506 aa - 506 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5462+/-0.00199; mu= 13.5058+/- 0.119 mean_var=253.0927+/-48.901, 0's: 0 Z-trim(104.5): 982 B-trim: 79 in 1/50 Lambda= 0.080618 statistics sampled from 6854 (7936) to 6854 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.565), E-opt: 0.2 (0.244), width: 16 Scan time: 2.990 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS14278.1 ZNF157 gene_id:7712|Hs108|chrX ( 506) 3628 436.5 3.3e-122 CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1708 213.3 6.2e-55 CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1708 213.4 6.4e-55 CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1708 213.4 6.5e-55 CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1708 213.4 6.6e-55 CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1683 210.5 5.1e-54 CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1671 209.2 1.4e-53 CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 616) 1655 207.1 4.5e-53 CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 647) 1655 207.2 4.6e-53 CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 699) 1647 206.3 9.1e-53 CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 810) 1647 206.4 9.8e-53 CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 811) 1647 206.4 9.8e-53 CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 817) 1647 206.4 9.9e-53 CCDS73088.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 829) 1647 206.4 9.9e-53 CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 620) 1643 205.8 1.2e-52 CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 639) 1643 205.8 1.2e-52 CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1635 204.8 2.2e-52 CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1635 204.9 2.3e-52 CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1634 204.8 2.5e-52 CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1629 204.1 3.5e-52 CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1629 204.2 3.7e-52 CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1625 203.6 4.6e-52 CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1625 203.7 5.3e-52 CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1614 202.2 1.1e-51 CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1613 202.2 1.3e-51 CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1614 202.5 1.3e-51 CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 1616 202.9 1.3e-51 CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1613 202.2 1.3e-51 CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1613 202.3 1.3e-51 CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1608 201.7 2e-51 CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1606 201.3 2e-51 CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 1609 202.0 2.1e-51 CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 1609 202.0 2.1e-51 CCDS12505.1 ZNF571 gene_id:51276|Hs108|chr19 ( 609) 1603 201.1 2.9e-51 CCDS77773.1 ZNF717 gene_id:100131827|Hs108|chr3 ( 864) 1604 201.4 3.3e-51 CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 1598 200.6 4.7e-51 CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1597 200.5 5.2e-51 CCDS42636.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 662) 1595 200.2 5.8e-51 CCDS82405.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 664) 1595 200.2 5.8e-51 CCDS6754.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 626) 1593 199.9 6.7e-51 CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1593 200.0 6.9e-51 CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1593 200.0 6.9e-51 CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1593 200.0 7e-51 CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19 ( 499) 1590 199.4 7.5e-51 CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1591 199.8 8.6e-51 CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 1592 200.1 9.1e-51 CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 1590 199.8 9.8e-51 CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 1590 199.8 1e-50 CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 1590 199.8 1e-50 CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1587 199.4 1.2e-50 >>CCDS14278.1 ZNF157 gene_id:7712|Hs108|chrX (506 aa) initn: 3628 init1: 3628 opt: 3628 Z-score: 2307.4 bits: 436.5 E(32554): 3.3e-122 Smith-Waterman score: 3628; 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CCDS54 QHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQR 340 350 360 370 380 390 220 230 240 250 260 270 pF1KB7 THTGERPFECNECGKSFGRKSQLILHTRTHTGERPYECTECGKTFSEKATLTIHQRTHTG ::::.:.::.::::.: . . :: : ::::::.:::: ::::.::... :: :.: ::: CCDS54 IHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTG 400 410 420 430 440 450 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 EKPYECSECGKTFRVKISLTQHHRTHTGEKPYECGECGKNFRAKKSLNQHQRIHTGEKPY :::: :.:::::: . ::.::.:::::::::::..::: :: . :.:::::::::::: CCDS54 EKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPY 460 470 480 490 500 510 340 350 360 370 380 390 pF1KB7 ECGECGKFFRMKMTLNNHQRTHTGEKPYQCNECGKSFRVHSSLGIHQRIHTGEKPYECNE ::..::: : . .:..::: :::::::.::.::..: . : ::::::::::::::. CCDS54 ECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQ 520 530 540 550 560 570 400 410 420 430 440 450 pF1KB7 CGNAFYVKARLIEHQRMHSGEKPYECSECGKIFSMKKSLCQHRRTHTGEKPYECSECGNA :: :: .. ::::::.:. :::: :.:::: :: ..:: ::.::::::::::: .::.. 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CCDS31 SSLVSLGYEVMKPDVIFKLEQGEEPWV------GDGEIPS--------SDSPEVWKVDGN 50 60 70 80 130 140 150 160 170 pF1KB7 LLHHQ----KIQTLDQNVEYNGCRKAFHEKTGFVR-RKRTPRGDKNFECHECGKAYCRKS .. :: :.. . .. : .. : :. . .:: :: . .:: . : CCDS31 MMWHQDNQDKLKIIKRGHECDAFGKNFNLNMNFVPLRKSNSEGDLD------GLI----- 90 100 110 120 130 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 NLVEHLRIHTGERPYECGECAKTFSARSYLIAHQK---THTGERPFECNECGKSFGRKSQ : .:: . . : .: . :.. . .. :.: : : . ..:.. .:. .::: CCDS31 -LKHHLDLLIPKGDYGKAE-SDDFNVFDNFFLHSKPEDTDTWLKYYDCDKYKESY-KKSQ 140 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 LILHTRTHTGERPYECTECGKTFSEKATLTIHQRTHTGEKPYECSECGKTFRVKISLTQH .:.. :.. ::. :::.:: : ::.: .: :: : . . :..::::: : .. : CCDS31 IIIYHRNRLGEKLYECSECRKRFSKKPSLIKHQSRHIRDIAFGCGNCGKTFPQKSQFITH 200 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 HRTHTGEKPYECGECGKNFRAKKSLNQHQRIHTGEKPYECGECGKFFRMKMTLNNHQRTH ::::::::::.:..::: : :..:..::: :::::::::::::: : : : .: ::: CCDS31 HRTHTGEKPYNCSQCGKAFSQKSQLTSHQRTHTGEKPYECGECGKAFSRKSHLISHWRTH 260 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 TGEKPYQCNECGKSFRVHSSLGIHQRIHTGEKPYECNECGNAFYVKARLIEHQRMHSGEK :::::: :::::..: .:.: ::::::::::.:: ::: CCDS31 TGEKPYGCNECGRAFSEKSNLINHQRIHTGEKPFECRECGKAFSRKSQLVTHHRTHTGTK 320 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 PYECSECGKIFSMKKSLCQHRRTHTGEKPYECSECGNAFYVKVRLIEHQRIHTGERPFEC CCDS31 PFGCSDCRKAFFEKSELIRHQTIHTGEKPYECSECRKAFRERSSLINHQRTHTGEKPHGC 380 390 400 410 420 430 >>CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 (778 aa) initn: 6514 init1: 1669 opt: 1671 Z-score: 1075.5 bits: 209.2 E(32554): 1.4e-53 Smith-Waterman score: 1671; 54.8% identity (76.2% similar) in 416 aa overlap (82-494:363-773) 60 70 80 90 100 pF1KB7 HKDVMLETYSNLASVGLCVAKPEMIFKLERGEELW---ILEEESSGHGYSGSLSLLCGNG :. .: : ... .: .: . :.. CCDS71 ECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGEKHFQCNQCGKTFWEKSNLTKHQRSH--TGEKPFECNEC 340 350 360 370 380 390 110 120 130 140 150 160 pF1KB7 SVGDNALRHDNDLLHHQKIQTLDQNVEYNGCRKAFHEKTGFVRRKRTPRGDKNFECHECG . .:. : . : ::. .: .. . :.: :.:..:. .....:: :.: .::.::: CCDS71 G---KAFSHKSALTLHQRTHTGEKPYQCNACGKTFYQKSDLTKHQRTHTGQKPYECYECG 400 410 420 430 440 170 180 190 200 210 220 pF1KB7 KAYCRKSNLVEHLRIHTGERPYECGECAKTFSARSYLIAHQKTHTGERPFECNECGKSFG :..: .:.:. : : ::::.:.:: ::.:.: .:.: ::.:: :..:.::: :::.: CCDS71 KSFCMNSHLTVHQRTHTGEKPFECLECGKSFCQKSHLTQHQRTHIGDKPYECNACGKTFY 450 460 470 480 490 500 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 RKSQLILHTRTHTGERPYECTECGKTFSEKATLTIHQRTHTGEKPYECSECGKTFRVKIS .:: : : ::: .:::: :::::: :. :::::::::::::. : :::: : : . 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CCDS71 TGEKPYECNECGKSFSHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECGKIFYRKSDLAKHQRSHTGEK 690 700 710 720 730 740 470 480 490 500 pF1KB7 PFECQECGKAFCRKAHLTEHQRTHIGWSWRCTMKKASH :.::. : :.: .:..: ::::::: CCDS71 PYECNTCRKTFSQKSNLIVHQRTHIGEKPYE 750 760 770 >-- initn: 1157 init1: 330 opt: 704 Z-score: 467.6 bits: 96.7 E(32554): 1e-19 Smith-Waterman score: 723; 36.6% identity (63.7% similar) in 366 aa overlap (21-363:6-362) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MPANGTSPQRFPALIPGEPGRSFEGSVSFEDVAVDFTRQEWHRLDPAQRTMHKDVMLETY ..:.:::::.::.: ::..::..:::.::....:::::.: CCDS71 MNKVDQKFQGSVSFKDVTVGFTQEEWQHLDPSQRALYRDVMLENY 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KB7 SNLASVGLCVAKPEMIFKLERGEELWILEEESSGHGYSGSLSLLCGNGSVGDNALRH--- :::.::: :. :::.::.::.::: : :::: .... . . .: .: CCDS71 SNLVSVGYCAHKPEVIFRLEQGEEPWRLEEEFPSQSFPEVWTADHLKERSQENQSKHLWE 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 pF1KB7 ----DNDLLHHQKIQTL----DQNVEYNGCRKAF--HEKTG--------FVRRKRTPRGD .:..: ... ... ...: :: : ... : .: : . : CCDS71 VVFINNEMLTKEQGNVIGIPFNMDVSSFPSRKMFCQYDSRGMSFNTVSELVISKINYLGK 110 120 130 140 150 160 160 170 180 190 200 210 pF1KB7 KNFECHECGKAYCRKSNLVEHLRIHTGERPYECGECAKTFSARSYLIAHQKTHTGERPFE :. : . ::: ..: . :: :. : . .:.: : . :.: .: .. :: CCDS71 KSDEFNACGKLLLN----IKHDETHTREKN-EVLKNRNTLSHRENTLQHEKIQTLDHNFE 170 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 270 pF1KB7 CNECGKSFGRKSQLILHTRTHTGERPYEC--TECGKTFSEKATLTIHQRTHTGEKPYECS . : ... .:. ...:: . . . .: .: :.:: ....: .:: . .. :: : CCDS71 YSICQETLLEKA--VFNTRKRENAEENNCDYNEFGRTFCDSSSLLFHQIPPSKDSHYEFS 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 ECGKTFRVKISLTQHHRTHTGEKPYECGECGKNFRAKKSLNQHQRIHTGEKPYECGECGK .: : . :: .:..: . . : :.::: :.::: : :.: :. ::: .::.:::: CCDS71 DCEKFLCVKSTLSKHDGVPV--KHYDCGESGNNFRRKLCLSQLQKGDKGEKHFECNECGK 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KB7 FFRMKMTLNNHQRTHTGEKPYQCNECGKSFRVHSSLGIHQRIHTGEKPYECNECGNAFYV : : :. :::.::::: .:::.: CCDS71 AFWEKSHLTRHQRVHTGEKHFQCNQCGKTFWEKSNLTKHQRSHTGEKPFECNECGKAFSH 340 350 360 370 380 390 >>CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 (616 aa) initn: 1651 init1: 1651 opt: 1655 Z-score: 1066.4 bits: 207.1 E(32554): 4.5e-53 Smith-Waterman score: 1655; 58.8% identity (79.1% similar) in 374 aa overlap (121-494:237-610) 100 110 120 130 140 150 pF1KB7 ESSGHGYSGSLSLLCGNGSVGDNALRHDNDLLHHQKIQTLDQNVEYNGCRKAFHEKTGFV :. :: :.. .. . . : .::..:. .. CCDS12 SVYNKKRRATNIEKKHTCNECGKSFCRKSVLILHQGIHSEEKPYQCHQCGNAFRRKSYLI 210 220 230 240 250 260 160 170 180 190 200 210 pF1KB7 RRKRTPRGDKNFECHECGKAYCRKSNLVEHLRIHTGERPYECGECAKTFSARSYLIAHQK ..:: :.: : :.::::.. :. :..: : ::::. ::: .: ..: .:.:: ::. 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